分子生物学第八章_真核基因表达调控讲述

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现代分子生物学第八章

现代分子生物学第八章
序列中对应于外显子的部 分可能还不到10% 图8-1是哺乳动物二氢叶酸还原酶基因,全长25一31 kb,但6 个外显子总长只有2kb。少数基因根本不带内含子。前尚 不清楚内含子的生理功能。某些基因完全除去内含子
以后,照样可以产生有活性的mRN A; 另一些基因, 如SV40 T抗原基因,一旦除去内含子,成熟mRNA运 人细胞质基质的过程就完全被阻断。
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8.1.3基因家族 • 真核细胞的DNA是单顺反子结构,很 • 少出现置于一个启动子控制之下的操纵子。 真核细胞中许多相关的基因常按功能成套 组合,被称为基因家族。 • 同一家族的成员有时紧密地排列在一起, 成为一个基因簇;但更多的时候,它们分散 在同一染色体的不同部位.甚至位于不同的 染色体上。具有各自不同的表达调控模式。
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• 选择性剪接:同一基因的转录产物由于不同的剪接方式形成不同 mRNA的过程。 • 选择性剪接的典刑例子:小鼠淀粉酶基因表达的组织特异性变化
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• 在小鼠肝和唾液腺这两种组织中,淀粉酶mRNA的编码 序列完全相同,但5‘端起始部分长度不同。 • 事实上,L外显子只是唾液腺淀粉酶基因中内含子序列的 一部分,将在mRNA成熟过程中被切除。 • 有实验证明,由S外显子起始的转录产物是由L外显子起 始转录产物的100倍以上。 • 由于一个基因的内含子成为另一个基因的外显子,形成 基因的差异表达,这是真核基因断裂结构的一个重要特 点。
现代分子生物学
指导老师:杨林松 演绎人:徐楸能
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8.1真核基因表达调控相关概念和一 般规律

• 8.1.1基因表达的基本概念 基因组: 一个细胞或病毒所携带的全部遗传 信息或整套基因。 基因:指能产生一条肽链或功能RNA所必需的 DNA片段。它包括编码区和其上下游区域。以 及在编码片段间(外显子)的间断切割序列(内 含子) 基因表达:基因经过转录、翻译,产生具有特 异生物学功能的蛋自质分子或RNA分子的过程。 基因表达调控:受内源及外源信号调控的这个 调控的过程。

真核生物基因表达调控

真核生物基因表达调控

酸性激活域 (D/E-rich) 谷氨酰胺(Q)富含域 脯氨酸(P)富含域
蛋白质-蛋白质结合域 (dimerization, co-factors)
1) TF最常见的DNA binding domain
Zinc Finger
bZIP
Homeodomain
bHLH
(1) 锌指(zinc finger)
2. The pri5’ capping 3’ formation / polyA splicing
3. Mature transcripts are transported to the cytoplasm for translation
Chromatin
epigenetic control
Protein degradation RNA silencing
一般而言的基因表达调控范畴
二、基因表达的时间性及空间性
(一)时间特异性
按功能需要,某一特定基因的表达严格按 特定的时间顺序发生,称之为基因表达的时间 特异性(temporal specificity)。
Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-X5-Leu-X2-His-X3-His C-terminal: α-helix binding DNA
常结合GC box
(2) 碱性亮氨酸拉链 bZIP
(3) 碱性螺旋-环-螺旋bHLH
bHLH蛋白(basic Helix-Loop-Helix)
2) TF常见的trans-activation domain
– usually expressed at high level – the level of their gene expression may vary

