血浆-血清-体液蛋白质组学
血清蛋白质组学在疾病诊断中的应用
血清蛋白质组学在疾病诊断中的应用人体的血液中含有丰富的蛋白质，这些蛋白质在人体内具有重要的生理功能。
随着科学技术的发展，人们开始将蛋白质分析应用于医学领域，开创了蛋白质组学领域。
其中，血清蛋白质组学作为体液分析的一种重要方法，在疾病诊断方面有着广泛的应用。
本文将介绍血清蛋白质组学在疾病诊断中的应用。
一、血清蛋白质组学的原理血清蛋白质组学是一种依据不同蛋白质在电泳等技术上的分离和检测，来分析患者血液中某些特定蛋白质量的量和质的方法。
血清蛋白质组学分析的基础是体液中包含大量蛋白质，包括细胞因子、激素、酶和抗体等，这些蛋白质的种类、分子量和结构都不同。
当人体发生病变时，血液中含有的某些蛋白质数量或结构可能会发生变化。
利用这种变化，可以通过血清蛋白质组学的方法，分析血液中是否存在特定的蛋白质，来做出疾病的诊断。
二、血清蛋白质组学在肿瘤诊断中的应用肿瘤是一种常见的恶性疾病，早期的诊断是治疗肿瘤的关键。
血清蛋白质组学作为一种新的诊断方法，可以对肿瘤早期诊断提供较为敏感和特异的检测手段。
例如，可利用相对分子量、异常表达和图片特征等方面识别癌细胞的蛋白质，在肿瘤早期诊断、疗效监测以及预后评估方面都有着广泛的应用前景。
三、血清蛋白质组学在心血管疾病中的应用心血管疾病是目前常见的致死因素之一，在临床上具有较高的诊断难度和治疗风险。
血清蛋白质组学可以检测体液中的蛋白质含量和结构，可以发现心脏组织和其他器官之间的相互作用和参与。
通过这种分析方法，可以在心血管疾病早期出现时识别出各种标志物来促进治疗。
例如，检测高敏感C-反应蛋白、前B型利钠肽等标记物能更准确地诊断心脏病变和危及患者生命的程度，为临床治疗提供有效基础。
四、血清蛋白质组学在其他疾病中的应用除了肿瘤和心血管疾病，血清蛋白质组学在许多其他疾病的诊断中也有广泛的应用。
例如，在肝病、肾病、自身免疫性疾病、炎症和感染等疾病中，血清蛋白质组学能够帮助鉴别症状和病因，并帮助确定肝炎乙型、艾滋病毒和输血后疾病等病因和治疗方案。
血清蛋白质组学方法
百泰派克生物科技
血清蛋白质组学方法
血清蛋白质组学多用于筛选血清中的低丰度蛋白质，因为它们是主要的生物标志物靶标。
也因此血清蛋白质组学方法包括了去除高丰度蛋白质。
百泰派克生物科技提供基于质谱的血清蛋白质组学分析。
血清蛋白质组学
血清是血液发生凝血反应后形成的位于上层的淡黄色透明液体。
在凝血过程中，血液中的纤维蛋白会被凝结去除，因此血清中不含纤维蛋白，这也是血清与血浆的最大区别。
血清中大量未参与凝血反应的物质还是与血浆中的一样。
血清蛋白质组学是研究血清中蛋白质组的科学，旨在研究目标人群血清中表达的所有蛋白质，这有助于研究疾病的病理生理学机制、筛选诊断标志物和药物靶点等。
血清蛋白质组学方法。
血清蛋白质组学方法
血清中的蛋白质具有来源广、组成复杂、种类和数量多以及不同蛋白含量差异大等特点。
如白蛋白是最丰富的血清蛋白，贡献了约50％的血清蛋白含量。
为了通过
蛋白质组学分析血清中的蛋白质混合物，必须先消耗高丰度蛋白质，以检测低丰度蛋白质（主要的生物标志物靶标）。
因此血清蛋白质组学方法常常涉及高丰度蛋白
质的去除和分级技术，常用的技术包括抗体亲和与染料亲和。
去除高丰度蛋白质后，后续的分离和检测方法与其他蛋白质组学方法相同，如色谱分离与质谱鉴定等。
蛋白质与蛋白质组学实验指南
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感谢支持！(Thank you for downloading and checking it out!)蛋白质与蛋白质组学实验指南一、蛋白质组学基础蛋白质组学是一门综合性学科，旨在研究生物体内所有蛋白质的结构、功能、表达调控以及相互作用。
蛋白质组学研究对于揭示生物学过程中的分子机制、疾病发生发展规律以及药物作用机理具有重要意义。
本文将从蛋白质组学概述、蛋白质组学研究方法以及蛋白质组学应用领域三个方面进行介绍。
蛋白质组学概述蛋白质组学是在基因组学、转录组学和翻译组学的基础上发展起来的，它研究的是生物体内所有蛋白质的表达、修饰、相互作用以及功能。
蛋白质组学的发展涉及到多个学科，如生物信息学、生物技术、生物物理学和分子生物学等。
蛋白质组学研究对象不仅包括蛋白质的结构和功能，还包括蛋白质的表达水平、翻译后修饰以及蛋白质之间的相互作用等。
蛋白质组学研究方法蛋白质组学研究方法主要包括蛋白质分离、蛋白质鉴定、蛋白质定量以及蛋白质功能分析等。
在蛋白质分离方面，常用的技术有凝胶渗透色谱、离子交换色谱、亲和色谱等。
蛋白质鉴定主要采用质谱技术，通过测定蛋白质的肽质量指纹图谱来识别蛋白质。
蛋白质定量方法有西方印迹法、定量PCR等。
此外，蛋白质组学还可以采用蛋白质芯片技术、蛋白质蛋白质相互作用网络分析等方法来研究蛋白质的功能。
