1 载体构建流程
载体构建流程
菌落PCR
此步以适应现代分子生物学实验室批量工作 的高效性,通常只需挑半个菌落直接作为模 板进行常规PCR就能初步检测阳性克隆。 初步检菌的阳性克隆接种提质粒,供后续酶 切分析以及测序检测。
酶切检测阳性克隆
将菌检的阳性克隆所得质粒进行酶切分析,获得预期 条带的即为阳性克隆。 要进一步确认是否有因PCR所带来的点突变,插入, 缺失等改变目的基因的序列,还需要对阳性克隆进行 测序。 选用的酶通常为设计引物的两个酶,因为它能完整切 下ORF和载体骨架,可以通过条带大小以判断阳性克 隆。
挑取阳性克隆去测序
测序是构建载体的最后一个关键的环节,只有测 序正确的阳性克隆才算成功构建载体。 ORF序列不允许出现插入、缺失、改变氨基酸的 点突变,至于密码子简并突变以及相似氨基酸间 的突变要视客户要求或是否影响所研究蛋白的表 达、结构、功能。 不符合要求的测序文件需要重克隆或对其进行修 补。
转化
基本步骤: (1)将100μl感受态细胞于冰上解冻。 (2)取5μl连接产物加入到感受态细胞中,轻轻旋转几次以 混匀内容物。 在冰上放置30分钟。 (3)将管放入预加温到42℃的水浴中,热激90秒。快速将 管转移到冰浴中,使细胞冷却1~2分钟。 (4)每管中加700μl LB培养基,37℃振荡培养1小时,进行 复苏。 (5)室温4,000rpm离心5分钟,弃去上清后,用剩余100μl 培养基重悬细胞并涂布到含抗性的LB琼脂平板表面。注意: 细胞用量应根据连接效率和感受态细胞的效率进行调整。 (6)将平板置于室温直至液体被吸收。 (7)倒置平皿,于37℃培养,12~16小时后可出现菌落。
回收前
回收后
酶切载体带 酶切目的条带
连接
载体构建流程
载体构建SOP流程:GenBank查询目的基因序列→根据ORF序列利用引物设计软件设计引物→表达目的基因的组织或细胞总RNA提取→RT-PCR获取目的基因→酶切目的基因和载体→分别纯化酶切的目的基因和载体并建立连接反应→转化→初步筛选阳性克隆→阳性克隆测序→测序正确的质粒保种并重提质粒I.获取目的基因/序列片段一.获取序列信息通过GENBANK数据和生物信息的方法设计目的基因或目的片段引物(shRNA、miRNA)。
PCR引物的设计原则:①引物应用核酸系列保守区内设计并具有特异性。
②产物不能形成二级结构。
③引物长度一般在15~30碱基之间。
④ G+C含量在40%~60%之间。
⑤碱基要随机分布。
-⑥引物自身不能有连续4个碱基的互补。
⑦引物之间不能有连续4个碱基的互补。
⑧引物5′端可以修饰。
⑨引物3′端不可修饰。
⑩避免在引物的3’端使用碱基A。
在实际设计引物中由于ORF两末端序列本身的限制,不能完全按照上述理想的设计原则,但也切记引物不能过长或过短。
过长的引物不容易打开其二级结构,与模板结合缓慢,也容易形成引物二聚体,通常不超过35bp(不包括酶切位点和保护碱基)。
过短的引物特异性差,扩出其它不相关片段,最终很难得到目的片段,通常不短于18bp(不包括酶切位点和保护碱基)。
要将目的基因定向克隆至相应载体,需要在上下游引物两端设计不同的酶切位点,由于酶切位点位于线性末端时酶对其识别切割能力大大降低,需依据NEB目录添加相应保护碱基,酶切时可相应增加时间。
二.制备模板1.分离高质量RNA:成功的cDNA合成来自高质量的RNA。
高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或SDS。
RNA的质量决定了能够转录到cDNA上的序列信息量的最大值。
现在实验室通常使用Trizol试剂法提取总RNA,可以从多种组织和细胞中提取高质量的非降解RNA。
Trizol试剂法可以从最少100个细胞或1mg组织中提取RNA。
载体构建流程优秀课件
