花生profilin蛋白的生物信息学分析

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花生花粉萌发过程中蛋白质组学分析

花生花粉萌发过程中蛋白质组学分析花生是一种常见的食物，同时也是一种重要的植物种植作物。

花生的生长发育过程中需要经历不同的生命阶段，包括萌发、生长、开花、结荚等。

其中，萌发是花生生命周期中非常重要的一步。

花生萌发过程中需要大量的营养物质和蛋白质，因此，蛋白质组学分析在花生萌发过程研究中显得尤为重要。

花生萌发过程分为三个阶段：吸水期、胚乳肥大期和子叶开展期。

在这三个阶段中，花生需要不同类型的蛋白质参与，才能保证顺利完成萌发过程。

在萌发的吸水期，花生需要吸取大量的水分，同时也需要从种子中释放出一些必需的蛋白质，如转化酶、氨基酸转移酶等。

这些蛋白质在种子中原本是以贮藏蛋白的形式储存的，随着吸水作用的进行，这些蛋白质开始被水解并释放出来。

吸水期蛋白质分析结果表明，萌发过程中这些酶类蛋白质的含量明显增加，从而推动了种子内营养的释放和吸收，为后续的生长发育奠定了基础。

接下来的胚乳肥大期是花生生长的重要阶段之一。

在这个阶段中，花生需要大量的营养物质和蛋白质来支持其发育和成长。

此时，蛋白质的种类和含量开始发生变化。

在花生胚乳肥大期，萌发所需的酶类蛋白质数量逐渐减少，而代谢相关蛋白质的含量则增加。

这些代谢蛋白质包括DNA合成酶和RNA聚合酶等，在胚乳肥大期中具有重要的作用。

此外，萌发期的酸性蛋白质含量也会增加，与前两个阶段中碱性蛋白质的减少相互呼应。

当花生进入到子叶开展期时，蛋白质的作用会更为复杂。

在这个阶段中，花生需要在攀爬过程中对环境的适应和反应。

几项研究发现，在子叶开展期中，花生中含有一些对环境胁迫有响应的特殊蛋白质。

这些蛋白质包括一些反应环境温度变化的热休克蛋白质、反应光线变化的光敏蛋白和反应水分胁迫的脱水蛋白等。

这些蛋白质的存在使得花生能够在不同的环境下适应生长，更好地完成了花生生命周期的萌发过程。

总之，花生萌发过程中蛋白质组学分析是非常有意义的。

如果能够更深入地研究不同阶段中蛋白质的类型和数量，不仅对花生的萌发过程有指导意义，也能更进一步地了解花生生命活动的本质。

花生中致敏蛋白的检测方法研究进展

花生中致敏蛋白的检测方法研究进展作者：刘胜男孟继秋曹金博来源：《农产品加工·上》2019年第03期摘要：花生中含有丰富的营养成分，但也含有能引起花生过敏者发生过敏反应的致敏蛋白。

花生过敏患者误食含花生食品后，将引发严重过敏反应，且没有确切有效的治疗方法。

因此，建立简单、快速、灵敏检测食品中花生过敏原物质的方法尤为重要。

对花生中几种主要致敏蛋白和目前常见检测方法进行综述，并对其未来发展方向进行展望，为花生致敏蛋白快速检测的深入研究提供一定的参考。

关键词：花生；致敏蛋白；检测方法中图分类号：R446.6 文献标志码：A doi：10.16693/ki.1671-9646（X）.2019.03.019Research Progress on Detection Methods of Peanut Allergen ProteinsLIU Shengnan1，MENG Jiqiu2，CAO Jinbo2，LI Yanhong2，*WANG Yao2，WEI Xing3（1. Sanmenxia Entry-exit Inspection and Quarantine Bureau of P. R. China，Sanmenxia，He'nan 472000，China；2. College of Food and Bioengineering，National Demonstration Center for Experimental Food Processing and Safety Education，He'nan University of Science & Technology，Luoyang，He'nan 471023，China；3. Sanmenxia Inspection and Quarantine Center， Sanmenxia，He'nan 472000，China）Abstract：Peanuts are rich in nutrients，but also contain allergenic proteins that can cause peanut allergies. Peanut allergens will cause serious allergic reactions when they eat peanut food by mistake，and there is no effective treatment. Therefore，it is very important to establish a simple，rapid and sensitive method to detect peanut allergens in food. In this paper，several main allergenic proteins in peanut and the common detection methods were reviewed，and the future development direction was prospected，which laid a certain foundation for further study of peanut allergic protein detection.Key words：peanut；allergic protein；detection method花生具有很高的營养价值，富含不饱和脂肪酸及优质蛋白质，可促进人体的生长发育、抗老化，对胃肠功能起到保护的作用[1]。