蛋白质组学应用领域蛋白质组学在多个领域具有广泛的应用，包括疾病机理研究、药物研发、生物标志物发现、个性化医疗等。
在疾病机理研究中，蛋白质组学可以帮助研究者发现与疾病相关的蛋白质及其相互作用网络，从而揭示疾病的发生发展规律。
血浆-血清-体液蛋白质组学(完整版 柳满然)
MAIDI-TOF
数据处理 与生物信 息学分析
ESI-MS/MS
13
2DE:Advantages & Disadvantages
• Provides a hard-copy record of separation • Allows facile quantitation • Separation of up to 3000 different proteins • Highly reproducible • Gives info on Mw, pI and post-trans modifications • Inexpensive • Limited pI range (4-8) • Proteins >150 kD not seen in 2D gels • Difficult to see membrane proteins (>30% of all proteins) • Only detects high abundance proteins (top 30% typically) • Time consuming • 30% of spots with multiple proteins from pI 4-7
基本缩略词
IEF: isoelectric focusing (等电聚焦) 2-DE：Two-dimensional gel electrophoresis
第一向基于蛋白质的等电点不同用等电聚焦分离； 第二向则按分子量的不同用SDS-PAGE分离， 把复杂蛋白混合物中的蛋白质在二维平面上分开
蛋白质组学标本要求
蛋白质组学标本要求蛋白质组学是研究蛋白质在生物系统中的表达、组成、功能和相互作用的一门学科。
在进行蛋白质组学研究时，选择合适的标本对于结果的准确性和可靠性至关重要。
本文将介绍蛋白质组学研究中常用的标本要求。
一、组织和细胞标本组织和细胞是蛋白质组学研究的常见标本。
在选择组织和细胞标本时，需要考虑以下要求：1. 样本来源：标本应根据研究目的选择合适的来源，如人体组织、动物模型或细胞系。
2. 样本数量：样本数量应根据研究的统计学要求确定，通常需要多个重复样本来获得可靠的结果。
3. 样本质量：样本质量对于蛋白质组学研究至关重要。
标本应避免受到污染或降解，如冷冻保存、离心分离、快速冻结等可以保证样本质量。
4. 样本处理：样本处理应尽量避免蛋白质的降解和修饰。
常见的处理方法包括冷冻研磨、离心分离、蛋白质提取等。
二、体液标本体液标本是蛋白质组学研究的重要标本之一。
在选择体液标本时，需要考虑以下要求：1. 样本类型：常见的体液标本包括血浆、血清、尿液、唾液等。
选择合适的体液标本应根据研究目的和样本获取的便利性综合考虑。
2. 样本收集：样本的收集应遵循规范的操作流程，避免污染和样本失活。
例如，血液标本应采用抗凝剂进行处理，避免血液凝固。
3. 样本保存：体液标本在采集后需及时处理或冷冻保存，以保证蛋白质的稳定性和完整性。
4. 样本预处理：体液标本中存在大量的蛋白质，为了提高检测的灵敏度和准确性，常需要进行样本预处理，如蛋白质浓缩、清除高丰度蛋白等。
三、细胞外液标本细胞外液标本是研究细胞外蛋白质组的重要手段。
在选择细胞外液标本时，需要考虑以下要求：1. 样本类型：常见的细胞外液标本包括细胞培养上清液、胶原水解液、脑脊液等。
选择合适的细胞外液标本应根据研究目的和样本获取的便利性综合考虑。
2. 样本收集：样本的收集应遵循规范的操作流程，避免污染和样本失活。
例如，细胞培养上清液应在细胞生长状态良好时收集，避免细胞死亡。
3. 样本保存：细胞外液标本在采集后需及时处理或冷冻保存，以保证蛋白质的稳定性和完整性。
一、血浆蛋白质的组成、功能及分类 (一)血浆蛋白质的组成
（四）α1-酸性糖蛋白（α-AG或AAG）分 子量约4万，含糖约45％，pI2.7～3.5，主要 由肝细胞合成，某些肿瘤组织也可合成。 AAG是主要的急性相反应蛋白，急性炎症时 上升，与免疫防御功能有关。
AAG测定方法 使用AAG抗体，进行免 疫散法或免疫比浊法检测，
【参考范围】0.25～2.0g/L
【临床意义】主要作为急必时相反应的指 标，风湿病、恶性肿瘤、心肌梗塞患者上升， 营养不良、严重肝病下降。
（五）甲胎蛋白（AFP）分子量6.5～7万， pI4.75，含糖量4％，主要在胎儿肝合成，妊 娠13～15周血清AFP含量最高，以后逐渐下 降，出生时仅为高峰期的1％，周岁时接近成 人水平，仅10～30μg/L，功能不详。
1. 维持血浆胶体渗透压 清蛋白。
2. 作为某些物质的载体 如清蛋白能 与多种物质结合（FA、胆红素），而某 些球蛋白具特异地运输某些物质的功能， 运铁蛋白、运皮质醇蛋白。