酶切检测阳性克隆
将菌检的阳性克隆所得质粒进行酶切分析,获得预期 条带的即为阳性克隆。
要进一步确认是否有因PCR所带来的点突变,插入, 缺失等改变目的基因的序列,还需要对阳性克隆进行 测序。
酶切目的基因和载体
酶切注意事项
两种酶切的条件不同时,分别进行两次酶切,切 完一个纯化后再切:温度要求不同,先酶切低温 要求的,再酶切高温要求的;若盐浓度要求不同, 先酶切低盐浓度要求的,再酶切高盐浓度要求的。 只要其中一种酶需要添加BSA,则应在双酶切反 应体系中加入BSA。BSA不会影响任何内切酶的 活性。
DNA 2
形 成
条变
子链延伸
单性
DNA加倍
链
DNA单链
与引物复性
DNA双螺旋
1
2
3
4
时间(min)
重复1~3步 25~30轮 目的DNA片段 扩增100万倍以上
5
PCR常出现的问题
1.假阳性:出现的PCR扩增条带与目的靶序列条
带一致, 有时其条带更整齐,亮度更高 2.出现非特异性扩增带:PCR扩增后出现的条带 与预计的大小不一致,或大或小,或者同时出现 特异性扩增带与非特异性扩增带 3.什么条带都没有
复苏。 (5)室温4,000rpm离心5分钟,弃去上清后,用剩余100μl
培养基重悬细胞并涂布到含抗性的LB琼脂平板表面。注意: 细胞用量应根据连接效率和感受态细胞的效率进行调整。 (6)将平板置于室温直至液体被吸收。 (7)倒置平皿,于37℃培养,12~16小时后可出现菌落。
菌落PCR
此步以适应现代分子生物学实验室批量工作 的高效性,通常只需挑半个菌落直接作为模 板进行常规PCR就能初步检测阳性克隆。
载体构建的基本步骤
载体构建的基本步骤Company Document number:WUUT-WUUY-WBBGB-BWYTT-1982GT载体构建一、原理依赖于限制性核酸内切酶,DNA连接酶和其他修饰酶的作用,分别对目的基因和载体DNA进行适当切割和修饰后,将二者连接在一起,再导入宿主细胞,实现目的基因在宿主细胞内的正确表达。
二、操作步骤1、摇菌(制作感受态细胞备用)取装有液体培养基的3ml试管两支(依情况而定),每管加40-100μl菌种,过夜摇。
2、提质粒(也就是载体)依照提质粒试剂盒中的说明书操作(根据情况最后一步洗脱时可以多洗1-2次)。
3、酶切(双酶切产生粘性末端)反应所需试剂体积(单位:ul)质粒 10所需内切酶反应缓冲液 2所需限制性内切核酸酶 1H2O 7将加好的EP管置于37℃保温1-2h。
(依照提酶切的具体步骤操作;为了达到最佳酶切的效果,最好根据所选用的酶确定所需要的反应温度)4、电泳检测将酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳,检测酶切是否成功。
回收胶:琼脂糖与缓冲液一比一制胶,经过切胶回收目的产物,也有目的产物纯化的功能;检测胶:琼脂糖与缓冲液一比二制胶,为了检测目的条带与预期是否相符。
切胶回收与产物纯化是差不多的过程,所达到的目的是一样的:切胶回收也是一种纯化过程,它能去除非目的片段,然后用回收试剂盒进行纯化,能将很不纯的DNA溶液纯化;产物纯化是将较纯的DNA溶液进一步除去多余的杂质,用纯化试剂盒,你会发现纯化试剂盒和回收试剂盒的步骤几乎一样。
5、载体与目的基因连接如果电泳检测酶切成功的话,则仔细将所需的片段切割下来,将胶体回收(依照胶回收试剂盒说明书操作);之后将回收的片段和载体连接。
置于温箱,12-16℃,保温8-16h6、转化(连接产物转化到感受态细胞中)依照转化具体操作步骤做感受态,将上述连接产物进行转化实验,涂板培养,37℃,12-16h。
7、单克隆检测(1)挑单克隆先将AMP从冰箱中取出,待融化后,在3ml装有LB液体培养基的试管中加入3μL的AMP,用枪头混匀;取 mlEP管5支(依情况可以多挑几管),给每支管中加500μL上述培养液,然后用接种环(或黄枪头)挑单克隆,挑完后用枪吹打;之后,将挑好的菌摇4-5小时,至混浊即可。
