国产全自动核酸提取仪的比较
国产全自动hiv-1核酸定量检测试剂盒的性能评价
剂盒相当的国产试剂盒迫在眉睫[8]。目前,国内 已有厂商自主研发了一些HIV-1核酸定量检测试 剂盒,并用于临床检测,但准确性、敏感性尚 不明确。本研究拟对国产全自动HIV核酸检测试 剂的主要性能进行评估,并与进口试剂进行比 对,探讨其临床应用的可行性。 1 材料和方法 1.1 样本
收集巴中市疾病预防控制中心2018年2—5 月210例临床样本,其中男127例、女83例,年 龄15~68岁。感染HIV-1的样本190例,非HIV-1 感染样本20例。所有样本均采用乙二胺四乙酸 二钾抗凝, 1 000×g离心15 min,吸取上层血浆 待测。所有样本均无重度溶血、变质及反复冻 融等情况。 1.2 仪器与试剂
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检验医学 2020 年 2 月第 35 卷第 2 期 Laboratory Medicine,February 2020,Vol. 35,No. 2
自东北制药集团辽宁生物医药有限公司。cobas AmpliPrep/cobas Taq-Man全自动核酸提取纯化 及实时荧光定量PCR检测系统购自瑞士罗氏公 司。待测试剂为NEPG全自动HIV-1核酸定量检 测试剂盒(简称国产NEPG HIV-1试剂,批号
2018001),购自东北制药集团辽宁生物医药 有限公司。参比试剂为cobas AmpliPrep cobas TaqMan HIV-1 Test v2.0试剂盒(简称进口HIV-1 试剂,批号Y06193),购自瑞士Roche公司。2 种试剂盒的技术参数见表1。
表1 国产NEPG HIV-1试剂和进口HIV-1试剂的技术参数
核酸提取方法 纳米磁珠法
纳米磁珠法
定量原理 内标定量
外标定量
1.3 方法 1.3.1 准确性 将灵敏度/定量参考品用参 考品稀释液稀释成低(5.0×102 IU/mL)、中 (5.0×103 IU/mL)、高(5.0×104 IU/mL)3个 浓度,采用国产NEPG HIV-1试剂检测,每个浓 度重复检测3次,计算均值。将检测结果用lg函 数转换成对数值。绝对偏差=测定结果均值的对 数值-预期值的对数值。根据我国医药行业标准 YY/T 1182—2010中的要求,绝对偏差≤±0.5个 对数数量级为符合要求。 1.3.2 灵敏度 将灵敏度/定量参考品用参考品 稀释液稀释至200、100、50、25 IU/mL,采用 国产NEPG HIV-1试剂检测,每个浓度重复检测3 次,计算可检出浓度。 1.3.3 对照试验 分别采用待测试剂和参比试 剂双盲检测同份一血浆样本,评价2种试剂的符 合率和一致性。待测试剂的定性结果判断:如 果扩增曲线不呈现S型曲线或循环阈值(cycle threshold,Ct)为0,同时内标检测为阳性,报 告为HIV-1 RNA阴性;除此之外,其他情况加上 内标检测为阳性均判定为HIV-1 RNA阳性。 1.3.4 单位换算 根据基于核酸技术的HIV-1 RNA世界卫生组织第1代国际标准品(NIBSC 97/656)[9],1拷贝/mL相当于1.67 IU/mL。 1.4 统计学方法
全自动核酸提取仪器及试剂对比
/show1equip.asp?equipid=347691 7
ROCHE 全自动核酸提取工作站
cobas AmpliPrep
/products/Pages/COBASAmpliPrep.aspx
8
简化样本制备 cobas® AmpliPrep分析仪使整个样本提取 过程自动化。手工操作步骤仅限于样本 加载和卸载,试剂装在密封且带有条码 标签的即用型试剂盒(专利设计)中, 使试剂数据输入更快速准确。
定性和定量结果 cobas® AmpliPrep分析仪为定性和定量分 子诊断提供了整合的自动化样本制备系 统。
高通量 最多可在系统上同时加载72个样本和3种 不同的测定。
磁珠提取技术 cobas® AmpliPrep分析仪能净化PCR所需的 RNA或DNA靶标。
仪器比较
厂家 圣湘 复星 天隆
仪器 The NatCH 64 system SuperPure System-32
NP968
通量 64 32 32
/show1equip.asp?equipid=368483 4
天隆科技 半自动核酸提取仪
产品型号 处理体积 样品通量 磁珠回收效率
加热温度
振荡混合 试剂种类 操作界面
内部程序
计算机接口 程序管理
NP968
污染控制 处理时间 产品外形尺寸 重量 使用电源 操作温度范围 操作湿度范围
9
试剂比较
厂家
圣湘 复星 QIAGEN
雅培
罗氏 PerkinElmer
检测下限 (IU/ml)
10 15 10.2
10 15 20 20
线性范围 (IU/ml) 20~2x109 100~109 31.6~2x107
Stream SP96全自动核酸提取仪招标参数(1)
