蛋白质翻译练习题
蛋白质组学蛋白质组学试卷(练习题库)(2023版)
蛋白质组学蛋白质组学试卷(练习题库)1、自由流电泳分离蛋白质的机理及其优缺点。
2、质谱仪的组成及其主要技术指标。
3、蛋白质组学定量分析方法的主要原理。
4、请列举预测蛋白质相互作用的方法。
5、系统生物学研究的主要流程是什么？6、试述如何应用2D-PAGE进行差异蛋白质组学的研究，并分析其优缺点。
7、 Proteome（蛋白质组）8、 Proteomics（蛋白质组学）9、 Mass Spectrometer（质谱仪）10、 Post translational modification(蛋白质翻译后修饰)11、 De novo sequencing(从头测序)12、 Tandem mass spectrometry(串联质谱)13、 Peptide mass fingerprint(肽指纹谱)14、 Peptide sequence tag 肽序列标签15、 Post-source decay(源后衰变)16、 Neutral loss scan 中性丢失扫描17、 Matrix-assisted laser desorption/ionization基质辅助激光解18、论述蛋白质组学与基因组学的区别和联系。
19、简述与传统的分离技术相比较，PF-2D的优点。
20、多反应监测的英文缩写？（）21、下列哪一个不是质谱的离子化模式？（）22、质谱分析是根据（）对样品进行分析。
23、质谱仪的构造包括（）。
24、以下不属于质量分析器的是（）。
25、分辨率指，当两个质谱峰的峰高相等，而其谷高相当于峰高的（），这两个峰可以分开。
26、以下哪个质量分析器的检测上限最高（）。
27、电子轰击电离主要用于检测（）。
28、电喷雾电离源主要用于检测（）。
29、 MALDI的中文意思是指（）。
30、质谱仪的进样系统包括（）。
31、 MALDI是用于（）的离子化方法。
32、飞行时间质量分析器是利用具有相同能量的带电荷粒子，由于（）的差异而具有不同的速度，通过相同的漂移距离33、要想得到较多的碎片离子，应采用下面哪种离子源（）。
蛋白质考题及答案解析
蛋白质结构与功能试题一、问答题：1.影响蛋白质二级结构改变的因素有哪些？参考答案：温度；pH；邻近氨基酸残基的二级结构倾向；肽链中远程肽段的影响；肽段是处于分子表面还是被包埋在分子内部2.如下图所示。
多聚谷氨酸poly (Glu) 是由多个L-Glu聚合形成的多肽链，在pH为3的溶液中能形成a-螺旋构象，当pH升高到7时，则由a-螺旋变为无规卷曲，旋光率陡然下降。
同样，多聚赖氨酸poly (Lys) 在pH为10的溶液中具有a-螺旋结构，当pH降低至7时，旋光率也发生陡然下降，由a-螺旋结构变为无规卷曲。
请解释pH对poly (Glu) 和poly (Lys) 构象变化的影响。
答案要点：pH=3接近Glu g-COOH的p K R (4.07)，侧链基团为质子化不带电荷状态，可形成a-螺旋结构。
其余情况按此思路分析。
Lys e-NH2 p K R 为10.54。
3.胶原蛋白的结构特点（原胶原分子的一级结构和高级结构）1)在体内，胶原蛋白以胶原纤维的形式存在，胶原纤维的基本结构单位是原胶原分子2)每个原胶原分子由三条左手螺旋的a链（a-肽链）组成右手超螺旋结构，每条a链约含1000个氨基酸残基3)a链间靠H-键和范得华力维系，胶原纤维可以通过分子内和分子间的进一步交联增强稳定性4)a链一级结构序列96%遵守(Gly-X-Y)n。
x多为脯氨酸Pro；y多为羟基脯氨酸Hyp或羟基赖氨酸Hly5)胶原蛋白是糖蛋白，少量糖与5-羟赖氨酸(Hyl)残基的碳羟基共价连接6)具有较好的弹性和抗张强度4.形成结构域的意义是什么？参考答案：1)各结构域分别折叠，其动力学上更有利2)结构域自身紧密装配，结构域之间的柔性连接使每个结构域间可以作较大幅度的相对运动3)多个结构域形成的间隙部位往往是蛋白质的功能部位，结构域的相互作用有利于蛋白质分子产生别构效应5.简述三种浓缩蛋白质溶液的方法及原理1)超滤法：将蛋白质样品装入适当的超滤管中，经一定时间离心，溶剂穿过超滤管滤膜流出而使蛋白质溶液得以浓缩2)硫酸铵沉淀法：通过盐析作用使蛋白质在高浓度中性盐中析出而浓缩。
第四章蛋白质翻译习题
