HIV-1蛋白酶与其抑制剂相互作用的分子动力学研究

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Ｉ１９Ｖｌ８和Ｉｌ３总相互作用能均较大。结论：Ｖ１白酶通过上述１ｌ４、ａｌ１ｅｌ８ｅＨＩ一蛋２个残基的非价键作用对利托那韦进行生物识别。
关键词
ＨＶｌ白酶；制剂；子动力学Ｉ— 蛋抑分
ｔｓ，ｉｊｄａＵｉｒｔＴａｊ０００Ｃｉａｉ）ＴａｉＭｅｉｌｎｖｓｙｉｉ３０７，ｈ）ｅｎｎｅｅｉｎｎｎＡｂｔａｔＯｊｃｉｅＴｖｓｇｔｔｅｍｌｕａｃｇｉｏｅｈｎｍｏＨＶ１ｒｔａｅｉｈｂｔｔｎｖ．ｔｏｓＡ４ｎｓｃｂｅｔ：ｏｉｅｔａｅｈｏｃｌｒｏｎｔｎｍｃａｉＩ一ｏｅｓｔｉｉｉｒｉａｉＭｅｈｄ：ｓｒｖｎｉｅｒｅｉｓｆｐｗｈｎｏｒｏｒ
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论著
ＨＶ１白酶与其抑制剂相互作用的分子动力学研究Ｉ一蛋
谢宪斌，王润玲，程先超。刘桂友
（津医科大学药学院，天天津市临床药物关键技术重点实验室，天津３０７）０００
摘要目的：究抑制剂利托那韦与ＨＩ— 蛋白酶相互作用的分子识别机制。方法：用ＨＶｌ白酶与利托那韦晶体结构复研Ｖｌ利Ｉ— 蛋合物和ＨＶ１白酶晶体结构进行４ｎ的分子动力学模拟。结果：Ｉ～蛋ｓ利托那韦对ＨＶｌ白酶骨架运动影响不大，ＨＩ — 蛋白Ｉ— 蛋与Ｖｌ酶Ｉ５、ｓ１８和Ａｐ２成稳定氢键作用。利托那韦与Ａｐ５Ａａ８Ａｐ９Ｇｙ９Ｉ５、ｓ１４Ａｐ２、ｓｌ９Ｇｙ４、ｌ０Ａｐ２ｅｓ１９形ｓ２、ｌ２、ｓ２、ｌ４、ｅ０Ａｐ２、ｓ１８Ａｐ２、ｌ１８ｌ
Ａｓ２ｆＨＩｐｌ９ｏＶ－１ｐｒｔａｅ．ｔｎａｉｏｄｅｈｂｔｓｒｎｎｅａｔｏｗｉｈＡｓ２５，ａ，Ａｓ２９ｏｅｓＲｉｏｖｒｃｕｌｘｉｉｔｏｇｉｔｒｃｉｎｔｐＡｌ２８ｐ，Ｇｌ４ｙ９，Ｉｅ０，ｐｌ４，ｐ１，Ａｓ２９ｌ５Ａｓ２Ａｓ２８ｐ１，
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第１卷３８期２１０２年９月
天津医科大学学报
ＪｕａｏｉｊｄｃｌｎｖｒｉｏｒｌｆａｉＭｅｉａＵｉｅｓｙｎＴｎｎｔ
Ｖｏ．１．ＮＯ３１８．Ｓｐ２２ｅ．０１
文编。一７０２一６４章号。４（１ ∞ ｏ — ６２）０
Ｒ６．９９１文献标志码Ａ
中图分类号
ｎｏｅｕｌｒｄｙｍｉｓｓｕｄｉｓｏｔｎｅａｔＯｌｆＨＩｌｃａｎａｃｔｅｎｈｅｉｔｒｃｉＩｏＶ－１ｐｒｔａｅｗｉｈｓｉｂｔｒＳｏｅｓｔｉｔｎｈｉｉｏ
Ｇｌ１８１１９Ｖａｌ１ａｄｌ１３ｙ４，１４，ｉ８ｎｅ８．Ｃｏｃｕｉｎ：Ｖ－１ｐｏｅｓｏｌｅｏｎｚｉｎｖｒｔｒｕｈｔｅａｏｅ１ｅｉｕｓｏ－ｏｄｄｅｌｎｌｓｏＨＩｒｔａｅ ห้องสมุดไป่ตู้ ｕｄｒｃｇｉｒｏａｉｈｏｇｂｖ２ｒｓｄｅ ’ｎｎｂｎｅｅｔｈ
ｍｏｅｕａｙａｃｉｌｔｎｏＶ一１ｐｏｅｓ — ｉｎｖｒｃｍｐｅｎＶ一ｒｔａｅｗｅｅｃｒｉｄｏｔＲｅｕｔ：ｔｎｖｒｄｄｎｔｌｃｌｒｄｎｍｉｓｓｍｕａｉｆｏＨＩｒｔａｅｒｏａｉｏｌｘａｄＨＩ１ｐｏｅｓｒａｒｅｕ．ｓｌＲｉａｉｉｏｔｓｏｈｖｉｎｆａｔｅｆｃｎｔｅｂｃｂｎｖｍｅｔｏＶ一１ｐｏｅｓ．Ｉｃｕｄｆｒｓａｌｙｒｇｎｂｎｓｗｔｌ５，ｐＩ８ａｄａｅｓｇｉｃｎｆｔｏｈａｋｏｅｍｏｅｎｆＨＩｉｅｒｔａｅｔｏｌｏｍｔｂｅｈｄｏｅｏｄｉｌ０Ａｓｎｈｅ２