真核生物RNA聚合酶
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（2）功能：是使RNA 聚合酶正确的定位在起始位 点。
RNA 聚合酶 I 基因转录起始
CTCCGAGTCGNNNNNNTGGGCCGCCGG startpoint
上游控制元件（UCE）
核心启动子（core element）
-170
-110
-40
+1
+20
UBF1
UBF1
TBP
SL1
TAFIs
TBP
Pol III
2、上游因子(Upstream factor)
（1）识别并与启动子上游元件结合 （2）与上游元件结合可增加转录起始的效率
上游元件
Startpoint
UBF1
（五）启动子
RNA 聚合酶Ⅰ的启动子：位于转录起点上游 RNA 聚合酶Ⅱ的启动子：位于转录起点上游 RNA 聚合酶III的启动子：位于转录起点下游
TAFIs
Pol I
三、RNA 聚合酶III 基因的转录
（一）tRNA基因的转录 1、启动子----基因内启动子
（1）启动子的两个保守序列： A框（5’-TGGCNNAGTGG-3’)； B框(5’-GGTTCGANNCC-3’)
（2）A框和B框编码的序列： A框----D-loop； B框---- T C-loop
CTCCGAGTCGNNNNNNTGGGCCGCCGG startpoint
上游控制元件（UCE）
核心启动子（core element）
-170
-110
-40
+20
人类RNA Pol I的启动子
（三）RNA Pol I的辅助因子(UBF1 & SL1)
1、上游结合因子（UBF1） （1）可以与UCE结合 （2）可与核心元件的一段序列结合 （3）两个UBF1通过蛋白－蛋白相互作用而相互结
合，导致在两个结合位点间的DNA形成一个环状 结构。
UBF1
UBF1
2、选择因子1（SL1） （1）组成：4个亚基
a、TBP (TATA-binding protein): 是保证RNA pol 准确结合到起始位点的一个 关键因子
b、其他的三个亚基TAF：（TBP 相关因子） 为RNApol I转录所需的亚基称为TAFI
（2）起始子(initiator，Inr) 与转录起始位点重叠的短的较保守序列
附：缺少TATA 盒启动子 （1）无TATA盒，只有一个起始子 （2）既无TATA框，也无起始子，这种基因通常
转录速率很低，起始点不固定。
3、上游启动子（upstream promoter element，UPE） （1）位置：
真核生物基因的转录
一、真核生物基因转录概述
（一）真核生物的转录和原核生物转录的不同点： 1、原核细胞只有一种RNA聚合酶，而真核细胞 有三种聚合酶； 2、启动子的结构特点不同，真核基因有三种不 同的启动子和有关的元件； 3、真核基因的转录有很多蛋白质因子的介入。
（二）真核生物RNA聚合酶（三种）
(B’’, TBP, BRF)
TF III B
TF III A TF III C
Pol III
四、RNA 聚合酶 II 基因的转录
（一）RNA聚合酶 II 的启动子 1、组成：
核心启动子（core promoter）： TATA盒（Hogness box）： - 25 ~ -35bp
上游启动子（upstream promoter element，UPE） CAAT盒 ：-70 ~ -80区 GC盒：-80 ~ -110区
基因内启动子
二、RNA 聚合酶 I 基因的转录
（一）rRNA基因（Ribosomal RNA Genes ） 多拷贝基因
（二）RNA聚合酶Ⅰ启动子
1、核心启动子（core promoter）或核心元件： 位于-45 ~ +20，负责转录的起始。
2、上游控制元件（upstream control element ）： 位于-180 ~ -107，可增加转录起始的效率。
1、 5S rRNA 基因： 特点：串连排列，形成基因簇 （是唯一单独被转录的rRNA亚基）
2、启动子： C框 ；A框
3、转录因子：