一、选择题【单选题】1．下列氨基酸活化的叙述哪项是错误的A．活化的部位是氨基酸的α-羧基B．活化的部位是氨基酸的α-氨基C．活化后的形式是氨基酰-tRNA D．活化的酶是氨基酰-tRNA合成酶E．氨基酰tRNA既是活化形式又是运输形式2．氨基酰tRNA的3’末端腺苷酸与氨基酸相连的基团是A．1’-OH B．2’-磷酸C．2’-OH D．3’-OH E．3’-磷酸3．哺乳动物的分泌蛋白在合成时含有的序列是A．N末端具有亲水信号肽段[B．在C末端具有聚腺苷酸末端C．N末端具有疏水信号肽段D．N末端具有“帽结构”E．C末端具有疏水信号肽段4．氨基酸是通过下列哪种化学键与tRNA结合的A．糖苷键B．磷酸酯键C．氢键D．酯键E．酰胺键5．代表氨基酸的密码子是A．UGA B．UAG C．UAA D．UGG E．UGA和UAG6．蛋白质生物合成中多肽链的氨基酸排列顺序取决于A．相应tRNA专一性；B．相应氨基酰tRNA合成酶的专一性C．相应mRNA中核苷酸排列顺序D．相应tRNA上的反密码子E．相应rRNA的专一性7．与mRNA中密码5’ACG3’相对应的tRNA反密码子是A．5’UGC3’B．5’TGC3’C．5’GCA3’D．5’CGT3’E．5’CGU3’8．不参与肽链延长的因素是A．mRNA B．水解酶C．转肽酶D．GTP E．Mg2+ 9．能出现在蛋白质分子中的下列氨基酸哪一种没有遗传密码A．色氨酸B．甲硫氨酸C．羟脯氨酸D．谷氨酰胺E．组氨酸(10．多肽链的延长与下列何种物质无关A．转肽酶B．甲酰甲硫氨酰-tRNA C．GTP D．mRNA E．EFTu、EFTs和EFG 11．下述原核生物蛋白质生物合成特点错误的是A．原核生物的翻译与转录偶联进行，边转录、边翻译、边降解(从5’端)B．各种RNA中mRNA半寿期最短C．起始阶段需ATPD．有三种释放因子分别起作用E．合成场所为70S核糖体12．可引起合成中的肽链过早脱落的是A．氯霉素B．链霉素C．嘌呤霉素D．四环素E．放线菌酮<13．肽键形成部位是A．核糖体大亚基P位B．核糖体大亚基A位C．两者都是D．两者都不是E．核糖体大亚基E位14．关于核糖体叙述正确的是A．多核糖体在一条mRNA上串珠样排列B．多核糖体在一条DNA上串珠样排列C．由多个核糖体大小亚基聚合而成D．在转录过程中出现E．在复制过程中出现15．翻译过程中哪个过程不消耗GTP？A．起始因子的释放B．进位C．转肽D．移位E．肽链的释放16．下列哪一种过程需要信号肽A．多核糖体的合成B．核糖体与内质网附着C．核糖体与mRNA附着D．分泌性蛋白质合成E．线粒体蛋白质的合成17．哺乳动物细胞中蛋白质合成的重要部位是A．核仁B．细胞核C．粗面内质网D．高尔基体E．溶酶体18．氨基酰-tRNA合成酶的特点是`A．存在于细胞核内B．只对氨基酸的识别有专一性C．只对tRNA的识别有专一性D．催化反应需GTP E．对氨基酸、tRNA的识别都有专一性19．蛋白质生物合成时转肽酶活性存在于A．EFTu B．EFG C．IF-3 D．核糖体大亚基E．核糖体小亚基20．下列关于原核生物蛋白质生物合成的描述哪一项是错误的A．起动阶段核糖体小亚基先与mRNA结合B．肽链延长阶段分为进位、转肽、移位三个步骤C．合成肽键需消耗GTPD．在A位上出现UAA以后转入终止阶段E．释放因子只有一种可识别3种终止密码子·21．在氨基酰-tRNA合成酶催化下，tRNA能与哪一种形式的氨基酸结合A．氨基酸-酶复合物B．自由的氨基酸C．氨基酰-ATP-酶复合物D．氨基酰-AMP-酶复合物E．氨基酰-ADP-酶复合物22．下列哪一项不适用于真核生物蛋白质生物合成的起始阶段A．mRNA在30S小亚基上准确就位B．起动作用需甲硫氨酰-tRNAC．起始因子有至少9种D．起始阶段消耗GTPE．起动复合物由大亚基、小亚基、mRNA与甲硫氨酰-tRNA组成23．蛋白质合成时肽链合成终止的原因是】A．已达到mRNA分子的尽头B．特异的tRNA识别终止密码子C．释放因子能识别终止密码子并进入A位D．终止密码子本身具酯酶作用，可水解肽酰基与tRNA之间的酯键E．终止密码子部位有较大阻力，核糖体无法沿mRNA移动24．下列关于蛋白质生物合成的描述错误的是A．氨基酸必须活化成活性氨基酸B．氨基酸的羧基端被活化C．活化的氨基酸被搬运到核糖体上D．体内所有的氨基酸都有相应的密码|E．tRNA的反密码子与mRNA上的密码子按碱基配对原则反向结合25．下列有关多肽链中羟脯氨酸和羟赖氨酸的生成，哪一项是正确的A．各有一种特定的遗传密码编码B．各有一种与之对应的反密码子C．各有一种tRNA携带D．是翻译过程中的中间产物E．是脯氨酸和赖氨酸修饰的产物26．为氨基酰-tRNA和核糖体A位结合所必需的是A．EFTu和EFTs B．IF-3 C．转肽酶D．EFT和EFG E．以上都不是27．一个mRNA的部分序列和密码子编号如下：^140 141 142 143 144 145 146……GAU CCU UGA GCG UAA UAU CGA……以此mRNA为模板，经翻译后生成多肽链含有的氨基酸数是A．140 B．141 C．142 D．143 E．14628．在大肠杆菌中初合成的各种多肽链N端第一个氨基酸是A．丝氨酸B．谷氨酸C．蛋氨酸D．N-甲酰蛋氨酸E．N-乙酰谷氨酸1．B 2．D 3．C 4．D 5．D 6．C 7．E 8．B 9．C 10．B 11．C 12．C 13．B 14．A 15．C 16．D 17．C 18．E 19．D 20．E 21．D 22．A 23．C 24．D 25．E 26．A 27．B 28．D部分习题解释5．D mRNA分子中共有64个密码，其中61个代表20种氨基酸，有一个起始密码－AUG（在蛋白质生物合成的起始阶段，即代表蛋白质合成的起始，也是蛋氨酸的密码），3个终止密码－UAA、UAG及UGA，所以答案A、B、C、E均为终止密码，只有答案D是代表氨基酸（色氨酸）的密码。
