第十一章 微生物分类

（2）细菌鉴定的检索表
细菌的分类鉴定必须参照一定的分类系统，根据该分 类系统确定区分各分类单元的一系列特征，构成一个鉴定
系统，即细菌鉴定的检索表。检索表分为双歧式和表格式
两种。
①双歧式检索表
由一系列是与否的问题构成，通过逐级分支的流程图 将一个菌株确定到一个已知的分类单元。其中每一个问题
(性状)都必须回答，不能跨越。在鉴定中，如果检索表的
分类的基础。细菌的分类鉴定包括传统的鉴定方法和分子
鉴定两个方面。
1、细菌分类鉴定的特征 传统的细菌分类鉴定采用的特征包括以下七个方面的
内容：
(1) 个体形态特征 (2) 培养特征 (3) 生理生化特征 (4) 血清学反应特征 (5)生态学特征 (6)化学组成特征 (7)遗传学特征
2、细菌的鉴定
细菌鉴定工作包括培养特征观察、显微镜观察、生理 对噬菌体和抗生素的敏感性等环节。
基础上重新制定实验方案，进行必要的补充试验，直到作
出最后鉴定。
三、种以下的分类单元
为了使用方便，在种以下人们又提出了许多分类单 元，这些分类单元不是正式的分类单位，一般也没有得到
国际公认。
1、亚种(Subspecies，subsp.,ssp.) 在种内，根据少数几个稳定的变异特性或遗传性状区
分为小群，这样可将一个种分为两个和更多的小的分类单
位，称为亚种。亚种是微生物分类中具有正式分类地位的
验项目的结果可疑或有矛盾，应在仔细分析原因的基础上，
③鉴定结果的判断 在全面鉴定试验结束后，应查对有关的文献资料和检
索表，鉴定结果可能出现以下情况： a.未知菌株的特征与某一属中的某个种的特征完全一致， 未知菌株即鉴定为该属该种。 b.未知菌株的特征与某一属中某个种的特征基本一致，少 数次要的特征不符，但又不足以鉴定为新种，可鉴定为该 种的亚种。
a.基本形态：球状、杆状或螺旋状；有无特殊结构；革兰
氏染色反应；有无运动性等。
b.某些突出的培养特征：能否产生色素等。 c.营养方式：是化能自养、化能异养或光合细菌，有无特 殊的营养要求等。 d.对氧气的要求：好氧、厌氧、微好氧或兼性。
e.糖类的代谢方式：是发酵性的或氧化性的。
f.其他：接触酶、氧化酶有无等。
1995年，英国出版的《真菌学词典》第八版将真菌分
为五大类： 壶菌 接合菌 子囊菌 担子菌 有丝孢真菌类（半知菌类）
真菌的分类目前以形态学观察为主，同时也在逐渐应 用分子生物学手段以确定真菌的分类地位和亲缘关系。
三、细菌的分类鉴定
细菌的分类鉴定主要是采用一系列的特征来作为分类 鉴定的依据。分类特征是指用于细菌分类的标准，是生物
最低等级。
亚种是在种的加词后写上“subsp.”、或“ssp.”，再 写上亚种的加词。
Bacillus cereus subsp.mycoides (Flü gge)Smith et al.1946
2、变种(Variety,var.)
变种是亚种的同义词，因易引起混乱，1975《国际 细菌命名法规》已取消其在命名法中的地位，且不主张使 用。
细菌鉴定的步骤依鉴定的要求，以及所鉴定菌株归属 类群的不同而有所不同。细菌鉴定的一般程序如下：
①初步鉴定 ②全面鉴定 ③鉴定结果的判断
①初步鉴定
初步鉴定是为了掌握未知菌株的一些基本特征，然后， 通过查阅有关的文献资料或细菌检索表，初步判断该菌株
可能的归属范围(目、科、属等)，基本特征包括六个方面：
出版了《伯捷氏细菌鉴定手册》第九版。第九版主要根据
表型特征，将细菌分成四个类别，35群。
二.真菌的分类系统
1.Martin（1950） 2.Whittaker（1969） 3.Ainsworth（1973、1995） 4.Margulis（1974）
5.Leedale（1974）
6. Alexopoulos（1979）
菌株的名称都放在学名（即只有属名和种的加词者） 的后面，可随意地用字母、符号、编号或字母加编号等自
行决定，例如：
埃希氏大肠杆菌(Escherichia coli) K12 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis) V1J
第二节 微生物的命名方法
微生物与高等生物一样，也是按照 “双名法” 来命名 的，即 种的学名包括属名和种的加词。 属名和种的加词都是由拉丁文、希腊文和拉丁化的其他词 组成，要求印刷为斜体，或书写时在学名下划线。
具体的原则归纳起来主要有五点： ①必须保证所鉴定的分离物始终是纯培养物。 ②要有一个已知的、可靠的参考菌株作对照，以证明本实 验室采取的实验条件是有效的。 ③试验的方法一般应用公认的或指定的，并严格按要求进 行。 ④根据文献资料逐步缩小分离物的归属范围到属、种。
⑤尽量减少所使用的实验项目。
（4）细菌鉴定的步骤
第三节 微生物的分类系统
一、原核生物的分类系统 二、真菌的分类系统
一、原核生物的分类系统
