生物信息学1 陈润生
生物信息学(第二版)
生物信息学(第二版)生物信息学是一门跨学科的学科,它结合了生物学、计算机科学、信息学以及统计学等多个领域的知识,旨在通过计算机技术和算法来分析生物数据,解决生物学问题。
随着生物技术的飞速发展,生物信息学在基因组学、蛋白质组学、代谢组学等领域发挥着越来越重要的作用。
第二版的生物信息学教材在第一版的基础上进行了全面升级和更新。
它不仅涵盖了生物信息学的基础知识,如生物序列分析、基因表达分析、蛋白质结构预测等,还增加了许多新的内容,如生物网络分析、系统生物学、生物医学大数据分析等。
第二版的生物信息学教材为读者提供了一个全面、深入、实用的学习资源,帮助他们更好地理解和应用生物信息学的知识。
无论您是生物学专业的学生,还是对生物信息学感兴趣的爱好者,这本教材都将为您提供宝贵的指导和帮助。
生物信息学(第二版)在生物信息学领域,第二版教材的推出不仅是对知识的更新,更是对教学理念的升华。
新版教材不仅关注生物信息学的基础理论和方法,更注重培养学生的实践能力和创新思维。
它通过引入最新的研究成果和技术进展,鼓励学生探索生物信息学的前沿领域。
教材的第二版还特别强调了跨学科的合作与交流。
在生物信息学的研究中,不同领域的专家需要紧密合作,共同解决复杂的生物学问题。
因此,教材中包含了大量跨学科合作的案例研究,让学生了解如何将生物学、计算机科学、数学和统计学等多学科的知识结合起来,以实现更高效的数据分析和生物学问题的解决。
第二版教材还注重培养学生的批判性思维和解决问题的能力。
它鼓励学生不仅要知道如何使用现有的生物信息学工具和技术,还要能够评估这些工具的适用性和局限性,以及如何根据具体问题设计和优化新的分析方法。
在实际应用方面,教材通过详细的案例分析,展示了生物信息学在疾病诊断、药物研发、个性化医疗等领域的应用。
这些案例不仅帮助学生理解生物信息学的实际价值,还激发了他们对未来可能的研究方向的兴趣。
生物信息学(第二版)随着生物科学和信息技术的高速发展,生物信息学作为两者的桥梁,其重要性日益凸显。
生物信息学专业介绍
学好生物信息学做什么?
湖南农业大学生物信息学专业的优势
2005年开始招生,是国内最早开设生物信息学 专业的高校之一。
师资力量雄厚,生物信息系教师全部具有博士 学位,83.3%的教师有出国留学经历。
与全球最大的基因组学研发机构华大基因签署 协议,每年选拔优秀学生到基因学院实行 2.5+1.5制的联合培养。
开设生物信息学专业的大学
序号 1
2
3
4 5
6 7 8 9 10 11 12 13 14 15
院校名称
天津医科大学
山西农业大学
哈尔滨工业大学
同济大学 南通大学
福建农林大学
郑州大学 华中农业大学 湖南农业大学 重庆邮电大学 南方医科大学
河北大学 哈尔滨工业大学
徐州医科大学 西交利物浦大学
序号 16
17
18
19 20
21 22 23 24 25 26 27 28 29 30
院校名称
河北大学
大连理工大学
哈尔滨医科大学
苏州大学 浙江大学
福建医科大学
华中科技大学 中南大学
西南交通大学 重庆医科大学 南方科技大学 河北农业大学 山西中医学院 泰山医学院 承德医学院
生物科学类专业市场需求
专业名称 生物信息 生物工程 生物技术 生物科学
优秀学生代表-2008级崔亚(陈润生院士博士)
优秀学生代表-2015级李玲果(杨焕明院士博士生)
谢 谢!
平均薪资(元/月) 13200 11110 8500 7020 5950
——信息来自职友集
——信息来自职业圈
什么是生物信息学?
生物数据 + 计算机
10
2019/6/10
非编码RNA研究的源起及对未来发展的一些思考_陈润生
,
、
。
、
,
,
,
,
,
。
报告 人 简 介
陈 润 生 院 士 19 6 4 年 毕 业 于 中 国科 技 大 学 生 物物 理 系 ; 一 19 7 8 19 8 0 年在 吉 林 大 学 理论 化 学进 修班 学 习 ; 19 85 一 19 8 7 年 获洪 ; 19 9 4 一 2 0 堡 奖 学 金 在德 国 纽 伦 堡 大 学 从事 量 子 生 物学 研 究 3 年作 0 为访 问 学 者或访 问 教 授 先后 在香港 中文 大 学 美 国加 州 洛 杉矶大学 美 国 哈佛 大学 日本大阪大学 蛋 白质 研 究所 台湾 理论科 学 中心 等 从 事合 作 研 究 1 9 8 9 年 至 今 在 生 物 物 理 研 究 所 做 研究 员 2 0 7 年 1 月 当选 中 国 科 学 院院 士 现为 国 际 人类 基 因 组 组 织 ( H U G O ) 会 员 ; 国 际 数 据 库 组 织 ( C O D A T A ) 生 物 大 分 子 专 业 组 委 员 国 际 纯粹 及 应 用 物 理 学会 ( u I P A P ) 生 物 信 息 学 专 业委 员 会委 员 ; 国 际 学 术期 。 c o l f Th e r i t a l l g n a o e iB o y 》 的 编 委 陈 润 生 院 士 是 中 国 最 早 从 事 理 论 生 物学 和 刊 《 Jo u r 生 物 信 息 学 研 究 的科 研人 员 之 一 在生 物 信 息 学 领 域 进行 了 系 统 的研究 曾参 加 中国 第 一个 完 整 基 因 组 泉生 热袍菌 B 4 基 因组 序 列 的组装 和 基 因 标识 曾参加人类基 因组 1% 和 水 稻 基 因 组 工 作草 图 的研 究 共 发 表 S C I 学术 论 文 1 2 0 余篇 自 1 9 % 年 以 来 在 国 际 学术会 议 上 共 作 大会 报 告及分 组 会 报 告 二 十 余 次 由 于 其 在 基 因 组 信 息学领 域 的早 期 9 % 年 9 月 2 0 月 3 日在 日 本 筑波 召 开 的 第 十 五 届 国 际科 学 技术数 据委 工作 1 9 日至 1 o a e o r a e e r e o a 员会 (e o D A T A ) 大会 上 应 邀作 K t n i M m i l L t u 同时获得 小谷 正 雄 奖 ( K t n i P ri z e 生 物领域 )
中国科学院院士
自1994年~2002年,共产生5批46名外籍院士。
1 数学物理学部(191)艾国祥白以龙蔡诗东陈彪陈和生陈佳洱陈建功陈建生陈景润陈木法陈难先陈式刚陈希孺程开甲程民德崔尔杰戴传曾戴元本邓稼先丁大钊丁伟岳丁夏畦段学复范海福方成方守贤冯端冯康甘子钊葛墨林葛庭燧龚昌德谷超豪关肇直管惟炎郭柏灵郭尚平郭永怀郭仲衡郝柏林何泽慧何祚庥贺贤土洪朝生洪家兴胡宁胡和生胡济民胡仁宇胡世华华罗庚黄昆黄润乾黄胜年黄祖洽霍裕平江泽涵姜伯驹解思深金建中经福谦柯召邝宇平李林李邦河李大潜李德平李方华李国平李家春李家明李惕碚李荫远李正武廖山涛林群林同骥刘应明卢鹤绂陆埮陆启铿陆学善吕敏马大猷马志明闵乃本欧阳钟灿潘承洞彭桓武彭实戈蒲富恪钱临照钱三强钱伟长钱学森曲钦岳饶毓泰沈元沈文庆沈学础施汝为石钟慈苏步青苏定强苏肇冰孙义燧谈镐生汤定元唐孝威陶瑞宝田刚童秉纲万哲先汪承灏汪德昭王迅王元王承书王鼎盛王淦昌王乃彦王诗宬王世绩王绶琯王湘浩王业宁王竹溪王梓坤魏宝文魏荣爵文兰吴杭生吴式枢吴文俊吴有训席泽宗夏道行冼鼎昌肖健谢家麟谢希德熊大闰徐叙瑢徐至展许宝騄严济慈严加安严志达杨乐杨澄中杨福家杨国桢杨立铭杨应昌叶朝辉叶企孙叶叔华应崇福于渌于敏余瑞璜詹文龙张杰张殿琳张恭庆张涵信张焕乔张家铝张仁和张淑仪张文裕张钰哲张裕恒张宗燧张宗烨章综赵光达赵忠贤赵忠尧郑厚植周恒周光召周培源周同庆周又元周毓麟朱邦芬朱光亚朱洪元庄逢甘邹广田2 化学部(175)白春礼蔡镏生蔡启瑞曹镛曹本熹查全性陈懿陈冠荣陈洪渊陈家镛陈鉴远陈俊武陈凯先陈庆云陈荣悌陈茹玉陈新滋陈耀祖程津培程镕时戴安邦戴立信邓从豪邓景发方肇伦费维扬冯守华冯新德傅鹰高鸿高济宇高世扬高小霞高怡生高振衡顾翼东郭景坤郭慕孙郭燮贤何炳林何国钟何鸣元洪茂椿侯建国侯祥麟侯虞钧胡英胡宏纹黄宪黄量黄葆同黄本立黄春辉黄鸣龙黄乃正黄维垣黄耀曾黄志镗黄子卿嵇汝运计亮年纪育沣江龙江明江元生姜圣阶蒋丽金蒋明谦蒋锡夔黎乐民李灿李方训李洪钟李静海梁敬魁梁树权梁晓天林国强林励吾林尚安刘若庄刘有成刘元方柳大纲楼南泉卢嘉锡卢佩章陆婉珍陆熙炎麻生明麦松威闵恩泽倪嘉缵彭少逸钱保功钱人元钱逸泰钱志道任咏华沙国河申泮文沈家骢沈天慧沈之荃时钧苏锵苏元复孙家钟唐敖庆唐有祺田昭武田中群佟振合万惠霖汪猷汪德熙汪尔康汪家鼎王夔王序王葆仁王方定王佛松吴奇吴浩青吴新涛吴学周吴养洁吴云东吴征铠武迟肖伦谢毓元邢其毅徐僖徐光宪徐如人徐晓白严东生颜德岳杨石先杨玉良姚建年姚守拙殷之文游效曾余国琮俞汝勤虞宏正袁权袁承业袁翰青恽子强曾昭抡张滂张存浩张大煜张礼和张乾二张青莲张玉奎赵承嘏赵玉芬赵宗燠郑兰荪支志明周其凤周同惠周维善朱道本朱起鹤朱清时朱亚杰庄长恭卓仁禧3 