gamit的安装步骤

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2008年10月22日,Gamit 10.34版发布了最新的修改补丁。修改后,新版本包含如下目录及文件:/incremental_updates

com.10.34.tar.Z

etopo5.grd.10.0.tar

example.10.34.tar.Z

gamit.10.34.tar.Z

help.10.34.tar.Z

incremental_updates.081022.tar.Z

kf.10.34.tar.Z

libraries.10.34.tar.Z

maps.10.1.tar.Z

tables.10.34.tar.Z

install_software

install_updates

relnote.10.21

relnote.10.34

下载后立即安装软件于ubuntu8.04 linux桌面操作系统。安装比较简单,只需要输入几个命令,并修改一个参数即可。

Gamit安装需要csh(tcsh)环境、GNU gfortran 4.2编译器和libx11-dev库支持。gfortran是软件推荐使用的编译器。libx11-dev是X11的程序开发库,它提供的lib.h和libx11.a(libx11.so)是Gamit 安装必须用到的两个库文件,主要是为Globk的提供图形库支持。以上三个条件却一不可。

ubuntu系统没有csh,默认为bash。因此要先安装csh。

ubuntu系统自带了gcc4.2,但是却没有安装gfortran编译器。而你安装时安装程序会调用默认的gfortran编译器,除非你指定gcc为你的编译器。

首先,以root身份登录,打开终端,输入

apt-get install csh

系统自动下载并安装csh,安装完成后在终端输入

chsh

提示

正在更改root 的SHELL

请输入新值,或直接敲回车键以使用默认值

登录Shell [/bin/bash]:

输入

/bin/csh

修改bash为csh。重新起动ubuntu,并以root身份登录,打开终端,输入

# echo $SHELL

返回s“/bin/csh”,说明SHELL修改成功。

接着输入

apt-get install gfortran

系统自动下载并安装gfortran。

在输入

apt-get install libx11-dev

系统自动下载并安装libx11-dev库支持。

至此,准备工作完成,开始正是安装Gamit10.34。安装文件大部分为.tar.Z格式压缩文件,但是你不需要解压缩这些文件,因为安装程序install_software会自动为你完成这一步骤。

首先,在/opt目录下建立gamit10.34目录作为软件的安装目录,因为/opt目录一般用来存放软件。当然,你也可以选择其他目录。将下载的文件全部复制到/opt/gamit10.34/目录下。打开终端,输入

cd /opt/gamit10.34

进入安装目录,输入

./install_software

安装程序install_software启动,搜索安装目录/opt/gamit10.34下的全部压缩文件,提示

GAMIT and GLOBK to be installed into /opt/gamit10.34

If you need help with command line options type CTL_C now and type

install_software -help on the command line

The compressed tarfiles will be removed after extraction of the

directories, but except for that, the script may be stopped and

rerun safely from any point. Tarfiles to be uncompressed:

com.10.34.tar.Z etopo5.grd.10.0.tar example.10.34.tar.Z gamit.10.34.tar.Z help.10.34.tar.Z kf.10.34.tar.Z libraries.10.34.tar.Z maps.10.1.tar.Z tables.10.34.tar.Z

Continue ? (y/n)

输入字母“y”,开始解压缩安装文件,

.. uncompressing and extracting the directories:

Do you want to apply incremental updates: incremental_updates.080812.tar.Z

incremental_updates.080919.tar.Z incremental_updates.081022.tar.Z

Continue ? (y/n)

输入字母“y”,开始解压缩安装文件,

.. applying incremental updates:

.. adding /opt/gamit10.34/com to your search path to continue installation

To execute GAMIT and GLOBK you will need to set your login path to

include /opt/gamit10.34/com /opt/gamit10.34/gamit/bin /opt/gamit10.34/kf/bin

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