引用ensemble数据库
如何查药物在USA、JP、EU的上市及临床情况
如何查药物在USA、JP、EU的上市及临床情况一般情况下 如果对一个国外的新药感兴趣 我会先用Pharmaprojects和Ensemble、Martindale、The Merck Index_13th等数据库进行一下前期搜索 不一定全用 视具体情况而定 几个常用数据库的简介见后附――这好像就是从园子里得来的资源 借用一下 也省得偶罗哩罗嗦说不明白园子里的原帖还附有用法 因为贴图较多文件较大 就没有粘过来 有兴趣的战友可以自己找来看 这些都是非常有价值的数据库 但总体说来 我还是比较喜欢Pharmaprojects CA on CD在立项阶段的用途不是很大 列在这里是因为它实在是太权威的东西 对这个药物的基本信息进行大略了解 再结合这些数据库里提供的信息查一查专利方面的限制 专利查询好像大家也都讨论过多次 不再赘述 做一个简单的总结 如果没有什么大问题就开始详细的查询 这就又分几种不同情况了。
1 该药物是美国上市的品种这是比较乐观的情况。
因为众所周知 能通过FDA重重关卡上市的药物一般各方面的信息都已经比较完善了 端看咱们怎么把这些资料挖出来。
个人经验就是先到FDA的网站上搜索 DRUG@FDA上面总能有许多有用的资源 且不说各个药物Label Information是基本收获 夸张点说 很多时候FDA的说明书就是一个小型的药物信息总结了 甚而很多时候能在Approval History and Related Documents里发现一个名叫“Review”的东东 这可是份颇为有用的宝贝 里面包罗的东西足够研究一阵了――Approval Letter、Printed Labeling、Medical Review、Chemistry Review、Pharmacology Review、Statistical Review、Clinical Pharmacology Biopharmaceutics Review……虽不能细看 但粗粗浏览而过也会收获不小 收藏起来 真的立了项之后也是很有用的资料。
引用ensemble数据库
引用ensemble数据库集成数据库的引用在数据科学领域，集成多个数据库以利用其协同效应变得越来越普遍。
Ensemble数据库（集成数据库）通过整合来自不同来源的数据，为分析和决策提供更全面、更准确的见解。
引用集成数据库时，需要遵循特定的最佳实践，以确保准确性和可重复性。
明确数据来源引用集成数据库的最重要步骤之一是明确说明数据来源。
这意味着指出每个数据子集的来源，包括原始数据库、数据收集方法和数据处理步骤。
通过提供对数据来源的准确描述，读者可以评估数据的可靠性和适用性。
描述数据集成过程集成数据库涉及将数据子集组合成一个连贯的数据集。
引用时，描述用于集成数据的过程非常重要。
这包括说明用于匹配、合并和处理数据的技术和算法。
通过记录集成过程，读者可以理解集成数据集的完整性和有效性。
指定数据质量指标数据质量对于确保集成数据库的准确性和可靠性至关重要。
引用时，提供有关数据质量指标的信息非常有帮助。
这些指标可能包括数据完整性、一致性、准确性和及时性。
通过指定这些指标，读者可以评估数据集的质量并确定其在特定应用程序中的适用性。
引用文献引用集成数据库的最佳实践包括引用原始数据库和用于集成数据的任何文献。
这有助于建立信息来源的可信度和可靠性。
正确的引文格式将根据采用的引用风格而有所不同，例如 APA、MLA 或Chicago。
考虑伦理影响当引用集成数据库时，考虑伦理影响至关重要。
数据可能包含敏感信息，因此在使用前必须遵守隐私和道德准则。
引用时，应指出已采取必要措施保护参与者的隐私和保密性。
示例引用以下是一些集成了不同数据来源的数据库引用的示例：数据集名称：城市人口数据库数据来源：美国人口普查局国家地理空间情报局数据集成过程：使用地理匹配算法将人口数据与空间数据合并数据集名称：健康和医疗保健数据库数据来源：电子健康记录系统患者调查数据集成过程：通过匿名唯一标识符连接医疗记录和调查数据使用自然语言处理技术提取相关信息通过遵循这些最佳实践，引用集成数据库可以提供准确、可靠和可重复的分析和决策。
new drug R&D 数据库简介
PharmaProjects 数据库简介Pharmaprojects是世界药物研制开发处于领先地位的智能型数据库。
