细菌分类分类学
细菌分类学
弧菌属。
1838年，德国生物学家Eheneberg对微生物分类做 了修改，把细菌列为纤毛虫纲，分为2科。
1857年，德国植物学家Nagali在《植物学杂志》上发表
文章指出，这些微生物具有细胞壁，应归属于植物界，
并独立设一纲，取名裂殖菌纲。
1872年，德国植物学家Cohn发表新的细菌分类系统， 吧细菌分为4个族，每个族由一个或几个属组成。 1909年，Jensen发表了一种新的分类法，该方法在采用
第一章
微生物分类学
——细菌分类学
第一节 细菌分类学概述
一、细菌分类鉴定的意义
细菌分类学的任务是在全面了解细菌的
生物学特征的基础上，研究他们的种类，
探索其起源、演化以及与其他类群之间的
亲缘关系，进而提出能反映自然发展的分
类系统，并将微生物加以分门别类。
二、细菌分类学研究简史
1675年，荷兰人用自制显微镜观察到“微小动物” 第一个尝试生物分类的科学家—林奈 丹麦动物学家Muller提出新的分类系统，其中包括 动物、藻类、细菌。并建议将细菌分为单胞菌属和
常用的细菌分类学术语：
（1）种（species）物种，生物分类中基本的分类单元 高等生物中，“生殖隔离”被看作是区分物种的标准 微生物的种：具有高度特征相似性的菌株群，这个菌株群 与其他类群的菌株有很明显的区别。 (2). 亚种(subspecies): 是正式分类单元中地位最低的 分类等级。
当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传性
1 （6）培养物(culture)：一定时间一定空间内微生
物的细胞群或生长物。如微生物的斜面培养物、 摇瓶培养物等。
初一生物细菌的分类总结
初一生物细菌的分类总结细菌是一类微生物，广泛存在于自然界中。
它们的分类可以根据形态、结构、代谢方式和氧需求等多个方面进行划分。
本文将对初一生物课程中所学的细菌分类进行总结。
一、形态分类细菌的形态分类是根据它们的形状和结构特征来区分的。
1. 球状细菌（Coccus）：这类细菌呈圆形，在显微镜下观察，它们看起来像小颗粒。
常见的球状细菌有葡萄球菌和链球菌。
2. 杆状细菌（Bacillus）：这类细菌呈长柱状，外形像细长的棍子。
大肠杆菌和炭疽杆菌就属于杆状细菌。
3. 螺旋细菌（Spirillum）：这类细菌呈螺旋状，外形像一根螺旋线。
铜绿假单胞菌和酿酒酵母就属于螺旋细菌。
二、结构分类细菌的结构分类主要考虑细菌体内是否有细胞壁和细胞膜的组成。
1. 革兰氏阳性菌（Gram-positive）：这类细菌的细胞壁含有厚厚的脂肪酸，显著染紫色。
革兰氏阳性菌包括葡萄球菌和链球菌。
2. 革兰氏阴性菌（Gram-negative）：这类细菌的细胞壁相对较薄，不易染色。
革兰氏阴性菌包括大肠杆菌和沙门氏菌。
三、代谢方式分类细菌的代谢方式分类是根据细菌的能量来源和碳源来区分的。
1. 好氧菌（Aerobic）：这类细菌需要氧气来进行代谢。
好氧菌包括绿色光合细菌和蓝藻菌。
2. 厌氧菌（Anaerobic）：这类细菌在缺氧环境下进行代谢，无需氧气。
厌氧菌包括产气荚膜梭菌和硫酸还原细菌。
四、氧需求分类细菌的氧需求分类考虑到细菌对氧气的需求量。
1. 嗜氧菌（Obligate aerobes）：这类细菌只能在充足的氧气条件下生长和繁殖。
典型的嗜氧菌有拟杆菌和放线菌。
2. 厌氧菌（Obligate anaerobes）：这类细菌只能在无氧环境中生长和繁殖。
典型的厌氧菌有产气荚膜梭菌和柱状硫杆菌。
3. 兼性厌氧菌（Facultative anaerobes）：这类细菌既可以在有氧条件下生长，也可以在无氧条件下生长。
典型的兼性厌氧菌是大肠杆菌和乳酸菌。
细菌分类分类学
（4）型(form或type)，常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌 株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。
例如抗原特征的差异分为不同的血清型；对噬菌体裂解反应的不同分为 不同的噬菌型等等。
Pseudomonas aeruginosa(铜绿色假单胞菌)。其中Pseudomonas是属名 (假单胞菌属)(阴性 )；aeruginosa是种名加词，是拉丁语形容词(阴 性)，原意为"铜绿色的"。
Mycobacterium tuberculosis(结核分枝杆菌)。其中Mycobacterium是 属名(分枝杆菌属)， 系希腊词源的复合词(中性)，tuberculosis是种 名加词，是希腊词和拉丁词缀合成的名词所属格形式，意为"结核病的"。
旧时衙门里草拟文牍、掌管档案的幕僚，其地位比一般属吏高。《老残游记》第四回:"像你老这 样抚台央出文案老爷来请进去谈谈，这面子有多大!"夏衍《秋瑾传》序幕:"将这 阮财富 带回衙 门去，要文案给他补一份状子。"
文案音译
文案英文:copywriter、copy、copywriting
文案拼音:wén àn
