苎麻生长素结合蛋白ABP1基因cDNA的克隆及表达
生长素结合蛋白ABP1基因在棉纤维伸长中的功能
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词 :棉花;生长素结合蛋白A B P 1 基因;纤维伸长;功能
中图分 类号 : ¥ 5 6 2 ;Q 7 8 6
文献标 志码 :A
文章编号 :1 0 0 7 — 1 0 3 2 ( 2 0 1 3 ) 0 6 — 0 6 0 4 — 0 5
On f un c t i o ns o f a ux i n bi n di ng pr o t e i n ABP1 g e ne i n c o t t o n ib f e r e l o n g a t i o n
摘
要 :以 ‘ 湘杂棉 1 4 ’ 为材料, 采用 R T - P C R方法克隆了棉花A B P 1 基因全长 e D N A序列。 序列全长 7 9 2 b p ,
与G e n B a n k中陆地棉 P 基 因序列 的同源性 为 9 9 %。 半定量分析表明 , 该基 因在棉花叶 、 花及纤维 中都有表达 , 其 中叶 中的表达量最高 ,花和纤维 中的表达量稍低 。A B P1基 因在纤维快速伸长期表达水平较高 ,纤维发育 的其 他时期的表达水平较低。将 P 基因 e D NA构建 成棉 花 A B P1 过表达载体 ,并 以 NP T I I 作为选择标 记 ,经农杆 菌介导转化棉花 ,获得了 6株 K a n抗性植株 ,其 中 3株 尸 』表达水平提高 。 尸 过表达植株生长发育正常 , 但纤维长度变化不显著 ,说明 P 棉纤维细胞 中提高表达水平对其细胞伸长没有显著作用 。
H UAN G L i . h u a , Z H AO Y a n , P E NG Z h e n . z i , Z E NG Q i a n , H U C h a o , Z H A NG X u e . we n
苎麻Actin1基因克隆及其在韧皮部纤维不同发育阶段的表达
A T G O OMI A SN C 2 1,61:0— 0 CA A R N C I I A 0 0 3()11 18
htp: www.hia r so g z b/ t / / c n c op .r / wx
I SN 49 .49 CCDEN HP S O 6 3 0; ) TS A9
马 雄 风 熊和 平 ,
河南安 阳 450 50 0
喻春 明 ・ 唐 守伟 朱 爱国 王廷周 朱 四元
刘建 新
t中国农业科 学 院麻 类研究 所 , 农业部 麻类遗 传改 良与T程微生 物重点 开放实 验室,湖南长沙 4 0 0 ; 中国农业科 学 院棉 花研究所 12 5
摘 要 :通 过 e NA 文 库 的 P R 筛 选 法 获 得 苎 麻 内 源 肌 动 蛋 白基 因 片 段 ,采 用 苎 麻 [o h ei nva( .Gad 中苎 D C B e m r ie L) u ] a 1号 为 材 料 , 合 R E 技 术 获 得 了 苎 麻 的 A t 1蛋 白 编 码 基 因 ( n C I ) e NA 全 长 序 y ( e B n 结 AC ci n B A TN1的 D IG n a k登 录 号 为 ] DQ 6 8 2 2 0 6 5 3 . 0 9年 8月 i日公 布 ) 该 基 因 全 长 e A 序 列 17 2b ,编 码 区 长 114b ,编 码 3 7个 氨基 酸 残 基 。 , , DN 8 p 3 p 7
B at 分 析表 明 ,B A TN 基 因 与桑 树 ( rs ab :DQ 8 8 8 、蓖麻 子 ( iiu o ru i:A 6 2 1、棉花 ls n n C II Mo u la 7 501 ) Rcn s c mn ns Y3 0 2 ) ( sy imhruu A 3 5 2 .0 7 6 等植 物的肌 动蛋 白基 因序列有 高度 的同源性 。对推导 的氨基酸序 列进行分 子 Go'pu i tm: Y 0 7 3 5 3 ) s . s 3 进化 分析表 明,该基 因与棉花 A t ci 白家族 A 7 4 11 AP 3 5 . 聚为一 类,三 者之间 的亲源关 系最 近 。建 立 n蛋 AP 3 5 .、A 7 4 71 荧光 定量 P R体 系,用 1 Sr N C 8 A和 Hio e R s n 3内参基 因对表达水 平均一 化,分析 B AC I 基 因在苎麻纤 维细胞伸 长 t n TN1 过程 中的表达水 平变化 。结果表 明,在株 高 9 m 时最高 ,约为株 高 1 、10和 2 0c 时表达 量的 2 0倍以上,是 7c 1 5 2 m 3 株 高 4 m时期 的 2 倍 。 7c 0 本研究揭示 的所获得 B A TN1 列为苎麻 的 Aei1 白编码 基 因,其最高 表达时期 开始 nC I 序 t 蛋 n 于纤维 快速 伸 长时期 ,但 稍 早 于纤维 发育 的 高峰 期,推测 该 基 因可能 与 韧皮部 纤 维伸 长过 程 中的肌 细胞 骨架 形 成
苎麻镉响应基因BnG6PDH1的克隆和表达分析
266江 苏 农 业 学 报 2019 年 第 35 卷 第 2 期图 2 苎麻 BnG6PDH1 基因 cDNA 序列全长及推测的氨基酸序列 Fig.2 The full ̄length sequence of BnG6PDH1 cDNA and the deduced amino acid sequence3 讨 论葡萄糖 ̄6 ̄磷酸 脱 氢 酶 是 磷 酸 戊 糖 代 谢 途 径 的 关 键 限 速 酶ꎬ 调 控 NADPH 和 碳 流 的 产 生[34] ꎮ G6PDH 催化生成的 NADPH 不仅为生物细胞中一些生物大分子的生物合成提供所需的还原力ꎬ同时 还是与抗氧化及解毒有关的还原型谷胱甘肽( Glu ̄ tathioneꎬ GSH) 再生的唯一还原力[35] ꎬ可见 G6PDH 在植物生长发育过程中起到至关重要的作用ꎮ 本研 究 从苎麻品种中苎一号中成功克隆了BnG6PDH1朱守晶等:苎麻镉响应基因 BnG6PDH1 的克隆和表达分析267BnG6PDH1:苎麻 Boehmeria nivea MG941010ꎻMnG6PDH:川桑 Morus notabilis XP_010111634.1ꎻZjG6PDH:枣 Ziziphus jujuba XP_015878928.1ꎻ PaG6PDH:甜樱桃 Prunus avium XP _ 021825040. 1ꎻ MdG6PDH: 苹 果 Malus domestica XP _ 008362117. 