3. 维持体液pH恒定 血浆蛋白PI一 般都小于7.4是弱酸，一部分的弱酸盐形 式存在，构成缓冲对。
4.免疫功能 血浆中汗多具有免疫功 能的球蛋白，主要由浆细胞合成，电泳时 位于r区带，如IgG、IgA、IgM、IgD、 IgE，此外，还有具有免疫作用的非特异 球蛋白，如补体。
CER测定方法 免疫化学法或酶活性测定。
【参考范围】0.2～0.5g/L。
【临床意义】CER属于急性时相反应蛋白。 在感染、创伤和肿瘤时上升，Wilson病（肝豆状 核变性）CER下降。
（九）转铁蛋白（TRF） 血浆中主要含铁 蛋白质，分子量7.7万，含糖约6％，由肝及网 状皮系统合成，半寿期7天。
（十）β2-微球蛋白（BMG） 由淋巴细胞合 成，分子量11800，pI5.7，存在于所有有核细胞 的表面，特别是淋巴细胞和肿瘤细胞并由此释放 入血，半寿期107min。
血浆血清体液蛋白质组学
LC-ESI-MS/MS: 高效液相色谱-电喷雾串联质谱 9
基本缩略词
PMF： Peptide Mass Fingerprinting (肽质量指纹谱)， 是蛋白质被识别特异酶切位点的蛋白酶水解后得到的 肽片段的质量图谱
IPG(EF)：Immoblized pH gradients isoelectric focusing (固相pH梯度等电聚焦)
Protein digests
Results
Auto MS/MS detection
BioWorks data base search
Tandem MS spectra
17
Shotgun:Advantages & Disadvantages
Advantages
Disadvantages
• Alleviate some limitations • Requires more handling for
蛋白质组学研究中，质谱测序一般采用两种方式： 一种是利用串联质谱 (MS/MS) 测序； 另一种是利用源后衰变 (PSD：post-source decay) 技术PepIdent: ProteinProspector: PepSea: 195.41.108.38
Protein extract 1 Label with fluor 1
Mix labeled extracts
Co-separate by 2D PAGE
Excitation wavelength 1
Image gel
Protein extract 2 Label with fluor 2
Excitation wavelength 2
血清和血浆
血清和血浆血清和血浆是两种常见的生物体液，它们在临床和科研领域中起着重要的作用。
血清和血浆都是从全血中分离出来的成分，但它们在组成和功用上略有区别。
本文将对血清和血浆进行详细解析，包括它们的定义、制备方法、用途以及在临床中的应用。
血清是指在全血凝固后，将凝结的纤维蛋白和血小板去除后得到的液体。
它主要是血浆在凝固过程中释放出来的液体部分，不包含纤维蛋白原、凝血因子和血小板。
血清中含有丰富的蛋白质、激素、抗体、酶等生物活性物质，可以通过离心分离全血后收集血清得到。
血清可以用于诊断疾病、研究生物学过程、评估病情和药物治疗的有效性等。
血浆是指在抗凝剂的作用下，将离心后的全血中的红细胞、白细胞和血小板等固体成分去除后得到的液体。
血浆是血液的非细胞部分，它约占据全血的半数以上。
血浆是通过离心分离全血后收集得到，可以用于血型鉴定、输血、制备血浆制品等。
血浆中含有水、蛋白质、营养物质、激素、细胞因子等，它们在维持正常生理功能和免疫应答中起着重要的作用。
血清和血浆的制备方法有所不同。
血清的制备过程中需要对全血进行离心，去除凝固物质和血小板，然后将液体部分分离收集。
而血浆的制备中，在全血中加入抗凝剂，离心后直接将非细胞部分的液体收集。
制备血清和血浆的离心参数和离心时间也会因实验目的和设备不同而有所差异。
血清和血浆在医学临床中有着广泛的应用。
首先，它们可以用于诊断疾病。
通过检测血清和血浆中的生物标志物、抗体和激素水平，可以帮助医生了解患者的病情和病因，并进行合理的治疗。
其次，血清和血浆还可以应用于疾病预防和控制。
通过研究血清和血浆中的抗体水平，可以评估人群对某种病原体的暴露和免疫情况，为疫苗接种和流行病防控提供依据。
此外，血清和血浆还可以通过蛋白质组学和基因组学等技术用于生物医学研究，以揭示疾病发生机制和药物作用机理。
然而，血清和血浆在应用中也存在一些限制和注意事项。
首先，采集和处理血清和血浆的过程需要严格的操作技术和标准，以确保样品质量和可靠性。
蛋白组组学
蛋白组组学蛋白组学是一门研究蛋白质在生物体中组成、结构和功能的学科，是生物信息学领域的重要组成部分。
通过对蛋白质组的研究，人们可以更深入地了解生物体内蛋白质的种类、数量、结构和功能，从而揭示生命活动的规律和机制。
