内参基因的概念
内参基因使用方法
内参基因使用方法
内参基因是在分子生物学和基因表达研究中常用的实验技术。
它是一种可以用作对比和标准化基因表达水平的参考基因。
以下是内参基因的使用方法。
首先，选择一个合适的内参基因。
内参基因应该具有以下特征：在不同样本中表达稳定，不受研究条件的影响，并且其表达水平与感兴趣的基因相对稳定。
常用的内参基因包括β-actin、GAPDH和18S rRNA等。
其次，设计合适的实验方案。
确定研究目的和实验条件，并选择适当的实验方法。
例如，可以使用实时定量PCR（qPCR）技术来测量内参基因和感兴趣的基因的表达水平。
接下来，实施实验。
收集样本，并提取RNA或DNA。
使用逆转录酶将RNA 转录成cDNA，然后用qPCR技术测量内参基因和感兴趣基因的表达水平。
在实验过程中，应该设置技术重复和生物重复来保证实验结果的可靠性。
最后，分析实验结果。
使用合适的统计方法对实验数据进行分析，比较不同样本中内参基因和感兴趣基因的表达水平。
根据实验结果，可以确定内参基因的表达水平，并将其用作标准化感兴趣基因的表达水平。
需要注意的是，在使用内参基因时，应该选择多个内参基因进行验证，以确保结果的可靠性。
此外，内参基因的选择应该根据研究对象和实验条件进行优化，并与其他研究结果进行比较。
总结一下，内参基因是基因表达研究中常用的参考基因。
通过选择合适的内参基因、设计合理的实验方案、实施实验和分析实验结果，可以准确使用内参基因来标准化和对比感兴趣基因的表达水平。
这种方法有助于我们更深入地了解基因的功能和调控机制。
内参基因的概念
内参基因的概念 Revised by Chen Zhen in 2021内参即是内部参照，它们在各组织和细胞中的表达相对恒定，在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。
其作用是校正上样量、上样过程中存在的实验误差，保证实验结果的准确性。
借助检测每个样品内参的量就可以用于校正上样误差，这样半定量的结果才更为可信。
一般要选择一个在处理因素作用的条件下不会发生表达改变的基因作内参。
在进行基因研究的过程中,实时反转录 PCR也和传统的mRNA定量方法如 Northern b lot技术等一样, 要求使用参照基因以校正转录效率和 cDNA用量, 弥补制备过程中样本纯度和浓度的差别, 使不同样本之间目的基因的比较成为可能,以期获得真实可靠的结果。
大多数分析方法中这些差别可通过与内参照比较处理消除。
最普通的内参照是内源性参照基因,也叫管家基因。
管家基因：又称持家基因(house-keeping genes)生物体各类细胞中都表达，其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的蛋白质编码的基因。
如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因与核糖体蛋白基因等。
是为维持细胞基本生命活动所需而时刻都在表达的基因。
管家基因表达水平受环境因素影响较小，而是在个体各个生长阶段的大多数、或几乎全部组织中持续表达，或变化很小。
它的表达只受启动序列或启动子与RNA聚合酶相互作用的影响，而不受其他机制调节。
管家基因高度保守并且在大多数情况下持续表达，因此管家基因常被用于分子技术--多位点基因分析。
内参基因通常是各种看家基因，在细胞内组成稳定性表达，有助于保持细胞的功能。
理想的内参基因应该满足以下条件：1, 不存在假基因(Pseudogene)，以避免基因 DNA的扩增; 2,高度或中度表达，排除低表达; 3,稳定表达于不同类型的细胞和组织(如正常细胞和癌细胞)，而且其表达量是近似的，无显着性差别; 4,表达水平与细胞周期以及细胞是否活化无关;5, 其稳定的表达水平与目标基因相似;6, 不受任何内源性或外源性因素的影响，如不受任何实验处理措施的影响.近年来的研究发现：这些常用内参基因均存在缺陷，在不同类型的细胞和组织细胞增殖和器官发育的不同阶段体外培养各种实验条件等情况下它们的表达量通常变异较大。
内参基因的概念和作用.doc
内参基因的概念和作用内参即是内部参照 ,它们在各组织和细胞中的表达相对恒定 ,在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。
其作用是校正上样量、上样过程中存在的实验误差 ,保证实验结果的准确性。
借助检测每个样品内参的量就可以用于校正上样误差 ,这样半定量的结果才更为可信。