1、前苏联克拉西尼科夫的细菌分类系统（1949） 2、法国普雷沃的细菌分类系统（1961） 3、中国科学院王大耜的细菌分类系统（1981）
4、美国的贝捷氏细菌分类系统（1923、25、30、34、39、
48、57、74、84~89、94）
第十一章 微生物分类
学时：3 教学内容 1.了解分类的单元 2.掌握微生物的命名方法 3.了解微生物的分类系统
4.了解微生物的分类鉴定方法
微生物分类学(Microbial taxonomy)是一门研究微生
物分类的理论和方法的科学。
微生物分类学通常由三个部分组成：
分类(Classification) 微生物 分类学 鉴定(Identification)
某一个性状不能确定，分离物就不能准确地鉴定。
②表格式检索表
只对分类群的特征进行总结，对各分类特征不给 看似复杂，但容许被鉴定对象的个别特征不确定，故比双
予等级化的排列。表格式检索表常包含较多的性状、特征， 歧式检索表优越。
（3）细菌鉴定的原则
鉴定工作的总原则是：在鉴定的初期运用简单的鉴别 方法，获取必要的信息，尽量缩小分离物的归属范围，以 减少实验项目（工作量）。 当一个分离物初步被确定为某一个类群后，就应当遵 循检索表中该类群所采用的实验项目。
c.未知菌株的特征与某一属特征相符，少数较重要的特征
与该属所有的种(包括最新报道的种)都不相同，经仔细的
全面鉴定后，可鉴定为新种，并进行描述、命名，同时应
及时予以报道。原始菌株应妥为保存，以备查考。 d.在全面鉴定后，如发现有一些重要特征与初步鉴定所归 属的类群不相符，而与相近的分类群更近，应在原试验的
3、型(Form) 是亚种以下的分类单位，是指具有相同或相似特性的 一个或一组菌株构成的分类类群。 常见的有生物型、形态型、血清型、病理型、噬菌体 型等。
Байду номын сангаас
4、菌株(Strain) 菌株是指由任何一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯
种群体及其后代。
一种微生物的每一不同来源的纯培养物均可称为该菌 种的一个菌株。
第一节 分类单元
一、微生物分类等级 二、种的定义
三、种以下的分类单元
一、微生物分类等级
分类等级也叫分类单元，在微生物分类中，分类单
位是按一定的阶元顺序排列的，自上而下依次可分为七个
等级：
界(Kingdom) 门(Phylum) 纲(Class) 目(Order) 科(Family) 属(Genus) 种(Species) 亚种(Subspecies)
②全面鉴定 在初步鉴定未知菌株可能属于某属的基础上，须进一 步全面考察该菌株是否就是该属的细菌，或是该属的某个 种。 全面鉴定的实验项目主要参照文献资料上对该属和其 中各种的特征描述，以及这些属、种与相关的属、种之间 的鉴别性特征来确定。
实验完成后必须及时地整理实验结果，如发现某些实 重做该项目，以求获得可靠的实验结果。 在传统的鉴定实验结束后，如发现鉴定菌株是新种， 还必须进行分子鉴定。
第一个词是属名，为单数主格名词，或用作为名词的形容 词表示；第一个字母要大写，并可用缩写为大写的单个或
几个字母表示。
第二个词是种名加词，通常为形容词，表示形态、生理或 生态特征，也可是人名、地名、病名或其他加词，第一个 字母不能大写，也不得缩写。
通式：学名=属名+种的加词+(首次定名人)+现在定名人+ 定名时间
命名(Nomenclature)
1、分类(Classification)：根据细菌的相似性或亲缘关系，
将细菌归并到不同的分类阶元中。
2、鉴定(Identification)：确定一个新的分离物(菌株)是否
属于已命名的分类阶元的过程。
3、命名(Nomenclature)：根据国际命名法规，给予细菌 一个科学的名称。
美国的伯捷氏细菌分类系统
伯捷氏系统于1923、25、30、34、39、48、57、74、 94年分别出版了九版，由于该系统的科学性、系统性以及
收集的资料比较全面，在国际上倍受重视，逐渐成为了最
有影响、最权威的细菌分类系统，在世界上广泛被采用。
1994年，作者将《伯捷氏系统细菌学手册》四卷中关 于细菌分类鉴定的资料及最新的细菌分类资料汇集成册，
例:(1)枯草芽孢杆菌
Bacillus subtilis (Ehrenberg) Cohn 1919 例如:(2)铜绿色假单胞杆菌 Pseudomonas aeruginosa (Schroeter) Migula 1920 例:(3)苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种
Bacillus thuringiensis subsp. galleria
生化试验、分子生物学检测，血清学检查、动、植物接种，
细菌鉴定需要具备必要的基本条件，要依据一定原则， 要参照相关的细菌鉴定检索表，鉴定前还应制定相应的实 验方案。