image_j的中文使用方法-值得借鉴哈

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Image j 基本操作

Image j 基本操作

Image j 基本操作imagej菜单栏列出了ImageJ的所有命令,它包含八个菜单:File:基本的文件操作,包括打开、保存、创建新图片,大多数命令看名字就知道什么意思Edit:编辑和绘制操作,以及全局设定Image:图像显示,包括图像格式的转化、怎样显示等Process:图像处理,包括点操作、过滤器和算术运算Analyze:图像分析,统计测量、直方图绘制和其他与图像分析有关的操作Plugins:创建、编辑和管理插件,列出了用户安装的所有宏、脚本和插件。

Window:已打开的窗口的选择和管理Help:升级,文档资源和版本信息File菜单New新建可以新建的东西有很多:Image:可以指定图片的标题、类型、尺寸、初始填充。

且如果Slices大于1,则创建了一个stackHyperstack:与Image-Hyperstacks-New Hyperstack相同Text Window:创建一个编写宏的文本窗口Internal Clipboard:打开ImageJ内部剪贴板中的内容System Clipboard:打开系统剪贴板中的内容TrakEM2:Fiji中还加入了编写TrakEM2程序Script:Fiji中还加入了新建脚本。

Open打开可以打开的东西也有很多:常见图片,后缀有TIFF、GIF、JPEG、DICOM、BMP、PGM和FITS格式。

也可以通过插件打开额外的后缀的图片ImageJ和NIH的图片查询表,后缀是.lut以制表符分割的表格,后缀是.xls和.csv选区,后缀是.roi和.zip文本文件,后缀是.txt、.ijm、.js和.java其他Open Next打开下一个关闭当前图片,打开目录中的下一个图片(如果有的话)。

按住Alt打开目录中的前一个图片(如果有的话)。

Open Samples打开样例打开ImageJ服务器上的样例图片,可以用来测试宏、脚本、插件等。

Open Recent打开最近文件子菜单会显示最近15个打开的文件,可以选择其中一个。

老司机带你解锁ImageJ长度分析

老司机带你解锁ImageJ长度分析

⽼司机带你解锁ImageJ长度分析ImageJ分析长度⼀般⽅法最常见的长度分析为直线的长度分析,在ImageJ新建线段长短、粗细不⼀的图⽚:分析步骤:1、点击Analyze -> Set Measurements进⼊测量参数界⾯,选择Bounding rectangle参数,Area 与Limit to threshold,点击OK:2、Image -> Adjust -> Threshold选中五个不同的形状,红⾊代表选中:3、Analyze -> AnalyzeParticles分析粒⼦,选择Display results、Add to Manager,点击OK:得到测量结果,Width为各形状长度:此外对于简单的长度测量还可以使⽤⼿动测量的⽅法,选择Straight直线⼯具沿着形状绘制直线后点击Analyze -> Measure进⾏测量形状1长度,与前述⽅法相同所得长度⼀致,均为97:扩展:⾮直线的⼿动长度计算,以拟南芥初⽣根长度分析为例。

步骤:1、使⽤ImageJ软件打开待分析图⽚:2、选择⼯具栏Segmented line⼯具,⼿动确定锚点追踪主根长度:这样追踪的主根长度不够平滑,可使⽤Edit-> Selection -> Fit Spline进⾏处理后点击Analyze ->Measure进⾏测量。

对于Fit Spline处理的效果可见下图,右侧是原始折线,左侧为Fit Spline 处理后的效果:ImageJ计算植物根系长度以2016年Front Plant Sci⽂献【1】中的拟南芥初⽣根(primary root)长度分析为例给⼤家分享使⽤ImageJ计算曲线长度。

分析步骤:1、ImageJ软件(FiJi版本ImageJ 1.52 t)File -> Open打开⽰例图⽚(为RGB格式图⽚)。

Process -> Enhance Contrast增强对⽐度,默认Saturated pixels 0.3%:左侧为原图,右为Enhance Contrast处理效果:2、Image -> Type -> HSB Stack将RGB格式图⽚转换为HSB格式,即H(hues)表⽰⾊相,S(saturation)表⽰饱和度,B(brightness)表⽰亮度H。

image j批量处理图片的三种方法

image j批量处理图片的三种方法

image j批量处理图片的三种方法(从傻瓜式到看不懂)方法一:使用批处理功能1、打开宏命令录制窗口:Plugins-Macros-Record2、打开一张图片进行你要进行的操作3、复制Recorder窗口里录制的宏命令4、打开批处理Process-Batch-Macro...点击这里正式批处理。

