穿心莲八氢番茄红素脱氢酶ApPDS的基因克隆及功能鉴定
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T h e e D N A s e q u e n c e c o n s i s t s o f 2 2 2 4 b p w i t h a n i n t a c t O R F o f l 7 5 2 b p( G e n e B a n k : K P 9 8 2 8 9 2 ) , e n c o d i n g a p l o y p e p t i d e o f 5 8 4 a mi —
2 0 1 5 年1 0 月r 第4 O 卷 第1 9 期
凰 曼 蠡蠹
பைடு நூலகம்
V o 1 . 4 0 , N o 1 9『 O c t o b e r , 2 0 1 5
穿 心 莲八 氢 番 茄 红 素脱 氢 酶 A p P D S的基 因 克 隆及 功 能鉴 定
谌 琴 琴 ,李 丽 霞 , 战 鹏 林 ,王 强
莲 内酯类二萜生物合成基 因的功能奠定 了基础 。 [ 关键词 ] 穿心莲 ; R A C E; 八氢 番茄 红素脱氢酶 ; V I G S ; 反 向遗传学
Cl o n i n g a n d f u n c t i o n a l c h a r a c t e r i z a t i o n o f p h y t o e n e d e s a t u r a s e i n
( H) 一 b i n d i n g d o ma i n 。利 用 半 定 量 R T — P C R技 术 进 行 组 织 表 达 模 式 分 析 , 发现 P D S基 因在 穿 心 莲 的 根 、 茎、 叶、 花 中均有表 达 ,
表达量为叶 >花 >茎 > 根 。用 病毒诱导基因沉默 ( V I G S ) 的方法在穿 心功莲体 内鉴定 A p P D S的功能 , 构建 V I G S载体 p T R V 2 .
P D S , 经农杆菌浸染穿心莲叶 片, 植物表型观察 、 定量 R T — P C R检测 A p P D S基 因 的表 达 , 结 果 观 察 到 叶 片 轻 微 变 黄 和 明显 的 基 因下调 , 鉴定了 A p P D S在 体 内 的功 能 。该 研 究 首 次 克 隆 并 鉴 定 了穿 心 莲 P D S基 因 , 为 进 一 步 研 究 穿 心 莲 中 新 基 因 尤 其 是 穿 心
An d r o gr a phi s pa ni c u l a t a
S H E N Q i n — q i n 。 , L I L i — x i a , Z HA N P e n g 一 1 i n , WA N G Q i a n g ‘
( 1 . C o l l e g e A g r o n o m y , S i c h u a n A g r i c u l t u r a l U n i v e r s i t y ,C h e n g d u 6 1 1 1 3 0 ,C h i n a ;
n 0 a c i d s .Ho mo l o g y a n a l y s i s s h o we d t h a t t h e d e d u c e d p r o t e i n h a s e x t e n s i v e s e q u e n c e s i mi l a r i t i e s t o P DS f r o m o t h e r p l a n t s a n d c o nt a i ns
( 1 .四 川农业 大 学 农 学院 ,四 川 成 都 6 1 1 1 3 0 ; 2 . 四川 农业 大 学 动物 医学院 ,四 川 成 都 6 1 1 1 3 0 )
[ 摘要] 采用 R T — P C R和 R A C E技术从穿心莲植株 中克隆得到了八氢番茄红素脱氢酶 ( P D S ) 的全长 c D N A, 预测有一个 1 7 5 2 b p的完整 开放阅读框 ( 序列 已登 录 G e n B a n k , 登录号 K P 9 8 2 8 9 2 ) , 编码 5 8 4个氨基 酸。序列 同源性 分析 , 穿 心莲 P D S编码 的氨 基酸序列与芝麻 、 广藿香 、 黄芩 等其他植物的 P D S有很 高的同源性 , 该蛋 向包 含一个共 有的氨基 酸脱氢 酶的辅酶结构 域 N A D
2.Co l l e g e V e t e r i n ar y Me d i c i n e,Si c hu an Agr i c ul t u r a l Un i v e r s i t y,Ch e n gd u 611 1 3 0
,
C h i n a)
l A b s t r a c t ] A f u l l — l e n g t h c D N A o f p h y t o e n e d e s a t u r a s e( P D S )g e n e f r o m A n d r o g r a p h i s p a n i c u l a t a w a s o b t a i n e d t h r o u g h R A C E — P C R .
