广西地方稻种资源核心种质构建和遗传多样性分析
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李丹婷等:广西地方稻种资源核心种质构建和遗传多样性分析
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JII、融安、融水、罗城、天峨、隆林、西林、靖西、德保、那坡和桂林市郊区17个县市;高寒山区稻作区包括
龙胜、资源、三江、金秀、南丹、乐业和融水县部分山区北部海拔在500m以上的稻田(图1)。
表2
34对SSR标记所在的染色体及在414份广西地方稻核心种质中的遗传多样性信息
Table2
Chromosomelocation,numberofalleles(Na),andNei’sgeneticdiversity
(H)index
at
34SSRlociin414Guangxilandracerice
core
collection
RM9RMl28RM262RMl06RM240RMl75RMl6RM471
RM273
RMl53RMl69RM305
RM274
RM586RM314
RM30
RMllRM3826RM234RMl34RM408RMl270RM284RMl05RM434RM201RM205RM216RM8201RM467RM6901RM206RMl9
0.73320.5869O.65540.48830.75320.8004O.5738O.6309O.05420.5490O.71420.30490.1746O.61540.56100.53460.32990.59990.50940.17600.65070.2823O.65200.48670.6721O.6527O.4556O.7189O.52440.09780.52000.80750.5776
0.72690.63850.61560.49900.80820.75990.43540.44980.07760.56860.27190.42850.43810.5734O.24300.14160.4456O.5973O.66350.46120.57920.45920.7640O.59160.5332O.65840.36090.6235O.6975O.69650.46260.83430.6831
O.73930.60710.7076O.4916O.7893O.7953O.6662O.66630.05940.56000.75470.41600.24970.60750.5429O.4769O.36250.5995O.6323O.25850.66110.3258O.72410.55140.68530.73590.57730.74360.64030.30720.53770.82460.6631
墨坚!!
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将四个稻作区的人选初级核心种质资源等位基因数与Nei’s基因多样性指数进行多重比较。如表4,等位基因数最丰富的为桂南稻作区,与桂北稻作区与高寒山区稻区呈显著性差异,与桂中稻作区无显著差异;广西四个稻区的Nei’S遗传多样性丰富度排序为:桂中>桂北>桂南>高寒山区;但它们之问无显著性差异,说明桂中稻作区地方栽培稻最为丰富,其次是桂北和桂南,最低是高寒山区稻作区。2.3聚类分析及核心种质压缩
2.3.1聚类分析对414份初级核心种质的SSR检测结果进行主成分分析,并利用前三个主成分数据
进行PCA作图分析。图2显示,核心种质明显分为籼粳两大类群,但仍有少部分籼粳稻分类与表型性状的籼粳稻分类存在差异,这与SSR标记表现的是DNA水平上的变异,形态性状是环境和DNA变异互作的结果有关。籼稻325份和粳稻89份分别占初级核心种质数量的79%和21%。籼早型稻和籼晚型稻分别占籼稻总量的30%和70%,粳稻89份全部为晚稻类型,无粳早型稻。籼稻中以粘稻为主,粘稻占79%,而粳稻中却以糯稻为主,粘稻仅占22%。陆稻比例在初级核心种质中占比例较小,为22%。糯稻占初级核心种质的33%,籼型糯稻与粳
848298563452334644743463656444685
746277553442334434543463453444485
747298563452333644743463656443
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