批处理默认状态下不会在桌面上加载图片,这样运行速度会更快。

➢在Image j工具栏下面可以看到批处理的进度条,这样可以判断批处理是否已经完成。

➢如果想要提前终止批处理,可以按esc键退出。

个人要按两三次才能够退出,不知道批处理的局限性:1、在处理过程中有部分插件的操作宏录制功能无法录制。

如IHC Toolbox插件里面Select Model里面进行H-DAB模式选择这一操作就无法识别,使用批处理会暂停在这一阶段。

2、在图片处理过程中,有时候会从一张图片中分离出多张图片,这时候难免要进行窗口的选择。

而宏命令录制功能录制下的宏命令会包含你选中的窗口文件名。

直接复制粘贴,批处理会反复查找你录制的那张图片而报错。

批处理的优化:1、解决窗口选择问题。

在批处理窗口大输入框,第一行输入如下宏命令,该命令意思是获取你进行操作的图片文件名,并用title这个代号表示。

注意不要忘记后面的分号,英文状态下输入。

title=getTitle();在需要选取窗口的阶段输入,通过该命令除了可以改变接下来处理的图片窗口,也可以改变保存哪一个窗口的图片。

一般插件处理图片都是在原有文件名的基础上加入后缀,比如使用Colour Deconvolution里的H-DAB颜色分离功能就会把图片分为带-(Colour_1)、-(Colour_2)、-(Colour_3)三种类型后缀的图片窗口。

假如我们需要选择含有-(Colour_2),就可以输入以下代码。

selectWindow(title+"-(Colour_2)");2、添加快捷键让操作更快Plugins-Shortcuts-Add Shortcut...Shortcut里面选择你要设置的快捷键。

附imagej的多种实用技巧

附imagej的多种实用技巧

附imagej的多种实用技巧
以下是一些使用ImageJ的多种实用技巧:
1. 像素测量:使用ImageJ的测量工具可以准确测量图像中的像素长度、角度和面积。

2. 对比度调整:使用ImageJ的对比度/亮度调整工具可以增强图像的对比度,使细节更加清晰。

3. 图像校正:使用ImageJ的图像校正工具可以对图像进行旋转、翻转和裁剪,以使其对齐和修复。

4. 图像滤波:使用ImageJ的滤波器可以应用各种滤波器,如高斯滤波器、中值滤波器等,以去除图像中的噪声。

5. 图像分割:使用ImageJ的图像分割工具可以将图像分割为不同的区域,以便进行进一步的分析和处理。

6. 图像拼接:使用ImageJ的图像拼接工具可以将多个图像合并为一个大的图像,以获得更广阔的视野。

7. 图像配准:使用ImageJ的图像配准工具可以将多个图像对齐,以消除图像间的位移和变形。

8. 图像分析:使用ImageJ的图像分析工具可以进行各种图像分析,如粒子计数、形状分析、颜色分析等。

9. 批处理:使用ImageJ的批处理功能可以自动处理多个图像,以提高工作效率。

10. 插件和脚本:ImageJ具有丰富的插件和脚本库,可以通过安装和使用这些插件和脚本来扩展ImageJ的功能。

软件Image J使用教程

软件Image J使用教程

作图软件:Image J介绍:该软件可以计算选定区域内分析对象的一系列几何特征,分析指标包括:长度,角度,周长,面积,长轴,短轴,圆度等。

参考:解螺旋-套路课01-第三章-第3节两种应用:免疫组化定量分析,计数免疫组化定量分析3种方法:手动、自动1、自动2【1】手动定量1.打开图片File –open –找到图片2.选择完所有阳性结果后,再同一进行计算Analyze –tools –ROI manger(感兴趣区域)然后标签栏选择第3个标签(以任意形状选取感兴趣区域)【2】自动定量11. 打开图片File –open –找到图片2. 彩图转换为8bit灰度图Image –type –8-bit3. 设定阈值Image –adjust –threshold系统会自动设定一个阈值,并将阈值之上的面积进行统计,此时打开免疫组化原始图片,手动调节阈值大小,当我们设定的阈值能够比价好的反应免疫组化的生物学意义时,就使用此时的阈值统计4. 统计Analyze –measure得到4个参数:area(阳性区域总面积),mean(平均光密度),min(最小光密度),max(最大光密度),后续作图用。

