应用SSR技术进行白菜品种纯度鉴定的研究
利用SSR进行品种纯度鉴定的研究进展
利用优势 。 另外 , 受到保护的品种未经授权单位许 可而 进 行 非 法 经 营 , 害 了 品种 所 有 人 的利 益 , 侵 这 种 情 况 下 ,迫 切 需 要 对产 生 纠纷 的 品种 做 出快 速
Q A u , N i y g S a I O Jn WA G L— i , HI o n Y
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Ab ta t rsn i ain a d dfc l e fv r t u i d ni ct n S r cpe a d a v nae n pa t eweerve d sr c:P ee ts u t n i ut so ai y p r yie tiai ,S R p i il n d a tg si rci r eiwe t o i i e t f o n c
关 键 词 :S 品 种 ; 度 鉴 定 S R; 纯
中 图 分 类 号 :3 8 ¥ 3 文 献 标 识 码 : A D I 码 :03 6 / i n10 — 5 02 1.40 3 O 编 1 .9 9j s .0 6 6 0 . 10 .1 .s 0
Re e r h og e son Va i t s a c Pr r s r e y Purt de tfc ton b iy I n i a i y SSR c i Te hno o y lg
良种 是 农 业 生 产 发 展 的基 础 ,种 子 真 伪 和纯 度 鉴定 对 作 物 和蔬 菜生 产 具有 重 要 意 义 。郭健 等 …
利用SSR分子标记研究白菜类亚种资源的遗传多样性
利用SSR分子标记研究白菜类亚种资源的遗传多样性李光光;黄红弟;张华;郑岩松;李荣华【摘要】In order to analyze the evolution of Chinese cabbage [ssp. chinensis (L.) Makino] resource, a total of 94 Chinese cabbage [ssp. chinensis (L.) Makino] materials were used to assess the genetic diversity. The results showed that, nineteen cabbage SSR primers combinations amplified 137 alleles, 7.16 loci on average for each pair of primers. The average of polymorphism loci percentage ( P), genetic heterozygosity ( He), effective number of alleles (Ne), Shannon-Wiener index (H') and polymorphism information content (PIC) was 99.9%, 0.897, 11.598, 2.454, 0.886, respectively, and there were extremely significant correlation among them except P value. 94 Chinese cabbage [ssp. chinensis (L.) Makino] materials were clustered into three groups by UPGMA when GSC was 0.58, much of local Chinese cabbage was closer relationships with pakchoi. The order of genome amplification polymorphism by Chinese cabbage SSR primers was (small) cabbage, red bolt second lowest and wild mustard.%为研究几种白菜类亚种资源的演变过程,利用白菜SSR引物对94份白菜类亚种种质资源进行遗传多样性分析.结果表明,19对SSR引物扩增出137个条带,平均每对引物可扩增出7.16个;多态性位点百分率(P)、基因杂合度(He)、有效等位基因数(Ne)、Shannon-Wiener指数(H')和多态信息含量(PIC)的均值分别为:99.9%、0.897、11.598、2.454、0.886,除P值外,4个指标间相关性极显著;94份白菜类亚种种质资源的UPGMA聚类结果表明:在遗传相似系数为0.58时实验材料分为3类,多数地方种菜心与小白菜亲缘关系更近.