它监控着国际上处于开发阶段的每一个重要新药，跟踪着国际上处于研发活跃阶段的候选药物，提供给客户产品开发的全面资料。
Pharmaprojects数据库包括自1980年以来超过30000个处于开发阶段的药物，并且每月都有1000多个药物的更新信息。
Pharmaprojects中的每个药物都包含以下信息：1、主要信息：包括药物名称、开发阶段、各国上市情况。
2、该药物开发公司的情况：包括原始开发公司、国家、开发状况、上市国家。
3、药理依据：包括药效分类及代号、药物用于该适应证的开发状况、药理作用描述、适应证描述、给药途径等。
4、化学依据：包括化合物代号、CA 注册号、分子量、分子式、化学名、结构式。
5、专利情况：包括专利国家、专利号码、专利优先号、优先日期等。
6、各国上市情况：包括上市国家、上市情况、上市时间、批准情况等。
7、主要事件：记录了该药物开发过程中的重大事件。
8、开发进度：记录了药物开发的进度、市场评测。
9、细节信息：详细记录了该药物的市场和临床前以及临床情况。
10、除了药物信息之外，Pharmaprojects 还提供了世界上1300余家主要制药和生物技术企业的相关文件，通过组合查询，可以轻松地获得所需的开发信息。
总之，Pharmaprojects 是跟踪国际上的新药开发动态、寻找新药报批机会及市场合作开发伙伴和分析市场收益的最佳工具！Ensemble 数据库简介Ensemble 数据库可为药物研发提供超过167,000 种生物活性化合物包括化学结构在内的必要信息。
本数据库利用用户容易掌握的界面将数据、文本和图象资料有机地结合起来，便于查询。
Ensemble 可从药品专利开始，再通过其临床前和临床研究资料，直至注册信息、市场概况及其他方面的相关资料来跟踪药物。
数据库每月更新一次，每年增加约10,000 种新化合物。
ensemble method
ensemble methodEnsembleMethod（集成方法）是一种比独立模型更强大的机器学习方法，它可以提高模型的准确性和性能。
这种方法有很多不同的变体，比如bagging（bootstrap aggregating），boosting，stacking 等。
这篇文章将讨论ensemble method的概念和原理，并介绍它的一些常用变体。
首先，让我们来看看ensemble method是什么。
它是一种将多个较弱的模型集合在一起的方法，以便构建一个更强大的模型。
一般来说，模型的强度依赖于对训练数据进行拟合的能力，但是，当训练数据受到噪声影响时，模型可能会出现过拟合现象。
而ensemble method 可以解决这一问题，它可以增强模型的准确性，并减少过拟合的可能性。
Ensemble method的基本原理是使用多个模型来预测同一类事件。
然后，根据分类算法，将这些预测结果组合在一起，得出最终的结论。
模型的结果可以通过加权平均，投票机制等技术整合起来。
Ensemble method有很多常用的变体，以下是其中几种：1. Bagging（Bootstrap Aggregation）：Bagging即bootstrap aggregation，它是通过使用有放回的重采样（bootstrap sampling）的方法，从训练集中取出不同的样本，从而构建多个较弱的模型，再将模型结果进行综合，以提高预测精度。
2. Boosting：Boosting是一种迭代算法，它与bagging不同，它通过调整每个模型对训练集的重点，来提高模型的准确性。
在boosting算法中，每个新提出的模型的权重取决于其前一个模型的准确性，这样系统就可以持续改进模型，从而产生一个更强大的模型。
3. Stacking：Stacking是一种将多个模型结果进行堆叠的技术。
它首先使用多个较弱的模型对训练数据进行建模，然后使用第二层模型使用上一层模型的结果来构建预测结果。
THOMSON REUTERS EndNote 说明书
生物信息学实验指导 实验二 Ensemble 使用
实验二Ensemble 使用1.1在Ensemble页面All genomes的下拉菜单中选择human，查看这个物种的具体信息，人的染色体和基因数量如图所示，基因数量主要看Alternative sequence 的图示。
genetic variation有Short Variants （329,179,721）和Structural variants （5,955,877）。