9. 蛋白质翻译(1)
摇摆的原因（摇摆假说）：
一般地，同义密码子的第１、２位是保守的，而第３位 则是可变的，意味着该可变位点的配对具有一定的灵活 性。
tRNA的反密码子在反密码环上呈弧状排列，与密码子 不能保持完全的平行排列；另外，反密码子的第1个核 苷酸位于非双链结构的松弛环内，摇摆的自由度较大， 从而导致密码子的第3位核苷酸和反密码子的第1位核苷 酸之间形成非标准的碱基配对。（反密码子的这个位点 称为摇摆位点） 如果tRNA的摇摆位点是被修饰的碱基，就可能出现更 多的选择配对关系。
上次讲解内容
一、顺式作用元件与反式作用因子（重点） 二、真核生物RNA的转录过程 三、真核生物RNA转录后加工（重点） 1. 5’加帽； 2. 3’加尾; 3. 选择性剪接; 4. RNA编辑 四、RNA编辑
碱基的突变
C变为U
ApoB 基因有 29 个外显子
CAA
第 2153 个密码子编码 Glu 编辑
T-loop（TψC环）
• 这个环中始终含有胸 腺嘧啶-假尿嘧啶-胞嘧 啶的序列。 • 它与核糖体大亚基的 5S rRNA结合，稳定 蛋白质的结构
D-loop (DHU环)
直接与氨基酰tRNA合成酶
结合，使氨基酸连接到 tRNA的受体位点上。
tRNA与氨基酰tRNA合成酶的结合
氨基酸连接到受体位点上的过程：
UAA
3’UTR
AAA
Open reading frame（开放阅读框）, ORF （3’非翻译区）
Stop codon(终止密码) UAG UGA UAA
开放阅读框（open reading frame, ORF）： mRNA中从起始密码子（AUG）到终止密 码子（UAA、UAG或UGA）的核酸序列， 它可以编码一条完整的多肽链。
第五章 基因表达2：蛋白质翻译 分子生物学习题
第五章基因表达2：蛋白质翻译名词解释：SD序列、无义突变和错义突变、EF-Tu、同义密码填空：1.可使每个氨基酸和它相对应的tRNA分子相偶联形成一个2.核糖体包括两个tRNA分子的结合位点：即P位点，紧密结合与多肽链延伸尾端相连接的tRNA分子；即A位点，结合带有一个氨基酸的tRNA 分子。
3.蛋白质合成的起始过程很复杂，包括一系列被催化的步骤4.tRNA的三叶草型结构中，其中氨基酸臂的功能是_________，反密码环的功能是___________。
5.核糖体沿着mRNA前进时，它需要另一个延伸因子，这一步需要的水解。
当核糖体遇到终止密码、、的时候，延伸作用结束，核糖体和新合成的多肽被释放出来。
翻译的最后一步被称为，并且需要一套因子。
6.tRNA的反密码子为GGC，它可识别的密码子为和7.遗传密码中第个碱基常很少或不带有遗传信息8.真核细胞多肽合成的起始氨基酸均为，而原核细胞的起始氨基酸应为。
9.蛋白质生物合成是从_____端到______端10.原核生物中的释放因子有三种，其中RF-1识别终止密码子_____________、____________；RF-2识别__________、____________；真核中的释放因子只有___________一种。
判断：1、因为AUG是蛋白质合成的起始密码子，所以甲硫氨酸只存在于蛋白质的N末端（）2、原核生物蛋白质合成的起始氨基酸为甲硫氨酸，真核生物蛋白质合成起始氨基酸为甲酰甲硫氨酸（）3、核糖体小亚基最基本功能是连接mRNA和tRNA大亚基则催化肽键的形成。
（）选择题：1、反密码子中哪个碱基参与了密码子的简并性（）A、第一个B、第二个C、第三个D、第一个与第二个E、第二个与第三个2、“同工tRNA”是指（）A、识别同义mRNA密码子（具有第三个碱基简并性）的多个tRNAB、识别相同密码子的多个tRNAC、代表相同氨基酸的多个tRNAD、由相同的氨酰tRNA合成酶识别的多个tRNA3、核糖体的E位点是（）A、真核mRNA加工位点B、tRNA离开原核生物核糖体的位点C、核糖体中受EcoR限制的位点D、电化学势驱动转运的位点4、蛋白质合成所需的能量来自（）A、ATPB、GTPC、ATP和GTPD、CTP5、mRNA的5’-ACG-3’密码子相应的反密码子是（）A、5′-UGC-3′B、5′-TGC-3′C、5′-CGU-3 ′D、5 ′ -CGT-3 ′6、在蛋白质合成过程中，下列哪些说法是正确的？（）A、氨基酸随机地连接到tRNA上去B、新生肽链从C一端开始合成C、通过核糖核蛋白体的收缩，mRNA不断移动D、合成的肽链通过一个tRNA与核糖核蛋白相连问答题：1、简述遗传密码的性质2、原核生物蛋白质合成的过程3、蛋白质前体加工包括哪些？有一个被认为是mRNA的核苷酸序列，长300个碱基，你怎样才能：1.证明此RNA是mRNA而不是tRNA或rRNA。
