PubMed数据库的检索利用 - 欢迎访问贵州师范大学图书馆
pubmed检索方法
pubmed检索方法Pubmed 检索方法Pubmed 是美国国家医学图书馆(National Library of Medicine)所开发的一个免费的生物医学文献库,包含了全球几乎所有的生物医学文献,是医学研究人员和医生进行搜索和查找相关医学文献的重要工具。
本文将介绍Pubmed 的检索方法。
一、关键词检索关键词检索是 Pubmed 最常用的检索方式,通过输入关键字搜索相关的文献。
在检索时需要注意以下几点:(1)关键词要准确。
Pubmed 检索采用布尔操作符(AND、OR、NOT)连接多个关键词,关键词之间要使用英文逗号(,)隔开。
使用过多的关键词可能会导致检索结果没有想象中的好。
(2)参数设置。
可以根据需求调整相关参数,例如年份、文献类型(Review、Clinical Trial、Randomized Controlled Trial等)、文章作者、机构等。
(3)英文文献。
Pubmed 绝大部分都是英文文献,所以检索时需要使用英文关键词。
(4)筛选性强的关键词。
例如疾病名称、独特的药品名称等。
Pubmed 支持多种文献类型检索,例如:(1)临床试验在 Pubmed 首页上,勾选临床试验会检索到近期的中断临床试验、未发布的临床试验等。
(2)随机对照试验勾选随机对照试验可以检索到已发表的随机对照试验。
(3)综述勾选文章类型为系统综述或综述,可以检索到该领域最新的文献综述。
三、学科分类检索Pubmed 中的文献都会有一个或多个学科分类号(MeSH Terms),用户可以通过选择学科分类号进行检索。
在检索时需要注意以下几点:(1)科学性强的关键词。
例如,临床试验、人类、治疗法等。
(2)与所需内容相关的关键词。
例如,药物作用机制、剂量方案等。
(3)使用适当数量的关键词。
使用过少的关键词会导致检索结果过多,使用过多的关键词会导致检索结果不够全面。
Pubmed 中的文献都会有一个分值,通过分值和其他指标来对文献进行评价。
pubmed文献检索方法
pubmed文献检索方法摘要:一、PubMed简介二、文献检索方法1.基本检索2.高级检索3.检索策略三、检索实例四、检索技巧1.关键词选择2.运用布尔操作符3.限制检索范围五、文献管理与分析工具六、总结与建议正文:一、PubMed简介PubMed是由美国国立卫生研究院(NIH)开发和维护的一个免费生物医学文献数据库,包含了大量的生物医学、生命科学、化学等领域的研究文献。
它为广大科研工作者、医生和药师等提供了便捷的文献查询途径。
二、文献检索方法1.基本检索在PubMed首页,可以通过输入关键词或输入文献的题名、作者、出版年份等进行基本检索。
基本检索的结果会按照相关性排序。
2.高级检索点击检索框下方的“高级检索”按钮,可以进入高级检索界面。
高级检索允许用户对检索词、检索范围、文献类型等进行更详细的设定,从而提高检索的准确性。
3.检索策略在检索过程中,可以采用一些策略提高检索效果。
例如,使用截词符(*)进行词干检索,或将关键词用引号括起来进行精确检索。
三、检索实例以下是的一个检索实例:假设我们想查找关于“新冠病毒”(SARS-CoV-2)的研究文献,可以在检索框中输入“SARS-CoV-2”或“新冠病毒”,然后点击检索按钮。
检索结果会包括与新冠病毒相关的文章,如病毒基因序列、疫苗研究、治疗方法等。
四、检索技巧1.关键词选择选择合适的关键词是提高检索效果的关键。
可以通过查阅相关领域的专业词典、综述文章等,了解研究领域的主要术语和概念。
2.运用布尔操作符布尔操作符(AND、OR、NOT)在检索过程中起到筛选和组合检索词的作用。
例如,输入“新冠病毒AND 疫苗”,可以检索到同时涉及新冠病毒和疫苗的文章。
3.限制检索范围在检索过程中,可以通过设置文献类型、发表年份、语言等限制条件,缩小检索范围,提高检索的针对性。
五、文献管理与分析工具PubMed提供了多种文献管理与分析工具,如引文导出、文献收藏、文献标签等。
PubMed检索原理及途径
PubMed检索原理及途径1. 检索原理PubMed具有自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)。
对于输入检索框中的检索词,将按照一定的顺序进行对照、匹配和转换,然后再进行检索。
其顺序是:MESH转换表、期刊刊名转换表、短语表、著者索引。
此外,还可进行短语检索,即将短语作为一个词组进行检索,可用双引号将其引起,此时系统不进行自动转换匹配,也不进行MeSH词的扩检。
2. 检索途径⑴基本检索PubMed的主界面有一个简单的提问词输入框及辅助工具栏,此外,其左侧栏还提供了几种检索功能:Journals Database , MeSH Database , Single Citation Matcher, Batch Citation Matcher, Clinical Queries, Special Queries, LinkOut, My NCBI (Cubby)。
在提问框输入自由词或检索表达式(可直接进行字段限定),点击go 即可进行自由词检索。
同样可结合辅助工具栏按钮,进一步检索。
Limits:限定检索。
PubMed限制内容较多,可对字段、出版类型、年龄、性别、语言、出版年限、收录进Entrez年限、是否具备摘要、检索范围等进行限制。
History:检索历史。
可自动将检索式及结果数量记录到History屏,结合#号进一步检索。
#号间可以用布尔逻辑符组佩检索,如#1 AND #2。
例:查找2004年以来的有关胎盘生长(placenta growth)和氧气(oxygen)的英文文献步骤:PubMed主页→点击limits,限定时间2004;语种为English→页面最下端点击go,在检索词输入框中,输入placenta gr owth AND oxygen→点击go→得到检索结果。
⑵主题词检索点击主页左侧栏MeSH Database,或从上面数据库PubMed下拉菜单中选中MeSH,即可进入MESH检索界面。
使用pubmed进行检索的方法
使用pubmed进行检索的方法使用Pubmed进行文献检索的方法摘要:本文介绍了使用Pubmed进行文献检索的方法。