蛋白质是生物体内最基本的功能分子，承担着细胞结构的构建、信息传递、代谢调节等重要功能。
蛋白组学的研究主要包括蛋白质的组成、表达水平、翻译后修饰、互作关系等方面。
通过对蛋白质组的系统分析，可以揭示蛋白质在细胞和生物体水平上的功能和调控机制，为疾病的诊断、治疗和药物研发提供重要的理论基础和实验依据。
在蛋白组学研究中，常用的技术包括质谱分析、蛋白质芯片、蛋白质相互作用分析等。
质谱分析是一种常用的蛋白质鉴定和定量方法，可以通过质谱仪测定蛋白质的质量、序列和修饰信息。
蛋白质芯片是一种高通量的蛋白质检测技术，可以同时分析大量蛋白质的表达水平和功能。
蛋白质相互作用分析可以揭示蛋白质之间的相互作用关系，帮助理解蛋白质网络的结构和功能。
通过蛋白组学的研究，人们可以揭示蛋白质在细胞和生物体中的功能和调控机制，发现新的生物标志物和药物靶点，为疾病的诊断、治疗和药物研发提供重要的科学依据。
例如，蛋白组学在肿瘤研究中发挥着重要作用，可以帮助识别肿瘤特异性蛋白质，揭示肿瘤发生发展的机制，为个性化治疗提供依据。
总的来说，蛋白组学是一门重要的生物信息学学科，对揭示生物体内蛋白质的组成、结构和功能具有重要意义。
通过蛋白组学的研究，人们可以更深入地了解生命活动的规律和机制，为疾病的诊断、治疗和药物研发提供重要的理论基础和实验依据。
希望通过不断地努力和创新，蛋白组学在生命科学领域发挥更大的作用，为人类健康和生命质量的提高做出更大的贡献。
代谢组学中血浆和血清的主要区别
代谢组学中血浆和血清的主要区别代谢组学是一门研究生物体代谢物质组成和变化的科学，通过分析和解释代谢物质的变化来研究生物体的生理状态和疾病进程。
在代谢组学中，血浆和血清是两种常用的样本类型，它们在代谢物质组成和应用中有着一些主要区别。
血浆和血清是从全血中分离出来的液体样本，它们具有相似的成分，但也存在一些不同之处。
血浆是在全血凝固前离心分离得到的，而血清则是在全血凝固后离心分离得到的。
这两种样本都包含了丰富的代谢产物，如脂质、蛋白质、糖类和代谢产物等。
血浆和血清在代谢组学研究中的主要区别在于它们的成分和应用。
血浆中含有凝血因子，而血清中则没有。
这意味着血清在某些实验中更适用，因为它不会干扰凝血过程。
血浆中的凝血因子可以通过离心和凝固来去除，从而得到类似于血清的样本。
因此，在一些代谢组学研究中，血浆和血清可以互相替代使用。
血浆和血清在代谢物质组成方面也存在一些差异。
血浆中含有一定量的蛋白质，这些蛋白质可以与代谢物质结合，影响其测量结果。
而血清中则没有这些蛋白质的干扰，因此在某些代谢物质的测量中，血清更为准确。
例如，在糖类代谢的研究中，血浆中的葡萄糖浓度可能会被蛋白质的干扰而得到较高的测量值，而血清中的葡萄糖浓度则更为准确。
血浆和血清在样本处理和保存方面也有一些差异。
血浆需要在采集后立即进行离心分离，并在低温下保存，以保持代谢物质的稳定性。
而血清则可以在采集后放置一段时间再进行离心分离，其样本处理和保存相对更加简单。
因此，在一些需要大量样本处理的代谢组学研究中，血清更受欢迎。
总结起来，血浆和血清在代谢组学研究中存在一些主要区别。
血浆中含有凝血因子，而血清则没有；血浆中的蛋白质可能对代谢物质的测量结果产生干扰，而血清中则没有这种问题；血浆的样本处理和保存相对更加复杂，而血清则更为简单。
在实际应用中，研究人员需要根据具体的研究目的和需求选择合适的样本类型，以获得准确可靠的代谢组学结果。
血浆和血清作为常用的样本类型，在代谢组学研究中发挥着重要的作用，为揭示生物体的代谢特征和疾病机制提供了有力的工具。
临床蛋白质组学
临床蛋白质组学
临床蛋白质组学是指将蛋白质组学在临床医学中应用的领域。
蛋白质组学是一种研究生物体蛋白质组成和蛋白质功能的分析技术，因其高通量、高灵敏度、高分辨率等优势，越来越多地被应用于生物医学研究和临床诊断。
临床蛋白质组学的发展可以追溯到20世纪90年代，当时随着质谱技术的发展，研究人员开始将其应用于生物体中蛋白质的鉴定和分析。
随着技术的不断成熟和完善，临床蛋白质组学在临床诊断和治疗中有着越来越重要的作用。
临床蛋白质组学主要应用于以下几个方面：
1.疾病诊断和治疗
临床蛋白质组学可以通过分析体液中的蛋白质差异，为疾病的早期诊断和治疗提供帮助。
例如，在肺癌的早期诊断中，血清中糖类抗原CA125和CA15-3的含量可以通过临床蛋白质组学的方法进行测定，从而提高肺癌的检测灵敏度和特异性。
2.药物研发
临床蛋白质组学可以用于药物研发的各个环节，如靶点发现、药效评价和药物安全性评价等。
例如，在新药开发中，研究人员可以通过对治疗和对照组患者的体液样品进行蛋白质组学分析，发现新的生物标志物，从而为新药的研发提供依据。
3.疾病机制研究
临床蛋白质组学可以帮助研究人员深入了解疾病的发生、发展机制，为疾病的预防和治疗提供新的思路。
例如，在糖尿病的研究中，通过蛋白质组学分析可以发现糖尿病患者血浆中存在着多个蛋白质的异常表达和修饰，从而揭示出了糖尿病的发生机制。