【3】自动定量21. 打开图片File –open –找到图片2. 彩图转换为RGBImage –type –RGB stack在得到的图片中,通过拖动下方的进度条,选取对比度最显著的那张3. 设定阈值Image –adjust –threshold系统会自动设定一个阈值,并将阈值之上的面积进行统计,此时打开免疫组化原始图片,手动调节阈值大小,当我们设定的阈值能够比价好的反应免疫组化的生物学意义时,就使用此时的阈值统计4. 统计Analyze –measure得到4个参数:area(阳性区域总面积),mean(平均光密度),min(最小光密度),max(最大光密度),后续作图用。

计数例如:克隆形成实验定量分析两种方法:手动计数、自动计数【1】手动计数1. 打开图片File –open –找到图片2. 点击工具栏第7个按钮“多点计数工具”在每个克隆上进行点击,每点一下,图上就会多一个软件加上的点3. 所有的点都选上之后,点击analyze –measure软件会生成一个结果图拉到最下面,就可以看到一共有多少点【2】自动计数1. 打开图片File –open –找到图片2. 彩图转换为8bit灰度图Image –type –8-bit3. 设定本张图中最大克隆和最小克隆设置最大克隆:点击工具栏第3个按钮,然后圈出本图中最大的克隆,再analyze –measure,看这个克隆的面积,例如area = 276设置最小克隆:点击工具栏第3个按钮,然后圈出本图中最小的克隆,再analyze –measure,看这个克隆的面积,例如area = 544. 设定阈值Image –adjust –threshold系统会自动设定一个阈值,并将阈值之上的面积全部用红色标记如果不合适,可手动调节因为阴影的存在,软件把这些阴影也识别为阳性结果,我们需要通过对克隆大小的限定,从而将阴影排除在阳性结果之外5. 通过对克隆大小的限定,从而将阴影排除Analyze –analyze particles在size(pixel^2)处填入克隆的大小范围,结合第3步的结果设置:30---300,点击“OK”这样,阴影就被排除了6. 拉到最低,便可以看到克隆的数量。

imagej使用教程

imagej使用教程

imagej使用教程ImageJ是一款免费开源的图像处理软件,被广泛应用于生物医学图像的分析和处理中。

本教程将向您介绍如何使用ImageJ进行基本的图像处理。

1. 安装ImageJ首先,您需要从ImageJ的官方网站(https:///ij/)下载并安装ImageJ软件。

根据您的操作系统,选择适合的安装程序进行安装。

2. 打开图像在ImageJ的菜单栏上,选择"File"(文件),然后点击"Open"(打开)。

浏览您的计算机,选择要处理的图像文件并点击"Open"(打开)按钮。

3. 调整图像大小如果您需要调整图像的大小,可以在菜单栏上选择"Image"(图像),然后点击"Adjust Size"(调整尺寸)。

在弹出的对话框中,输入所需的宽度和高度,并选择插值算法。

点击"OK"(确定)按钮应用更改。

4. 调整亮度和对比度您可以在菜单栏上选择"Image"(图像),然后点击"Adjust"(调整)来调整图像的亮度和对比度。

在弹出的对话框中,拖动亮度和对比度滑块,直到您满意为止。

点击"OK"(确定)按钮应用更改。

5. 进行滤镜处理ImageJ提供了多种滤镜工具,以改变图像的外观。

在菜单栏上选择"Process"(处理),然后点击"Filters"(滤镜)来选择所需的滤镜效果。

在弹出的对话框中,您可以调整滤镜的参数,然后点击"OK"(确定)按钮应用更改。

6. 测量图像特征ImageJ允许您测量图像中的各种特征,如面积、长度、角度等。

在菜单栏上选择"Analyze"(分析),然后点击"Measure"(测量)来测量图像的特征。

在弹出的结果窗口中,您可以查看测量结果。

imagej操作流程

imagej操作流程

imagej操作流程下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成,希望大家下载以后,能够帮助大家解决实际的问题。

文档下载后可定制随意修改,请根据实际需要进行相应的调整和使用,谢谢!并且,本店铺为大家提供各种各样类型的实用资料,如教育随笔、日记赏析、句子摘抄、古诗大全、经典美文、话题作文、工作总结、词语解析、文案摘录、其他资料等等,如想了解不同资料格式和写法,敬请关注!Download tips: This document is carefully compiled by theeditor.I hope that after you download them,they can help yousolve practical problems. The document can be customized andmodified after downloading,please adjust and use it according toactual needs, thank you!In addition, our shop provides you with various types ofpractical materials,such as educational essays, diaryappreciation,sentence excerpts,ancient poems,classic articles,topic composition,work summary,word parsing,copy excerpts,other materials and so on,want to know different data formats andwriting methods,please pay attention!ImageJ操作流程详解:从新手到专家的进阶指南ImageJ是一款广泛应用于生物学、医学、物理学等领域,专门处理和分析图像的开源软件。