Stream SP96全自动核酸提取仪性能参数1.工作模式:全自动加样& 核酸提取& PCR反应体系加样2.提取方式:磁珠提取技术,批量、单样同步处理3.单次移液范围:1μL~1000μL4.工作体积:20~1000uL;样本体积:支持双倍样本提取,适用体积20μL~700μL 5.处理通量:1~96个样本6.提取速度:96样品/60分钟7.PCR位:最大3*96孔PCR位,可放置288人份PCR管8.单人份提取:支持单人份提取,避免试剂耗材浪费9.具备空气过滤系统,排风系统排气流量≥100m3/h10.具备UV紫外消毒系统,紫外线灯辐照强度≥95uW/cm211.具备样本条码扫描功能,样本条及条码扫描状态指示灯指示功能;12.具有液面探测功能,有效穿透气泡干扰层进行吸液;13.核酸污染安全防护:核酸提取区、样品试剂分配区严格物理分,提取区可封闭工作;14.双独立提取模块,两个提取模块可同时运行不同提取流程提取核酸;15.枪头丢弃位置可用防污导料套,具备独立密闭的垃圾桶存放空间;16.具备气压、湿度、温度和加样修正功能;17.具备温度设置不超过沸点保护功能(防止试剂沸腾),保护温度可根据海拔(气压)修正;18.异常报警:具备声光指示运行状态和报警功能、枪头堵塞及凝块报警功能异常报警,在试剂、耗材不足报警提醒,并可进行添加。
19.试剂冷藏(可选配):温度2℃-8℃,自动密封,避免冷凝水稀释试剂20.独立冷藏模块(可选配):2组96*2独立模块,同时可放置9组PCR试剂或288人份的PCR管21.显示器支架(可选配):万向支架22.加样准确性:加样量为20~100 uL时,误差不超过±1% ;加样量为100~1000 uL时,误差不超过±0.8%23.加样重复性:变异系数不超过0.8% (≥20uL)24.提取温度控制范围:室温~99℃25.XYZ机械臂运动精度:≤0.1mm26.具备安全门锁功能;27.具备双向LIS或HIS系统通讯功能;28.输入电源:100~220V 50Hz29.额定功率:1850VA30.工作温度范围:10℃~30℃31.工作湿度范围:≤80%32.重量:250kg33.外形尺寸(长×宽×高):1300mm×745mm×1707mm。
关于全自动核酸提取仪的优点都有哪些
关于全自动核酸提取仪的优点都有哪些随着科技的不断进步,现代医疗越来越依赖于分子生物学技术。
其中,核酸提取是基础而重要的步骤。
传统的核酸提取方法需要大量的人工操作,耗费时间和人力,而且操作过程中容易发生交叉感染的风险。
全自动核酸提取仪的出现,为核酸提取带来了翻天覆地的改变。
那么,全自动核酸提取仪有哪些优点呢?1. 高效快捷全自动核酸提取仪减少了繁琐的人工操作,节省了时间和人力成本。
整个核酸提取的过程在机器内部完成,无需操作人员亲自参与。
一旦样本加入到提取卡带中,全自动核酸提取仪就能够自动完成样本的提取、纯化和浓缩等工作,时间只需要几小时,甚至更短。
此外,全自动核酸提取仪还可以实现高通量的核酸提取,单次可以处理多个样本,大大提高了工作效率。
对于检测几千份样本的实验室来说,全自动核酸提取仪的效率是不可替代的。
2. 提取质量高全自动核酸提取仪在操作过程中,可以严格控制各个条件,使提取的核酸质量非常高。
仪器可以通过微调样品、缓冲液、磁珠等的浓度,以及加热、震荡等参数的设置,优化核酸提取的效果。
相比传统的手工提取方法,全自动核酸提取仪可以避免人为操作时产生的误差和不稳定性,从而提高提取的质量和纯度。
3. 降低操作风险全自动核酸提取仪的另外一个优点是大大降低操作风险。
传统的核酸提取过程中,操作人员需要进行许多繁琐的步骤,包括样品的移液、离心、吸液、加磁珠等,操作过程中很容易受到污染和误操作的影响。
在一次实验中,误操作有可能导致大量样品或关键试剂的浪费,而且还可能交叉感染。
相比之下,全自动核酸提取仪可以降低误操作的风险。
它把整个核酸提取流程封装在一个系统中,减少了对操作人员的依赖程度。
样品加入卡带后,整个提取过程在机器内部完成,操作人员接触样品的时间减少了很多。
这降低了污染和误操作的风险,提高实验的成功率。
4. 高度自动化全自动核酸提取仪可以高度自动化,减少了人工精度和疲劳对实验结果的影响。
几乎所有的步骤都由机器自动完成,例如样品输入、磁珠分离、洗涤等,只需要按照菜单的操作步骤即可。
核酸提取仪的原理、分类及几种核酸提取仪的比较-科邦实验室
核酸提取仪(Nucleic Acid Extraction System)是应用配套的核酸提取试剂来自动完成样本核酸提取工作的仪器。广泛应用在疾病 控制中心、临床疾病诊断、输血安全、法医学鉴定、环境微生物检测、食品安全检测、畜牧业和分子生物学研究等多种领域。
只配套 QIAGEN 离心柱相关试剂
盒,成本高
震荡加热模块
离心柱法,粘 稠样品和组织
容易堵柱子
组织需要预 先研磨过夜
消化
20-30 元
预消化 5 小时 或者过
夜
分类: 1. 根据仪器型号大小不同划分
1) 自动液体工作站 自动液体工作站是功能非常强大的设备,液体分液、吸液等自动完成,甚至能通过整合扩增、检测等功能,实现标本提取、扩增、 检测全自动化。提取核酸只是其功能的一个应用,不太适合常规实验室提取核酸,一般都应用在单一类标本并且一次提取标本量非常 大(至少 96 个,一般几百个)的实验需求上。自动工作站的平台建立及平台的运作,需要比较大的资金。 2) 小型自动核酸提取仪 小型的自动化仪器是通过运行结构的特殊性来达到自动提取核酸的目的,可以在任何实验室得到应用。 2. 根据提取原理不同划分 1) 采用离心柱法的仪器 离心柱法核酸提取仪主要采用离心机和自动移液装置相结合的方法,通量一般在 1-12 个样本,操作时间和手工提取差不多,并不 能提高实际工作效率,且价格昂贵,不同型号仪器的耗材也不能通用,仅适合经费充足的大型实验室使用。 2) 采用磁珠法的仪器 以磁珠为载体,利用磁珠在高盐低 PH 值下吸附核酸,在低盐高 PH 值下与核酸分离的原理,再通过移动磁珠或转移液体来实现核 酸的整个提取纯化过程。由于其原理的独特性,所以可设计成很多种通量,既可以单管提取,也可以提取 8-96 个样本,且其操作简单 快捷,提取 96 个样本仅需 30-45min,大大提高了实验效率,且成本低廉,因而可以在不同实验室使用,是目前市场上的主流仪器。