Pubmed是一个免费的、全球最大的生物医学文献数据库,提供了大量的生物医学文献资源。
通过合理使用关键词、筛选条件和检索策略,可以高效地找到所需的文献信息。
本文将从以下几个方面介绍如何使用Pubmed进行文献检索:关键词选择、搜索策略、结果筛选和文献阅读。
一、关键词选择在进行文献检索之前,首先要确定适当的关键词。
关键词应该与所研究的主题相关,并且能够准确地描述研究内容。
一般来说,关键词应该是具体的、明确的,避免使用过于笼统的词汇。
同时,可以考虑使用同义词或相关词汇来扩大检索范围。
在选择关键词时,可以参考相关文献或专业术语词典,确保关键词的准确性和完整性。
二、搜索策略在Pubmed的主页上,可以找到搜索框。
在搜索框中输入关键词,然后点击搜索按钮即可进行文献检索。
Pubmed提供了多种搜索界面,如简单搜索、高级搜索和专项搜索等,可以根据需要选择合适的搜索界面。
在进行高级搜索时,可以根据文献类型、发表日期、作者、期刊等条件进行筛选。
此外,还可以使用布尔运算符(如AND、OR、NOT)来组合关键词,以进一步缩小或扩大检索范围。
三、结果筛选Pubmed的搜索结果页面会列出符合检索条件的文献列表。
为了准确地找到所需的文献,可以根据以下几个方面进行结果筛选。
首先,可以根据发表日期范围来筛选文献,以获取最新的研究成果。
其次,可以根据文章类型进行筛选,如原始研究、综述、临床试验等。
此外,还可以根据作者、期刊等信息进行筛选,以找到权威的研究成果。
四、文献阅读找到符合要求的文献后,可以点击文献标题或摘要,进而查看详细信息。
Pubmed提供了文献的摘要、作者、期刊、关键词等信息,可以帮助读者快速了解文献内容。
如果需要获取全文,可以查看文献的链接或通过图书馆等渠道获取。
在阅读文献时,要注意文献的质量和可信度,同时可以根据需要进行进一步的文献检索和引用查找。
PubMed使用教程指南
引言概述
PubMed是一个公认的医学文献数据库,由美国国家医学图书馆(NLM)开发和维护。
这个教程指南是第二部分,旨在深入介绍如何使用PubMed数据库来检索医学文献,并提供一些高级功能和技巧。
正文内容
一、使用MeSH(医学主题词)进行高级检索
1.了解MeSH的概念和分类体系
2.使用MeSH浏览器来查找和浏览主题词
3.利用MeSH词汇筛选器进行高级检索
4.使用MeSH树进行链式搜索
5.了解MeSH组合词的使用方法
二、使用文献筛选器和高级检索器
1.使用高级检索器来限定检索结果
2.利用文献筛选器进行精确的文献检索
3.使用搜索历史和搜索详情来追踪检索过程
4.利用查询器来创建复杂的检索语句
5.使用MeSH流行趋势来了解当前研究热点
三、利用搜索工具和文献管理器
1.使用索引工具来查找文章的相关信息
2.使用MyNCBI创建和管理文献收藏夹
3.使用单击目录搜索相关文献
4.使用外部工具和来获取全文和其他资源
5.使用CitationMatcher进行文献引用的匹配
四、了解首选项和界面定制
1.个性化设置首选项和搜索界面
2.添加和删除搜索工具和菜单
3.自定义搜索结果的显示格式
4.创建个人帐户并管理订阅邮件和提醒
5.利用网站帮助和文献教育资源进行学习和培训
五、了解常见问题和解决方案
1.如何处理搜索结果过多或过少的情况
2.如何处理重复文献和非相关文献
3.如何使用布尔运算符进行复杂的检索
4.如何处理缺失的全文和报告
5.如何解决其他常见问题和疑问
总结。
pubmed检索英文文献的步骤
pubmed检索英文文献的步骤要进行PubMed检索英文文献,可以按照以下步骤进行:1. 访问PubMed网站,打开浏览器,输入"/pubmed",进入PubMed网站的首页。
2. 定义研究主题,明确你感兴趣的研究主题,可以是某个特定的疾病、医学领域或者其他相关主题。
3. 使用关键词进行检索,在PubMed首页的搜索框中输入与你的研究主题相关的关键词。
关键词应该是具体而明确的,以便缩小搜索范围。
4. 高级搜索选项,如果你想进一步精确搜索结果,可以使用高级搜索选项。
点击搜索框旁边的"Advanced"按钮,可以在更多的搜索字段中输入关键词,如作者、期刊、出版日期等。
5. 筛选搜索结果,当你点击搜索按钮后,PubMed将会显示与你关键词相关的文献列表。
可以根据自己的需要使用筛选选项来缩小搜索结果的范围,如出版日期、文章类型、文献来源等。
6. 阅读摘要和全文,在搜索结果中,你可以点击文章标题或摘要以获取更多信息。
摘要通常提供了文章的简要概述,帮助你判断是否与你的研究主题相关。
有些文章可能提供免费全文,可以直接阅读,而有些文章可能需要付费或订阅才能获取全文。
7. 下载文献,如果你找到了感兴趣的文献,可以选择下载或保存文献的选项。
这样你就可以在离线状态下阅读或打印文献。
8. 引用和相关文献,在每篇文献的页面上,你可以找到该文献的引用和相关文献。
这些引用和相关文献可能对你的研究有帮助,可以进一步扩展你的文献检索范围。
9. 检索历史和搜索提醒,PubMed还提供了检索历史和搜索提醒的功能。
检索历史可以帮助你回顾之前的搜索记录,搜索提醒可以让你及时获取最新的相关文献。
总结起来,PubMed检索英文文献的步骤包括访问PubMed网站、定义研究主题、使用关键词进行检索、使用高级搜索选项、筛选搜索结果、阅读摘要和全文、下载文献、查找引用和相关文献,以及利用检索历史和搜索提醒功能。
Pubmed数据库检索与利用
PubMed概述 PubMed检索途径与使用方法 检索结果导入NoteExpress
PubMed元数据利用
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数据库检索与利用
从图书馆网站下载NoteExpress
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数据库检索与利用
检索结果保存为Medline格式文件
67
数据库检索与利用
从NoteExpress导入题录及在文章中引用
数据库检索与利用
输入检索词
作者姓名[字段标识] Woods[au]
数据库检索与利用
详细检索过程
数据库检索与利用
输入检索词