载体构建的基本步骤
载体构建的基本步骤载体构建是分子生物学研究中不可或缺的过程,它涉及到将目标基因或蛋白质序列移植到不同的载体中,以便扩大其表达量、纯化和研究。
本文将介绍载体构建的基本步骤,包括质粒的选择、PCR扩增、连接和转化等过程。
质粒的选择质粒是最常用的载体类型之一,具有很多优点,如易于扩增、转化和操纵等。
在选择质粒时,需要考虑以下几个方面:1. 质粒大小和拷贝数质粒的大小和拷贝数会影响其扩增和表达,选择适当大小和拷贝数的质粒可以提高表达效率。
2. 基因水平选择标记质粒中常含有基因水平选择标记,如抗生素耐药基因等。
在构建载体时需要选择合适的标记,以便快速筛选到表达了目标基因的细胞。
3. 表达宿主质粒可以在不同的宿主中表达,选择合适的表达宿主可以提高表达效率和纯度。
常见的表达宿主包括大肠杆菌、酵母等。
PCR扩增PCR扩增是将目标序列扩增为质粒中适当长度的过程。
在进行PCR扩增之前,需要准备以下试剂和设备:•Taq DNA聚合酶•原始模板DNA•引物•正向引物和反向引物•dNTP混合物•PCR缓冲溶液在PCR扩增中,需要设置合适的反应体系和程序。
常见的PCR反应条件为:•94℃,5 min:初始变性•94℃,30 s:变性•50-60℃,30 s:退火•72℃,1 min/kb:延伸•72℃,7 min:最终延伸连接连接是将PCR扩增产物与质粒DNA连接的过程。
连接反应需要用到T4 DNA连接酶和DNA PCR产品凝胶提取试剂盒等试剂,具体操作步骤如下:1.将PCR扩增产物切割至合适长度。
2.提取PCR产物,并使用DNA PCR产品凝胶提取试剂盒纯化。
3.连接酶在37℃下反应数小时。
4.连接反应后,在大肠杆菌中进行转化。
转化转化是将连接成功的PCR产物转化为大肠杆菌的过程。
转化需要用到大肠杆菌、新鲜的LB培养基和适当的抗生素等试剂。
常见的转化条件为:80-90秒高温热冲击,加入细胞后在37℃,250rpm振荡培养1小时后添加适宜浓度的抗生素进行筛选。
载体构建的基本步骤
载体构建
一、原理
依赖于限制性核酸内切酶,DNA连接酶和其他修饰酶的作用,分别对目的基因和载体DNA进行适当切割和修饰后,将二者连接在一起,再导入宿主细胞,实现目的基因在宿主细胞内的正确表达。
二、操作步骤
5、载体与目的基因连接
如果电泳检测酶切成功的话,则仔细将所需的片段切割下来,将胶体回收(依照胶回收试剂盒说明书操作);之后将回收的片段和载体连接。
置于温箱,12-16℃,保温8-16h
6、转化(连接产物转化到感受态细胞中)
依照转化具体操作步骤做感受态,将上述连接产物进行转化实验,涂板培养,37℃,
12-16h。
7、单克隆检测
(1)挑单克隆
先将AMP从冰箱中取出,待融化后,在3ml装有LB液体培养基的试管中加入3μL的
AMP,用枪头混匀;取1.5mlEP管5支(依情况可以多挑几管),给每支管中加500μL上述培养液,然后用接种。
载体构建流程
PCR产物纯化
• 倘若直接对PCR产物进行酶切,体系的 杂蛋白、离子等会造成酶切困难或星活 性,残余的聚合酶也会填平粘性末端, 造成克隆失败。
• 所以此步对整个分子克隆都至关重要, 可适当用酚抽提、柱纯化,必要的话也 可以胶回收。
酶切目的基因和载体
酶切注意事项
• 两种酶切的条件不同时,分别进行两次酶切, 切完一个纯化后再切:温度要求不同,先酶切 低温要求的,再酶切高温要求的;若盐浓度要 求不同,先酶切低盐浓度要求的,再酶切高盐 浓度要求的。只要其中一种酶需要添加BSA, 则应在双酶切反应体系中加入BSA。BSA不会 影响任何内切酶的活性。
谢谢!