白菜SSR引物对大(小)白菜基因组具有较好的多态性、红菜苔次之、野生芥菜最低.【期刊名称】《热带作物学报》【年(卷),期】2017(038)007【总页数】7页(P1316-1322)【关键词】白菜类亚种资源;SSR;遗传多样性;亲缘关系【作者】李光光;黄红弟;张华;郑岩松;李荣华【作者单位】广州市农业科学研究院, 广东广州 510308;广州市农业科学研究院,广东广州 510308;广州市农业科学研究院, 广东广州 510308;广州市农业科学研究院, 广东广州 510308;广州大学生命科学学院, 广东广州 510006【正文语种】中文【中图分类】S330doi10.3969/j.issn.1000-2561.2017.07.021芸薹属白菜类蔬菜[Brassica campestris L.ssp. chinensis(L.)Makinomunis Tsen et Lee]为A基因组,除了大白菜外,其亚种有5个变种:普通白菜变种(munis Tsen et Lee)、乌塌菜变种(var.rosularis Tsen et Lee)、菜薹变种(var. utilize Tsen et Lee)、紫菜薹变种(var.purpurea Bailey)及薹菜变种(var.tai-tsai Hort),经过自然及人工选择形成了类型丰富的群体。
应用正交设计对大白菜纯度鉴定中EST-SSR反应体系的优化
Z H AO X i n , H E C h a n g — z h e n g , L A N Q i n g - k u o , C HE N R u i , Q I Z h i - w e i , L I O u- j i n g ,Z H U Z h u , WA N G
模板 D N A和 z 伽 酶 5因素 4水平进行优化 , T 结果表 明, 适用于大 白菜纯度 鉴定 E S T — S S R检测体 系为 : 在 1 0 L反应 体系 中包
含3 . 0 m m o 1 . L ~ M g C 1 2 、 4 0 0 t x m o 1 . d N T P s 、 0 . 2 0 I  ̄ m o l ・ L - l S S R引物、 4 n g 模板 D N A和 O . 0 5 U z 酶。利用该优 化的体系 , 对3
a mp l i ic f a t i o n s y s t e m b a s e d o n o r t h o g o n a l d e s i g n. F i v e f a c t o r s we r e c o n s i d e r e d s u c h a s Mg 2  ̄ , d N T P s , p r i me r ,t e mp l a t e DNA a n d T a q DNA p o l y me r a s e a t f o u r l e v e l s . A s u i t a b l e E S T -S S R r e a c t i o n s y s t e m wa s e s t a b l i s h e d . T h e r e s u l t s s h o we d t h a t 1 0 L r e a c t i o n s y s t e m
【推荐下载】SSR标记技术在种子纯度鉴定中的研究
SSR标记技术在种子纯度鉴定中的研究 随着我国农业经济的发展和种子市场的逐步规范,种子的真假和纯度对种子生产具有越来越重要的影响。
下面是编辑老师为大家准备的SSR标记技术在种子纯度鉴定中的研究。
为了保护农民以及育种者的利益,发展快速、稳定、可靠的品种纯度鉴定方法具有重要的意义。
种子品种纯度鉴定主要包括品种真实性和品种纯度鉴定两个方面。
品种鉴定主要指对供检样品的真实性进行鉴定。
品种纯度就是对品种的一致性进行分析。
种子纯度是种子质量的核心指标,是衡量种子质量的主要标准,种子纯度的高低对农业生产的产量和品质有较大的影响,因此在种子生产、加工、贮藏和经营贸易中有重要的意义,历来受到种子管理部门、种子生产者和用种者的密切关注。
品种纯度检验的方法很多,有籽粒形态鉴定,幼苗鉴定,蛋白质电泳鉴定和田间小区种植鉴定等[1],但这些方法均有不足之处。
籽粒形态鉴定可以鉴别性状差异明显的,但这种差异性状较少,准确性差;幼苗鉴定适用于性状表现差异较大的品种,能够鉴定的品种少;蛋白质电泳由于遗传种质资源的狭窄,品种间的差异越来越小,难以鉴定。