总之，临床蛋白质组学的发展为临床医学的发展提供了新的思路和手段。
随着研究的不断深入和技术的不断进步，临床蛋白质组学必将在医学领域中发挥越来越重要的作用。
血液蛋白质组学
血液蛋白质组学
血液蛋白质组学包括血浆蛋白质组学和血清蛋白质组学，选择血浆还是血清需根据研究目的而定。
百泰派克生物科技提供基于质谱的血液蛋白质组学分析服务。
血液蛋白质组学
人的血液中的蛋白质基本包括了来自所有器官、组织、细胞中的蛋白质，因此血液是用于诊断各种疾病和发现生物标志物的有价值的和最常用的标本。
血液蛋白质组学就是对血液中的蛋白质组进行研究。
血液蛋白质组学。
蛋白质组学用血清还是血浆好
血清指血液凝固后，在血浆中除去纤维蛋白原及某些凝血因子后分离出的淡黄色透明液体或指纤维蛋白原已被除去的血浆。
血浆是血液的重要组成部分，为淡黄色液体，组成复杂（包括大量的水和蛋白质、脂类、无机盐等）。
血浆由向血液中加入抗凝剂后离心得到，因此与血清的主要区别在于含有纤维蛋白，但抗凝剂可能会影响研究结果。
在进行蛋白质组学研究时，采用血清还是血浆需要根据研究目的进行选择，例如研究一种凝血因子时用血浆较好。
蛋白组学血液样本要求
无论是血浆蛋白质组学还是血清蛋白质组学均需从血液开始制备获得血浆或血清，血浆是向血液中加入抗凝剂后离心获得的上清液，血清是由血液凝固后离心获得的
上清液，因此研究者需根据研究目的进行血液处理。
如果后续使用质谱进行分析，不推荐使用EDTA作为抗凝剂。
血液应于-80℃储存，且不能反复冻融。
第8章 体液蛋白质检验(4课时+2课时病例分析)
血浆蛋白质功能
1.直接在血液中发挥作用
在血浆中运载弱水溶性物质 维持血浆胶体渗透压(清蛋白) 组成血液pH缓冲系统
因在急性炎症病人血清中出现的可以结合 肺炎球菌细胞壁C-多糖的蛋白质而命名 是第一个被认定的急性时相蛋白 由肝细胞所合成，115kD 电泳分布在慢γ区带，有时可延伸到β区带
广泛存在于体液中，具有类似抗体的功能，能 激活补体，促进粒细胞、白细胞的运动和吞噬， 有免疫调理作用和吞噬作用，表现炎症反应
血浆蛋白质有多种功能，PA即TTR能转运甲状 腺激素，并结合携带视黄醇的RBP；ALB是最 重要的血浆营养蛋白和血浆载体蛋白；AAG是 主要的APP；AAT是最重要的蛋白酶抑制物； Hp结合Hb并防止Hb从肾脏丢失；血浆铜95％ 存在于Cp中；TRF携带铁在血液中运输；α2MG也是主要的蛋白酶抑制剂；CRP能结合异 物并激活补体；CEA是非器官特异性肿瘤相关 抗原；AFP是用于诊断肝癌的肿瘤标志物。
C-反应蛋白首先升高 12小时内α1-酸性糖蛋白也升高 然后触珠蛋白 、α1抗胰蛋白酶升高 最后是铜蓝蛋白升，早期C反应蛋白、α1抗胰蛋白 酶、α1酸性糖蛋白、触珠蛋白上升很快，然后相 继在3周内逐步降低至正常。
组织损伤后24小时血中触珠蛋白和α1抗胰蛋 白酶开始升高，同时可有血中纤维蛋白原水平的 上升，使血栓形成的可能性升高。
对血小板凝集和血块收缩有抑制作用。
是炎症、感染及疗效的良好指标。
临床意义
急性时相反应的一个极灵敏的指标。 浓度升高：急性心肌梗死、创伤、感染、炎 症、外科手术、肿瘤浸润、风湿病时血浆CRP浓 度迅速显著升高，可达正常浓度的数千倍。 结合临床病史，有助于随访病程。
样本准备tips血清or血浆？看看专业化学期刊Chem Rev文章怎么说
样本准备tips|血清or血浆？看看专业化学期刊Chem Rev文章怎么说有句谚语说“眼睛是通往灵魂的窗户”，在疾病研究中，由于血液会流经整个身体，并反应机体内循环特征和个体生理机能，因此血液可以被认为是了解病人身体状况的窗口。
研究人员试图从血液蛋白质组中破译有价值的信息，但在大多数蛋白质组学研究中，真正直接分析的并不是血液，而是血液中的血浆或血清部分。
血液是监测病人健康状况的一种非常有价值的液体（Haleem J. Issaq, Zhen Xiao, and Timothy D. Veenstra，2007）既然血液样本价值这么高，那选择血清还是血浆？样本怎么准备？怎么做蛋白质组学实验呢？这些问题可谓是血液蛋白组经典问题，小迈在查阅文献时发现了一篇宝藏文章，迫不及待第一时间和大家分享。
该文章为2007年发表在Chemical Reviews（IF：62.1）的文章“Serum and Plasma Proteomics”，文章中对“为什么使用血液做蛋白质组学”、“血液蛋白质特征”、“如何分析血液蛋白质”进行了详细讲解，接下来小迈会对上述内容总结后进行分享。
一、血液样本类型比较➢血浆血浆是在去除所有细胞类型后留下的上清部分，在此过程中会去除纤维蛋白凝块，获取方法如下：用含有EDTA或肝素钠的采血管采集血液后，立即轻轻颠倒混匀，在4℃条件下3000 rpm离心10 min，吸取上清液（即血浆）置于离心管中。