一般要选择一个在处理因素作用的条件下不会发生表达改变的基因作内参。
在进行基因研究的过程中,实时反转录 PCR也和传统的mRNA定量方法如 Northern b lot技术等一样, 要求使用参照基因以校正转录效率和 cDNA用量, 弥补制备过程中样本纯度和浓度的差别, 使不同样本之间目的基因的比较成为可能,以期获得真实可靠的结果。
大多数分析方法中这些差别可通过与内参照比较处理消除。
最普通的内参照是内源性参照基因,也叫管家基因。
管家基因：又称持家基因(house-keeping genes)生物体各类细胞中都表达 ,其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的蛋白质编码的基因。
如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因与核糖体蛋白基因等。
是为维持细胞基本生命活动所需而时刻都在表达的基因。
管家基因表达水平受环境因素影响较小 ,而是在个体各个生长阶段的大多数、或几乎全部组织中持续表达 ,或变化很小。
它的表达只受启动序列或启动子与RNA聚合酶相互作用的影响 ,而不受其他机制调节。
管家基因高度保守并且在大多数情况下持续表达 ,因此管家基因常被用于分子技术--多位点基因分析。
内参基因通常是各种看家基因 ,在细胞内组成稳定性表达 ,有助于保持细胞的功能。
理想的内参基因应该满足以下条件：1, 不存在假基因(Pseudogene) ,以避免基因 DNA的扩增; 2,高度或中度表达 ,排除低表达; 3,稳定表达于不同类型的细胞和组织(如正常细胞和癌细胞) ,而且其表达量是近似的 ,无显着性差别; 4,表达水平与细胞周期以及细胞是否活化无关;5, 其稳定的表达水平与目标基因相似;6, 不受任何内源性或外源性因素的影响 ,如不受任何实验处理措施的影响.近年来的研究发现：这些常用内参基因均存在缺陷 ,在不同类型的细胞和组织细胞增殖和器官发育的不同阶段体外培养各种实验条件等情况下它们的表达量通常变异较大。
基因组内参基因
基因组内参基因基因组是生物体最基本的遗传结构，其中记录着特定生物体所有进化过程中积累的特有信息。
它构成了生物体的遗传因子，负责控制和调节其生长发育、新陈代谢、受累过程和表型变化等等。
在基因组中有一类重要的基因，即参基因。
参基因（reference gene），也称为标准基因，指的是一种在不同器官、不同时间、不同处理条件下，表达量稳定的基因。
其主要作用是用来提供参照，和其他基因比较，检测后者表达改变的幅度和方向。
因此，参基因对于生物学实验的结果及解释起着重要的作用。
参基因的特性是在不同的生物系统中，表达量稳定。
其表达量的变化率处于某一范围之内，可以作为参考，用于比较两个器官或细胞的差别或差异。
它在植物、动物、微生物的基因组中都有广泛的应用，其表达量的变化稳定性是引物扩增法中质量控制的重要指标。
参基因的筛选主要是从基因组中全局进行搜索，从数量上而言，参基因通常是少数几十个，通常是在多个细胞类型中表达量相对稳定的基因，通常具有普遍的生物学功能、高度特异的表达模式与组织特异的表达模式。
另外，它们还应具有低的表达变异以及较低的标准偏差。
参基因的选择及应用是一个复杂的问题，它受多种因素的影响。
例如，运用的技术，研究对象的器官或细胞类型；它们的状态（活细胞和死细胞）；它们是否已受外界刺激等等。
因此，选择参考基因时，必须考虑研究对象的生物特征。
基因组内参基因的发掘有很多思路，包括对拟南芥基因组的全基因组测序的历史数据分析，利用新一代测序技术，不同生物样本的复杂性分析，借助量子计算等。
在基因组内参基因的发现和筛选上，将更多地应用分子生物学和计算机科学的知识，以及多学科之间的交叉合作。
参基因可以作为基础基因，为生物体的统一解读提供参照。
未来，参基因将成为基因组研究、转录组研究、蛋白质组研究和体外实验等领域的重要工具。
它能够帮助我们更深入地理解基因表达调控机制，实现基因组信息的有效分析，从而发掘更多的生物学信息、寻求有效的新药物目标。
内参基因_精品文档
内参基因摘要：内参基因是一类在基因表达研究中被广泛应用的基因，它们在细胞中的表达不受外界条件和实验干扰的影响，并在分析基因表达水平时被用作参照基因。
本文将介绍内参基因的定义、特点和选择方法，并讨论其在基因表达研究中的重要性和应用前景。
第一部分：引言内参基因是指在特定细胞或组织中表达稳定且没有明显变化的基因，它们的表达水平被广泛应用于基因表达研究的标准化和比较。