生命科学和医学学部(232)鲍文奎贝时璋秉志蔡翘蔡旭蔡邦华曹天钦曹文宣常文瑞陈桢陈竺陈凤桐陈华癸陈焕镛陈可冀陈世骧陈慰峰陈文贵陈文新陈晓亚陈宜瑜陈宜张陈中伟陈子元承淡安戴芳澜戴松恩邓叔群邓子新丁颖方精云方荣祥方心芳冯德培冯兰洲冯泽芳高尚荫龚岳亭郭爱克韩济生韩启德郝水贺林贺福初洪德元洪国藩洪孟民侯光炯侯学煜胡经甫黄家驷黄祯祥蒋有绪金国章金善宝鞠躬孔祥复匡廷云黎尚豪李博李朝义李季伦李继侗李家洋李竟雄李连捷李庆逵李振声梁希梁伯强梁栋材梁植权梁智仁林镕林其谁林巧稚刘承钊刘崇乐刘建康刘瑞玉刘思职刘新垣刘以训刘允怡娄成后卢永根陆宝麟陆士新罗宗洛马世骏马文昭毛江森钮经义潘菽庞雄飞裴钢蒲蛰龙戚正武钱崇澍强伯勤钦俊德秦仁昌邱式邦裘法祖裘维蕃饶子和沈岩沈其震沈善炯沈允钢沈韫芬沈自尹盛彤笙施教耐施立明施履吉施蕴渝石元春宋大祥苏国辉孙大业孙汉董孙曼霁孙儒泳谈家桢汤飞凡汤佩松唐崇惕唐守正唐仲璋田波童第周童坦君涂治汪堃仁汪忠镐王大成王德宝王恩多王伏雄王家楫王善源王世真王文采王应睐王正敏王志均王志新王志珍魏曦魏江春魏于全吴旻吴常信吴建屏吴阶平吴孟超吴英恺吴征镒吴中伦吴祖泽伍献文萧龙友谢联辉谢少文熊毅徐冠仁徐国钧许根俊许智宏薛社普阎隆飞阎逊初阳含熙杨简杨福愉杨弘远杨惟义杨雄里姚錱姚开泰叶桔泉叶玉如殷宏章尹文英印象初于天仁俞大绂俞德浚曾毅曾呈奎曾益新翟中和张春霆张广学张景钺张启发张树政张锡钧张香桐张孝骞张新时张亚平张永莲张友尚张肇骞张致一赵尔宓赵国屏赵洪璋赵善欢郑光美郑国锠郑儒永郑守仪郑万钧郑作新钟惠澜周俊周廷冲周泽昭朱洗朱既明朱壬葆朱兆良朱祖祥朱作言诸福棠庄巧生庄孝僡邹冈邹承鲁4 地学部(192)安芷生常印佛巢纪平陈旭陈顒陈国达陈俊勇陈梦熊陈庆宣陈述彭陈永龄陈运泰程纯枢程国栋程裕淇池际尚丑纪范戴金星邓起东丁国瑜丁仲礼董申保方俊冯景兰冯士筰符淙斌傅承义傅家谟高俊高由禧高振西谷德振顾功叙顾知微关士聪郭承基郭令智郭文魁郝诒纯何作霖侯德封侯仁之胡敦欣黄秉维黄汲清黄荣辉黄绍显贾承造贾福海贾兰坡金玉?金振民乐森璕李钧李崇银李春昱李德仁李德生李吉均李曙光李四光李廷栋李小文李星学林学钰刘宝珺刘昌明刘东生刘光鼎刘嘉麒刘振兴卢衍豪陆大道吕达仁马瑾马杏垣马在田马宗晋毛汉礼孟宪民穆恩之欧阳自远裴文中秦大河秦馨菱秦蕴珊邱占祥任纪舜任美锷戎嘉余沈其韩盛金章施雅风石耀霖斯行健宋叔和苏纪兰孙枢孙大中孙殿卿孙鸿烈孙云铸谭其骧陶诗言滕吉文田奇田在艺童庆禧涂长望涂传诒涂光炽汪集旸汪品先王仁王水王颖王钰王德滋王恒升王鸿祯王铁冠王曰伦王之卓王竹泉魏奉思文圣常翁文波吴传钧吴国雄吴汝康吴新智伍荣生武衡席承藩夏坚白肖序常谢家荣谢学锦谢义炳徐仁徐冠华徐克勤徐世浙许杰许厚泽许志琴薛禹群杨起杨文采杨钟健杨遵仪姚振兴业治铮叶大年叶笃正叶嘉安叶连俊殷鸿福尹赞勋於崇文俞建章袁道先袁见齐岳希新曾庆存曾融生翟裕生张本仁张炳熹张伯声张国伟张弥曼张彭熹张文佑张宗祜章申赵柏林赵金科赵九章赵鹏大赵其国郑度钟大赉周立三周明镇周廷儒周秀骥周志炎朱夏朱日祥朱显谟竺可桢5 信息技术科学部(82)包为民保铮陈桂林陈国良陈翰馥陈俊亮陈星弼陈星旦褚君浩戴汝为董韫美冯纯伯干福熹高庆狮郭雷郭光灿何积丰侯洵侯朝焕黄琳黄宏嘉黄民强黄纬禄简水生匡定波雷啸霖李未李启虎李衍达李志坚梁思礼林惠民林为干林尊琪刘盛纲刘颂豪刘永坦陆汝钤陆元九罗沛霖母国光彭堃墀秦国刚阙端麟沈绪榜宋健孙钟秀唐稚松王圩王选王越王大珩王家骐王启明王守觉王守武王阳元王育竹王占国王之江吴德馨吴宏鑫吴培亨吴全德夏建白夏培肃薛永祺杨芙清杨嘉墀姚建铨叶培大张钹张煦张景中张嗣瀛张效祥郑耀宗郑有炓周炳琨周巢尘周兴铭朱中梁6 技术科学部(204)毕德显蔡昌年蔡方荫蔡金涛蔡其巩蔡睿贤曹楚南曹春晓曹建猷常迵陈达陈创天陈芳允陈能宽陈新民陈学俊陈宗基陈祖煜程耿东程庆国程孝刚褚应璜慈云桂戴念慈党鸿辛邓锡铭丁舜年都有为窦国仁范守善高景德高为炳高玉臣高镇同葛昌纯龚祖同顾秉林顾诵芬顾逸东郭可信过增元韩祯祥侯德榜胡海昌胡文瑞胡聿贤黄克智黄文熙姜中宏蒋民华金展鹏靳树梁柯俊雷天觉李强李天李薰李国豪李济生李敏华李述汤李文采李依依梁守盘梁思成林皋林秉南林兰英刘宝镛刘敦桢刘高联刘广均刘恢先刘仙洲柳百新卢柯卢强卢肇钧路甬祥吕保维马祖光毛鹤年茅以升孟少农孟昭英苗永瑞闵桂荣欧阳予潘际銮潘家铮彭一刚齐康钱宁钱令希钱钟韩邱大洪任新民邵象华沈鸿沈志云沈珠江师昌绪石青云石志仁史绍熙宋家树宋玉泉宋振骐孙钧孙德和孙家栋唐九华唐叔贤陶宝祺陶亨咸陶文铨童宪章屠守锷汪耕汪胡桢汪菊潜汪闻韶王补宣王崇愚王大中王淀佐王景唐王立鼎王希季王之玺魏寿昆温诗铸闻邦椿吴承康吴良镛吴硕贤吴学蔺吴仲华吴自良伍小平肖纪美谢光选邢球痕熊有伦徐采栋徐建中徐士高徐性初徐芝纶徐祖耀许学彦薛其坤严恺严陆光颜鸣皋杨卫杨槱杨叔子杨廷宝姚熹叶恒强叶培建叶渚沛余梦伦俞鸿儒张维张泽张楚汉张德庆张恩虬张光斗张沛霖张兴钤张佑启张钟俊张作梅章名涛章梓雄赵淳生赵飞克赵仁恺郑时龄郑哲敏支秉彝钟万勰钟香崇周远周仁周本濂周干峙周国治周惠久周锡元周孝信周尧和周志宏朱静朱森元朱位秋朱物华庄逢辰庄育智邹世昌邹元爔7 外籍院士(28)巴顿伯奇费尔陈省身崔琦德泰丁肇中冯元桢傅睿思高锟葛守仁何毓琦黄煦涛霍克弗尔特霍西金斯简悦威杰尔井口洋夫科顿克里斯琴森库什莱恩雷文黎念之李约瑟李政道利翁斯林家翘林同炎罗伯特.康马库斯毛河光米歇尔莫里茨潘诺夫斯基丘成桐萨支唐沈元壤司马贺田长霖威利威塞尔吴健雄吴耀祖肖荫堂辛克维奇杨振宁姚期智张立纲张永山朱棣文朱经武卓以和中国科学院新增院士名单数学物理学部(6人):张伟平43 基础数学南开大学龙以明58 数学南开大学王恩哥50 凝聚态物理中国科学院物理研究所邢定钰62 凝聚态物理南京大学吴岳良45 理论物理中国科学院理论物理研究所俞昌旋65 等离子体物理中国科学技术大学化学学部(6人)张希41 高分子化学和物理清华大学宋礼成69 有机化学南开大学段雪50 化工(应用化学)北京化工大学赵东元44 物理化学复旦大学柴之芳64 放射化学中国科学院高能物理研究所高松43 无机化学北京大学生命科学与医学学部(7人)孟安明43 发育生物学清华大学赵进东50 植物生理学、藻类学北京大学武维华50 植物生理中国农业大学陈润生66 生物信息学中国科学院生物物理研究所杨焕明54 基因组学中国科学院北京基因组研究所张明杰40 结构生物学香港科技大学谢华安65 植物遗传育种福建省农业科学院地学部(4人)张经49 化学海洋学与海洋生物地球化学华东师范大学周卫健54 放射性碳年代学与全球变化中国科学院地球环境研究所姚檀栋52 冰川环境与全球变化中国科学院青藏高原研究所穆穆52 大气动力学中国科学院大气物理研究所信息科学与技术学部:1人技术科学学部:5人姓名学部学校评定年份何积丰信息技术科学部华东师范大学 2005吴培亨信息技术科学部南京大学 2005张钹信息技术科学部清华大学 1995俞昌旋数学物理学部中国科学技术大学 2007张伟平数学物理学部南开大学 2007邢定钰数学物理学部南京大学 2007龙以明数学物理学部南开大学 2007彭实戈数学物理学部山东大学 2005王诗宬数学物理学部北京大学 2005张家铝数学物理学部中国科学技术大学 2005张裕恒数学物理学部中国科学技术大学 2005龚昌德数学物理学部南京大学 2005葛墨林数学物理学部南开大学 2003陆埮数学物理学部南京大学 2003陈木法数学物理学部北京师范大学 2003洪家兴数学物理学部复旦大学 2003陶瑞宝数学物理学部复旦大学 2003邝宇平数学物理学部清华大学 2003朱邦芬数学物理学部清华大学 2003赵光达数学物理学部北京大学 2001周又元数学物理学部中国科学技术大学 2001邹广田数学物理学部吉林大学 2001田刚数学物理学部北京大学 2001王迅数学物理学部复旦大学 1999文兰数学物理学部北京大学 1999杨应昌数学物理学部北京大学 1997陈难先数学物理学部北京科学技术大学 1997陈希孺数学物理学部中国科学技术大学 1997孙义燧数学物理学部南京大学 1997方成数学物理学部南京大学 1995李大潜数学物理学部复旦大学 1995刘应明数学物理学部四川大学 1995霍裕平数学物理学部郑州大学 1993吴杭生数学物理学部中国科学技术大学 1993严志达数学物理学部南开大学 1993周恒数学物理学部天津大学 1993陈佳洱数学物理学部北京大学 1993张恭庆数学物理学部北京大学 1991张淑仪数学物理学部南京大学 1991潘承洞数学物理学部山东大学 1991王业宁数学物理学部南京大学 1991王梓坤数学物理学部北京师范大学、汕头大学 1991杨福家数学物理学部复旦大学 1991李家明数学物理学部清华大学 1991廖山涛数学物理学部北京大学 1991闵乃本数学物理学部南京大学 1991甘子钊数学物理学部北京大学 1991郭仲衡数学物理学部北京大学 1991胡和生数学物理学部复旦大学 1991经福谦数学物理学部西南交通大学,西南科技大学 1991 吴式枢数学物理学部吉林大学 1980夏道行数学物理学部复旦大学 1980谢希德数学物理学部复旦大学 1980徐叙瑢数学物理学部北方交通大学 1980曲钦岳数学物理学部南京大学 1980沈元数学物理学部北京航空航天大学 1980唐孝威数学物理学部浙江大学 1980魏荣爵数学物理学部南京大学 