全自动核酸提取仪技术参数
全自动核酸提取仪技术参数1.工作条件1.1电源要求:220V±10%,50Hz1.2环境要求:室内温度10~30℃,相对湿度10~80%2.技术参数要求2.1 适用范围:植物组织、种子等样本中核酸的自动化提取工作,同时具备PCR 反应体系建立功能;2.2适用样品:植物组织、种子;*2.3工作原理:磁珠法分离原理,底部吸附或侧壁吸附;2.4样品通量:1—96通道可选;*2.5试剂、耗材类型:开放性;*2.6 液体处理模块:8通道空气活塞加样器,兼具单通道功能;2.7 模块化配置:具有加热、制冷、震荡、真空吸废装置;*2.7.1温度范围:25-65℃;*2.7.2振荡速度:具有震荡混匀功能,速度可调;2.8移液体积/内部操作方式:通过转移磁珠或者转移液体(移液体积1-5000µL)完成操作;2.9 移液精度:移液精度(CV值): 20~200μL ≤1%,5~20μL ≤2%,1~5μL ≤5%;2.10 机械臂精度:模块式机械臂,定位准确到0.05mm,保证使用标准96孔板;2.11抽提样品量:20~400µL;2.12洗脱体积:20~200µL;2.13洗脱装置:具备加热洗脱装置;*2.14 安全防护:封闭式工作站,高效过滤和紫外灯灭菌达到分子生物学实验要求;*2.15具备PCR反应体系建立功能3.配置要求3.1基本配置要求全自动核酸提取仪,机械臂, 组合液体处理模块, 移盘机械手,模块化盘面, 真空吸废器, 加热震荡器, 普通震荡器,棒状磁盘和96孔圆底磁盘,电控试剂冷槽,8通道Tips盒(for 20, 50, 200 µL),单通道Tips盒适配器(for 20, 50, 200 µL),6道试剂槽,安全装置(高效过滤、UV外罩、UV灯、UV灯开盖控制门联锁、提供无菌风过滤装置、电子遥控器等),PCR适配器,启动工具包(10盒 20uL 灭菌 tips,10盒 50uL 灭菌 tips,30 盒 200uL 灭菌 tips,10个12道深试剂槽,250X7mL 旋盖离心管, 100x50 mL NAP 旋盖离心管,20x125 mL NAP 旋盖离心管),水平仪、定位适配器,96孔定位盘,96真空吸废器装脱Tips装置,100次提取试剂。
全自动核酸提取仪标准
全自动核酸提取仪标准全自动核酸提取仪标准介绍•全自动核酸提取仪是一种用于从样品中提取核酸的高效设备;•核酸提取是分子生物学研究的重要步骤,也是疾病诊断和基因检测的关键步骤之一;•全自动核酸提取仪的标准是确保提取过程的准确性、一致性和可重复性。
核酸提取的重要性•核酸提取是从生物学样本中分离出核酸分子的过程;•核酸提取对后续的PCR扩增、测序等实验具有决定性影响;•核酸提取的质量和纯度直接影响后续实验的结果准确性。
全自动核酸提取仪标准的必要性•标准化的核酸提取过程可以确保提取结果的准确性和可靠性;•核酸提取仪的标准化可以提高实验室内不同操作者之间的一致性;•标准的验证和认证流程可以帮助生物实验室选择合适的核酸提取仪设备。
全自动核酸提取仪标准应包括的要点1.提取效率标准:–标准化的样品输入量和提取产量;–提取效率的变异系数限制;–提取过程中的样品损耗限制。
2.纯度要求:–核酸提取后的杂质含量要求;–蛋白质、RNA和DNA的污染限制;–标准化的纯化步骤和方法。
3.自动化程度:–提取过程中是否需要人工干预的限制;–是否具备自动化的样品处理功能;–自动化控制的准确性和稳定性要求。
4.流程验证和认证:–核酸提取仪的性能测试标准;–设备使用前的校准和验证要求;–核酸提取仪的质量管理体系要求。
结论全自动核酸提取仪标准的制定和遵守对于保证核酸提取的准确性和可靠性至关重要。
标准化的提取过程可以提高实验结果的一致性,并推动生物领域的科学研究和临床应用。
通过制定合理的标准和认证流程,我们能够选择到合适的核酸提取仪设备,为科学研究和医学诊断提供可靠的支持。
(自动)核酸提取仪关键性能评价
(自动)核酸提取仪关键性能评价发布时间:2023-01-16T08:39:38.888Z 来源:《中小学教育》2022年18期作者:张进辑[导读] 本文将详细介绍自动核酸提取仪的操作流程与提取原理,通过专业的调查与研究,精准找出仪器内部关键性能的指标评价,对仪器评价与项目评价实行科学分析,有效增强核酸提取仪的使用效果。
张进辑中检西南计量有限公司云南昆明 650200摘要:本文将详细介绍自动核酸提取仪的操作流程与提取原理,通过专业的调查与研究,精准找出仪器内部关键性能的指标评价,对仪器评价与项目评价实行科学分析,有效增强核酸提取仪的使用效果。
关键词:关键性能;项目评价;核酸提取仪引言:为更好地控制核酸提取仪中的内部关键参数,需恰当了解该仪器的内部构造,明确不同仪器的提取方式,再根据实际情况改善仪器提取状态,增强仪器评价的准确性,为此后更多提取物质的研究打下坚实基础。
1自动核酸提取仪的操作流程与提取原理1.1操作流程若想明确自动核酸提取仪中的关键性能指标,需确认该类仪器的操作流程。
首先,要利用自动核酸提取仪开展裂解释放工作,使磁珠特异结合,提升提取效果。
其次,还要开展核酸与磁珠复合物洗涤,利用该项举措来洗脱核酸。
最后,需在试验下游开展对应性质量检测工作。
在明确了自动核酸提取仪的操作步骤后,需将操作流程划分成多个层次。