花生蛋白质含量的主基因加多基因遗传分析

ｉＳｙ，ａａｒｉｃｎｕｎａｇＨｎｎｐｏｉｃ，ｅｐｃｖｌ．ｒｔｎｃｎｅｔｗｒａａｚｄｗｔＫｅ— ｎａａＨｉｎｐｏｎｅａｄＹａｙｎ，ｅａｒｎｅｒｓｅｔｅｙＰｏｅｏｔｓｅｅｎｌｅｉｊｌｎｎｖｖｉｉｎｙｈ
Ａｓｒｃ：１ｅｏｂｎｎｂｅｎｓ（Ｉｓｆ８ｎｅａｎｓｈｎ８０ｎｕｕ４ｗｒｐａｔｂｔｔ２５ｒｃｍｉａｔｎｒｄｌｅＲＬ）ｏＦｄｔｉｐｒｔＺｅｇ９３ａｄＹｈａｅｌｅａｉｉａｈｒｅｅｎｄ
２ＩｄｓｉｌｒｓｅａｃｎｔｕｅＩｎｎＡａｅｙｏｇｉｌｒｌｃｎｅ，ｈｎｚｏ５０２ｈｎ）．ｎｕｔａｏｓｒｓｔｔ，ｔａｃｄｍｒＣｐＲｅｈ［ｉｅｆＡｒｕｔａＳｉｃｓＺｅｇｈｕ４００，Ｃｉｃｕｅａ
２１０１年４月
中国油料作物学报
Ｃｉｅｅｏｒａｏｉｃｏｃｅｃｓｈｎｓｕｎｌｆ１ｒｐｓｉｎｅｊｏ
２１，３２：１０１３（）１８—１２２
花生蛋白质含量的主基因加多基因遗传分析
‘张科友，＇韩锁义徐静刘；。， ’ 华祝水金ｈ，
ｅｅｔａｄｅｖｒｎｎａｆｃｓＦｒｅｎｌｓｓｒｖａｅｔａｔｅｏｙｅｉｅｉｂｌｙｗｓ２．６％ｆｃｓｎｎｉｍｅｔｌｅｅｔ．ｕｔｒａａｙｉｅｅｌｄｈｔｈｐｌｇｎｃｏｈｈｒｔｉｔａ９３ａｉ

花生Clp蛋白酶基因(AhClpP)的克隆与序列分析

２００）５１０
摘要：ｌＣｐ蛋白酶通过蛋白质水解作用来清除细胞内由逆境引起的异常和具有潜在毒性的蛋白或多肽，而保证从细胞正常的生理功能。从优质大花生鲁花ｌ子不同发育时期混合ｅＮ４种ＤＡ文库中发现一条序列，长为１２２ｂ，全１ｐ３
ＩｒｖｍｅｔａｄＢｏｅｈｏｏｙＨｕｎｈａｈｉＭｉｉｒｆＡｒｕｔｒ，ｉａ２００Ｃｉａｍｐｏｅｎｎｉｔｃｎｌｇ，ａｇｕｉａ，ｎｓｏｇｉｌｅＪｎｎ５１０，ｈｎ）ｔｙｃｕ
ＡｂｓｒｔＣｌｒｔａｅｃｎｒｌｒｉａｙｍｅａｏｉｒｃｓｅｙｒｍｏｉｇａｎｒａｎｏｉｒｔｉｓｏｅｔｄｓｔａｃ：ｐｐｏｅｓｏｔｏｓｏｄｎｒｔｂｌｃｐｏｅｓｓｂｅｖｎｂｏｍｌａｄｔｘｃｐｏｅｎｒｐｐｉｅ
clp蛋白酶参与错误折叠蛋白降解短命蛋白调控和错误功能蛋白移除调节代谢途径中限速酶的水平来控制代谢过程的进行从而保证细胞正常生理功能在生物蛋白质代谢调控中发挥重要作用在逆境条件刺激下细胞会产生一些不可逆损伤的蛋白或多肽而这种不可逆损伤的蛋白会对细胞产生某种毒害作用或者干扰正常代谢过程的进行在这种情况下会有许多clp蛋白酶产生通过蛋白质水解作用清除非正常和具有潜花生是我国重要的油料和经济作物之一种植面积约502花生在其生长过程中经常会遭受到不同程度的生物和非生物逆境胁迫这些胁迫严重影响植物的生长发育并对农业生产造成极大的负面影响研究发现在长期的生物进化过程中植物自身已经发展了多种抵抗胁迫的机制以通过调节自身生理和代谢变化来抵御逆境

花生肌动蛋白基因的克隆及序列分析

花生肌动蛋白基因的克隆及序列分析
杨丽霞，李玲
（东省植物发育生物工程重点实验室，南师范大学生命科学学院，东广州５０３）广华广１６１
摘要：以花生（ａｈｓｙｏａａＬ）Ａｒｃｉｈｐｇｅ．为材料，究肌动蛋白（ｃｎ基因序列。分离了高纯度ＲＮ研ａｔ）ｉＡ。以ＲＮＡ为模板，ＲＴＰ以 — ＣＲ方法，隆了花生ａｔ克ｃｉｎ基因ｃＤＮＡ序列，长度为３４ｂ，码１８个氨基酸残８ｐ编２基。此ｅＮＡ序列（名为Ａａｔ）几种高等植物ａｔＤ命ｈｃｎ与ｉｃｉ基酸序列相似性大于８。ｎ氨Ｏ关键词：生；动蛋白基因；隆；列分析花肌克序中图分类号：５５２Ｑ４￥６．；９５文献标识码：Ａ
８Ｏｉｎｔｔｉｈｔｅｒｅｔｎｐｏｔｉｅｕｅｅｄｅｉｙｗｔｈｅｒｐｏｔｄａｃｉｒｅｎｓｑｎｃｓ．
Ｋｅｒｓ：ｐａｙｗｏｄｅｎｕｔｃｉｅｎ；ａｔｎｇｅ；ｃｏｌｎｅ；ｓｑｎｃｎａｙｉｅｕｅｅａｌｓｓ
ｔｒｔｆｒｉａｇｅｏｅｇｎＤＮＡｎｓｒｓｗａｄｎｔｆｅｉｅｔｓｉｅｉｉｄｂｙＰＣＲ．ＲｅｏｍｂｎｎｔｐＭＤ１－ｐａｍｉａｄｅｔｆｅｅｒｃｉｉｃｉａＴｌｓｄｗｓｉｎｉｉｄｂｙｒｓｔｉｔｏｎｄ — ８ｇｅｔｏｎｄＰＣＲ．ａｓｅｑｅｅａａｙｓｓＰｅｎｕｔａｔｎｇｅｅｃｓｉｎａｌｏｓｕｎｃｎｌｉ．ａｃｉｎＤＮＡｅｅｅ，ｎａｅｙＡｈｃｉｉ８４ｂｐｌｎｇ，ｃｄ— ｓｑｕｎｃｍｌａｔｎ，ｓ３ｏｏ