1980胡济民数学物理学部北京大学 1980黄祖洽数学物理学部北京师范大学 1980姜伯驹数学物理学部北京大学 1980卢鹤绂数学物理学部复旦大学 1980程民德数学物理学部北京大学 1980冯端数学物理学部南京大学 1980谷超豪数学物理学部复旦大学 1980余瑞璜数学物理学部吉林大学 1955周培源数学物理学部北京大学 1955周同庆数学物理学部复旦大学 1955王湘浩数学物理学部吉林大学 1955王竹溪数学物理学部北京大学 1955许宝騄数学物理学部北京大学 1955叶企孙数学物理学部北京大学 1955苏步青数学物理学部复旦大学 1955李国平数学物理学部武汉大学 1955钱临照数学物理学部中国科技大学 1955钱伟长数学物理学部上海大学 1955饶毓泰数学物理学部北京大学 1955段学复数学物理学部北京大学 1955胡宁数学物理学部北京大学 1955江泽涵数学物理学部北京大学 1955陈建功数学物理学部杭州大学 1955张亚平生物学部云南大学 2003郑光美生物学部北京师范大学 2003饶子和生物学部清华大学 2003魏于全生物学部四川大学 2003刘允怡生物学部香港中文大学 2003梁智仁生物学部香港大学 2001孙大业生物学部河北师范大学 2001叶玉如生物学部香港科技大学 2001陈文新生物学部中国农业大学 2001张启发生物学部华中农业大学 1999孔祥复生物学部香港大学 1999宋大祥生物学部河北大学 1999苏国辉生物学部香港大学 1999沈自尹生物学部上海医科大学 1997施蕴渝生物学部中国科学技术大学 1997 韩启德生物学部北京大学 1997庞雄飞生物学部华南农业大学 1997徐国钧生物学部中国药科大学 1995张春霆生物学部天津大学 1995陈慰峰生物学部北京大学医学部 1995 陈宜张生物学部第二军医大学 1995李季伦生物学部中国农业大学 1995吴常信生物学部中国农业大学 1995陈竺生物学部上海第二医科大学 1995 裘法祖生物学部同济医科大学 1993孙儒泳生物学部北京师范大学 1993韩济生生物学部北京大学医学部 1993 郝水生物学部东北师范大学 1993李博生物学部内蒙古大学 1993卢永根生物学部华南农业大学 1993石元春生物学部中国农业大学 1991吴孟超生物学部第二军医大学 1991阎隆飞生物学部中国农业大学 1991杨弘远生物学部武汉大学 1991姚开泰生物学部湖南医科大学 1991翟中和生物学部北京大学 1991鞠躬生物学部第四军医大学 1991强伯勤生物学部中国协和医科大学 1991 唐崇惕生物学部厦门大学 1991谢联辉生物学部福建农业大学 1991薛社普生物学部中国协和医科大学 1991 陈子元生物学部浙江农业大学 1991朱祖祥生物学部浙江农业大学 1980王志均生物学部北京医科大学 1980吴旻生物学部中国协和医科大学 1980吴阶平生物学部北京医科大学 1980赵善欢生物学部华南农业大学 1980郑国锠生物学部兰州大学 1980谈家桢生物学部复旦大学 1980唐仲璋生物学部厦门大学 1980汪堃仁生物学部北京师范大学 1980王世真生物学部协和医科大学 1980娄成后生物学部中国农业大学 1980蒲蛰龙生物学部中山大学 1980裘维蕃生物学部中国农业大学 1980陈华癸生物学部华中农业大学 1980陈中伟生物学部复旦大学 1980高尚荫生物学部武汉大学 1980梁植权生物学部中国协和医科大学 1980蔡旭生物学部北京农业大学 1980刘思职生物学部北京医学院 1957吴英恺生物学部北京协和医学院 1955赵洪璋生物学部西北农学院 1955周泽昭生物学部第一军医大学、重庆医学院 1955杨惟义生物学部江西农学院 1955俞大绂生物学部北京农业大学 1955张景钺生物学部北京大学 1955张孝骞生物学部中国医科大学 1955林巧稚生物学部北京协和医学院 1955梁伯强生物学部中山医学院 1955刘承钊生物学部四川医学院 1955马文昭生物学部北京医学院 1955涂治生物学部八一农学院 1955侯光炯生物学部西南农业大学 1955黄家驷生物学部中国医科大学、首都医科大学 1955李继侗生物学部内蒙古大学 1955李连捷生物学部北京农业大学 1955陈文贵生物学部四川医学院 1955承淡安生物学部江苏省中医学校 1955冯泽芳生物学部南京农学院 1955武维华生命科学和医学学部中国农业大学 2007赵进东生命科学和医学学部北京大学 2007孟安明生命科学和医学学部清华大学 2007曾益新生命科学和医学学部中山大学肿瘤防治中心 2005 童坦君生命科学和医学学部北京大学医学部 2005方精云生命科学和医学学部北京大学 2005邓子新生命科学和医学学部上海交通大学 2005贺林生命科学和医学学部上海交通大学 2005汪忠镐生命科学和医学学部首都医科大学附属宣武医院 2005 王正敏生命科学和医学学部复旦大学附属眼耳鼻喉科医院 2005 程时杰技术科学部华中科技大学 2007祝世宁技术科学部南京大学 2007胡海岩技术科学部南京航空航天大学 2007王克明技术科学部山东大学 2007任露泉技术科学部吉林大学 2007陶文铨技术科学部西安交通大学 2005薛其坤技术科学部中国科学院物理研究所、清华大学 2005吴硕贤技术科学部华南理工大学 2005李述汤技术科学部香港城市大学 2005赵淳生技术科学部南京航空航天大学 2005都有为技术科学部南京大学 2005彭堃墀技术科学部山西大学 2003金展鹏技术科学部中南大学 2003郭光灿技术科学部中国科学技术大学 2003章梓雄技术科学部香港大学 2003黄琳技术科学部北京大学 2003陈国良技术科学部中国科学技术大学 2003范守善技术科学部清华大学 2003郑有炓技术科学部南京大学 2003朱位秋技术科学部浙江大学 2003杨卫技术科学部清华大学 2003秦国刚技术科学部北京大学 2001张楚汉技术科学部清华大学 2001郑时龄技术科学部同济大学 2001庄逢辰技术科学部解放军装备指挥技术学院 2001葛昌纯技术科学部北京科技大学 2001柳百新技术科学部清华大学 2001马祖光技术科学部哈尔滨工业大学 2001高玉臣技术科学部北方交通大学 2001陈达技术科学部南京航空航天大学 2001唐叔贤技术科学部香港城市大学 2001陶宝祺技术科学部南京航空航天大学 1999温诗铸技术科学部清华大学 1999张佑启技术科学部香港大学 1999郑耀宗技术科学部香港大学 1999顾秉林技术科学部清华大学 1999韩祯祥技术科学部浙江大学 1999刘高联技术科学部上海大学 1999刘颂豪技术科学部华南师范大学 1999陈星弼技术科学部电子科技大学 1999张嗣瀛技术科学部东北大学 1997林皋技术科学部大连理工大学 1997宋玉泉技术科学部吉林工业大学 1997伍小平技术科学部中国科学技术大学 1997姚建铨技术科学部天津大学 1997过增元技术科学部清华大学 1997雷啸霖技术科学部上海交通大学 1997李未技术科学部北京航空航天大学 1997朱静技术科学部清华大学 1995徐祖耀技术科学部上海交通大学 1995张景中技术科学部广州师范学院 1995周国治技术科学部北京科技大学 1995王立鼎技术科学部大连理工大学 1995王阳元技术科学部北京大学 1995熊有伦技术科学部华中理工大学 1995冯纯伯技术科学部东南大学 1995简水生技术科学部北方交通大学 1995彭一刚技术科学部天津大学 1995沈珠江技术科学部清华大学 1995程耿东技术科学部大连理工大学 1995王崇愚技术科学部清华大学 1993王大中技术科学部清华大学 1993钟万勰技术科学部大连理工大学 1993周兴铭技术科学部国防科技大学 1993齐康技术科学部东南大学 1993石青云技术科学部北京大学 1993钟香崇技术科学部郑州大学 1991周炳琨技术科学部清华大学 1991周尧和技术科学部西北工业大学、上海交通大学 1991 吴全德技术科学部北京大学 1991杨芙清技术科学部北京大学 1991杨叔子技术科学部华中理工大学 1991姚熹技术科学部西安交通大学、同济大学 1991孙钟秀技术科学部南京大学 1991王选技术科学部北京大学 1991王越技术科学部北京理工大学 1991闻邦椿技术科学部东北大学 1991邱大洪技术科学部大连理工大学 1991阙端麟技术科学部浙江大学 1991沈志云技术科学部西南交通大学 1991宋振骐技术科学部山东矿业学院 1991孙钧技术科学部同济大学 1991母国光技术科学部南开大学 1991李衍达技术科学部清华大学 1991。
[至本医疗靠独创的生物信息分析算法和大数据平台称雄基因检测领域]今珠生物公司靠不靠谱
[至本医疗靠独创的生物信息分析算法和大数据平台称雄基因检测领域]今珠生物公司靠不靠谱原标题:至本医疗:靠独创的生物信息分析算法和大数据平台称雄基因检测领域文/阿基苹果公司创始人史蒂夫·乔布斯是世界上最早尝试基因检测治疗癌症的人。