比如,可全面查询自动核酸提取仪的不同类型,依照其对应型号来规范操作模式。
针对雅培M200sp仪器来说,其采用的模式为单个管子、转移液体;而针对Ezbead仪器而言,其需采取多个管子、转移磁珠等模式,要依照不同的实验室环境来观察对应仪器的操作状态,科学设计操作模式与过程。
1.2提取原理在明确了自动核酸提取仪的操作内容后,还要找出仪器提取原理,借助对该项原理内部元素的判断,增强对该类仪器关键指标的控制。
比如,当前自动核酸提取仪的提取原理主要有柱提分离与磁珠分离,而磁珠分离原理较为常见。
确认磁珠分离的原理前,要找出磁珠结构,该结构中包括有机高分子、磁性无机粒子,利用合适方法将分子粒子有机结合,继而使该结构带有磁性[1]。
全自动核酸提取仪技术参数
全自动核酸提取仪技术参数嘿,大家好!今天咱们来聊聊全自动核酸提取仪,这可是个了不起的玩意儿哦!说到核酸提取,可能有的人就开始挠头了,核酸是什么?提取干嘛?别担心,今天我就带你们轻松了解这个神奇的小机器。
全自动核酸提取仪就像厨房里的搅拌机,能把原材料变成你想要的东西。
想象一下,咱们在实验室里,需要从样本中提取DNA或者RNA,传统的方法那可真是麻烦得很,手动操作还得小心翼翼,搞得像是在玩高难度的魔方。
可是,有了这个全自动的小家伙,整个过程简直就像开了挂!它能把繁琐的步骤统统自动化,让科研人员省时省力,心情也跟着好起来。
这仪器的技术参数,别说,还真是让人眼前一亮。
它的提取效率高得惊人,样本处理量大,像流水线一样,一下子就能搞定好多样本。
操作界面友好得很,像是在玩游戏一样,轻轻一点,仪器就乖乖开始工作。
它不仅速度快,而且提取的结果也特别纯净,基本上可以说是高质量的保证。
要知道,在科学研究中,质量可是一条命啊,差一点都不行。
这仪器的体积也挺小巧的,放在实验室里简直不占地方,关键是颜值也不低,简直就是实验室的“高颜值”代表。
它有各种模式可以选择,适应不同的实验需求。
简直是科研工作者的好帮手。
嘿,有时候我都想,它是不是有自己的小情绪,感觉它在帮我们加油,努力工作呢!说到安全性,大家可能会担心这些高科技的东西会不会出错。
放心吧,这个全自动核酸提取仪可是经过多重测试的,稳定性杠杠的。
就像你信任的老朋友一样,虽然长得比较复杂,但绝对不会给你添麻烦。
而且它的清洗和维护也很简单,简直不费吹灰之力。
真心觉得,这机器就像是个勤劳的小蜜蜂,工作再忙也不怕。
当然了,使用全自动核酸提取仪的好处可不仅仅是提取效率高、操作简单。
它还能减少人为操作带来的误差,这在科研领域可是个大大的加分项。
大家都知道,科研就是一个对数据精益求精的过程,哪怕是一点小差错,都可能影响整个实验的结果。
有了这台仪器,简直就像是为科研保驾护航,心里踏实多了。
国内外核酸自动提取仪常见品牌分类及特点
中国医疗核酸检测行业自动化进程及国内外核酸自动提取仪常见品牌浅析国内在核酸检测方面的自动化进程尚且远远落后于美国日本等国,很多医院仍然在进行手动提取检测的模式。
因为大多数核酸检测的目的基因是HBV、HCV、HIV等传染性病毒,这种检测方法大大增加了一线操作人员的感染风险,且工作效率低下,无法完成大量样本的快速检测。
目前国内医疗资源紧张,很多病人都反映在医院看病难,速度慢,等待时间长,价格贵等等。
这和我国医疗机构的自动化进程普遍较低也有关系。
试想,一个熟练的核酸提取及检测人员每次仅能进行20~30个样本的提取检测,每次提取需要1~2个小时,面对数以千记的需要检测的病人,想要完成检验,要么需要很长的时间,要想缩短时间,就要大量增加人手,显然就会增加医疗成本。
要解决这些问题,推动国内医疗检测行业的自动化进程是非常有必要的。
要推进核酸检测类别的自动化进程,就需要引入自动化仪器,目前国内外很多仪器厂商都致力于生产开发改进核酸自动提取仪。
国外主流品牌有以下几个:贝克曼库尔特SPRI-TE作为小型化的自动提取,提供高质量,高效率,可重复的磁珠核酸提取,专门为小实验室设计。
Vidiera NsP则更倾向于血站,CDC,大型医院实验室等大客户。
贝克曼库尔特是提供和QIAGEN签约的extraction reagents,而且提取的核酸可以同LightCycler,* Cobas* Taqman* or 96-well Thermowell Plate等联用去做定量检测的结果。
产品性能:SPRI-TE自动化处理1-10个样品即开即用的试剂UV去除污染Vidiera NsP全自动样品提取96 样本提取需要2.5小时阳性样本追踪预制样本提取和用户定义样本提取雅培雅培m2000系统是由雅培加拿大公司研发成功的,旨在用于医学诊断实验室样品的自动提取,可以和m2000 rt联用。
目前可以应用的检测有RT HIV-1, RT HBV, RT HCV 和RT CT/NG。
QIAcube全自动核酸提取仪技术参数
QIAcube技术参数1、主要用途:1)可从动物,植物组织,全血中的白细胞组分及以下法医特殊检材中纯化总DNA(基因组DNA和线粒体DNA):表面和口腔拭子,FTA和Guthrie,体液斑,口香糖,烟蒂,指甲和毛发,纸质材料,小体积血液或唾液,组织,激光显微切割标本,骨头和牙齿,性侵犯样品等;*2)可对性侵犯混合样本进行精子细胞和女性上皮成分全自动化差异洗涤,得到单一男性组分;3)可对STR产物进行净化,达到纯化和浓缩STR产物的目的,进而大幅度提高毛细管电泳步骤中检测的信噪比。
2、工件条件:温度:18-28℃,湿度:15-75%,电压:220-240V。
3、技术指标:1、*基于硅胶膜离心法的全自动样品制备装置。
