ChemSketch软件及ISISdraw(化学绘图)的使用
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1 ChemSketch 软件(化学绘图)的使用
ACD/ChemSketch 是高级化学发展有限公司(ACD)设计的用于化学画图用软件包,该软 件包可单独使用或与其他软件共同使用。这是一个非常实用和功能强大的化学图形绘图软 件,它是绘制化学分子结构式、化学反应式、化学装置示意图和相关的化学论文或演讲设计 图等的综合软件包。
底端 顶端 对齐 对齐
2 ISISDraw 软件(化学绘图)的使用
2.1 窗口界面
如图 2-1 所示
选取 2D 旋转
擦除 添加原子 符号工具 添加碳键符号 添加立体键 添加碳链工具
反应式加号
反应箭头工具 标注原子对 系列工具
括弧工具 文本工具 线条工具
矩形工具
命名工具
图 2-1 ISIS Draw 2.4 窗口界面
图 1-6 回流加热实编 辑 置图形 水 平 左 对 右 对 中间垂
取 转 文本 于前面
旋转
齐
齐
直对齐
置图形 于后面
组合 图形
上 下 旋 转 中间水
旋转 900
平对齐
图 1-8 绘图模式编辑工具栏的功能 有关 ChemSketch 软件的详细使用说明可使用帮助文件。
参考结构栏
图 1-2 Draw 模式界面图
1.2 绘制化学分子结构式示例
(1) 使用结构模板绘制结构简式 绘制步骤: (1)在结构模式下的常用工具栏右边上选取结构模板,弹出结构模板窗口,如图 1-3 所示。用鼠标点取所需结构模板(如三苯基磷结构)。 (2)在工作区适当位置单击鼠标,则该结构式出现在工作区。将其保存,其后辍名为 *.sk2 。也可将其复制于粘贴板上,可复制于其它文档如 WORD 文档中。如图 1-4 所示。
P
Triphenylphosphine PPh3
图 1-4 复制-粘贴图形
图 1-5 PPH3 的棒式结构立体图 请用原子工具栏和结构模板绘制下列分子式结构式:
CH3
C CH2
绘制化学键时, 当鼠标选取某
个原子后, 移向化学键时, 单
N
N
击单键, 则单键成为双键, 单 击双键, 则双键成为叁键, 单
ACD/ChemSketch 有如下主要功能: 结构模式:用于画化学结构和计算它们的性质。 画图模式:用于文本和图象处理 分子性质模式:对以下性质进行估算:分子量、百分组成、摩尔折射率、 摩尔体积、等张比容、折射率、表面张力、密度、单一同位素质量、标称分子量和平均 分子质量。
1.1 窗口界面
ChemSketch 有两种窗口界面,结构模式界面和绘图模式界面,两种界面可以通过左上 角编辑工具栏中的 Structure Mode 和 Draw Mode 按钮进行切换。
B、键、链、原子基团的绘制:单击左边垂直工具条上“Bond”或“Chain”工具按钮,选取 单、双、叁键或链,在绘图区单击鼠标左键或按住左键拖动鼠标即可绘制键或链。单击左边
垂直工具条上“Atom”工具按钮,在欲绘部位单击左键,即出现文本输入框,可以直接从键 盘输人或从下拉菜单中选取欲输人的原子基因。
图 1-3 结构模板窗口
(2) 立体结构式的绘制步骤: 完成上述结构式绘制步骤后,在主菜单栏的 ACD/Labs 菜单 中选取 3D Viewer ,则工作窗口切换到 3D 状态,可以用编辑工 具栏工具使其成为所期侍的立体图形和角度, 如图 1-5 所示。将其 保存,后辍名为*.s3d,同样也可复制粘贴板上用于其它文档的素 材。 从上述的操作中可看出,使用该软件绘制化学结构式是非常简单 容易的事情。当然要熟悉各种工具的使用,必须通过多次的反复 的使用过程。
CH3
击叁键, 则叁键成为单键
对-二甲苯
苯乙烯
-联吡啶
(3) 绘制化学图形示例 用绘图模式绘制图 1-6 的实验装置图。 操作步骤: (1)运行程序,切换为 Draw 模式,在常用工具栏中打 开右边的应用图形模板窗口,如图 1-7 所示 (2)选取适当图形,在工作区用编辑栏工具进行组合, 应用模板中没有的图形可用绘图工具栏中的工具进行绘制,然 后组合。 (3)画出的图形认为满意后进行存盘,或将其复制于粘 贴板上用于其它文档引用。 编辑工具栏的各图标的功能如图 1-8 所示。