2004年,当他发现自己被确诊患有胰腺癌后,曾花费10万美元,请哈佛大学几个教授帮助自己进行了基因检测,延续了8年的寿命,创造了癌症治疗的奇迹。
2022年,在风险资本的帮助下,当年帮助乔布斯进行基因检测的那几位哈佛大学教授创办了基因检测创业公司FoundationMedicine(以下简称:FMI),比尔·盖茨、GoogleVenture都是它的股东。
2022年,FMI成功在美国纳斯达克上市。
FMI从创办之初到现在,一直在引领全球精准医疗的革命,直接影响了全球10几万患者的治疗,以及数十个创新药物的研发。
基因检测技术发展到今天,不仅在治疗上有重大意义,在疾病预防上同样至关重要。
2022年5月,奥斯卡影后安吉丽娜·朱莉发现自己有患乳腺癌的风险,她通过基因检测和相应的手术将患病风险从87%降到了5%。
美国是基因检测技术最发达,商用化程度最高,以及政策最开放的国家,Illumina、FMI、LifeTechnologie和23andMe等公司是全球基因检测领域的领头羊。
中国是在基因检测技术领域追赶美国的国家之一,一大批新创公司在近几年成立。
至本医疗(上海)科技有限公司(以下简称:至本医疗)是目前中国领先的头部基因检测技术公司,它的创始人王凯在FMI成立之初就加入进去,后来成为其主要技术负责人之一,同时,他也是FMI负责企业文化制定的7人委员会成员。
可以说,至本医疗是国内最具有FMI气质的基因检测公司。
图:至本医疗创始人王凯2022年,随着中国十三五规划中写入“精准医疗”等内容,基因检测在中国发展的政策大门被打开,王凯看到了机会,在家人的支持下,放弃了在美国的优渥工作和生活,返回中国创业,成立了至本医疗。
复杂疾病关联分析进展
comp lex d iseases in popu lations w ith large numb er of samp les T he p resen t pap er briefly describes th e resu lts of the m erg ing who le genom e associat ion study, and som e n ew m ethods app li cab le to d ata in clud ing m u lt ip le loci
p lore th e associations bet w een hun dred s of poly m orph ism s in the hum an genom e , th e In ternational H apM ap P ro ject ,
K ey w ords : co m plex disease ;
[4 , 5]
常 见疾 病 常 见 变
, 即 多个基因 上的多 个常 见 多态 [一 般 为 单 ( s ing le nucleot ide polymorph ism,
核苷 酸 多 态 性
SNP ) , 少见等 位 基因 频 率超 过 1% ] 从遗 传 上 影 响 了 疾病 的发 生 发展 , 近期 的 一项 荟 萃分 析 支持 了 这
po ly m orph ism; hap lotype ; who le genom e assoc iation A cta A cad M ed Sin, 2006, 28( 2): 271- 277
[ 1]
50%
。从 完成的人 类 基 因 组序 列 中 发 现, 任 何 两
复杂疾病研究中的问题
第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会
第六届全国生物信息学与系统生物学学术大会
暨国际生物信息学前沿研讨会
会议时间:2014年10月6日— 9日
会议地点:南京市中山东路307号钟山宾馆(江苏省会议中心)
会议日程概要
会议期间联系:侯越,谢建明,孙啸
会议日程
3
四、主题报告、专题报告(三)10月7日下午,309会议室
五、10月8日上午, 三楼大会堂
六、主题报告、专题报告(四)10月8日下午,307会议室
5
八、主题报告、专题报告(六)10月8日下午,309会议室
九、会议墙报交流10月8日晚上,20:00开始,金陵厅
十、青年沙龙10月8日晚上,20:00开始,307会议室
欢迎青年科研工作者参加。
7
十一、10月9日上午, 三楼大会堂。
中国科学院院士
中国科学院院士中国科学院院士中国科学院院士,原称“中国科学院学部委员”,1993年10月改为现名,中国大陆最优秀的科学精英和学术权威,中国科学院院士从国内外最优秀的科学家中选出,每两年增选一次。
1955年随“中国科学院学部”的成立,中国科学院产生第一批院士;自1994年开始,增选外籍院士。
1993年随着中国工程院的成立,部分院士既为“中国科学院院士”也为“中国工程院院士”。
自1955年开始,到2003年止,中国科学院共产生10批共计1027名院士。
院士列表(自1994年~2002年,共产生5批46名外籍院士。
)数学物理学部(191)艾国祥白以龙蔡诗东陈彪陈和生陈佳洱陈建功陈建生陈景润陈木法陈难先陈式刚陈希孺程开甲程民德崔尔杰戴传曾戴元本邓稼先丁大钊丁伟岳丁夏畦段学复范海福方成方守贤冯端冯康甘子钊葛墨林葛庭燧龚昌德谷超豪关肇直管惟炎郭柏灵郭尚平郭永怀郭仲衡郝柏林何泽慧何祚庥贺贤土洪朝生洪家兴胡宁胡和生胡济民胡仁宇胡世华华罗庚黄昆黄润乾黄胜年黄祖洽霍裕平江泽涵姜伯驹解思深金建中经福谦柯召邝宇平李林李邦河李大潜李德平李方华李国平李家春李家明李惕碚李荫远李正武廖山涛林群林同骥刘应明卢鹤绂陆埮陆启铿陆学善吕敏马大猷马志明闵乃本欧阳钟灿潘承洞彭桓武彭实戈蒲富恪钱临照钱三强钱伟长钱学森曲钦岳饶毓泰沈元沈文庆沈学础施汝为石钟慈苏步青苏定强苏肇冰孙义燧谈镐生汤定元唐孝威陶瑞宝田刚童秉纲万哲先汪承灏汪德昭王迅王元王承书王鼎盛王淦昌王乃彦王诗宬王世绩王绶琯王湘浩王业宁王竹溪王梓坤魏宝文魏荣爵文兰吴杭生吴式枢吴文俊吴有训席泽宗夏道行冼鼎昌肖健谢家麟谢希德熊大闰徐叙瑢徐至展许宝騄严济慈严加安严志达杨乐杨澄中杨福家杨国桢杨立铭杨应昌叶朝辉叶企孙叶叔华应崇福于渌于敏余瑞璜詹文龙张杰张殿琳张恭庆张涵信张焕乔张家铝张仁和张淑仪张文裕张钰哲张裕恒张宗燧张宗烨章综赵光达赵忠贤赵忠尧郑厚植周恒周光召周培源周同庆周又元周毓麟朱邦芬朱光亚朱洪元庄逢甘邹广田化学部(175)白春礼蔡镏生蔡启瑞曹镛曹本熹查全性陈懿陈冠荣陈洪渊陈家镛陈鉴远陈俊武陈凯先陈庆云陈荣悌陈茹玉陈新滋陈耀祖程津培程镕时戴安邦戴立信邓从豪邓景发方肇伦费维扬冯守华冯新德傅鹰高鸿高济宇高世扬高小霞高怡生高振衡顾翼东郭景坤郭慕孙郭燮贤何炳林何国钟何鸣元洪茂椿侯建国侯祥麟侯虞钧胡英胡宏纹黄宪黄量黄葆同黄本立黄春辉黄鸣龙黄乃正黄维垣黄耀曾黄志镗黄子卿嵇汝运计亮年纪育沣江龙江明江元生姜圣阶蒋丽金蒋明谦蒋锡夔黎乐民李灿李方训李洪钟李静海梁敬魁梁树权梁晓天林国强林励吾林尚安刘若庄刘有成刘元方柳大纲楼南泉卢嘉锡卢佩章陆婉珍陆熙炎麻生明麦松威闵恩泽倪嘉缵彭少逸钱保功钱人元钱逸泰钱志道任咏华沙国河申泮文沈家骢沈天慧沈之荃时钧苏锵苏元复孙家钟唐敖庆唐有祺田昭武田中群佟振合万惠霖汪猷汪德熙汪尔康汪家鼎王夔王序王葆仁王方定王佛松吴奇吴浩青吴新涛吴学周吴养洁吴云东吴征铠武迟肖伦谢毓元邢其毅徐僖徐光宪徐如人徐晓白严东生颜德岳杨石先杨玉良姚建年姚守拙殷之文游效曾余国琮俞汝勤虞宏正袁权袁承业袁翰青恽子强曾昭抡张滂张存浩张大煜张礼和张乾二张青莲张玉奎赵承嘏赵玉芬赵宗燠郑兰荪支志明周其凤周同惠周维善朱道本朱起鹤朱清时朱亚杰庄长恭卓仁禧生命科学和医学学部(232)鲍文奎贝时璋秉志蔡翘蔡旭蔡邦华曹天钦曹文宣常文瑞陈桢陈竺陈凤桐陈华癸陈焕镛陈可冀陈世骧陈慰峰陈文贵陈文新陈晓亚陈宜瑜陈宜张陈中伟陈子元承淡安戴芳澜戴松恩邓叔群邓子新丁颖方精云方荣祥方心芳冯德培冯兰洲冯泽芳高尚荫龚岳亭郭爱克韩济生韩启德郝水贺林贺福初洪德元洪国藩洪孟民侯光炯侯学煜胡经甫黄家驷黄祯祥蒋有绪金国章金善宝鞠躬孔祥复匡廷云黎尚豪李博李朝义李季伦李继侗李家洋李竟雄李连捷李庆逵李振声梁希梁伯强梁栋材梁植权梁智仁林镕林其谁林巧稚刘承钊刘崇乐刘建康刘瑞玉刘思职刘新垣刘以训刘允怡娄成后卢永根陆宝麟陆士新罗宗洛马世骏马文昭毛江森钮经义潘菽庞雄飞裴钢蒲蛰龙戚正武钱崇澍强伯勤钦俊德秦仁昌邱式邦裘法祖裘维蕃饶子和沈岩沈其震沈善炯沈允钢沈韫芬沈自尹盛彤笙施教耐施立明施履吉施蕴渝石元春宋大祥苏国辉孙大业孙汉董孙曼霁孙儒泳谈家桢汤飞凡汤佩松唐崇惕唐守正唐仲璋田波童第周童坦君涂治汪堃仁汪忠镐王大成王德宝王恩多王伏雄王家楫王善源王世真王文采王应睐王正敏王志均王志新王志珍魏曦魏江春魏于全吴旻吴常信吴建屏吴阶平吴孟超吴英恺吴征镒吴中伦吴祖泽伍献文萧龙友谢联辉谢少文熊毅徐冠仁徐国钧许根俊许智宏薛社普阎隆飞阎逊初阳含熙杨简杨福愉杨弘远杨惟义杨雄里姚錱姚开泰叶桔泉叶玉如殷宏章尹文英印象初于天仁俞大绂俞德浚曾毅曾呈奎曾益新翟中和张春霆张广学张景钺张启发张树政张锡钧张香桐张孝骞张新时张亚平张永莲张友尚张肇骞张致一赵尔宓赵国屏赵洪璋赵善欢郑光美郑国锠郑儒永郑守