分子生物学 ch8真核生物基因表达调控

分子生物学    ch8真核生物基因表达调控

CpG岛(CpG island) 岛 )
真核生物基因组中,常见富含的 的区域, 真核生物基因组中,常见富含的CpG的区域, 的区域 称为CpG岛,常位于转录调控区及其附近,其 称为 岛 常位于转录调控区及其附近, 甲基化程度直接影响转录活性. 甲基化程度直接影响转录活性. 人类基因组中约有29,000个CpG岛 个 人类基因组中约有 岛 CpG岛的甲基化可抑制启动子的活性. 岛的甲基化可抑制启动子的活性 岛的甲基化可抑制启动子的活性.
转录调节因子结构
DNA结合结构域 DNA结合结构域 TF 转录激活结构域 二聚体结构域
与RNA聚合酶结合 聚合酶结合 与顺式元件识别, 与顺式元件识别,结合
DNA结合域 DNA结合域
螺旋-转角 螺旋 螺旋 转角-螺旋(HTH)结构基序 转角 螺旋( ) 锌指( ) 锌指(ZF)结构基序 螺旋-突环 螺旋 螺旋 突环-螺旋(HLH)结构基序 突环 螺旋( ) 亮氨酸拉链( ) 亮氨酸拉链(LZ)结构基序 同源异型( ) 同源异型(HD)基序
☆ 真核基因表达调控的层次
染色体和染色质水平:基因数量,结构 染色体和染色质水平:基因数量, 转录水平:顺式作用元件与反式作用因子 转录水平: 转录后水平:mRNA的加工 成熟, 的加工, 转录后水平:mRNA的加工,成熟,转运 翻译水平:起始复合物及mRNA稳定性 翻译水平:起始复合物及mRNA稳定性 翻译后水平:蛋白质加工,修饰,转运 翻译后水平:蛋白质加工,修饰,
螺旋-转角-螺旋(Helix-turn-helix) 螺旋-转角-螺旋( )
最常见的一种基序,基序包含有两个 螺旋 螺旋, 最常见的一种基序,基序包含有两个a螺旋,螺旋之间间 隔有一个短的b转角 使两个螺旋可通过疏水作用装配起来. 转角, 隔有一个短的 转角,使两个螺旋可通过疏水作用装配起来. 第一个螺旋稳定并使第二个螺旋暴露出来, 第一个螺旋稳定并使第二个螺旋暴露出来,与DNA的大沟作 的大沟作 而特异性地与碱基接触.因此, 用,而特异性地与碱基接触.因此,第二个螺旋被称为识别 螺旋(recognition helix).上述的相互作用锚定了蛋白质中识别 螺旋 . 螺旋的位置并稳定了DNA的构象,从而调节不同蛋白和其结 的构象, 螺旋的位置并稳定了 的构象 合位点的亲和力. 合位点的亲和力.

第八章真核生物基因的表达调控

第八章真核生物基因的表达调控

真核生物的基因结构与转录活性 基因家族( 基因家族(简单多基因家族和复杂多基因 家族) 家族) 真核基因的断裂结构( 真核基因的断裂结构(组成型剪接和选择 型剪接) 型剪接)
基因簇与基因家族 (Gene cluster、Gene family) 、 )
基因家族( 真核生物的基因组中许多来源相同, 基因家族(Gene family):真核生物的基因组中许多来源相同, ) 真核生物的基因组中许多来源相同 结构相似、 结构相似、功能相关的一组基因 目前可分为 目前可分为三类: 简单多基因家族:5SrRNA基因家族 ① 简单多基因家族:5SrRNA基因家族 复杂多基因家族: ② 复杂多基因家族:各个成员并不都是相同的 往往以串联重复基因簇的形式出现
SP1
TF IIIA
344aa,N端与 , 端与 端与DNA结合 结合 9个锌指,每个~30aa 个锌指, 个锌指 每个~ 与5s rRNA基因内启动 基因内启动 子(50bp)结合 结合
Cys2/Cys2 zinc finger Cys- X2- Cys-X13 - Cys- X2- Cys Zn++与4个Cys结合 个 结合 DNA结合序列较短,对称 结合序列较短, 结合序列较短 无大量重复性锌指 例如GAL4,酵母的转录因子 例如 , 哺乳类的固醇类激素受体
1、反式作用因子DNA结合域的模式(motif ) 、反式作用因子 结合域的模式( 结合域的模式
1)螺旋-转折 螺旋(helix-turn-helix,HTH) )螺旋 转折 螺旋( 转折-螺旋 , ) 2)锌指结构(zinc finger) )锌指结构( ) 3)碱性-亮氨酸拉链 (basic-leucine zipper,bZIP) )碱性 亮氨酸拉链 , ) 4)碱性-螺旋 环-螺旋(basic-helix/loop/helix,HLH) )碱性 螺旋 螺旋-环 螺旋 螺旋( , ) 5)同源域蛋白(homeo domain,HD) )同源域蛋白( , )