纯度鉴定最可靠的方法是田间小区种植鉴定,但是这种方法需要一个生长季节,时间较长,耗费较多的人力物力。
而且上述方法受人为因素的影响较大,导致检测结果产生误差。
为了克服这些缺陷,人们不断地探索新的方法。
随着科学技术的进步,分子生物技术逐渐应用于品种纯度的检验,以遗传物质DNA 为基础的分子标记技术也逐渐受到人们的亲睐。
DNA分子标记技术本质上是指能反映生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性DNA片段[2],由于其快速、准确、可靠、不受环境因素的影响,越来越多地被应用到种子纯度检测中。
SSR是近年来发展起来的一种DNA分子遗传标记技术,是建立在PCR(Polymerase Chain Reaction)基础上的,在植物基因组中的应用非常活跃,已被广泛应用于基因定位,种子进化及遗传多样性的研究[3]。
利用EST—SSR标记鉴定大白菜杂交种纯度的研究
大学 生命 科学 学院 , 山东 青 岛 2 6 0 ) 6 19
摘
要 : 用 E T S R分 子标记 技术 , 利 S—S 选用 自主开 发 的 3 E T S R引物 , 1 个 大 白菜 品种 的总 D A进行 了 P R扩增 。 对 S—S 对 3 N C
天津农业科学 Taj gi l rl c ne in n rut a i cs iA c u S e
・ 植 物 生 理 与 生 物 技 术
2 1 ,6 6 :- 0 01 ( )1 4
利 用 E T S R标 记 鉴 定 大 白菜 杂 交 种 纯 度 的研 究 S—S
张 庶 。周 新 成 , 利 斌 刘 立 锋 李 化 银 宋 梅 芳 , 建 伟 , 玲 , 李 , , , 高 一高
Z HANG S u Z h , HOU Xi— h n 。L i bn, I ifn L a yn , ONG Me- a g, n c e g, I - i L U L -e g, IHu - i S L i fn GAO Ja - i GAO in we ,
中 图分 类 号 :6 41 文 献 标 识 码 : D I 码 :0 9 9 .s.06 6 0 . 1. . 1 ¥3. A O编 l. 6 0i n10 — 5 02 00 0 3 s 0 60
Us f T- S M a k r d n i e S e u i f i e eCa b g l v r eo ES S R r e st I e t y t e d P r t o n s b a eCu t a s o f h y Ch i
白菜SSR分子标记的研究进展
之 间真 实性 鉴别 , 其 多 态性频 率相 对较 低 , 实验 重 复性较 差 , 影响 其在 品种 鉴定 中广 泛应用 。 S R A P 是一 种新型 的基于 P C R的标记 系统 , 最早 是在 芸薹属 作物 开发 出来 。S S R分子标记 技术 通过 设计 引物 进行 S S R 的多态 性分 析 的方 法 已在植物 中得 到较广 泛的应用 。本文 对于应 用较 广泛 的 S S R分子标 记技术 在 白菜 品种鉴定 中的研究及 应用 现状进 行 了 概述 , 为今后 的 白菜研究 工作提供 —定 的参 考 。 1 S S R分子 标记 的基 本原理 和特| S S R也叫微 卫星 D N A , 一般 由几个 核苷酸 ( 2 - 5 b p ) 序列 简单 串联 成 重复序 列 , 根据微 卫星 序列两 端的保 守序列 设 计特异性 引物 , 通过 P C R 反应 扩增 , 并将 扩增 产物进 行凝 胶 电泳 检测得 到 的扩 增片段 , 从而来 揭 示其多 态性 。 S S R具有 以下几 个特点 : ( 1 ) 一般检 测到 的是 —个单一 的多 等位基 因位点 ; ( 2 ) 呈共显, 性遗传 , 可用 来对杂 交种进 行纯度 检测 ; ( 3 ) 实 验所 需 D N A量 较少 , 且操 作简 单 , 实验 重 复 好 , 结果 可靠性 高 ; ( 4 ) 数 量 丰富 , 且均 匀覆 盖整个染 色体组 。与其 他分 子标 记技术 相 比 , S S R标 记在遗 传多样 性分析 和 品种鉴定 上 的优 势显 而易见 ,重要 的是可 以选 特定 的染 色体 上特定位置 的 S S R标 记 进行种 质资源 的鉴定 和杂交种 纯 度 的检 测。 2 白菜种 质资源遗 传多样性 的分析 分 子标 记 在种 质 资 源遗 传多 样性 的研究 中是 一种 有效 的技术 手 段, 目 前, 主要应用 在遗 传多样 性分析 中的分 子标 记技术 有 A F L P 、 I S S R 和S S R标记 等 , 其中 S S R标 记 以其 丰 富的 多态性 被广 泛应用 于蔬 菜 作物品种的遗传多样性的分析中。 杨华I 研 等利用 S S R分子标记技术, 对