(1)培养物(culture)，是指一定时间一定空间内微生物的细胞 群或生 长物。如微生物的斜面培养物、摇瓶培养物等。 如果某一培养物是由单一微生物细胞繁殖产生的，就称之为该细菌的纯 培养物(pure culture)。
（2）菌株(strain)，从自然界中分离得到的任何一种微生物的纯培养 物或用实验方法(如通过诱变)所获得的某一菌株的变异型，（但为另一 新菌种）
细菌的分类与命名-微生物命名规则
细菌得分类与命名细菌分类学细菌分类学（ｔaｘｏｎomy）就是指对细菌进行分类、命名与鉴定得一门学科。
它得任务就是在全面了解细菌得生物学特征得基础上,研究它们得种类，探索其起源、演化以及与其她类群之间得亲缘关系，进而提出能反映自然发展得分类系统，并将细菌加以分门别类.它包括三个方面：分类(claｓsificatiｏn）、命名（ｎomencｌature)与鉴定（iｄentiｆicatｉoｎ)。
一、基本概念1、细菌分类就是根据每种细菌各自得特征,并按照它们得亲缘关系分门别类,以不同等级编排成系统。
分类有两种:①以细菌得形态与生理生化特性为依据得表型特征分类法，包括有传统分类法（classicａｌclassｉｆｉcａｔiｏｎ)与数值分类法(numeｒiｃａl clasｓifｉcatｉｏn）;②用化学分析与核酸分析，以细菌大分子物质(核酸、蛋白质）结构得同源程度进行分类称种系分类(phylogenetic ｃｌassｉficaｔｉoｎ）或自然分类（natural cｌassfｉcａtioｎ）。
2、细菌命名在分类基础上,给予每种细菌一个科学名称，使之在生产实践、临床实践与科学研究工作中相互交流成为可能。
按照细菌命名得法规，能保证所有得科研工作者以同样方式给予细菌命名。
3、细菌鉴定将未知细菌按分类原则放入系统中某一适当位置与已知细菌比较其相似性，用对比分析方法确定细菌得分类地位。
若与已知细菌相同即采用已知菌得名称,不同者则按命名原则确定一个新名称。
二、分类等级细菌得分类等级与其她生物相同，依次为界(kinｇdom）、门(divｉsiｏn）、纲（cｌass）、目(order)、科(fａmilｙ）、属（genus）、种（species）。
细菌属于原核生物界（procarｙoｔae），包括有细菌、放线菌、支原体、衣原体、立克次体与螺旋体.分类等级拉丁字尾比较固定，表示方法如下:目—aｌeｓ、亚目-ｉneae、科-aceae、亚科—oideａae、族—eａe、亚族-inａe。
细菌学基础知识细菌的分类与特性
细菌学基础知识细菌的分类与特性细菌是一类广泛存在于自然界中的微生物，其形态多样，功能特征各异。
了解细菌的分类与特性对于深入研究微生物学和生命科学领域具有重要意义。
本文将介绍细菌的分类方法及其特性，旨在帮助读者全面了解细菌的基础知识。
一、细菌的分类方法细菌根据其形态、结构、代谢特性等方面的差异，可以分为多个不同的分类群。
现代细菌分类方法主要包括形态分类、生理分类和遗传分类等。
1. 形态分类细菌的形态分类主要是基于细菌的形态特征，包括细菌的形状、大小、生长方式等方面的观察和描述。
根据形态特征，细菌可以分为球菌（cocci）、杆菌（bacilli）、弧菌（vibrios）、螺旋菌（spirochaetes）等。
例如，球菌呈球形，如葡萄球菌；杆菌呈杆状，如大肠杆菌等。
2. 生理分类细菌的生理分类是基于其代谢特性和生活环境选择等方面的差异进行分类。
根据细菌的营养需求、氧气利用方式、产物生成等方面的特点，细菌可以分为厌氧菌、好氧菌、兼性厌氧菌、光合细菌等。
例如，厌氧菌可在无氧环境下生长和繁殖，如肠炎沙门菌；光合细菌能利用光合作用产生能量，如光合细菌。
3. 遗传分类细菌的遗传分类是根据细菌的遗传物质DNA序列的差异，利用分子生物学技术进行分类。
通过测定和比较细菌的16S rRNA基因序列，可以确定细菌的亲缘关系和分类位置。
这种分类方法旨在揭示细菌的遗传进化关系和种间联系。
二、细菌的特性细菌作为微生物的一类，具有一些共同的特性，这些特性也是进行细菌分类的重要依据。
1. 细菌的结构细菌通常由细胞壁、细胞膜、细胞质和核酸组成。
细菌的细胞壁主要由多糖和蛋白质构成，可以保护细菌免受外界环境的伤害。
细菌的细胞膜则是细菌与外部环境进行交换的关键结构，能够调控物质的进出。
细菌的细胞质中含有各种细胞器和遗传物质，这些结构和物质是细菌进行生命活动的基础。
2. 细菌的代谢细菌的代谢方式各异，可以通过不同的途径利用和转化营养物质进行生长和繁殖。
细菌分类分类学
第二节细菌分类分类学内容涉及三个相互依存又有区别的组成部分:分类(classification)是根据一定的原则(表型特征相似性或系统发育相关性)对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴定；命名(nomenclature)是根据命名法规，给每一个分类群一个专有的名称；鉴定(identification或determination)则是指借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。
