保护碱基表
保护碱基列表
PCR设计引物时酶切位点的保护注释：1．如果要加在序列的5‘端，就在酶切位点识别碱基序列（红色）的5’端加上相应的碱基（黑色），相同如果要在3‘端加保护碱基，就在酶切位点识别碱基序列（红色）的3’端加上相应的碱基（黑色）。
2．切割率：正确识别并酶切的效率3。
加保护碱基时最好选用切割率高时加的相应碱基。
1. 前台功能方案51.1主页面51.2 商品搜索51.3 商品列表51.4 虚拟分类61.5 商品展示616 会员中心61.7 购物车71.8 促销专题81.9 帮助中心82 后端管理82.1 商品82.2 订单112.3 会员122.4 营销推广132.5 模版设计142.6 系统工具142.7 商店配置142.8 网站内容管理152.9 统计报表152.10 系统工具161. 前台功能方案1.1主页面主分类导航商品搜索广告公告商品分类推荐商品虚拟分类（快速检索链接）最新发货信息最新留言自定义版块1.2 商品搜索分词搜索货号糊模搜索商品关键词搜索（配合商品关键词）1.3 商品列表无限商品分类按商品规格筛选列表按销量、人气、价格筛选排序热卖排行顾客游览过的商品快速订货1.4 虚拟分类虚拟分类（快速检索链接）1.5 商品展示商品规格选择相册图片展示立刻购买与加入购物车功能16 会员中心交易记录我的订单我的积分积分兑换优惠券我的优惠券收藏夹商品留言评论与咨询个人设置个人信息修改密码收货地址预存款管理站内消息管理1.7 购物车所购商品名称列表商品积分销售价格优惠价格数量小计商品总额商品享受订单优惠说明功能按钮按货号订购购物车商品EXCEL 下载继续购物清空购物车使用优惠券去结算1.8 促销专题1.9 帮助中心购物流程图购物指南新手上路支付与配送1.11 会员注册登陆弹会员注册或登陆1.12 评论/咨询/留言更简化的评论咨询页面1.13 友情链接支持图文链接2 后端管理2.1 商品商品管理批量操作商品上架商品下架统一调价分别调价统一调库存分别调库存商品名称商品简介商品品牌商品排序商品重量分类转换类型转换添加商品一键调用相册图片添加相关商品商品搜索货号模糊搜索商品筛选按名称按货号按商品标签按商品分类按商品品牌按商品销售价商品CSV 导入商品CSV 导出商品定时上下架货品上下架商品页SEO 功能商品分类无级分类管理自定义分类模板分类页SEO 功能虚拟分类商品类型商品类型管理商品类型下载商品类型导入扩展属性管理商品规格商品规格管理商品规格导入品牌管理品牌名称、网址，LOGO 添加管理品牌页SEO 功能自定义品牌页模板品牌关联商品类型商品批量上传CSV 文件下载上传CSV 文件第三方平台CSV 上传配置CSV 上传2.2 订单订单管理添加订单订单状态操作管理订单支付订单发货订单退款订单退货订单作废订单标签订单筛选订单导出订单打印配货单打印购物清单打印订单打印样式管理购物清单样式配货单样式单据管理收款单管理退款单管理发货单管理退货单管理售后服务管理快递单管理快递单模板添加快递单模板编辑快递单模板下载快递单模板导出发货信息管理2.3 会员会员管理会员等级管理群发邮件群发消息群发短信批量编辑批量修改会员等级批量修改积分会员筛选会员导出会员注册项管理统计报表预存款充值/冻结冻结列表预存款交易报表购买咨询管理商品评论管理商店留言管理站内消息管理2.4 营销推广批发方案混批方案管理批发方案管理SEO 设置管理SiteMaps 管理站外推广链接2.5 模版设计网站内容管理站点栏目管理文章管理友情链接网页底部信息管理模板管理模板编辑模板下载图片管理样式管理模板在线预览2.6 系统工具2.7 商店配置全站设置基本设置购物显示设置商品图片设置支付管理支付方式添加编辑管理配送管理配送方式添加编辑管理配送费用管理配送地区管理权限分配管理角色权限分配管理货币管理第三方整合地区管理2.8 网站内容管理2.9 统计报表访问统计预付款统计销售统计销售额总览销售量排名会员购物量排名商品访问购买次数销售指标分析2.10 系统工具数据管理数据备份数据恢复数据库校验体验数据清除网店暂停营业页面显示管理2.11 第三方应用扩展插件1 采购单中心1、1 供应商管理供应商列表更新列表同步更新采购价同步最后同步时间代销商品列表我的采购单商品数据下载1、2 采购单列表刷新导出筛选1、3 同步更新配置添加配置添加规则选择供应商针对产品线1、4 配置列表添加配置刷新删除回收站增加：供应商内部进销存项目招投标项目及产品的智能匹配支付可以整体支付给平台，也可以通过参数设置支付到每个供应商；项目招投标暂时不需要网上支付增加中介管理：中介可以发布招标信息和求购信息原则上：游客浏览网站，先注册会员，会员可以购买产品和投标项目，可以发布求购信息，但是不能上架产品及发布招标信息，通过平台认证后，方可；通过开店认证，该会员具有发布新产品、发布招标信息；会员也可以通过认证成为中介；B2B（Business To Business），是指一个市场的领域的一种，是企业对企业之间的营销关系。
