基因工程实验的详细步骤
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基因工程实验
实验一、质粒DNA的提取、分离和纯化
试剂
A.LB液体培养基(L): 1000ml
蛋白胨(tryptone)10g,
酵母提取物(yeast extract)5g,
NaCl 10g,
加去离子水至1000ml
用5MNaOH调至pH7.2-7.5。121o C高压下蒸汽灭菌20分钟。
B.LB固体培养基(L):
每升液体培养基加15g 琼脂粉,高压下蒸汽灭菌20分钟。
C.氨苄青霉素(Amp)母液:配成50mg/ml水溶液,-20 o C下保存备用。
Amp使用时配成100mg/ul,按千分之一加入培养基中。
D.溶液I:50mmol/L葡萄糖、25mmol/L TrisCl (pH8.0), 10mmol/L
EDTA(pH8.0). 高压蒸汽灭菌15分钟, 储存于4 o C冰箱。
E.溶液II:0.2mol/L NaOH (临用前用10 mol/L NaOH母液稀释), 1%SDS.
F.溶液III: 5mol/L KAC 60ml, 冰醋酸 11.5ml, 水28.5ml.
G.RNase A母液:将RNase A酶粉溶于10mmol/L TrisCl (pH7.5)、15mmol/L
NaCl, 终浓度为10mg/ml。100 o C加热15分钟,冷却后分装。
H.饱和酚:市售酚需重蒸。重蒸后加0.1%8-羟基喹啉,并用等体积的
0.5mol/L TrisCl (pH8.0)和0.1mol/L TrisCl (pH8.0)缓冲液反复抽提,
使pH达到7.6以上。
I.氯仿:按氯仿/异戊醇=24:1混合。
J.酚/氯仿:将上述饱和酚和氯仿按1:1混合。
K.TE缓冲液:10mol/L TrisCl (pH8.0), 1mmol/L EDTA(pH8.0). 高压蒸气灭菌15分钟, 储存于4 o C冰箱。
三、操作步骤
1.细菌的培养和收集:将含有质粒pBS的DH5α菌株接种在LB固体培养基(含50μg/ml Amp)中,37o C培养12-24小时。用无菌牙签挑取单菌落接种到5ml LB液体培养基(含 50μg/ml Amp)中,37 o C培养约12小时至
对数生长后期。
2.质粒DNA的少量快速提取---碱裂解法
A.取1.5ml培养液倒入1.5ml ependorf 管中,4o C下12000g离心3min。
B.弃上清,将管倒置于卫生纸上数秒钟,使液体流尽。
C.菌体沉淀重悬浮于100μl预冷的溶液I中(激烈震荡,充分混匀)。
D.加入新配制的溶液II 200μl,快速盖紧管口,并倒置离心管,温和颠
倒ependorf管6-8次,以混匀内容物(千万不要震荡),放置5分钟。
E.加入150μl预冷的溶液III,盖紧管口,并倒置离心管,温和颠倒
ependorf管数次,以混匀内容物,放置5分钟。4o C下12000g离心5-10
分钟。
F.将上清液移入干净ependorf管中,加入等体积的酚/氯仿(1:1)(吸
取酚/氯仿试剂瓶中的下层溶液),震荡混匀,4o C下12000g离心5分
钟。
G.将上清液(水相)移入干净ependorf管中,加入等体积的氯仿/异戊
醇(吸取氯仿/异戊醇剂试瓶中的下层溶液),震荡混匀,4o C下12000g
离心5分钟。
H.将上清液(水相)移入干净ependorf管中,加入2倍体积的无水乙
醇,震荡混匀后置于-20o C冰箱中20分钟。然后在 4o C下12000g离心
10分钟。
I.弃上清液,将管口敞开并倒置于卫生纸上,使液体流尽。加入0.3ml 70%
乙醇洗涤沉淀。4o C下12000g离心5-10分钟。
J.吸去上清液,将管倒置于卫生纸上,使液体流尽,室温干燥或真空干燥10分钟
K.将沉淀溶于20μl TE缓冲液(pH8.0, 含20μg/ml Rnase A)中,储于-20o C冰箱。
实验二、基因组DNA的提取
1.1 材料
1.1.1植物材料
银杏等木本植物。
1.1.2 主要试剂
CTAB抽提液:1g CTAB,5ml 1M Tris,2ml 500mM EDTA,4.1g Nacl至50ml。
(2% CTAB,0.1M Tris,20mM EDTA,1.4M NaCl,pH8.0)
CTAB/NaCl:10g CTAB,4.1g NaCl,溶解后定容至100ml。(10% CTAB,0.7M NaCl) TE/NaCl:0.5ml 1M Tris,10μl 500mM EDTA,2.9g NaCl,至50ml。(10mM Tris,
0.1mM EDTA,1M NaCl,pH8.0)。
RNase: 溶于10mM Tris.Cl(pH7.5),15mM NaCl溶液中,配成10mg/ml浓度,于100℃加热15min,缓慢冷却至室温,添加等体积甘油后贮
于-20度。
3 mol/L NaAc(pH 5.2),氯仿:异戊醇(24:1)。β-巯基乙醇,氯仿,异丙醇,异戊醇,饱和酚,无水乙醇,不溶性PVP等。
上述药品及Lambda DNA/Hin dIII均购自上海生物工程公司。
1.2改进的CTAB法
根据文献(Frederick M. et al.,1998)CTAB法,稍做改进。
具体步骤:
① 吸取8ml CTAB抽提液,加入320μl β-巯基乙醇,混匀,预热至65℃;
② 称取0.5克叶片,置于事先用液氮预冷的研钵中,快速加入适量不溶性PVP,加入液氮研磨成粉未;
③ 迅速将粉未倒入至CTAB抽提液中,摇匀,65℃保温1h,期间每隔5min 摇匀一次;