一、分类单元及其等级分类单元(taxon,复数taxa)是指具体的分类群，如原核生物界(Procaryotae)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)等都分别代表一个分类单元。
细菌的分类单元分为七个基本的分类等级(rank或category)或分类阶元，由上而下依次是：界、门、纲、目、科、属、种在分类中，若这些分类单元的等级不足以反映某些分类单元之间的差异时也可以增加"亚等级"即：亚界、亚门……亚种，在细菌分类中，还可以在科(或亚科)和属之间增加族和亚族等级。
值得强调的是，分类单元的等级(阶元)只是分类单元水平的概括，它并不代表具体的分类单元。
在细菌分类中，还使用一些非正式的类群术语。
(1)培养物(culture)，是指一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物。
如微生物的斜面培养物、摇瓶培养物等。
如果某一培养物是由单一微生物细胞繁殖产生的，就称之为该细菌的纯培养物(pure culture)。
（2）菌株(strain)，从自然界中分离得到的任何一种微生物的纯培养物或用实验方法(如通过诱变)所获得的某一菌株的变异型，（但为另一新菌种）菌株是微生物分类和研究工作中最基础的操作实体。
菌株名称常用数字编号、字母、人名、地名等表示。
细菌的分类及命名[知识研究]
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着研究的深入科属的划分会发生变动
专业知识
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1、属（genus）性状相近、关系密切的 若干菌种组成一个菌属，与其他属有明 显差异。
2、种（species）是细菌学分类的最基本 单元，生物学性状基本相同的细菌群体 归成一个菌种。
3 、 菌 株 （ strain ） 是 不 同 来 源 的 某 一 种 细菌的纯培养物。
细菌的分类及命名
一、 细菌的分类地位 二、 细菌的命名 三、 细菌分类鉴定的标准 四、 细菌的分类体系 五、 细菌的鉴定
专业知识
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一、细菌分类学——对细菌进行分类， 命名与鉴定的 一门学科。
任务：
•在全面了解细菌生物学特征的基础上， 研究它们的种类，探索其起源，演化以 及与其他类群之间的亲缘关系，进而提 出能反映自然发展的分类系统，并将细
专业知识
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例如 大肠埃希菌的学名全名是：
Escherichia coli(Migula) Castellani et
Chalmers l919 指的是Migula于1895年命名此菌为 Bacillu coli，Castellani及Chalmers 于1919年改为现名。
专业知识
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金黄色葡萄球菌的学名为：
恶臭消化链球菌是由 Veillon 首先发现和定名的 ，后 Smith 重新定为现名。
专业知识
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3、拉丁文学名应按拉丁文字母的发音规 则读念
4、属名重复出现时，拉丁文可缩写，用 第一个字母，为避免混肴，也可用2个 字母。大肠杆菌(E.coli)
专业知识
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5、只确定属名、未确定种名的某一株细菌， 其拉丁文学名可在属名之后加sp．(正体字)； 如果同属未定种名的若干菌株，则用 spp． (species 的缩写， sp. 表示单数，spp. 表示复数 ) ， 如 Micrococcus sp.表示微球菌属的一个种， Micrococcus spp. 表示微球菌属的一些种。
微生物学中的细菌分类
微生物学中的细菌分类微生物学是研究微生物的科学，而细菌是微生物学中最为重要的一类微生物。
细菌广泛存在于自然界的各个角落，无论是土壤、水体还是人体内部，都可以找到它们的踪迹。
细菌的分类是微生物学中的一个重要研究方向，通过对细菌的分类可以更好地了解它们的特性和功能，为人类的健康和环境保护提供指导。
细菌的分类可以从不同的角度进行，比如形态学、生理学和遗传学等。
在形态学上，细菌可以分为球菌、杆菌和螺旋菌等不同形状的类群。
球菌是一类呈球状的细菌，比如肺炎球菌和链球菌；杆菌是一类呈杆状的细菌，比如大肠杆菌和结核杆菌；螺旋菌则呈螺旋形，比如钩端螺旋体和梅毒螺旋体。
这些形态上的差异反映了细菌在进化过程中的适应性和多样性。
除了形态学外，细菌的分类还可以根据它们的生理特性进行。
比如，一些细菌可以利用光合作用进行能量合成，这类细菌被称为光合细菌，比如光合细菌和古菌等；而一些细菌则无法进行光合作用，它们通过分解有机物质来获取能量，这类细菌被称为化学合成细菌，比如大肠杆菌和葡萄球菌等。