数据库检索与利用
详细检索过程
数据库检索与利用
输入检索词
刊名[字段标识] Science[ta]
数据库检索与利用
详细检索过程
数据库检索与利用
输入检索词
数据库检索与利用
添加到检 索框检索
勾选加权检索、 不扩展检索选项
数据库检索与利用
检索结果
数据库检索与利用
题录检索
数据库检索与利用
数据库检索与利用
输入检索信息
点击“Search”
例:检索《病毒杂志》(archives of virology)2009年发表的《基因稳定性与连 续性分析》(genetic stability and linkage analysis)这篇文献
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数据库检索与利用
主要内容
PubMed概述 PubMed检索途径与使用方法 检索结果导入NoteExpress
PubMed元数据利用
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数据库检索与利用
结果存为XML文件
70
数据库检索与利用
将XML文件数据d检索PubMed数据库
pubmed高级检索方法
pubmed高级检索方法一、pubmed高级检索基础1.1 首先呢,pubmed是个超棒的医学文献宝库。
它的高级检索功能就像一把神奇的钥匙,能让你更精准地找到你想要的东西。
咱别小看这个功能,它就像一个隐藏的宝藏地图,要是会用,那可真是如鱼得水。
1.2 你得知道,pubmed高级检索界面有很多选项。
就好比一个大超市,每个货架都有不同的东西。
这里的选项就是那些货架,你得清楚每个货架放的是啥,才能快速找到你需要的“商品”,也就是文献啦。
二、检索字段的运用2.1 比如说作者字段。
这就像找人一样,你知道作者是谁,那就直接在作者字段里输入作者的名字。
这就好比你在人群里找一个熟人,直接喊他名字就好啦。
不过有时候作者名字可能有多种写法,你得像个侦探一样,把可能的写法都试试,可不能一根筋。
2.2 还有标题字段。
如果一个文献的标题里有你想要的关键词,那在标题字段检索就像瓮中捉鳖一样容易。
标题可是文献的招牌,往往包含了核心内容。
你要是想找关于某种疾病特定治疗方法的文献,在标题里搜这个治疗方法的名字,很可能就一击即中。
2.3 期刊字段也不能忽视。
你要是对某个期刊特别感兴趣,或者知道你要找的文献大概率发表在某个期刊上,那就在期刊字段里输入期刊名。
这就像你知道一个人住在某个小区,直接去那个小区找他就对了,省得满世界乱找。
三、布尔逻辑运算符的使用3.1 AND这个运算符啊,就像是交朋友里的“志同道合”。
你输入两个关键词,中间用AND连接,那搜索出来的文献就是同时包含这两个关键词的。
比如说你搜“糖尿病 AND 胰岛素”,那找出来的文献就是既和糖尿病有关,又提到胰岛素的,这样就把范围缩小得很精准了。
3.2 OR这个运算符呢,有点像广撒网。
当你输入两个关键词,中间用OR连接,搜索出来的文献只要包含其中一个关键词就会被显示。
比如“感冒 OR 流感”,那只要是关于感冒或者流感的文献都会出来。
这在你不确定具体用词或者想扩大搜索范围的时候很有用,就像你想找水果,苹果或者香蕉都可以满足你吃水果的愿望,这里的苹果和香蕉就相当于不同的关键词啦。
如何使用pubmed进行文献检索
如何使用pubmed进行文献检索使用PubMed进行文献检索是非常重要的,因为它是一个专门为生命科学和医学领域提供的免费文献数据库。
下面是一个详细的步骤指南,以帮助你使用PubMed进行文献检索。
2. 进行关键词:在PubMed首页的框中输入你感兴趣的关键词,可以是疾病名称、特定的治疗方法、生物标志物等。
点击“”按钮。
4.阅读摘要和全文:当你找到感兴趣的文章时,你可以点击标题以查看摘要。
摘要通常提供了关于研究目的、方法、结果和结论的概述。
如果你对文章感兴趣并且有免费全文可用,你可以直接点击“全文”链接以阅读完整的文章。
5. 扩大或缩小范围:如果你的结果不够理想,你可以尝试扩大或缩小范围。
你可以使用更广泛或更具体的关键词来,或者使用PubMed高级功能来更精确地定位你的。
6. 使用MeSH词汇进行检索:MeSH(Medical Subject Headings)是PubMed的一种标准词汇,用于对文章进行分类和索引。
如果你想进行更准确的检索,你可以使用MeSH词汇来。
在框中输入你的关键词,然后点击右侧的“在[MeSH]中”按钮以进一步精确。
7. 使用历史和提示:PubMed提供了历史和提示功能,以帮助你更好地管理和改进你的。
你可以在框下方找到你最近的历史记录,并且当你输入关键词时,PubMed会自动提供相关的建议。
8. 使用PubMed Central进行全文检索:除了PubMed,你还可以使用PubMed Central来全文可用的文章。
PubMed Central是一个免费的全文文献数据库,其中包含了许多生命科学和医学领域的文章。
你可以在PubMed结果页面的右上方切换到PubMed Central进行检索。
总结起来,使用PubMed进行文献检索需要一些技巧和经验。
通过使用关键词、筛选结果、阅读摘要和全文、扩大或缩小范围、使用MeSH词汇、使用历史和提示、使用PubMed Central进行全文检索、导出和管理文献等功能,你可以更有效地利用PubMed来找到相关的研究文献。
pubmed文献检索方法
pubmed文献检索方法【原创版4篇】目录(篇1)I.检索PubMed的意义II.PubMed的检索方法III.PubMed检索结果的展示和筛选IV.检索PubMed的注意事项正文(篇1)I.检索PubMed的意义PubMed是全球最大的生物医学数据库之一,提供了大量的生物医学文献资源。
对于研究人员、医学专业人士和学生来说,了解和掌握PubMed的检索方法,可以帮助他们快速找到所需的文献。
II.PubMed的检索方法1.打开PubMed网站,输入网址:https:///2.在页面左侧导航栏中选择“Search”按钮,进入检索页面。
3.在检索页面中,可以选择不同的检索方式,如关键词、作者、出版日期等。
4.输入检索词后,点击“Search”按钮,即可得到相关的检索结果。