imagej二值化处理

imagej二值化处理

imagej二值化处理
ImageJ二值化处理
ImageJ是一款非常强大的数字图像处理软件,可以用来对数字图像进行各种操作,包括图像缩放、旋转等。

ImageJ也可以用来对数字图像进行二值化处理,使图像中的像素只有黑白两种状态,只能实现黑白的效果,不能实现彩色效果。

本文将介绍如何使用ImageJ进行二值化处理,以达到黑白效果,以及一些技巧和注意事项。

一、简介
tImageJ是一款强大的图像处理软件,可以用来进行图像分析、图像校正、灰度变换等操作。

它也可以用来进行二值化处理,使图像中的像素只有黑白两种状态,只能实现黑白的效果,不能实现彩色效果。

二、步骤
1. 打开ImageJ,从“文件”中打开待处理的图像。

2. 从弹出的窗口中选择“灰度和二值化”,点“确定”;
3. 在弹出的窗口中,输入阈值,点“确定”;
4. 程序会根据输入的阈值,对图像进行二值化处理,使图像中的像素只有黑白两种状态,只能实现黑白的效果,不能实现彩色效果;
5. 处理完成后,可以从“文件”菜单中保存图像,保存的图像只显示两种颜色:黑色和白色。

三、技巧和注意事项
1. 阈值的设定是影响二值化处理效果的重要因素,一般来说,可以在0~255之间任意设定阈值,阈值越大,处理后的图像越“黑”;阈值越小,处理后的图像越“白”。

2. 如果图像太大,可以先将图像缩小,以减少处理时间。

3. 二值化处理后,图像有时会出现“噪声”,噪声部分可以用鼠标涂黑或涂白后,重新保存图像,以消除噪声。

imageJ中文开发教程

imageJ中文开发教程

imageJ中文开发教程ImageJ开发教程(苑永超整理,仅供参考,勿作商业用途)目录一、ImageJ简述 (2)二、ImageJ内部结构 (3)三、ImageJ通过插件扩展功能的方法 (4)三、插件编辑、编译、运行与部署 (6)四、主要的包介绍 (8)五、重要类方法介绍 (10)1、创建图象和图象栈 (10)2、创建图象处理器 (11)3、载入和存储图象 (11)4、图象参数 (11)5、操作像素 (11)6、图象转换 (12)7、直方图与图象统计量 (12)8、点运算 (12)9、滤波器 (13)10、几何运算 (13)11、图形运算 (14)12、显示图象和图象栈 (14)13、图象栈上的操作 (15)14、感兴趣的区域 (16)15、图象属性 (17)16、用户交互 (17)17、插件 (18)18、窗口管理 (19)19、其他函数 (19)六、学习资源 (20)ImageJ官网(/doc/2518836251.html,/ij/index.html)上有英文的用户手册和教程,以及一些例子。

本教程主要是为看英文比较累的朋友提供一些快速的入门。

如果想在ImageJ上开发自己的图象处理算法,建议先熟悉java编程知识。

本教程基本不对ImageJ菜单中提供的各种文件操作、图象编辑、图象处理、图象分析等功能作详细介绍,请读者自行探索;也不准备介绍数字图象处理的各种算法和操作,本文假定读者是图象处理方面的专业人士,本教程的重点是如何进行二次开发,如果不特别指出,文中的部分内容和例子都为ImageJ软件包自带或采自相关书籍(如《数字图像处理-java语言描述》),中文注释是后加的。

一、ImageJ简述图象处理的流程无外乎就是打开图象数据文件,将图象数据加载到内存,然后对该内存中的图象数据进行一系列处理(分割、检测、滤波、合成、识别、显示等等),最后可能还需要将处理结果保存成某种格式的文件。

对于一般的用户来说,类似ACDsee之类的傻瓜式的软件足够了。

使用imagej diameterj的技巧

使用imagej diameterj的技巧

使用imagej diameterj的技巧使用ImageJ和DiameterJ的技巧简介ImageJ是一款免费的图像处理和分析软件,它提供了丰富的功能和工具,用于处理和测量图像。