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Hind III
CAAGCTTG CCAAGCTTGG CCCAAGCTTGGG
GGAATTCC CGGAATTCCG CCGGAATTCCGG
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切割率%
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CCTCGAGG CCCTCGAGGG CCGCTCGAGCGG
引物设计保护碱基列表
在分子克隆实验中，有时我们会在待扩增的目的基因片段两端加上特定的酶切位点，用于后续的酶切和连接反应。
由于直接暴專在末端的酶切位点不容易直接被限制性核酸内切酶切开，因此在设计PCR引物时，人为的在酶切位点序列的5 “端外侧添加额外的碱基序列，即保护碱基，用来提高将来酶切时的活性。
添加保护碱基，需要考虑两个因素：一是碱基数目，一是碱基种类。
添加保护碱基时，最关心的应该是保护碱基的数目，而不是种类。
什么样的酶切位点，添加几个保护緘基，是有数据可以参考的，见附表。
添加什么保护碱基，如果严格点，是根据两条引物的Tm值和各引物的緘基分布及GC含量。
如果某条引物Tm值偏小，GC%较低，添加时多加G或C,反之亦反。
保护碱基列表(基础教育)
PCR设计引物时酶切位点的保护酶寡核苷酸序列切割率%2 hr20 hrAcc I G GTCGAC CCG GTCGAC CGCCG GTCGAC CGG 0Afl III C ACATGT GCC ACATGT GGCCC ACATGT GGG>90>90>90>90Asc I GGCGCGCCA GGCGCGCC TTT GGCGCGCC AA >90>90>90>90>90>90Ava I C CCCGGG GCC CCCGGG GGTCC CCCGGG GGA50>90>90>90>90>90BamH I C GGATCC GCG GGATCC CGCGC GGATCC GCG10>90>9025>90>90Bgl II C AGATCT GGA AGATCT TCGGA AGATCT TCC7525>90>90BssH II G GCGCGC CAG GCGCGC CTTTG GCGCGC CAA50>90BstE II G GGT(A/T)ACC C010BstX I AACTGCAGAA CCAATGCATTGGAAAACTGCAG CCAATGCATTGG AACTGCAGAA CCAATGCATTGG ATGCAT252550>90Cla I C ATCGAT GG ATCGAT CCC ATCGAT GGCCC ATCGAT GGG>9050>9050EcoR I G GAATTC CCG GAATTC CGCCG GAATTC CGG >90>90>90>90>90>90Hae III GG GGCC CCAGC GGCC GCTTTGC GGCC GCAA >90>90>90>90>90>90Hind III C AAGCTT GCC AAGCTT GGCCC AAGCTT GGG1075Kpn I G GGTACC CGG GGTACC CCCGG GGTACC CCG>90>90>90>90Mlu I G ACGCGT CCG ACGCGT CG2550Nco I C CCATGG GCATG CCATGG CATG5075Nde I C CATATG GCC CATATG GGCGC CATATG GCGGGGTTT CATATG AAACCCGGAATTC CATATG GAATTCCGGGAATTC CATATG GAATTCCC7575>90>90Nhe I G GCTAGC CCG GCTAGC CGCTA GCTAGC TAG10102550Not I TT GCGGCCGC AAATTT GCGGCCGC TTTAAAATAT GCGGCCGC TATAAAATAAGAAT GCGGCCGC TAAACTATAAGGAAAAAA GCGGCCGC AAAAGGAAAA10102525101090>90Nsi I TGC ATGCAT GCACCA ATGCAT TGGTTCTGCAGTT10>90>90>90Pac I TTAATTAAG TTAATTAA CCC TTAATTAA GG 025>90Pme I GTTTAAACG GTTTAAAC CGG GTTTAAAC CCAGCTTT GTTTAAAC GGCGCGCCGG752550>90Pst I G CTGCAG CTGCA CTGCAG TGCAAA CTGCAG