此外，还有一些细菌可以在极端环境下生存，比如高温、高压和酸碱等极端条件，这类细菌被称为极端嗜好细菌，比如嗜热菌和嗜酸菌等。
这些生理特性的差异使得细菌在不同的环境中具有不同的功能和适应性。
细菌的分类还可以从遗传学的角度进行。
通过对细菌的基因组进行测序和比较，可以揭示细菌之间的亲缘关系和进化历史。
基因组测序技术的发展使得我们能够更加准确地了解细菌的遗传信息，从而更好地进行分类和研究。
比如，通过对细菌的16S rRNA基因进行测序和比较，可以将细菌分为不同的菌属和菌种。
这种基于遗传信息的分类方法被广泛应用于细菌学研究中，为我们揭示了细菌的多样性和进化历史。
细菌的分类不仅有助于我们更好地了解它们的特性和功能，还对人类的健康和环境保护具有重要意义。
细菌是人体内的常见微生物，它们在人体内起着重要的生理功能，比如帮助消化食物、合成维生素和抵抗病原微生物等。
细菌的分类与命名-微生物命名规则
细菌的分类与命名-微生物命名规则细菌的分类与命名细菌分类学细菌分类学 (taxonomy)就是指对细菌进行分类、命名与判定的一门学科。
它的任务就是在全面认识细菌的生物学特色的基础上,研究它们的种类 ,探究其发源、演化以及与其她类群之间的亲缘关系,从而提出能反应自然发展的分类系统,并将细菌加以分门别类。
它包含三个方面:分类 (classification)、命名 (nomenclature)与鉴定 (identification) 。
一、基本观点1、细菌分类就是依据每种细菌各自的特色,并依照它们的亲缘关系分门别类 ,以不一样样级编排成系统。
分类有两种 :①以细菌的形态与生理生化特征为依照的表型特色分类法 ,包含有传统分类法 (classical classification)与数值分类法(numerical classification);②用化学剖析与核酸剖析,以细菌大分子物质 (核酸、蛋白质 )构造的同源程度进行分类称种系分类 (phylogenetic classification)或自然分类(natural classfication)。
2、细菌命名在分类基础上 ,赐予每种细菌一个科学名称,使之在生产实践、临床实践与科学研究工作中互相沟通成为可能。
依照细菌命名的法例,能保证全部的科研工作者以相同方式赐予细菌命名。
3、细菌判定将未知细菌按分类原则放入系统中某一适合地点与已知细菌比较其相像性 ,用对照剖析方法确立细菌的分类地位。
若与已知细菌相同即采纳已知菌的名称 ,不一样者则按命名原则确立一个新名称。
二、分类等级细菌的分类等级与其她生物相同,挨次为界 (kingdom)、门(division) 、纲 (class)、目(order)、科 (family) 、属 (genus)、种 (species)。
细菌属于原核生物界 (procaryotae),包含有细菌、放线菌、支原体、衣原体、立克次体与螺旋体。
微生物学中的细菌分类
微生物学中的细菌分类微生物学是研究微小生物的学科，其中细菌是研究的重要对象之一，而对细菌进行分类是微生物学的基础和核心之一。
在细菌分类的基础上，才能深入了解细菌的生态、代谢、基因组等方面的特性。
一、古菌和细菌的区别在开始讨论细菌的分类之前，有必要先介绍古菌和细菌的区别。
曾经认为古菌和细菌是同一类微生物，但现在已经证实，古菌和细菌在生理、生态、基因组等方面有显著的区别。
最明显的区别是它们细胞壁的组成不同，细菌细胞壁含有肽聚糖，而古菌不含。
古菌也不像细菌那样造成人体疾病，它们在一些特殊环境中能够生存和繁殖，例如高温、高盐、低氧等情况。
目前，古菌被分为8个门，分别包括创建生命的古菌门，甲烷型古菌门等。
本文重点讨论细菌的分类。
二、形态分类细菌的分类可以从不同的角度进行，其中形态分类是最基本、最古老的分类方法之一。
细菌的形态类型有很多，包括球菌、杆菌、弧菌、螺旋菌等。
球菌如链球菌、溶血性链球菌、肺炎球菌等，通过染色法可以观察到它们组成的串珠状结构，因为它们生长时会分裂成一串。
杆菌则包括痢疾杆菌、大肠杆菌、结核杆菌等，它们的形态呈现出细长的棒状。
弧菌和螺旋菌则分别形成弯曲和螺旋形。
三、代谢分类细菌的代谢分类指的是它们在环境中的作用和代谢方式。
根据细菌的代谢方式，可以将细菌分为两类，即自养细菌和异养细菌。
自养细菌可以从无机物中合成有机物，因此与光合作用有关的细菌属于自养细菌，例如绿色光合细菌。
异养细菌不能从无机物中合成有机物，它们必须从其他生命体中获取有机物质，包括分解有机物和寄生等方式。
四、培养特性分类细菌的培养特性分类是指在实验室中，细菌的生长特性与需求，例如温度、pH值、营养物质等是否会影响其生长繁殖。
这个分类方法最早由德国细菌学家柯赖茨于1883年发明。
根据细菌对氧气的要求，细菌可以分为好氧菌、厌氧菌和兼性厌氧菌。
如果需要氧气才能进行呼吸代谢，称为好氧菌；如果在没有氧气的情况下可以代谢，称为厌氧菌；而能够同时进行好氧和厌氧代谢的称为兼性厌氧菌。
细菌的分类与命名
志”（IJSEM）原名“国际系统细菌学杂志” （IJSB）发表，如在其他杂志发表，必须提
交论文副本给该杂志公布，两年后无异议，
所提出的新细菌名称才能生效。