仪郑万钧郑作新钟惠澜周俊周廷冲周泽昭朱洗朱既明朱壬葆朱兆良朱祖祥朱作言诸福棠庄巧生庄孝僡邹冈邹承鲁地学部(192)安芷生常印佛巢纪平陈旭陈顒陈国达陈俊勇陈梦熊陈庆宣陈述彭陈永龄陈运泰程纯枢程国栋程裕淇池际尚丑纪范戴金星邓起东丁国瑜丁仲礼董申保方俊冯景兰冯士筰符淙斌傅承义傅家谟高俊高由禧高振西谷德振顾功叙顾知微关士聪郭承基郭令智郭文魁郝诒纯何作霖侯德封侯仁之胡敦欣黄秉维黄汲清黄荣辉黄绍显贾承造贾福海贾兰坡金玉金振民乐森璕李钧李崇银李春昱李德仁李德生李吉均李曙光李四光李廷栋李小文李星学林学钰刘宝珺刘昌明刘东生刘光鼎刘嘉麒刘振兴卢衍豪陆大道吕达仁马瑾马杏垣马在田马宗晋毛汉礼孟宪民穆恩之欧阳自远裴文中秦大河秦馨菱秦蕴珊邱占祥任纪舜任美锷戎嘉余沈其韩盛金章施雅风石耀霖斯行健宋叔和苏纪兰孙枢孙大中孙殿卿孙鸿烈孙云铸谭其骧陶诗言滕吉文田奇田在艺童庆禧涂长望涂传诒涂光炽汪集旸汪品先王仁王水王颖王钰王德滋王恒升王鸿祯王铁冠王曰伦王之卓王竹泉魏奉思文圣常翁文波吴传钧吴国雄吴汝康吴新智伍荣生武衡席承藩夏坚白肖序常谢家荣谢学锦谢义炳徐仁徐冠华徐克勤徐世浙许杰许厚泽许志琴薛禹群杨起杨文采杨钟健杨遵仪姚振兴业治铮叶大年叶笃正叶嘉安叶连俊殷鸿福尹赞勋於崇文俞建章袁道先袁见齐岳希新曾庆存曾融生翟裕生张本仁张炳熹张伯声张国伟张弥曼张彭熹张文佑张宗祜章申赵柏林赵金科赵九章赵鹏大赵其国郑度钟大赉周立三周明镇周廷儒周秀骥周志炎朱夏朱日祥朱显谟竺可桢信息技术科学部(82)包为民保铮陈桂林陈国良陈翰馥陈俊亮陈星弼陈星旦褚君浩戴汝为董韫美冯纯伯干福熹高庆狮郭雷郭光灿何积丰侯洵侯朝焕黄琳黄宏嘉黄民强黄纬禄简水生匡定波雷啸霖李未李启虎李衍达李志坚梁思礼林惠民林为干林尊琪刘盛纲刘颂豪刘永坦陆汝钤陆元九罗沛霖母国光彭堃墀秦国刚阙端麟沈绪榜宋健孙钟秀唐稚松王圩王选王越王大珩王家骐王启明王守觉王守武王阳元王育竹王占国王之江吴德馨吴宏鑫吴培亨吴全德夏建白夏培肃薛永祺杨芙清杨嘉墀姚建铨叶培大张钹张煦张景中张嗣瀛张效祥郑耀宗郑有炓周炳琨周巢尘周兴铭朱中梁技术科学部(204)毕德显蔡昌年蔡方荫蔡金涛蔡其巩蔡睿贤曹楚南曹春晓曹建猷常迵陈达陈创天陈芳允陈能宽陈新民陈学俊陈宗基陈祖煜程耿东程庆国程孝刚褚应璜慈云桂戴念慈党鸿辛邓锡铭丁舜年都有为窦国仁范守善高景德高为炳高玉臣高镇同葛昌纯龚祖同顾秉林顾诵芬顾逸东郭可信过增元韩祯祥侯德榜胡海昌胡文瑞胡聿贤黄克智黄文熙姜中宏蒋民华金展鹏靳树梁柯俊雷天觉李强李天李薰李国豪李济生李敏华李述汤李文采李依依梁守盘梁思成林皋林秉南林兰英刘宝镛刘敦桢刘高联刘广均刘恢先刘仙洲柳百新卢柯卢强卢肇钧路甬祥吕保维马祖光毛鹤年茅以升孟少农孟昭英苗永瑞闵桂荣欧阳予潘际銮潘家铮彭一刚齐康钱宁钱令希钱钟韩邱大洪任新民邵象华沈鸿沈志云沈珠江师昌绪石青云石志仁史绍熙宋家树宋玉泉宋振骐孙钧孙德和孙家栋唐九华唐叔贤陶宝祺陶亨咸陶文铨童宪章屠守锷汪耕汪胡桢汪菊潜汪闻韶王补宣王崇愚王大中王淀佐王景唐王立鼎王希季王之玺魏寿昆温诗铸闻邦椿吴承康吴良镛吴硕贤吴学蔺吴仲华吴自良伍小平肖纪美谢光选邢球痕熊有伦徐采栋徐建中徐士高徐性初徐芝纶徐祖耀许学彦薛其坤严恺严陆光颜鸣皋杨卫杨槱杨叔子杨廷宝姚熹叶恒强叶培建叶渚沛余梦伦俞鸿儒张维张泽张楚汉张德庆张恩虬张光斗张沛霖张兴钤张佑启张钟俊张作梅章名涛章梓雄赵淳生赵飞克赵仁恺郑时龄郑哲敏支秉彝钟万勰钟香崇周远周仁周本濂周干峙周国治周惠久周锡元周孝信周尧和周志宏朱静朱森元朱位秋朱物华庄逢辰庄育智邹世昌邹元爔外籍院士(51)巴顿伯奇费尔陈省身崔琦德泰丁肇中冯元桢傅睿思高锟葛守仁何毓琦黄煦涛霍克弗尔特霍西金斯简悦威杰尔井口洋夫科顿克里斯琴森库什莱恩雷文黎念之李约瑟李政道利翁斯林家翘林同炎罗伯特.康马库斯毛河光米歇尔莫里茨潘诺夫斯基丘成桐萨支唐沈元壤司马贺田长霖威利威塞尔吴健雄吴耀祖肖荫堂辛克维奇杨振宁姚期智张立纲张永山朱棣文朱经武卓以和新增名单数学物理学部(6人)张伟平43 基础数学南开大学龙以明58 数学南开大学王恩哥50 凝聚态物理中国科学院物理研究所邢定钰62 凝聚态物理南京大学吴岳良45 理论物理中国科学院理论物理研究所俞昌旋65 等离子体物理中国科学技术大学化学学部(6人)张希41 高分子化学和物理清华大学宋礼成69 有机化学南开大学段雪50 化工(应用化学)北京化工大学赵东元44 物理化学复旦大学柴之芳64 放射化学中国科学院高能物理研究所高松43 无机化学北京大学生命科学与医学学部(7人)孟安明43 发育生物学清华大学赵进东50 植物生理学、藻类学北京大学武维华50 植物生理中国农业大学陈润生66 生物信息学中国科学院生物物理研究所杨焕明54 基因组学中国科学院北京基因组研究所张明杰40 结构生物学香港科技大学谢华安65 植物遗传育种福建省农业科学院地学部(4人)张经49 化学海洋学与海洋生物地球化学华东师范大学周卫健54 放射性碳年代学与全球变化中国科学院地球环境研究所姚檀栋52 冰川环境与全球变化中国科学院青藏高原研究所穆穆52 大气动力学中国科学院大气物理研究所信息科学与技术学部:(1人)技术科学学部:(5人)2009名单当选院士(共35人,分学部按姓氏笔画为序)数学物理学部(6人)序号姓名年龄专业工作单位1 孙昌璞46 理论物理中国科学院理论物理研究所2 李安民62 数学四川大学3 罗俊52 引力物理华中科技大学4 郑晓静(女)51 力学兰州大学5 席南华46 数学中国科学院数学与系统科学研究院6 崔向群(女)57 天体物理中国科学院国家天文台南京天文光学技术研究所化学部(8人)序号姓名年龄专业工作单位1 万立骏51 物理化学中国科学院化学研究所2 包信和49 物理化学中国科学院大连化学物理研究所3 江雷44 无机化学中国科学院化学研究所4 江桂斌51 分析化学、环境化学中国科学院生态环境研究中心5 陈小明47 无机化学中山大学6 周其林52 有机化学南开大学7 唐本忠52 高分子化学与物理香港科技大学8 涂永强50 有机化学兰州大学生命科学和医学学部(5人)序号姓名年龄专业工作单位1 庄文颖(女)60 真菌学中国科学院微生物研究所2 尚永丰45子生物学北京大学3 林鸿宣48 作物遗传学中国科学院上海生命科学研究院4 侯凡凡(女)58 内科学(肾脏病学)南方医科大学5 隋森芳64 生物物理学清华大学地学部(5人)序号姓名年龄专业工作单位1 周卫健(女)56 宇宙成因核素与全球变化中国科学院地球环境研究所2 郑永飞49 地球化学中国科学技术大学3 莫宣学70 岩石学中国地质大学(北京)4 陶澍58 环境地理北京大学5 翟明国61 前寒武纪地质与变质地质学中国科学院地质与地球物理研究所信息技术科学部(4人)序号姓名年龄专业工作单位1 刘国治48 高功率微波中国核试验基地2 许宁生51 真空微纳光电子学中山大学3 怀进鹏46 计算机软件北京航空航天大学4 陈定昌72 导航、制导与控制中国航天科工集团科技委技术科学部(7人)序号姓名年龄专业工作单位1 于起峰51 实验力学、精密光测国防科学技术大学2 王曦42 材料科学中国科学院上海微系统与信息技术研究所3 王光谦47 水力学及河流动力学清华大学4 王自强70 固体力学中国科学院力学研究所5 王锡凡73 电力系统西安交通大学6 申长雨46具技术郑州大学7 刘竹生69 火箭总体设计中国航天科技集团公司第一研究院外籍院士(共6人,按学科领域排序)序号姓名年龄国籍专业工作单位1 菲立普·希阿雷Philippe G.Ciarlet71 法国应用数学香港城市大学2 哈迈德·泽维尔AhmedH. Zewail63 美国化学美国加州理工学院3 徐立之Lap-CheeTsui59 加拿大高等教育及基因研究香港大学4 郎尼·汤姆森LonnieThompson61 美国地学美国俄亥俄州立大学5 马佐平Tso-Ping Ma64 美国微纳电子科学美国耶鲁大学6王中林Zhong LinWang48 美国材料科学和纳米技术美国佐治亚理工学院2011名单中国科学院2011年12月9日下午在北京公布该院2011年院士增选结果,从314名有效候选人中,经材料公示、通信评审、会议评审暨选举和后续的审查确认、审议批准等环节,最终产生51名新院士,新当选院士平均年龄52.6岁。
生物信息学论文
生物信息学课程论文(2011学年下学期)论文题目:浅谈生物信息学的发展和前景班级:08生工3班学号:0809030308姓名:周永强摘要:生物信息学已成为整个生命科学发展的重要组成部分,成为生命科学研究的前沿。
本文对生物信息学的产生背景及其研究现状等方面进行了综述,并展望生物信息学的发展前景。
生物信息学的发展在国内、外基本上都处在起步阶段。
因此,这是我国生物学赶超世界先进水平的一个百年一遇的极好机会。
关键字:生物信息学、产生背景、发展现状、前景随着生物科学技术的迅猛发展,生物信息数据资源的增长呈现爆炸之势,同时计算机运算能力的提高和国际互联网络的发展使得对大规模数据的贮存、处理和传输成为可能,为了快捷方便地对已知生物学信息进行科学的组织、有效的管理和进一步分析利用,一门由生命科学和信息科学等多学科相结合特别是由分子生物学与计算机信息处理技术紧密结合而形成的交叉学科——生物信息学(Bioinformatics)应运而生,并大大推动了相关研究的开展, 被誉为“解读生命天书的慧眼”。