不结球白菜品种鉴定 ssr分子标记法
不结球白菜品种鉴定 ssr分子标记法不结球白菜是一种重要的蔬菜作物,具有高营养价值和经济价值。
为了研究不同的不结球白菜品种,可以使用SSR分子标记法进行品种鉴定。
SSR分子标记法包括先从DNA中扩增核苷酸序列,然后根据DNA序列特性,使用引物对PCR扩增产物进行分析。
这种技术广泛应用于分子遗传学和生物技术领域,可以提供快速而准确的品种鉴定和基因检测。
使用SSR分子标记法进行不结球白菜品种鉴定的步骤包括:
1.提取不结球白菜DNA。
2.选择适当的SSR引物和PCR反应体系。
3.通过PCR扩增获得DNA片段。
4.电泳分析PCR产物,评估基因型差异。
5.根据结果进行不结球白菜品种鉴定和分析。
通过SSR分子标记法进行品种鉴定,可以帮助种植者和消费者确定不同品种的不结球白菜,从而提高种植效率和产品质量。
白菜SSR分子标记的研究进展
白菜SSR分子标记的研究进展简述了SSR分子标记的基本原理和特点,从白菜种质资源遗传多样性分析、SRR指纹图谱的构建、杂交种纯度的鉴定、遗传图谱构建和分子标记在辅助育种上的应用等几个方面介绍了近年来白菜研究中SSR分子标记的研究进展及应用前景。
标签:白菜;分子标记;SSR;遗传分析引言白菜(Brassica campestris L. ssp. Pekinensis)原产于我国北方,现广泛种植于全国的标志性蔬菜种类之一,分为结球白菜、不结球白菜两个亚种。
由于不同的白菜品种之间可以进行天然的杂交,如隔离不当以至于品种之间混淆,形成了很多栽培亚种或变种,且现今大量的白菜新品种涌入市场,因此,品种差异的鉴定在蔬菜生产和使用中显得尤为重要。
对于商用种子的品种鉴别,新品种登记测试以及资源种质遗传多样性分析,都非常需要发展一种高效、快速、准确和经济实用的品种鉴别方式[1]。
近年来生化和分子标记技术的快速发展使得其在鉴别能力、速度及准确性方面都比传统的种植鉴别有明显的优势,并且这些技术已经应用于茄子、黄瓜、玉米、水稻等蔬菜作物种质资源的鉴定,指纹图谱的构建,分子标记辅助选择育种及杂交种纯度的检测。
利用分子技术已经在白菜的研究中进行了遗传多样性的分析,SSR指纹图谱的构建,品种真实性的鉴定及纯度的检测等大量工作[2-4]。
在新品种审定及新品种的品种权授予前需要进行DUS测试,确定该品种的特异性(Distinctness)、一致性(Uniformity)和稳定性(Stability),由于在各项研究中运用了分子标记技术,大大减少了实际中对于白菜种子检测的工作量。
现阶段在蔬菜研究中应用较广泛的DNA分子标记主要包括扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)、随机扩增的多态性(random amplified polymorphic DNA,RAPD)、相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)、简单重复序列区间扩增多态性(simple sequence repeats,SSR)。
利用SSR标记鉴定油绿3号大白菜品种纯度
s e s Usn h s wo p me ar , 0 s e i g f Yo liNo 3 we e e a n d, n h u iy wa 7. e d . i g t e e t r rp is 5 e d n s o u t i . r x mi e a d t e p rt s9 3% ,
方法 和数 据参 考 。
生产 商 品大 白菜 前 , 对 种 子 纯 度进 行 鉴 定 。但 由于 需 大 白菜 自采种 至播 种 间隔时 问短 , 种 当年投 入生 产 , 制
( 河北 农业 大学 园艺学 院 , 河北 保 定 0 10 ) 700
摘要 : 利用 SR标记对大 白菜新品种油绿 3号及其父母 本进行 纯度鉴 定, S 结果表 明: 选取 的 4 7对芸 薹属 S R引物 中, S 有 2对 引物表现稳定的共显性 , 杂交后代表现 为父母本 互补的 带型 , 异性强 , 用于杂 交种 纯度 鉴定 。纯度鉴 定结果 为 特 可
第3 0卷
第 9期
2 1 9月 0 1年
种
子
( ed Se )
V 13 N . S p 2 1 o 0 o9 e . 0 1 .