可实现样品裂解、裂解液转移、离心柱清洗、洗脱液回收等实验步骤的全自动操作,无需人工介入;2、无需专用的自动化试剂盒,只需普通手工试剂盒即可实现自动化;3、*有专门应用于法医领域的体液和血液、法医案件、FTA及Guthrie卡、表面及口腔拭子等检材纯化程序;4、*有专门针对性侵犯混合斑检材的全自动化处理程序,无需手工进行女性成分洗涤去除工作;5、每次可对1-12个样品进行纯化,样品数目可按需设置;6、内置控制系统,无需电脑;7、程序的选择和设置通过触摸屏完成;8、*配备自动裂解模块,具有加热和震荡功能,最高加热温70℃,兼容圆底离心管和锥形底离心管;9、配备自动离心模块,离心机安全盖可自动开合;10、配备自动液体转移机械臂,可使用一次性带滤芯枪头进行液体转移;配备离心柱转移机械臂,可对离心柱进行夹放、旋转、丢弃操作;11、*配备光学感应器和超声液面探测器,能够自动感应检查样品数目、移液枪头数目、移液枪头类型、离心管数目及摆放状态、试剂液面高度等,防止人为摆放错误;12、预装有各种应用的纯化程序,并可通过网络免费下载不断开发的新程序,使用USB接口导入仪器中,并可根据客户要求订制程序;13、带有安全保护门,全封闭运行,防止样品污染及保护人身安全;14、维护简单,内置向导型维护程序,方便用户自行操作。
国产华大智造测序仪与进口illumina、life测序仪比较
华大智造测序仪与 illumina、life 测序仪比较目前在病原微生物鉴定的检测领域,各家单位主要使用的测序仪器厂家和机型主要有华大智造(MGISEQ-200、MGISEQ-2000)、Illumina(Miseq、Nextseq 500 系列)和Life(Proton、S5)。
华大智造测序仪与illumina、life 相比较,优势主要体现在以下几个方面:测序原理和测序质量、仪器产能和灵活性、仪器在临床检测上的适用范围等几个方面,下面具体给老师展开介绍以下。
一、测序原理和测序质量图 1:华大智造DNBSEQ TM 技术特点华大智造测序仪采用领先的测序技术,DNBSEQ TM 技术主要包括DNA 单链环化和DNB 制备、规则阵列芯片、DNB 加载、cPAS 联合探针锚定聚合技术、双端测序技术、碱基识别算法等。
DNBSEQ TM 具有高准确性、低重复序列率、低标签跳跃的重要特性(详见图1)。
优势 1:扩增原理上相当于始终原始DNA 模板进行复制,有效避免了传统的PCR 测序方法中出现的复制错误积累,测序准确度更高。
优势2:规则阵列芯片可以有效的避免测序时相邻DNB 之间荧光信号的干扰,测序质量更高,产出更稳定。
优势3:华大智造测序仪基本无标签跳跃(index-hopping)的问题,可以有效的避免测序的不同样本之间的交叉影响,可以有效的提高样本检出率。
Illumina 测序仪采用的是桥式PCR 扩增技术,扩增时容易引入扩增错误累积,导致测序精确度降低;此外,Miseq 和Nextseq 系列的测序芯片为非阵列排布芯片,测序时Cluster 在芯片上散乱的生长,相邻Cluster 之间荧光信号容易相互干扰,影响测序质量和测序数据产出。
Life 测序仪采用的是半导体测序原理,测序速度相对较快,但是建库流程非常繁琐耗时;半导体测序原理对连续5 个以上相同碱基序列检测不准确,导致整个测序质量比较低,对测序结果影响很大。
全自动核酸提取仪工作原理
全自动核酸提取仪工作原理一、引言全自动核酸提取仪是一种高效、精确的实验设备,广泛应用于生物医学领域的核酸提取过程中。
它通过自动化的方式,实现了对样本中的核酸进行提取和纯化的过程,大大提高了实验效率和准确性。
本文将主要介绍全自动核酸提取仪的工作原理。
二、工作原理全自动核酸提取仪主要由样本处理模块、核酸提取模块、洗涤模块、干燥模块和存储模块组成。
其工作原理可以概括为以下几个步骤:1. 样本处理:将待提取的样本放入样本处理模块中,通过特定的方法,如离心或超声波处理,使样本中的细胞或病毒破裂,释放出核酸。
2. 核酸提取:经过样本处理后,样本中的细胞或病毒溶解,核酸溶液与提取试剂混合后形成复合物。
核酸提取模块中的磁珠吸附这些复合物,并通过磁力的作用将其沉降到底部。
3. 洗涤:经过核酸提取后,为了去除杂质和残留的试剂,需要进行洗涤步骤。
洗涤模块中的洗涤缓冲液与磁珠上的核酸复合物结合,然后通过磁力的作用将洗涤液吸附到底部,将杂质和残留的试剂去除。
4. 干燥:洗涤后的核酸复合物需要去除液体,以便进行后续的操作。
干燥模块中的干燥缓冲液与磁珠上的核酸复合物结合,然后通过磁力的作用将液体吸附到底部,使核酸复合物干燥。
5. 存储:经过干燥后的核酸复合物可以长时间保存。
存储模块中的稳定液与核酸复合物结合,形成稳定的复合物,以便后续的分析和实验。
三、优势与应用全自动核酸提取仪具有以下优势和应用:1. 高效性:全自动核酸提取仪可以同时处理多个样本,大大提高了核酸提取的效率。
相比手工操作,其处理速度更快,且结果更准确可靠。
2. 准确性:全自动核酸提取仪通过精确的控制和自动化的操作,可以减少人为操作的误差,提高核酸提取的准确性。
3. 灵活性:全自动核酸提取仪可根据不同的实验需求和样本特点进行调整和优化,适用于不同类型的核酸提取。
4. 应用广泛:全自动核酸提取仪广泛应用于医学、生物学、遗传学等领域的核酸提取过程中。
例如,在临床诊断中,可用于病毒核酸的提取和检测,以帮助医师进行疾病的早期诊断和治疗。
《(自动)核酸提取仪校准规范》征求意见稿发布