第二节 细菌的命名
• 细菌的命名依据国际细菌命名法规采用 “双名法”命名。即用“属名”加“种名” 来表示一个生物的学名。
• 书写时“属名”在前，用拉丁文或拉丁化 的名词表示，且第一个字母大写；“种名” 在后，用拉丁文或拉丁化的形容词或名词 所有格，小写。译成中文时，种名在前， 属名在后。
最重要和最基本的分类单元
• 在微生物分类中种是最重要和最基本 的分类单元，相似的种划归到一起构 成属，相似属构成科，依此类推，最 高的分类单元为界。
• 目前科和科以上的划分在细菌学中还 不太完善，而且随着研究的深入，科、 属的划分还会发生变动。
三、种和种以下分类单位及含义
1、种（species）
第1卷 一般医学和工业方面重要的G-细菌（1984年） 第2卷 放线菌以外的G＋细菌（1986年） 第3卷 古细菌、蓝细菌及其他G－细菌（1989年） 第4卷 放线菌（1989 年）
• 从2001年开始发行第2版，共分5卷，计划在数 年内出齐，内容将反映分子水平的细菌分类。
• 该书的姐妹篇是“伯吉氏细菌鉴定手册”
目前分类主要的依据 • 主要是根据种系发生关系，即分析其 基因的同源性，从而确定分类地位。 方法主要采用三种： 测定DNA分子中碱基(G+C)mol% 核酸分子杂交 16SrRNA寡核苷酸编目
五、细菌的分类体系
• 《伯吉氏系统细菌学手册》（Bergey’s Manual of Systematic Bacterology），由美国细菌学家Holt 主编，共四卷：
细菌生物学分类
细菌生物学分类
细菌是一类单细胞微生物，它们广泛存在于自然界中，包括土壤、水体、空气、动植物体内等各种环境中。
细菌的生物学分类是指将细菌按照其形态、生理特征、生态习性等方面进行分类，以便更好地了解细菌的特点和功能。
形态分类
细菌的形态分类是指将细菌按照其形态特征进行分类。
根据细菌的形态特征，可以将细菌分为球菌、杆菌、弧菌、螺旋菌等几类。
球菌是指形状呈球形或卵圆形的细菌，如链球菌、葡萄球菌等；杆菌是指形状呈杆状的细菌，如大肠杆菌、炭疽杆菌等；弧菌是指形状呈弧形的细菌，如弧菌属、螺旋菌是指形状呈螺旋形的细菌，如螺旋体属等。
生理分类
细菌的生理分类是指将细菌按照其生理特征进行分类。
根据细菌的生理特征，可以将细菌分为厌氧菌、好氧菌、兼性厌氧菌等几类。
厌氧菌是指只能在无氧环境下生长的细菌，如产气荚膜梭菌、厌氧梭菌等；好氧菌是指只能在有氧环境下生长的细菌，如链球菌、大肠杆菌等；兼性厌氧菌是指既能在有氧环境下生长，也能在无氧环境下生长的细菌，如肠球菌、乳酸菌等。
生态分类
细菌的生态分类是指将细菌按照其生态习性进行分类。
根据细菌的生态习性，可以将细菌分为土壤菌、水生菌、空气菌、动植物共生菌等几类。
土壤菌是指生活在土壤中的细菌，如放线菌、假单胞菌等；水生菌是指生活在水体中的细菌，如蓝藻、水葡萄球菌等；空气菌是指生活在空气中的细菌，如枯草芽孢杆菌、金黄色葡萄球菌等；动植物共生菌是指与动植物共生的细菌，如乳酸菌、酸奶菌等。
细菌的生物学分类是一项重要的工作，它有助于我们更好地了解细菌的特点和功能，为细菌的研究和应用提供了基础。
细菌分类方法
19世纪以来，以细菌的形态、生理特征为依据的分类奠定了传统的分类基础，它选择一些较为稳定的生物学性状，如细菌的形态结构、染色性、培养特性、生化反应、抗原性作为分类依据，然后按主次顺序逐级区分。这种方法使用方便，分类亦较为明确，但往往带有一定程度的盲目性。
（二）数值分类法
20世纪60年代，随计算机的应用而发展的细菌分类方法。它对细菌的各种生物学性状按“等重要原则”进行分类，一般需选用50项以上的生理、生化指标逐一进行比较，通过计算机分析各菌间相似度，划分细菌的属和种，并确定它们的亲缘关系。
细菌分类方法
细菌的分类是在对细菌的大量分类标记进行鉴定和综合分析的基础上进行的。用作细菌的分类标记有形态学、生理生化学、免疫化学和遗传学等方面的性状。近年来，应用各种现代化技术和设备研究细胞的化学结构和化学组成，分析它们的来源关系，为发展细菌分类学开拓了前景。
一、按表型特征分类法
细菌的形态、染色以及细菌的特殊结构是最早和最基本的分类依据，众多的理化特征如细菌生长条件、营养要求、需氧或厌氧、抵抗力、菌体成分、能否利用某些糖类和有机酸、蛋白质、氨基酸、代谢途径、代谢产生、呼吸酸、毒性酶、毒素、致病力等也一直作为分类依据。目前，以生理生化学作为细菌分类方法有两种，即传统分类法和数值分类法。
细菌种属鉴定一般采用形态学观察作初步鉴定，包括革兰氏染色、夹膜、鞭毛、运动性观察等。
然后进行生理生化实验做进一步鉴定，包括厌氧、好氧实验，完全培养基和基本培养基培养实验，降解性实验等系统的生理生化实验研究。
最后进行16sRNA序列扩增测序，将测到的序列与GENEBANK中已知的细菌序列相比较，根据亲缘关系远近最终确定种属。一般来说，90％以上的同源性就可以确定到属，确定到种的可能性很小。
细菌种属分类
细菌种属分类细菌（Bacteria）是生物的主要类群之一，属于细菌域。
细菌是所有生物中数量最多的一类依据分类标准不同，细菌的分类有所差异。