利 用 S R标 记 鉴 定 油 绿 3号大 白菜 品种 纯 度 S
管 志坤 , 罗双 霞 , 李 艳霞 , 陈 雪平 , 王彦 华 , 顾爱侠 , 申书兴
46份大白菜种质资源SSR标记的遗传多样性分析
46份大白菜种质资源SSR标记的遗传多样性分析作者:段丽丽郑永胜李华孙加梅王东建王雪梅仙丽娜王秀娟张晗来源:《山东农业科学》2016年第05期摘要:利用30对SSR引物分析了46 份大白菜品种的遗传多样性。
结果表明,30对引物共检测到170个多态性位点,平均每对引物检测到5.667个,变化范围为2~10个;引物的多态信息含量分布范围为0.367~0.793,平均值为0.633,等位基因多样性指数分布范围为0.485~0.817,平均值为0.685。
UPGMA 聚类分析将 46 份大白菜品种划分为五大类,说明本研究中的大白菜品种具有较为丰富的遗传多样性。
关键词:大白菜;遗传多样性;SSR;聚类分析中图分类号:S634.103.6文献标识号:A文章编号:1001-4942(2016)05-0005-04Abstract Thirty primers of SSR molecular markers were used to analyze the genetic diversities of 46 Chinese cabbage varieties. The results showed that a total of 170 alleles were identified with an average of 5.667 alleles per locus, which varied from 2 to 10. The polymorphism information content (PIC) varied widely from 0.367 to 0.793 with an average value of 0.633. And the allelic diversity index varied from 0.485 to 0.817 with an average value of 0.685. Cluster analysis with UPGMA showed that the 46 Chinese cabbage varieties could be classified into five groups, which reflected that they owned abundant genetic diversities.Key words Chinese cabbage; Genetic diversity; SSR; Cluster analysis大白菜Brassica campestris L. ssp. pekinensis (Lour) Olsson是世界范围内的主要蔬菜品种之一,原产于我国,在我国蔬菜栽培面积中占第一位,栽培历史悠久,品种丰富。
青梗菜速俊109杂交种纯度SSR分子标记鉴定
第39卷第8期2020年8月Vol.39No.8Aug.2020种子(Seed)•种子检验•青梗菜速俊109杂交种纯度SSR分子标记鉴定范伟强】,王超楠打黄志银】,李梅】,张红】,郑思宇2,徐营莉2,华德平3(1.天津科润蔬菜研究所,蔬菜种质创新国家重点实验室,天津市蔬菜遗传育种企业重点实验室,天津300381;2.天津师范大学生命科学学院,天津300387;3.天津大学生命科学学院,天津300072)Purity Identification of Pakchoi Cabbage Hybrid Variety Sujun109SeedsBased on SSR Molecular MarkersFAN Weiqiangi,WANG Chaonan1,HUANG Zhiyin1,LI Mei1,ZHANG Hong】,ZHENG Siyu2,XU Yingli2,HUA Depiig摘要种子纯度体现商品种的一致性和稳定性,是反映种子质量的一项重要指标。
为了准确、快速地鉴定青梗菜速俊109杂交种的纯度,本研究筛选了72对不结球白菜核心引|物,发现QGC-A07-44|物对在速俊109双亲及F1杂交种间存在共显性差异,利用该|物对8份F’杂交种样品进行纯度鉴定,与田间形态学鉴定结果相比较,偏差<2%,说明|物QGC-A07-44可以用于青梗菜速俊109杂交种的纯度鉴定。
关键词:青梗菜;纯度鉴定;分子标记;SSRD()I编码:10.16590/ki.1001-4705.3020.08.146中图分类号:S634.文献标志码:A文章编号:1001-4705(2020)08-0146-03青梗菜(Brassica rapa L.SSP.chinensis),是小白菜的一种,原产于中国,因其具有生长期短、商品性好、方便烹饪、味道鲜美等优点,深受人们喜爱,广泛种植于世界各地。
种子纯度是种子质量的重要指标之一,直接影响品种产量及商品性。