• 注意将甘油的终浓度控制在10%以下,以避免 出现星号活性,可通过增加反应体系的总体积 的方法实现这一要求。
酶切常见问题
纯化酶切产物
• 通常此步是必要的,可以对比未经纯化的酶切 产物进行连接后获得的阳性克隆大大低于胶回 收酶切产物连接所得阳性克隆。
• 此步的目的是去除多余的片段,得到单一纯化 的目的基因与载体骨架,使之连接不受其他序 列干扰。
• 初步检菌的阳性克隆接种提质粒,供后续酶 切分析以及测序检测。
酶切检测阳性克隆
• 将菌检的阳性克隆所得质粒进行酶切分析,获得预期 条带的即为阳性克隆。
• 要进一步确认是否有因PCR所带来的点突变,插入, 缺失等改变目的基因的序列,还需要对阳性克隆进行 测序。
• 选用的酶通常为设计引物的两个酶,因为它能完整切 下ORF和载体骨架,可以通过条带大小以判断阳性克 隆。
经典载体构建流程
载体构建的基本流程
载体构建的基本流程载体构建的基本流程主要包括设计方案确定、材料准备、工艺加工和性能测试四个基本环节。
首先,设计方案确定是载体构建的第一步,也是最为关键的一步。
在这个阶段,我们需要明确载体的功能要求、外形尺寸、结构布局等设计参数,然后进行方案设计和优化,最终确定最佳的设计方案。
设计方案的确定需要充分考虑载体的使用环境、工作条件、使用寿命等因素,确保设计方案的科学合理性和可行性。
接下来是材料准备环节,这一步是实现设计方案的关键环节。
根据设计方案确定的材料要求,我们需要选择合适的材料,并进行采购和准备工作。
在材料选择方面,需要考虑材料的力学性能、耐磨性、耐腐蚀性、导热性、导电性等多个方面的要求,确保选择的材料符合设计要求。
在材料准备工作中,还需要对材料进行切割、成型、加工等工艺处理,以满足设计方案的要求。
随后是工艺加工环节,这一步是将设计方案和准备好的材料转化为具体载体的关键环节。
在这个阶段,我们需要进行组装、焊接、切割、打磨、涂装等一系列工艺加工工序,将材料加工成符合设计要求的零部件,并进行组装装配,最终形成完整的载体。
工艺加工环节需要严格按照设计要求和工艺规程进行操作,确保加工质量和工艺精度。
最后是性能测试环节,这一步是验证载体构建结果的关键环节。
在这个阶段,我们需要对构建好的载体进行功能测试、性能测试、可靠性测试等一系列测试工作,确保构建的载体能够满足设计要求和使用要求。
在测试过程中,需要对载体的各项性能指标进行全面检测和评估,发现问题及时进行调整和改进,最终确保构建的载体达到预期的使用效果。
总的来说,载体构建的基本流程包括设计方案确定、材料准备、工艺加工和性能测试四个基本环节。
在实际的载体构建过程中,需要严格按照这个基本流程进行操作,确保构建的载体能够满足设计要求和使用要求。
同时,也需要不断改进和优化载体构建的技术方法和工艺流程,提高构建质量和效率,推动载体构建技术的发展和应用。
rnai载体构建的基本流程
rnai载体构建的基本流程下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成,希望大家下载以后,能够帮助大家解决实际的问题。
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载体构建操作流程
载体构建操作流程载体构建操作流程一、载体准备1、质粒准备电泳检测载体质量好的质粒为三条带,分别是超螺旋、开环和复制中间体(即没有复制完全的两个质粒连在了一起);也有观点认为是质粒两条链没有断裂的超螺旋结构,开环DNA和线性DNA。
超螺旋结构应至少占到90%。
测定质粒浓度用核酸定量仪测定质粒的浓度,A230、A260和A280值。
2、质粒双酶切根据需要的酶切位点,选择对应的酶,查找适合的Buffer,进行单酶切。
以TaKaRa的限制酶为例,双酶切的体系如下:试剂体积质粒<1 μgEnzyme I 1μLEnzyme II 1μL10×X Buffer 2μL灭菌水to 20μL总体积20μL将上述体系置于37℃(不同酶可能存在差异)水浴锅中酶切。
根据酶切效率不同确定酶切时间,可以去除2 μl进行电泳检测。