其中一个非常有用的插件是DiameterJ,它可以实现图像中物体的直径测量。

本文将介绍如何使用ImageJ和DiameterJ进行直径测量,并分享一些技巧和注意事项。

一、安装和准备1. 下载并安装ImageJ软件,可以从官方网站()上获取最新版本。

2. 安装完成后,打开ImageJ,然后点击"Plugins" -> "Manage Plugins",在插件列表中搜索"DiameterJ"并安装。

3. 准备要测量的图像,可以从本地文件夹导入,或通过ImageJ的"File"菜单中的"Open"选项打开。

二、测量直径1. 打开要测量的图像,确保图像属于8位灰度图像或32位浮点图像。

如果不是,请使用ImageJ的"Image"菜单中的"Type"选项将其转换为适当的格式。

2. 选择测量工具。

在ImageJ的工具栏中,可以看到不同的测量工具,包括线段、圆形和椭圆等。

根据图像中物体的形状选择适当的测量工具。

3. 在图像上点击并拖动,绘制一个与物体直径或周长相切的线段、圆形或椭圆。

4. 单击"Analyze"菜单,选择"DiameterJ",然后选择"Measure"选项。

DiameterJ将自动测量出物体的直径并显示在结果窗口中。

三、技巧和注意事项1. 精确选择:在绘制测量工具时,要尽量准确地选择与物体相关的区域。

避免选择与其他物体重叠或干扰的区域。

2. 多次测量:如果测量对象有多个直径或周长,可以使用多次测量来获取更准确的平均值。

老司机带你解锁ImageJ实用技巧(下)

老司机带你解锁ImageJ实用技巧(下)

老司机带你解锁ImageJ实用技巧(下)文章转载自公众号科研讲坛,作者半夏今天我们继续来聊一聊ImageJ的高阶使用技巧。

问题三、为什么总是全部圈起来的灰度值,有没有大神指导呢求助!本问题涉及免疫印迹(Western Blot)分析,提问者不能分别得到每个条带的值。

灰度值0为纯黑,255为纯白,灰度值与光密度值(OD值)的关系如下图所示:以灰度来统计WB条带的话,无条带的纯白255左右,条带越黑着色越深灰度值反而越小,这与我们的认知不符。

步骤:1. File -> Open -> 打开需要分析的WB条带。

2. Image –> Type -> 8-bit, 将图像转换为8-bit的灰度图片;Image-> Invert,黑白反转,得到如下图片:3. Analyze -> Calibrate, 校正光密度值Function中选择Uncalibrated OD,左下方Global calibration,勾选表示有多张图片打开时对所有图片进行此操作。

否则只对当前图片进行此操作。

4. 在工具栏中选择矩形工具——Rectangular, 最左边的为矩形工具,选择条带:键盘上按数字1,弹出如下提示框:点Yes,键盘上按数字3,得到如下:5. 工具栏中选择直线工具——Straight,下图最右边的为直线工具,按住Shift键使用直线工具画竖线将步骤4的峰进行分割:6. 选择魔棒工具——Wand tool,分别点击分割好的峰,即可得到结果,保存结果(File -> Save as…)即可:7. WB统计分析一般将对照组标准化为100%或1,上述结果6个条带前3个为对照组。

在Excel中,先计算对照组3个的平均值(AVERAGE(B2:B4)):然后所有B列的数值除以对照组平均值,此时对照组的均值为1:8. 将所得数据放入Graphpad prism绘图即可:拓展:弯曲的WB条带应如何使用ImageJ拉直?1. 使用Segmented line沿着倾斜条带画间断线段:2. 双击Segmented line,设置线段的宽度至包含所有条带:3. 点击菜单栏Edit -> Selection-> Straighten,倾斜的WB条带即可拉直:问题四、如何统计SEM图片小球数量?步骤:1. 打开ImageJ软件,File -> Open打开SEM图片。

Image J官方简体中文快速 入门指南

Image J官方简体中文快速 入门指南

ImageJ 入门by tree_cmu 2011-10-201 Image J 是什么?ImageJ是一个基于java的公共的图像处理软件,它是由National Institutes of Health开发的。

可运行于Microsoft Windows,Mac OS,Mac OS X,Linux,和Sharp Zaurus PDA等多种平台。

其基于java的特点,使得它编写的程序能以applet等方式分发。

ImageJ能够显示,编辑,分析,处理,保存,打印8位,16位,32位的图片,支持TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS等多种格式。

ImageJ支持图像栈(stack)功能,即在一个窗口里以多线程的形式层叠多个图像,并行处理。

只要内存允许,ImageJ能打开任意多的图像进行处理。

除了基本的图像操作,比如缩放,旋转,扭曲,平滑处理外,ImageJ还能进行图片的区域和像素统计,间距,角度计算,能创建柱状图和剖面图,进行傅里叶变换。

[1]2 ImageJ可以做什么?概括一下,主要分为以下几个方面:A)图像的区域和像素统计(大小)。

长度,角度。

阳性点密度和数量B)光密度或辉度,并制备密度直方图和线性图。

C)两种蛋白共定位的程度(丁香园有篇专门介绍帖子/bbs/thread/18145886?keywords=image%20J#18145886)D)卷积,Sholl分析,傅里叶分析(这些还不会使用)E)更多功能3 Image 界面[2]界面分为:菜单栏,工具栏和状态栏。

