知识点总结:蛋白质及氨基酸生化基础
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蛋白质
▲蛋白质的化学知识
历史
1.1838, Mulder发现了组成生物体的复杂含氮物。
2.1902, Fischer, Hofmeister同时提出肽键理论。(Nobel,1902)
3.1950, Pauling提出蛋白质的二级结构的基本单位:α-螺旋和β-折叠,肽键6个原子在同一平面。(Nobel,
1954)
4.1953, Sanger确定了牛胰岛素一级结构。(Nobel,1958)
5.1961, Anfinsen证明蛋白质的一级结构决定其三级结构, 利用核糖核酸酶的变性和复性
20种氨基酸–一级氨基酸, Primary amino acid
⏹缩写
丙氨酸(Ala),缬氨酸(Val),亮氨酸(Leu),异亮氨酸(Ile),脯氨酸(Pro),苯丙氨酸(Phe),色氨酸(Trp),蛋氨酸/甲硫氨酸(Met),甘氨酸(Gly),丝氨酸(Ser),苏氨酸(Thr),半胱氨酸(Cys),酪氨酸(Tyr),天冬酰胺(Asn),谷氨酰胺(Gln),赖氨酸(Lys),精氨酸(Arg),组氨酸(His),天冬氨酸(Asp),谷氨酸(Glu)
口诀:
⏹分类及特性:
✓非极性,通过疏水作用稳定蛋白质的结构, Met, Val, Ala, Gly, Ile, Leu
✓芳香族氨基酸,相对非极性,都能参与疏水作用。Trp, Try, Phe
✓极性不带电:水中溶解度较大或更加亲水,可以与水形成氢键。Ser, Thr, Cry, Asn, Gln, Pro
✓植物受到逆境条件的危害,积累Pro。积累一定量的溶质降低水势。Pro主要以游离状态广泛存在于植物中,水溶性最大的氨基酸,具有较强的水和能力。Pro大量积累,含量甚至高达百倍以上。
✓带正电和的三个碱性氨基酸,最为亲水,侧链上有第二个氨基,Arg有带正电的胍基,His有可带电的咪唑基。Lys
✓旋光性与手性原子上的构型没有确定的关系。
⏹氨基酸的理化性质
✓一般物理性质:无色晶体,熔点较高,溶解度各不同,在紫外有特征吸收的仅三个芳香族的氨基酸Trp、Tyr、Phe。测定280nm处的紫外吸收值。
✓两性电解质:同一氨基酸分子上可以同时解离携带正电荷和负电荷,被称为两性电解质ampholyte。氨基和羧基在不同的PH条件下表现出不同的解离状态。电荷总量为零时(净电荷为零),溶液的PH值为等电点 isoelectric point, pI.
✓ -氨基参与的反应
➢与亚硝酸反应(Van Slyke 定氮)
➢与甲醛发生羟甲基化反应,直接测定氨基酸浓度。
➢烃基化反应(DNFB)法,二硝基氟苯法,桑格反应,Sanger reaction, 鉴定多肽N端氨基酸的重要方法
➢烃基化反应(PITC)法。Edman氨基酸顺序分析法。N端测序,苯异硫氰酸酯。能够不断重复循环,将肽链N端氨基酸逐一进行标记和解离。
➢酰基化反应(丹磺酰氯法),N端测序,丹磺酰-氨基酸有很强的荧光性质,DNS-Cl
➢酰基化反应(氨基保护反应),用于保护氨基以及肽链合成
➢生成西佛碱,多种酶促反应的中间过程
➢脱氨基反应:酶催化的反应
✓羧基的化学反应
➢Strecker降解:弱氧化剂(次氯酸钠)作用下生成NH3和醛;特殊条件下还原成醇、醛;与肼反应,C端氨基酸分析
➢成盐成酯,成盐后COOH被保护;酰卤;叠氮化反应,作为多肽合成活性中间体,活化羧基;脱羧
✓侧链的化学反应
➢羟基:酯化(磷酸化),修饰蛋白质
➢巯基:氧化还原,与金属离子的螯合可用于体内解毒
✓氨基和羧基共同参与
➢茚三酮反应(定性、定量),紫色产物,Pro黄色,比色测定和纸层析显色
➢成肽反应
▲理化性质、测定及分离纯化
理化性质:
➢蛋白质溶液是一种胶体溶液;
➢特定的空间构象,分子量一定–分子筛层析
➢大部分pH条件下,蛋白质分子同时存在两种电荷–等电点沉淀,盐溶,盐析,电泳,离子交换层➢一般而言,蛋白质上同时存在疏水和亲水区域–有机溶剂沉淀,疏水层析(反相层析)
胶体性质:分子量大,一万到百万。球状蛋白质表面亲水,形成水化膜,从而阻止蛋白质颗粒的相互聚集。
颗粒大小:1-100nm之间,属胶体。稳定亲水胶体的因素:水化膜,表面电荷相同
蛋白质分子扩散速度慢,不易透过半透膜,粘度大,将混有小分子杂质的蛋白质溶液置于半透膜制成的透析袋或管内,浮于流动动水或适宜的缓冲液中,小分子杂质易从袋中透出,保留了比较纯化的蛋白质,即透析(dialysis)。
蛋白质大分子溶液在一定溶剂中超速离心时可发生沉降。沉降速度与离心加速度之比值即为蛋白质的沉降系数S。s = v/w2r;沉降系数以每单位重力的沉降时间表示,蛋白质、核酸、核糖体、病毒等的沉降系数通常为1-200*10-13s,10-13这个因子叫做沉降单位S。
两性电离和等电点:氨基酸分子中除两端游离的氨基和羧基外,Glu、Asp残基中的γ和β羧基,Lys残基中的ε-氨基,Arg的胍基和His的咪唑基。作为带点颗粒,在电场中移动,移动方向取决于蛋白质分子所带电荷性质。蛋白质的电荷即决定于分子组成中碱性和酸性氨基酸的含量,又受所处溶液的pH影响。当蛋白质溶液处于某一pH时,蛋白质游离成正、负离子的趋势相等,即成为碱性离子(净电荷为0),此时溶液的pH值成为蛋白质的等电点。
➢pH=pI,净电荷为零,电场中不移动;
➢pH大于pI,带负电,向阳极移动;
➢pH小于pI,带正电,向阴极移动;
➢pI时,蛋白质失去了胶体的稳定条件,没有相同电荷相互排斥的作用,不稳定,溶解度最小,易沉淀。 蛋白质的变性,denaturation