《(自动)核酸提取仪校准规范》征求意见稿发布随着生物分子工作领域的飞速发展,相关分离纯化工作量也逐渐增加,对核酸提取仪的应用也更加广泛。
基于此,近日,全国生物计量技术委员会发布了《(自动)核酸提取仪校准规范》征求意见稿,并面向全国的并面向全国的计量技术机构、科研院所以及相关的行业企业征求意见。
核酸提取仪,是应用配套的核酸提取试剂来自动完成样本核酸的提取工作的仪器。
主要分为两类:一类是大型的自动化的,一般称为自动液体工作站;另一类是小型自动核酸提取仪,利用封装好的配套试剂自动完成提取纯化过程。
相较于大型自动液体工作站,小型自动核酸提取仪具有仪器设备和运行成本低、操作方便优势,现如今得到越来越多的应用。
现如今,几乎在每个实验室,与生物分子相关的分离纯化共作都是十分重要,且必不可少的,但要对多个样品进行纯化还是相当困难的,不仅需要选择合适的纯化技术,而且工作量也特别大,很难满足当前飞速发展对高通量样品进行提取纯化的需求。
而自动核酸提取仪是一套高通量、高灵敏度的自动核酸纯化提取设备,应用配套的核酸提取试剂来自动完成样本核酸的提取工作的仪器,灵活、高效、结果稳定、成本低,成为这一实验过程中必备的仪器设备,具有重要作用。
为进一步规范其应用,精确技术参数要求,使其能高效的满足分离要求,《(自动)核酸提取仪校准规范》征求意见稿成功发布。
该规范的编制基于(自动)核酸提取仪的主要技术参数实验测试的基础上,参考了JJF1527-2015《聚合酶链反应分析仪校准规范》,依据《JJF 1071-2010 国家计量校准规范编写规则》、《JJF 1059.1-2012测量不确定度评定与表示》完成本规范的制定。
作为首次发布的规范,它主要适用于(自动)核酸提取仪的校准。
该仪器设备其原理是利用一定的温度、振动等条件对样本进行破碎、纯化和提取,其系统组成主要由温控系统、取液装置、振荡装置和分离纯化系统组成。
配合提取单个标本的独立分装试剂,操作过程中,只需要加入标本动作,仪器自动完成提取纯化的全过程,不需要加入提取过程中所需要的试剂过程,是真正得到应用的小型自动核酸提取仪。
两种HBV DNA定量检测方法的临床对比研究
两种HBV DNA定量检测方法的临床对比研究王爽;王雅杰;郭杰;王大刚;时景仁;潘美晨;殷商启;何超男;孟欢;张响【摘要】目的比较某国产实时荧光定量PCR试剂(后称国产试剂)与某进口(后称进口试剂)检测乙型肝炎病毒(HBV)DNA的定量的结果.方法根据进口试剂检测结果抽取514份慢性乙型肝炎的血浆标本,采用国产全自动核酸提取仪和PCR高敏试剂进行HBV DNA定量平行检测,以分析国产试剂的检测情况和与进口试剂的结果差异和相关性.结果进口试剂和国产试剂的阳性检出率分别为77.2%和78.5%,不符合率分别为7.2%和8.6%,两者无明显差异;Spearman相关分析显示,两种试剂检测的HBV DNA在20~1.7×108 IU/mL区间内检测结果的相关系数(r=0.966,P<0.0001),表明二者具有较强的相关性;Bland?Altman分析2种方法检测病毒载量的差异分析显示结果具有较高的一致性.结论国产高敏试剂和进口试剂,检测血浆HBVDNA在20~1.7×108 IU/mL的病毒载量结果具有较好的相关性和一致性.【期刊名称】《分子诊断与治疗杂志》【年(卷),期】2019(011)005【总页数】5页(P374-378)【关键词】乙型肝炎病毒DNA;荧光定量PCR;病毒载量;一致性【作者】王爽;王雅杰;郭杰;王大刚;时景仁;潘美晨;殷商启;何超男;孟欢;张响【作者单位】首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015;首都医科大学附属北京地坛医院检验科,北京,朝阳100015【正文语种】中文在目前全球面临的最严峻的公共卫生问题中,乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是最大的问题之一,目前全球慢性感染者逾2.57 亿人,每年死亡88.7 万人,其中约25%死于肝癌或肝脏相关并发症[1]。
两种全自动核酸检测系统对乙肝核酸检测性能的比较
两种全自动核酸检测系统对乙肝核酸检测性能的比较乙肝核酸检测是指通过检测患者体内是否存在乙肝病毒DNA分子来判断患者是否感染了乙肝病毒,因此是乙肝病毒感染的一种重要监测手段。
近年来,全自动核酸检测系统的出现,极大地提高了乙肝核酸检测的准确性和效率。
本文将就两种全自动核酸检测系统(Roche Cobas® 6800和Daan Gene Co. LTD.)对乙肝核酸检测性能进行比较。
一、技术原理Roche Cobas® 6800系统采用磁珠法提取核酸,PCR荧光探针技术进行扩增和检测,具有试剂消耗少、操作简便等优点。
Daan Gene Co. LTD.则采用非细胞裂解法提取核酸,荧光PCR技术进行扩增和检测,实现了从血浆中检测出100个拷贝/毫升的乙肝病毒DNA,从而能够检测到更低的病毒载量样本。
二、检测效能两种系统对于不同浓度样本的检测效能均较高,但Roche Cobas® 6800系统在样本浓度较低时表现更优。
相对灵敏度为10 ~10,000 IU/mL,通过内部控制质量确认体现测试的准确性,能够对阳性样本20万份以上的快速检测,检测时间约为3~4.5小时。
三、试剂耗材Roche Cobas® 6800系统试剂耗材相对消耗较少,有较佳的反应批内控制效果,但价格较昂贵。
Daan Gene Co. LTD.系统试剂耗材相对较多,但价格较为实惠,易于采购。