蛋白质翻译
如果错误的氨酰-tRNA进入核糖体的A位，那么由 于错误配对，其缔合能偏低，仅为正确配对的 1/3000，延伸因子会将错误进入的aa-tRNA清除。
原核生物：EF-Tu
真核生物：eEF-1
合，再结合mRNA。
（一）真核生物蛋白质翻译起始
（1）40S核糖体小亚基与起始因子eIF-1和eIF-3结 合，使核糖体大小亚基分离；
（2）形成eIF-2-Met-tRNAMet-GTP三联体复合物； 它们与40S小亚基（包括eIF-1和eIF-3）P位点结 合，形成43S前起始复合物。
（3）在帽子结合复合物起始因子eIF-4F的帮助下， 前起始复合物与mRNA的5’端结合，形成起始复 合物。 eIF-4F复合物包括： eIF-4E（结合到mRNA的5’帽 子结构上)、eIF-4A(解旋酶活性)和eIF-4G（连接 eIF-4E与eIF-3）。
原核生物：EF-T (EF-Tu, EF-Ts)和EF-G
1、AA-tRNA与核糖体A位点的结合
需要消耗GTP，并需EF-Tu、EF-Ts两种延伸因子来进 行能量的再利用。
能量的再生： EF-Tu-GDP+ EF-Ts
EF-Tu-Ts + GDP
EF-Tu-Ts + GTP EF-Tu-GTP + EF-Ts 重新参与下一轮循环
二、真核生物蛋白质翻译（起始） 三、保证蛋白质翻译准确起始的机制（翻译 保真性） 四、复习题
一、原核生物翻译的起始
1. 蛋白质合成装备的组装 2. 模板mRNA在核糖体上的准确定位 3. 起始氨基酸的插入
1. 氨基酸的活化
蛋白质翻译总结
氨基酸的活化a.起始信号（AUG-甲硫氨酸密码子）和缬氨酸（GUG）极少出现i.真核生物起始氨基酸—甲硫氨酸，原核生物-甲酰甲硫氨酸ii.SD序列：存在于原核生物起始密码子AUG上游7~12个核苷酸处的一种4~7个核苷酸的保守片段，与16srRNA3’端反向互补。
功能将mRNA的AUG起始密码子置于核糖体的适当位置以便起始翻译作用。
1)原核生物的SD序列：原核mRNA起始密码子上一段可与核糖体结合的序列。
30s小亚基首先与翻译因子IF-1（与30s结合）和IF-3（稳定小亚基，帮助其与mRNA结合位点的识别）结合，通过SD序列与mRNA模板相结合。
iii.真核生物依赖于结合5'帽，核糖体小亚基沿mRNA5'端帽子结构扫描到RBSiv.在IF2起始因子和GTP的帮助下，fMet-tRNA进入小亚基的P位，tRNA上的反密码子与mRNA密码子配对。
v.小亚基复合物与50s大亚基结合，GTP水解，释放翻译起始因子vi.翻译的起始b.后续氨基酸与核糖体的集合：第二个氨酰-tRNA与EF-Tu.GTP形成复合物，进入核糖体的A位，水解产生GDP并在EF-Ts的作用下释放GDP并使EF-Tu结合另一分子GTP形成新的循环。
i.肽键的生成：AA-tRNA占据A位，fMet-tRNA占据P位，在肽基转移酶的催化下，A位上的AA-tRNA转移到P位，P位上的起始tRNA转移至E位，与fMet-tRNA上的氨基酸生产肽键。
起始RNA随后离开。
ii.移位：核糖体通过EF-G介导的GTP水解所提供的能量向mRNA模板3'末端移动一个密码子，二肽基-tRNA完全进入P位点iii.肽链的延申c.当终止密码子UAA,UAG，UGA出现在核糖体的A位时，没有相应的AA-tRNA能与其结合，而释放因子能识别密码子并与之结合，水解P位上的多肽链与tRNA之间的二酯键，然后新生的肽链释放，核糖体大小亚基解体i.肽链的终止d.N端fMet或Met的切除i.二硫键的形成ii.特定氨基酸的修饰iii.新生肽段非功能片段的切除iv.蛋白质前体的加工e.无义突变：DNA序列中任何导致编码氨基酸的三联密码子突变转变为终止密码子UAA,UGA,UAG中的突变，使得蛋白质合成提前终止，合成无功能或无意义的多肽。
蛋白质翻译
A A U C U A U U A G A U A U C
tRNA离开，再去转运新的氨基酸
亮氨酸
天门冬 酰氨
异亮氨酸
C U A U A G U U A G A U A U C
亮氨酸
天门 冬氨酸
异亮氨酸
A U G C U A U U A G A U A U C
以mRNA为模板形成了有一定氨基酸顺序的蛋白质
遗传信息的翻译
核酸的语言
蛋白质的语言
遗传密码
密码子 密码子 密码子
U U A G A U A U C
mRNA（模板）
tRNA的三叶草结构
亮氨酸
A A U U U A G A
mRNA
密码子
遗传信息的翻译
场所： 翻译者： 模板： 条件
原料：
能量： 结果：
mRNA 与核糖体结合
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
核糖体
U U A G A U A U C
边解旋边转录
表达遗传信息，使生物表现出各种性状
tRNA 上的碱基与 mRNA上的密码子互补配对 .