III.PubMed检索结果的展示和筛选1.检索结果会按照相关度排序,用户可以选择不同的排序方式。
2.每个检索结果都包含标题、摘要、作者、出版日期等信息。
3.对于需要进一步阅读的文献,可以点击“Open”按钮,查看全文。
4.可以通过筛选条件,如主题、关键词、学科领域等,缩小检索范围。
IV.检索PubMed的注意事项1.避免使用过于具体的检索词,以免得到过多的无关结果。
2.对于复杂的检索需求,可以使用逻辑运算符和短语检索等方式进行组合检索。
目录(篇2)I.引言A.为什么需要pubmed文献检索方法B.pubmed简介II.pubmed文献检索方法A.如何使用pubmed1.输入关键词2.选择检索结果3.查看文献详情B.pubmed的优点1.方便快捷2.检索结果全面3.文献质量较高C.pubmed的不足1.检索结果可能不全面2.文献质量可能较低3.检索结果可能存在误导III.结论A.pubmed文献检索方法的重要性和实用性B.如何利用pubmed进行有效的文献检索正文(篇2)pubmed文献检索方法是一种非常实用的工具,可以帮助科研人员快速、准确地检索到所需的文献。
pubmed使用介绍
2000年
02
01
03
04
05
PubMed的起源和发展
A
B
C
D
PubMed的特点和优势
权威性
收录内容主要来源于权威的医学学术期刊和会议论文集,具有很高的学术价值和可信度。
更新及时
收录的文献内容实时更新,能够反映全球生物医学领域的最新研究成果。
检索功能强大
提供多种检索方式,方便用户快速找到所需内容。
关键词筛选
文章类型筛选
发表时间筛选
根据文章类型,如期刊论文、综述、病例报告等进行筛选。
选择特定时间范围内的文章,如近五年、近十年等。
03
02
01
检索结果筛选
检索结果数量
显示符合条件的文章总数。
学科分布
统计各学科领域符合条件的文章数量,便于了解相关领域的研究热点和发展趋势。
高频关键词
分析检索关键词中出现频率较高的词汇,有助于了解相关领域的研究重点和热点话题。
跨学科研究的支持
THANKS FOR
感谢您的观看
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个性化服务的进一步发展
跨学科研究热点分析
利用人工智能技术对多学科领域的文献数据进行热点分析和趋势预测,帮助用户了解跨学科研究的前沿和动态。
跨学科合作平台
构建跨学科的合作平台,促进不同学科领域的研究者之间的交流与合作,推动跨学科研究的创新和发展。
跨学科主题词系统
建立和完善跨学科的主题词系统,方便用户检索和获取不同学科领域的文献资源。
与Scopus的整合
用户可以在PubMed搜索框中输入关键词,然后点击"在Scopus中搜索"选项,直接跳转到Scopus数据库进行相关文献的搜索。
pubmed文献检索方法
pubmed文献检索方法摘要:1.引言2.PubMed 的基本概念和作用3.PubMed 的检索方法4.PubMed 的检索结果处理5.结论正文:作为一名中文知识类写作助理,我将根据所提供的文本,为您提供一篇关于“PubMed 文献检索方法”的文章。
1.引言PubMed 是一个包含生物医学领域文献的庞大数据库,它收录了来自MEDLINE、生命科学期刊和在线书籍的超过3500 万条引文。
因此,掌握PubMed 的文献检索方法对于研究人员和学生来说至关重要。
2.PubMed 的基本概念和作用PubMed 是一个免费的在线数据库,由美国国立卫生研究院(NIH)开发。
它收录了生物医学领域的各种文献,包括研究论文、综述文章、会议论文和书籍章节等。
用户可以通过检索PubMed,找到与自己研究领域相关的文献,并了解最新的研究动态。
3.PubMed 的检索方法在PubMed 上进行文献检索,用户可以通过输入关键词、作者姓名、期刊名称等来进行检索。
此外,PubMed 还提供了一些高级检索功能,如限制检索结果的时间范围、出版物类型和语言等。
4.PubMed 的检索结果处理当用户在PubMed 上检索文献后,系统会返回一系列检索结果。
用户可以根据需要,对检索结果进行筛选和排序。
例如,用户可以根据文献的出版时间、引用次数和相关度等指标,对检索结果进行排序。
此外,用户还可以通过点击文献标题,查看文献的详细信息,包括全文内容、作者信息和引用文献等。
5.结论总之,PubMed 是一个重要的生物医学文献数据库,掌握其文献检索方法对于研究人员和学生来说至关重要。
PubMed使用教程指南
PubMed使用教程指南PubMed使用教程指南1:简介1.1 PubMed概述1.2 文档目的和范围1.3 文档结构2:注册和登录2.1 注册过程2.2 登录步骤2.3 用户账户管理3:检索和筛选文献3.1 关键字检索3.2 高级检索3.3 检索结果筛选和排序3.4 收藏和导出文献4:文献详细信息和摘要4.1 文献详细信息页4.2 文献摘要和关键词4.3 相关文献推荐5:全文获取途径5.1 免费全文获取5.2 付费全文获取5.3 图书馆访问6:文献浏览和阅读工具6.1 在线阅读器6.2 PDF和打印6.3 标注和笔记7:数据库交互和导出选项7.1 搜索历史和搜索警报设置7.2 保存和导出搜索结果7.3 数据库交互和集成8: PubMed Central (PMC) 8.1 PMC概述8.2 PMC文献访问和8.3 PMC作者和机构信息9:其他功能和资源9.1 科学计量指数和引用分析9.2 转录本数据库和序列检索9.3 生物医学主题词(MeSH)搜索附录:附件1: PubMed常见问题解答 (FAQs)附件2: PubMed搜索示例附件3: PubMed用户指南(官方文档)法律名词及注释:1:版权(Copyright):著作权法所规定的权利,授予创作者对其所创作作品的独占权利。
2:公共领域(Public Domn):指作品的版权保护期已经过去,不再受版权法保护,可以自由使用。
3:开放获取(Open Access):指文献免费并可自由获取的出版模式,通常由作者或资助机构支付出版费用,以使文献对全球范围内的读者免费开放。
4:数据共享(Data Sharing):研究数据的共享原则,将研究数据公开存档并向其他研究人员开放,促进科学研究的可重复性和透明度。