3、回收质粒凝胶回收参照TaKaRa MiniBEST Agarose Gel DNA Extraction Kit Ver.3.0试剂盒说明书。
1)称量胶块重量,计算胶块体积。
计算胶块体积时,以1mg=1μl进行计向胶块中加入胶块融化液Buffer GM,我们一般用1%的琼脂糖凝胶电泳,所以一般加入3个凝胶体积量。
2)均匀混合后室温15-25℃融化胶块。
此时应间断振荡混合,使胶块充分融化(约5~10分钟)。
3)将试剂盒中的Spin Column安置于Collection Tube上。
将上述操作的溶液转移至Spin Column 中,12,000 rpm离心1分钟,弃滤液。
滤液再加入Spin Column中离心一次,可以提高DNA的回收率。
4)将700μl的Buffer WB加入Spin Column中,室温12,000 rpm离心30秒钟,弃滤液。
5)重复操作步骤。
6)将Spin Column安置于Collection Tube上,室温12,000 rpm 离心1分钟。
7)将Spin Column安置于新的1.5ml的离心管上,在Spin Column膜的中央处加入30μl的灭菌蒸馏水或Elution Buffer,室温静置1分钟。
载体构建的基本步骤
载体构建的基本步骤集团文件发布号:(9816-UATWW-MWUB-WUNN-INNUL-DQQTY-载体构建一、原理依赖于限制性核酸内切酶,DNA连接酶和其他修饰酶的作用,分别对目的基因和载体DNA进行适当切割和修饰后,将二者连接在一起,再导入宿主细胞,实现目的基因在宿主细胞内的正确表达。
二、操作步骤1、摇菌(制作感受态细胞备用)取装有液体培养基的3ml试管两支(依情况而定),每管加40-100μl菌种,过夜摇。
2、提质粒(也就是载体)依照提质粒试剂盒中的说明书操作(根据情况最后一步洗脱时可以多洗1-2次)。
3、酶切(双酶切产生粘性末端)反应所需试剂体积(单位:ul)质粒 10所需内切酶反应缓冲液 2所需限制性内切核酸酶 1O 7H2将加好的EP管置于37℃保温1-2h。
(依照提酶切的具体步骤操作;为了达到最佳酶切的效果,最好根据所选用的酶确定所需要的反应温度)4、电泳检测将酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳,检测酶切是否成功。
回收胶:琼脂糖与缓冲液一比一制胶,经过切胶回收目的产物,也有目的产物纯化的功能;检测胶:琼脂糖与缓冲液一比二制胶,为了检测目的条带与预期是否相符。
切胶回收与产物纯化是差不多的过程,所达到的目的是一样的:切胶回收也是一种纯化过程,它能去除非目的片段,然后用回收试剂盒进行纯化,能将很不纯的DNA溶液纯化;产物纯化是将较纯的DNA溶液进一步除去多余的杂质,用纯化试剂盒,你会发现纯化试剂盒和回收试剂盒的步骤几乎一样。
5、载体与目的基因连接如果电泳检测酶切成功的话,则仔细将所需的片段切割下来,将胶体回收(依照胶回收试剂盒说明书操作);之后将回收的片段和载体连接。
置于温箱,12-16℃,保温8-16h6、转化(连接产物转化到感受态细胞中)依照转化具体操作步骤做感受态,将上述连接产物进行转化实验,涂板培养,37℃,12-16h。
7、单克隆检测(1)挑单克隆先将AMP从冰箱中取出,待融化后,在3ml装有LB液体培养基的试管中加入3μL的AMP,用枪头混匀;取1.5 mlEP管5支(依情况可以多挑几管),给每支管中加500μL上述培养液,然后用接种环(或黄枪头)挑单克隆,挑完后用枪吹打;之后,将挑好的菌摇4-5小时,至混浊即可。
载体构建流程pp课件
• 凝胶电泳检测纯化后的PCR产物的浓度,优化连接反应时 插入片段与载体摩尔比例为2:1~10:1(通常为3:1)。
• PCR产物及载体应尽量避免反复冻融,否则易造成3’末端 残基的丢失。
• 一般连接25度2小时,16或4度过夜。
• 另外酶切后纯化前,均需热灭活,以免残余的限 制性内切酶干扰后续连接反应,降低阳性率。
15
回收前
回收后
酶切载体带 酶切目的条带
16
连接
• 催化DNA中相邻的5′磷酸基和3′羟基末端之间形成磷酸二 酯键,使DNA切口封合或使两个DNA分子或片段连接。