亮氨酸
A A U U U A G A U A U C
核糖体随着 mRNA滑动.
另一个tRNA上的碱基与mRNA上的 密码子互补配对.
亮氨酸
天门冬 酰氨
A A U C U A U U A G A U A U C
两个氨基酸分子脱水缩合
亮氨酸
天门冬 酰氨
天门冬 酰氨
亮氨酸
异亮氨酸
U A G U U A G A U A U C
遗传信息的翻译
场所： 翻译者： 细胞质的核糖体上 转运RNA ( tRNA ) 模板： mRNA 条件
蛋白质翻译
蛋白质的生物合成⎯⎯翻译一切生命现象不能离开蛋白质，由于代谢更新，即使成人亦需不断合成蛋白质(约400g/日)。
蛋白质具有高度特异性。
不同生物，它们的蛋白质互不相同。
所以食物蛋白质不能为人体直接利用，需经消化、分解成氨基酸，吸收后方可用来合成人体蛋白质。
mRNA含有来自DNA的遗传信息，是合成蛋白质的“模板”，各种蛋白质就是以其相应的mRNA为“模板”，用各种氨基酸为原料合成的。
mRNA不同，所合成的蛋白质也就各异。
所以蛋白质生物合成的过程，贯穿了从DNA分子到蛋白质分子之间遗传信息的传递和体现的过程。
mRNA生成后，遗传信息由mRNA传递给新合成的蛋白质，即由核苷酸序列转换为蛋白质的氨基酸序列。
这一过程称为翻译（translation）。
翻译的基本原理见图14-1。
由图14-1可见，mRNA穿过核膜进入胞质后，多个核糖体（亦称核蛋白体，图中为四个）附着其上，形成多核糖体。
作为原料的各种氨基酸在其特异的搬运工具（tRNA）携带下，在多核糖体上以肽键互相结合，生成具有一定氨基酸序列的特定多肽链。
合成后从核糖体释下的多肽链，不一定具有生物学活性。
有的需经一定处理，有的需与其他成分（别的多肽链或糖、脂等）结合才能形成活性蛋白质。
第一节参与蛋白质生物合成的物质参与蛋白质合成的物质，除氨基酸外，还有mRNA（“模板”）、tRNA（“特异的搬运工具”）、核糖体（“装配机”）、有关的酶（氨基酰tRNA合成酶与某些蛋白质因子），以及ATP、GTP等供能物质与必要的无机离子等。
一、mRNA与遗传密码天然蛋白质有1010~1011种，组成蛋白质的氨基酸却只有20种。
这20种氨基1酸排列组合的不同，形成了形形色色的蛋白质。
蛋白质中氨基酸的序列如何决定？（一）三联体密码与密码的简并研究表明，密码子（codon）共有64个，每个密码子是由三个核苷酸（称为三联体，triplet）组成的。
有的氨基酸有多个密码子，这种现象称为简并（degenerate），如UUU和UUC都是苯丙氨酸的密码子，UCU、UCC、UCA、UCG、AGU和AGC都是丝氨酸的密码子，同一氨基酸的不同密码子称为同义词（synonyms）。
蛋白质翻译
3、核糖体的活性位点
30S小亚基 头部 基底部 中间有一豁口 50S大亚基 三个突起
• 两者之间形成一个mRNA通道 (Prok.与 Euk.之间互有异同)
• 根据功能将核糖体上的活性部位分为两类 ♪ 翻译区域 7个活性位点 占2/3 ♪ 逐出位点 2个位点（多肽的逐出） 占1/3
tRNA
Ala (GGC)
tRNA
Ala (UGC)
具有G3 ：U70 paracodon
--- paracodon 是为AARS（特定氨基酸）所识别的若干 碱基（并非均为一对核苷酸）
--- AARS 对paracodon 的识别与结合是通过氨基酸与 碱基之间的连接实现的。属于生物 II 型空间密码
实验证实—模板mRNA只能识别特异的tRNA而不是AA
[14C]-Cys-tRNACys
Ni
[14C]-Ala-tRNACys
（2） AA– tRNA合成酶（AARS）
★ 需要三种底物 AA tRNA ATP
★ 因此有三个位点 aa binding site tRNA binding site ATP site
多顺反子mRNA（polycistronic mRNA ）:
mRNA 分子的组成： • 编码区 起始AUG到终止密码子 • 前导序列 AUG之前的 5’ 端非编码区（5’UTR）
• 尾巴 终止密码子之后，不翻译的 3’ 端
1、 原核生物mRNA的特征 （1） 大部分为多顺反子 spacer: 各顺反子之间（基因之间）的非编码区 长度变化很大 因此，多顺反子的mRNA翻译有两种情况： a、spacer较长时，下一个基因的产物合成起始是独立的 b、spacer长度较短时,两个顺反子使用相同的核糖体或小 亚基( 相当…………，有S-D 序列的特征） 所以-----Prok中多顺反子mRNA中各基因的产物数量不一 定相等
蛋白质翻译(外文版)
Accepting an aminoacyl-tRNA
Forming the peptidyl bonds
Releasing the deacylated tRNA
A site, P site and E site
Section 2
Protein Synthetic Process
General concepts
Section 1
Protein Synthetic System
Protein synthesis requires multiple elements to participate and coordinate.
• mRNA, rRNA, tRNA • substrates: 20 amino acids • Enzymes and protein factors:
• The complex of the GTP-bound IF-2 and the fMet-tRNA enters the P site.
Initiation 4
• The 50S subunit combines with this complex.