,
a c o n s e r v e d NAD( H) 一 b i n d i n g d o ma i n o f p l a n t d e h y d r a s e c o f a c t o r b i n d i n g — d o ma i n i n N— t e r mi n a 1 .P h y l o g e n e t i c a n a l y s i s d e mo n s t r a t e d t h a t A p P DS w a s mo r e r e l a t e d t o PDS o 厂 S e s a mu m n d i c u m a n d Po g o s t e mo n c a b l i n .T h e s e mi — q u a n t i t a t i v e RT — P CR a n a l y s i s r e v e a l e d t h a t
2 0 1 5 年1 0 月r 第4 O 卷 第1 9 期
凰 曼 蠡蠹
பைடு நூலகம்
V o 1 . 4 0 , N o 1 9『 O c t o b e r , 2 0 1 5
穿 心 莲八 氢 番 茄 红 素脱 氢 酶 A p P D S的基 因 克 隆及 功 能鉴 定
谌 琴 琴 ,李 丽 霞 , 战 鹏 林 ,王 强
莲 内酯类二萜生物合成基 因的功能奠定 了基础 。 [ 关键词 ] 穿心莲 ; R A C E; 八氢 番茄 红素脱氢酶 ; V I G S ; 反 向遗传学
Cl o n i n g a n d f u n c t i o n a l c h a r a c t e r i z a t i o n o f p h y t o e n e d e s a t u r a s e i n
( H) 一 b i n d i n g d o ma i n 。利 用 半 定 量 R T — P C R技 术 进 行 组 织 表 达 模 式 分 析 , 发现 P D S基 因在 穿 心 莲 的 根 、 茎、 叶、 花 中均有表 达 ,
表达量为叶 >花 >茎 > 根 。用 病毒诱导基因沉默 ( V I G S ) 的方法在穿 心功莲体 内鉴定 A p P D S的功能 , 构建 V I G S载体 p T R V 2 .
P D S , 经农杆菌浸染穿心莲叶 片, 植物表型观察 、 定量 R T — P C R检测 A p P D S基 因 的表 达 , 结 果 观 察 到 叶 片 轻 微 变 黄 和 明显 的 基 因下调 , 鉴定了 A p P D S在 体 内 的功 能 。该 研 究 首 次 克 隆 并 鉴 定 了穿 心 莲 P D S基 因 , 为 进 一 步 研 究 穿 心 莲 中 新 基 因 尤 其 是 穿 心
An d r o gr a phi s pa ni c u l a t a
S H E N Q i n — q i n 。 , L I L i — x i a , Z HA N P e n g 一 1 i n , WA N G Q i a n g ‘
( 1 . C o l l e g e A g r o n o m y , S i c h u a n A g r i c u l t u r a l U n i v e r s i t y ,C h e n g d u 6 1 1 1 3 0 ,C h i n a ;
n 0 a c i d s .Ho mo l o g y a n a l y s i s s h o we d t h a t t h e d e d u c e d p r o t e i n h a s e x t e n s i v e s e q u e n c e s i mi l a r i t i e s t o P DS f r o m o t h e r p l a n t s a n d c o nt a i ns
( 1 .四 川农业 大 学 农 学院 ,四 川 成 都 6 1 1 1 3 0 ; 2 . 四川 农业 大 学 动物 医学院 ,四 川 成 都 6 1 1 1 3 0 )
[ 摘要] 采用 R T — P C R和 R A C E技术从穿心莲植株 中克隆得到了八氢番茄红素脱氢酶 ( P D S ) 的全长 c D N A, 预测有一个 1 7 5 2 b p的完整 开放阅读框 ( 序列 已登 录 G e n B a n k , 登录号 K P 9 8 2 8 9 2 ) , 编码 5 8 4个氨基 酸。序列 同源性 分析 , 穿 心莲 P D S编码 的氨 基酸序列与芝麻 、 广藿香 、 黄芩 等其他植物的 P D S有很 高的同源性 , 该蛋 向包 含一个共 有的氨基 酸脱氢 酶的辅酶结构 域 N A D
2.Co l l e g e V e t e r i n ar y Me d i c i n e,Si c hu an Agr i c ul t u r a l Un i v e r s i t y,Ch e n gd u 611 1 3 0
,
C h i n a)
l A b s t r a c t ] A f u l l — l e n g t h c D N A o f p h y t o e n e d e s a t u r a s e( P D S )g e n e f r o m A n d r o g r a p h i s p a n i c u l a t a w a s o b t a i n e d t h r o u g h R A C E — P C R .
,
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