1.2 在Ensemble 首页进行human for MAPK4搜索，在结果页面追加Restrict category to 为gene，筛选到117条序列，打开登录号为ENSG00000141639的目标序列，查看Gene-based displays。
1.2.1这个基因有6个可变剪接，他们之间序列长度不同，其中4个可以编码蛋白，所编码蛋白的氨基酸数量也不同。
1.2.2 在Comparative Genomics项Genomic alignments中，选择multiple，然后选择27种amniota vertebrates Pecan进行比对，在configure this page中勾选Showconservation regions，在Alignments (text)部分，可以看到蓝色高亮显示的保守区域了。
1.2.3 MAPK4基因位于Chromosome 18: 50,560,078-50,731,824。
有10个外显子，9内含子。
从sequence项可以看到core exons的数量，从基因结构图示也可以看到内含子和外显子的数量。
1.2.4 MAPK4 属于PTHR24055_SF25(2 genes)蛋白家族。
家族其他成员还有MAPK4-001，MAPK4-002，MAPK4-003，MAPK4-005。
1.2.5从GO注释中，我们了解到MAPK4基因可编码蛋白的四个转录本，分别在分子功能、生物学进程和细胞组分方面的信息。
nosql数据库的base原则
nosql数据库的base原则NoSQL数据库的BASE原则NoSQL数据库是一种非关系型数据库，其设计和数据处理原则与传统的关系型数据库有所不同。
在NoSQL数据库中，BASE原则被广泛应用，以保证系统的可用性和性能。
本文将介绍NoSQL数据库的BASE原则以及其对数据库设计和数据处理的影响。
BASE是指基本可用（Basically Available）、软状态（Soft state）和最终一致性（Eventual consistency）。
相对于传统的ACID（原子性、一致性、隔离性和持久性）原则，BASE原则在可用性和性能方面提供了更大的灵活性。
基本可用性是指系统在出现故障或异常情况下仍然能够提供基本的服务。
在NoSQL数据库中，为了实现基本可用性，通常会采用分布式架构和数据冗余的方式。
分布式架构将数据分布在不同的节点上，当某个节点出现故障时，系统可以自动切换到其他可用的节点，保证服务的连续性。
数据冗余则是通过将数据复制到多个节点上，以提高系统的可靠性和容错性。
软状态是指系统中的数据在不同的时间点可能处于不同的状态。
与ACID原则中的一致性要求相比，软状态允许数据在一段时间内处于不一致的状态。
在NoSQL数据库中，为了实现软状态，通常采用异步复制和延迟更新的方式。
异步复制将数据的复制操作延迟到后台进行，不会阻塞用户的读写操作，从而提高系统的性能。
延迟更新则是指系统会在适当的时间点将数据进行同步，以保证数据的一致性。
最终一致性是指系统中的数据最终会达到一致的状态，但在某个时间段内可能存在不一致的情况。
与ACID原则中的强一致性要求相比，最终一致性放宽了数据的一致性要求，从而提高了系统的性能和可扩展性。
在NoSQL数据库中，最终一致性通常通过版本控制、向量时钟等技术来实现。
版本控制可以记录数据的变更历史，从而保证数据的一致性。
向量时钟则可以解决分布式系统中数据的并发访问问题，保证数据的一致性。
光盘阅览室数据库简介
地址：上海市北京西路 1320 号(200040)
电话：021-62897078 联系人：郭文
上海医药工业研究院信息中心
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上海数图健康医药科技有限公司
技术数据包括：沸点、堆密度、可压性、吸湿性、流动性、熔点、含水量、粒度分布、 流变学特性表面积和溶解度等 大多数辅料均列出供应商网址
Medline(美国医学文摘) 美国国家医学图书馆出版 1965 年创立 收录了世界上 70 个国家出版的 3800 余种专业杂志和专著中的 800 余万条信息，全部档 案 75%为英文文献 信息内容包括：重大发现、研究开发、临床实践、行政管理、政策颁布等