一、生物信息学产生的背景生物信息学是80年代未随着人类基因组计划(Human genome project)的启动而兴起的一门新的交叉学科。
它通过对生物学实验数据的获取、加工、存储、检索与分析,进而达到揭示数据所蕴含的生物学意义的目的。
由于当前生物信息学发展的主要推动力来自分子生物学,生物信息学的研究主要集中于核苷酸和氨基酸序列的存储、分类、检索和分析等方面,所以目前生物信息学可以狭义地定义为:将计算机科学和数学应用于生物大分子信息的获取、加工、存储、分类、检索与分析,以达到理解这些生物大分子信息的生物学意义的交叉学科。
事实上,它是一门理论概念与实践应用并重的学科。
生物信息学的产生发展仅有10年左右的时间---bioinformatics这一名词在1991年左右才在文献中出现,还只是出现在电子出版物的文本中。
事实上,生物信息学的存在已有30多年,只不过最初常被称为基因组信息学。
生物信息学_高通量测序技术及数据分析_陈润生院士 ppt课件
背景介绍
• 高通量测序数据格式
– fastq
Q =-10 log10(p) OR Q =-10 log10[p/(1-p)] (p:碱基错误率) 字符的ASCII值 - 64 = 质量值 OR 字符的ASCII值 - 33 = 质量值
NCBI/Sanger or Illumina 1.8 and later. Using a Phred scale encoded using ASCII 33 to 93. This is the standard for fastq formats except for the early Illumina data formats (this changed with version 1.8 of the Illumina Pipeline). Illumina Pipeline 1.2 and earlier. Using a Solexa/Illumina scale (-5 to 40) using ASCII 59 to 104. The Workbench automatically converts these quality scores to the Phred scale on import in order to ensure a common scale for analyses across data sets from different platforms (see details on the conversion next to the sample below). Illumina Pipeline 1.3 and 1.4. Using a Phred scale using ASCII 64 to 104. Illumina Pipeline 1.5 to 1.7. Using a Phred scale using ASCII 64 to 104. Values 0 (@) and 1 (A) are not used anymore. Value 2 (B) has special meaning and is used as a trim clipping. This means that when selecting Illumina Pipeline 1.5 and later, the reads are trimmed when a B is encountered in the input the Trim reads option is checked. 36 39 39 39 39 39 39 39 39 39 38 39 39 生36物36信3息4 3学4 _2高9 3通1 量2 2测0 序20技19术1及9 1数9 据38分38析38 36 36 36 36 36 36 30 32 35 35
信息领域专家
陈润生:是我国最早从事理论生物学和生物信息学研究的科研人员之一。
二十多年来在生物信息学领域进行了系统的研究,曾参加我国第一个完整基因组泉生热袍菌B4基因组序列的组装和基因标识,曾参加人类基因组1%和水稻基因组工作草图的研究。
共发表学术论文100余篇,自1996年以来在国际学术会议上共作大会报告及分组会报告十余次。
*. 杨焕明:杨焕明教授一直从事基因组科学的研究。
他主持完成的―人类基因组计划—中国卷‖使中国成为这一被称为―二十世纪登月计划‖的宏伟项目的成员国,得到了各国领导人和国际科学界的高度赞扬。
杨焕明教授及其团队―华大基因‖)所承担的人类基因组、水稻基因组以及家猪、家鸡、家蚕基因组等重大项目使我国的基因组研究得以跻身于世界前沿。
2003年,―华大基因‖又在水稻基因组完成图、家蚕基因组―框架图‖的绘制以及SARS冠状病毒的基因组研究及建立诊断方法都做出了新的成绩。
杨焕明教授还特别关注基因组研究的社会影响和基因知识的普及。
*. 罗静初:北京大学生物信息中心教授,博士生导师,欧洲分子生物学网络组织中国节点负责人,英国Briefings in Bioinformatics杂志编委。
1947年生,1970年毕业于北京大学生物系。
1986年起从事DNA和蛋白质序列计算机分析。
1987-89 赴美国马里兰大学进修访问,从事蛋白质分子模型和计算机在分子生物学中的应用研究。
1991-99先后5次赴英国帝国癌症研究所合作研究,从事蛋白质分子模型、蛋白质结构域分析和数据库构建、蛋白质回环数据库构建等研究。
1996年起主持和参加863、973、211、985,以及自然科学基金委、教育部、北京市科委等项目。
发表学术论文30多篇,主持翻译《生物信息学概论》、合作编写《生物信息学》、《分子生物学前沿技术》,开设―实用生物信息技术‖ 研究生课程。
郝柏林:郝柏林1934年6月生于北京市。
1959年毕业于乌克兰国立哈尔科夫大学物理数学系。
北京信息科学与技术国家研究中心
北京信息科学与技术国家研究中心Beijing National Research Center for Information Science and Technology简 报本期导读北京信息科学与技术国家研究中心团队工作会议举行李梢教授课题组的《Cell 》子刊论文被F1000推荐为“杰出论文”清华大学“复杂生物网络、中医药与关系推断”高层研讨会召开信息国家研究中心张学工教授当选第四届中国人工智能学会生物信息学与人工生命专委会主任委员生物信息学研究部积极开展学术交流信息国家研究中心开展信息楼安全工作大检查◆ 焦点要闻北京信息科学与技术国家研究中心团队工作会议举行6月5日中午,北京信息科学与技术国家研究中心团队工作会议在信息楼1-415会议室举行。
国家研究中心主任陆建华院士,副主任罗毅教授以及已经立项建设的21个团队和国家研究中心各研究部主任参加了会议。
罗毅主持会议,向与会人员介绍了国家研究中心建设情况,指出国家研究中心最主要的工作就是面向重大需求做出国家级别影响力的科研成果,团队是国家研究中心科研工作的“台柱子”和建设主线,目前启动的人才引进工作来源于团队需求,归属于团队建设,希望各团队积极配合国家研究中心的管理工作。
陆建华一一解答了各团队负责人的疑问,他在谈话中介绍了国家研究中心在人才引进,机构建设等方面获得学校支持的情况,着重阐述了国家研究中心在人员评价中正在执行的三维度“创新立方”改革措施,以及即将在项目评估中引入的“无干扰评估”新机制。
陆建华希望各团队明确定位,高度重视,主动适应,积极沟通,共同努力为国家信息科学基础研究突破和产业发展做出应有贡献。
北京信息科学与技术国家研究中心实施人员按照团队聘任的人事管理办法。
2018年底,中心通过院系推荐和评审立项21个研究团队,6月5日下午,后续3个团队通过了评审。
至此,国家研究中心围绕六个重点研究方向的首批研究团队建设立项工作完成。
接下来,国家研究中心将在跨学科团队策划组织、人才引进评聘办法、项目评估机制等工作中探索机制改革措施,实现人、财、物、管多方位服务科研、引导科研,多维聚焦推动实现国家信息科学技术发展的伟大使命。
等闲言语变瑰奇
25一段演讲可能语言鲜活幽默,也可能感情真挚,但如果没有正确的立意,就必然是失败的演讲。
南宋诗人戴复古说:“入妙文章本平澹,等闲言语变瑰奇。
”这一千古名句道破了作文的玄机:至为高妙的文章原本是质朴自然的,貌似平常的语言组织起来会变得瑰丽奇异。
一些优秀的演讲者也深谙此道,不追求华丽的辞藻,但求“平淡之中见奇崛,散淡之中见真知”的境界。
生物信息学家陈润生在一次演讲中讲道:“从我是一名普通科研人员起至今,我一直站在讲台上,年复一年地讲给学生听,33年来从未间断。
我就不知道当了院士后有什么区别,从来没有任何区别。
学生们满意是最让我感到欣慰的,我对获奖从来没有感觉,什么奖都无所谓。