• GTP is hydrolyzed to GDP and Pi.
overlapping
Frameshift
2. Degeneracy
• Except Met and Trp, the rest amino acids have 2, 3, 4, 5, and 6 triplet codons.
• These degenerated codons differ only on the third nucleotide.
• A ribosome is composed of a large subunit and a small subunit, each of which is made of ribosomal RNAs and ribosomal proteins.
山东大学分子生物学章节习题及参考答案05蛋白质的生物合成(翻译)
第五章蛋白质的生物合成（翻译）一、选择题1．仅有一个密码子的氨基酸是A．色氨酸、赖氨酸B．苏氨酸、甘氨酸C．甲硫氨酸、甘氨酸D．亮氨酸、丙氨酸E．色氨酸、甲硫氨酸2．密码与反密码配对时，不遵从碱基配对规律，称为A．密码的简并性B．密码的偏爱性C．密码的连续性D．密码的摆动性E．密码的通用性3．真核生物核蛋白体中没有的rRNA是A．18SB．23SC．5SD．28SE．5.8S4．反密码存在于A．DNAB．tRNAC．mRNAD．rRNAE．cDNA5．不符合密码的通用性的细胞器是A．细胞核B．微粒体C．线粒体D．内质网E．高尔基体6．氨基酰-tRNA合成酶的校正活性是A．水解酯键B．水解3’，5’磷酸二酯键C．水解磷酸酯键D．形成酸酐键E．形成磷酸酯键7．关于核蛋白体，错误的是A．由rRNA和多种蛋白质组成B．分为大小亚基C．是翻译的场所D．在细胞核内起作用E．一个mRNA上可附着多个核蛋白体8．能促使大小亚基解离的因子是A．IF1B．IF2C．IF3D．EF-TsE．IF1与IF39．EF-Tu的功能是A．协助氨基酰-tRNA进入A位B．促进核糖体亚基聚合C．促进核糖体解聚D．促进mRNA与核糖体分离E．促进肽酰-tRNA移位10．延长因子EFG具有哪种酶的活性A．转肽酶B．酯酶C．转位酶D．转甲酰酶E．转氨酶11．肽链延长过程的叙述，错误的是A．又称为核蛋白体循环B．每循环一次延长一个氨基酸C．分为进位，成肽和转位三步D．需要EFT、EFGE．需要ATP供能12. 翻译终止时激活转肽酶为酯酶活性的是A．RF-1B．RF-2C．RF-3D．RF-4E．RR13. 蛋白质合成中不消耗能量的阶段是A．氨基酸活化B．翻译起始C．进位D．成肽E．转位14. 关于多肽链一级结构的翻译后修饰，描述错误的是A．蛋白质合成过程中N端总是甲酰甲硫氨酸B．天然蛋白质N端多数不是甲酰甲硫氨酸C．脱甲酰基酶可除去N端甲酰基D．氨基肽酶可除去N端氨基酸E．翻译终止才能除去N端甲酰基15. 鸦片促黑皮质素原水解加工生成的是A．胰岛素B．糖蛋白C．脂蛋白D．ACTHE．TSH16. 可被信号肽酶裂解的部位是A．加工区B．疏水核心区C．碱性氨基末端区D．酸性羧基末端区E．亲水区17.关于信号肽识别粒子（SRP）的描述，错误的是A．由蛋白质与RNA组成的复合体B．能特异识别结合信号肽C．具有暂停蛋白质合成的作用D．可将正在合成蛋白质的核蛋白体带至膜外E．SRP需与对接蛋白结合18. 白喉毒素可共价修饰的因子是A．EF3B．eEF1C．EF1D．eEF2E．EF219. 干扰素通过何种方式使eIF2失活A．甲基化B．ADP核糖基化C．羧化D．磷酸化E．乙酰化20. 可辨认结合分泌蛋白新生肽链N端的是A．转肽酶B．信号肽识别颗粒C．GTP酶D．RNA酶E．对接蛋白二、名词解释1. 多聚核蛋白体(polyribosome)2. 信号肽(signal peptide)3．开放阅读框架（open reading frame, ORF）三、问答题1．三种RNA在蛋白质合成中各起何作用?2．原核与真核生物翻译起始阶段各有何异同？3．细胞核蛋白合成后如何靶向输送到细胞核？4．举例说明抗生素在翻译水平抑菌的作用机理。
第8章蛋白质的生物合成——翻译
第8章蛋白质的生物合成——翻译一、名词解释1．翻译2．密码子3．密码的简并性4．同义密码子5．变偶假说6．移码突变 7．同功受体 8．Anticodon 9．多核糖体 10．Paracodon 11．Signal peptide二、填空题1．蛋白质的生物合成是以___________为模板，以___________为原料直接供体，以_________为合成杨所。
2．生物界共有______________个密码子，其中___________个为氨基酸编码，起始密码子为_________；终止密码子为_______、__________、____________。
3．原核生物的起始tRNA以___________表示，真核生物的起始tRNA以___________表示，延伸中的甲硫氨酰tRNA以__________表示。
4．植物细胞中蛋白质生物合成可在__________、___________和___________三种细胞器内进行。
5．延长因子T由Tu和Ts两个亚基组成，Tu为对热___________蛋白质，Ts为对热________蛋白质。
6．原核生物中的释放因子有三种，其中RF-1识别终止密码子_____________、____________；RF-2识别__________、____________；真核中的释放因子只有___________一种。
7．氨酰-tRNA合成酶对__________和相应的________有高度的选择性。
8．原核细胞的起始氨基酸是_______，起始氨酰-tRNA是____________。
9．原核细胞核糖体的___________亚基上的__________协助辨认起始密码子。
l0．每形成一个肽键要消耗_____________个高能磷酸键，但在合成起始时还需多消耗___________个高能磷酸键。
11．肽基转移酶在蛋白质生物合成中的作用是催化__________形成和_________的水解。
蛋白质翻译(英译中)
总结
通常蛋白质分子分为多个不同组织结构。
最初的是由基因决定的氨基酸序列，这个序列依次为二级结构,三级结构,四级结构。
蛋白质有许多二级结构,但是只有少量的可以有稳定的氢键。
包括α螺旋、β折叠,无规则螺旋。
这些特定结构都是多肽链所形成的。
拉马钱德兰图提供了一种可视化的方式。
蛋白质可以分为纤维状和球状两大类。
在细胞和生物体内，纤维状蛋白质是细长的,通常的为二级结构。
比如角蛋白(α螺旋)，蚕丝蛋白(β折叠),胶原蛋白(三重螺旋)和弹性蛋白(不规则螺旋)。
球状蛋白质有更复杂的三级结构，并折叠成紧凑的形成，其中包含着结构域。
许多已经确认的三级结构包括α螺旋束、扭曲的β折叠和β
桶状结构。
许多因素通过内部的非共价键，疏水作用和二硫键影响球状蛋白的构象稳定。
在“天然”的条件下，许多球状蛋白质自发迅速地折叠。
在细胞中，蛋白质在分子伴侣的帮助下，防止不正确的或不必要的相互作用形成的结构。
当在折叠时，球状蛋白质也在进行多种内部运动，是一种动态结构。
我们现在可以准确的预测蛋白质二级结构，但三级结构的预测很困难。
许多（大多数）球状蛋白质是由多亚基形成的四级结构。
这些蛋白质是不规则螺旋的对称结构；大部分都具有点群对称性（通常是2，4或6）。
所有的结构水平都是由基因序列决定。
蛋白质 翻译