Inpharma Database(药物数据库) 由 Adis International Ltd 出版 综合性药品信息全文数据库 信息来源于 2000 多种重要的国际性医学和生物医学杂志，重要的国际会议和公司社团 的报告 内容包括药物处方及用药趋势、新药开发、临床重要不良反应报道、医疗保健政策、药 品经济学、药品法规、处方问题等 其相应的出版物为《Inpharma Weekly》 每年增补 5000 条信息，每季度增补更新一次
上海数图健康医药科技有限公司
Pharmaprojects(药物研发数据库) 由英国 PJB 公司出版 记录全球 26000 个开发中的药物，3000 家企业信息，每月 1000 余条药物更新 218 个疾病治疗领域 有 41 个可检信息项和视窗功能，如从药品、公司、结构、治疗类别等 用于跟踪国际上新药开发动态，寻找市场合作开发伙伴、分析市场收益
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Merck Index(默克索引) 由 Chapman and Hall 出版 收集了 1000 余种化合物，其中包括药物化合物、常见有机化合物、试剂、天然产物、 元素、无机化合物、农用化合物等 对每种化合物都有其命名、分子式、分子量、化学文摘、登记号、结构、性质等
使用 Ensemble 实现企业实时业务监控制.
使用Ensemble实现企业实时业务监控制概况业务活动监控(BAM)通过探测企业系统内部事件增加了业务情报，并且筛选感兴趣的信息，把他们在计算机屏幕上以可视化的仪表板的形式展示出来。
Ensemble提供了高级的业务活动监控方案，为应用集成、复合应用和开发、数据协作和业务流程/工作流管理在顶部建立了一个全面和极快速的平台。
成功的业务集成方案是由元数据驱动的，这是Ensemble的设计规则。
元数据定义体现和带动所有的集成元素,包括数据、服务和业务过程，也就是说消息和数据流是推动系统的神经。
因此，Ensemble把数据管理为中心的方法引入了集成。
该方法用单一的、共享的元数据仓库和在Ensemble核心架构中的超级可伸缩的消息仓库实现。
它的数据管理能力和数据为中心的方法，结合强大的面向服务的架构，使数据可以被任何需要的应用使用。
Ensemble的业务活动监控能力使用所有这些特性来使之能够快速构建高级和全面的BAM方案集。
这要感谢它独特的技术融合，Ensemble开发广泛的企业业务数据源，提供把业务数据转换成业务情报的工具，支持老练的分析家发现趋势和异常，能够对特定的条件作出响应。
InterSystems证实这些技术创新使这些能力能够以最高级别的可靠性和可扩展性实时地运作。
1 介绍业务活动监控的目标是提供当企业的业务环境发生变化时能够及时了解业务事件的能力，这样就能做出及时的决定。
通过提供实时的信息，BAM方案可以减少成本和加速执行事务。
Ensemble的业务活动监控能力依靠它的技术基础。
这包括了：全面的集成和开发– 一个支持复合应用、自定义适配器和业务过程协奏的快速开发和集成的环境通用的服务架构– 一个能高级和唯一的抽象技术，它能够为了快速访问应用程序和数据把不同的编程模型和数据格式用一致和高效的方法表示出来持久化对象引擎– 一个高性能的、高可靠性的分布式的数据库，消息仓库，元数据仓库，提供了对消息和事件极快的恢复和处理能力可定制的管理环境– 一个用消息引擎和仓库以及业务过程管理和开发工具紧密集成的全面的可裁减和可扩展的监控和管理工具Ensemble的技术对BAM方案主要有3个好处。
国外上市药品说明书查询
国外上市药品说明书查询在实际工作中,有时候需要查询国外上市药品的说明书做参考,比如适应症.用法用量等,或者是药政部门要求提供国外的药品说明书,我总结了自己近一段时间查询说明书的感想和遇到的困难,在这里抛砖引玉,希望大家来谈谈自己的体会.提供给一些有需要或者刚入手的朋友们。