我从事科研工作这么多年,从来没有在论文署名上有过争议,爱把我放哪儿就放哪儿。
我给自己取了个微信名叫‘微不足道’,我自己非常不乐意跟他们去争那些东西。
但正因为你脚踏实地,你没有吃任何亏,该得到的都会有,这些东西不是说你削尖脑袋去硬钻营就能得来的。
”陈润生由衷之言,发自肺腑,真诚讲述自己的生活态度,不慕名利,不计得失;但问耕耘,不问收获。
其实,耕耘不问收获,自有一路花香。
这一看似平淡无奇的演讲,实则如“随风潜入夜,润物细无声”的春雨般富有感染力,触人灵魂。
其功足以激浊扬清,师范众人,去摈弃那些令人浮躁的杂念,全神贯注地走好自己脚下的人生之路。
纳米材料专家江雷在一次演讲中讲道:“我在大学时代,就为一种‘红绿灯现象’所触动。
马路口遇到的第一个是红灯的话,以后遇到红灯的机会就会增多;反之,当第一个路口遇到的如果是绿灯,那么以后遇到绿灯的概率就会增加。
当绿灯变红之前,加速穿过路口,就有可能赶上下一个绿灯。
我的性格就是属于追赶绿灯一类的,攻读硕士期间,我提前一年进入实验室,提前拿到第一手的实验数据,这样,当后来的同学进入实验室时,我已经有了自己的实验数据。
着手写论文了。
我有一篇论文导师说可以和博士生论文比肩,且获得吉林大学‘青春杯’科技论文大赛特别奖。
新闻时事素材解读及适用话题
新闻时事素材解读及适用话题作者:孙俊强来源:《作文成功之路·高考冲刺》2022年第10期29道题全选“A”:让学生“相信自己”也是一道必考题江德斌29道选择题答案全部是“A”!近日,山东青岛平度市某学校一名90后数学老师制作了一份这样的试卷,并在社交媒体发布了此事,引发网友讨论。
这位老师称自己曾经在备考时,做练习题遇到过连着七八个选择题都选A,当时特别怀疑自己,所以这次如此设置考题,是想帮助学生树立自信,让学生相信自己。
这确实是一份难得一见的试卷,选择题答案都是“A”,估计一辈子也遇不到一次。
这张别出心裁的试卷是数学老师为学生量身定做的,对数学题的选项进行了重新编排,花费了不少时间。
这张特殊的试卷,也是数学老师给学生出的一道必考题,借此考验学生的心理承受力,测试学生的临场应变能力,增强学生的自信心。
学生每个学期都要经历许多次考试,正所谓久考成精,卷子刷多了,也会揣摩出题者的思路,总结出应试套路,特别是针对选择题,有很多做题“口诀”,比如,“多选B,少选C,尽量不选A和D”,“三长一短就选短,三短一长就选长。
两长两短就选b,参差不齐c无敌”等。
显然,如果遇到选择题选项都一样的时候,这种做题“口诀”就失灵了,毫无作用,反而会害了迷信“口诀”的学生。
还有一些学生自信心不足,总是怀疑自己,甚至因为过度疑虑而选错答案。
这份特别的试卷能提醒学生,不要过于迷信“口诀”,不要赌概率,应该相信自己。
(摘自2022年10月25日东方网有删节)【素材解读】在人生的道路上,会遇到很多意外和不可预测的事,这些也是人生的“必考题”,无法绕过,只能面对。
在这些特别的时候,就需要葆有自信心,理性思考,勇敢地面对问题、解决问题。
由此可见,这份特别试卷凸显了老师的良苦用心,不管学生的考试成绩如何,都会给他们留下深刻的记忆,让他们知晓,无论何时都要“相信自己”!这才是最难能可贵的“考试口诀”。
适用话题:教育自信直面问题81岁院士被排队要签名,这样的星该追伍璨课程8:30开始,6点半已经没有座位,整个礼堂都是坐满的,几乎每一届学生都会去追院士的课、找院士要签名……近日,话题“81岁院士课后被学生排长队要签名”登上微博热搜,网友纷纷留言点赞:“这样的星应该被追,这样的课必须火爆”“这种景象才是追星的正确打开方式”。
陈润生,生物信息学,考试总结
问题一:生物信息学的含义是什么?举一到两个例子说明你对生物信息学的哪方面感兴趣。
参考答案:生物信息学有三个方面的含义:1、它是一个学科领域,包含着基因组信息的获取、处理、存储、分配、分析和解释的所有方面。
2、生物信息学是把基因组DNA序列信息分析作为源头,破译隐藏在DNA序列中的遗传语言,特别是非编码区的实质;同时在发现了新基因信息之后进行蛋白质空间结构模拟和预测;其本质是识别基因信号。
3、生物信息学的研究目标是揭示“基因组信息结构的复杂性及遗传语言的根本规律”。
它是当今自然科学和技术科学领域中“基因组、“信息结构”和“复杂性”这三个重大科学问题的有机结合。
例子:怎样从新测得的DNA序列中找到编码区?非编码区与编码区的差别是什么?非编码区有什么具体功能?RNAi现象对于细胞来说有着很重要的意义,包括基因表达的调控等等,那么都有哪些具体机制可以诱导正常细胞产生RNAi现象?SARS病毒的比较基因组研究;治疗SARS的RNAi设计;SARS蛋白的结构预测和模拟。
问题二:有哪些数据库可以发现新基因,其本质是什么?参考答案:大部分新基因是靠理论方法预测出来的。
a)、利用NCBI中EST( E xpression Sequence Tag) 数据库(dbEST) 发现新基因和新SNPs。
国际上现已出现了几个基于EST的基因索引如UniGene, Merck-Gene, GenExpress-index . 其本质是: : 以一个序列片段为线索, 通过它和整个数据库的比较, 还原出全序列原貌。
当测序获得一条EST序列时,它来自哪一个基因的哪个区域是未知的(随机的),所以属于同一个基因的不同EST序列之间常有交叠的区域。
根据这种“交叠”现象,就能找出属于同一个基因的所有EST序列,进而将它们拼接成和完整基因相对应的全长cDNA序列。
b)、从基因组DNA序列中预测新ORF。
基于信号或基于组成。
问题三:1、基于核酸和蛋白质序列如何研究生物进化?2、主要步骤是什么?3、当前的主要困难是什么?参考答案:1、构建系统进化树。
陈润生,生物信息学,考试算法题总结
以下各题例子均来自老师的课件,看不明白的可以追本溯源。
O(∩_∩)O1.不完全酶切问题。
(10分)给定一个DNA片段经不完全酶切所得到的所有片段,求酶切位点。
举例说明:已知L={2,2,3,3,4,5,6,7,8,10},求各酶切位点X={0}。
首先将L中最大的数10挪到X中,因为10肯定是原始片段长度。
即L={2,2,3,3,4,5,6,7,8,10},X={0,10}。
然后取出8,在这里有两种可能情况,即处于0端或10端,我们任取一种,处于0端。
那么L中2和8被取出,X中添加2.即L={2,2,3,3,4,5,6,7,8,10},X={0,2,10}。
然后再取出7,因为没有1,所以这一位点不在0端,而在10端。
由此出现片段3,5,7,将他们从L中取出。
即L={2,2,3,3,4,5,6,7,8,10},X={0,2,7,10}。
再看片段6,有三个可能性出现6片段,即切割位点在4,6或8 。
由于如果在6或8,必有1片段,所以舍弃。
选位点4.这样产生了片段2,3,4,6.将它们从L中取出。
即L={2,2,3,3,4,5,6,7,8,10},X={0,2,4,7,10}。
这样就得到了最终结果X。
2.最短superstring问题。
(10分)给出一个superstring的3mer谱,分别用欧拉图和汉密尔顿图找出最短的superstring。
例如,已知S={ATG,TGG,TGC,GTG,GGC,GCA,GCG,CGT}。
求最短路径。
(1)用汉密尔顿图:比如ATG的后两位和TGC的前两位相同,则由ATG向TGC画箭头。
ATG TGG TGC GTG GGC GCA GCG CGT由此得到两条路径:(2)用欧拉图:将所给每个三联体分割成两个二联体(如ATG分成AT和TG),去除冗余,得到{AT TG GC GG GT CA CG}将能够形成已有三联体的两个二联体间画箭头,比如从TG始,已知有TGG和TGC,则由TG向GG和GC画箭头。
陈润生-大数据与精准医学
“I want the country that eliminated polio and mapped the human genome to lead a new era of medicine — one that delivers the right treatment at the right time. In some patients with cystic fibrosis, this approach has reversed a disease once thought unstoppable. Tonight, I’m launching a new Precision Medicine Initiative to bring us closer to curing diseases like cancer and diabetes — and to give all of us access to the personalized information we need to keep ourselves and our families healthier.”