蛋白质翻译Protein is an essential macronutrient that plays a variety of important roles in the human body. It is composed of amino acids, which are the building blocks of life. The translation of the term "protein" into Chinese is "蛋白质".Proteins are involved in many bodily functions, including growth and repair of tissues, hormone production, and regulation of enzymes. They are also a major component of muscles, skin, hair, and nails. In addition, proteins play a crucial role in the immune system, as they help to protect the body against infections and diseases.There are two main types of protein: complete and incomplete. Complete proteins contain all nine essential amino acids that the body cannot produce on its own. They are usually found in animal-based sources like meat, fish, eggs, and dairy products. Incomplete proteins, on the other hand, lack one or more essential amino acids and are typically derived from plant-based sources such as beans, grains, and nuts. It is important for vegetarians and vegans to combine different plant-based protein sources in order to get all necessary amino acids.Protein requirements vary depending on age, sex, weight, and activity level. The recommended daily intake for adults is around 0.8 grams of protein per kilogram of body weight. However, athletes and active individuals may require more protein to support muscle growth and repair.Insufficient protein intake can lead to various health problems.Protein deficiency can cause muscle wasting, weakened immune system, poor wound healing, and slow growth in children. On the other hand, excessive protein intake can also have negative effects on health, such as increased risk of kidney damage, osteoporosis, and cardiovascular disease.It is important to choose high-quality protein sources and maintain a balanced diet. Lean meats, fish, poultry, eggs, dairy products, and plant-based proteins are all good options. It is also beneficial to include a variety of protein sources in the diet to ensure adequate intake of all essential amino acids.In conclusion, protein is a vital nutrient that plays a crucial role in various bodily functions. It is necessary for growth, repair, and maintenance of tissues, as well as for the production of hormones and enzymes. Adequate protein intake is essential for overall health and well-being.。
蛋白质翻译
蛋白质翻译Protein TranslationProtein translation is the process by which genetic information is decoded to synthesize proteins. It is a key step in gene expression and plays a crucial role in the functioning of living organisms.Translation occurs in the ribosomes, which are large complexes of RNA and proteins. The process begins with the binding of the messenger RNA (mRNA) to the small ribosomal subunit. The ribosome then scans the mRNA for the start codon, which signals the beginning of translation. Next, the large ribosomal subunit joins the small subunit, forming a functional ribosome.The translation process requires transfer RNA (tRNA) molecules, which carry amino acids to the ribosome. Each tRNA has an anticodon that is complementary to the codon on the mRNA. The ribosome moves along the mRNA, matching each codon with the appropriate tRNA molecule. As the ribosome moves, the amino acids carried by the tRNAs are joined together to form a protein chain.There are three main steps in protein translation: initiation, elongation, and termination. During initiation, the ribosome assembles on the mRNA and begins scanning for the start codon. Once the start codon is found, the small ribosomal subunit binds to the mRNA, and the large ribosomal subunit joins to form a functional ribosome.In the elongation phase, the ribosome moves along the mRNA,synthesizing the protein chain. Each codon on the