• PCR产物最好进行切胶回收纯化,以去除PCR产物中的非特 异性片段和引物等杂质。
• 初步检菌的阳性克隆接种提质粒,供后续酶 切分析以及测序检测。
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酶切检测阳性克隆
• 将菌检的阳性克隆所得质粒进行酶切分析,获得预期 条带的即为阳性克隆。
• 要进一步确认是否有因PCR所带来的点突变,插入, 缺失等改变目的基因的序列,还需要对阳性克隆进行 测序。
• 选用的酶通常为设计引物的两个酶,因为它能完整切 下ORF和载体骨架,可以通过条带大小以判断阳性克 隆。
• 什么条带都没有,其原因可能是少加东西,酶已经失活了,或退火温 度太高等。解决方法:检查是否少加东西了,换一下酶,降低退火温 度或做个梯度,摸一下条件。
10
PCR产物纯化
• 倘若直接对PCR产物进行酶切,体系的杂蛋 白、离子等会造成酶切困难或星活性,残 余的聚合酶也会填平粘性末端,造成克隆 失败。
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挑取阳性克隆去测序
• 测序是构建载体的最后一个关键的环节,只有测 序正确的阳性克隆才算成功构建载体。
构建载体的实验流程
构建载体的实验流程下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成,希望大家下载以后,能够帮助大家解决实际的问题。
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载体构建技术基本流程
载体构建技术基本流程
1.载体质粒的选择;
2.引物设计;
3.PCR扩增;
4.载体和目标片段的限制性酶切;
5.连接转化;
6.挑取克隆提质粒验证。
重要的是,我们要为大家提供了一个载体构建流程模板,构建载体时希望大家可以创建一个word文档,按照我们提供的模板,将载体构建过程记录下来,便于后续优化。
后续文章中我们将举例告诉大家如何使用这个模板。
P.S. 构建表达载体时可以先连接T载体,可把步骤(12)酶切片段换成连接T载体后再对T载体进行酶切。
连接T载体会多花一天时间,但是可以使载体构建流程更顺利。
连接T载体与连接目的载体方法十分类似,本次举例不再涉及。
如果想要通过连接T载体过渡,可以网上搜索T载体相关产品说明书,了解T载体和连接T载体的方法。
引物设计的内容我们将放在接下来的一篇推送里,正在构建载体的大家,先尝试使用我们的载体构建流程模板吧。
载体构建的基本步骤
将酶切产品举止琼脂糖凝胶电泳,检测酶切是可乐成.
回支胶:琼脂糖与慢冲液一比一造胶,通过切胶回支手段产品,也有手段产品杂化的功能;
检测胶:琼脂糖与慢冲液一比二造胶,为了检测手段条戴与预期是可相符.
切胶回支与产品杂化是好已几的历程,所达到的手段是一般的:切胶回支也是一种杂化历程,它能去除非手段片段,而后用回支试剂盒举止杂化,能将很没有杂的DNA溶液杂化;产品杂化是将较杂的DNA溶液进一步与消多余的杂量,用杂化试剂盒,您会创造杂化试剂盒战回支试剂盒的步调险些一般.
5、载体与手段基果连交
如果电泳检测酶切乐成的话,则小心将所需的片段切割下去,将胶体回支(依照胶回支试剂盒证明书籍支配);之后将回支的片段战载体连交.置于温箱,12-16℃,保温8-16h
6、转移(连交产品转移到体验态细胞中)
依照转移简直支配步调干体验态,将上述连交产品举止转移真验,涂板培植,37℃,
(2)单克隆检测
以每管摇好的菌液为模板,以本有的引物举止PCR,而后将PCR产品跑电泳,瞅察电泳图像中那几管的条戴粗确,将粗确条戴相对于应管的菌液再抽与100μL,加到3ml(有LB液体培植液,AMP+)试管中,过夜摇;第二天沉摇,将摇好的菌与1ml于1.5mlEP管中支测序,并保种.
注:①挑单克隆时,一定要挑简单圆润的菌降,有卫星斑的没有挑.
载体建立之阳早格格创做
一、本理
依好于节造性核酸内切酶,DNA连交酶战其余建饰酶的效率,分别对于手段基果战载体DNA举止适合切割战建饰后,将二者连交正在所有,再导进宿主细胞,真止手段基果正在宿主细胞内的粗确表白.