5:版权许可(Copyright License):版权持有者授权他人使用、复制或再分发作品的许可证。
6:存取策略(Access Policy):指特定出版物的访问规则和限制,如开放获取、订阅制度等。
检索报告pubmed
NCBI网站
3
NCBI提供的数据库
• 检索大分子生物学数据 • 获取GenBank, EMBL等数据库的核酸序列; • 获取 Swiss-port,PIR,PRF,PDB 等蛋白质序列, 从核酸序列翻译到蛋白质的序列; • 获取基因和染色体图谱;蛋白质三维结构数据 及大分子模式(MMDB)等其他生物信息数据 库检索。 • PubMed等文献数据。
文献相关注释
基金编号 基因符号 期编号
资助调研者
资助调研单位 国际标准期刊号 美国立医学图书馆识别号 期刊全称
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最后修订日期 规范词表词 规范词确立日期 系统组织的文摘
版权拥有者
题录提供机构的识别号 病史相关与原始记录
其他关键词
提供其他关键词的机构 数据提供者机构 文章总页数 出版商提供数据时间 期刊出版国 数据库文献编号
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全文链接,部分需连外网
相关论文 MeSH词、物质名、 文献类型等信息 LinkOut外部资源链接 全文链接
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输出方式选择
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输出方式选择(send to)
• File:保存检索结果为文本文件 • Clipboard 剪贴板,多次检索,可暂存每 次检索需下载的记录,最后一起保存。 最 多允许存储500条,保留8小时。 • Email: 通过邮件发送 • Collections:将检索结果存到My NCBI中 • Order:全文传递服务,需帐号、收费。
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作为主题词的个人姓名
出版状态 文献类型 出版模式(纸张或电子) 参考文献数 已撤回的文献 酶或化学物质代码
正在撤消中的文章 初版文献 修订和再版的文章 子专题文档 太空署提供的数据 二次文献数据库以及文章讨论的 分子序列访问号 原文来源 引用了病例的文献内部处理代码 标准期刊缩写 文献标题 翻译标题 更新文献 文献正在更新 期刊卷号
如何使用pubmed进行 文献检索
一、PubMed简介
• 很多医务工作者宁可在每次检索时 都花上成倍的时间,却不愿花上几个小 时去认真研究一下PubMed。"君欲善其事, 必先利其器",PubMed就好像一把功能强 大的枪,你决不能仅仅满足于知道扣动 扳机就可以发射子弹,更重要的是,你 要知道如何利用准星瞄准,如何把这把 枪的功能发挥到及至。
• 回溯年代:1948年至今 • 每条记录标有[indexed for MEDLIEN]标记
MEDLINE数据库简介
学科范围:
• 基础生命科学 临床生命科学
• 生物科学
解剖学
• 组织学
化学与药物
• 心理学
社会医学
• 农业
医技设备学
• 医技工业学
医学信息学
使用词表:MeSH(医学主题词表)
4.2 PreMEDLINE
1998/03[dp]; 1998[dp]; 1996:1998[dp]; 1998/01:1998/04 [dp]
• Publication Type[PT]:出版类型 review[pt]
• Title[TI] :文章题名 • Text Words[TW]:文本词
包括Title, Abstract, MeSH Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等字段
检索规则
1、自动转换匹配
PubMed具有对检索词的自动转换匹配功能。 对于输入检索框的检索词,PubMed按4个转换表 进行对照、匹配和转换,然后进行检索。 ① MeSH表:包括MeSH的主题词、副主题词、款目 词。 ②期刊刊名表: 所收录的刊名全称、缩写和ISSN ③短语表:文献篇名或文摘中出现的短语。 ④著者索引表: PubMed所收录的的作者姓名组成。
pubmed文献检索系统使用指南
PubMed医学文献检索系统PubMed是因特网上重要的免费文献检索系统。
目前全球最著名的医学文献数据库系统是美国国立医学图书馆的MEDLINE,该数据库重数据免费提供给各个检索系统的开发商,因此在因特网上有重多的免费MEDLINE检索系统。
这些系统所涵盖的文献年代、检索结果的输出格式以及检索途径各不相同,但是,目前被医务人员广泛使用的仍然是美国国立医学图书馆的PubMed系统PubMed和NCBI:1.美国国立医学图书馆“NLM”2.早在1879年,编译医学文献的检索刊物IM3.1964年采用计算机进行电子编辑和排版,在此基础上开发了“医学文献分析与检索系统”(即著名的MEDLARS)4.1971年正式建立了钙系统的联机系统,称为“MEDLARS联机检索系统,MEDLARS online,既MEDLINE 系统。
5.PubMed则是NLM的国家生物信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)开发的一个以网络为基础的检索系统,自1997年免费提供服务PubMed ――特点:PubMed具有MEDLINE 所具有的各种检索和数据库优势,同时还具有以下特点:⏹连接广泛:包括对外链接和对内链接,对内指与NCBI其它数据库的链接和PubMed文献相似度计算后的相关文献链接,对外连接指出版商提供的文献全文的连接,有免费和需要注册的。
⏹更新速度快:出版商直接把电子版提供给NLM⏹收录文献范围广:三个层次的数据库:MEDLINE数据库、PreMEDLINE数据库和出版商直接提供的文献数据库等PubMed ――收录范围总体包括:⏹收录年限:1966~⏹收录内容:70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊的文献和一些非医学内容的文献,主要是MEDLINE。