(1) TFIIIA ：结合位点为C box 。 (2) TFIIIC (3) TFIIIB： TBP + BRF + B//
4、5s rRNA 基因转录的起始
boxA boxC
附：真核基因在转录时RNA聚合酶需要多种 转录因子的协助
TBP
TAFIs
Pol I
（四）转录因子
1、通用因子(General factor) （1）是所有启动子起始RNA合成所必须 （2）与RNA 聚合酶在起始位点周围形成复合体，
并决定起始的位置。
TBP
TAFIs
Pol I
TF III B (B’’, TBP, BRF)
源自文库类型
转录产物
对鹅膏蕈碱的反应
Ⅰ rRNA:18s,5.8s,28s
不敏感
Ⅱ hnRNA
高度敏感
Ⅲ tRNA,5srRNA,snRNA 不同物种敏感性不同
（三）真核生物RNA 聚合酶（RNA Pol II）
▪ 由8~14个亚基组成，分子质量为500KDa
250KDa ▪ 与模板结合；与转录起始、延伸有关 130KDa ▪ 与DNA、底物和新生的RNA结合 40KDa 40KDa ▪ 负责酶的装配
CAAT盒 ：-70 ~ -80区（ -70区） GC盒：-80 ~ -110区（-90区） （2）功能： 控制转录起始的频率
（基本不参与起始位点的精确定位） （3）功能特点：正反方向排列均能发挥作用
（4）上游元件的多样性
SV40 early
2、tRNA基因转录因子
（1）TFⅢC：识别boxB （2）TFⅢB：与A框上游50kb上游序列结合
a、组成: TBP、BRF、B” b、功能：是RNA聚合酶Ⅲ真正的起始因子
3、tRNA基因转录的起始
boxA
boxB
TF III C
TF III B
Pol III
（二）5S rRNA 基因的转录
-100
-80
-60
GC
CAAT
GCCACACCC GGCCAATC
-40
-20
TATA
ATATAA
2、核心启动子（core promoter）： （1）TATA盒（Hogness box）：
a、位置： - 25 ~ -35bp b、序列特征：富含AT，
5’-TATA(A/T)A(A/T)-3’. c、功能：决定RNApol II的定位与转录精确起始
RNA 聚合酶 I 基因转录起始
CTCCGAGTCGNNNNNNTGGGCCGCCGG startpoint
上游控制元件（UCE）
核心启动子（core element）
-170
-110
-40
+1
+20
UBF1
UBF1
TBP
SL1
TAFIs
TBP
Pol III
2、上游因子(Upstream factor)
（1）识别并与启动子上游元件结合 （2）与上游元件结合可增加转录起始的效率
上游元件
Startpoint
UBF1
（五）启动子
RNA 聚合酶Ⅰ的启动子：位于转录起点上游 RNA 聚合酶Ⅱ的启动子：位于转录起点上游 RNA 聚合酶III的启动子：位于转录起点下游
TAFIs
Pol I
三、RNA 聚合酶III 基因的转录
（一）tRNA基因的转录 1、启动子----基因内启动子
（1）启动子的两个保守序列： A框（5’-TGGCNNAGTGG-3’)； B框(5’-GGTTCGANNCC-3’)
（2）A框和B框编码的序列： A框----D-loop； B框---- T C-loop
CTCCGAGTCGNNNNNNTGGGCCGCCGG startpoint
上游控制元件（UCE）
核心启动子（core element）
-170
-110
-40
+20
人类RNA Pol I的启动子
（三）RNA Pol I的辅助因子(UBF1 & SL1)
1、上游结合因子（UBF1） （1）可以与UCE结合 （2）可与核心元件的一段序列结合 （3）两个UBF1通过蛋白－蛋白相互作用而相互结
合，导致在两个结合位点间的DNA形成一个环状 结构。
UBF1
UBF1
2、选择因子1（SL1） （1）组成：4个亚基
a、TBP (TATA-binding protein): 是保证RNA pol 准确结合到起始位点的一个 关键因子
b、其他的三个亚基TAF：（TBP 相关因子） 为RNApol I转录所需的亚基称为TAFI