1、根据形状分为三类，即：球菌（包括单球菌、双球菌、链球菌、葡萄球菌等）、杆菌（比如肠杆菌）和螺旋菌（包括弧菌、螺菌、螺杆菌）。
2、按细菌的生活方式来分类，分为两大类：自养菌和异养菌，其中异养菌包括腐生菌和寄生菌。
3、按细菌对氧气的需求来分类，可分为需氧（完全需氧和微需氧）和厌氧（不完全厌氧、有氧耐受和完全厌氧）细菌。
4、按细菌生存温度分类，可分为喜冷、常温和喜高温三类。
5、根据细菌阴阳分类：革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。
例如：化脓性球菌都属于革兰氏氏阳性菌，它们能产生外毒素使人致病，而肠道菌多属于革兰氏阴性菌，它们产生内毒素，靠内毒素使人致病。
常见的革兰氏阳性菌有：葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等。
补注：①国际上最具权威性的细菌分类系统专著有“伯杰氏系统细菌学手册”和“伯杰鉴定细菌学手册”。
②细菌的分类层次与其他生物一样，也是界、门、纲、目、科、属、种，但细菌常用的是“属和种”，种是细菌分类的基本单位。
③细菌的结构分为基本结构和特殊结构。
基本结构是各种细菌都具有的结构，包括细菌的细胞壁、细胞膜、细胞质、核质。
某些细菌特有的结构称为特殊结构，包括细菌的荚膜、鞭毛、菌毛、芽胞。
④细菌主要以无性二分裂方式繁殖(裂殖)，即细菌生长到一定时期，在细胞中间逐渐形成横隔，由一个母细胞分裂为两个大小相等的子细胞。
⑤微生物划分为以下8大类——细菌、病毒、真菌、放线菌、立克次氏体、支原体、衣原体、螺旋体。
细菌分类学2各论
第六部分 螺旋和弯曲的细菌
单细胞，菌体螺旋状， 单细胞，菌体螺旋状，或形成弯曲的杆状 具有坚韧的细胞壁，革兰氏染色阴性， 具有坚韧的细胞壁，革兰氏染色阴性，以单极生鞭毛或两 极生鞭毛运动 化能异氧菌，大多数种不需要氨基酸， 化能异氧菌，大多数种不需要氨基酸，有机酸作为碳源和 能源，不能利用糖类。 能源，不能利用糖类。 好氧菌， 好氧菌，大部分是水生腐生菌 包括一科:螺菌科 包括一科 螺菌科
一 、粘细菌目 具有特殊的生活史——子实体阶段 具有特殊的生活史——子实体阶段 —— DNA的G+C含量很高67-71% DNA的G+C含量很高67含量很高67 粘细菌为革兰氏阴性化能异养型菌， 粘细菌为革兰氏阴性化能异养型菌，能在固体界面上做滑行 运动。 运动。 营养细胞为小杆状，横断分裂繁殖。 营养细胞为小杆状，横断分裂繁殖。 严格好氧菌， 严格好氧菌，氧化代谢型 粘细菌目包括孢囊杆菌亚目和堆囊菌亚目两个亚目。 粘细菌目包括孢囊杆菌亚目和堆囊菌亚目两个亚目。
光合细菌 简称 是地球上出现最早、 光合细菌(简称 细菌 简称PSB)是地球上出现最早、自然界中普遍存在、具有原始 是地球上出现最早 自然界中普遍存在、 光能合成体系的原核生物，是在厌氧条件下进行不放氧光合作用的细 光能合成体系的原核生物，是在厌氧条件下进行不放氧光合作用的细 原核生物 光合作用 菌的总称，是一类没有形成芽孢能力的革兰氏阴性菌， 菌的总称，是一类没有形成芽孢能力的革兰氏阴性菌，是一类以光作 革兰氏阴性菌 为能源、能在厌氧光照或好氧黑暗条件下利用自然界中的有机物、 为能源、能在厌氧光照或好氧黑暗条件下利用自然界中的有机物、硫 有机物 化物、氨等作为供氢体兼碳源进行光合作用的微生物。 化物、氨等作为供氢体兼碳源进行光合作用的微生物。 微生物
细菌生物学分类
细菌生物学分类细菌生物学分类细菌是一类非常小的单细胞微生物。
在自然界中，细菌广泛分布于各种环境中，包括土壤、水体、动植物体内等等。
由于细菌数量极为庞大，因此对细菌的生物学分类具有至关重要的意义。
本文将简要介绍细菌的生物学分类，并着重探讨现代分子生物学技术在细菌分类中的应用。
传统分类学传统分类学主要基于细菌的形态、生理特征、生化代谢等传统生物学特征进行分类。
根据细菌形态的不同，传统分类学将细菌分为球菌、杆菌、弧菌、螺旋菌等几大类。
此外，细菌的生理特征也是分类的一个重要依据，如革兰氏染色、革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌等。
生化代谢特征也被用于分类。
在此基础上，细菌被进一步分为许多菌属和菌种。
然而，传统分类学对于某些形态相似、生理代谢相同的细菌无法更好地进行分类。
例如，视杆菌和乳酸杆菌在生理代谢和形态上非常相似，但它们的生态环境和生命史差异很大。
另外，类似霉菌、蓝菌，以及放线菌等微生物在形态、生理等面貌上都有较大不同，但它们在分子水平上存在较高相似性的情况下，传统分类学的缺陷就更加凸显。
分子分类学分子分类学由于其对生命现象的描述更加准确、精细，成为了现代细菌分类学的重要手段。
基于分子分类学的方法，从而发现了如许多已知属的菌株间的高度相似性，例如在16S rRNA序列上的相似性等。
这也导致了本质性问题：如何在分子水平上更准确地分类和鉴定微生物。
分子分类学主要方法有多种，包括：1. DNA–DNA杂交DNA–DNA杂交是利用DNA分子的完全相同性或相似性来确定细菌菌株的亲缘关系的方法。