1ꎻ PmG6PDH: 梅 Prunus mume XP _ 008231184.1ꎮ 实线表示 NAD 结合区域ꎻ虚线表示 C 端保守结构域ꎻ▲表示活性位点ꎮ图 3 苎麻 BnG6PDH1 蛋白与其他植物 G6PDH1 蛋白氨基酸序列的同源性比较 Fig.3 Amino acid sequence alignment between BnG6PDH1 protein of ramie and G6PDH1 protein of other plants268江 苏 农 业 学 报 2019 年 第 35 卷 第 2 期图 4 BnG6PDH1 蛋白及其他植物 G6PDH 蛋白的系统进化树 Fig.4 Phylogenetic tree of BnG6PDH1 protein and G6PDH protein from other plants∗表示与根相比差异显著( P<0.05) ꎮ 图 5 BnG6PDH1 在苎麻不同组织中的表达分析 Fig.5 Expression analysis of BnG6PDH1 in different tissues oframie∗表示与 0 mg / L相比差异显著( P<0.05) ꎮ 图 6 BnG6PDH1 基因在不同浓度镉胁迫下的表达 Fig.6 The expression of BnG6PDH1 under different concentra ̄tion of cadmium基因的完整开放读码框ꎮ 保守结构域分析结果表 明ꎬ在推导的氨基酸序列中ꎬ35 ~ 223 位氨基酸属于 G6PDH 蛋白的 NAD 结合区域ꎬ227 ~ 503 位氨基酸 为 G6PDH 蛋白的 C 端保守结构域ꎬ213 ~ 219 位氨 基酸序列为 G6PDH 蛋白保守的 DHYLGKE 活性位点ꎬ以上结果表明它是一个典型的 G6PDH 蛋白ꎮ 植物体内同时存在胞质和质体氧化戊糖磷酸途径ꎬ即植物细胞中的 G6PDH 同工酶可分为胞质型和 质体型 2 种类型[36 ̄37] ꎬ胞质型 G6PDH 的氨基酸序 列比质体 G6PDH 少一段约 60 个氨基酸左右的转朱守晶等:苎麻镉响应基因 BnG6PDH1 的克隆和表达分析269运肽序列ꎮ 这 2 种类型的 G6PDH 在调节方式上有 所不同ꎬ 胞 质 G6PDH 受 到 代 谢 产 物 调 节ꎬ 而 质 体 G6PDH 只有在夜晚才具有活性ꎮ 目前ꎬ在不同植物 中发现了多种类型的 G6PDH 同工酶ꎬ比如拟南芥中 发现的 6 个 G6PDH 蛋白中ꎬ有 4 种为质体型ꎬ2 种 为胞质 类 型[14] ꎮ 本 研 究 中ꎬ 对 苎 麻 BnG6PDH1 蛋 白的生物信息学分析结果表明ꎬBnG6PDH1 与其他 植物 的 胞 质 G6PDH 蛋 白 相 似 性 较 高ꎬ 不 含 质 体 G6PDH 所具有的信号肽序列ꎬ也不存在跨膜区域ꎮ 亚细胞定位预测结果表明ꎬBnG6PDH1 蛋白主要位 于 细 胞 质 中ꎮ 系 统 进 化 树 分 析 结 果 表 明ꎬ BnG6PDH1 蛋白与胞质类 G6PDH 亲缘关系较近ꎮ 因此ꎬ综合以上结果可以推测ꎬ苎麻 BnG6PDH1 为 胞质型蛋白ꎮ一些研究结果表明ꎬG6PDH 基因的表达存在组 织特异性ꎮ 王晓晖等[38] 研究发现ꎬ腊梅 G6PDH1 基 因主要在花 和 根 中 表 达ꎬ 在 叶 和 茎 中 表 达 量 较 低ꎮ 侯夫云[39] 利用半定量 RT ̄PCR 分析了水稻胞质型 OsG6PDH1 基因在水稻根、茎、叶和幼穗中的表达情 况ꎬ结果发现 OsG6PDH1 在根、茎和穗中呈高丰度表 达ꎬ 而 在 叶 中 的 表 达 量 较 低ꎮ 本 研 究 中ꎬ 苎 麻 BnG6PDH1 基因在叶中表达量最高ꎬ而在根中表达 量最低ꎮ 这表明 G6PDH 在不同植物中的表达存在 差异ꎬ推测 BnG6PDH1 基因主要在苎麻的叶片生长 发育和防御机制中起作用ꎮ大量研究结果表明ꎬ外界的一些生物或非生物 胁迫能够诱导植物 G6PDH 的表达ꎬ包括重金属胁 迫ꎮ Van 等[40] 研 究 发 现ꎬ 菜 豆 在 锌 或 镉 离 子 剌 激 后ꎬG6PDH 及 其 他 酶 的 活 性 也 被 诱 导ꎬ 因 而 认 为 G6PDH 等酶可作为土壤是否受到锌或镉离子污染 的检测指标ꎮ 李焱[41] 对大豆的研究结果表明ꎬ高质 量浓度的铝胁迫可以诱发大豆胞质型 G6PDH 蛋白 活性 的 增 加ꎬ 2 个 编 码 胞 质 G6PDH 蛋 白 的 基 因 G6PDH1 和 G6PDH2 在铝胁迫下也能够被显著地诱 导表达ꎮ 钱立生等[42] 采用不同质量浓度的镍处理 小麦幼苗并测定根系抗氧化酶的活性ꎬ结果发现ꎬ小 麦 G6PDH 的活性随着镍处理质量浓度的提高而逐 渐提高ꎮ 本研究中ꎬ苎麻 BnG6PDH1 基因的表达显 著受镉的诱导ꎬ表达量随镉质量浓度的增加而增加ꎬ 暗示 BnG6PDH1 基因可能在苎麻镉耐受机制中具 有重要功能ꎬ这一结论将为后续苎麻耐镉生理及分 子机制研究提供线索和思路ꎮ参考文献:[1] 徐 奕ꎬ梁学峰ꎬ彭 亮ꎬ等. 农田土壤重金属污染黏土矿物钝 化修复研究进展 [ J] . 山东农业 科学ꎬ2017ꎬ49 ( 2) :156 ̄162ꎬ 167.[2] 陈怀满.土壤 ̄植物系统中的重金属污染[ M] . 北京:北京出版 社ꎬ 2005.[3] 公 勤ꎬ康 群ꎬ王 玲ꎬ等. 重金属铜对植物毒害机理的研究 现状及展望[ J] . 南方农业学报ꎬ2018ꎬ49(3) :469 ̄475.[4] 刘 晨ꎬ贾凤安ꎬ吕 睿.我国耕地重金属污染现状及固氮菌在 其修复中的作用[ J] . 江苏农业科学ꎬ2018ꎬ46(3) :21 ̄27.[5] CHRISTENSEN T H. 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苎麻4-香豆酸辅酶A连接酶-1基因的克隆与分析
苎麻4-香豆酸辅酶A连接酶-1基因的克隆与分析陈建荣;郭清泉【期刊名称】《中国农学通报》【年(卷),期】2008(24)10【摘要】为了抑制苎麻木质素代谢关键酶基因的表达,克隆苎麻内源木质素代谢关键酶的基因,为通过基因手段降低木质素含量奠定基础。
以苎麻为材料,采用PCR方法,以简并引物从苎麻基因组DNA模板中,首次克隆了其木质素代谢关键酶基因4-香豆酸辅酶A连接酶-1基因(4CL-1)的DNA部分序列,长度为983bp;采用RT-PCR的方法,以特异引物,从苎麻茎RNA反转录的cDNA为模板中,首次克隆了苎麻4CL-1cDNA核心序列,长度为110bp;经生物信息学方法分析,得知所获得的基因序列编码一段含37个氨基酸残基的多肽,该多肽与几个酰基合成酶和AMP结合酶的同源性较高,可以推论其编码了AMP形成与结合的保守区域。