利用EST-SSR标记鉴定大白菜杂交种纯度的研究
利用EST-SSR标记鉴定大白菜杂交种纯度的研究张庶;周新成;李利斌;刘立锋;李化银;宋梅芳;高建伟;高玲【期刊名称】《天津农业科学》【年(卷),期】2010(016)006【摘要】利用EST-SSR分子标记技术,选用自主开发的3对EST-SSR引物,对13个大白菜品种的总DNA进行了PCR扩增.结果表明:EST-SSR标记可以体现品种内的一致性、亲本问以及品种间的多态性,具有共显性、稳定性和可重复性的特点;EST-SSR标记可以快速、准确地鉴别大白菜品种的真实性和杂交种纯度,为大白菜种子质量的高效检测提供科学依据.【总页数】4页(P1-4)【作者】张庶;周新成;李利斌;刘立锋;李化银;宋梅芳;高建伟;高玲【作者单位】山东省农业科学院蔬菜研究所山东省设施蔬菜生物学重点实验室,国家蔬菜改良中心山东分中心,山东,济南,250100;青岛农业大学生命科学学院,山东,青岛,266109;山东省农业科学院蔬菜研究所山东省设施蔬菜生物学重点实验室,国家蔬菜改良中心山东分中心,山东,济南,250100;山东省农业科学院蔬菜研究所山东省设施蔬菜生物学重点实验室,国家蔬菜改良中心山东分中心,山东,济南,250100;山东省农业科学院蔬菜研究所山东省设施蔬菜生物学重点实验室,国家蔬菜改良中心山东分中心,山东,济南,250100;山东省农业科学院蔬菜研究所山东省设施蔬菜生物学重点实验室,国家蔬菜改良中心山东分中心,山东,济南,250100;山东省农业科学院蔬菜研究所山东省设施蔬菜生物学重点实验室,国家蔬菜改良中心山东分中心,山东,济南,250100;山东省农业科学院蔬菜研究所山东省设施蔬菜生物学重点实验室,国家蔬菜改良中心山东分中心,山东,济南,250100;青岛农业大学生命科学学院,山东,青岛,266109;青岛农业大学生命科学学院,山东,青岛,266109【正文语种】中文【中图分类】S634.1【相关文献】1.利用RAPD标记鉴定大白菜杂交种纯度的研究 [J], 宋顺华;郑晓鹰2.利用InDel标记鉴定大白菜杂交种豫新四号种子纯度 [J], 薛银鸽;原玉香;张晓伟;董森森;姚秋菊;蒋武生;田保明;张强;赵艳艳3.利用广亲和基因S5-n的功能标记鉴定特殊配组类型杂交种纯度研究 [J], 张馨月; 李友发; 刘江宁; 富昊伟4.利用SSR标记技术鉴定西瓜杂交种纯度的研究 [J], 韩道杰;冯锡鸿;马长河;孙德祥;申太荣;钱瑾;董建力5.利用荧光标记SSR鉴定西瓜杂交种的纯度研究 [J], 程维舜;罗茜;洪娟;王素萍;黄翔;杜雷;姜利;张利红;陈钢因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
DB12_T647-2016大白菜品种纯度SSR分子标记检测方法
ICS67.050B31DB12天津市地方标 准DB12/T 647—2016大白菜品种纯度S S R分子标记检测方法Methods of identifying varietal purity of Chinese cabbage by using SSR-based markers2016-09-27 发布2016-11-01 实施天津市市场和质量监督管理委员会发布,> t,—*_刖言本标准按照GB/T 1.1—2009给出的规则起草。
本标准由天津市农村工作委员会提出。
本标准起草单位:天津市农业质量标准与检测技术研究所、天津市蔬菜研究中心。
本标准主要起草人:赵新、王超楠、兰青阔、王成、刘莉莉、朱珠、李梅、陈锐、徐石勇。
本标准2016年9月首次发布。
大白菜品种纯度S S R分子标记检测方法1范围本标准规定了大白菜品种纯度SSR分子标记检测方法的术语和定义、检测方法、纯度计算方法。
本标准适用于大白菜单交种的纯度检测。
2规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。
凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本 文件。
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T3543.2农作物种子检验规程扦样GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法3术语和定义下列术语和定义适用于本文件。
3.1品种纯度 varieties purity品种纯度指种子在SSR分子标记带型方面典型一致的程度,用具有本品种特异带型的种子粒数占 检测样品种子粒数的百分率表示,以反映某品种特征特性的一致性程度。
3.2聚合酶链式反应 polymerase chain reaction (PCR)一种在体外通过酶促反应扩增特异D N A片段的技术。
3.3简单重复序列 simple sequence repeat (SSR)由几个核苷酸(1-6个)为重复单位聚集而成的长达几十个至几百个bp(—般为100-200bp)的串 联重复序列,又称微卫星序列或短串联重复序列,其高度多态性主要来源于串联数目的不同。