血浆准备示意图➢血清血清相比于血浆是在没有任何抗凝血剂的情况下制备的，获取方法如下：用含有促凝剂的血清分离胶采血管（常用品牌推荐：BD）采集血样，室温静置（注意:不能振摇采血管）60 min使其凝结后，4℃条件下3000 rpm离心10 min，吸取上清液（即血清）分装于合适的离心管中。
血清样本准备示意图➢血浆与血清差异凝血过程使血清与血浆有本质上的不同。
纤维蛋白凝块含有血浆中的大部分纤维蛋白原，因此纤维蛋白凝块去除导致血清蛋白质浓度低于血浆，然而，这种差异仅在3-4%左右。
蛋白组学流程 组织
蛋白组学流程组织
蛋白质组学是一种研究蛋白质的技术和方法，它可以帮助我们了解蛋白质的表达、修饰、相互作用等方面的信息。
以下是蛋白组学研究的一般流程：
1. 样品制备：从研究对象（如细胞、组织、体液等）中提取蛋白质。
通常使用裂解液、超声处理或其他方法将蛋白质从细胞或组织中释放出来。
2. 蛋白质分离：使用二维电泳（2-DE）或液相色谱（LC）等技术将蛋白质混合物分离成单个蛋白质。
3. 蛋白质鉴定：使用质谱（MS）技术对分离的蛋白质进行鉴定。
通常使用基质辅助激光解吸/电离（MALDI）或电喷雾离子化（ESI）等技术将蛋白质离子化，并通过分析其质量/电荷比（m/z）来确定蛋白质的身份。
4. 蛋白质定量：使用同位素标记（如稳定同位素标记）或其他定量方法对蛋白质进行定量分析。
5. 数据分析：使用生物信息学工具对蛋白质鉴定和定量数据进行分析，包括蛋白质注释、功能分类、网络分析等。
6. 验证和功能研究：通过其他实验技术（如Western blotting、免疫组化、细胞培养等）对蛋白质表达和功能进行验证和进一步研究。
蛋白组学研究的流程可能因具体的实验设计和研究目的而有所不同。
在实际操作中，可能需要根据具体情况进行调整和优化。
血清和血浆的区别运动生理学
血清和血浆的区别运动生理学1.引言1.1 概述血清和血浆是两种常见的生物学液体，在医学和生物化学研究中有着重要的应用。
血清和血浆都是血液的组成部分，它们之间存在一些显著的区别。
血浆是无细胞的液态部分，它是通过离心分离血液细胞后剩余的液体。
而血清则是在血浆中去除了凝血因子之后得到的液体。
在运动生理学中，血清和血浆被广泛应用于研究运动过程中的生理反应和健康状况。
血浆是由血液中的红细胞、白细胞、血小板等细胞成分和液体成分混合而成的黏稠液体。
血浆中含有丰富的蛋白质、糖类、脂类、氨基酸、激素和酶等物质。
同时，血浆还起到运输养分、药物和废物的作用，为维持机体正常功能发挥着重要的作用。
血浆的主要成分是水，约占血浆体积的90以上。
血清是在血浆基础上通过凝血过程去除了凝血因子后所得。
凝血因子主要包括纤维蛋白原、凝血酶原、纤维蛋白降解产物等物质。
凝血酶原是一种在血浆中存在的不活性蛋白质，它在凝血过程中被激活为凝血酶，从而引发凝血反应。
由于血清中不含有凝血因子，因此它呈现出液体状态，清澈透明。
在运动生理学中，血清和血浆可以通过提取血液样本进行生化指标检测，从而评估运动过程中的生理反应和机体健康状况。
通过分析血清和血浆中的蛋白质含量、酶活性、代谢产物等指标，可以了解到运动对机体的影响以及身体的适应能力。
此外，血清和血浆对于药物代谢和毒理学研究也具有重要意义。
总而言之，血清和血浆在运动生理学中是不可或缺的研究工具，它们通过分析血液中的生化指标来评估运动对机体的影响和身体的适应能力。
深入理解血清和血浆的区别和特点对于进行准确的运动生理学研究具有重要意义。
1.2文章结构文章结构部分的内容应该包括文章的主要分节和每个分节所涉及的内容。
根据给出的大纲，可以将文章结构部分的内容编写如下：在本文中，我们将按照以下结构来探讨血清和血浆的区别以及它们在运动生理学中的应用。
第一部分为引言。
首先，在概述部分将介绍血清和血浆的基本概念以及其在运动生理学中的重要性。
简述血浆和血清的区别是什么
简述血浆和血清的区别是什么血浆是离开血管的全血经抗凝处理后，通过离心沉淀，所获得的不含细胞成分的液体，那么你知道血浆和血清两者间有什么区别吗？下面由店铺为你介绍血浆和血清的区别，希望对大家有所帮助。
血浆与血清的区别1、成分血浆：正常人从血管抽出血液加抗凝剂，经离心沉淀，下面部分为血细胞，上面淡黄色部分就叫血浆，里面有第5、第8凝血因子及纤维蛋白原。
血浆的化学成分中，水分占90-92%，其他10%以溶质血浆蛋白为主，并含有电解质、营养素、酶类、激素类、胆固醇和其他重要组成部分。
血浆蛋白是多种蛋白质的总称，用盐析法可将其分为白蛋白、球蛋白和纤维蛋白原三类。
血清：正常人从血管抽出的血液不加抗凝剂，自然凝固，经离心沉淀，下面红色部分为血细胞部分，上面淡黄色部分就叫血清，里面没有第5、第8凝血因子及纤维蛋白原。
2、作用血浆的主要作用是供给血细胞，运输维持人体生命活动所需的物质和体内产生的废物等。
血浆相当于结缔组织的细胞间质。
血浆是血液的重要组成部分。
因为纤维蛋白原能转换成纤维蛋白，具有凝血作用，所以血浆一般是大面积烧伤的病人使用。