四、系统特点Roche Cobas® 6800系统具有自动化程度高、开放式检测质量好的特点,可以自动监测和分析数据,并提供算法灵活性,如:定制病毒载量分析范围、定制质量控制范围等;Daan Gene Co. LTD.系统具有高通量、成本低、可扩展性好等优点,可适用于临床大规模筛查等领域,同时仪器维修方便成本低,性能较稳定。
综上,Roche Cobas® 6800系统适用于病毒载量较高的样本检测,并且具有较高的自动化程度;而Daan Gene Co. LTD.系统适用于病毒载量较低的样本检测,成本实惠,适用范围较广。
艾康NSE-32全自动核酸提取仪标准操作规程
版本号:1 修订号:0 页码:Page 1 of 3生效日期:2020年07月01日B10.艾康NSE-32核酸提取仪标准操作规程1 仪器简介及工作原理1.1 仪器简介:NSE-32核酸提取仪,生产厂家为艾康生物技术(杭州)有限公司,样品通量最多为32个,具有高度自动化、专业方便的操作界面、安全的防护设计等特点。
1.2 工作原理:在裂解液(含有蛋白酶K)中依次加入样本、磁珠,在加热及机械振动的情况下,将样本裂解,使核酸从样本中释放并吸附到磁珠表面,利用磁棒及磁棒套将磁珠转移并充分洗涤,得到纯净的核酸。
2 仪器运行环境2.1 仪器放置于PCR室样本制备区,本区要求相对负压。
2.2 额定电压/电源频率/额定功率:220V/50Hz/600W。
2.3 工作环境温度:5℃~40℃。
2.4 工作环境相对湿度:<90%(不结露)。
3 授权操作人具有PCR上岗证并经本岗位培训合格的人员。
4 仪器操作程序4.1样品的前处理:不同样品的前处理,应严格按核酸提取试剂盒中的操作说明进行。
4.2操作步骤4.2.1按照试剂盒说明书向96孔板中加入样本及试剂。
4.2.2开机:打开仪器后部的电源开关按钮,待仪器完成自检,运行至准备状态,选择核酸提取程序。
4.2.3放置96孔深孔板:将96孔深孔板板按正确位置(A位朝左侧)小心缓慢地放置在提取槽内。
4.2.4安装磁棒套:手握住磁棒套的手柄,将磁棒套从包装中取出后,将磁棒套插入磁棒架上。
往里轻推,直至听到“咔嗒”一声,表示磁套已完全插入沟槽中。
4.2.5关上前盖,以避免环境的污染。
4.2.6按照说明书选择核酸提取程序,按“运行”键开始运行。
4.2.7程序运行完毕后取出96孔深孔板和磁棒套,立即通过移液器将洗脱下来的核酸溶液转移到反应管中用于后续扩增实验,也可置4℃暂时或-20℃长久保存。
4.2.8 仪器工作结束,按右下角返回键,点击右上角“开启紫外灯”(默认30分钟);本仪器使用的是波长为254nm,光功率为8W的紫外灯管。
全自动核酸提取仪介绍
陈晓东 jycxd@
1953
1956
1990
1993
免疫磁珠法
从经典方法到硅膜吸附法、磁珠分离法
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从手动到全自动
核酸纯化方法比较
酚氯法 纯度 较高 高盐沉淀法 低 硅介质柱 高 离子交换 高 磁性分离 高
方法稳定性
技术要求 有机试剂 操作时间 规模化 多步离心 自动化
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产品型号 处理体积 样品通量 磁珠回收效率 磁棒 加热温度 振荡混合 磁珠大小 试剂种类 操作界面 内部程序 计算机接口 程序管理 污染控制 操作时间 网络通讯 产品外形尺寸 重量 使用电源 操作温度范围 操作湿度范围
核酸提取仪NP968 20uL-1000uL 1-32 >95% 32 裂解加热温度:室温-120℃ 洗脱加热温度:室温-120℃ 多模式多档可调 > 1um 磁珠法试剂 中文操作系统,彩色液晶屏触控操作 内建15组模式程序(可存储 >500组程序) USB 新建、编辑、删除模式程序,自由灵活编辑提取程序 内置紫外消毒模块 30~60分钟/次 可扩展以太网远程控制 40cm×42cm×47cm 25Kg AC110~240V 50Hz/60Hz 1000VA 10℃~40℃ 低于80%
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硅胶膜法:可用于手工提取,也可用于自动化提取
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磁珠分离法:一般用于自动化提取
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全自动磁珠法核酸提取
全自动磁珠法核酸提取引言:核酸提取是分子生物学研究中的重要步骤之一,它能够从生物样本中分离出纯净的核酸,为后续的实验操作提供可靠的基础。
全自动磁珠法核酸提取技术是一种高效、快速、准确的核酸提取方法,具有很高的应用价值和发展前景。
一、全自动磁珠法核酸提取技术的原理全自动磁珠法核酸提取技术是基于磁珠和磁力的原理进行的。
磁珠是一种具有磁性的微小颗粒,能够与核酸等靶分子特异性结合。
该技术利用磁珠在磁力场中的响应特性,通过磁力的作用将目标核酸从样本中分离出来。
全自动磁珠法核酸提取技术结合了磁珠的高特异性结合能力和磁力的精确控制,能够实现高通量、高效率的核酸提取。
二、全自动磁珠法核酸提取技术的步骤1. 样本处理:首先需要对样本进行预处理,包括离心、裂解等步骤,以获得可用于核酸提取的样本溶液。
2. 磁珠结合:将磁珠与样本溶液混合并充分搅拌,使磁珠与目标核酸结合。