【总页数】5页(P83-87)【关键词】苎麻;木质素生物合成代谢;4-香豆酸辅酶A连接酶;基因克隆【作者】陈建荣;郭清泉【作者单位】长沙学院生物工程与环境科学系【正文语种】中文【中图分类】S330【相关文献】1.七彩虹竹4-香豆酸辅酶A连接酶基因(Ih4 CL)的克隆及功能分析∗ [J], 孙金金;朱金鑫;杨宇明;王娟;王毅2.核桃内果皮4-香豆酸辅酶A连接酶基因克隆及表达分析 [J], 郭永翠;秦江南;朱玲;张锐3.多穗柯4-香豆酸辅酶A连接酶基因的\r克隆和表达分析 [J], 邢朝斌;冯若宣;王志焱;张妍彤;王卓;黄剑;龙月红4.茶树4-香豆酸辅酶A连接酶基因Cs4CL1的克隆与蛋白表达分析 [J], 高荣广; 李昊; 向勤锃; 李敏5.胡椒4-香豆酸:辅酶A连接酶Pn4CL基因的克隆及表达分析 [J], 范睿; 胡丽松; 伍宝朵; 郝朝运因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
一种DNA分子及其应用和获得高根量苎麻植株的方法[发明专利]
专利名称:一种DNA分子及其应用和获得高根量苎麻植株的方法
专利类型:发明专利
发明人:高钢,朱爱国,喻春明,陈平,陈坤梅,王晓飞,陈继康
申请号:CN202010552855.0
申请日:20200617
公开号:CN111575292A
公开日:
20200825
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:本发明涉及转基因技术领域,特别涉及一种DNA分子及其应用和获得高根量苎麻植株的方法。
该DNA分子为将苎麻BnWOX8基因5’端非翻译区翻译起始位点上游的2000~2500bp序列替换为SEQ ID NO:1的序列。
本发明将修饰后的DNA分子转入苎麻植株,获得的苎麻株系表现出较高的根系生产量,且对根系中总黄酮含量没有显著影响。
申请人:中国农业科学院麻类研究所
地址:410205 湖南省长沙市岳麓区咸嘉湖西路348号
国籍:CN
代理机构:北京集佳知识产权代理有限公司
代理人:潘颖
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一种水稻生长素响应蛋白基因ARP克隆及应用[发明专利]
专利名称:一种水稻生长素响应蛋白基因ARP克隆及应用专利类型:发明专利
发明人:裴忠有,宋东颖,赵飞,陈晓木,罗峰,孙守钧,段霞飞,吕建澎,王玲
申请号:CN201710511649.3
申请日:20170627
公开号:CN107227310A
公开日:
20171003
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:本发明涉及一种水稻生长素响应蛋白基因ARP克隆及应用,该基因位于水稻基因组的4号染色体,距离4,5,7-三羟黄烷酮加双氧酶基因3.8kb位置,该基因没有内含子,其基因序列为
SQ1,该基因ARP克隆的应用,是将所述水稻生长素响应蛋白基因ARP应用于水稻转基因育种、分子设计育种及水稻矮化育种领域。
本发明的生长素响应蛋白基因ARP可广泛应用于作物分子育种领域,将会给水稻等作物分子育种及矮化育种带来株高降低起推动作用,对水稻等作物育种产生巨大影响,并且在实施推广过程中对实验室及田间施肥管理要求条件宽松,株高矮化效果显著,为基因克隆和分子育种提供一套行之有效的方法。
申请人:天津农学院
地址:300384 天津市西青区津静路22号
国籍:CN
代理机构:天津盛理知识产权代理有限公司
代理人:韩奎勇
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小麦生长素结合基因TaABP1-D的克隆、功能标记开发及其与株高的关联
作物学报ACTA AGRONOMICA SINICA 2012, 38(11): 2034−2041 /zwxb/ ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9E-mail: xbzw@DOI: 10.3724/SP.J.1006.2012.02034小麦生长素结合基因TaABP1-D的克隆、功能标记开发及其与株高的关联乔麟轶1,**张磊1,**张文萍1赵光耀2王玺1,*贾继增2,*1沈阳农业大学农学院, 辽宁沈阳 110866; 2中国农业科学院作物科学研究所 / 农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程 / 农业部作物基因资源与种质创制重点实验室, 北京 100081摘要: 生长素在植物生长发育过程中通过建立浓度梯度来调控植物的株型。
ABP1 (auxin binding protein)作为生长素受体, 在质膜上相关生长素响应活动中起重要作用。
本研究从普通小麦中国春基因组数据库中分离了TaABP1基因的基因组序列, 根据基因组间序列差异将TaABP1定位于小麦第5同源群。
在中国春中克隆得到TaABP1-D基因的gDNA和cDNA序列。
TaABP1-D基因的开放阅读框为1 887 bp, 编码205个氨基酸, 含有ABP1蛋白典型的内质网滞留信号KDEL及Box区域。
表达分析表明, TaABP1-D在普通小麦中国春拔节期的根、茎基部、茎上部和叶尖均有表达, 相对表达量为叶尖>茎上部>根>茎基部, 与小麦的株型发育关系密切。
系统发育分析表明, ABP1基因在植物中较为保守, TaABP1-D是水稻OsABP1的直向同源基因。
针对TaABP1-D基因上游调控区重复序列差异(GT)6/5开发了一个SSR标记, 该标记在W7984×Opata85重组自交系(RIL)群体中对株高的表型变异解释率为9.7%, 是一个与株高极显著关联的功能标记; 其中对应高秆类型的等位变异属野生种特有, 在栽培种中被淘汰, 推测TaABP1-D基因在小麦驯化过程中可能经历了瓶颈效应。
苎麻茎皮环状RNA表达谱分析
作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2021, 47(6): 1020 1030 / ISSN 0496-3490; CN 11-1809/S; CODEN TSHPA9 E-mail: zwxb301@本研究由国家自然科学基金项目(31871678)和中国农业科学院科技创新工程项目(CAAS-ASTIP-IBFC)资助。