美国FDA批准上市的药品:1.CDER的drug@FDA是首选,权威且方便快捷,输入通用名或是商品名或日期,点击后就进入药品信息的网页,可查看药品的批准历史.治疗等效性的信息,当然最有价值的还是说明书信息(label information)（实践证明，有些药品，特别是ANDA的药，无说明书；仅部分NDA 药品可查到）2.也可以选择直接登陆/dailymed/about.cfm,可查询FDA批准的处方药说明书（美国国立医学图书馆提供的公共服务的网站，用于向健康信息提供者和广大市民提供一个标准，全面，最新，查找和下载资源的药品标签和药品包装的网站）(推荐指数★★★★★)3.rxlist几乎可查询所有处方药,除说明书以外,还包括其它的特色,比如Top300,网上商店等等,这里就不一一赘述了,有兴趣上去转转,一定会有收获.欧洲上市批准的药品1.登陆emea的官方网站（http://www.emea.europa.eu/）,进入human medicines的A-Z list （A-Z Listing of EPARs，EPARs：The European Public Assessment Report ）,然后按字母顺序查找（字母顺序以英文商品名为关键词）,包括品种综述和公开评价报告,后者主要包括摘要.病人信息.说明书等,但美中不足的是A-Z list只提供近两年欧盟批准的药品信息,更早的信息在什么地方查询还不知道,希望大家指点!（正规的PDF版本的SPC，包装标签）(推荐指数★★★)2.EMC:/（电子医药汇编，英国上市药品信息）更多的药品信息综述,在emea网站上没有找到的可以上这里试试3./mrindex/index.htmlThis Product Index includes medicines approved in the Member States of the European Union according to the procedure for Mutual Recognition 通过欧盟各成员的互认程序后批准的药品索引,网页左下方的quicksearch中输入药品名快速查询,也可以点击find product 后进行高级搜索,选择Rms(Reference Member State),或是cms(Concerned Member States ),next后进入下一个界面选择限定条件进一步搜索.4.emea 06/12/2006 已经发布了其药品数据库EudraPharm ,支持产品名或活性成分搜索. ( Find products by searching product information such as product name or ingredient.) The database can be accessed at: www.eudrapharm.eu日本上市药品存在语言障碍,但有的药品只在日本上市.所以也可作为备选方法.pmda.go.jp/进入首页后,点击右边的添付文書情報,在点击医療用医薬品の添付文書情報（検索ページ）就进入说明书检索页了（操作简单，方便，需要另行翻译，推荐指数★★★）日本制药工业协会http://www.jpma.or.jp/english/index.html（英文版，未找到药品说明书）其它:1.上生产商的网站上去找,一般大的公司会把自家产品的说明书放在网站上,而且是最新版的（推荐指数★★★★）2.google搜索,对于搜索google可以化腐朽为神奇。
ensemble安装说明
一、Ensemble安装步骤1、安装Ensmble之前必须先安装IIS。
IIS在控制面板->添加或删除程序->添加/删除Windows组件->Internet信息服务(IIS)添加；2、Ensemble安装步骤总共十二步，每一步都配有图例；双击Setup，首先进行安装文件解压第一步：第二步：第三步：选择Custom第四步：全部选项都选中第五步：选择默认方式第六步：第七步：选择“否”第八步：第九步：选择“是”第十步：第十一步：第十二步：二、Cpf、Key存放路径1、拷贝Cache.cpf到EnsembleSys根目录下，cpf中主要配置数据库存放路径，根据事情情况可以自己修改cpf文件，或者在System management Portal->Local Databases->Home->Configuration->Local Databases->Edit;2、拷贝Cache.key到EnsembleSys\Mgr根目录下；3、如果是作为服务器，连接Terminate,[Home] > [Security Management] > [Services]%Service_T elnet，Service enabled:Y三、Cache.cpf修改Cache.cpf修改图例四、CSP的配置CSP配置:1、设置路径：[Home] > [Security Management] > [CSPApplications] > [Create NEW CSP Application]>[Save]；2、Csp Application路径为IE访问路径3、Resource required to run the application: %Service CSP;4 、Namespace:DHC-APP;5、CachePhysicalPath:“数据库存放路径”:\trakcare\app\trak\web\6、Default Superclass: locale.ChineseCSP 配置图例:1.