与实验条件和处理无关，内参基因在基因表达分析过程中能提供一个相对稳定的参照点，从而减小实验误差。
在过去的几十年中，内参基因已成为基因表达研究中不可或缺的重要因素。
第二部分：内参基因的特点1. 表达稳定性：内参基因的表达水平相对稳定，不受外界条件和实验干扰的影响。
这使得内参基因成为一个可靠的参照标准。
2. 丰度适中：内参基因的表达水平应适中，既不能太高，也不能太低。
如果表达水平过高，会导致内参基因的扩增曲线过早饱和，影响定量结果的准确性。
3. 表达均匀性：内参基因的表达在不同样本中应该是均匀的。
这意味着在不同组织或条件下，内参基因的表达水平不会发生明显的变化。
第三部分：内参基因的选择方法内参基因的选择是基因表达研究中的一个关键环节。
目前常用的方法包括基于文献综述、生物信息学分析和实验验证等。
以下是一些常用的内参基因选择方法：1. 综合评估：通过综合考虑内参基因的表达稳定性、丰度适中性和表达均匀性等因素，从候选基因中筛选出最适合的内参基因。
2. 基因表达稳定性分析：利用统计学方法，比较多个候选内参基因的表达数据，选取具有最小变异的基因作为内参基因。
3. 基因表达数据库：利用公开的基因表达数据库，比如GEO数据库和TCGA数据库，分析不同基因在不同样本中的表达水平，选择表达稳定的基因作为内参基因。
4. 实验验证：通过逆转录聚合酶链式反应（RT-PCR）或实时定量PCR等技术，验证候选基因的表达稳定性和适用性。
第四部分：内参基因的应用前景内参基因在基因表达研究中的应用前景广阔。
鼠李糖乳杆菌内参基因
鼠李糖乳杆菌内参基因
鼠李糖乳杆菌内参基因是一种常用的内参基因，它在基因表达研究中具有重要的作用。
内参基因是指在实验中不受处理影响，表达稳定的基因，用于标准化实验结果，以消除实验误差。
鼠李糖乳杆菌内参基因的选择是基于其在不同条件下表达稳定的特性。
鼠李糖乳杆菌是一种革兰氏阳性菌，广泛存在于自然界中。
它是一种重要的乳酸菌，可以用于制作酸奶、酸乳等乳制品。
鼠李糖乳杆菌内参基因的选择是基于其在不同条件下表达稳定的特性。
研究表明，鼠李糖乳杆菌内参基因gyrB、rpoB、recA、atpD、ldh等在不同条件下表达稳定，可以作为内参基因使用。
在基因表达研究中，内参基因的选择非常重要。
如果选择不当，会导致实验结果的误差，影响实验的可靠性和准确性。
因此，在选择内参基因时，需要考虑多个因素，如基因表达稳定性、表达水平、特异性等。
鼠李糖乳杆菌内参基因的选择是基于其在不同条件下表达稳定的特性，可以保证实验结果的准确性和可靠性。
总之，鼠李糖乳杆菌内参基因是一种常用的内参基因，具有表达稳定的特性，在基因表达研究中具有重要的作用。
在选择内参基因时，需要考虑多个因素，以保证实验结果的准确性和可靠性。
内参基因筛选方法
内参基因筛选方法
内参基因是指在细胞或组织中表达稳定、不受外部刺激影响、对于生物体正常生长发育至关重要的基因。
内参基因的表达量在分子生物学研究中常被用作参考，因为它们在不同样本中的表达量应该是相同的。
然而，在进行基因表达定量时，应选用适当的内参基因，否则可能会导致结果偏差。
因此，内参基因筛选方法是分子生物学研究中的重要步骤之一。
目前，内参基因的筛选方法主要包括三种：文献综述法、基因芯片法和实时荧光定量PCR法。
文献综述法是指通过文献调研，选择已有研究证实表达稳定、适合做内参基因的基因。
这种方法的优点是简单快捷，但缺点是容易出现结果偏差，因为不同实验条件下内参基因的选择可能不同。
基因芯片法是指利用基因芯片技术，同时检测多个基因的表达量，然后利用统计学方法筛选出表达稳定的内参基因。
这种方法的优点是高通量、准确性高，但缺点是成本较高，同时需要非常严格的数据分析方法。
实时荧光定量PCR法是指利用实时荧光定量PCR技术，同时检测多个基因的表达量，然后利用统计学方法筛选出表达稳定的内参基因。
这种方法的优点是准确性高、成本低，且操作简单。
缺点是只能同时检测有限数量的基因。
综上所述，内参基因筛选方法的选择应根据实验设计、设备条件等多个因素综合考虑。
无论采用何种方法，都应该进行严格的数据分
析和统计学处理，以确保得到准确、可靠的结果。
tert基因内参基因
tert基因内参基因内参基因的特性内参基因是用于归一化基因表达水平的稳定基因，在不同实验条件下其表达水平保持相对恒定。
理想的内参基因应具备以下特性：表达稳定性：在不同的组织、发育阶段、实验条件和处理下，表达水平始终保持稳定。
物种保守性：在不同物种中具有相似的序列和功能，以确保跨物种比较的准确性。
