甘蓝抽薹结实相关性状的基因定位与分析
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甘蓝抽薹结实相关性状的基因定位与分析
结球甘蓝(Brassica oleracea L var capitata L)是一种在世界上广泛种植的重要蔬菜作物,具有较复杂的遗传机理,许多农艺性状如抽薹、开花、产量等都是数量性状。对这些性状进行深入的研究,在甘蓝类作物的遗传育种与改良方面具有重要的理论与实践意义。本研究以早抽薹晚熟高代自交系
R<sub>4</sub>P<sub>1</sub>和晚抽薹早熟的R<sub>2</sub>P<sub>2</sub>构
建的重组自交系群体(RIL8)为材料,构建甘蓝高密度连锁遗传图谱,并对抽薹性状进行QTL定位及分析。
并基于甘蓝自交不亲和特性,利用DNA测序及序列分析,对52份甘蓝材料进行了S单元型的鉴定,从而减少自交不亲和的发生,为一代杂交种的配制提供帮助。主要研究结果如下:1.遗传图谱的构建利用软件Join Map4.0对408个SSR
和InDel分子标记进行连锁遗传分析,当LOD值≥3.0时,有387个分子标记进入甘蓝9个连锁遗传群,与甘蓝9条染色体数目一致,分别命名为Ch1-Ch9。在甘蓝的9条染色体中,覆盖基因组长度为838cM,标记间平均图距为2.2 cM,各染色体长度分别为105 cM、67 cM、103 cM、101 cM、95 cM、61 cM、94 cM、105 c M、108 cM,标记数目分别为37、25、29、54、33、34、86、51、38。
其中C09标记长度最大但标记数目却不是最多,C07标记数目最多,密度最大。
2.甘蓝抽薹性状的QTL定位及分析利用软件MapQTL6.0对结球甘蓝重组自交系(RIL8)的抽薹时间性状进行QTL定位及遗传效应分析,对构图群体进行了田间抽薹时间的调查,并利用新构建的遗传图谱进行抽薹性状的定位,在第8染色体
上定位到一个与抽薹时间相关的QTL(qbt-2-2),其贡献率为9.1%,加性效应为-1.23,分子标记为CB10139。3.甘蓝52份自交不亲和材料的鉴定及分析本研究
开发了两对引物SRK1F/R和SRKSP2F/R,能够很好地对甘蓝52份材料的单倍型进行快速的鉴定。
其中发现13种单倍型,其中S<sub>2</sub>材料2份,S<sub>5</sub>材料2份,S<sub>6</sub>材料2份,S<sub>7</sub>材料2份,S<sub>8</sub>材料2份,S<sub>14</sub>材料1份,S<sub>15</sub>材料18份,S<sub>28</sub>材料5份,S<sub>33</sub>材料6份,S<sub>36</sub>材料3份,S<sub>45</sub>材料4份,S<sub>50</sub>材料3份,S<sub>57</sub>材料2份。本研究甘蓝材料中,不同的S单元型出现频率为0.19%-34.62%,其中S<sub>15</sub>出现频率最
高,S<sub>14</sub>只有1份材料最低,而S<sub>2</sub>、S<sub>5</sub>、
S<sub>6</sub>、S<sub>7</sub>、S<sub>8</sub>和S<sub>57</sub>都是两份材料,频率为3.8%。