分子生物学课件--真核生物表达调控

分子生物学课件--真核生物表达调控

(4)DNA拓扑结构变化 天然双链DNA的构象大多 是负性超螺旋。当基因活跃转录时,RNA聚合酶转 录方向前方DNA的构象是正性超螺旋,其后面的 DNA为负性超螺旋。正性超螺旋会拆散核小体,有 利于RNA聚合酶向前移动转录;而负性超螺旋则有 利于核小体的再形成。
(5)DNA碱基修饰变化:真核DNA中的胞嘧啶约有 5%被甲基化为5甲基胞嘧啶(5methylcytidine,m5C), 而活跃转录的DNA段落中胞嘧啶甲基化程度常较低。 这种甲基化最常发生在某些基因5′侧区的CpG序列中, 实验表明这段序列甲基化可使其后的基因不能转录。 甲基化可能阻碍转录因子与DNA特定部位的结合从而 影响转录。
分子生物学课件--真核生物表达 调控
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一、转录前调控
1、DNA水平的调控:是真核生物发育调控的一种形式,它包括:基因
丢失、甲基化、扩增、重排、等方式。 (1) 基因丢失:目前认为这种调节方式主要是在较低等的真核生物中。如
马蛔虫,只有在生殖细胞核中保持个体发育的全部基因,而体细胞核 中却失去了一部分基因。在原生动物和昆虫中也有类似现象,体细胞 不具有全能性。高等生物没有发现类似的现象,可进行体细胞核移植。
③碱性-亮氨酸拉链(basic leucine zipper,bZIP)
这结构的特点是蛋白质分子的肽链上 每隔6个氨基酸就有一个亮氨酸残 基,结果就导致这些亮氨酸残基都 在α螺旋的同一个方向出现。两个 相同的结构的两排亮氨酸残基就能 以疏水键结合成二聚体,这二聚体 的另一端的肽段富含碱性氨基酸残 基,借其正电荷与DNA双螺旋链上 带负电荷的磷酸基团结合。若不形 成二聚体则对DNA的亲和结合力明 显降低。
(1) 启动子
真核启动子间不像原核那样有明显共同一致的序列,而且单靠RNA聚合 酶难以结合DNA而起动转录,而是需要多种蛋白质因子的相互协调作 用。

基因的表达与调控

基因的表达与调控

No RNA
R-
1 No RNA R-
No RNA
RNA
RNA
RNA
RNA
No RNA
No RNA
1
21
2
2
32
3
3、基因的微细结构
20世纪50年代的生化技术还无法进行DNA的序列 测定,本泽尔利用经典的噬菌体突变和重组技术, 对T4噬菌体rⅡ区基因的微细结构进行了详细分析。
野生型T4噬菌体 可侵染B株和K12株 噬菌斑小而模糊
功能上被互补(顺反)测验所规定的核苷酸 序列。
假定有两个独立起源的隐性突变,如a1与a2,它 们具有类似的表型。
如何判断它们是属于同 一个基因的突变,还是分 别属于两个基因的突变? 即如何测知它们是否是等 位基因?
二、基因的微细结构
1、互补作用与互补测验(顺反测验)
需要建立一个双突变杂合二倍体,测定这两个突 变间有无互补皱粒表现型是由于缺少了淀粉档分享dnagtacatcatgtacttgaaacttgacctggagaacttgaacttaaatttmrna密码子guacaucuuacuccugaagaaaaa氨基酸dnagtacatmrna密码子gua氨基酸dnaaaatttmmrna密码根据红色面包霉的研究提出了一个基因一个酶的假说后来又被修改为一个基因种多肽链
Enzymes
B
CAP
G
R
ZY A
a
b
P
X
在有葡萄糖存在时,不能形成cAmp,也就不能 形成正调控因子cAmp-CAP,因此,基因不表达。
目前,通过遗传分析证明了lac操纵元的存在; 已经分离出阻遏蛋白,并成功地测定了阻遏蛋白 的结晶结构,以及阻遏蛋白与诱导物及操纵子序 列结合的结构。