检测范围：具有足够的检测范围，以量化不同样品中的基因表达水平。
扩增效率：与目标基因具有相似的扩增效率，以避免引入偏差。
tert基因作为内参基因tert基因（端粒酶逆转录酶）编码端粒酶催化亚基，负责维持真核细胞端粒的长度。
它被广泛用作内参基因，因为它具有以下优点：表达稳定性： tert基因在多种细胞类型和实验条件下表现出稳定的表达，使其成为可靠的内参。
物种保守性： tert基因在不同的哺乳动物物种中高度保守，这使其适用于跨物种研究。
检测范围： tert基因的表达水平在不同样品中通常处于中等范围，使其在各种实验中都适用。
扩增效率： tert基因的扩增效率通常与典型目标基因相似，这有助于确保定量分析的准确性。
其他可用内参基因除了tert基因，还有其他常用内参基因，包括：GAPDH（甘油醛-3-磷酸脱氢酶）：一种在糖酵解中起作用的家政基因，具有稳定的表达水平。
ACTB（β-肌动蛋白）：一种参与细胞骨架形成的结构蛋白，在多种细胞类型中具有可靠的表达。
18S rRNA：一种核糖体RNA，其表达在不同组织和条件下通常保持稳定。
内参基因选择选择合适的内参基因至关重要，以确保基因表达分析的准确性和可靠性。
以下准则是内参基因选择的考虑因素：实验的具体要求和目标基因的特性。
组织类型和实验条件。
文献中已确定的可靠内参基因。
结论tert基因是常用的内参基因，具有表达稳定性、物种保守性、检测范围和扩增效率等优点。
它对于归一化不同实验条件下基因表达水平的分析至关重要。
然而，在选择内参基因时，应根据实验的具体要求和目标基因的特性进行仔细考虑。
真菌内参基因
真菌内参基因
真菌内参基因是指在真菌中常用的内参基因，用于在qRT-PCR技术中稳定不同样本间的表达水平，从而准确比较基因的表达差异。
常用的真菌内参基因包括肌动蛋白（actin）、泛素（ubiquitin，UBQ）、18S核糖体RNA（18S rRNA）、微管蛋白（tubulin beta，TUB）和翻译延长因子（translation elongation factor，TEF）等。
这些内参基因可在真菌中稳定表达，不受实验条件和操作差异的影响，因此常被用作参照，帮助校正样本间的误差，提高实验的准确性和可靠性。
然而，内参基因的表达水平可能会受到不同真菌种类、生长条件、环境因素等多种因素的影响。
因此，在选择内参基因时，需要考虑实验的具体条件和样本特点，并进行验证和评价，确保其适用性和稳定性。
总之，真菌内参基因是qRT-PCR技术中重要的组成部分，通过选用合适的内参基因，可以帮助校正实验误差，提高实验的准确性和可靠性。
了解和掌握真菌内参基因的相关知识，对于进行准确的基因表达分析和比较具有重要意义。
内参基因筛选原理
内参基因筛选原理
内参基因是一种普遍存在于各种生物中的基因，其主要作用是参与细胞内基本代谢和生命活动过程。
在基因筛选中，内参基因往往被用作参照基因，以确保实验结果的准确性和可靠性。
内参基因筛选原理主要包括以下几个方面：
1. 选择稳定表达的基因：内参基因的表达水平应该相对稳定，
不受实验条件和处理影响，以确保筛选结果的可靠性和精度。
2. 确定表达水平：通过实时荧光定量PCR等技术，可以对内参
基因的表达水平进行定量分析，以确定其表达水平的稳定性和可靠性。
3. 比较不同内参基因的表达：在实验中，可以选择多个内参基因，比较其表达水平的差异和稳定性，以确定最适合的参照基因。
4. 优化实验条件：在实验中，应该尽可能控制各种因素的干扰，如反应体系、反应温度、酶浓度等，以确保内参基因的表达水平稳定、准确。
5. 验证筛选结果：在选择内参基因后，还需对其进行验证，以
确保其表达水平的稳定性和可靠性，避免在实验中产生误差和偏差。
总之，内参基因筛选的原理是通过选择稳定表达的内参基因，确定其表达水平的稳定性和可靠性，并优化实验条件，最终确定最适合的参照基因，以确保实验结果的准确性和可靠性。
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内参基因的概念和作用教学内容
内参基因的概念和作
用
内参基因的概念和作用
内参即是内部参照，它们在各组织和细胞中的表达相对恒定，在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。
其作用是校正上样量、上样过程中存在的实验误差，保证实验结果的准确性。
借助检测每个样品内参的量就可以用于校正上样误差，这样半定量的结果才更为可信。