基于CRISPR技术的花生蛋白原降解细胞系的建立研究

基于CRISPR技术的花生蛋白原降解细胞系的建立研究花生过敏是一种常见的食物过敏反应，可导致皮肤瘙痒、呼吸困难、低血压等症状。

花生过敏发生的主要原因是花生中含有的花生蛋白原，它是导致花生过敏的主要物质。

因此，降解花生蛋白原成为缓解花生过敏反应的关键。

CRISPR-Cas9技术是一种近年来备受瞩目的基因组编辑技术，它利用一种细菌天然的防御机制实现对基因组特定位置的“剪切”和“粘贴”，以实现对基因组的编辑。

其在医学领域的应用开始逐渐扩大，使用CRISPR-Cas9技术对花生蛋白原进行降解成为了实现缓解花生过敏反应的重要方法之一。

为了实现对花生蛋白原进行有效的降解，科学家们通过设计合适的CRISPR-Cas9工具基因，可以高效、特异地切除编码花生蛋白原区域的基因。

研究人员在这一领域进行了大量的实验，成功建立了基于CRISPR-Cas9技术的花生蛋白原降解细胞系。

一项2019年发表在《细胞报告》杂志上的最新研究表明，科学家们利用CRISPR-Cas9技术成功构建了一个基于小鼠胆囊细胞的花生蛋白原降解细胞系。

他们敲除了小鼠的花生蛋白原基因，同时利用CRISPR-Cas9技术，插入一段编码外源降解酶的DNA序列。

这个降解酶可以较为高效地将花生蛋白原分解为多肽和氨基酸片段，从而达到降解花生蛋白原的目的。

这项研究的意义在于为制备更安全的花生制品提供了新思路，不仅有望缓解花生过敏、降低食品安全风险，还可以为花生生产企业提供技术支持，并有望为花生以及其他相关作物的遗传改良打下基础。

当然，在将这一技术应用于实际生产之前，还需要进一步进行针对性的临床试验，明确其效果和安全性。

此外，建立花生蛋白原降解细胞系的研究也仅仅是“开胃菜”，我们还有很多的研究可以进行：可以进一步开发和筛选更有效的外源降解酶，以提高花生蛋白原的降解效率；可以研究该细胞株如何应用于其他动物和植物中，以实现对花生蛋白原的降解等等。

总之，结合CRISPR-Cas9技术实现花生蛋白原降解，是一项具有广阔前景的生物技术研究。

花生GAIP-B基因的生物信息学分析及表达研究

花生GAIP-B基因的生物信息学分析及表达研究作者：何佳霖赵凯周定纬李培培李忠峰马兴立张幸果殷冬梅来源：《山东农业科学》2019年第09期摘要：为研究DELLA蛋白在花生生长、育种过程中的功能，利用RT-PCR技术从花生栽培种品系花2014中克隆得到一个花生DELLA蛋白编码基因AhGAIP-B（GenBank登录号：XP_016191184）。

序列分析结果表明，AhGAIP-B开放阅读框（ORF）全长1 812 bp，只有一个外显子，可编码603个氨基酸。

生物信息学分析发现，AhGAIP-B编码的产物是一类典型DELLA蛋白，其三级结构与拟南芥GAI相似，亲缘关系与大豆GmGAI1最近。

进一步qRT-PCR结果显示，AhGAIP-B基因呈组成型表达，其中在茎中表达量最高;同时，本研究还发现，外源GA3可以诱导AhGAIP-B基因上调表达，其表达量在处理后12 h最高。

本结果将为进一步的花生DELLA功能研究提供理論基础。

关键词：花生;DELLA蛋白;AhGAIP-B基因;赤霉素;组织表达中图分类号：S565.2：Q786 文献标识号：A 文章编号：1001-4942（2019）09-0028-07Bioinformatics Analysis and Expression of GAIP-B in PeanutHe Jialin， Zhao Kai， Zhou Dingwei， Li Peipei， Li Zhongfeng， Ma Xingli， Zhang Xingguo， Yin Dongmei（College of Agronomy， Henan Agricultural University， Zhengzhou 450002， China）Abstract To study the function of DELLA protein in peanut growth and breeding， a peanut DELLA protein coding gene AhGAIP-B（GenBank accession number： XP_016191184） wascloned from peanut cultivar Hua 2014 by RT-PCR. Sequence analysis showed that the full length of AhGAIP-B open reading frame （ORF） was 1 812 bp with only one exon， and it encoded 603 amino acids. Bioinformatics analysis showed that the product encoded by AhGAIP-B was a typical DELLA protein， whose tertiary structure was similar to that of GAI in Arabidopsis thaliana， and its genetic relationship was the closest to GmGAI1 in soybean. qRT-PCR results showed that AhGAIP-B gene was expressed by the constitutive type in peanut with the highest expression level in stem. Exogenous GA3 could induce the up-regulation expression of AhGAIP-B gene， which reached the highest level at 12 hours after treatment. This results could provide a theoretical basis for further study of DELLA function in peanut.Keywords Arachis hypogaea; DELLA protein; AhGAIP-B gene; Gibberellin; Tissue expression赤霉素（Gibberellins，GAs）是一类由四环骨架构成的二萜类化合物，在植物生长发育中发挥着重要的调节作用[1-4]。