菜单栏菜单栏从左至右分别是:文件,编辑,图形,处理,分析,插件,窗口,帮助。

文件和office word 等软件类似,主要有文件打开,关闭,保存等功能,比较特殊的一个功能是恢复功能(revert),可以直接回到上次保存过的状态。

由于编辑菜单里的取消功能(undo)只能回退一步,所以revert有时会很有帮助。

干货一把西瓜子也能教会你ImageJ图片分析

干货一把西瓜子也能教会你ImageJ图片分析

干货一把西瓜子也能教会你ImageJ图片分析在我开始学习图片分析软件「ImageJ」的时候,实验室的大神给了我一把西瓜子说:「瓜子会教会你 ImageJ 的!」我开始不以为然,一把瓜子能够教会我什么?后来事实证明我错了,瓜子教会了我细胞计数的各种方法、面积计算、ROI 的使用、颜色编码与伪彩的使用等等。

是不是不可思议,今天给大家分享一下瓜子是如何实现 ImageJ 教学的!超长干货,先收藏再慢慢看咯~一、细胞计数1、ImageJ 软件 File -> Open 打开自己准备的瓜子图片:2、瓜子图片中间颜色较浅,使用 Process –> Enhance Contrast 增强对比:3、Image –> Type 将图片由 RGB Color 转变为 HSB Stack,HSB:Hue(色度)、Saturation(饱和度)与 Brightness(亮度)。

Stack 图像分别为色度、饱和度与亮度:Image –> Duplicate 复制亮度图片:4、Find Maxiam 细胞计数Process -> Find Maxiam,浅色背景勾选 Light background,Preview point selection 可预览结果:调节 Noise tolerance 参数决定计数的准确性,即在瓜子上戳有且唯一的点。

参数不合适可能漏选或多戳点,导致计数不准确:Find Maxiam 下 Output Type 选择 Count,即可得到计数结果为 23:5、Muliti-point tool 工具手动计数验证计数结果,确为 23 颗瓜子:二、ImageJ 快速计数同类型图片如何快速计数?ImageJ 可以录制 Macro,只需要点击运行宏就可以进行快速分析。

快速分析步骤:1、 ImageJ 软件 File -> Open 打开瓜子图片。

2、 Plugins -> Macros -> Record… 开始录制宏:3、 Image -> Type -> 8-bit,这一操作就会被录制下来:4、 Image -> Adjust -> Threshold 选择阈值 Minimum,红色代表选中:5、 Analyze -> Analyze particles,选择 Display results、Summarize 与 Add to manager,点击 OK 得到结果。