This study was supported by the National Natural Science Foundation of China (31871678) and the Agricultural Science and Technology Innovation Program of China (CAAS-ASTIP-IBFC).*通信作者(Corresponding author): 刘头明, E-mail: liutouming@第一作者联系方式: E-mail: 704510340@Received (收稿日期): 2020-02-24; Accepted (接受日期): 2020-07-02; Published online (网络出版日期): 2020-07-16. URL: https:///kcms/detail/11.1809.S.20200715.1817.006.htmlDOI: 10.3724/SP.J.1006.2021.04042苎麻茎皮环状RNA 表达谱分析李 富 王延周 严 理 朱四元 刘头明*农业农村部麻类生物学与加工重点实验室 / 中国农业科学院麻类研究所, 湖南长沙 410205摘 要: 苎麻[Boehmeria nivea (L.) Gaud.]是我国特色的天然纤维作物, 其纤维具有拉伸力强、纤维束长等特点。
解析苎麻纤维发育调控机制, 对实现纤维产量和品质性状遗传改良具有重要意义。
本研究基于高通量测序技术开展了苎麻茎顶部和中部的茎皮组织环状RNA (circRNA)分析, 在2个组织中共鉴定到5268个苎麻circRNA 。
两种苎麻纤维素合酶基因cDNA序列的克隆及表达
作物学报ACTA AGRONOMICA SINICA 2014, 40(11): 1925-1935http:///ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9E-mail: xbzw@ DOI: 10.3724/SP.J.1006.2014.01925两种苎麻纤维素合酶基因cDNA序列的克隆及表达刘昱翔1,**陈建荣2,**彭彦1黄妤1赵燕1黄丽华1郭清泉2张学文1,*1湖南农业大学生物科学技术学院, 湖南长沙 410128; 2长沙学院生物工程与环境科学系, 湖南长沙 410003摘要: 从苎麻转录组数据出发, 利用Blast工具从中分析出与多种植物纤维素合酶高度相似的片段CL789和Unigene 20360。
根据片段信息设计特异性引物, 从苎麻[Boehmeria nivea (Linn.)Gaud.]栽培种湘苎3号中克隆纤维素合酶核心片段, 并利用5'及3'RACE技术获得2个片段的全长cDNA。
两者都具有典型的纤维素合酶特征结构域, 表明为2个苎麻纤维素合酶基因CesA的cDNA序列, 分别命名为BnCesA2和BnCesA3。
BnCesA2基因编码区全长度3240 bp, 编码1079氨基酸多肽; BnCesA3基因编码区全长3120 bp, 编码1039氨基酸多肽。
对BnCesA2和BnCesA3基因在湘苎1号、湘苎3号、湘潭大叶白和城步青麻苎麻品种木质部和韧皮部荧光定量PCR分析显示, 2个基因在不同品种苎麻的木质部及韧皮部都有表达, 但表达量存在着一定差异, 整体而言BnCesA2具有更高的表达水平, 其木质部和韧皮部的表达都为BnCesA3的2~5倍。
推测BnCesA2和BnCesA3均参与了苎麻细胞壁的次生合成。
关键词:苎麻; 纤维素合酶基因; cDNA克隆; 表达分析cDNA Cloning and Expression of Two Cellulose Synthase Genes from Boeh-meria niveaLIU Yu-Xiang1,**, CHEN Jiang-Rong2,**, PENG Yan1, HUANG Yu1, ZHAO Yan1, HUANG Li-Hua1, GUO Qing-Quan2, and ZHANG Xue-Wen1,*1 College of Bioscience and Biotechnology, Hunan Agricultural University, Changsha 410128, China;2 Department of Biotechnology and Environ-mental Science, Changsha University, Changsha 410003, ChinaAbstract: Two potentially high homologous fragments CL789 and Unigene 20360 were identified as plant cellulose synthase character sequence from the transcriptome data we obtained previously by Blast aligning and homologous screening. The two pairs of specific primers were then designed based on the CL789 and Unigene 20360 sequences information. The intermediate fragments of two cellulose synthase gene cDNA were cloned from ramie variety Xiangzu 3 by RT-PCR. And the whole cDNA was cloned by followed 5' and 3' RACE. The full length cDNAs were sequenced and their encoded putative proteins were identified as cellulose synthase by the conserved domain analysis. The‘se two cDNA sequences were named as BnCesA2 and BnCesA3 respec-tively. The full-length coding sequence of BnCesA2 gene is 3240 bp, and encodes a putative 1079 amino acids. The coding se-quence of BnCesA3 gene is 3120 bp, and could be translated into a 1039 amino acids protein. We designed the specific primers based on cDNA sequences of the two genes and their expression levels were tested by quantitative