AACCAATGCATTGGAAAA CTGCAG CCAATGCATTGGAACTGCAG AACCAATGCATTGGATGCAT10>90>9010>90>90Pvu I C CGATCG GAT CGATCG ATTCG CGATCG CGA102510Sac I C GAGCTC G1010Sac II G CCGCGG CTCC CCGCGG GGA50>90Sal I GTCGAC GTCAAAAGGCCATAGCGGCCGC GC GTCGAC GTCTTGGCCATAGCGGCCGCGGACGC GTCGAC GTCGGCCATAGCGGCCGCGGAA10105075Sca I G AGTACT CAAA AGTACT TTT 10752575Sma I CCCGGGC CCCGGG GCC CCCGGG GGTCC CCCGGG GGA10>90101050>90Spe I G ACTAGT CGG ACTAGT CCCGG ACTAGT CCGCTAG ACTAGT CTAG 1010>90>905050Sph I G GCATGC CCAT GCATGC ATGACAT GCATGC ATGT102550Stu I A AGGCCT TGA AGGCCT TCAAA AGGCCT TTT >90>90>90>90>90>90Xba I C TCTAGA GGC TCTAGA GCTGC TCTAGA GCACTAG TCTAGA CTAG>907575>90>90>90Xho I C CTCGAG GCC CTCGAG GGCCG CTCGAG CGG10102575Xma I C CCCGGG GCC CCCGGG GGCCC CCCGGG GGGTCCC CCCGGG GGGA2550>9075>90>90注释：1．如果要加在序列的5‘端，就在酶切位点识别碱基序列（红色）的5’端加上相应的碱基（黑色），相同如果要在3‘端加保护碱基，就在酶切位点识别碱基序列（红色）的3’端加上相应的碱基（黑色）。
引物设计保护碱基列表
在分子克隆试验中，有时我们会在待扩增目标基因片段两端加上特定酶切位点，用于后续酶切和连接反应。
因为直接暴露在末端酶切位点不轻易直接被限制性核酸内切酶切开，所以在设计PCR引物时，人为在酶切位点序列5‘端外侧添加额外碱基序列，即保护碱基，用来提升未来酶切时活性。
添加保护碱基，需要考虑两个原因：一是碱基数目，一是碱基种类。
添加保护碱基时，最关心应该是保护碱基数目，而不是种类。
什么样酶切位点，添加多个保护碱基，是有数据能够参考，见附表。
添加什么保护碱基，假如严格点，是依据两条引物Tm值和各引物碱基分布及GC含量。
假如某条引物Tm值偏小，GC%较低，添加时多加G或C，反之亦反。
保护碱基列表。
内切酶保护碱基表
内切酶保护碱基表什么是内切酶内切酶是一类用于切割DNA或RNA分子的酶。
在DNA分子中，内切酶能够识别特定的碱基序列，并在该序列两侧剪断双链，形成切口。
内切酶在基因工程、分子生物学和医学研究中有着重要的应用。
内切酶的分类内切酶可以根据其切割产物的特征进行分类，常见的分类方法有以下几种：1. 双链切割酶双链切割酶能够同时在DNA分子的两条链上切割出两个切口。
根据切割的位置，双链切割酶又可以分为非对称性双链切割酶和对称性双链切割酶。
非对称性双链切割酶切割产物的两条链是不同长度的，而对称性双链切割酶切割产物的两条链长度相同。
2. 单链切割酶单链切割酶只在DNA分子的一条链上切割产生切口。
根据切割的位置，单链切割酶又可以分为3’端切割酶和5’端切割酶。
3’端切割酶切割产物的末端在3’端，而5’端切割酶切割产物的末端在5’端。
3. 偏心切割酶偏心切割酶在DNA分子的两条链上切割出的切口不在同一位置，形成不对称的切割产物。
偏心切割酶的切割位点在DNA分子上有一定的距离。
内切酶保护碱基表内切酶保护碱基表是一种记录内切酶切割位点的表格。
通过内切酶对特定碱基序列的识别，可以将切割位点记录在保护碱基表中。
保护碱基表以碱基的序号和切割位点的相对位置来表示。
例如，给定一个DNA序列，如果内切酶识别的切割位点位于该序列的第10号碱基之前两个碱基的位置，那么在保护碱基表中相应的位置会标注为-2。
内切酶保护碱基表的编制对于研究DNA序列的结构和功能有着重要的意义。
它可以帮助研究人员了解内切酶在DNA序列中的作用，进而推测DNA分子的结构和功能。
内切酶保护碱基表的构建步骤构建内切酶保护碱基表的步骤如下：1.选择合适的内切酶：根据研究的需要，选择适合的内切酶进行实验。
2.准备DNA样品：从生物体中提取DNA样品，并进行纯化处理。
3.选择适当的限制性内切酶切割条件：通过试验找到合适的限制性内切酶切割条件，使得切割效果最佳。
4.进行内切酶切割实验：按照选定的内切酶和切割条件，在实验室中进行内切酶切割实验。