血清的作用是提供基本营养物质、提供激素和各种生长因子、提供结合蛋白、提供促接触和伸展因子使细胞贴壁免受机械损伤、对培养中的细胞起到某些保护作用。
血清还可以用来检验血型。
3、凝血反应在凝血反应中，血小板释放出许多物质，各凝血因子也都发生了变化。
这些成分都留在血清中并继续发生变化，如凝血酶原变成凝血酶，并随血清存放时间逐渐减少以至消失。
这些也都是与血浆区别之处。
但大量未参加凝血反应的物质则与血浆基本相同。
为避免抗凝剂的干扰，血液中许多化学成分的分析，都以血清为样品。
血浆和血清的鉴别方法血清的鉴别方法血液凝固析出的淡黄色透明液体。
如将血液自血管内抽出，放入试管中，不加抗凝剂，则凝血反应被激活，血液迅速凝固，形成胶冻。
凝血块收缩，其周围所析出之淡黄色透明液体即为血清，也可于凝血后经离心取得。
蛋白质谱对样品的要求
蛋白质谱对样品的要求质谱技术是蛋白质组学研究中的重要技术，可以实现多种蛋白质分析。
进行蛋白质质谱分析首先要制备合适的样品，样品的好坏程度与实验结果的准确度息息相关，很多小伙伴在问蛋白质质谱样品怎么准备、需要多少量等，这次小编就从样本类型、样本含量以及其他注意事项三个方面给大家介绍一下蛋白质质谱分析中样品制备相关的内容。
一、蛋白样本类型：可以用于质谱分析的蛋白样本类型很多，包括动植物/微生物细胞或细胞裂解液、动植物组织、体液样品如血清/血浆/尿液等、蛋白胶条/胶点以及Pull down/Co-IP/IP蛋白样本等。
二、不同的蛋白质样本的含量需求如下表所示：样本。
类型。
蛋白溶液。
细胞。
动物常规组织。
植物常规组织。
细菌与真菌菌体。
胶点胶条、Pull down/Co-IP/IP蛋白样本。
用量。
50ug。
(2ug/ul)。
1*107/(50ul细胞沉淀)。
100mg。
0.1-2g。
100mg/100ul。
胶条大小以1cm*1cm大小为宜，蛋白含量不低于20ug。
三、其他注意事项：1、对于蛋白质溶液样本需提供溶剂的试剂成分；2、若样品中含有毒性或腐蚀性的物质，必须事先声明；3、一些病原性的微生物或具有侵染性的病变组织需进行灭活；4、用银染法进行蛋白胶染色时，应选择与质谱分析兼容的试剂，银染的样本不能进行脱色。
综上可知，制备蛋白质质谱样品没有一个固定或统一的方法，应根据具体的实验目的和质谱分析的要求进行样本制备，在样本制备过程中应遵循准确记录、迅速低温的原则，最大限度的缩短样本采集到实验的时间，避免蛋白质发生降解。
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基本缩略词
MS：Mass Spectroscopy (质谱)
MS是单级质谱，适用于样品不是特别复杂的样品分析。 对于复杂样品，单级质谱会出现很多干扰峰，影响测定。
质谱仪分为进样系统、离子源、质量分析器和检测器四部分。 离子源又分为： 电子轰击源 (Electron Ionization，EI) 化学电离源 (Chemical Ionization，CI) 场致电离源 (FI) 电喷雾电离源 (Electro Spray Ionization，ESI) 等
• Highly reproducible • Gives info on Mw, pI and
post-trans modifications
• Inexpensive
• Only detects high abundance proteins (top 30% typically)
DIGE：2-D difference Gel Electrophoresis
HPLC：High-performance liquid chromatography
or high-pressure liquid chromatography (高压液相
iTRAQ: Isobaric tag for relative and absolute quantitation 同位素标记相对和绝对定量
MS/MS是串联四级杆质谱，通过两个质量分析器间的碰撞室进行
一定能量的碰撞，选择性的扫描碰撞后得到的子离子碎片，不符合
一定质量数的离子被抛弃，这就降低了背景噪音、大大提高了检测的
灵敏度和准确度。
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ESI-MS：Electro Spray Ionization-Mass Spectroscopy，
血浆、血清、体液蛋白质组学 研究及其应用
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蛋白组学基本知识
血浆、血清蛋白组学 唾液蛋白组学
尿液蛋白组学
脑、脊液蛋白组学
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一、蛋白组学基本知识