分子生物学-14-真核调控-1-基因结构与顺式元件

分子生物学-14-真核调控-1-基因结构与顺式元件

多肽链或功能RNA所必需的全部核苷酸序
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• 启动子定义:Promoter,真核基因启动子由
核心启动子和上游启动子两个部分组成,是 在基因转录起始位点(+1)及其5‘上游大约 100~200bp以内的一组具有独立功能的DNA 序列,是决定RNA聚合酶Ⅱ转录起始点和转 录频率的关键元件。
• 内含子的两端序列之间没有广泛的同源性
• 连接区序列很短,高度保守,是RNA剪接的信号序列
5'GT————————AG 3’
5'CA————————TC 3’
5'GU————————AG 3'
供体位点 左剪接位点
受体位点 右剪接位点
基本概念
外显子与内含子的可变调控
• 通常,一个基因的转录产物通过组成型剪接
GC CAAT TATA box box box
ATGCAAAT的八 聚体box
5’ 非 翻
译 区
终止子 外显子
加尾 信号
转 录 终
绝 缘
止子

异染色 质区域
ATATTCAT的
5’UTR 内含子
POU box、
翻译起始
CANNG的Ebox
转录起始
异染色 质区域
“基NSRR因ES、E”、IGH的RSEE分、子生物学定义:产生一条 模式图
二、发育调控或称不可逆调控,是真核基因调控的精髓部 分,它决定了真核细胞生长、分化、发育的全部进程。在 个体发育过程中,DNA会发生规律性变化,从而控制基因 表达和生物的发育
真核生物基因表达调控的水平:
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根据基因调控在同一事件中发生的先后次序又可分为:
基因组水平调控 染色体水平调控 染色质水平调控

真核生物的基因表达调控

真核生物的基因表达调控
1. 真核基因表达调控的特点 2. DNA染色体水平的调控
3. 真核基因转录水平的调控
4. 翻译水平的调节因素及其调节
真核生物基因表达的调控是当前分子 生物学中最活跃的研究领域之一。人们已 经能够利用许多过去不曾具备的先进仪器
设备等手段来研究许多分子生物学方面的
重大问题,使我们能从分子水平上认识许
④真核生物大都为多细胞生物,在个体发育 过程中发生细胞分化后,不同细胞的功能 不同,基因表达的情况也就不一样,某些 基因仅特异地在某种细胞中表达,称为细 胞特异性或组织特异性表达,因而具有调 控这种特异性表达的机制。
11.2 DNA染色体水平的调控 每个真核细胞所携带的基因数量及总基 。 因组中蕴藏的遗传信息量都大大高于原核生
物。
基因组 DNA 中基因之间存在许多重复序列、 基因内部有大量不编码蛋白质的序列、真核生 物的 DNA 常与蛋白质 ( 包括组蛋白和非组蛋白 ) 结合形成十分复杂的染色质结构、染色质构象 的变化、染色质中蛋白质的变化以及染色质对 DNA 酶敏感程度的不同等,都直接影响着真核 基因的表达调控。
真核细胞基因表达调控在DNA和染色 体水平上主要有以下几个方面: 染色质的结构、DNA在染色体上的位 置、基因拷贝数的变化、基因重组、基因 扩增、基因丢失、基因重排、DNA修饰等。
DNase I、II和微球菌核酸酶等非特 异性内切酶可用于检测核小体构象的变 化。染色质能被DNaseI降解为酸溶性小 片段,但由于核小体结构的保护,其对 酶的攻击仍具有一定的耐受性,敏感区 仅相当于染色质全长的1/10。
当用极低浓度的DNase I处理染色质时,
切割首先发生在少数特异性位点,其敏感hypersemitiveske)。
DNaseI超敏感位点(100~200bp)的存在是活 性染色质的重要特征,具有组织特异性,并 同基因的表达密切相关。 每个活跃表达的基因都有一个或几个超敏感 位点。大部分位于5′端启动子区域,少数 位于转录单位下游,为RNA聚合酶、转录因 子或其他调节蛋白提供结合位点。