real-time PCR (qRT-PCR), indicating that BnCesA2 and BnCesA3 were both actively expressed in phloem and xylem in the four different cultivars of ramie. But the level of expression showed significant difference that the BnCesA2 expression was 2 to 5 multiples higher than BnCesA3 in both phloem and xylem. It is speculated that both the BnCesA2 and BnCesA3 participate the primary and secondary cell wall biosynthesis.Keywords: Ramie (Boehmeria nivea L.); Cellulose synthase genes; cDNA cloning; Expression analysis苎麻为荨麻科苎麻属多年生宿根性草本植物, 是重要的韧皮纤维作物[1], 同时还具有较强的水土本研究由国家自然科学基金项目(31071457), 湖南省科技计划重点项目(2012NK3062), 湖南省教育厅项目(SCX1103)和湖南省教育厅科学研究一般项目(12C0156)资助。
苎麻生长素结合蛋白BnABP1与GFP融合在烟草中的表达
苎麻生长素结合蛋白BnABP1与GFP融合在烟草中的表达黄妤;周晶辉;乔波;赵燕;张学文【摘要】运用已克隆的苎麻生长素结合蛋白BnABPl基因cDNA及植物表达载体pCAMBIA 1300-GFP,构建了35S启动子控制的苎麻BnABP1基因编码区段与绿色荧光蛋白(GFP)基因融合表达重组体(pCAMBIA1300-GFP-BnABPl).通过根癌农杆菌介导法将其转化烟草WS38,经抗性筛选和PCR检测获得了转基因烟草.对转基因烟草细胞进行荧光显微镜观察,发现在细胞质膜和内膜系统上都有较强烈的荧光信号,进一步证明苎麻生长素结合蛋白ABPI已结合在细胞的膜系统上.%The coding region of a cloned cDNA of Ramie auxin binding protein gene (BnABPl) was inserted into a plant expression vector pCAMBIA1300-GFP under the control of promoter CaMV35S to construct a green fluorescent protein (GFP) fusion expression vector. The recombinant plasmid named pCAMBIA1300-GFP-BnABPI was transformed into Nicotiana tabacumWS38 via Agrobacterium tumefaciens mediated transformation and transgenic tobacco was obtained by screening on antibiotic media and by PCR identification. The transgenic tobacco callus was detected under fluorescence microscope and the strongest green fluorescence signals were appeared in plasma membrane and inner membrane system. The results showed that Ramie auxin binding protein ABP1 was mostly concentrated in the membrane system of cell.【期刊名称】《湖南农业大学学报(自然科学版)》【年(卷),期】2012(038)004【总页数】4页(P381-384)【关键词】苎麻;苎麻生长素结合蛋白ABP1基因cDNA;绿色荧光蛋白;烟草转化【作者】黄妤;周晶辉;乔波;赵燕;张学文【作者单位】湖南农业大学生物科学技术学院,湖南长沙410128;湖南农业大学生物科学技术学院,湖南长沙410128;湖南农业大学信息科学技术学院,湖南长沙410128;湖南农业大学生物科学技术学院,湖南长沙410128;湖南农业大学生物科学技术学院,湖南长沙410128【正文语种】中文【中图分类】Q786生长素参与植物生长和发育的诸多过程,研究其作用机制对深入认识植物生长发育的生理过程有重要意义[1-3]。
甘蔗生长素结合蛋白ScABP4基因的克隆与表达
甘蔗生长素结合蛋白ScABP4基因的克隆与表达邓宇晴;翟玉山;彭磊;董萌;徐倩;程光远;林彦铨;徐景升【摘要】Auxin binding protein (ABP) plays an important role in auxin signal transduction and the regulation of plant growth and development.To study the function and expression features of the ABP gene in sugarcane,we cloned an ABP gene from a sugarcane cultivar (Badila) using RT-PCR.Sequence analysis showed that it contained a 615 bp open reading frame (ORF) and encoded a deduced protein of 204 amino acids.It was designated as ScABP4 because of the multiple sequence alignment and phylogenetic tree analysis results revealed that it had closer relationships with ABP4 in Sorghum bicolor and Zea mays.It was cloned into the prokaryotic expression vector pGEX-6P-1 and expressed a 22.5 kD protein successfully