内容涉及医学、护理、牙科、兽医、健康保健系统、前临床医学等学科,另外有非医学内容的文献,如science 和nature中具有地理学方面的文献。
httplibnxmueducn信息服务活页PubMed检索功能及技巧检索功能及
信息服务活页 信息服务活页 PubMed PubMed PubMed检索功能及技巧 检索功能及技巧 20102010年第年第年第010101期期一、检索功能(一) 常用的检索方式:主题概念检索:1.检索词的转换:在检索词汇方面,使用者所输入的检索词都将自动被转换对映至MeSH ,但系统会同时以MeSH 及Text Word 方式进行检索,例如检索vitaminh ,系统将以Biotin[MeSH] OR vitamin h[Text Word]进行检索。
如果需找特定词汇,可在词汇间加入引号,如:"single cell "。
2. 刊名检索刊名检索a. PubMed 检索对话盒:查询期刊名称时可以输入全称,如 molecular biology of the cell ,或是MEDLINE 中的刊名缩写:mol biol cell ,抑或是输入期刊的ISSN 号码,查询特定的期刊,此外,也可用[ta]或[journal name ]指令查询特定刊名的文章,如jcr[ta]或jcr[journal name],可查到在Journal of cardiopulmonary rehabilitation 发表被PubMed 收录的文献。
b. limit 功能:指定查询刊名栏,得知该刊被PubMed 收录的文献。
c. Journal Browser :直接输入刊名全称、简称、ISSN (须符合ISSN 标准写法,如0883-9212)即可浏览PubMed 是否已收录该刊。
3. 作者查询作者查询::查询作者时输入形式为:姓 名字的首字缩写,例如:smith ja 。
如只输入作者的姓,PubMed 将以该检索值检索所有的字段,例如查询:Yang ,系统将转换成查询:Yin-Yang[MeSH] or Yang[Text Word]。
使用者亦可用指令方式查询作者名:lai my[au];或是在「limit 」功能中指定查询作者名。
PubMed使用教程指南
2.引文匹配器 3.临床问题
三、个性化检索
1.Mesh Database 确定规范检索词 查看词义注释、树状结构表 副主题词、扩展、主要主题词 例:欲查肾衰竭的饮食疗法相关文献?
MeSH Database 规范主题词数据库检索 肾衰竭饮食疗法课题
2.执行浏览 1.输入检索词
3.临床问题(Clinical Queries)
用于临床问题的检索
3.临床问题(Clinical Queries)
输入检索词
检索设置
3.临床问题(Clinical Queries)
检索结果
检索结果输出
显示检索结果 保存检索结果 保存检索策略 打印检索结果
显示字段选择(Display)
一、基本检索
(3)通过“limit”的 “search by journal”
6.期刊检索
一、基本检索
(4)通过“期刊 数据库”检索
6.期刊检索
一、基本检索
6.期刊检索
一、基本检索
发送至检索恇
点击选中
6.期刊检索
一、基本检索
点击执行检索
6.期刊检索
一、基本检索
检索结果
二、辅助检索区
1.Limit (限定检索) 2.Preview/index(预览/索引) 3.History(检索史) 4.Clipborard(剪贴板) 5.Detail(检索式详览)
获取原文及相关资源
1.联机获取原文( free full text article) 2. link out 3.向有关图书馆索要 4.其他数据库资源(生物信息学等)
文摘中的期刊图标链接
Linkout链接
使用PUBMED检索
使⽤PUBMED检索NLM的PubMed医学⽂献检索服务可以在MEDLINE和Pre-MEDLINE数据库的9,000,000条⽂献中进⾏检索,并可与其他数据库建⽴检索连接。
请输⼊⼀或两条英⽂检索词;作者姓名输⼊格式:“姓+名”(英⽂)如Freedman DJ,“名”可以省略不输;检索期刊时可以输⼊期刊全名,MEDLINE规定的缩写名或ISSN序号(详细信息可由期刊浏览服务查阅);由下拉式菜单选择检索内容,如MEDLINE,GeneBanK等;由下拉式菜单选择显⽰检索⽂献的页⾯设置;由下拉式菜单选择检索⽂献的发表⽇期年限,15天到10年不等。
⾼级检索⽅式(Advanced Search)与基本检索⽅式不同的是增加了检索范围(search fields).和检索模式(search mode)的选择框,检索前请参看检索指南。
检索范围: :请输⼊⼀或两条英⽂检索词;作者姓名输⼊格式:“姓+名”(英⽂)如Freedman DJ,“名”可以省略不输;检索期刊时可以输⼊期刊全名,MEDLINE规定的缩写名或ISSN序号(详细信息可由期刊浏览服务查阅);由下拉式菜单选择检索范围(search fields)和检索模式(search mode)检索词可以按照布⽒逻辑检索PubMed检索指南PubMed基本检索⽅式(参看⽰例)PubMed⾼级检索⽅式(参看⽰例)查询结果的显⽰选择(参看⽰例)PubMed医学⽂献检索服务系统,其检索内容包含MedLine,PreMedline(不含Mesh检索主题词)医学⽂献数据库及其他电⼦出版⽂献。
1. PubMed基本检索⽅式(Basic PubMed Search)进⼊PubMed基本检索⽅式主页,在检索框中可以输⼊任意词,包括⽂献作者,出版杂志等:键⼊⼀个或多个检索词(可以为任意词),如protein disulfide isomerase ,也可以输⼊缩略名如pdi等;输⼊多个词时,可⾃动识别成词组;但词数太多时,则以逻辑与的⽅式识别,如可以将protein disulfide isomerase识别成⼀个词,也有可能将其识别成“protein AND disulfide AND isomerase”尤其是出现数字等符号时不易识别成词组;对PubMed不能识别检索的词组,需加引号强调,如键⼊:“Insight II”以⽂献作者⽅式检索,作者名的输⼊格式为:姓+名如输⼊:Freesman DJ,其中“姓”为全称,“名”则为⾸字母简写形式(“名”可以省略);键⼊的杂志名称可以是全名,也可以是杂志名的MedLine缩写格式或ISSN杂志号(见期刊浏览)。