3. 磁力分离:使用磁力将磁珠与结合的目标核酸分离出来,其他杂质被去除。
4. 洗涤:对分离得到的磁珠-核酸复合物进行洗涤,去除非特异性结合的物质,提高纯度。
5. 解吸:通过改变溶液条件,使磁珠与核酸解离,获得纯净的核酸溶液。
三、全自动磁珠法核酸提取技术的优势1. 高效快速:全自动磁珠法核酸提取技术能够在较短的时间内完成核酸提取过程,大大缩短实验时间。
2. 高通量:该技术可以同时处理多个样本,实现高通量的核酸提取,适用于大规模样本处理。
3. 高纯度:全自动磁珠法核酸提取技术可以高效地去除杂质,获得高纯度的核酸样品,有利于后续实验的进行。
4. 自动化操作:该技术采用全自动仪器进行操作,减少了人工操作的误差,提高了实验的准确性和稳定性。
5. 灵活性:全自动磁珠法核酸提取技术具有很大的灵活性,可以根据实验需求进行扩展和优化,适用于不同种类的样本和不同规模的实验。
四、全自动磁珠法核酸提取技术的应用领域1. 生物医学研究:全自动磁珠法核酸提取技术在基因检测、疾病诊断和治疗等方面具有广泛应用,可以为相关研究提供高质量的核酸样品。
博晟思远 BS-AME96 全自动核酸提取仪 使用说明书
全自动核酸提取仪使用说明书北京博晟思远生物科技有限公司全自动核酸提取仪使用说明书本说明书版权由北京博晟思远生物科技有限公司所有。
未经本公司同意,任何其他个人或组织均不得以任何形式对本说明书的任何内容进行复印、编辑、发布。
本说明书可随时在未经通知的情况下变更,并以变更内容为准。
特别提示:首次安装使用本仪器时,请务必先仔细阅读使用说明书。
首次运行,必须检查是否已拆卸运输固定螺钉(请参见本说明书上最后一页拆卸安装指引),否则对仪器造成的损伤,我公司概不承担任何责任。
版本号:2021年02月第1.3版重要说明用户在使用全自动核酸提取仪之前,对仪器的使用需有一个完整的了解。
用户在运行系统之前,请仔细阅读说明书。
△!注意:如果用户不按照说明书上的提示进行操作所造成的一切后果,我公司概不承担任何责任。
△!注意:首次运行,必须检查是否已拆卸运输固定螺钉(请参见本说明书上最后一页拆卸安装指引),否则对仪器造成的损伤,我公司概不承担任何责任。
△!注意:本仪器在开箱后应根据装箱单,验收包装箱内物品。
如发现物品损坏或缺少,请与我公司或供应商联系。
验收合格后,请填写安装信息反馈表上相关内容,反馈回本公司,以便建档和保修。
仪器开箱后请妥善保存包装材料,以备后用。
对于在送往维修部门途中因包装不善而发生的仪器损伤,我公司概不承担任何责任。
△!注意:在下列情况下,应立即将仪器的电源插头从电源插座上拔掉,并与供应商联系或请我公司的专业维修人员进行处理:●仪器经雨淋或水浸;●仪器工作时出现不正常的声音或气味;●仪器摔落或外壳受损;●仪器功能有明显变化。
△!注意:请勿将本仪器当作城市垃圾处理。
具体可查询当地有关医疗废弃物产品处理的规定。
△!注意:使用本仪器产生废液及废料应当按照行政主管部门或者环保部门等要求处理。
△!注意:本产品需经过本产品培训或具有专业检验科医疗知识的医疗人员使用。
○-禁止:不得在存在或可能存在易燃易爆气体的场合使用。
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>99%
30ul-15ml
杭州博日
32、96
高频振荡加热、紫外
30-60min
CV值<3%
有
>98%
10ul-1000ul
杭州奥盛
24、32、48、96
紫外、风扇
15-40min
CV值<5%
无
>95%
50ul-10ml
杭州艾康
32
紫外
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CV值<1.5%
有
>98%
20ul-1000ul
上海浩源
32
紫外
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CV值<5%
有
>99%
100ul-2400ul
上海英芮诚
32
紫外
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CV值<3%
有
>98%
20ul-1100ul
江苏硕世
32
紫外
30-50min
CV值<5%
有
>99%
Max1000ul
百泰克
32、96
紫外、过滤膜
<60min
CV值<5%
有
>99%
20ul-7000ul
国产全自动核酸提取仪的比较
厂家
仪器通道
防污染措施
提取时间
均一性
是否有试剂盒
磁珠回收率
处理体积
南京中科拜尔
16、20、32、96
循环风路、hepa滤膜、紫外
30-40min
CV值<5%
有
>99%
30ul-2000ul
西安天隆
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循环风路、hepa滤膜、紫外
30-50min
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厦门致善
24、32、96
紫外
30-60min
CV值<5%
有
>99%
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济凡生物
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50ul-1000ul
天根
16、32
紫外
30-4பைடு நூலகம்min
CV值<5%
有
>99%
20ul-2400ul