肌动蛋白的克隆与鉴定
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β—肌动蛋白的克隆与验证
李亚楠邹曾阳孟冠奇李军张建忠沈彤
摘要:Actin即“肌动蛋白”,是细胞的一种重要骨架蛋白。Actin在不同物种之间高度保守,以至于很难获得较好的针对actin的抗血清。Actin大致可分为六种,其中四种是不同肌肉组织特异性的,包括α-skeletal muscle actin,α-cardiac muscle actin,α-smooth muscle actin,和γ-smooth muscle actin;其余两种广泛分布于各种组织中,包括β-acti n(β-non-muscle)和γ-non-muscle actin。[1]β-Actin是横纹肌肌纤维中的一种主要蛋白质成分,也是肌肉细丝及细胞骨架微丝的主要成分。具有收缩功能,分布广泛。β-Actin是PCR常用的内参,β-Actin抗体是Western Blot 很好的内参指数。内参即是内部参照(Internal Control),对于哺乳动物细胞表达来说一般是指由管家基因编码表达的蛋白。它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照物。[2]
本次实验主要通过PCR的手法来扩增目标蛋白。通过组织细胞提取DNA,用琼脂凝胶电泳来验证是否得到目标DNA;回收后的目标DNA 用PCR仪扩增,并用电泳进行回收;与T载体(PUD-18T)连接;用培养的大肠杆菌DH-5a来制备感受态细胞;将制备完成的感受态细胞均匀的涂布于含有x-gal和IPTG的混合液的LB培养基平板中进行蓝白斑的筛选;最后提取质粒DNA,经验证后保藏菌种。
关键词:β-肌动蛋白横纹肌蛋白质PCR
1材料与方法
1.1 组织细胞DNA提取。[3]
1.1.1 试剂:细胞裂解缓冲液、蛋白酶K、TE缓冲液、酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)、7.5mol/l乙酸铵。
器材:胶头滴管、离心机、烧杯、动物组织、研钵、水浴。
1.1.2 方法
取新鲜或冰冻动物组织块0.1g,尽量剪碎,置于石英研钵中,加入1ml的细胞裂解缓冲液匀浆至不见组织块,转入1.5ml离心管中,加入蛋白酶K20微升,混匀。在65℃恒温水浴锅中水浴20min,间歇震荡离心管数次。于台式离心机以
12000rpm离心5min,取上清液入另一离心管中。
加2倍体积的异丙醇,倒转混匀后,可以看见丝状物,用100微升吸头挑出晾干,用200微升TE重新溶解。
加等量的酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)振荡混匀,离心12000rpm 5min。
取上层溶液至另一管,加入1/2体积的7.5mol/l
乙酸铵,加入2倍体积的无水乙醇,混合后室温沉淀
2min,离心12000rpm 10min。
小心倒掉上清液,将离心管倒置于吸水纸上,将
附于管壁的残余液滴除掉。
用1ml 70%乙醇洗涤沉淀物1次,离心12000rpm
5min。
小心倒掉上清液,将离心管倒置于吸水纸上,将附于管壁的残余液滴除掉,室温干燥。
加200微升TE重新溶解沉淀物,然后置于4℃或-20℃保存备用。
1.2 PCR扩增
1.2.1 器材:PCR仪、移液枪、上下引物、去离子水、反应缓冲液,模板DNA、组织DNA
1.2.2 方法
在DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以特定引物为延伸起点,通过变性(高温使双链DNA解离形成单链。)、退火(低温下,引物与模板DNA互补区结合)、延伸(中温延伸,DNA聚合酶催化引物为起始点的DNA链延伸反应与),体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA
在PCR管中依次加入下列溶液:PCR预混液12.5微升、去离子水9.5微升、上游引物1微升、下游引物1微升、组织DNA1微升。共计
25微升体系
设置PCR反应程序: 94℃ 5min
94℃ 30s
58℃ 30s 32个循环
72℃ 1min
72℃ 8min
1.3电泳
1.3.1仪器:水平电泳槽.电泳仪.凝胶成像分析系统.微波炉.微量移液器.透明胶带.点样板.100ml或250ml锥形瓶.量筒.吸头等。
试剂:50x TAE.Tris溶液.冰乙酸.EDTA溶液.去离子水.1xTAE缓冲液.琼脂
糖.溴化乙啶贮存液.溴化乙啶.溴酚蓝.二甲苯青.甘油.