二、支配步调
1、摇菌(创造体验态细胞备用)
与拆有液体培植基的3ml试管二支(依情况而定),每管加40-100μl菌种,过夜摇.
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目录
载体构建概念 01 02 载体构建原理
载体构建流程 03 载体构建拓展 05
04 载体构建结果
01
载体构建概念
Ø载体构建的概念
载体构建的概念
酶切
连接
酶切
转化
鉴定
载体构建:在基因工程中,将能进入细胞、在装载了外来的NA片段后仍能照样复 制的运载体称为载体,常用的载体是人工构建的质粒。载体构建即是构建含外源 DNA的质粒,将其导入到宿主细胞并能正常复制和表达的过程。
05
载体构建拓展
Ø载体构建新技术
载体构建新技术
片段1
同源臂 片段3
同源臂
片段2
片段1
外切酶,50℃
片段3
片段2
50℃退火,外切酶逐渐失活
片段1
片段3 50℃连接酶修补切口
片段2
片段1
片段3
片段2
无缝克隆:载体末端和引物末端具有15-20个同源碱基,由此得到的PCR产物两端便分别带上了15-20个 与载体序列同源性的碱基,依靠碱基间作用力互补配对成环,无需酶连即可直接用于转化宿主菌,进入宿 主菌中的线性质粒(环状)依靠自身酶系将缺口修复。
目的条带
凝胶成像
电泳图
纯化PCR产物
目的条 带凝胶
含DNA 的结合液
离心
离心
离心
高纯度DNA
结合液60℃,
结合
10min
洗涤
洗脱
酶切与连接
AluⅠ
目的片段
BamHⅠ
目的片段
酶切
HaeⅢ
酶切
EcoRⅠ
平末端
粘性末端
22℃,T4 DNA 连接酶催化,连 接2h
转化与鉴定
取50μl感受态细 胞冰上解冻
加入5μl连接产物, 冰浴30min
42℃热激90s,冰 浴冷却1-2min
加入200μl LB,摇床 37℃/1h,200rpm/min
鉴定(菌落PCR/ 酶切鉴定/测序)
37℃恒温箱 培养过夜
涂平板
04
载体构建的结果
Ø载体构建结果分析
载体构建结果分析
菌落PCR
酶切鉴定
载体 目的片段
挑选单克隆进行菌落PCR检测,电泳结果可初步断定1、4、6、7、10为阳性克隆,酶切鉴定电泳结果 显示2、4、6在载体和目的片段大小位置处均有条带,符合预期即为阳性克隆。但要确定目的基因序列 完全正确,需要送去测序,只有测序正确才算成功构建载体。
PCR扩增目的基因
94
温
度 (
72
℃
) 55
预变性
1.高温 变性
2.低温 复性
3.适温 延伸
重复1-3步约30个循环
DNA变性形 成2条单链
目的基因片段扩增上百万倍
子链延伸DNA加倍
DNA单链与引物复性
22
DNA双链
1
2
3
4
5
时间(min)
琼脂糖凝胶电泳
-
+
缓冲液
上样
电泳方向
缓冲液
电泳
700bp 500bp
02
载体构建的原理
Ø载体构建原理
载体构建原理
限制酶酶切
DNA连接酶连接
转化
载体构建原理,是依赖于限制性核酸内切酶、DNA连接酶和其他修饰酶的作用, 分别对目的基因和载体进行适当切割和修饰后,将二者连接在一起,再导入宿主 细胞,鉴定成功后,实现目的基因在宿主细胞内的正确表达。
03
载体构建的流程
Ø扩增目的基因 Ø琼脂糖凝胶电泳 Ø纯化PCR产物 Ø酶切与连接 Ø转化与鉴定
载体构建新技术
EGFRvIII基因 P2A多顺反子元件 iRFP720基因
无缝克隆构建多顺反子表达载体
无缝克隆的优势:不受片段序列的限制、实现任意组装;可以同时无缝地拼接多个片段,节省时间。
载体构建新技术
无缝克隆的劣势:
T5外切酶 T5外切酶
1. 无法组装小片段
2. 黏性末端内部形成稳定的 二级结构(如发夹结构)
3. 长链黏性末端易随 机拼接错误
《载体的构建与鉴定》系列