C、键、链、原子基团的编辑:点击左边工具条上的“Select”按钮,双击欲编辑的键、链 和原子基团,即弹出编辑对话框,在对话框中修改完毕后点击“OK”即可。
D、结构图的等比例放大或缩小:使用模板工具栏中的模板在窗口中绘制出的图形往往 比实际需要的图形大或小。因此常常需要进行缩放处理。点击“Select”按钮选中图形后,按 住右下角拖动即可放大或缩小结构图,同时右上角出现放大、缩小百分比。松开鼠标后,会 弹出一个对话框,询问以后绘制的结构图是否按此比例放大或缩小,这样可以保证所有的结 构式均为相同尺寸,以免大小不一。 2.2.2 反应式的绘制
“Template”项,菜单下列有程序自带的数十类几百个模板,从芳环、多元环、羰基化合物到 糖、氨基酸等等应有尽有,使用十分方便。点击选取后直接在窗口中欲绘制处点击左键即可。 同时窗口上的模板工具条也可根据日常研究工作的需要进行定制。方法是在工具条右边点击 右键,击活快捷工具栏,选择“Customize Menu And Tool”,弹出定制对话框,将所需官能团 移至工具条上点击“OK”(可选)。
Structure Mode 窗口界面如图 1-1 所示,可分为主菜单栏、常用工具栏、原子工具栏、 参考结构式工具栏、状态栏、工作区和颜色面板。 Draw Mode 窗口界面如图 1-2 所示,分为主菜单栏、常用工具栏、状态栏、绘图工具栏、工 作区和颜色面板。
常用工具栏
主菜单栏
原子工具栏
状态栏 图 1-1 Structure 模式界面图
2.2 基本操作
请模仿图 2-1 工作区的图形进行下列操作绘制图形
2.2.1 分子式绘制 基本步骤: (l)在模板工具条或模板上选取相应的官能团,绘出基本框架; (2)在框架上进行原子、键及分子编辑,绘制出目标结构式; (3)运行“Chem Inspector”,进行结构式检查,确保所绘结构式的正确性(可选)。 说明: A、运用模板画结构式:模板可以从窗口上方模板工具条选取,也可点击菜单栏上
ACD/ChemSketch 是高级化学发展有限公司(ACD)设计的用于化学画图用软件包,该软 件包可单独使用或与其他软件共同使用。这是一个非常实用和功能强大的化学图形绘图软 件,它是绘制化学分子结构式、化学反应式、化学装置示意图和相关的化学论文或演讲设计 图等的综合软件包。
底端 顶端 对齐 对齐
2 ISISDraw 软件(化学绘图)的使用
2.1 窗口界面
如图 2-1 所示
选取 2D 旋转
擦除 添加原子 符号工具 添加碳键符号 添加立体键 添加碳链工具
反应式加号
反应箭头工具 标注原子对 系列工具
括弧工具 文本工具 线条工具
矩形工具
命名工具
图 2-1 ISIS Draw 2.4 窗口界面
图 1-6 回流加热实编 辑 置图形 水 平 左 对 右 对 中间垂
取 转 文本 于前面
旋转
齐
齐
直对齐
置图形 于后面
组合 图形
上 下 旋 转 中间水
旋转 900
平对齐
图 1-8 绘图模式编辑工具栏的功能 有关 ChemSketch 软件的详细使用说明可使用帮助文件。
参考结构栏
图 1-2 Draw 模式界面图
1.2 绘制化学分子结构式示例
(1) 使用结构模板绘制结构简式 绘制步骤: (1)在结构模式下的常用工具栏右边上选取结构模板,弹出结构模板窗口,如图 1-3 所示。用鼠标点取所需结构模板(如三苯基磷结构)。 (2)在工作区适当位置单击鼠标,则该结构式出现在工作区。将其保存,其后辍名为 *.sk2 。也可将其复制于粘贴板上,可复制于其它文档如 WORD 文档中。如图 1-4 所示。
P
Triphenylphosphine PPh3
图 1-4 复制-粘贴图形
图 1-5 PPH3 的棒式结构立体图 请用原子工具栏和结构模板绘制下列分子式结构式:
CH3
C CH2
绘制化学键时, 当鼠标选取某
个原子后, 移向化学键时, 单
N
N