使用ImageJ给照片添加刻度尺

使用ImageJ给照片添加刻度尺

使用ImageJ给照片添加刻度尺步骤一:安装和启动ImageJ安装完成后,启动ImageJ软件。

步骤二:导入照片在ImageJ软件界面上,你会看到一个菜单栏和一个工具栏。

点击菜单栏上的 "File",然后选择 "Open",从你的计算机中导入你想要编辑的照片。

步骤三:选择刻度工具在工具栏上,你会看到一系列不同的工具。

我们需要选择刻度工具来添加刻度尺。

点击工具栏上的 "Straight Line Tool"(直线工具),然后将鼠标放在照片上想要添加刻度尺的位置。

步骤四:测量刻度尺使用直线工具在照片上绘制一条与实际刻度长度相对应的直线。

然后,点击菜单栏上的 "Analyze",选择 "Set Scale"(设定刻度),进入测量刻度尺的界面。

在测量刻度尺的界面中,输入刻度长度和相应的单位。

同时,确保 "Global"(全局)选项被选中,并点击 "OK" (确定)按钮。

步骤五:添加刻度尺回到照片上,在直线工具下拉菜单中,选择 "Segmented Line Tool"(分段线条工具)。

然后,点击照片上的刻度线的两个端点来绘制出完整的刻度尺。

步骤六:保存和导出照片当刻度尺添加完成后,点击菜单栏上的 "File",然后选择"Save"(保存),将图片保存在你的计算机上。

如果你想将照片导出为其他格式,点击菜单栏上的 "File",然后选择 "Save As"(另存为),选择导出格式,并点击 "Save"(保存)按钮。

注意:为了保持图像质量,请尽量选择无损压缩格式如PNG 或TIFF进行保存。

以上就是使用ImageJ给照片添加刻度尺的步骤。

希望本文对你有所帮助!。

imageJ功能简单解析

imageJ功能简单解析

1Image Types and Formats1.1>image>type〔此子菜单确定图像的类型或将其转换为另一种类型,所支持的转换如下〕1.1.18-bit转换为256(28)个灰度级别的图像(只有整数)1.1.216-bit转换为65,536(216)灰度级别的图像(仅限整数)1.1.332-bit转换为4,294,967,296(232)灰度(实数)的图像,像素由浮点值表示〔RGB图像转换为灰度使用灰色的公式=(红+绿+蓝)/ 3或灰色= 0.299×红色+0.587×绿色+ 0.114×蓝色〕1.1.48-bit color 用Heckbert’s median-cut color quantization algorithm将图像转换为8位RGB彩色图像1.1.5RGB color 转换为32位RGB彩色图像将一彩色图像分解为三不同类型的彩色:1.1.6RGB stack 转换为3层(红、绿、蓝)堆栈1.1.7HSB stack 转换为3层(色相、饱和度和亮度)堆栈1.1.8Lab stack 〔...〕1.2>image>adjust〔此子菜单包含调整亮度/比照度、阈值级别和图像大小的命令〕对于8位图像,通过更新图像的查找表(lookup table,LUT)来改变亮度和比照度,像素值不变。

对于16位和32位的图像,通过将像素值映射到8位来显示,像素值也保持不变。

RGB图像通过修改像素值来改变RGB图像的亮度和比照度1.2.1Brightness/Contrast实质是对图像直方图调节(1)minimum和maximum分别改变图像的最小值和最大值,来修改图像的像素值围(2)brightness和contrast分别修改直线的斜率和截距来改变图像的亮度和比照度〔直线意义...〕1.2.2Window/Level实质和B&C的亮度和比照度调节一样1.2.3Color Balance对red,green,blue,cyan,magenta,yellow,all共7种颜色选项进展minimum、maximum和brightness调节1.2.4Threshold〔only for grayscale images〕设置较低和较高的阈值,将灰度图像分割成感兴趣的特征和背景〔对灰度图像直方图进展分割〕共16种阈值选取方法,3种展示方法1.2.5Color Threshold基于色相饱和度和亮度(HSB)、红绿蓝(RGB)、Lab或YUV的24位RGB图像阈值,分割图像共16种阈值选取方法,3种展示方法1.2.6Size缩放到指定的宽度和高度(以像素为单位)可选择保持原来的长宽比可选择在缩小图像大小时检查平均值,以获得更好的结果。

imagej教程

imagej教程

(1)打开imagej,将图片拖入imagej。imagej能识别鼠标所 在位置的像素点坐标。记下标尺上单位长度所对应的像素点 距离。此标尺中1405个像素点距离对应100 um。
(2)设置281个像素点对应20 um。
(3)将需要设置标 尺的金相照片拖入软 件。点开Scale Bar对 话框。
(3)点击lyze Particles选项,出现右侧对 话框。输入要统计的碳化物的尺寸范围。
(4)结果依次碳化物数目、面积大小,平均 尺寸,面积分数。这里面积单位是平方微米, 如果没有Set Scale,面积以像素点为单位。
报告人马凯imagej软件对金相照片加标尺和碳化物统计目录一imagej软件介绍二imagej软件给金相照片加标尺三imagej软件统计第二相一imagej软件介绍?imagej能打开任意多的图像进行处理
imagej软件对金相照片加标尺和碳化物统计
报告人:马凯
目录
(一)Imagej软件介绍 (二)Imagej软件给金相照片加标 尺
(4)在ScaleBar对话框里设置需要的标尺长 度,位置,颜色等。
(5)将已经设置好 标尺的金相照片导 出。
对比度高的第二项统计
(1)将要统计第二相的金相照片拖入imagej。
M42一次淬火三次回火后500×金相照片
(2)将金相照片转换成8-bit格式。
(2)调节碳化物和基体的对比度,以尽量清 晰准确显现碳化物的轮廓为止。
(三)Imagej软件统计第二相
(一)imagej软件介绍
• ImageJ能打开任意多的图像进行处理。除 了基本的图像操作,比如缩放,旋转, 扭 曲,平滑处理外,ImageJ还能进行图片的 区域和像素统计,间距,角度计算,能创 建柱状图和剖面图,进行傅里叶变换。
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ImageJ这套软件可以自动帮你你计算细胞数,也可以定量分析DNA电泳或是Western blot条带。