访问路径2.%Service CSP3.DHC-APP4.物理路径5.locale.Chinese（不装）CSP Gateway Management的设置设置路径[Home] > [Configuration] >[CSP Gateway Management]Server Access（一般安装数据库后自动生成）Application Access （需要添加一个）IE访问的地址物理路径位置数据库服务器连接设置五、IIS中虚拟目录设置操作路径：控制面板->管理工具->Internet 信息服务->(本地计算机->网站->默认网站) 。
bookkeeper详解
bookkeeper详解Apache BookKeeper 简介Apache BookKeeper 是一个分布式事务日志服务，专为写入密集型和高吞吐量的应用程序而设计。
它是一个基于 ZooKeeper 的协调分布式日志存储，提供持久性、可靠性和高可用性。
架构BookKeeper 集群由以下组件组成：Bookie：存储日志条目的服务器。
BookKeeper 客户机：与 BookKeeper 服务交互的应用程序。
Ensemble 管理器：管理 BookKeeper 集群的元数据和配置。
ZooKeeper：一种协调服务，用于保持集群状态和元数据。
写入过程写入 BookKeeper 的过程如下：1. 客户机向 ensemble 管理器请求创建新的日志，称为Ledger。
2. Ensemble 管理器将 Ledger 分片到多个 Bookie 上，并分配写入副本和读副本。
3. 客户机向 Bookie 发送写入请求，并等待足够数量的副本确认写入。
读取过程读取 BookKeeper 的过程如下：1. 客户机向 ensemble 管理器查询 Ledger 的元数据。
2. 客户机从副本之一读取数据，并验证数据完整性。
特性BookKeeper 具有以下关键特性：持久性：日志条目一旦写入就永远存在。
可靠性：通过副本机制确保数据的高可用性。
可扩展性：可以轻松地添加和删除 Bookie 以扩展集群。
高吞吐量：优化处理高并发写入。
低延迟：采用异步写入和并发读取来减少延迟。
易用性：提供简单易用的 API。
应用场景BookKeeper 广泛用于以下场景：分布式事务日志：记录事务日志，以实现高可用性和容错性。
流处理：处理大量实时数据流。
时间序列数据库：存储和管理大量时间序列数据。
消息队列：作为消息队列的持久性后端。
分布式锁：实现分布式环境中的锁协调。
与 Apache Kafka 的比较BookKeeper 和 Apache Kafka 都是分布式日志服务，但它们有不同的设计目的和功能。
如何给平末端产物加A如何查找一个基因的启动子序列
如何查找一个基因的启动子序列[BCL-2为例]定义：启动子是参与特定基因转录及其调控的DNA序列。
包含核心启动子区域和调控区域。
核心启动子区域产生基础水平的转录，调控区域能够对不同的环境条件作出应答，对基因的表达水平做出相应的调节。
区域：启动子的范围非常大，可以包含转录起始位点上游2000bp，有些特定基因的转录区内部也存在着转录因子的结合位点，因此也属于启动子范围。
下面以BCL-2基因为例，查找查找该基因的启动子区域，首先要找到该基因的基因组序列。
去NCBI吧，在Search的下拉菜单里找到Gene，在检索项里输入Bcl-2，检索第一项就是bcl-2 for human，点进去看看啥样。
首先你可以看到该基因的参考序列（reference sequence）,然后看到bcl-2的位置和基因组背景。
bcl-2上游是PHLPP，下游是FVT1基因。
在这个长长的网页的最后是已经注册的Bcl-2基因的信息。
看到基因组序列了么，点进去，根据序列信息自己就能定位转录起始位点，上游就是promoter了，简单吧。