击单键, 则单键成为双键, 单 击双键, 则双键成为叁键, 单
ACD/ChemSketch 有如下主要功能: 结构模式:用于画化学结构和计算它们的性质。 画图模式:用于文本和图象处理 分子性质模式:对以下性质进行估算:分子量、百分组成、摩尔折射率、 摩尔体积、等张比容、折射率、表面张力、密度、单一同位素质量、标称分子量和平均 分子质量。
1.1 窗口界面
ChemSketch 有两种窗口界面,结构模式界面和绘图模式界面,两种界面可以通过左上 角编辑工具栏中的 Structure Mode 和 Draw Mode 按钮进行切换。
B、键、链、原子基团的绘制:单击左边垂直工具条上“Bond”或“Chain”工具按钮,选取 单、双、叁键或链,在绘图区单击鼠标左键或按住左键拖动鼠标即可绘制键或链。单击左边
垂直工具条上“Atom”工具按钮,在欲绘部位单击左键,即出现文本输入框,可以直接从键 盘输人或从下拉菜单中选取欲输人的原子基因。
图 1-3 结构模板窗口
(2) 立体结构式的绘制步骤: 完成上述结构式绘制步骤后,在主菜单栏的 ACD/Labs 菜单 中选取 3D Viewer ,则工作窗口切换到 3D 状态,可以用编辑工 具栏工具使其成为所期侍的立体图形和角度, 如图 1-5 所示。将其 保存,后辍名为*.s3d,同样也可复制粘贴板上用于其它文档的素 材。 从上述的操作中可看出,使用该软件绘制化学结构式是非常简单 容易的事情。当然要熟悉各种工具的使用,必须通过多次的反复 的使用过程。
CH3
击叁键, 则叁键成为单键
对-二甲苯
苯乙烯
-联吡啶
(3) 绘制化学图形示例 用绘图模式绘制图 1-6 的实验装置图。 操作步骤: (1)运行程序,切换为 Draw 模式,在常用工具栏中打 开右边的应用图形模板窗口,如图 1-7 所示 (2)选取适当图形,在工作区用编辑栏工具进行组合, 应用模板中没有的图形可用绘图工具栏中的工具进行绘制,然 后组合。 (3)画出的图形认为满意后进行存盘,或将其复制于粘 贴板上用于其它文档引用。 编辑工具栏的各图标的功能如图 1-8 所示。
C、键、链、原子基团的编辑:点击左边工具条上的“Select”按钮,双击欲编辑的键、链 和原子基团,即弹出编辑对话框,在对话框中修改完毕后点击“OK”即可。
D、结构图的等比例放大或缩小:使用模板工具栏中的模板在窗口中绘制出的图形往往 比实际需要的图形大或小。因此常常需要进行缩放处理。点击“Select”按钮选中图形后,按 住右下角拖动即可放大或缩小结构图,同时右上角出现放大、缩小百分比。松开鼠标后,会 弹出一个对话框,询问以后绘制的结构图是否按此比例放大或缩小,这样可以保证所有的结 构式均为相同尺寸,以免大小不一。 2.2.2 反应式的绘制
“Template”项,菜单下列有程序自带的数十类几百个模板,从芳环、多元环、羰基化合物到 糖、氨基酸等等应有尽有,使用十分方便。点击选取后直接在窗口中欲绘制处点击左键即可。 同时窗口上的模板工具条也可根据日常研究工作的需要进行定制。方法是在工具条右边点击 右键,击活快捷工具栏,选择“Customize Menu And Tool”,弹出定制对话框,将所需官能团 移至工具条上点击“OK”(可选)。
Structure Mode 窗口界面如图 1-1 所示,可分为主菜单栏、常用工具栏、原子工具栏、 参考结构式工具栏、状态栏、工作区和颜色面板。 Draw Mode 窗口界面如图 1-2 所示,分为主菜单栏、常用工具栏、状态栏、绘图工具栏、工 作区和颜色面板。
常用工具栏
主菜单栏
原子工具栏
状态栏 图 1-1 Structure 模式界面图
2.2 基本操作
请模仿图 2-1 工作区的图形进行下列操作绘制图形
2.2.1 分子式绘制 基本步骤: (l)在模板工具条或模板上选取相应的官能团,绘出基本框架; (2)在框架上进行原子、键及分子编辑,绘制出目标结构式; (3)运行“Chem Inspector”,进行结构式检查,确保所绘结构式的正确性(可选)。 说明: A、运用模板画结构式:模板可以从窗口上方模板工具条选取,也可点击菜单栏上