一般要选择一个在处理因素作用的条件下不会发生表达改变的基因作内参。
在进行基因研究的过程中，实时反转录PCR也和传统的mRNA 定量方法如Northern b lot 技术等一样, 要求使用参照基因以校正转录效率和cDNA 用量，弥补制备过程中样本纯度和浓度的差别，使不同样本之间目的基因的比较成为可能，以期获得真实可靠的结果。
大多数分析方法中这些差别可通过与内参照比较处理消除。
最普通的内参照是内源性参照基因，也叫管家基因。
管家基因：又称持家基因(house-keeping genes) 生物体各类细胞中都表达，其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的蛋白质编码的基因。
如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因与核糖体蛋白基因等。
是为维持细胞基本生命活动所需而时刻都在表达的基因。
内参基因的概念
内参基因的概念 Document number：PBGCG-0857-BTDO-0089-PTT1998内参即是内部参照，它们在各组织和细胞中的表达相对恒定，在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。
其作用是校正上样量、上样过程中存在的实验误差，保证实验结果的准确性。
借助检测每个样品内参的量就可以用于校正上样误差，这样半定量的结果才更为可信。
一般要选择一个在处理因素作用的条件下不会发生表达改变的基因作内参。
在进行基因研究的过程中,实时反转录 PCR也和传统的mRNA定量方法如 Northern b lot技术等一样, 要求使用参照基因以校正转录效率和 cDNA用量, 弥补制备过程中样本纯度和浓度的差别, 使不同样本之间目的基因的比较成为可能,以期获得真实可靠的结果。
大多数分析方法中这些差别可通过与内参照比较处理消除。
最普通的内参照是内源性参照基因,也叫管家基因。
管家基因：又称持家基因(house-keeping genes)生物体各类细胞中都表达，其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的蛋白质编码的基因。
如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因与核糖体蛋白基因等。
是为维持细胞基本生命活动所需而时刻都在表达的基因。
管家基因表达水平受环境因素影响较小，而是在个体各个生长阶段的大多数、或几乎全部组织中持续表达，或变化很小。
它的表达只受启动序列或启动子与RNA聚合酶相互作用的影响，而不受其他机制调节。
管家基因高度保守并且在大多数情况下持续表达，因此管家基因常被用于分子技术--多位点基因分析。
内参基因通常是各种看家基因，在细胞内组成稳定性表达，有助于保持细胞的功能。
理想的内参基因应该满足以下条件：1, 不存在假基因(Pseudogene)，以避免基因 DNA的扩增; 2,高度或中度表达，排除低表达; 3,稳定表达于不同类型的细胞和组织(如正常细胞和癌细胞)，而且其表达量是近似的，无显着性差别; 4,表达水平与细胞周期以及细胞是否活化无关;5, 其稳定的表达水平与目标基因相似;6, 不受任何内源性或外源性因素的影响，如不受任何实验处理措施的影响.近年来的研究发现：这些常用内参基因均存在缺陷，在不同类型的细胞和组织细胞增殖和器官发育的不同阶段体外培养各种实验条件等情况下它们的表达量通常变异较大。
内参基因βActin简介
内参基因βA c t i n简介文件编码（GHTU-UITID-GGBKT-POIU-WUUI-8968）内参基因β-Actin简介日期：2012-05-03来源：未知作者：周慕云点击：次β-Actin内参即是内部参照，它们在各组织和细胞中的表达相对恒定，在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。
常用的PCR内参有GAPDH、β-actin、18sRNA、28sRNA、B2M、ACTB、SDHA、HPRT1、ARBP内参基因等。
β-Actin简介Actin即“肌动蛋白”，是细胞的一种重要骨架蛋白。
同时Actin在细胞分泌、吞噬、移动、胞质流动和胞质分离等过程中起重要作用。
Actin在不同物种之间高度保守，以至于很难获得较好的针对actin的抗血清。