（2）起始子(initiator，Inr) 与转录起始位点重叠的短的较保守序列
附：缺少TATA 盒启动子 （1）无TATA盒，只有一个起始子 （2）既无TATA框，也无起始子，这种基因通常
转录速率很低，起始点不固定。
3、上游启动子（upstream promoter element，UPE） （1）位置：
真核生物基因的转录
一、真核生物基因转录概述
（一）真核生物的转录和原核生物转录的不同点： 1、原核细胞只有一种RNA聚合酶，而真核细胞 有三种聚合酶； 2、启动子的结构特点不同，真核基因有三种不 同的启动子和有关的元件； 3、真核基因的转录有很多蛋白质因子的介入。
（二）真核生物RNA聚合酶（三种）
(B’’, TBP, BRF)
TF III B
TF III A TF III C
Pol III
四、RNA 聚合酶 II 基因的转录
（一）RNA聚合酶 II 的启动子 1、组成：
核心启动子（core promoter）： TATA盒（Hogness box）： - 25 ~ -35bp
上游启动子（upstream promoter element，UPE） CAAT盒 ：-70 ~ -80区 GC盒：-80 ~ -110区
基因内启动子
二、RNA 聚合酶 I 基因的转录
（一）rRNA基因（Ribosomal RNA Genes ） 多拷贝基因
（二）RNA聚合酶Ⅰ启动子
1、核心启动子（core promoter）或核心元件： 位于-45 ~ +20，负责转录的起始。
2、上游控制元件（upstream control element ）： 位于-180 ~ -107，可增加转录起始的效率。
1、 5S rRNA 基因： 特点：串连排列，形成基因簇 （是唯一单独被转录的rRNA亚基）
2、启动子： C框 ；A框
3、转录因子：
(1) TFIIIA ：结合位点为C box 。 (2) TFIIIC (3) TFIIIB： TBP + BRF + B//
4、5s rRNA 基因转录的起始
boxA boxC
附：真核基因在转录时RNA聚合酶需要多种 转录因子的协助
TBP
TAFIs
Pol I
（四）转录因子
1、通用因子(General factor) （1）是所有启动子起始RNA合成所必须 （2）与RNA 聚合酶在起始位点周围形成复合体，
并决定起始的位置。
TBP
TAFIs
Pol I
TF III B (B’’, TBP, BRF)
源自文库类型
转录产物
对鹅膏蕈碱的反应
Ⅰ rRNA:18s,5.8s,28s
不敏感
Ⅱ hnRNA
高度敏感
Ⅲ tRNA,5srRNA,snRNA 不同物种敏感性不同
（三）真核生物RNA 聚合酶（RNA Pol II）
▪ 由8~14个亚基组成，分子质量为500KDa
250KDa ▪ 与模板结合；与转录起始、延伸有关 130KDa ▪ 与DNA、底物和新生的RNA结合 40KDa 40KDa ▪ 负责酶的装配
CAAT盒 ：-70 ~ -80区（ -70区） GC盒：-80 ~ -110区（-90区） （2）功能： 控制转录起始的频率
（基本不参与起始位点的精确定位） （3）功能特点：正反方向排列均能发挥作用
（4）上游元件的多样性
SV40 early
2、tRNA基因转录因子
（1）TFⅢC：识别boxB （2）TFⅢB：与A框上游50kb上游序列结合
a、组成: TBP、BRF、B” b、功能：是RNA聚合酶Ⅲ真正的起始因子
3、tRNA基因转录的起始
boxA
boxB
TF III C
TF III B
Pol III
（二）5S rRNA 基因的转录
-100
-80
-60
GC
CAAT
GCCACACCC GGCCAATC
-40
-20
TATA
ATATAA
2、核心启动子（core promoter）： （1）TATA盒（Hogness box）：
a、位置： - 25 ~ -35bp b、序列特征：富含AT，
5’-TATA(A/T)A(A/T)-3’. c、功能：决定RNApol II的定位与转录精确起始