其他:DNA样品.DNA Ladder。
1.3.2方法
称取 1.5g琼脂糖置于锥形瓶中,加入150ml1xTAE
瓶口倒扣小烧杯100℃加热煮沸3次至琼脂糖全部融化,
摇匀即成10%琼脂糖凝胶液。
胶板制备:取电泳槽内有机玻璃内槽(制胶槽)洗干净,晾干.放入制胶玻璃板,取透明胶带将玻璃板与槽两端边缘封好形成模子。将内槽置于水平位置并在固定位置放好梳子,将冷却到65℃左右的琼脂糖凝胶完全凝固垂直轻拔梳子、取下胶带、将凝胶及内槽放入电泳槽中,添加1xTAE电泳缓冲液至没过胶板为止。
加样:在点样板上混合DNA样品和上样缓冲液,上样缓冲液的最终稀释倍数应不小于1x。用10微升微量移液枪分别将样品加入胶板的样品小槽内,每加完一个样品应该更换一个加样头以防污染,加样时勿碰坏样品周围的凝胶面。
电泳:加样后的凝胶板立即通电进行电泳,电压60-100v。
样品由负极(黑色)向正极(红色)方向移动,电压升高琼脂
糖凝胶的有效分离范围降低,当溴酚蓝移动到距离胶板下沿约1
㎝处时停止电泳。
观察照相:在紫外灯下观察,DNA存在则显示出红色荧光条
带,采用凝胶成像系统拍照保存。
琼脂糖凝胶电泳回收按电泳回收试剂盒操作,回收电泳。
1.4 感受态细胞与T载体的连接
1.4.1 设备:移液器、离心机、感受态细胞、T载体
1.4.2 方法
PUD-187 取0.5-1.0
微升回收纯化的DNA 2微升或3-4微升,看具体浓度。
加水补至5微升,再加入5毫升SOLUTION1,冰上助融。
共10微升在16摄氏度放置30分钟,之后4摄氏度过夜。
1.5 细菌转化
1.5.1 设备 LB液体培养基LB固体培养基,抗生素,,氨苄青霉素,配成100mg/ml,备用,0.1mol/L.CaCl2aq.接种针移液管,培养皿,净化工作台,摇床,恒温水浴锅,离心机。
X-gal(5-溴-4-氯-3吲哚-β-D半乳糖)X-gal溶于N,N'-二甲基甲酰胺中配20mg/ml原液。-20℃避光保存,IPTG(异丙基-β-D半乳糖苷)0.2g/ml分装贮存于-20℃,氨苄青霉素(Ampiaillin)1g Ampiaillin溶于5ml灭菌水中。配成母液保存于-20℃
1.5.2 方法
LB液体培养基:
胰蛋白酶1g,酵母粉2克,氯化钠1克,pH7.2-7.4(分
装,20毫升/250毫升,三角瓶,3毫升试管0.07兆帕高压
灭菌30分钟)。
LB固体培养基:
LB液体培养基加入1.6%琼脂粉即可。(分装50毫升/250毫升,三角瓶,加入8克琼脂粉0.07兆帕高压灭菌30分钟)。
1mol/l氯化钙(称取1.1克无水氯化钙,溶于90毫升蒸馏水,定容100毫升,装在250毫升三角瓶,0.07兆帕高压灭菌30分钟,4摄氏度保存)。
从-70摄氏度冰箱中取出感受态细胞,放入冰水中融化,放置大约10分钟。