in E.coli.Subcellular localization assay showed that ScABP4 protein is located in the reticular of cytoplasm and on the cytomembrane;protein structure prediction showed that it has a signal-peptide,speculate it may be stored in the endoplasmic reticulum,and exert its function on the plasma membrane,qRT-PCR showed that ScABP4 expressed in bud,root,stem and leaf in sugarcane with the highest expression level in bud.ScABP4 was up-regulated by IAA or dark treatments indicated that ScABP4 might participate in sugarcane responses to auxin,and involved in light signaling pathway(s).In addition,the expression of ScABP4 in sugarcane was induced by ABA,JA,SA and CuCl2 but was down-regulated by CdCl2.These results indicated thatScABP4 might involve in the sugarcane resistance to disease,osmotic and heavy metal stress,which provides the basis for further studying the functions of ScABP4.%生长素结合蛋白(auxin binding protein,ABP)在生长素信号转导、植物生长发育调控等方面发挥重要作用.该研究利用RT-PCR方法从甘蔗品种Badila中克隆得到了1个ABP基因,序列分析显示该基因的开放读码框(ORF)长度为615 bp,编码204个氨基酸.多序列比对和系统进化树分析表明它与高粱(Sorghum bicolor)和玉米(Zeamays)的ABP4蛋白的亲缘关系最近,因此将该基因命名为ScABP4.将其构建到原核表达载体pGEX-6P-1中,成功表达出一个分子量约为22.5 kD的蛋白.亚细胞定位结果显示ScABP4主要定位于细胞质网状结构和细胞膜;生物信息学分析显示ScABP4是一个带有信号肽的分泌蛋白,说明ScABP4蛋白可能储存在内质网中并在质膜上执行其生物学功能.荧光定量PCR分析结果表明,ScABP4基因在甘蔗的芽、根、茎、叶中均有表达,其中在芽中相对表达量最高.生长素和黑暗处理下ScABP4基因的表达上调,说明ScABP4基因可能参与甘蔗对生长素的响应及与光信号通路的互作.此外,ABA、JA、SA、CuCl2胁迫能够诱导ScABP4基因的表达,CdCl2胁迫可抑制ScABP4的表达.由此推测,ScABP4基因可能参与甘蔗对病害、干旱、渗透、重金属等胁迫的应答过程.该研究结果为探讨甘蔗生长素结合蛋白基因的功能提供了实验证据.【期刊名称】《西北植物学报》【年(卷),期】2016(036)005【总页数】9页(P865-873)【关键词】甘蔗;生长素结合蛋白;同源克隆;表达分析【作者】邓宇晴;翟玉山;彭磊;董萌;徐倩;程光远;林彦铨;徐景升【作者单位】福建农林大学/农业部福建甘蔗生物学与遗传改良重点实验室,福州350002;福建农林大学/农业部福建甘蔗生物学与遗传改良重点实验室,福州350002;福建农林大学/农业部福建甘蔗生物学与遗传改良重点实验室,福州350002;福建农林大学/农业部福建甘蔗生物学与遗传改良重点实验室,福州350002;福建农林大学/农业部福建甘蔗生物学与遗传改良重点实验室,福州350002;福建农林大学/农业部福建甘蔗生物学与遗传改良重点实验室,福州350002;福建农林大学/农业部福建甘蔗生物学与遗传改良重点实验室,福州350002;福建农林大学/农业部福建甘蔗生物学与遗传改良重点实验室,福州350002【正文语种】中文【中图分类】Q785;Q786生长素(auxin)是植物调控生长发育和逆境响应最重要的激素之一,参与植物整个周期的生命活动,如胚形成、细胞分裂和伸长、维管束分化、侧根分化、向地性、向光性等。
苎麻Δ1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(P5CS)基因的克隆和表达分析
作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2012, 38(3): 549−555/zwxb/ISSN 0496-3490; CODEN TSHPA9E-mail: xbzw@本研究由湖南省科技计划重点项目(2010TP4004-1), 湖南省教育厅重点项目(09A042), 湖南农业大学人才引进科技资助项目(07YT03), 湖南省教育厅优秀人才项目(10B050)和省部共建国家重点实验室培育基地科学基金开放项目(10KFXW09)资助。
*通讯作者(Corresponding author): 揭雨成, E-mail: ibfcjyc@, Tel: 138********第一作者联系方式: E-mail: jinghua06101@Received(收稿日期): 2011-06-25; Accepted(接受日期): 2011-10-12; Published online(网络出版日期): 2011-12-01. URL: /kcms/detail/11.1809.S.20111201.0920.004.htmlDOI: 10.3724/SP.J.1006.2012.00549苎麻Δ1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(P5CS )基因的克隆和表达分析周精华1 邢虎成1,2 揭雨成1,2,* 钟英丽1,3 朱守晶1 蒋 杰1 王 亮11湖南农业大学苎麻研究所, 湖南长沙410128; 2 湖南省种质资源创新与资源利用重点实验室, 湖南长沙410128; 3 湖南农业大学生物科学与技术学院, 湖南长沙410128摘 要: 以耐旱性较强的湘苎3号为材料, 从苎麻转录组测序结果中获得了1个与P5CS 基因高度相似的Unigene, 该片段长1 448 bp, 根据该序列设计5′RACE 和3′RACE 槽式PCR 引物, 利用RACE 结合RT-PCR 技术分别克隆得到590 bp 的5′端和293 bp 的3′端, 拼接获得该基因全长cDNA 序列。
