蛋白质思考题总汇
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蛋白质化学思考题总汇
绪论
基因组,蛋白质组,功能基因组
为什么从基因组到蛋白质组是一个十分复杂而漫长的过程?
蛋白质一级结构
1、各种氨基酸的三字母符合和单字母符合。
2、名词概念:同源蛋白质、趋异突变、趋同、变异、蛋白质家族、蛋白质超家族、蛋白质、亚家族、单位进化周期、中性突变、蛋白质的一级结构。
3、各种氨基酸的性质与蛋白质空间结构的关系.
蛋白质的空间结构
1、名词及符号:蛋白质构象、蛋白质二级结构、超二级结构、三级结构、四级结构、结构域、连接条带、无规卷曲、无序结构、α-螺旋、β-折叠、β-转角、EF-手、3.6
13螺旋、HTH、HLH、b-Zip、motif、Zn指、domain、
2、稳定球蛋白构象有哪些的化学键.
3、二级结构的类型有哪些?
4、举例说明5种motif的结构特征。
蛋白质的分离纯化
1.透析、超滤、盐溶、盐析、亲和层析、电泳。
2.如何理解分子筛分离pr的原理。
3.有机溶剂分级分离pr的基本原理。
4.据支持物不同,电泳可分为哪几种类型?
5.常用的选择性吸附剂有哪几种?
6.哪些物质可作用蛋白质亲和层析的配体?
7.测定pr分子量有哪些方法?
8.如何理解蛋白质电泳中的浓缩效应,电荷效应及分子筛效应。
9.聚焦法测定pr、pI的基本原理。
10.可用哪些方法来分要蛋白质的N-末端和C-末端AA。
蛋白质转运和修饰
1、名词及符号:翻译同步转运、翻译后转运、信号肽、易位子、SRP、I、II型膜蛋白、内部信号序列、分子伴侣、hsp70、内体、靶向序列、靶向班块、网格蛋白、包被体、停靠蛋白、PDI、ARF、COP、内质网分拣信号(KDEL)、核定位信号(PKKKRKV)、过氧化体分拣信号(SKF)、线粒体基质信号(N-端15-35AA形成两亲a螺旋或b折叠)、溶酶体分拣信号(M6P)、泛蛋白。
2、蛋白质的修饰包括哪些内容。
3、决定蛋白质半衰期的因素及泛素化作用。
4、受体介导的内化的生物学意义。
5、简述翻译同步转运和翻译后转运的基本内容。
6、如何理解小泡介导的蛋白质转运的“生物膜不对称性”的意义。
7、简述SRP介导的蛋白质转运。
免疫球蛋白
1、Ig, V区,C区,抗原决定族,D基因,J基因,超变区(补体决定区,CDR),类别转换(CH启换),12-23bp规则,茎环结构,Fab,Fc,去环缺失模式,Ig的分类与重链。
2、描述Ig四链单位的分子特征(结构域,功能域)。
3、如何根据Ig分子的V区和C区的结构变化,将Ig分子的变异体分成类、亚类、型、亚型、群和亚群。
4、如何从基因水平上解释Ig的多样性。
脂蛋白
1、名词及符号:
LP,Apo,TG,FC,PL,CM,VLDL,LDL,HDL,IDL,HL,LPL,LCAT,LTP;郭清作用,增加调节。
2、简述一种脂蛋白受体的分子结构特征。
3、主要脂蛋白的密度分类、电泳分类、功能及缩写符号间的关系。
4、Apo可分哪些大类。
5、CM,VLDL,LDL,HDL代谢的基本情况及其相互关系
细胞黏附分子
1、名词及符号:ECM、Fn、Ln、FAK、TPK、SH、Ln-R、CD44,Ig-SF;血管地址素、整联蛋白、层连蛋白、钙粘蛋白、粘着班激酶、酪氨酸蛋白激酶、纤连蛋白。
2、简述细胞外基质粘附分子的功能。
3、细胞表面粘附分子(如整联蛋白、层连蛋白受体、钙粘蛋白等)有哪些可能的功能。细胞骨架蛋白
细胞骨架蛋白:细胞质中由蛋白丝组成的非膜相结构统的蛋白质
细胞骨架系统:微丝、微管和中间丝还包括核骨架、核纤层、细胞外基质细胞骨架的主要蛋白质:肌动蛋白(肌动蛋白相关蛋白),微管蛋白(微管相关蛋白),中丝间蛋白(各种中间丝相关蛋白)。
加帽蛋白:选择性阻断F-肌动蛋白微丝的一端.如倒刺端加帽蛋白会造成微丝缩短,而尖端加帽蛋白会造成微丝的延长
肌球蛋白:属于马达蛋白,由两个重链和2个轻链组成肌球蛋白分子,两个分子尾部相连,缔合形成粗丝双极性结构,球形的头部具有ATP酶活性
肌球蛋白和肌动蛋白有什么功能?肌肉收缩,细胞结构,细胞运动,细胞分裂,细胞株凋亡,细胞器的转运
马达蛋白的功能:驱动蛋白和动力蛋白
细胞因子
1、名词及符号:PDGF、CSF、HGF、EPO、EGF、INF、TGF、NGF、IL、TNF、FGF、IGF、TPK;自分泌、旁分泌、内分泌、细胞内分泌、细胞因子、自磷酸化、重叠性、协调性、多功能性。
2、细胞因子(Cystokine)有哪些分类方法,各自的分类依据是什么?
3、简述细胞因子的结构和功能特点。
4、简述细胞因子受体结构的共同特征和功能特点
激素与信号转导
1、名词及符号
外激素、激素受体、下降调节(增加上升调节)、激素正协同效应、激素对抗、效应器、5-HT、ADH、LRH、FRH、TRH、CRH、OT、CRIH、AMP、AC、HCG、LH、FSH、CCK、PMCG、TSH、E2、P4、T、F、MSH、GH、PL(PRL)、ACTH、PG、CT、PTH、MRIH、MRH、PRH、PRIH、
GRIH、GRH。
2、哪些器官可以分泌H?据化学本质、H素可分哪几类?
3、受体分几类?胞内和胞膜受体的作用机理。
4、神经体液调节的基本模式。
糖蛋白和蛋白多糖
1、名词及符号:Gal、Glc、GalNAc、Fuc、SA、Man、Dol、GAG、HA、CS、KS、HS:糖蛋白,蛋白多糖、戊糖核心、高Man型、杂合型、复合型、还原末端、非还原末端、天线、糖型(同一Pr.不同NXS/T上的N-聚糖结构不同)。
2、比较O-聚糖和N-聚糖的差异。
3、ABO血型的分子差异(H-A;GalNAc -T;H-B;Gal-T)
4、O-糖基化和N-糖基化位点的结构特征。
5、简述N-糖合成与成熟的部位及特点(Dol,糖基转移,cis,中间,外侧高尔基体,糖苷酶,糖基转移酶)
蛋白质生物合成与调控
Kozak序列,帽子结合蛋白,小亚基需扫描,AUUUA序列(与mRNA的稳定性相关),翻译绕过,反式翻译(避免核糖体阻滞在异常mRNA上,加速核糖体再循环,翻译出异常多肽链的C端标记,便于被识别和降解)
mRNA翻译中的重编码:移码,密码子意义重定义(redefine),翻译中模板的不连续性
原核与真核生物蛋白质生物合成的差异?