3限制性内切酶

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3.反应缓冲液:
反应缓冲液主要由Tris· HCl、NaCl、Mg2+组成, 其中Mg2+为内切酶辅基; Tris· HCl维持反应体系pH值在7.2-7.6之间; NaCl浓度不同形成3种级别的离子强度: 低盐(10mM NaCl) 中盐(50mM NaCl) 高盐(100mM NaCl) 不同的内切酶选择特定的反应缓冲液。
2.DNA:
作为内切酶底物,DNA应该具备一定的 纯度,其溶液中不能含酚、氯仿、乙醚、 SDS、EDTA、高盐浓度、酒精等,这些因 素的存在均不同程度影响限制性内切酶的 活力。 这种抑制可通过: 增加酶作用单位数(10~20U/ug DNA)、 增大反应体积以稀释可能的抑制剂 或延长反应时间加以克服。
酶切反应中应注意以下几个问题:
1.内切酶: 不应混有其它杂蛋白特别是其它内切酶或外切酶的污染; 注意内切酶的识别位点及形成的粘性末端; 内切酶的用量 根据内切酶单位和DNA用量而定,通常 1u指在适当条件下,1小时内完全酶解1ug特定DNA底 物所需要的限制性内切酶量,使用中一般以1ug DNA对 2-3u酶短时间为宜。 同时内切酶体积不能超过反应体系10%,因内切酶中含 50%甘油,体系中甘油超过5%会抑制内切酶活力; 使用时防止操作中对内切酶的污染。
4.酶解温度与时间:
大多数限制酶反应温度为37℃,如 EcoRⅠ, HindⅢ, BamHⅠ, PstⅠ等,也有 如BclⅠ需在50℃下进行反应, 反应时间根据酶的单位与DNA用量之比 来定,原则是酶:DNA=2-3:1 2小时即可,充分酶解。
实验方法
1.按下表分别加入各试剂(注意限制性 内切酶最后加入且在冰上操作)于 Eppendorf管中。 DNA 5μl 10×buffer 1μl 无菌水 3.5μl 内切酶 0.5μl 总体积: 10μl
实验目的及背景
核酸限制性内切酶是一类能识别双链DN wenku.baidu.com中特定碱基顺序的核酸水解酶,这些酶 都是从原核生物中发现,它们的功能犹似 高等动物的免疫系统, 用于抗击外来DN A的侵袭。 限制性内切酶以内切方式水解核酸链中的 磷酸二酯键, 产生的DNA片段5’端为 P,3’端为OH。
限制酶的类型
根据限制酶的识别切割特性, 催化条件及是否具 有修饰酶活性可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型三大类。 Ⅰ类和Ⅲ类限制性内切酶,在同一蛋白分子中兼 有甲基化作用及依赖ATP的限制性内切酶活性。 Ⅰ类限制性内切酶结合于特定识别位点,且没有 特定的切割位点,酶对其识别位点进行随机切割, 很难形成稳定的特异性切割末端。 Ⅲ类限制性内切酶在识别位点上切割,然后从底 物上解离下来。 故Ⅰ类和Ⅲ类酶在基因工程中基本不用。
Ⅱ型酶
Ⅱ型酶就是通常指的DNA限制性内切酶. 它们能识别双链DNA的特异顺序,并在这个顺序内进 行切割,产生特异的DNA片段; Ⅱ型酶分子量较小,仅需Mg2+作为催化反应的辅助因子, 识别顺序一般为4~6个碱基对的反转重复顺序; Ⅱ型内切酶切割双链DNA产生3种不同的切口--5’ 端突出;3’端突出和平末端。 正是得益于限制性的内切酶的发现和应用, 才使得人们 能在体外有目的地对遗传物质DNA进行改造,从而极大 地推动了分子生物学的兴旺和发展。
2.将反应体系充分混匀,并于台式离心 机上短暂离心。 3.Eppendorf管于37℃水管中反应1小 时。 4.反应结束后加入2μl的6XLoading buffer 以终止反应。 5.混匀后0.8%琼脂糖凝胶上60伏电泳2 小时。
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