化学结构绘图()

Workspace
Color Palette Status bar
标题栏(Title bar) 菜单栏(Menu bar) 通用工具条(General toolbar)-在菜单键的下面, 包括那些 在结构和画图模式中都会用到的通用键, 如:保存文件, 打开文 件, 取消/重做操作, 拷贝和粘贴, 扩大与缩小, 以及插入不同 的模块。
一、ACD/ChemSketch基础
• 1.启动ACD/ChemSketch • 2.设定可兼容的文件类型 • 3. ChemSketch的工作界面
1.启动ACD/ChemSketch
两种启动方法：（1）从桌面双击图标启动 （2）从开始菜单启动：开始/所有程序 /ACDlabs FreeWare 5.0/ChemSketch
注：（1）免费版本弹出一个对话框ACD/Labs Products，点击OK或直接关闭。
（2）ACD/ChemSketch包括两个软件，3D Viewer（3D视图）和
ChemSketch， 在3D Viewer中可以看到绘制好的分子式的空间结构。
2.设定可兼容的文件类型
(1) 在第一次使用此软件时, 设定可兼容的文件类型(File Associations)对话框将出现. (2)这些可兼容的形式包括CS ChemDraw(*.CHM), REACCS Rxnfiles (*.RXN), ISIS/Sketch (*.SKC) , 可能还有其他格式的 文件, 这些文件都可以在ChemSketch 中打开. 具体做法是在 想要添加的选项前的方框内点上对号, 然后点击YES键即可。 (3)如果不知道或者不确切地知道 ChemSketch将打开的文件 的扩展名, 不要选任何选项, 然后点击NO键。 (4)然后今日诀窍(Tip of the Day)窗口将跳出, 可以在阅读结 束后关闭 。
Title bar Menu bar General toolbar ChemBasic toolbar Structure toolbar
Atoms toolbar
Reference toolbar
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• ChemBasic 功能键(ChemBasic toolbar) -在一般功能键的下 面, 它们是可选功能, 包括附件和其他 ChemBasics 的功能（免 费版无此项）。 • 结构模式功能栏(Structure toolbar)只有结构模式有这些功能 键, 包括画化学结构和相关功能. • 原子功能键(Atoms toolbar)包括原子名称和改变原子性能的键 (电荷, 电子层等). • 参考功能键 (Reference toolbar) 可以从此处进入ACD字典. • 工作区域(Workspace) 结构式将在这里显示. • 调色板(Color Palette)用来将原子和化学键等涂上颜色(只要在 相应的颜色上点击既可). • 状态栏(Status bar)-显示对当时状态有用的信息: 打开的SK2文 件名, SK2文件的页码, 化学结构的分子式, 以及化学结构的一些 性质。
1．使用常用画图工具
• 例1 画出结构
H3 C CH 3
当程序开始时，常用画图工具 是默认的。在这种模式下，可以很容易地 画直链和分支结构，并用元素周期表中的原子取代所画的原子。 在结构模式(Structure Model) 下,从原子工具条选择碳原子（默认） 。 单击空白处，画出CH4。 单击CH4以增加一个 CH3集团，并以标准键长连接。再双击同一个碳原子，画 CH3 出 HC 。
3. ChemSketch的工作界面
• 结构模式的工作界面（默认） • 画图模式的工作界面
Title bar Menu bar
结构模式的工作界面
Structure toolbar
General toolbar ChemBasic toolbar
ຫໍສະໝຸດ Baidu
Atoms toolbar
Reference toolbar
Color Palette Status bar
二、画简单的结构
• • • • • • • • • • • 常用工具介绍: 常用画图工具 连续画图工具 画链工具 在立体结构中, 远离你的键 在立体结构中,指向你的键 配位键 非定义键 翻转工具 编辑原子标签工具 改变位置(Change Position)
3
CH3
单击Set Bond Vertically HC CH 构旋转至 。
3 3
CH3
,套住左侧的水平键， 将从上一步得到的结
CH3
单击结构工具栏中常用画图工具 单击最右边的碳原子，画出 H C
3
。 。 CH
3
CH 3
例2 （双键和三键）
H3C
CH2
CH3
H3C CH
H3 C
CH3
CH3 CH 3
Title bar Menu bar
画图模式的工作界面
Editing toolbar Drawing toolbar
General toolbar ChemBasic toolbar
Workspace
• • • • • • • •
标题栏(Title bar) 菜单栏(Menu bar) 通用工具条(General toolbar)同结构模式。 编辑工具条(Editing toolbar) – 位于通用工具条的下面, 只适用于画图模式,包括编辑动画物体的功能键. 画图工具条(Drawing toolbar)包括画各种物体和文字的 功能键. 工作区域(Workspace)- 在中间的区域, 图画与文字将在 这里显示. 调色板(Color Palette) 用来将物体等涂上颜色,(只要在相 应的颜色上点击即可). 状态栏(Status bar) -显示对当时状态有用的信息: 打开的 SK2文件名和 SK2文件的页码等.
画出例1的结构
H3C
CH3
，在最后一个碳原子上单击增加碳链长度， ，在单键上点击得到双键
H3C CH2
画出
CH3
CH3
在双键上单击得到三键。
H3C CH
CH3
然后，点2D优化
即可 。
若重新在三键上单击又得到单键
注：（1）删除原子 如果增加了过多的原子, 可以逐一去除原子，点击 Delete 键.使用Delete 键也可以将整个分子清除， 先在空白处单击选中整个分子（或用套索工具选中） ，然后在分子上单击。点右键可取消删除状态。 （2）恢复键(Undo) 另外一个重要的功能是如何恢复以前的界面设置: 单击Undo键 。这会将ChemSketch的界面恢复到以前 的设置（ 点击 Undo键将会激活重做(Redo)键） Undo键可以连续点击50次.当画比较复杂的结构或者 物体时, 要养成及时保存文件的习惯file/save.