该方法包括：收集细菌的培养物，取细菌的DNA，测定DNA的相似度，进而根据DNA的相似度来确定两个孤立的细菌的菌种标准。
2.16S rRNA序列分析16S rRNA是细菌普遍存在的一个特异性RNA序列，可以用来辨别不同细菌。
16S rRNA序列在不同的细菌中具有相应的差异，因此可以用来确定细菌的分类位置。
16S rRNA序列分析是现代分子生物学和细菌学最重要的工具之一。
生物学 细菌有哪些分类
生物学细菌有哪些分类？细菌是一类原核生物，按照细菌的形态、代谢方式、生态特征和遗传关系等方面的差异，可以将细菌分为多个分类单位。
目前，细菌的分类系统主要基于其基因序列和进化关系的研究结果。
下面将介绍细菌的主要分类单位及其特征。
1. 基于形态特征的分类：-球菌（Coccus）：球状细菌，以分裂方式繁殖，如链球菌（Streptococcus）和葡萄球菌（Staphylococcus）等。
-杆菌（Bacillus）：长条状细菌，以分裂方式繁殖，如大肠杆菌（Escherichia coli）和炭疽杆菌（Bacillus anthracis）等。
-螺旋菌（Spirillum）：螺旋状细菌，如螺旋菌属（Spirillum）和钩端螺旋体属（Leptospira）等。
2. 基于代谢方式的分类：-厌氧菌（Anaerobes）：在缺氧条件下生长和繁殖的细菌，如产乙酸菌（Acetobacterium）和产丙酸菌（Propionibacterium）等。
-好氧菌（Aerobes）：需要氧气进行呼吸作用的细菌，如假单胞菌属（Pseudomonas）和链霉菌属（Streptomyces）等。
-兼性厌氧菌（Facultative anaerobes）：既可以在有氧条件下进行呼吸作用，也可以在无氧条件下利用发酵代谢，如大肠杆菌（Escherichia coli）和黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）等。
3. 基于生态特征的分类：-水生细菌（Aquatic bacteria）：生活在水体中的细菌，如水藻细菌（Cyanobacteria）和水生放线菌（Actinobacteria）等。
-土壤细菌（Soil bacteria）：生活在土壤中的细菌，参与了土壤有机物分解和养分循环，如枯草杆菌属（Bacillus subtilis）和拟杆菌属（Pseudomonas）等。
-肠道细菌（Gut bacteria）：寄生在动物消化道内的细菌，与宿主的消化和免疫系统密切相关，如乳酸菌属（Lactobacillus）和肠球菌属（Enterococcus）等。
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第二节细菌分类分类学
内容波及三个互相依存又有区其余构成部分:
分类 (classification) 是依据必定的原则 (表型特点相像性或系统发育有关性)对微生物进行分群归类，依据相像性或有关性水平摆列成系统，并对各个分类群的特点进行描绘，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴
定；
命名 (nomenclature) 是依据命名法例，给每一个分类群一个专有的名称；判定 (identification 或 determination) 则是指借助于现有的微生物分类系统，经过特点测定，确立未知的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。
一、分类单元及其等级
分类单元 (taxon, 复数 taxa) 是指具体的分类群，如原核生物界
(Procaryotae) 、肠杆菌科 (Enterobacteriaceae) 、枯草芽孢杆菌 (Bacillus subtilis) 等都分别代表一个分类单元。
细菌的分类单元分为七个基本的分类等级 (rank 或 category) 或分类阶元，由上而下挨次是：界、门、纲、目、科、属、种
在分类中，若这些分类单元的等级不足以反应某些分类单元之间的差别
时也能够增添 "亚等级 "即：亚界、亚门亚种，在细菌分类中，还能够在科 (或亚科 )和属之间增添族和亚族等级。
值得重申的是，分类单元的等级 (阶元 )不过分类单元水平的归纳，它其实不代表详细的分类单元。
在细菌分类中，还使用一些非正式的类群术语。
(1) 培育物 (culture) ，是指一准时间必定空间内微生物的细胞群或生长物。
如微生物的斜面培育物、摇瓶培育物等。
假如某一培育物是由单调微生物细胞生殖产生的，就称之为该细菌的纯
培育物 (pure culture) 。
（2）菌株(strain) ，从自然界中分别获取的任何一种微生物的纯培育物
或用实验方法(如经过诱变)所获取的某一菌株的变异型，（但为另一新
菌种）
菌株是微生物分类和研究工作中最基础的操作实体。
菌株名称常用数字编号、字母、人名、地名等表示。
如枯草杆
ASI.398( Bacillus subtilis ASI.398) 和枯草杆菌 BF7658(Bacillus subtil is BF7 658) ，分别代表枯草杆菌的两个菌株和BF7658 分别为菌株的编号)