真核生物DNA水平上的基因表达调控

真核生物DNA水平上的基因表达调控
(1)多层次; (2)无操纵子和衰减子; (3)个体发育复杂; (4)受环境影响较小;
研究基因调控主要应回答3个问题:
① 什么是诱发基因转录的信号? ② 基因调控主要是在哪一步(模板DNA的转录、mRNA
的成熟或蛋白质合成)实现的? ③ 不同水平基因调控的分子机制是什么?
第一节:真核生物的基因结构与转录活性
概述
目录
第一节:真核生物的基因结构与转录活性
第二节:真核基因的转录
第三节:反式作用因子
第四节:真核基因转录调控的主要模式
第五节:其他水平上的基因调控
概述
真核生物和原核生物由于基本生活方式不同所决定基因表达调控上 的巨大差别。
原核生物的调控系统就是要在一个特定的环境中为细胞创造高速生 长的条件,或使细胞在受到损伤时,尽快得到修复,所以,原核生 物基因表达的开关经常是通过控制转录的起始来调节的。
酶,另一种是从头合成型甲基转移酶,前者主要在甲基化母链(模板链) 指导下使处于半甲基化的DNA双链分子上与甲基胞嘧啶相对应的胞嘧啶甲 基化。该酶催化特异性极强,对半甲基化的DNA有较高的亲和力,使新生 的半甲基化DNA迅速甲基化,从而保证DNA复制及细胞分裂后甲基化模式 不变。后者催化未甲基化的CpG成为mCpG,它不需要母链指导,但速度 很慢。
1.“开放”型活性染色质(active chromatin) 结构对转录的影响
真核基因的活跃转录是在常染色质上进行的。转录发生之 前,染色质常常会在特定的区域被解旋松弛,形成自由DNA。 这种变化可能包括核小体结构的消除或改变,DNA本身局部结 构的变化等,这些变化可导致结构基因暴露,促进转录因子与 启动区DNA的结合,诱发基因转录。
一、基因家族 二、真核基因的断裂结构 三、真核生物DNA水平上的基因表达调控 四、DNA 甲基化与基因活性的调控

真核基因表达调控

真核基因表达调控

子遗传学的奠基石。
Gregor Mendel (1822-1884).
The Father of Genetics
在孟德尔遗传学基础上, Morgan 又提出了 基因学说。 1910年,Morgan和他的助手们发现了第一只 白眼雄果蝇,称为突变型。正常情况下,果蝇
都是红眼的,称为野生型。Morgan将白眼雄果
Actually, they had. That morning, Watson and
Crick
had
figured
out
the
structure
of
deoxyribonucleic acid, DNA. And that structure —
a "double helix" that can "unzip" to make copies
控制遗传信息流动的基本机制——RNA干扰 方面的杰出贡献而获得诺贝尔生理医学奖。
1928 年,英国科学家 Griffith 等人发现,具有
光滑外表的S型肺炎链球菌能使小鼠发病,具有 粗糙外表的R型细菌没有致病力。荚膜多糖能保
护细菌免受动物白细胞的攻击。
美国著名的微生物学家 Avery首先用实验证明 基因就是DNA分子。他将光滑型致病菌(S型) 烧煮杀灭活性以后再侵染小鼠,发现这些死细 菌自然丧失了致病能力。
• 1993 年,美国科学家 Roberts 和 Sharp 因发
现 断 裂 基 因 ( introns ) 而 获 得 Nobel 奖 ; Mullis 由 于 发 明 PCR 方 法 而 与 加 拿 大 学 者 Smith ( 第 一 个 设 计 基 因 定 点 突 变 ) 共 享 Nobel化学奖。