pubmed的使用方法
近年来,利用计算机进行文献检索已逐步代替传统的手工检索,随着Internet的普及,我们可以随时随地通过国际互联网来检索获得免费的医学文献,这是一条文献检索新捷径[1],特别是进行MEDLINE检索,既简单又实用[2]。
现在有多个机构提供免费的网上MEDLINE检索服务,其中由美国国立医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)建立的PubMed数据更新快[3],检索系统完善,深受广大医务工作者和图书情报人员的欢迎。
由于PubMed检索系统在不断完善和加强,要快速、全面、准确地在近4千种医学期刊、1千1百万条数据中检索出符合自己要求的资料[4],并不容易。
下面介绍最新版本(2000年9月版)的PubMed使用方法。
1. 进入PubMed在浏览器的地址栏内输入Pubmed的网址:/PubMed/后按回车键,就进入PubMed的主页,开始检索。
2. 普通检索在检索式提问框中输入一个或更多的词(例如:vitamin c common cold),然后按回车键或用鼠标点击"Go"按钮,PubMed就会利用"自动词语匹配"功能将重要的词或词组用"AND"组合在一起进行检索(见图1)。
输入的词可以是自由词、主题词、或其他指定字段。
由于主题词检索的文献更全面、更准确,应尽量使用主题词/副主题词检索。
对于某些新的技术词汇、新药、新方法、新疾病等,还没有相应的主题词时,应该用自由词检索。
3. 高级检索使用逻辑词AND, OR, NOT(例如:vitamin c OR zinc)、指定文献记录字段名称检索、使用医学主题词(MeSH)/副主题词组配格式检索,如neoplasms/diet therapy[mh]。
不久返回检索结果,检索提问框仍出现在页面顶端,并显示您刚才输入的检索词。
您可以在提问框内、点击"Details"或"Limits"按钮再修改检索词。
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- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
PubMed数据库的检索利用PPT课件11号内容提纲PubMed简介收录概况及访问方式数据来源及组成Pubmed首页数据库常识Pubmed检索途径及检索语法(实例演示) 基本检索主题检索高级检索外部特征限定检索结果的处理单篇引文匹配器Single Citation Matcher 临床查询(循证医学)Clinical Queries 专题查询Topic-Specific Queries个性化服务My NCBIPUBMED简介PubMed简介收录概况及访问方式-Pubmed是由美国国家卫生研究院(NIH)下属的美国国家医学图书馆(NLM)开发的建立于美国国家生物技术信息中心(NCBI)平台上的基于web的生物医学信息检索系统,是NCBI Entrez检索系统的重要数据库之一。
-收录时间范围:1947-,部分期刊回溯至创刊年。
数据每周二至周六更新(Tuesday – Saturday)-世界上权威性的生物医学文摘型数据库,收录全世界范围内70多个国家和地区近5000种生物医学相关期刊论文,主要收录英语语种期刊,少部分其他语种期刊。
- 学科范围涵盖基础医学、临床医学、护理学、口腔医学、兽医学、营养卫生、药理和药剂学、预防医学、卫生管理、医疗保健和情报科学领域,2000年起新增生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学领域访问方式:IE7以上的浏览器登录以下网址-/pubmed----全球免费使用,部分文献可免费获取全文大部分数据来源于MedlineFree- OldMEDLINE[PubMed - OLDMEDLINE ] - [Epub ahead of print ][PubMed-as supplied by publisher]- PreMEDLINE [PubMed-in process]- MEDLINE[PubMed-indexed for MEDLINE]- Publisher-Supplied [PubMed-as supplied by publisher/PubMed]- OldMEDLINE [PubMed - OLDMEDLINE ] :1947-1965年间的MEDLINE 数据,正在做回溯加工,补充主题词及部分全文链接。
- [Epub ahead of print ][PubMed-as supplied by publisher]:由出版商提供的纸质版尚未正式出版的文献,大部分最终会转入PubMed-in process ,再正式转入MEDLINE ,部分不在MEDLINE 收录学科范围内的数据,最终会转化为PubMed-as supplied by publisher/PubMed 状态。
- PreMEDLINE [PubMed-in process]:已被MEDLINE 录用,正处于加工标引状态的文献数据。
- MEDLINE [PubMed-indexed for MEDLINE]:标引了主题词被MEDLINE 正式收录的文献数据。
- Publisher-Supplied [PubMed-as supplied by publisher/PubMed]:由出版商提供但因其学科不在MEDLINE 收录学科范围内,而最终未进入MEDLINE 但保留在PubMed 中的文献数据。
未入选数据标引主题词入选数据数据来源及组成数据库常识数据库常识PUBMED检索途径及检索语法(实例演示)检索途径及检索语法检索途径¾基本检索(basic)¾主题检索(MeSH词检索)¾高级检索(advanced)检索语法¾智能词语匹配¾强制短语检索:“ ”¾布尔逻辑运算:AND, OR, NOT¾字段检索:[ ]¾截词检索:*•移动pubmed •单篇引文匹配器•多篇引文匹配器•临床咨询•专题查询•主题词库•NCBI收录期刊•临床实验•E-Utilities软件•外部链接•快速使用指南•全文文章•常见问题•使用教程•前沿动态Pubmed首页高级检索基本检索Pubmed 包括来自MEDLINE 的2200万条以上的生物医学文献记录、生命科学期刊以及在线图书,部分含有来自PMC 和出版商网站的全文链接。