Actin大致可分为六种，其中四种是不同肌肉组织特异性的，包括α-skeletalmuscleactin，α-cardiacmuscleactin，α-smoothmuscleactin，和γ-smoothmuscleactin;其余两种广泛分布于各种组织中，包括β-actin(β-non-muscle)和γ-non-muscleactin。
不同的actin之间同源性大于90%，但在N-terminal同源性仅50%-60%，因此N-terminal常被用作actin的抗原。
β-Actin是横纹肌肌纤维中的一种主要蛋白质成分，也是肌肉细丝及细胞骨架微丝的主要成分。
具有收缩功能，分布广泛。
β-Actin用途β-Actin是PCR常用的内参，β-Actin抗体是WesternBlot很好的内参指数。
内参即是内部参照(InternalControl)，对于哺乳动物细胞表达来说一般是指由管家基因编码表达的蛋白。
它们在各组织和细胞中的表达相对恒定，在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照物。
常用的蛋白质内参有细胞骨架蛋白beta-actin或beta-tubulin和GAPDH(glyceraldehyde-3-phosphatedehydrogenase)等。
内参基因的概念和作用(精)
内参基因的概念和作用内参即是内部参照,它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。
其作用是校正上样量、上样过程中存在的实验误差,保证实验结果的准确性。
借助检测每个样品内参的量就可以用于校正上样误差,这样半定量的结果才更为可信。
一般要选择一个在处理因素作用的条件下不会发生表达改变的基因作内参。
在进行基因研究的过程中,实时反转录 PCR也和传统的mRNA定量方法如Northern b lot技术等一样, 要求使用参照基因以校正转录效率和 cDNA用量, 弥补制备过程中样本纯度和浓度的差别, 使不同样本之间目的基因的比较成为可能,以期获得真实可靠的结果。
大多数分析方法中这些差别可通过与内参照比较处理消除。
最普通的内参照是内源性参照基因,也叫管家基因。
管家基因:又称持家基因(house-keeping genes生物体各类细胞中都表达,其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的蛋白质编码的基因。
如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因与核糖体蛋白基因等。
是为维持细胞基本生命活动所需而时刻都在表达的基因。
管家基因表达水平受环境因素影响较小,而是在个体各个生长阶段的大多数、或几乎全部组织中持续表达,或变化很小。
它的表达只受启动序列或启动子与RNA 聚合酶相互作用的影响,而不受其他机制调节。
管家基因高度保守并且在大多数情况下持续表达,因此管家基因常被用于分子技术--多位点基因分析。
内参基因通常是各种看家基因,在细胞内组成稳定性表达,有助于保持细胞的功能。
理想的内参基因应该满足以下条件:1, 不存在假基因(Pseudogene,以避免基因DNA的扩增; 2,高度或中度表达,排除低表达; 3,稳定表达于不同类型的细胞和组织(如正常细胞和癌细胞,而且其表达量是近似的,无显着性差别; 4,表达水平与细胞周期以及细胞是否活化无关;5, 其稳定的表达水平与目标基因相似;6, 不受任何内源性或外源性因素的影响,如不受任何实验处理措施的影响.近年来的研究发现:这些常用内参基因均存在缺陷,在不同类型的细胞和组织细胞增殖和器官发育的不同阶段体外培养各种实验条件等情况下它们的表达量通常变异较大。
肝脏内参基因
肝脏内参基因
“肝脏内参基因”指的是在研究肝脏相关基因表达时常用作内部参照的基因。
内参基因也称为内参或内部控制基因，其在不同组织或细胞类型中表达水平相对稳定，通常被用来作为定量PCR（qPCR）或其他基因表达分析方法中的标准来校正样本中的变异性。
在研究肝脏相关基因表达时，常用作内参基因的包括：
1．β-actin (ACTB)
2．Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH)
3．18S ribosomal RNA (18S rRNA)
4．β-2 microglobulin (B2M)
5．TATA-binding protein (TBP)
6．Ubiquitin C (UBC)