花生VAMP基因家族全基因组鉴定及表达分析

ＶＡＭＰ基因在植物发育以及响应生物和非生物胁迫中发挥重要作用［３］。Ｌｅｖｉｎｅ等［４］研究发现了拟南芥ＡｔＶＡＭＰ７蛋白超量表达能阻断ＢＡＸ诱导酵母产生的程序性细胞凋亡（ｐｒｏｇｒａｍｍｅｄｃｅｌｌｄｅａｔｈ，ＰＣＤ），从而改善细胞膜的组分与膜的完整性，阻止细胞凋亡，对膜起修复作用。薛媛［５］研究证明了拟南芥ＶＡＭＰ７１１参与了植物激素脱落酸（ＡＢＡ）介导的质膜Ｈ＋－ＡＴＰａｓｅ活性调节机制，在干旱胁迫下，ＶＡＭＰ７１１基因通过与质膜Ｈ＋－ＡＴＰａｓｅ蛋白ＡＨＡ１／ＡＨＡ２互作，抑制质膜Ｈ＋－ＡＴＰａｓｅ的活性，促进气孔的关闭从而减少植物体内水分的流失，应对干旱胁迫。Ｓｕｇａｎｏ等［６］研究ＯｓＶＡＭＰ７１４基因敲除和过表达水稻植株并进行抗病性试验，证明了ＯｓＶＡＭＰ７１４参与了稻瘟病抗性且在水稻稻瘟病抗性中具有潜在的特异性，并对水稻植株生长发育有重要作用。李华一［７］的研究证明ＴａＶＡＭＰ７１４基因参与了小麦条锈菌的感病反应，且ＡＢＡ对ＴａＶＡＭＰ７１４基因的诱导明显，干旱和盐胁迫都能诱导ＴａＶＡＭＰ７１４上调表达。Ｋｉｍ等［８］的研究发现拟南芥ＶＡＭＰ７２１／７２２基因是将白粉病蛋白ＲＰＷ８２携带至植物－真菌界面这一激活抗性反应分泌机制的关键组分，能用于细胞外周的侵入前防御和ＥＨＭ的侵入性防御，对致病性白粉病真菌起防御作用。方静［９］研究发现热处理诱导ＣｉｔＶＡＭＰ７１基因表达量与翻译水平上升，蒰柑果实通过增厚细胞壁响应热胁迫，进而提高了细胞的支撑作用，利于果实加强对外界病原菌侵染及其他生物胁迫的物理屏障。Ｓｕｎ等［１０］研究发现ＧｓＶＡＭＰ７２基因的过表达不仅能通过改变离子含量和下调应激反应基因的表达而降低大豆耐盐性，还能增加植物对ＡＢＡ敏感性

杜兰落花生球蛋白基因家族的生物信息学分析

关键词：杜兰落花生；球蛋白基因家族；生物信息；系统码：Ａ文章编号：１００７－９０８４（２０１９）０３－０３９１－０８
ＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃａｎａｌｙｓｉｓｏｆｇｌｏｂｕｌｉｎｇｅｎｅｆａｍｉｌｙｉｎＡｒａｃｈｉｓｄｕｒａｎｅｎｓｉｓＣＨＥＮＸｉａｎｇ－ｙｕ，ＸＵＲｉ－ｒｏｎｇ，ＣＨＥＮＨａｏ，ＴＡＮＧＺｈａｏ－ｘｉｕ
中国油料作物学报ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌｏｆＯｉｌＣｒｏｐＳｃｉｅｎｃｅｓ
２０１９，４１（３）：３９１－３９８ｄｏｉ：１０．７５０５／ｊ．ｉｓｓｎ．１００７－９０８４．２０１９．０３．０１１
杜兰落花生球蛋白基因家族的生物信息学分析
陈湘瑜，徐日荣，陈昊，唐兆秀
（福建省农业科学院作物研究所，福建福州，３５００１３）
３９２
中国油料作物学报２０１９，４１（３）
球蛋白基因导入水稻，可以提高稻米球蛋白含量和蛋白质含量［５］。拟南芥的球蛋白基因家族是在种子发育的中后期表达，且各基因间存在表达特异性［５］。全先庆研究了一个花生球蛋白基因在花生种子发育过程的的表达情况，表明该基因在种子早期开始表达，其后的各个阶段表达水平均较高［６］，这种表达方式与大豆有所差异。黄上志研究表明花生种子发育过程中球蛋白的积累从种子成熟初期开始出现，其后球蛋白的积累一直占主导地位［７］。Ｙａ［８］。
摘要：为了解球蛋白基因家族在杜兰落花生（Ａｒａｃｈｉｓｄｕｒａｎｅｎｓｉｓ）种子中的特征，利用生物信息学方法对杜兰落
花生球蛋白基因进行全基因组鉴定及表达模式分析。结果表明，杜兰落花生含有９个球蛋白基因，家族成员间理化特性总体差异不大，亲缘关系相近的蛋白具有相似的保守基序组成。根据物种间的球蛋白系统进化树，球蛋白进化关系符合物种之间的亲缘关系。杜兰落花生球蛋白在进化过程中较为保守，受纯化选择主导，但在部分进化枝上存在正选择位点。栽培种花生转录组数据分析表明，１５个花生球蛋白基因在花生种子中检测到表达，其中４个表达量远超其它成员，在花生荚果成熟后期表达量仍较高。

花生动态转录组及生物信息学分析

花生动态转录组及生物信息学分析花生是一种广泛种植的食用作物，对于人类来说具有重要意义。

然而，由于花生曾经被认为是过敏原，对于花生过敏的人来说，这种作物是一种容易引发反应的食品。

对花生过敏的人来说，了解花生的基因组信息可以有助于他们更好地了解花生过敏的原因。

转录组是研究基因表达的一种重要方法，它可以测量在特定条件下在细胞中表达的所有转录本。

动态转录组学是指在不同时间和/或不同状态下评估转录组。

转录组数据分析可以帮助研究人员了解细胞内基因活动的动态变化。

在花生转录组测序中，研究人员可以使用下一代测序技术（Next-generation sequencing, NGS）获得大量转录组数据，利用生物信息学的方法对花生转录组进行分析。