（3）居群，每一个物种在自然界中的存在，都有必定的空间构造，在其
分其余、不连续的居住场所或散布地区内，形成不一样的集体单元
（4）型(form 或type) ，常指亚种以下的细分。
当同种或同亚种不一样
菌株之间的性状差别，不足以分为新的亚种时，能够细分为不一样的
型。
比如抗原特点的差别分为不一样的血清型；对噬菌体裂解反响的不一样
分为不一样的噬菌型等等。
（5）种(species) ，是生物分类中基本的分类单元和分类等级。
作为分
类单元的等级，种的地位低于属而高于亚种这是十分明确的。
微生物的种
能够看作是：拥有高度特点相像性的菌株群，这个菌株群与其余类
群的菌株有很显然的差别。
种作为分类单元，它指的是 "物种 "，高等生物中，物种往常被看作是相
互杂交能生殖的自然集体，这个集体与其余集体在生殖上是隔绝的
（6）亚种 (subspecies) 或变种 (variety) ，当某一个种内的不一样菌株存在少量显然而稳固的变异特点或遗传性状而又不足以区分红新种时，能够将这些菌株细分红两个或更多的小的分类单元 --亚种。
（7）属(genus) ，是介于种 (或亚种 )与科之间分类等级，也是生物分类
中的基安分类单元。
往常是拥有某些共同特点或亲密有关的种归为一
个高一级的分类单元，称之为属。
在系统分类中，任何一个已命名的种都归属于某一个属。
当某一个种与
其余有关属的种拥有重要的差别时，也能够判定为只有一个种的属。
就一般而言，微生物属间的差别比较显然，但属的区分也没有客观标准。
所以，属水平上的分类也会跟着分类学的发展而变化，属内所含种的数
二、分类单元的命名
地区性的俗名
生物名称
国际上一致使用的学名
俗名是一个国家或地域使用的一般名称，如我们把惹起人结核病的细菌叫"结核杆菌 "，而英语称 "tubercle bacillus" ，而俄语则称 "tубepky лёзнаяпалочка"。
长处是在必定的地区内平常易懂便于记忆，但俗名有限制性，特别是不
便于国际间的沟通。
学名是为了使生物分类单元的名称能在国际上通用，就需要拟订一个为各
国生物学工作者共同恪守的命名法例，即国际生物命名法例，来管理生物
分类单元的命名，以保证生物名称的一致性、科学性和适用性。
此刻分别由国际动物命名法例、国际植物命名法例和国际细菌命名法例
来分别管理各种生物的命名。
１.分类单元的命名
全部正式分类单元 (包含亚种和亚种以上等级的分类单元 )的学名，一定用
拉丁词或其余词源经拉丁化的词命名。
(1)属名
属名用一个单数主格名词或看作名词用的形容词来表示，能够是阳性、
阴性或中性，首字母要大写。
比如： Bacillus( 芽孢杆菌属 )( 阳性 )，拉丁词，原意为 "小杆菌 "，因该属
菌有芽孢而译为" 芽孢杆菌属"。
Clostridium( 梭菌属)(中性)，源于希腊词，原意为 "纺缍状菌 "。
Salmonella( 沙门氏菌属 )(阴性 )，以美国细菌学家 D.E.Salmon 的姓氏命名。
亚属分类单元的命名和属名同样。
(2)种名
细菌的种名也用双名法 (binomial nomenclature) 命名，即种的学名由属名和种名加词两部分组合而成。
第一个词为属名，首字母要大写；第二
个词为种名加词，常用形容词 (要与属名性别一致 )，也能够用人名、地名、病名或其余名词 (名词用主格或所属格形式 )，种名加词首字母不大写。
Pseudomonas aeruginosa( 铜绿色假单胞菌 )。
此中 Pseudomonas 是属名(假单胞菌属 )(阴性 )；aeruginosa 是种名加词，是拉丁语形容词 (阴性)，原意为 "铜绿色的 "。
Mycobacterium tuberculosis(结核分枝杆菌)。
此中Mycobacterium是属名(分枝杆菌属 )，系希腊词源的复合词 (中性 )，tuberculosis 是种名加词，是希腊词和拉丁词缀合成的名词所属格形式，意为 "结核病的 "。
当泛指某一属细菌而不特指该属中任何一个种(或不决种名)时，可在属名后加sp. 或spp.( 分别代表species 缩写的单数和复数形式) 表示，如Streptomyces sp.( 一种链霉菌 )，Micrococcus spp.( 某些微球菌 )。
(3)亚种名
亚种名为三元式组合，即由属名、种名加词和亚种名加词构成。
(4)属级以上分类单元的名称
亚科、科以上分类单元的名称，是用拉丁或其余词源拉丁化的阴性复数
名词 (或看作名词用的形容词 )命名，首字母都要大写。
此中细菌目、亚目、科、亚科、族和亚族等级的分类单元名称都有固定的词尾 (后缀 )，其余，在分类单元名称的后边还能够附上命名人的姓名和命名年号。
族、属、种和亚种等级的分类单元的学名在正式第一版物中应用斜体字印
2.命名模式及其指定
依据命名法例要求，正式命名的分类单元应指定一个命名模式 (简称模式 ) 作为该分类单元命名的依照。
种和亚种指定模式菌株(type strain) ；
亚属和属指定模式种 (type species) ；
属以上至目级分类单元指定模式属(type genus) 。