如何用photoshop计算蛋白条带的灰度值
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如何用photoshop计算蛋白条带的灰度值?
在western blot或者DNA电泳条带中,经常需要半定量统计条带的灰度值,比较常用的是用ImageJ这个软件来统计,但是如果不熟悉操作很容易得出错误的统计数据。本文从原理到操作告诉你如何用photoshop来统计灰度值首先进行实际操作之前我们先来理解下什么叫做灰度值
如上图所示,灰度值就是从黑到白渐变过程中对应的数值。0代表黑色,255代表白色。
上图所示正常western blot条带和反向之后的条带。上图的箭头分别指出了条带以及背景对应的区域。在正常条带中条带的值约为20,背景值为80;在反向图片中,条带的值约为200,背景值为130。我们习惯了条带越粗亮灰度值越大,因此我们一般是对其进行反向之后测量。
在这里一定要去掉背景,至于为什么要去掉背景,在此不多说了(视频教程里将详细介绍)请看下面图片:那么接下来开始我们今天的教程:打开图片,因为图片有点倾斜,我们需要将其摆正,有两种方法进行拉直,第一种是将图层旋转(Ctrl+T,然后旋转至其摆正),另外一种是使用标尺工具,在左边快捷栏中安卓吸管工具不放,选择标识工具,然后在条带上面从左边点按住鼠标不放一直拖动到最右边,最后点击拉直图层即可。点击菜单栏的“窗口”,选
择直方图,弹出下面面板