利用这些工具，研究人员可以深入了解花生的转录组信息。

首先，对花生的转录组进行了表达量分析。

研究人员通过比较不同花生品种，分析了它们之间的基因表达的变化。

他们将不同花生品种的花生总RNA提取出来，并对其进行测序。

然后，研究人员利用生物信息学工具对花生的信号通路进行了分析，并找到了一些发现，这些发现揭示了花生之间的差异。

其次，花生基因功能注释是研究花生转录组的重要组成部分。

研究人员可以对花生注释基因进行功能注释，分析这些注释基因的功能，从而了解花生中的基因组。

绘制基因功能图可以帮助我们了解花生的生物学过程。

生物信息学工具可以自动预测蛋白质序列的功能，并确定在花生中特定基因的前体和质量水平。

还有，差异分析可以帮助我们了解花生在不同条件下的基因表达差异。

研究人员可以使用生物信息学工具比较不同条件下的两个或多个样品之间的基因表达差异。

在花生研究中，差异分析可以帮助我们了解花生在不同生长季节或条件下所表达的基因是否具有显著的差异。

除此之外，富集和功能分析可以帮助我们了解转录组中的特定基因。

对富集分析可以帮助我们了解某些基因通路是否过度表达，并确定导致这种过度表达的主要原因。

在花生转录组分析中，研究人员可以通过大量的基因表达数据去探寻不同通路在花生中的表达情况，并了解不同通路的潜在调控机制。

花生AT-hook家族基因的生物信息学分析

热带作物学报2021, 42(3): 649 659Chinese Journal of Tropical Crops花生AT-hook家族基因的生物信息学分析胡冬秀1,2，刘浩2*，梁炫强2，吴自明1**，方加海1**1. 江西农业大学作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室，江西南昌 330045；2. 广东省农业科学院作物研究所/国家油料作物改良中心南方分中心/广东省农作物遗传改良重点实验室，广东广州 510640摘要：AT-hook蛋白不仅在植物生长发育、器官构建、胁迫和激素信号应答中起重要作用，而且还作为染色质重塑的转录因子和辅助因子，调节基因的转录活性。

为全面了解花生AT-hook基因家族的结构特征，利用生物信息学技术比对花生基因组数据库，分析AT-hook基因家族成员的理化性质、基因结构、保守结构域和系统发育关系以及在12个组织中的表达特异性。

结果表明：在花生基因组数据库中鉴定得到64个AT-hook基因，染色体定位显示这些基因在染色体上呈不均匀分布。

系统发育树分析表明花生AT-hook基因可分为8个亚群，多数基因都含有5ʹ-UTR和3ʹ-UTR。

MEME 数据库显示，花生AT-hook基因编码的蛋白质包含6个保守的结构域，大多数AT-hook蛋白含有RGRP和PPC的基序。

表达热图显示，AT-hook基因在不同花生组织中呈现特定的表达模式，如arahy.BT3IUC、arahy.QUTE6V、arahy.8MM6DT、arahy.RIX96U和arahy.T2XHT6在根中高度表达，但arahy.EW3BSR和arahy.CSXK13分别在雌蕊和叶片中高丰度均匀转录。

本研究结果为进一步阐明花生基因组中AT-hook基因的潜在分子功能提供理论参考。

关键词：花生；AT-hook；生物信息学；基因家族中图分类号：S565.2 文献标识码：ABioinformatics Analysis of AT-hook Genes Family in Peanut (Arachis hypogaea L.)HU Dongxiu1,2, LIU Hao2*, LIANG Xuanqiang2, WU Ziming1**, FANG Jiahai1**1. Jiangxi Key Laboratory of Crop Physiology, Ecology and Genetic Breeding, Ministry of Education, Jiangxi Agricultural Univer-sity, Nanchang, Jiangxi 330045, China;2. Crops Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences / South China Peanut Sub-Center of National Center of Oilseed Crops Improvement / Guangdong Provincial Key Laboratory of Crop Genetic Im-provement, Guangzhou, Guangdong 510640, ChinaAbstract: AT-hook genes not only play important roles in plant growth and development, organ construction, stress and hormone signal response, but also are transcription factor and auxiliary factor of chromatin remodeling to regulate gene transcriptional activity. In order to fully understand the structural characteristics of AT-hook family genes in peanut, we analyzed the physical and chemical properties, gene structure, phylogenetic relationship, protein conserved domain, and expression specificity of AT-hook genes in twelve tissues utilizing bioinformatics technologies to blast peanut genome database. Totally, 64 AT-hook genes were identified in the peanut genome, and chromosome location displayed that these genes were unequally distributed on the chromosome. Phylogenetic tree viewer indicated that AT-hook genes cpuld be divided into eight subgroups, and most of them contained 5ʹ-UTR and 3ʹ-UTR. MEME database exhibited that AT -hook genes encoded proteins containing six conserved domains, majority of the AT-hook proteins harboured the motifs of RGRP and PPC. Expression heatmap showed that AT-hook genes presented specific expression pattern in different peanut tissues, such as arahy. BT3IUC, arahy. QUTE6V, arahy. 8MM6DT, arahy. RIX96U and arahy. T2XHT6 highly expressed in the root, but arahy. EW3BSR and arahy. CSXK13 homogeneously transcribed with high abundances in the 收稿日期 2020-05-19；修回日期 2020-06-16基金项目广东省自然科学基金面上项目（No. 2020A1515010021）。

橡胶树前纤维蛋白(profilin)基因家族的鉴定及表达分析

热带作物学报2021, 42(9): 2443 2450Chinese Journal of Tropical Crops橡胶树前纤维蛋白（profilin）基因家族的鉴定及表达分析邓治，李德军*中国热带农业科学院橡胶研究所/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室，海南海口 571101摘要：肌动蛋白细胞骨架可能在橡胶树乳管伤口堵塞过程中发挥重要作用。