苎麻α-amylase基因的克隆与表达
苎麻α-amylase基因的克隆与表达余伟林;钟英丽;揭雨成;周清明;周精华;朱守晶【期刊名称】《农业生物技术学报》【年(卷),期】2014(22)1【摘要】α-amylase基因不仅参与植物糖代谢与生物能量的调动,而且与植物抗逆功能相关.为了克隆Bn-α-amylase基因,分析其序列及表达特征,本研究以湘苎3号苎麻(Boehmeria nivea)转录组文库中Unigene4746序列为基础,采用RT-PCR技术克隆该基因的全长编码序列,并进行生物信息学分析;利用Real-time PCR分析该基因在不同组织和不同胁迫条件下的表达特征.研究结果表明,苎麻Bn-α-amylase的编码区序列长2 295 bp,编码765个氨基酸(GenBank登录号:KF860891),推导该蛋白质的等电点和分子量分别为5.685和86.11kD,该蛋白在羧基端含有两个保守的结构域,亚细胞定位预测显示该蛋白位于细胞质中,不存在信号肽和跨膜结构域.与苹果(Malus×domestic)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、猕猴桃(Actinidia chinensis)、蓖麻(Ricinus communis)、大豆(Glycine max)的α-amylase基因的核苷酸序列相似性分别为80%、76%、76%、73%和67%,与之编码的氨基酸序列相似性分别为68%、65%、65%、69%和51%.进化树分析表明Bn-α-amylase与大豆、葡萄、猕猴桃、蓖麻的α-amylase基因亲缘关系较近,与拟南芥、水稻、高粱的α-amylase基因亲缘关系次之,与卷柏的α-amylase基因亲缘关系较远.实时荧光定量PCR分析表明,Bn-α-amylase在苎麻根、茎皮、茎木质部、茎尖、叶片中均有表达,其中,在叶中表达量最高,在根中表达量最低,且受干旱、高盐胁迫表达增强,受ABA胁迫表达降低.本研究获得了Bn-α-amylase基因的编码区序列,其编码的蛋白具有植物α-amylase典型的结构域,且该基因响应ABA、干旱和高盐逆境胁迫,提示该基因可能与苎麻抗逆境机制密切相关.【总页数】10页(P27-36)【作者】余伟林;钟英丽;揭雨成;周清明;周精华;朱守晶【作者单位】湖南农业大学苎麻研究所,长沙410128;湖南农业大学苎麻研究所,长沙410128;湖南农业大学生物科学与技术学院,长沙410128;湖南农业大学苎麻研究所,长沙410128;湖南省种质创新与资源利用重点实验室,长沙410128;湖南农业大学农学院,长沙410128;湖南农业大学农学院,长沙410128;湖南农业大学苎麻研究所,长沙410128;湖南农业大学苎麻研究所,长沙410128【正文语种】中文【相关文献】1.苎麻胶质的基因型差异与成因及育种中利用研究Ⅰ.苎麻胶质及其组分含量的基因型差异 [J], 郭清泉;胡日生;孙焕良;周清明;杨瑞芳;王林辉2.苎麻BnbZIP1转录因子基因的克隆与表达特征分析 [J], 周精华;揭雨成;邢虎成;钟英丽;余伟林3.苎麻再生体系的建立及抗虫转基因苎麻的获得 [J], 易自力;李祥;蒋建雄;王志成;刘清波4.苎麻再生体系的建立及抗虫转基因苎麻的获得 [J], 易自力;李祥;蒋建雄;王志成;刘清波5.苎麻纤维素合成酶基因 BnCesA4 cDNA 序列的克隆与表达分析 [J], 刘昱翔;陈建荣;彭彦;黄妤;赵燕;黄丽华;郭清泉;张学文因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
高迁移率族蛋白B1cDNA的克隆与表达
高迁移率族蛋白B1cDNA的克隆与表达陈婧;袁志强;彭毅志【期刊名称】《创伤外科杂志》【年(卷),期】2007(9)1【摘要】目的克隆人高迁移率族蛋白B1(HMGB1)cDNA,构建重组原核表达载体,对其诱导表达并鉴定,为设计HMGB1 cDNA突变体及诱导表达可竞争性抑制HMGB1炎症效应的突变体蛋白奠定基础.方法提取人新鲜扁桃体组织总RNA,经RT-PCR扩增出人HMGB1 cDNA序列,并克隆至载体pUC18进行序列测定,随后构建于原核表达载体pQE-80L中,经IPTG诱导4小时后,可表达Mr约30 000的蛋白.Western Blotting鉴定所表达的目的蛋白.结果经RT-PCR扩增得到了648 bp的cDNA,经序列分析与GenBank中报道的已知序列完全一致,构建了HMGB1蛋白的重组表达质粒,诱导表达了目的蛋白,经Western Blotting证实,在Mr约为30000处有一条清楚的蛋白带.结论获得了HMGB1 cDNA的克隆与原核表达载体.【总页数】4页(P32-35)【作者】陈婧;袁志强;彭毅志【作者单位】第三军医大学西南医院烧伤研究所,重庆,400038;第三军医大学西南医院烧伤研究所,重庆,400038;第三军医大学西南医院烧伤研究所,重庆,400038【正文语种】中文【中图分类】R392.2【相关文献】1.高迁移率族蛋白B1在胰腺疾病中的作用机制研究进展 [J], 赖珊玲;曾清芳2.乌拉地尔联合酚妥拉明对妊娠高血压的治疗效果及对高迁移率族蛋白1、脂联素水平的影响 [J], 刘志薇;詹艳萍;向琼;向劲松3.血清高迁移率族蛋白B1、淀粉酶样蛋白A水平变化在新生儿感染性休克中的临床意义 [J], 王品;张靖4.大鼠Endostatin在乳酸乳球菌中的克隆与表达大鼠Endostatin在乳酸乳球菌中的克隆与表达 [J], 李充璧;闫宝山;李晓晨;孙克菲;王春香;周明海5.动脉血乳酸联合血清高迁移率族蛋白B1、肾损伤分子-1检测对新生儿窒息后肾损伤的评估价值 [J], 陈丽媛因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
苎麻茎皮cDNA文库的构建
苎麻茎皮cDNA文库的构建
佘玮;邢虎成;揭雨成;陈信波
【期刊名称】《中国麻业科学》
【年(卷),期】2007(29)1
【摘要】以生长中期的苎麻茎皮为材料,提取总RNA,经纯化mRNA后,合成双链cDNA.双链cDNA加上EcoRⅠ-SmaⅠ接头后,用限制酶NotⅠ酶切并除去小于400bp的短链cDNA,长的cDNA片段连接到EcoRⅠ-NotⅠ酶切载体pAP3neo 上,获得滴度为2.6×104的苎麻cDNA文库,插入片段大部分分布在500bp~1500bp之间.该文库的建立为苎麻表皮功能性新基因的发现奠定了基础.