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蛋白质组(proteome = protein + genome): 一种细胞、组织或生物体完整基因组所对应的 全套蛋白质
蛋白质组学（proteomics) 研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化 规律的科学
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蛋白质组研究的基本技术
计算机 技术
分离
SDS-PAGE, IEF
Gel-based 2DE
SCX, RP, SEC
HPLC Liquid-based
2D-HPLC
FFE
LC-ESI-MS-MS
鉴定
MALDI-TOF-MS MS ESI-MS
MS-MS
MALDI-TOF-TOF MALDI-Q-TOF
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Proteomics
基本生物学问题 Post-translational modification Protein-protein interaction Genome-Transcriptome-Proteome
临床应用问题 Disease marker-diagnosis Drug target-therapy
ESI-MS-MS
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基本缩略词
IEF: isoelectric focusing (等电聚焦)
2-DE：Two-dimensional gel electrophoresis
第一向基于蛋白质的等电点不同用等电聚焦分离； 第二向则按分子量的不同用SDS-PAGE分离，
把复杂蛋白混合物中的蛋白质在二维平面上分开
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PMF常用软件 Mascot: Profound: PepIdent: www.expasy.ch/tools ProteinProspector: PepSea: 195.41.108.38
电喷雾质谱
MALDI-TOF-MS：Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization/
Time of Flight Mass Spectrome 基质辅助激光解吸离子化-飞行时间质谱， 是一种新型的软电离生物质谱
MALDI-TOF-TOF：基质辅助激光解吸离子化-串联飞行时间质谱
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基于2DE的差异蛋白质组分析技术流程
条件A:样品 条件B:样品
图像分析
差异蛋白质 质谱分析
确定差异点
MAIDI-TOF
数据搜寻蛋 白质鉴定
数据处理 与生物信 息学分析
ESI-ME:Advantages & Disadvantages
• Provides a hard-copy record of separation
IPG(EF)：Immoblized pH gradients isoelectric focusing (固相pH梯度等电聚焦)
蛋白质组学研究中，质谱测序一般采用两种方式：
一种是利用串联质谱 (MS/MS) 测序；
另一种是利用源后衰变 (PSD：post-source decay)
技术测序
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• Allows facile quantitation
• Separation of up to 3000 different proteins
• Limited pI range (4-8)
• Proteins >150 kD not seen in 2D gels
• Difficult to see membrane proteins (>30% of all proteins)
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常用串联质谱检索工具
SEQUEST: /sequest Mascot: PepFrag: ProteinProspector:
MALDI-Q-TOF：基质辅助激光解吸离子化-三级四级杆-飞行时间质谱
LC-ESI-MS/MS: 高效液相色谱-电喷雾串联质谱
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基本缩略词
PMF： Peptide Mass Fingerprinting (肽质量指纹谱)， 是蛋白质被识别特异酶切位点的蛋白酶水解后得到的 肽片段的质量图谱