选择适当的内参基因对于准确测量目标基因的表达水平至关重要，因此在研究中通常会对潜在的内参基因进行验证和筛选，以确保其在特定条件下的稳定性和适用性。
染色质免疫共沉淀 内参基因
染色质免疫共沉淀内参基因染色质免疫共沉淀（ChIP）是用来研究蛋白质与染色质相互作用的一种实验技术，通过利用特异性抗体来富集与目标蛋白质结合的染色质片段。
然而，在进行ChIP实验时，需要使用内参基因来进行标准化和校正实验结果，以确保实验的准确性和可靠性。
内参基因是指在特定条件下表达稳定、不受外界因素干扰的基因。
在ChIP实验中，内参基因被用来标准化目标基因的富集水平，以消除实验中可能出现的误差。
下面将从内参基因选择、内参基因验证及常用内参基因几个方面来详细探讨。
一、内参基因选择选择适当的内参基因是进行ChIP实验的关键步骤之一。
一个理想的内参基因应具备以下特点：1. 稳定的表达水平：内参基因的表达水平应在不同样品、不同处理条件下保持稳定，不受干扰因素的影响。
这可以通过实时定量PCR （qPCR）或基因芯片技术来评估基因的表达稳定性。
2. 细胞类型特异性：内参基因的表达水平应在所研究的细胞类型中具有一定特异性，并且不受目标蛋白质结合与浓度的影响。
这可以通过在不同细胞类型中进行实时定量PCR检测来评估。
3. 控制组条件下表达水平不变：在ChIP实验中，常常需要对比不同样品或处理条件下的富集水平。
因此，内参基因的表达水平应在不同组别条件下保持相对稳定，以确保实验结果的可比较性。
根据以上的特点，常用的内参基因包括GAPDH、ACTB、GUSB等，这些基因的表达水平通常在不同细胞类型和处理条件下比较稳定，且与ChIP实验中的目标基因的结合无关。
二、内参基因验证为确保选择的内参基因在实验条件下满足稳定性和特异性等要求，进行内参基因验证是必要的。
验证内参基因的常用方法有：1. 实时定量PCR：通过实时定量PCR测定一系列候选内参基因的表达水平，根据表达的稳定性和特异性选择最合适的内参基因。
在实验中，可以根据ChIP-qPCR的结果及对应内参基因的表达情况，评估其在ChIP实验中的可靠性。
2. 基因芯片技术：利用基因芯片技术可以同时检测大量基因的表达水平，对于内参基因的选择具有更高的精确性和鉴定能力。
内参基因
何为内参基因1、我记得常用的就是[color=magenta]GAPDH[/color]（3-磷酸甘油醛脱氢酶）和actin，至于什么是内参，可以打个比方，比如我们要比较两个不一样大的西瓜的含糖量，不好直接比较，那就找他们都有的东西来比较，就拿西瓜子嘛，假设西瓜子是均匀分布的，而且随着西瓜的变大，糖分的增多，西瓜子也变多，那么这个西瓜子就可以作为内参了！不知比方准确否，请高手指教，共同进步！2、内参基因一般会选管家基因，是维持细胞基本代谢活动所必须的基因，在各组织和细胞中的表达相对恒定，如：GAPDH、Actin、18S rRNA等3、内参基因,表达稳定，通常用的有GAPDH,beta-actin，18s rRNA等内参即是内部参照，它们在各组织和细胞中的表达相对恒定，在检测基因的表达水平变化时使用绝对标准品，也可以使用相对标准品，而且相对标准品在实验操作上更为简便易行。
相对标准品是只知道样品中DNA或RNA的稀释比例而不需要知道其分子数目的标准品，典型的做法是将一个已知pg数的样品做一系列梯度稀释。
CT值比较法是利用CT值与起始DNA浓度的对数成反比的数学关系，来计算不同样本之间的相对百分比，其计算公式是绝对定量的数据易于理解，但是绝对标准品的制备和测定其DNA含量比较困难。
有许多商业性的标准品试剂盒供选购，可以解决这种困难。
相对定量的标准品容易在实验室里自己制备，但是数据处理比较麻烦，对实验数据的解释有一定难度。
定量PCR问题--标准曲线法相对定量的数据应该怎么处理？假设实验的目标是研究药物处理后0、24、48小时IL-2基因在某种组织中的表达量的变化，所用的内对照是18S RNA基因。
IL-2和18S RNA的测定结果都是总RNA的pg数，数据的处理方法见下表：定量PCR问题--什么是CT值比较法？数据怎么处理？CT值与起始DNA浓度的对数成反比：如果(1)不同管之间的PCR反应效率相同；(2)这些PCR的反应效率接近100%，可以从上面的公式推出相对含量(X01/X02) = 2 -ΔΔCT假设实验的目标是研究药物处理后0、24、48小时IL-2基因在某种组织中的表达量的变化，所用内对照是18S RNA基因。
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内参即是内部参照，它们在各组织和细胞中的表达相对恒定，在检测基因的表达水平变化时常用它