不！我觉得麻烦。
有更简单的方法么？有！注意到在网页的开头有这么个链接么？HGNC：990 点进去，看看吧。
原来是BCL-2的symbol report，各种各样的连接。
注意到左下角的Ensembl GeneView 了么，很有用的，点击。
呵呵，原来到了Ensemble了，是Ensemble的report。
列出了一堆令人兴奋的信息，太全了，只要是和这个基因相关的信息都能找到，包括SNP，Isoforms，等等等。
我们感兴趣的是，这个连接“View genomic sequence for this gene with exons highlighted”。
点击，看看，原来是bcl-2的基因组结构，红底色碱基是exon，绿底色碱基是SNP，太牛了。
别光高兴，忘了找promoter，默认的这个report只是显示bcl-2，上游600bp，下游600bp。
基因家族生信分析
基因家族生信分析一、什么是基因家族概念：是来源于同一个祖先，有一个基因通过基因重复而产生两个或更多的拷贝而构成的一组基因，他们在结构和功能上具有明显的相似性，编码相似的蛋白质产物。
划分：按功能划分：把一些功能类似的基因聚类，形成一个家族。
按照序列相似程度划分:一般将同源的基因放在一起认为是一个家族。
1.常见基因家族：WRKY基因家族：是植物前十大蛋白质基因家族之一，大量研究表明，WRKY 基因家族的许多成员参与调控植物的生长发育，形态建成与抗病虫。
NBS-LRR抗病基因家族：是植物中最大类抗病基因家族之一。
MADS-BOX基因家族：是植物体内的重要转录因子，它们广泛地调控着植物的生长、发育和生殖等过程。
在植物中参与花器官的发育，开花时间的调节，在果实，根，茎，叶的发育中都起着重要的作用。
热激蛋白70家族（HSP70）是一类在植物中高度保守的分子伴侣蛋白，在细胞中协助蛋白质正确折叠。
二、基因家族分析流程：●利用蛋白保守域结构提取号在Pfam数据库提取其隐马尔科夫模型矩阵文件（*.hmm）●在数据库（Ensemble 、JGI、NVBI）下载你所需要的物种的基因组数据（*.fa,*.gff）●在虚拟机中Bio-Linux中的hummsearch程序，用隐马尔科夫模型矩阵文件在蛋白序列文件中搜索含有该保守结构域的蛋白●将蛋白序列导入MEGA软件构建进化树（可以阐明成员之间系统进化关系，从进化关系上揭示其多样性）●利用MEME搜索蛋白质的保守结构域利用MEME搜索基因家族成员的motif可以揭示基因家族在物种内的多样化及其功能，如果他们都含有相同的motif表明其功能具有相似性，如果部分家族成员含有其他不同的motif,很可能这些成员有其他特异功能，或者可以归分为一个亚族●绘制基因染色体位置图从*.gff文件中抽取我们搜索到的基因位置信息，_v2.0/在线绘制基因染色体位置图通过染色体位置分布，可以了解基因主要分布字哪条染色体上，及是否能形成基因簇（被认为是通过重组与错配促进基因交流）●基因结构分析从gff文件中抽取基因的结构信息，绘制转录本结构图。
天津市组织机构代码管理信息系统
Using software engineering, this paper discusses in depth from the functional and system requirements analysis, to detailed design, implementation, and then to the management and employment of system engineering. It has designed a set of code certification management, query statistics, data quality management, electronic records management and other functions in one integrated information management system for staffs who manages organization code. This paper also provides a running basis for the scientific management and standardization of organization code.