简述真核生物基因表达调控过程

简述真核生物基因表达调控过程

简述真核生物基因表达调控过程真核生物基因表达调控过程是指在真核生物细胞中,如何通过一系列的调控机制,将基因中的遗传信息转化为蛋白质,以实现细胞功能的正常发挥。

基因表达调控过程可以分为转录调控和转录后调控两个阶段。

在转录调控阶段,首先是在细胞核中进行转录。

细胞核中的DNA被RNA聚合酶酶识别并解链,形成单链mRNA。

但并不是所有基因都会被转录,细胞会根据需要选择性地进行转录。

这是通过转录因子的作用来实现的。

转录因子是一类能够与DNA特定序列结合的蛋白质,它们能够促进或抑制转录的进行。

转录因子的结合位点位于启动子区域,当转录因子结合到启动子区域时,会引发一系列的反应,包括启动RNA聚合酶的活性和引导其结合到合适位置上,从而促使转录的进行。

转录因子的表达受到多种因素的调控,如细胞内的信号分子、细胞周期等。

转录后调控是指在mRNA合成后,通过一系列的调控机制来决定其在细胞中的命运。

mRNA在合成后需要经过剪接、修饰和运输等过程。

剪接是指将mRNA中的内含子去除,将外显子进行连接的过程。

通过剪接的不同方式,可以生成不同的mRNA亚型,从而在翻译过程中产生不同的蛋白质。

修饰是指在mRNA上加上帽子和尾巴等化学修饰,这些修饰可以保护mRNA不被降解,并帮助mRNA与翻译机器结合。

运输是指mRNA离开细胞核,进入到细胞质中,进一步参与翻译过程。

这个过程受到RNA结合蛋白的调控。

在翻译过程中,mRNA被核糖体识别并翻译成蛋白质。

这个过程也受到多种调控机制的影响。

一方面,mRNA上的启动子序列会影响翻译的起始位置,从而决定蛋白质的翻译起始位点。

另一方面,mRNA的稳定性也会影响翻译的效率和蛋白质的表达水平。

mRNA 的稳定性受到RNA结合蛋白和非编码RNA的调控。

总的来说,真核生物基因表达调控过程是一个复杂而精细的调控网络。

通过转录调控和转录后调控的相互作用,细胞可以根据内外环境的需要,在不同的时空位置上产生不同类型的蛋白质,以实现细胞功能的正常发挥。

分子生物学第八章 基因表达调控

分子生物学第八章 基因表达调控
* IPTG,异丙基-β-D硫代半乳糖苷 * TMG ,巯甲基半乳糖苷 * ONPG,O-硝基半乳糖苷
4、阻遏蛋白与操作子的相互作用
阻遏蛋白与操作子是否发生相互作用? 硝酸纤维素膜可以和蛋白质结合而不与DNA结合 阻遏蛋白四聚体结合与膜上,可以与野生型DNA片段形 成复合物。并可被IPTG抑制。 而用lacOc 突变体的DNA片段,则不能与阻遏蛋白结合
Luxury gene
顺、反因子间互作方式的基因表达调控
♫ 顺式作用元件(cis-acting element):能够影响 同一条或相连DNA序列活性的特定DNA片段。例如,启 动子 ♫ 反式作用因子(trans-acting factor):一种基 因的蛋白质产物,能够影响位于基因组另一条染色体上的 (或基因组别处的)另一个基因的表达活性。例如,RNA polymerase
经典锌指的三维结构:一个β发卡和一个α-螺旋
锌指上的α-螺旋 负责与DNA作用
b、Cys-Cys(C2/C2)锌指
Zn++与4个Cys残基 形成配位键
酵母的转录激活 因子GAL4、哺 乳类的固醇类激 素受体为典型代 表。
糖皮质激素受体
• ZYJ272 •
The DNA-binding domain of Cys2-Cys2 zinc finger proteins (Figure 1. Glucocorticoid receptor) is composed of two irregular antiparallel beta-sheets and an alpha-helix, followed by an extended loop.
♫ 操纵元中各结构基因按一定比例协调翻译 ♫ 聚有极性突变效应:
操纵元中一个近基因的无义突变能够影响远基因表, 且根据距离远近呈极性梯度效应

郜刚分子生物学-14-真核基因表达调控-4-组蛋白乙酰化与DNA甲基化对基因转录的调控

郜刚分子生物学-14-真核基因表达调控-4-组蛋白乙酰化与DNA甲基化对基因转录的调控

siRNA的作用是导致染色质失活状态的另一种调控机制 • TF: transcriptional factors; • DNMT: DNA methyltransferase; • HAT: Histone acetyltransferase; • HDAC: Histone deacetylase • MBP: Methyl-CpG binding protein; • HMT: Histone methyltransferase. Modifications of the histone H3
去乙酰化的染色质是转录受抑制的,在组蛋 白乙酰基转移酶HAT的作用下活化,转录进 行。但是这个过程可以被组蛋白去乙酰化酶 HDAC逆转。HDAC又可以被抑制因子抑制
于是转录又被激活
Proposed model for the transcriptional activation of genes regulated by methylation. Yellow line represents DNA and blue spheres indicate nucleosomes. Histone acetyltransferase (HAT); Histone Deacetylase (HDAC); Trichostatin (TSA); Methyl-CpG-binding Domain 2 (MBD2).
染色质重建需要重建 复合体 (Remodeling complex)的参与
重建复合体的中 心是它的ATP酶 亚基
机制:
组蛋白八聚体可 以在DNA上滑动, 改变特定序列在 核小体表面的位 置;核小体之间 的间距也可以发 生变化;特定序 列的核小体可能 被重建复合体临 时取代,其中最 重要的是TFIID, 一方面它使得基 因转录,另一方 面,使得组蛋白 乙酰化。其结果 招来了RNA聚合 酶,基因开启。

