昆虫基因组DNA的提取(CTAB法)
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昆虫基因组DNA提取方法—CTAB法
1. 将95% 酒精浸泡过的标本取出,用吸水纸吸去标本表面的乙醇,用1×TE Buffer浸泡两次,每次20min;
2. 解剖取个体胸部肌肉组织约0.02g,将组织转入1.5mL离心管加入1mL 液氮使其迅速冻结, 用玻璃棒迅速有力地将团状组织研磨成细粉末。
3. 然后加入600μL预热至60℃的2%CTAB提取缓冲液(2% CTAB,0.1mol/L Tris•Cl pH8.0,0.02 mol/L EDTA,1.4 mol/L NaCl),20mg/mLProK 2.5μL(终浓度100mg/mL),和β-巯基乙醇溶液1.0μL,轻轻混匀,60℃下恒温水浴2.0-3.0 hr,不时加以轻轻混匀。
4. 水浴后取出,等体积氯仿/异戊醇(24:1)混合液混匀,然后7,000 rpm 离心10min,取其上层清液,量体积;重复一次。
5. 在上层清液中加入2倍体积冷冻的无水乙醇于-20℃沉降2小时( 或1倍体积异戊醇于-20℃沉降1hr)。
4℃、10,000 rpm下离心15min,取沉淀, 小心弃上清。
6. 用500μL 70% 预冷的乙醇洗涤沉淀,10,000 rpm下离心5min,弃上清;重复一次。
7. 室温晾干或抽真空干燥;用40μL TE Buffer重溶。
8. 于基因组DNA中加入终浓度为50ug/mL的RNase(每次使用前90℃灭活10min),于37℃消化1.0-1.5hr。
9. 用0.8%的琼脂糖凝胶检测,取3μL DNA样品及2μL Load-buffer (含溴酚蓝和缓冲液),加入点样孔。
实验所用Marker是 DNA(EcoR/HindIII),100V 电压电泳90分钟。
凝胶成象分析仪进行检测。
10. 用紫外可见分光光度计测定DNA的OD值,判定DNA纯度和浓度。