或撰写过的研究成果，也不包含为获得 天津大学 或其他教育机构的学位或证
书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中 作了明确的说明并表示了谢意。
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本学位论文作者完全了解 天津大学 有关保留、使用学位论文的规定。 特授权 天津大学 可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检
组织机构代码已经成为连接政府各职能部门之间的信息管理系统的桥梁和 不可替代的信息传输纽带。组织机构代码号作为各个部门业务管理系统的有效检 索信息，牢固地嵌入到了各个部门的信息系统，为今后大数据整合和部门间信息 互联互通奠定了基础。
constraint foreign key references用法
constraint foreign key references用法摘要：1.介绍constraint 和foreign key 的概念2.解释references 的作用3.详述constraint foreign key references 的用法4.分析在实际数据库设计中的应用场景5.总结constraint foreign key references 的重要性正文：在数据库设计中，constraint 和foreign key 是两个非常关键的概念。
constraint 用于限制表中数据的添加、修改和删除操作，以保证数据的完整性和一致性。
而foreign key 则是一种用于建立表与表之间关联的字段，它可以引用同一数据库中其他表的主键。
当这两个概念结合在一起，就形成了constraint foreign key references，它能够帮助我们更好地管理数据库中的数据。
references 的作用主要体现在对foreign key 的限制上。
在数据库设计中，为了保证数据的完整性，我们通常需要对foreign key 设置一些约束条件，比如外键必须引用已存在的主键，或者外键不能为空等。
通过使用references，我们可以很方便地为foreign key 添加这些约束。
constraint foreign key references 的用法主要包括以下几个方面：首先，我们需要为要添加约束的列添加一个constraint。
例如，我们有一个名为“orders”的表，其中有一个名为“customer_id”的列，它用于引用“customers”表的主键。
我们可以通过以下SQL 语句为这个列添加一个名为“fk_customer_id”的constraint：```sqlALTER TABLE ordersADD CONSTRAINT fk_customer_idFOREIGN KEY (customer_id)REFERENCES customers(id);```这里，“fk_customer_id”是constraint 的名称，“customer_id”是要添加约束的列名，而“customers(id)”则是引用的主键表和主键列。
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引用ensemble数据库
Ensemble数据库概述
Ensemble数据库是一个综合性数据库，包含人类基因组和变异
的详细注解。
它整合了来自不同来源的广泛数据，包括基因组序列、转录组数据、表观遗传信息和蛋白-蛋白相互作用。
访问Ensemble数据库
Ensemble数据库可以通过其官方网站或使用编程接口（API）
进行访问。
网站提供了一个用户友好的界面，用户可以搜索基因、
变异或其他基因组特征。
API允许用户自动从数据库中提取和分析
数据。
Ensemble数据库的主要特征
Ensemble数据库的主要特征包括：
全面的基因组信息：包含全面的基因组序列、转录组数据和表
观遗传信息。
深入的变异注解：提供了对人类基因组中所有已知变异的广泛注解，包括功能后果预测和临床意义。
进化保守性分析：评估基因和调控区域在不同物种中的进化保守性，提供对基因功能的见解。
蛋白质相互作用数据：包含来自不同来源的大量蛋白-蛋白相互作用数据，揭示了蛋白质网络和途径。
用户友好的界面：提供了一个直观的界面，允许用户轻松浏览和检索数据。
Ensemble数据库的应用
Ensemble数据库已广泛应用于基因组研究和生物医学领域，包括：
基因组变异分析：识别和表征疾病相关的变异，预测其功能后果。
基因功能研究：研究基因的表达模式、调控机制和与其他基因
的相互作用。
药物发现：确定疾病的潜在靶点和开发治疗性干预措施。
进化研究：了解基因组进化、物种分化和适应性。
教育和培训：作为基因组学和生物信息学部门学生的宝贵资源。
Ensemble数据库的更新和改进
Ensemble数据库是一个不断更新和发展的资源。
定期发布新版
本以纳入来自新实验和研究的新数据和见解。
最近的改进包括：
更全面的基因组序列：纳入了新组装的人类基因组序列，提供
了基因组结构的更准确表示。
增强的变异注解：改进了变异的预测和临床意义注解，提供了
更全面的功能影响。
更多蛋白质相互作用数据：整合了来自更大范围来源的蛋白质
相互作用数据，改进了对蛋白质网络和途径的理解。
改进的用户界面：增强了网站的功能和易用性，使用户能够更轻松地浏览和检索数据。
结论
Ensemble数据库是一个强大的资源，为基因组研究和生物医学研究提供了丰富的基因组信息和见解。
其全面的数据、先进的注解和用户友好的界面使其成为基因组学家、生物信息学家和其他生物医学研究人员必不可少的工具。
随着数据库的不断更新和改进，它将继续为这一充满活力的领域做出宝贵的贡献。