分子生物学-真核生物基因表达调控

分子生物学-真核生物基因表达调控

3 基因重排与交换
将一个基因从远离启动子的地方移到距它很
Hale Waihona Puke 近的位点从而启动转录,这种方式称为基因 重排。
通过基因重排调节基因活性的典型例子是免
疫球蛋白和T-细胞受体基因的表达。
V、C和J基因片段在胚胎细胞中相隔较远。编码产生免疫球蛋白的细胞发 育分化时,通过染色体内DNA重组把4个相隔较远的基因片段连接在一起, 从而产生了具有表达活性的免疫球蛋白基因。
发育早期:只有一个着丝点行使功能,
从头合成型甲基转移酶:催化未甲基化的CpG成 为mCpG
基因丢失
在细胞分化过程中,可以通过丢失掉某些基
因而去除这些基因的活性。某些原生动物、 线虫、昆虫和甲壳类动物在个体发育中,许 多体细胞常常丢失掉整条或部分的染色体, 只有将来分化产生生殖细胞的那些细胞一直 保留着整套的染色体。
一.
基因丢失: 在细胞分化过程中,某些原生动物、线虫 、昆虫等体细胞通过丢失某些基因而除去 这些基因的活性。 马蛔虫:只有一对染色体,染色体上有许 多着丝点。
假基因
是基因组中因突变而失活的基因,无蛋白质产
物。
一般是启动子出现问题。
8.2 DNA水平的基因表达调控
1染色质水平的调节:“开放”型活性染色质
(activechromatin)结构对转录的影响
2基因扩增
3基因重排与交换
4
DNA甲基化与基因活性的调控
1 染色质状态对基因表达的调控
能相关的基因,这些基因成套组合称为基因家族。 如:编码组蛋白、免疫球蛋白和血红蛋白的基因都 属于基因家族 同一家族中的成员有时紧密地排列在一起,成为 一个基因簇(gene cluster) 。
1、简单多基因家族
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2020/10/1
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二、基因家族 (gene family)P297
原核生物中,功能相关的基因组成操纵子,以多 顺反子mRNA进行转录,整个体系在一个启动子的 控制之下。
真核生物中,DNA是以单顺反子的形式存在。 单顺反子(monocistronic mRNA) :只编码一个 蛋白质的mRNA称为单顺反子mRNA。
2020/10/1
1
真核基因表达调控根据性质分为两种类型:
瞬时调控或称可逆性调控: 相当于原核细胞对环境变化所做出的反应。
包括:某种底物或激素水平升降时,表现出细胞内酶 或某些蛋白质合成的变化;细胞周期不同阶段中酶活 性或浓度的调节。
发育调控或称不可逆调控:
是真核基因调控的精髓部分,决定了真核细胞生 长、分化、发育的全部进程。
发育调控或不可逆调控
➢转录水平调控: 遗传水平的DNA调控、表观遗传水平的染色质调控
➢转录后水平调控 RNA加工成熟过程的调控、翻译水平的调控、蛋白质
加工水平的调控
2020/10/1
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第二节 真核基因表达的转录水平调控
真核基因调控主要在转录水平上进行,受大 量特定的顺式作用元件(cis-acting element)和反 式作用因子(trans-acting factor,又称跨域作用 因子)的调控,真核生物的转录调控大多数是通 过顺式作用元件和反式作用因子复杂的相互作用 来实现的。
2020/10/1
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外显子(exon):基因中与mRNA一致的序列, 即编码序列,称为外显子。一个基因总是以外显子 为起点和终点。
内含子(intron):基因中编码序列之间的介入 序列,在原初转录物加工为mRNA时被去除,即非 编码序列,称为内含子。
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2、外显子与内含子的连接区 特点: 1)内含子两端序列不能互补;
用的性质; ⑥ 转录和翻译过程在时间和空间上的差别; ⑦ mRNA的加工。
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一、真核基因的断裂结构
1、外显子与内含子
断裂基因(interrupted gene):真核生物基因除 了与mRNA相对应的编码序列外,还含有一些不编 码的序列插在编码序列之间,这些非编码序列在加 工为成熟的mRNA时被去除。这样的结构基因称为 断裂基因。
DNA 由RNA聚合酶 I 转录完成
前rRNA(45S)
甲基化
主要在核糖的2-OH甲基化
RNA酶降解
5S rRNA
18S、28S、5.8S rRNA
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由RNA聚合酶III转录完成
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2、复杂多基因家族 由几个相关的多基因构成,基因家族间由间隔