mRNA is recognized by a complementary tRNA molecule, which brings the corresponding amino acid to the ribosome. The ribosome catalyzes the formation of a peptide bond between the amino acids, linking them together in a growing protein chain.Finally, during termination, the ribosome reaches a stop codon on the mRNA, signaling the end of translation. The protein chain is released from the ribosome, and the ribosome subunits dissociate from the mRNA.After translation, the protein chain may undergo further modifications, such as folding into its functional structure or being targeted to specific cellular compartments. These modifications are essential for the protein to carry out its specific functions in the cell.Protein translation is a highly regulated process, with multiple checkpoints to ensure the accuracy and fidelity of protein synthesis. Errors in translation can lead to the production of faulty proteins, which can have detrimental effects on cellular function and contribute to various diseases.In conclusion, protein translation is a complex and essential process in the cell. It involves the decoding of genetic information to synthesize proteins, which are vital for the structure, function, and regulation of living organisms. Understanding protein translation has important implications for both basic science and medical research.。
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• 3．氨酰-tRNA 合成酶对__________和相应的 ________有高度的选择性。
• 4、原核细胞的起始氨基酸是_______，起始氨酰-
tRNA 是____________。
5．肽酰转移酶在蛋白质生物合成中的作用是催化 __________形成和_________的水解。 6．肽链合成终止时，___________进人"A"位，识
C.终止密码子本身具有酯酶作用，可水解肽酰
与tRNA之是的酯键
D.终止密码子被终止因子(RF)所识别
• 6、蛋白质生物合成中的终止密码是( A：UAA B：UAU C：UAC D：UAG E：UGA
)。
• 7．根据摆动假说，当 tRNA 反密码子第 1 位碱基是 I 时，能够识别哪几种密码子( ) A：A B：C C：G D：T E：U
• 8、蛋白质生物合成具有下列哪些特征(
A.氨基酸必须活化 B.需要消耗能量
)。
C.每延长一个氨基酸必须经过进位、转肽、移位、脱 落四个步骤
D.合成肽链由 C 端向 N 端不断延长
E.新生肽链需加工才能成为活性蛋白质
• 9、下列哪些内容属于蛋白质合成后的加工、修饰( )。
A.切除内含子，连接外显子
D.从 NC 端
• 2．能与 tRNA 反密码子中的 I 碱基配对的是( A： A、G B： C、U C： U D：U、C、A
)。
• 3．tRNA 的作用是(
)。
A.将一个氨基酸连接到另一个氨基酸上 B.把氨基酸带到 mRNA 位置上 C.将 mRNA 接到核糖体上
D.增加氨基酸的有效浓度
• 4．关于核糖体的移位，叙述正确的是(
B.切除多余肽段
C.形成二硫键 D.氨基的侧链修饰 E.切除 N-端 Met
• 10、蛋白质生物合成过程中，下列哪些步骤需要消耗能量( A.氨基酸分子的活化
)。
B.70S 起始复合物的形成
C.氨酰 tRNA 进入核糖体 A 位 D.肽键形成 E.核糖体移位
四、是非题 • 1．DNA 不仅决定遗传性状，而且还直接表现遗传性 状。( ) )
一、名词解释 • 1．翻译 • 2．密码子 • 3．密码的简并性 • 4．同义密码子 • 5．变偶性 • 6．移码突变 • 8．反密码子 • 9．多核糖体
二、填空题 1．蛋白质的生物合成是以___________为模板，以 ___________为原料直接供体，以_______ 为合成杨所。
2．生物界共有______________个密码子，其中 ___________个为氨基酸编码，起始密码子为 _________；终止密码子为_______、__________、
别出_________，同时终止因子使_______的催
化作用转变为____________。
9．原核生物的核糖体由____________小亚基和 ____________大亚基组成，真核生物核糖体 由_________小亚基和_______________大亚基组成。
三、选择题
1．蛋白质生物合成的方向是( A.从 CN 端B.定点双向进行 C.从 N 端、C 端同时进行 )。
• 8．在大肠杆菌中，一种氨基酸只对应于一种氨酰tRNA 合成酶。( )
• 9．氨基酸活化时，在氨酰-tRNA 合成酶的催化下，
由 ATP 供能，消耗—个高能磷酸键。 ( )
• 11．每种氨基酸只能有一种特定的 tRNA 与之对应。 ( )
• 12．AUG 既可作为 Met-tRNA 的起始密码子，又可作 为肽链内部 Met 的密码子．( )
)。
A.空载 tRNA 的脱落发生在"A"位上
B.核糖体沿 mRNA 的 3'5'方向相对移动 C.核糖体沿 mRNA 的 5'3'方向相对移动 D.核糖体在 mRNA 上一次移动的距离相当于二个核苷 酸的长度
• 5、在真核细胞中肽链合成的终止原因是(
)。
A.已达到 mRNA 分子的尽头
B.具有特异的 tRNA 识别终止密码子
• 5、氨基酸在蛋白质合成过程中是怎样被活化的? • 6．简述蛋白质生物合成过程。 • 7．蛋白质合成中如何保证其翻译的正确性? • 8、蛋白质合成后的加工修饰有哪些内容?
• 2．密码子在 mRNA 上的阅读方向为 5' 3'。( • 3．每—种氨基酸都有两种以上密码子。( • 4．一种 tRNA 只能识别一种密码子。( ) )
• 6．大肠杆菌的核糖体的小亚基必须在大亚基存在时， 才能与 mRNA 结合。( )
• 7．大肠杆菌的核糖体的大亚基必须在小亚存在时，
才能与 mRNA 结合。( )
• 13．构成密码子和反密码子的碱基都只是 A、U、C、
G。(
)
• 15．核糖体的活性中心"A"位和"P"位都主要在大亚基
上。(
)
五、问答题 1．参与蛋白质生物合成体系的组分有哪些?它们具有
什么功能?
2．遗传密码是如何破译的?
3．遗传密码有什么特点?
4．简述三种 RNA 在蛋白质生物合成中的作用。