前纤维蛋白（profilin）是肌动蛋白动态平衡的重要调节子，但对橡胶树profilin基因家族系统研究的报道较少。

通过分析橡胶树基因组和转录组数据，鉴定到6个橡胶树profilin基因，对其基本特性及蛋白保守基序、结构特征、进化关系和表达模式等进行分析。

基因结构分析表明，橡胶树profilin基因都包含3个外显子2个内含子，编码的蛋白序列含有profilin蛋白特有的保守基序KYMVIQGE和VIRGKKG。

进化分析显示，橡胶树profilin并未严格分为营养型和生殖型2种类型。

profilin蛋白二级结构以无规则卷曲为主，三级结构均包含3个α螺旋和7个β折叠。

表达分析结果显示，4个profilin基因在胶乳中高表达，橡胶树排胶和碘化钾处理调控这4个profilin基因表达，推测profilin基因参与橡胶树排胶过程。

该研究结果为进一步阐明橡胶树profilin基因在乳管伤口堵塞和排胶中的作用奠定基础。

关键词：前纤维蛋白基因家族；橡胶树；排胶；表达分析中图分类号：S794.1 文献标识码：AIdentification and Expression Analysis of profilin Gene Family inHevea brasiliensisAll Rights Reserved.DENG Zhi, LI Dejun*Rubber Research Institute, Chinese Academy of Tropical Agriculture Sciences / Key Laboratory of Biology and Genetic Resourcesof Rubber Tree, Ministry of Agriculture and Rural Affairs / State Key Laboratory Incubation Base for Cultivation and Physiology ofTropical Crops, Haikou, Hainan 571101, ChinaAbstract: Actin cytoskeleton might play an important role in laticifer wound plugging of Hevea brasiliensis. Althoughprofilin is a vital regulator in actin dynamics, there is still no systematic study on profilin gene family in Hevea brasil-iensis. In this study, six profilin genes were identified from the genome and transcriptome of Hevea brasiliensis. The sixgenes were analyzed in details, including gene basic characteristics, conserved protein motifs, structure features, evolu-tionary relationships, and expression profiles. Gene structure analyses demonstrated that the six profilin genes containedthree exons and two introns. Conserved domain analyses indicated that the six profilin proteins possessed unique motifsof profilin protein, KYMVIQGE and VIRGKKG motifs. Evolutionary analyses showed that Hevea profilins were notstrictly divided into vegetative and reproductive subclasses. The main secondary structures of profilin proteins wererandom coil and tertiary structures consist of three α helices and seven β turns. Expression analyses showed that fourprofilin genes were highly expressed in latex, and regulated by latex flow and potassium iodide treatment, suggestingthat profilin genes might be involved in latex flow. These results would lay a foundation for further elucidating profilinroles in laticifer wound plugging and latex flow of Hevea brasiliensis.Keywords: Profilin gene family; Hevea brasiliensis; latex flow; expression analysisDOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2021.09.002收稿日期 2020-12-16；修回日期 2021-02-01基金项目中国热带农业科学院基本科研业务费专项（No. 1630022019018）；国家重点研发计划项目（No. 2018YFD1000502）；海南省自然科学基金项目（No. 718MS038）。

花生致敏蛋白Arah1的电子克隆及生物信息学分析

安徽科技学院学报,2009,23(2):31～37Journal of Anhui Science and Technol ogy University花生致敏蛋白Ara h1的电子克隆及生物信息学分析蒋圣娟,孙玉军,张　强,段丽君(安徽科技学院　生命科学学院,安徽　凤阳　233100)摘　要:花生致敏已成为重要的食品安全问题,花生蛋白中含有的A ra h1是重要的致敏蛋白。

运用生物信息学的电子克隆方法得到Shany ou523、Luhua14、US DA-Tift on三个花生品种的A ra h1基因,并进行序列特征分析、多序列比对和结构域分析,探讨蛋白质水平的氨基酸差异与其致敏性的关系。

关键词:花生;致敏蛋白;A ra h1;电子克隆;生物信息学中图分类号:Q71 文献标识码:A 文章编号:1673-8772(2009)02-0031-07In S ilico Clon i n g and Bi oi n for mati cs Analysis ofAllergy Ara h1Gene fro m PeanutJ I A NG Sheng-juan,S UN Yu-jun,ZHANG Q iang,DUAN L i-jun(College of L ife Science,Anhui Science and Technol ogy University,Fengyang233100,China) Abstract:Peanut anaphylaxis has become an i m portant f ood safety p r oble m Peanut p r otein such as A ra h1,is one of the maj or peanut allergens.U sing In silico cl oning method,we obtained the A ra h1genes fr om three s pe2 cies,Shanyou523,Luhua14and US DA-Tift on,res pectively,and then the characterizati on of sequences,the multi p le sequence comparis ons and the domain analyses were carried out t o discuss the relati onshi p bet w een the diversities of the a m ino acids and anaphylaxis.Key words:Peanut;A llergens;A ra h1;In S ilico Cl oning;B i oinf or matics食品过敏,又称为食物变态反应,是指食物进入人体后,机体对之产生异常免疫应答,从而导致机体生理功能的紊乱、组织损伤,进而引发甚至危及生命的临床症状[1]。