序列隔开,并作为独立的转录单位。
6000 bp, 重复1000次左右
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三、基因表达的方式和特点P300
基因表达的方式
➢组成性表达(管家基因) ➢选择性表达(诱导基因)
基因表达的时空特异性
➢时间特异性、阶段特异性 ➢空间特异性、细胞或组织特异性
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四、真核基因表达调控一般规律P301
瞬时调控或可逆调控
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真核基因表达调控的主要步骤
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第一节 真核基因表达调控相关概念和一般规律
真核细胞和原核细胞在基因转录、翻译、DNA空 间结构方面的主要差别:P302 ① mRNA与多肽链的数量关系; ② 基因组DNA存在的形式; ③ 基因组DNA的结构; ④ DNA片段的重排及拷贝数的增加; ⑤ 转录调节区的大小,距离转录起始位点的距离及作
1、简单多基因家族 家族中的成员一般以串联方式前后连接形成的
多基因家族,称为简单多基因。
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细菌中rRNA基因家族各成员的分布与成熟过程分析
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脊椎动物中rRNA基因家族各成员的分布与成熟过程分析
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真核生物中rRNA基因家庭各成员的成熟过程分析
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3、发育调控的复杂多基因家族
血红蛋白是所有动物体内输送分子氧的主要载体, 由两条链和两条链组成的四聚体加上一个血红素 辅基(结合铁原子)后形成功能性血红蛋白。
有功能的血红蛋白基因的基本结构:三个外 显子被两个内含子隔开。
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类和类珠蛋 白基因家族
人在发育过程中 的血红蛋白类型
2)连接区序列高度保守(GT-AG法则);
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5,GT 左剪接位点
donor site
AG 3, 右剪接位点 acceptor site
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3、外显子与内含子的可变性
组成性剪接:在高等真核生物中,内含子通常是有 序或组成性地从mRNA前体中被剪接,这种剪接方 式称为组成性剪接。 选择性剪接:又叫变位剪接,指在剪接过程中可以 有选择性地越过某些外显子或某个剪接位点进行变 位剪接,产生出不同mRNA的过程,这种剪接方式 称为变位剪接。
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一、真核基因的一般结构特征 基因(gene)
产生一条多肽链或功能RNA所必需的全部核 苷酸序列。
多顺反子(polycistronic mRNA ) :编码多个 蛋白质的mRNA称为多顺反子mRNA 。
2ily):真核细胞中,许多功能 相关的基因成套组合,称为基因家族。
基因簇(gene cluster):同一基因家族中的成员 紧密排列在一起,称为一个基因簇。
第八章 真核基因表达调控
原核生物基因表达调控的特点:原核生物是单细 胞生物,环境因子往往是调控的诱导物,每个细 胞对环境变化的反应都是直接和一致的。
真核基因表达调控的特点是:能在特定的时间, 特定的细胞中激活特定的基因,从而实现“预定” 的、有序的、不可逆转的分化过程,并使生物的 组织和器官保持正常的功能。
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小鼠淀粉酶基因的表达具有组织特异性。
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同一段DNA序列生成了两条或两条以上的mRNA链。
相同密码子、不同起始位点 产生长度不同的蛋白质
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不同起始位点、不同读码顺 序产生不同蛋白质
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不同外显子的使用产生不同蛋白质
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