来做参照物。
其作用是校正上样量、上样过程中存在的实验误差，保证实验结果的准确性。
借助检测每
个样品内参的量就可以用于校正上样误差，这样半定量的结果才更为可信。
一般要选择一个在处理因素
作用的条件下不会发生表达改变的基因作内参。
在进行基因研究的过程中,实时反转录 PCR也和传统的mRNA定量方法如 Northern b lot技术等一样, 要求使用参照基因以校正转录效率和 cDNA用量, 弥补制备过程中样本纯度和浓度的差别, 使不同样本之间目的基因的比较成为可能,以期获得真实可靠的结果。
大多数分析方法中这些差别可通过与内
参照比较处理消除。
最普通的内参照是内源性参照基因,也叫管家基因。
管家基因：又称持家基因(house-keeping genes)生物体各类细胞中都表达，其产物是对维持细胞基
本生命活动所必需的蛋白质编码的基因。
如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因与核糖体蛋白基因等。
是
为维持细胞基本生命活动所需而时刻都在表达的基因。
管家基因表达水平受环境因素影响较小，而是在个体各个生长阶段的大多数、或几乎全部组织中持
续表达，或变化很小。
它的表达只受启动序列或启动子与RNA聚合酶相互作用的影响，而不受其他机制
调节。
管家基因高度保守并且在大多数情况下持续表达，因此管家基因常被用于分子技术--多位点基因分析。
内参基因通常是各种看家基因，在细胞内组成稳定性表达，有助于保持细胞的功能。
理想的内参基
因应该满足以下条件：1, 不存在假基因(Pseudogene)，以避免基因 DNA的扩增; 2,高度或中度表达，
排除低表达; 3,稳定表达于不同类型的细胞和组织(如正常细胞和癌细胞)，而且其表达量是近似的，无
显着性差别; 4,表达水平与细胞周期以及细胞是否活化无关;5, 其稳定的表达水平与目标基因相似;6, 不受任何内源性或外源性因素的影响，如不受任何实验处理措施的影响.
近年来的研究发现：这些常用内参基因均存在缺陷，在不同类型的细胞和组织细胞增殖和器官发
育的不同阶段体外培养各种实验条件等情况下它们的表达量通常变异较大。
正确的选择内参基因, 很大程度上依赖所研究的细胞或组织, 不同的试验需要寻找适合各自试验体系的特异性稳定表达的内参基
因。
然而,合适内参基因的选择,需要在各种类型的细胞或组织和各种试验条件下进行比较选择。
理想的内参基因应在各种试验条件下,各种类型的组织和细胞中均恒定表达,而且其表达量是近似的,无显着性差别。
另外要求不存在假基因以避免基因组的扩增。
常用的内参基因包括GAPDH 、β- actin(BETA-actin) 、18sRNA、28sRNA 、B2M、ACTB、SDHA、HPRT1、ARBP内参基因等。
1，在血清刺激条件下的基因表达定量研究中, B 22MG 和 18SrRNA 作为内参基因是合适的, 而 B 2act in 和GAP 2DH 则不适合。
2，大鼠是常用实验动物, 老年大鼠在阿尔茨海默症等模型研究中常用。
我们针对老年大鼠组织实
时老年大鼠肾组织中相对表达最稳定的管家基因是ACTB; 心脏和肺组织中表达最稳定的内参基因是G3pd
3，内参基因sdha和hprt1适合用于校正目标基因的表达量，为研究幼龄小鼠小肠组织基因表达奠定基础。
4，对于枣树基因表达研究的内参基因,组蛋白 ZH j 3基因在不同器官、不同生长时期的结果枝及其顶端组织中有表达, 表达最稳定,最适宜用于枣树基因表达研究的内参基因。
5，HSV感染下用作标化内参基因排序其研究发现，在应用载体进行表达研究时，相比之下
GAPDH 作为内参效果更好更为适合和稳定
6，RT-PCR方法，检测乳腺肿瘤及其邻近乳腺组织中的IL-8mRNA及内参GAPDH的表达水平知乳腺癌
组织高表达IL-8,可作为评价乳腺癌进展及判断预后的指标
7，H MBS 和 C- TBP两个看家基因适用于校正目标基因的表达量,为研究男性乙肝相关肝癌组织中目标基因的表达奠定基础
实时反转录 PCR研究应使用至少两个内参基因以确保结论可靠: 其一可以是某种核糖体 RNA(例如18S r RNA), 用来对 RNA总量和转录步骤中可能发生的降解进行必要校正; 第二个内参基因应和目的基
因 mRNA表达水平接近。
Arb p细胞丰度相对最低、表达相对最稳定且在不同组织间差异最小,相对较适用于老年大鼠组织间 mRNA表达变化分析。