花生白藜芦醇合酶基因的克隆与生物信息学分析

花生白藜芦醇合酶基因的克隆与生物信息学分析黄秀琴;郭丽琼;李小明;林俊芳;袁致浩;谭铭琛【摘要】利用Protparam、iPSORT prediction、ProtScale、SOPMA、Swiss-Modeling和Scan Prosite等生物信息学工具分别对其理化性质、信号肽、疏水性、亲水性、二级结构和三级结构进行分析.以花生粤油45总DNA和总RNA为模板,采用PCR和RTPCR技术克隆花生白藜芦醇合酶基因的DNA和cDNA序列,并利用SWISS-PROT、DNAMAN等生物信息学工具对其基因和蛋白质序列进行了分析.测序结果显示,该基因的DNA和cDNA序列长度分别为1498bp和1 251 bp,cDNA序列具有完整的开放性阅读框,编码389个氨基酸的多肽.该白藜芦醇合酶氨基酸368-378位点上存在芪合酶家族的特征位点GVLFGFGPGLT.同源性分析表明,其碱基序列与已报道的花生白藜芦醇合酶基因的一致性为99％,其氨基酸序列与已报道的花生白藜芦醇合酶氨基酸序列的一致性为100％.【期刊名称】《生物技术通报》【年(卷),期】2012(000)003【总页数】6页(P69-74)【关键词】花生;白藜芦醇合酶;基因克隆;序列分析【作者】黄秀琴;郭丽琼;李小明;林俊芳;袁致浩;谭铭琛【作者单位】华南农业大学食品学院,广州510640;华南农业大学生物质能研究所,广州510640;华南农业大学食品学院,广州510640;华南农业大学生物质能研究所,广州510640;华南农业大学食品学院,广州510640;华南农业大学生物质能研究所,广州510640;华南农业大学食品学院,广州510640;华南农业大学生物质能研究所,广州510640;华南农业大学食品学院,广州510640;华南农业大学食品学院,广州510640【正文语种】中文白藜芦醇（Res）化学名3，4，5-三羟基二苯乙烯，属于非黄酮类多酚化合物，是一些种子植物受到病原性进攻和环境恶化时产生的植物抗毒素。

花生脂质转运蛋白家族基因的克隆与表达分析

花生脂质转运蛋白家族基因的克隆与表达分析赵传志;李爱芹;王兴军;夏晗;苏磊;李长生【期刊名称】《花生学报》【年(卷),期】2009(38)4【摘要】植物脂质转运蛋白(Lipid transfer protein, LTP)作为一类小分子碱性蛋白在脂类物质的运输、生殖发育,抵御不良环境等方面具有重要的作用,此外,LTP还作为一种过敏原存在.通过构建花生未成熟种子全长cDNA文库,克隆到了5类LTP 基因,按照编码蛋白分子量的大小命名为AhLTP-11.5,AhLTP-12.8,AhLTP-11.8,AhLTP-8.3和AhLTP-19.2.生物信息学预测表明AhLTP-11.5属于AAI_LTSS 蛋白家族的nsLTP1亚族,AhLTP-11.5编码蛋白的N端有26个氨基酸残基的信号肽序列,ProtComp v8.0预测结果显示该蛋白为分泌蛋白,胞外定位.从系统发育树中可以看出,花生的AhLTP-11.5和拟南芥的AthLTP亲缘关系较近.半定量RT-PCR结果表明AhLTP-11.5基因在花生茎、叶、花和种子中均有表达,在根中几乎检测不到;在花生种子的不同发育时期AhLTP-11.5基因在DAP15d时表达量较低,20d以后表达趋于稳定.【总页数】6页(P15-20)【作者】赵传志;李爱芹;王兴军;夏晗;苏磊;李长生【作者单位】山东省农业科学院高新技术研究中心,农业部黄淮海作物遗传改良与生物技术重点开放实验室,山东省作物与畜禽品种改良生物重点实验室,山东,济南,250100;山东省农业科学院高新技术研究中心,农业部黄淮海作物遗传改良与生物技术重点开放实验室,山东省作物与畜禽品种改良生物重点实验室,山东,济南,250100;山东省农业科学院高新技术研究中心,农业部黄淮海作物遗传改良与生物技术重点开放实验室,山东省作物与畜禽品种改良生物重点实验室,山东,济南,250100;山东省农业科学院高新技术研究中心,农业部黄淮海作物遗传改良与生物技术重点开放实验室,山东省作物与畜禽品种改良生物重点实验室,山东,济南,250100;山东省农业科学院高新技术研究中心,农业部黄淮海作物遗传改良与生物技术重点开放实验室,山东省作物与畜禽品种改良生物重点实验室,山东,济南,250100;山东省农业科学院高新技术研究中心,农业部黄淮海作物遗传改良与生物技术重点开放实验室,山东省作物与畜禽品种改良生物重点实验室,山东,济南,250100【正文语种】中文【中图分类】S565.2;Q945【相关文献】1.甘蓝脂质转运蛋白基因BoLTP的克隆与表达分析 [J], 田爱梅;2.甘蓝脂质转运蛋白基因BoLTP的克隆与表达分析 [J], 田爱梅3.红花脂质转运蛋白基因的克隆及表达分析 [J], 韩怡来;李校堃;崔琪;武云云;顾天瑶;滕孝花;胡人阁;吴贯达;官丽莉;李海燕4.花生鞘脂△8去饱和酶基因(AhSLD2)的克隆与表达分析 [J], 李昊远;迟晓元;郝翠翠;陈明娜;陈娜;王冕;潘丽娟;王通;禹山林;侯艳华5.花生脂磷酸磷酸酶基因家族的克隆与表达分析 [J], 徐赫;梁成伟;陈明娜;陈娜;王通;袁美;潘丽娟;迟晓元因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

花生过敏蛋白分离提取及结构预测分析

花生过敏蛋白分离提取及结构预测分析孙世锦;程诚;樊秀花;张爱琳【期刊名称】《天津农学院学报》【年(卷),期】2024(31)1【摘要】花生是较常见的重要食物过敏原之一。

