荧光素酶报告实验
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荧光素酶报告实验
1 扩增目的片段
扩增包含靶基因与miRNA互补位点的3’UTR序列以及mutant序列,上下游引物5’端各含有不同的酶切位点和保护碱基(如Pme I,Spe I);电泳检测目的条带,看大小是否正确,然后用试剂盒纯化PCR产物备用。主要采用了2 种方法进行序列突变及扩增,如下图所示:第一种方法:
第二种方法:
1.2 取1-2 μg纯化的目的片段或pMIR-REPORT载体,按酶切反应体系配制混合液进行酶切(加0.01% BSA),酶切3h后,80℃灭活5 min,冰上降温。酶切产物进行胶回收。
酶切体系连接体系Component V olume (μl) Component V olume (μl) H2O 16-x H2O 8-m-n
Vector or DNA x Vector m
NEB Buffer I或IV 2 DNA n
Spe I 1 10×T4 Ligase Buffer 1
Pme I 1 T4 DNA Ligase 1
Total voloume 20 Total voloume 10
1.3 配制连接反应混合液(DNA和Plasmid的molar ratio为3:1到6:1),16℃连接过夜或室温连接10 min。连接完毕后,将连接产物转化入感受态大肠杆菌(热激法)。Amp(100 μg/ml)抗性培养板筛选阳性克隆,菌落PCR鉴定目的片段,送3个样本测序,提取质粒酶切鉴定等。并扩繁阳性克隆。重组Luc-3’UTR 质粒主要元件和组成如下图所示(重组Luc-3’UTR-Mut 原理相同):
pLuc-MET 3'UTR 荧光素酶报告基因载体的构建
4.接种对数生长期的HEK293细胞(10% FBS+90% DMEM培养)于96孔板,3×103个/孔,每个实验组设置6个复孔,37℃,5% CO2培养箱中培养24h;
5.根据Lipofectamine 2000转染试剂说明书,配制转染液,转染HEK293细胞;
A 液B液
pLuc-3’UTR 0.1 μg Lipofectamine 2000 0.5 μl
pRL-SV40 0.05 μg OPTI-MEM 25 μl
Mimic/NC 100 nM终浓度
OPTI-MEM 25 μl
6 转染48 h后,吸除96孔板中的培养液,用ddH2O稀释Passive Lysis Buffer至1×浓度,在96孔板中加入1×Passive Lysis Buffer,20 μl/孔,用移液枪反复吸打裂解细胞;
7 在白色不透明的96孔板中加入100 μl/孔的Luciferase Assay Substrate;
8 从每孔裂解好的细胞悬液中吸出11.5 μl加入Luciferase Assay Substrate中混匀;
9 在酶标仪500 ms条件下检测,并记录数据;
10 用Stop & Glo® Buffer稀释Stop & Glo® Substrate至1×使用浓度;
11 在第7步完成后,加入Stop & Glo® Substrate 100 μl/孔,混匀;
12 在酶标仪500 ms条件下检测,并记录数据,两次测得数据的比值代表各孔样本的相对荧光强度。