【总页数】4页(P16-19)
【作者】佘玮;邢虎成;揭雨成;陈信波
【作者单位】中国农业科学院麻类研究所,湖南,长沙,410205;中国农业科学院麻类研究所,湖南,长沙,410205;中国农业科学院麻类研究所,湖南,长沙,410205;中国农业科学院麻类研究所,湖南,长沙,410205
【正文语种】中文
【中图分类】S563.1
【相关文献】
1.干旱胁迫下甘蔗幼苗cDNA文库构建与乙烯反应转录因子cDNA筛选研究 [J], 贺俐;许东风;吴杨
2.阔褶水蛙皮肤组织cDNA文库的构建及抗菌肽brevinin-2LTs的cDNA克隆和
序列分析 [J], 王辉;张秀清;胡玉红;刘敬兰;孙君社
3.牙鲆酵母双杂交cDNA文库的构建及文库质量鉴定 [J], 杨长庚;刘姗姗;孙冰;陈松林
4.芥蓝cDNA文库的构建及文库质量检测 [J], 王劲;袁旭;李旭峰
5.小金海棠抑制性消减cDNA文库的构建及文库质量分析 [J], 张玉刚;许雪峰;李天忠;韩振海
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[ e mei ie L n .Ga d】 Bo h r nva( in) u . a
HUANG Y L U F n GUO Q n — a a dZ ANG Xu — e u, I eg, igQu n , n H eW n,
( C l g f o ce c n itc n lg , n n Agiutr l ie s y C a g h 1 1 8 Hu a ; I s tt f a eS in e Hu a r u o l e s i ea dB o e h oo y Hu a rc l a v ri , h n s a4 0 2 , n 。 n t ueo mi ce c , n Agi l e o Bi n u Un t n i R n c
fo u ln otn ( sy im i uu Lin) c p iu ec Bu eei n ta yr p r a o ttea xnb dn rti f r m pa dc t o Go sp u hr tm n . a sc m, t. tt r s o n e ot b u u i i igp oen o s , h h n
r c pt ri t r l yi w i uxi r cl d fnd o w he sgna rns e e i t etsue cel。i c l o l a n t e e o n e p a ng t a n d e ty a h i n i utho t i lta . r d n o t is ls t a hep ust e r he f h n
明 该 基 因更 多 地 表 达 于 细 胞 生 长 旺 盛 的 幼 嫩 组 织 。
关键词 :苎麻 ;生长 素结合 蛋 白; DNA克 隆;表 达分 析 c
Cl n ng n Ex r s i n f Au i b nd n Pr t i 1 o i a d p e so o x n- i i g o e ns Ge n ne i Ra i m e
t r ie s y Ch g h 1 8 H n 』 C ia u a Unv r i , a s a 1 , u a , h n ) l t n 40 2 1
Ab ta t s r c :Au i, id o h th r n ic v rd q ieerir a e t ma y p o e sso ln r wt . fwe ie t y te xn akn fp yo o mo eds o ee ut al , f cs n r c se fpa tgo h I d n f e i h
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A T G O MI A SN C 20 ,48: 38 16 C A A R NO C I I A 0 83 ()15— 35
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因 DN 克 苎 麻生 长素结合蛋 AB 1基 c A 的 隆 及 表 达 白 P
me h ns o u i feto , ee t gma yp o es sa o t ln ’ go h e py ABP1(u i idn rti ) sco e c a im f xn e cin d tci n r c se b u a t r wt d e l. a n p s a xnbn igp oen 1 wa ln d
c N , 名为 B A P 。半定 量 R —C 分析结 果显 示 A P 在 苎麻三 麻成 熟期 的茎 、叶 和芽组织 中均 有表 达, D A 命 nB1 TP R B1 其
表 达量 为芽 >叶 >茎 ,相对 内标分 子 1 Sr NA 的表达量 依次 为 07 5 06 2和 03 0 但在 根 中没有 检测 到表 达,说 8 R . 、 .3 5 .6 。
黄 妤 刘 峰 2 郭清 泉 2 张学文 ,
( 湖南 农 业大学 生物 科学 技术学 院 , 南长 沙 4 0 2 ; 湖南农 业大 学苎 麻研 究所 , 南长 沙 4 0 2 ) 湖 1 18 湖 1 18
摘 要:以苎 麻 [o h r ie L n .Ga d] 培种湘 苎 3 为材料 ,通过 简并 引物 R — CR结合 R E技术 克隆 B e mei nva( in) u . a 栽 号 TP AC 了苎麻 生长 素结合 蛋 白 A P B 1基 因 的全长 c A分 子,其序列 全长 为 8 9b ,编码 一段 1 9 氨基 酸 的推导蛋 白质 。 DN 4 p 8个 经 基 因 比对及 蛋 白质结 构 分 析与 已报 道 的几种 植 物 生长 素结 合 蛋 白有 高 同源 性 ,认 为是 苎 麻 生长 素 结合 蛋 白基 因