The 17 December 2010 issue of Science includes special sections highlighting the Breakthrough of the Year and Insights of the Decade.
Insights of the Decade Shining a Light on the Genome's 'Dark Matter'
第一部分、基因组、转录组中的挑 战—基因组中的暗信息
How many characters are in the “Heaven Book”? 9 3*10 10,000 books
与生物信息学相关的两个前沿方向——非编码基因和复杂生物网络
与生物信息学相关的两个前沿方向——非编码基因和复杂生
物网络
陈润生
【期刊名称】《生物物理学报》
【年(卷),期】2007(23)4
【摘要】文章介绍了基因组研究领域快速发展的两个方向:非编码序列、非编码基因和非编码RNA以及生物网络和系统生物学,也讨论了他们对生物信息学的影响.【总页数】6页(P290-295)
【作者】陈润生
【作者单位】中国科学院生物物理研究所,北京,100101
【正文语种】中文
【中图分类】Q61
【相关文献】
1.新型肠毒素蛋白SElK编码基因的克隆测序、生物信息学分析和表达载体构建[J], 刘骥;潘洁;田万帆;唐俊妮;赵燕英;陈娟
2.腾冲嗜热厌氧杆菌ahpC编码基因的克隆表达\r及生物信息学分析 [J], 郑航辉;高昇;杨宇泽;吴润;万学瑞;王川;刘磊
3.第五届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会 [J],
4.第五届全国生物信息学与系统生物学学术大会暨国际生物信息学前沿研讨会在哈尔滨成功召开 [J],
5.人参属植物鲨烯合酶编码基因及其氨基酸序列的生物信息学分析 [J], 毛乐心;赵昶灵;支伟特;陈文龙;陈中坚;缪康汝
因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
real thing, Apr „00
1998
Animal, ~100 Mb, ~20K genes
[Science 282: 1945]
2000?
Human, ~3 Gb, ~100K genes [???]
„98 spoof
A Draft Sequence of the Rice Genome ( Oryza sativa L. ssp. indica)
它是一个学科领域,包含着基因组信息的获取、处理、存储、分 配 、分析和解释的所有方面。
(The U.S. Human Genome Project: The First Five Years FY 1991-1995, by NБайду номын сангаасH and DOE)
从美国的三个国家计划说起:曼哈顿计划;阿婆罗计 划;人类基因组计划。 破译人类遗传密码就要读懂由30亿符号组成的100万 页的“天书”
Science 2002 296: 79-92
Rice is the most important crop for human consumption, providing staple food for more than half the world's population. The euchromatic portion of the rice genome is estimated to be 430 Mb in size (1-3), which is the smallest of the cereal crops. It is 3.7 times larger than that of A. thaliana (4-6), and 6.7 times smaller than that of the human (7, 8). The wellestablished protocols for high-efficiency genetic transformation, widespread availability of high-density genetic and physical maps (9, 10), and high degrees of synteny among cereal genomes (11-15) combine to make rice a unique organism for studying the physiology, developmental biology, genetics, and evolution of plants. The International Rice Genome Sequencing Project (IRGSP) (16) has already delivered a substantial amount of sequence for the japonica (Nipponbare) subspecies, in bacterial artificial chromosome (BAC) and P1-derived artificial chromosome (PAC)-sized contigs. Working independently, Monsanto and Syngenta (17, 18) established proprietary working drafts for japonica, in April 2000 and February 2001, respectively. The Monsanto sequence has been used to assist in the efforts of the IRGSP.
1995
Bacteria, 1.6 Mb, ~1600 genes
[Science 269: 496]
1997
Eukaryote, 13 Mb, ~6K genes
[Nature 387: 1]
Genomes highlight the Finiteness of the “Parts” in Biology
Figure 9. Functional classification of rice genes, according to Gene Ontology Consortium, and assigned by homology to categorized A. thaliana genes. In this ontology, "biological process," "cellular location," and "molecular function" are treated as independent attributes. Only 36.3% of the 25,426 predicted genes for A. thaliana are classified. For rice, only 20.4% of the 53,398 complete predictions, with both initial and terminal exons, could be classified.
计算机运算速度: 18个月增长一倍; DNA序列数据: 14个月增长一倍;
代表基因组研究进展的数据
近年来GenBank中的DNA碱基数目呈指数增加,大约每14个月 增加一倍。到1999年12月其数目已达30亿,它们来自47000种生 物。2000年4月DNA碱基数目是60亿。现在,2002年2月13日这一 数目已达171亿(15465000记录)。各种生物的EST序列已达 1082万条(2002年3月8日),其中人类的EST序列已超过417 万 条(小鼠2525645),估计覆盖人类基因90%以上;自1999年初 单核苷酸多态性( SNPs,Single Nucleotide Polymorphisms ) 数据库出现以来,到2000年3月20日SNP的总数是26569,现在已 超过412万(2002年1月24日);自全长1.8Mb的嗜血流感杆菌 (Haemophilus influenzae Rd)基因组序列于1995年发表 (Fleischmann et al.,1995)以来,到2002年3月12日已有 83个模式生物的完整基因组被测序完成,它们中有13个古细菌、 63个原核真细菌、7个真核生物的完整基因组,其中包括酿酒酵 母、线虫、拟南芥、果蝇和人。还有另外的100余个微生物基因 组正在测试当中;
果蝇基因组包括1.2亿碱基对的编码区已于2000 年2月测序并组装完成;人类基因组研究的标志 性工作,包含三千三百万碱基对的人第22号染 色体已于1999年11月完成测序,其结果发表在 1999年12月2日的Nature 杂志上。从第22号染色 体已鉴定出679个基因,其中55%的基因是未知 的。有35种疾病与该染色体突变相关,象免疫 系统疾病、先天性心脏病和精神分裂症。作为 人类基因组研究的里程碑性的工作,覆盖率为 90%的人完整基因组的“工作草图”已经在 2000年4月底完成,到2003年将获得覆盖率为99 %的人类基因组全部序列。
Science 2002 296: 79-92
A Draft Sequence of the Rice Genome (Oryza sativa L. ssp. indica)
Jun Yu,1,2,3,4* Songnian Hu,1* Jun Wang,1,2,5* Gane Ka-Shu Wong,1,,24*………
背景
Normal Male
FISH
Different probes used to mark each chomosome Computer identifies probe and give chromosome a false color
Trisomy 13 Patau Syndrome
Patau Syndrome
Cleft lip and palate Extra fingers & toes
– polydactylism
Defects
– Heart – Brain – Kidney
Most abort Live span < 1 month
一. 什么是生物信息学?
生物信息学现状和重要研究方向
陈润生
E-mail : crs@ runshengc@ Tel: 86-10-64888543 Fax: 86-10-64871293
凌伦奖
E-mail : ling@ Tel: 86-10-64888544 中国科学院生物物理研究所 北京朝阳区大屯路15号
Jun Yu,1,2,3,4 *Songnian Hu,1 *Jun Wang,1,2,5 * Gane Ka-Shu Wong,1,2,4 *Songgang Li,1,5 Bin Liu,1 Yajun Deng,1,6 Li Dai,1 Yan Zhou,2,7 Xiuqing Zhang,1,3 Mengliang Cao,8 Jing Liu,2 Jiandong Sun,1 Jiabin Tang,1,3 Yanjiong Chen,1,6 Xiaobing Huang,1 Wei Lin,2 Chen Ye,1 Wei Tong,1 Lijuan Cong,1 Jianing Geng,1 Yujun Han,1 Lin Li,1 Wei Li,1,9 Guangqiang Hu,1 Xiangang Huang,1 Wenjie Li,1 Jian Li,1 Zhanwei Liu,1 Long Li,1 Jianping Liu,1 Qiuhui Qi,1 Jinsong Liu,1 Li Li,1 Tao Li,1 Xuegang Wang,1 Hong Lu,1 Tingting Wu,1 Miao Zhu,1 Peixiang Ni,1 Hua Han,1 Wei Dong,1,3 Xiaoyu Ren,1 Xiaoli Feng,1,3 Peng Cui,1 Xianran Li,1 Hao Wang,1 Xin Xu,1 Wenxue Zhai,3 Zhao Xu,1 Jinsong Zhang,3 Sijie He,3 Jianguo Zhang,1 Jichen Xu,3 Kunlin Zhang,1,5 Xianwu Zheng,3 Jianhai Dong,2 Wanyong Zeng,3 Lin Tao,2 Jia Ye,2 Jun Tan,2 Xide Ren,1 Xuewei Chen,3 Jun He,2 Daofeng Liu,3 Wei Tian,2,6 Chaoguang Tian,1 Hongai Xia,1 Qiyu Bao,1 Gang Li,1 Hui Gao,1 Ting Cao,1 Juan Wang,1 Wenming Zhao,1 Ping Li,3 Wei Chen,1 Xudong Wang,3 Yong Zhang,1,5 Jianfei Hu,1,5 Jing Wang,1,5 Song Liu,1 Jian Yang,1 Guangyu Zhang,1 Yuqing Xiong,1 Zhijie Li,1 Long Mao,3 Chengshu Zhou,8 Zhen Zhu,3 Runsheng Chen,1,9 Bailin Hao,2,10 Weimou Zheng,1,10 Shouyi Chen,3 Wei Guo,11 Guojie Li,12 Siqi Liu,1,2 Ming Tao,1,2 Jian Wang,1,2 Lihuang Zhu,3 † Longping Yuan,8 † Huanming Yang 1,2,3 †