step 1.首先打开软件后,开启图档
ImageJ这套软件可以自动帮你你计算细胞数,也可以定量分析DNA电泳或是Western blot条带。

step 1.首先打开软件后,开启图档
step 2.请先做校正,选择Analyze底下的Calibrate选项,再选择校正的模式,使用Uncalibrate OD,再按ok
按下ok之后会出现校正的图形
Step 3.在要分析的第一条(first lane)加上一个长型框(工具列第一个选项),再按下Analyze/Gels/select first Lane快速键(Ctr+1),此时框架中会出现一个号码1,之后可以移动框架到第二个lane再选择Analyze/Gels/select second Lane快速键(Ctr+2),当然可以一直加下去,最后按Analyze/Gels/plot Lanes快速键(Ctr +3)。

Step 4.分析以后会出现图型表示你刚选择的框内的影像强度,此时可以看到有几个比较高的区段,就是我们想定量的band,使用直线工具(工具列第五个选项)先将图形中高点为有band的区域和没有band的区域分开再,使用魔术棒工具(工具列第八个选项)点选要分析的区域。

Step 5.当我们点选分析时,在result的对话视窗会出现分析的数据,依序点选就会出现每个band的值。

注:当我们选择分析的条带也可以是横向选取,就可以只比较相同大小的DNA 的含量,同样也可以应用在western blot或其它类似实验条带的分析上。

使用ImageJ 分析图像中的颗粒数
[] 原创教程,转载请保留此行
1,到本站资料下载-实用小工具栏目下载 ImageJ 并安装。

2,打开ImageJ并打开要分析的图片。

请看演示图片。

3,把图像二值话或者设定阈值。

选择Image - Adjust - Threshold...
根据提示设定你需要的阈值。

这一步非常重要,关系到结果的正确性。

设定阈值的标准就是把是颗粒的地方都突出出来。

示例中颗粒都被染成了红色。

4,菜单Analyze - Anelyze particles... 自动统计结果。

示例图片中有2个1像素的点都被统计出来了。

结果非常准确。

ImageJ 功能强大,其他功能请自学或者听下回分解!再见~~~ #1
使用ImageJ 分析图像中的颗粒数
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1,到本站资料下载-实用小工具栏目下载 ImageJ 并安装。

2,打开ImageJ并打开要分析的图片。

请看演示图片。

3,把图像二值话或者设定阈值。

选择Image - Adjust - Threshold...
根据提示设定你需要的阈值。

这一步非常重要,关系到结果的正确性。

设定阈值的标准就是把是颗粒的地方都突出出来。

示例中颗粒都被染成了红色。

4,菜单Analyze - Anelyze particles... 自动统计结果。

示例图片中有2个1像素的点都被统计出来了。

结果非常准确。

ImageJ 功能强大,其他功能请自学或者听下回分解!再见~~~
附件:
particle.JPG(9.26 KB)
adjust.JPG(26.63 KB)
adjust2.JPG(22.57 KB)
analyze.JPG(24.67 KB)
result.JPG(38.38 KB)
2007/4/6 21:53
生物医学影像分析软件--ImageJ计算细胞数
2009年04月21日 22时21分52秒 来源:未知 浏览: 522次
相信许多朋友也许也在找一种影像软体,可以自动帮你计算细胞数,比方说常常用使用4'-6-Diamidino-2-phenylindole (DAPI),或是用其它的抗体在做免疫染色(Immunohistochemistry Staining),要如何把影像的资讯数量化呢?最常用的就是计算染色的细胞数。

那有没有软体可以自动帮你算细胞数呢?大概在90
年中就有人在做这种影像分析,在2000年左右也有不少文章介绍各实验室自己开发的软体,也免费的提供下载。

最近由猪排饭同学介绍一套软体ImageJ,是由National Institutes of Health (NIH)所开发免费且跨平台(windows、Mac、Linux都可用)的影像分析软体,试用一下觉得相当好用。

请参考以下之教学:
step 1. 下载安装ImageJ软体: /ij/download.html 或ImageJ下载
/html/protocol/ruanjianjiaocheng/2009/0421/284.html
请依据不同作业系统选择适合的版本
step 2. 打开软体,再开启要分析的图片(File->Open)。

step 3.
设定分析影像的阈值(Image->Adjust->Threshold,或快捷键Ctr+Shift+T)
step 4.调整阈值再按set决定。

step 5.
选择analyze particle(Analyze->Analyze particle)
并且记得要选择summarize,才会有分析的结果。

step 6.
分析结果,可以看到原图像的视窗会出现电脑判读的数据,summary会显示个数及分析影像的区域大小。

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