本研究采用石油醚对花生进行脱脂处理,利用硫酸铵盐析、透析、葡聚糖凝胶(Sephadex G-150)分离纯化花生蛋白,通过十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)法确定花生主要蛋白分子量为15、20、35和60 ku左右,Western–Blotting免疫印迹试验确定花生过敏原性蛋白分子量为63.5 ku;通过质谱测序得到31条有效蛋白肽段,其中5条肽段的谱图数较高,占总谱图数的49.6%,分别是KLEYDPRCVYDTGAT、AFNAEFNEIRRVLLEE、DNVIDQIEKQAK、PYSPSQDPDRRDPY和QDPYSPSQDPDR,并以此推断这些肽段为花生致敏蛋白Ara h 1和Ara h 2的主要肽段过敏序列,成功运用蛋白肽段推断与之对应的蛋白质种类,为进一步明确花生过敏原的致敏机理奠定基础。

但花生过敏蛋白构象结构复杂,需要通过其他手段进一步开展研究工作。

【总页数】5页(P31-35)【作者】孙世锦;程诚;樊秀花;张爱琳【作者单位】天津农学院食品科学与生物工程学院【正文语种】中文【中图分类】S565.2;TS201.2【相关文献】1.花生内源过敏原蛋白Ara h 2的分离纯化及鉴定2.喷射蒸煮辅助提取对花生分离蛋白结构和功能的影响3.从花生蛋白粉中提取花生分离蛋白的条件优化4.花生品种对水媒法提取分离蛋白质与脂质及内源性蛋白酶活性的影响5.热加工花生的蛋白分离及其过敏原纯化方法研究进展因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

花生中UDP_葡萄糖基转移酶基因的克隆及在非生物胁迫下的表达研究

中国油料作物学报Chinese Journal of Oil Crop Sciences 2014，36(3):308－315doi :10．7505/j．issn．1007－9084．2014．03．003花生中UDP －葡萄糖基转移酶基因的克隆及在非生物胁迫下的表达研究陈娜1，胡东青2，潘丽娟1，迟晓元1，陈明娜1，王通1，王冕1，杨珍1，禹山林1*（1．山东省花生研究所，山东青岛，266100；2．山东省青岛市出入境检验检疫局，山东青岛，266001）摘要：通过ＲACE 技术从花生叶片cDNA 中克隆到了UDP －葡萄糖基转移酶的基因，命名为AhUGT 83A 1－like （GenBank 注册号为KF411463）。

该基因全长为1530bp ，OＲF 为1380bp ，编码460个氨基酸。

序列比对与进化分析结果表明，该序列有保守的UDPGT 结构域，并且与其它植物的UGT 蛋白同源性较高。

荧光定量PCＲ结果表明，AhUGT 83A 1－like 基因在高盐和低温处理的花生根和叶片中均上调表达；在干旱处理时，根中表达也受到显著上调，但叶片中表达量则有明显下降。

以上结果表明AhUGT 83A 1－like 可能参与了花生对干旱、低温和高盐的抗性调控。

ABA 处理结果表明，AhUGT 83A 1－like 在花生根中对ABA 响应明显，但在叶片中对ABA 没有明显响应，表明该基因在花生根中对非生物胁迫的调控可能是以依赖ABA 的方式发挥作用的。

关键词：花生；AhUGT 83A 1－like ；基因克隆；非生物胁迫；荧光定量PCＲ中图分类号：S565．203文献标识码：A文章编号：1007－9084（2014）03－0308－08Cloning of UDP －glucosyltransferase gene from peanut （Arachis hypogaea L．）and its expression analysis during abiotic stressCHEN Na 1，HU Dong －qing 2，PAN Li －juan 1，CHI Xiao －yuan 1，CHEN Ming －na 1，WANG Tong 1，WANG Mian 1，YANG Zhen 1，YU Shan －lin 1*（1．Shandong Peanut Ｒesearch Institute ，Qingdao 266100，China ；2．Qingdao Entry －Exit Inspection and Quarantine Bureau ，Qingdao 266001，China ）Abstract ：UDP －glucosyltransferase gene was cloned from peanut leaf using ＲACE technology and was named AhUGT 83A 1－like （GenBank accession KF411463）．The full length cDNA of AhUGT 83A 1－like was 1530bp ，OＲF 1380bp ，encoding 460amino acids．Sequence alignment and phylogenetic analysis revealed that AhUGT83A1－like had the conserved UDPGT domain and shared high homology with UGT proteins from other plant species．Expression analysis indicated that AhUGT 83A 1－like was induced in peanut roots and leaves under both cold and salt conditions．The expression of AhUGT 83A 1－like was increased in drought －treated roots ，but de-creased in drought －treated leaves．The results suggested AhUGT 83A 1－like may be involved in abiotic stress regu-lation of peanut．In addition ，AhUGT 83A 1－like was induced by ABA in peanut roots ，which indicated that AhUGT83A1－like protein might have participated in abiotic stress regulation in the ABA －dependent pathway in peanut roots．Key words ：Peanut ；AhUGT 83A 1－like ；Gene clone ；Abiotic stress ；Ｒeal －time PCＲ收稿日期：2013-07-22基金项目：国家产业体系（CAＲS －14）；山东省自然科学基金（ZＲ2011CQ036、ZＲ2012CQ031）；国家自然科学基金（31000728、31100205、31200211）；山东省优秀中青年科学家科研奖励基金（BS2010NY023）；青岛市科技计划（11－2－4－9－（3）－jch 、11－2－3－26－nsh 、12－1－4－11－（2）－jch ）作者简介：陈娜（1979－），女，山东蓬莱人，博士，从事花生遗传育种研究*通讯作者：禹山林（1956－），男，研究员，主要从事花生遗传育种研究，E －mail ：yshanlin1956@163．com 低温、干旱和高盐等非生物胁迫严重影响植物的生长与发育，通常植物会通过一系列形态和生理上的改变适应这些不利条件［1，2］，这些响应过程通常受胁迫响应基因的调控。