智能匹配PubMed对检索用户输入任何有意义的检索词,如果不限定检索字段,系统依次到左侧六个表进行短语的匹配、转换和检索,如果都找不到匹配的短语,系统将短语拆为词语,继续到这六个表中搜索,拆开部分为逻辑AND关系。
如:oxygen free radicalsÆ (“oxygen”[MeSH Terms] OR “oxygen”[All Fields]) AND (“freeradicals”[MeSH Terms] OR (“free”[All Fields] AND “radicals”[All Fields]) OR “free radicals”[All Fields])MeSH转换表刊名转换表作者全名转换表作者索引表合作者全名转换表合作者转换表无匹配检索词拆分详见search details强制短语匹配符:“ ”严格按输入形式匹配,不再自动转换匹配和扩展检索,常用于词组和专有名词检索。
如:“oxygen free radicals ” 氧自由基备注:使用search details查看系统内部检索词运算过程布尔逻辑:NOT /AND /OR(大写)字段限定符:[ ]题名检索:[TI]如:Stem cell transplantation[ti]著者检索(authors): 姓全称在前,名首字母在后[AU]如:西方作者 Stephanie L. Cooper——Cooper SL[au] 中国作者 Guan zhi zhong——Guan zz[au]‐ 2002年以后的文章可以查著者全名,字段名为FAU如:Cooper sheldon lee [FAU]TI title 题名TIAB title/abstract 题名和摘要AU author 著者AD affiliation 第一著者单位和地址SO jounal title 刊名或ISSN PT publication type 文献类型LA language 语种ALL all fields 所有字段TT transliterated title 翻译题名1AU first author name 第一著者姓名FAU full author name 著者全称MH MeSH terms MeSH主题词SH MeSH subheadings MeSH副主题词PMID UID pubmed唯一识别号字段限定[AU]:西方作者Stephanie L. Cooper 的文献贵阳医学院官志忠教授发表在《中华病理学杂志》上的文章截词符:*9一般只作“后截断”使用,最多截取600个匹配的单词 例:检索有关肝移植患者术后生活质量的相关文献。
检索词:肝移植‐‐‐‐‐‐‐‐‐liver transplant*生活质量‐‐‐‐‐‐‐quality of life检索式详览search details主题检索¾PubMed依据MeSH词表(医学主题词表)对所收录数据进行 主题标引¾利用主题词检索可以提高文献检准率9关键词检索逻辑关系粗浅、修饰概念匹配不特定、检索词涵盖不全面9主题词检索逻辑关系紧密、修饰概念匹配特定、下位词检索全面¾MeSH网络版本集成在PubMed数据库中例:检索艾滋病(AIDS)并发症(complications)方面的文献检索途径及检索语法主题检索AIDS两个入口都可进入检索途径及检索语法主题检索规范化主题词,点击可查看详细信息主题词注释入口词主题词历史注释该主题词的参照系统 可组配的副主题词加权不进行下位词扩检该主题词所在的树状结构该主题词的树状结构号检索途径及检索语法主题检索"Acquired Immunodeficiency Syndrome/complications"[Mesh]勾选副主题词: 并发症添加到检索框 执行检索检索途径及检索语法主题检索检索结果检索途径及检索语法高级检索¾检索式编制(search builder) 通过索引选词构建复杂检索式 例:研究重度抑郁症激素替代疗法的非中文文献 9内容特征 激素替代疗法 hormone replacement therapy 抑郁症,重度 depressive disorder,major 9外部特征 非中文 NOT chinese检索途径及检索语法高级检索可直接编辑检索式输入检索词显示/隐藏检索词索引点击执行高级检索检索途径及检索语法高级检索检索途径及检索语法高级检索点击进入高级检索检索途径及检索语法高级检索¾检索历史(history) 9以列表形式显示历次检索式、检索时间和检出篇数。
9组配、调整检索式。
例: 9#12 add Chinese[LA] 9#13 add Guan zz[AU] 9#14 add guiyang medical college[AD] 点击编号可直接进行逻辑组配或删除等操作; 点击add可直接添加至检索框检索途径及检索语法点击执行高级检索检索历史左击检索途径及检索语法高级检索高级检索结果外部特征的限定外部特征的限定例:检索2008年至今发表的关于艾滋病并发症的英文综述文献,要求能可下载免费全文¾ 内容特征: AIDS/complications ¾ 外部特征: 2008 0101--now review free full text English检索结果的处理检索结果的处理免费 全文时间 限定注意:已选定的限定条件会一直保留,下次检索如果不需要需手动清除文种:综述语种:英文单篇引文匹配器单篇引文匹配器临床查询 CLINICAL QUERIES临床查询Clinical Queries专门检索临床研究方法学(循证医学)文献,分为三个专题: 临床研究文献 系统综述 医学遗传学输入疾病名称供查找疾病的系统评价文献、meta分析、 供查找疾病医学遗传学方面的文献,设 供查找病因、诊断、治疗、预后及临床 临床实验评论、实践指南等循证医学方 有遗传诊断、鉴别诊断、遗传疾病临床 预报指南五个方面的文献; 选择 scope选项,强调查准和查全。