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报道 。S R技术 , P R为基础 , 有信 息含量 高 、 S 以 C 具 呈
共 显性 遗传 、 易于 分析 等特 点 , 用 来高 效 准确 地 检 可 测 生物体 中的遗传变 异 。 本研究 旨在 以 S R分子标 记 S
b t e n h c mb n t n f h b i s a d r a t n y t m w s sa l h d h c wa s i b e o C ie e a b g e w e t e o ia i o y r , n a e ci s se o d o a e t b i e w ih s s ut l a fr h n s C b a e
采 用经典 S S法提取 了 l D 3个 白菜试 验样 品 ( 父母本 及 杂交 种 ) D A. 的 N 同时 利用 本研 究 中摸 索 出 的快 速 方 法 提 取 了 白菜 单 粒 干 种 子 、单 株 幼 苗 和 叶 片 的
D A. N 采用 1 %琼脂 糖 凝胶 电泳 检 测 D A提 取质 量 . 5 N
的 白菜基 因组 D A质量 S R扩 增产物跑 60 N S . %变性
聚丙 烯酰胺 凝胶 电泳 。 电泳 9 2 i; 预 0 W,0 m n 电泳 9 0
和北 京新 3号 ) 为 目前北京 市 白菜 生产 上大 面积 推 均 广使用 的杂交种 . 代表 了 白菜早 熟 、 晚熟 栽培类 型 。 样 品材料 为 白菜种 子
收稿 E 期 : 2 1 — 3 0 t 00 0—3
北京农业21年4 0 0 月下旬刊 【 羽
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栽 培育种
鉴定 等方 面 已成 为更加理 想 的方法 。国内宋顺 华【 3 ] 等
白菜是 十字花 科 芸薹属 1 生草 本植 物 栽 培历 年 史悠 久 , 域 广泛 . 地 深受 人 们 的喜 爱 . 在北 方 俗 称 “ 当
家 菜 ” 同 时 也 是 北 京 市 指 定 的 主 要 农 作 物 之 一 . 京 在
责任 和义 务 。它对 于提 高种 子 管理 的执 法力 度 . 厉 严
p u a iai . op l rz ton
K y rs C i s abg ; hbi; D A et ci ; S R p m r pry i n f ao e wod hn eC b ae e yr d N x at n S r e ; u t d t et n r o i i ei i i
为 技术 手段 . 探索适 合室 内白菜种 子纯度 的快速 鉴定
方法 。
G T G T C T A C T G 一 ’ Pi r I A C A T A A C G A A 3 。 r 2弓 物序列 : me
上游 5 一 T C A C F G G C C A A 一 ’ ’ A A A T T C T A T T C G 3 .下游
w, 。氢 氧化 钠一 酸银染 色 ,2 lh 硝 7 0万像 素数 码相 机
拍照 . 获得杂 交种和 亲本 的指 纹 图谱 。
1 研 究方法 . 2
1 . 白菜单粒 干种 子及 单株 幼苗 DNA 快速提 取方 .1 2
2 试 验 结 果 与分 析
2 白菜样品基 因组 D A的提取 . 1 N 利用 白菜叶片 。
物 的 产 量 和 产 品 品 质 在 白菜 种 子 生 产 和 销 售 过 程
植 鉴 定 . 这 一方 法 易 受环 境 的影 响 . 问 长且 费 工 但 时
占地 近 年 来 . 子 牛 化 鉴 定 技 术 的 应 用 对 种 子 纯 度 种 检 验 的 准 确 、 速 和 实 用 性 起 了 很 大 推 动 作 用 。 国 内 快
v reis a te pu iy sng SR m oe u a ma ke . Th r s ls nd c td ha t e e e in i rt u i S lc lr r r e e u t i i ae t t h d tct meho c u d o t d oro o m i e tfc to o Chi s Ca ba e d n i ai n f i ne e b g hy rd urt b p iy, a d o u e a ir b s f r t n h f ur a plc to a i n f nd d f m a e o i i t e ut e p i ain nd
Ab t c U ig Ch n s C b a e y r s n t e r a e t a e p rme t l sr t a sn 5 i e e a b g h b i a d h i p r n s s x e d i n a mae a , a t r l me h d f a i DNA i t o o rp d
匀 。离心管 中加入 1滴石蜡 油 , 放入 P R仪 中 . 行 C 执 9 ℃加 热 1 i .℃l n程序一 个循环 5 0 m n 4 0 mi 循环结 束
1 %琼脂糖 凝胶 电泳检 测 D A提 取质量 的结果 . 5 N 显示 :利 用 白菜 叶片 .采 用经典 S S法 提取 的 1 D 3个 白菜 基 因组 D A. 1条 清 晰 完 整 的 D A 带 , 有 N 为 N 没
Re e r h n Chn s s a c o ie e Ca b g r t s Pu i Ie t ia in b a e Va i i ry d n ic t Usn ee t f o ig SSR Ma k r re
Tin L i Pe g a e n Rud W a g ii n Hu Ja Xia i i h i
栽培 育种
应用 S R 技术进 行 白菜 品种纯 度鉴定的研 究 S
田 雷 彭瑞 迪 王 辉 贾希 海
(北 京 市 种 子 管 理 站 , 北 京 1 0 8 ) 008
摘 要 以 5个 白 菜 杂 交种 和 8个 亲本 为试 验 材 料 。 用 白菜 单 粒 干 种 子 D A 快 速 提 取 方 法 . 利 N 筛选 出能 够 区 分 5个 杂 交种 与 双 亲 , 具 有 互 补 带 型 的 S R 引 物 , 立 适 于 S R 分 子 标记 检 测 白 菜种 子 品 种 纯度 的反 应 体 系 试 验 结 果证 明这 并 S 建 S
种 子案 件 时有发 生 . 给农 业生 产 造成 了不可 弥补 的损
失 因此 , 白菜杂 交种 子纯 度进 行快 速 、 确 、 对 准 有效 地 鉴定 显得 十分 必要 . 是种 子 管理 部 门义不 容 辞 的 也
作者 简 介 : E ̄ (9 5 )高级 农 艺 师 , H -1 6 一, 主要 从 事 种 子 检 验 工 作 。
套检 测技 术体 系可 用于 白菜 杂 交种 品种 纯度 室 内快 速 鉴 定 .从 而 为 S R 分子 标 记 技 术 在 白 菜种 子 纯 度 鉴 定 中的 应 用 和 S
推 广 打 下 了 坚 实 的 基 础
关键 词 白 菜 ; 杂 交种 ; DNA提 取 ; S R 引 物 : 纯 度 鉴 定 S 中 图分 类 号 S 3. 3 95 文献 标 志 码 B
人 利用 R P A D技术 .从 5 0个 随机 引 物 中筛选 出 了 3 个 引物 .通 过在北 京 5 7号和北 京 1 6号及 其各 自亲 0 本 中检 测到有 别 于双亲 的特殊标 记 . 而用 于这 2 白 个 菜杂交 种品种纯 度的检 测。 到 目前 为止 国内还 未见 但
( 图 l 2) 见 ~ 。
法
将 白菜单粒 干种 子夹在硫 酸纸 ( 量用 ) , 小 称 中 用
锤 子砸 碎 , 放入 2 0 L离心 管 中 , 0 每管 加人 10 t 0 x L
D A提取 液 (. M Ti H L p .,.%S S 1 N 01 r — C H 7 1 s 6 0 D ,. 0 M K c . M N C , 同) 单 株幼 苗 加入 2 0 L A ,1 a L 下 0 ; 0 D A提 取 液及 少 量 石英 砂 .用 尖 头玻 璃棒 碾 碎 . N 混
有利 用 S R分 子标记 技术 检 测 白菜 品种 纯度 的研 究 S
环 后 退 火 温 度 降 至 5 o 7  ̄延 伸 1 ri;接 着 用 0C,2C n a 5  ̄退 火做 3 ~ 0个 循环 , 0C 54 变性 与延 伸 的温度 和时 间 同上 .最后 7 q延 伸 7 mi。P R扩增 在 MY C c r 2C n C yl e 扩增仪 上进行 1 . 引物 引物 信息 来 源 于文献 [ 及 ht :w w .3 2 4 t /w . p/ u co .e 网站下 载 .部分 引物 由北京 市农林 科 学 院 k rpnt 生 物技 术 中心 马荣 才老 师提供 . 上海英 俊 生物技 术有 限公 司进 行引 物 合成 。Pi el引物 序列 :上 游 5 一 r r m ’
后 。 离心管 从 P R仪 中取 出 . 将 C 放入 离心机 中 1 0 200
r i 心 5 mn / n离 m i,取上 清 液 l L 0 ,加 入 一 个新 的 2 0 L离心 管 中 ,里 面预 先放 人 10 L 1 T 混 0 0  ̄ E,
5’ AGCATCAACGCCAACr ATCC一 。 一 n 3’
1 材 料 和方 法
1 植物材料 . 1 本实验中所用到的 5 白菜杂交种 个
( 京小 杂 5 、 北 6 北京 小杂 6 、 京新 1 、 1北 号 北京新 2号
1 . 电泳检 测 用 1 %琼 脂糖 凝 胶 电泳检 测 提取 .4 2 . 5