胃癌转移相关基因谱及其差异性表达的研究进展
NLK基因表达与胃癌转移及相关机制的研究的开题报告
NLK基因表达与胃癌转移及相关机制的研究的开题报告【摘要】NLK基因是近年来发现的一种WNT信号通路中极为关键的抑制性因子,其参与了多种生命过程,并对于许多癌症的发生发展发挥着重要作用。
然而,关于NLK在胃癌转移和相关机制的研究目前还很有限。
本文将探讨NLK在胃癌转移中的作用及其潜在机制,为进一步研究胃癌的发生与发展提供新的思路。
【研究背景】胃癌是一种常见的恶性肿瘤,尤其是在亚洲地区。
随着人们生活方式和饮食结构的改变,胃癌的发病率有逐年上升的趋势。
胃癌发生和发展的机制非常复杂,多种分子在其中发挥作用。
WNT信号通路是一个参与多种生物学过程的信号通路,它在胃癌的发生发展中起到了重要作用。
NLK基因是WNT信号通路中的一个抑制因子,可以调节细胞增殖、分化和凋亡,同时还能调控轴突和突触的形成和重塑。
近年的研究表明,NLK在多种癌症中具有抑制作用。
但关于NLK在胃癌转移和相关机制的研究还很有限。
因此,本研究旨在探究NLK在胃癌发生和发展中的作用及其潜在机制。
【研究内容】1. NLK在胃癌组织中的表达水平通过收集胃癌组织和正常组织,检测NLK基因在这两种组织中的表达水平。
通过实验比较分析其表达水平的差异,并进一步验证该基因在胃癌发生和发展中的作用。
2. NLK在胃癌细胞中的调控作用通过建立胃癌细胞系,观察NLK基因沉默或过表达对其增殖、分化、凋亡等生物学过程的影响。
同时还将探究NLK基因对胃癌细胞迁移和转移的影响。
3. NLK与WNT信号通路在胃癌发生发展中的相互作用通过检测WNT信号通路在胃癌组织或细胞中的表达情况,进一步探究NLK在WNT信号通路中的作用。
通过介导WNT信号通路中的其他分子,进一步构建信号通路网络图谱,探究其对胃癌的影响及可能的机制。
【研究意义】本研究将探讨NLK在胃癌中的作用及其潜在机制,为进一步研究胃癌的发生和发展提供新的思路。
同时,本研究结果还可能为临床治疗提供新的靶点及参考。
胃腺癌预后基因的筛选和分析
胃腺癌预后基因的筛选和分析高丽娟;曹夏【摘要】目的通过对TCGA数据库中胃腺癌测序数据进行分析,找出预后相关的基因.方法通过R语言edgeR包筛选差异基因(FC>2,P<0.05),经DAVID在线软件对差异基因进行GO和pathway富集分析后(FDR<0.01),利用R语言sur-vival包对预后相关基因进行Cox回归分析,筛选出与预后相关的基因,结合Oncomine数据库将这些基因与其他胃癌研究中的表达情况进行结果比较.结果得到1634个差异基因,其中上调差异基因857个,下调差异基因777个,GO分析发现差异基因主要集中于消化吸收(GO:0007586),细胞外基质蛋白(GO:0005578),激素活性(GO:0005179),角质化包膜(GO:0001533),结构分子活性(GO:0005198),表皮发育(GO:0008544),蛋白质水解(GO:0006508),肽交联(GO:0018149)等生物过程,Pathway分析差异基因主要涉及细胞色素P450对有害物质的代谢(hsa00980),化学致癌(hsa05204),脂肪消化与吸收(hsa04975),甾类激素的生物合成(hsa00140),蛋白质的消化与吸收(hsa04974)等生物通路,通过Cox生存分析发现ATAD2和SERPINE1的高表达对患者的预后有显著影响.结论通过对TCGA数据库中胃腺癌的表达数据分析研究,选出两个与该疾病预后密切相关的基因ATAD2和SERPINE1,为该疾病的早期诊断治疗和靶向药物的开发提供重要理论依据.【期刊名称】《山西医科大学学报》【年(卷),期】2018(049)005【总页数】6页(P476-481)【关键词】TCGA数据库;胃腺癌;R语言;三磷酸腺苷酶家族蛋白2;纤溶酶原激活物抑制因子1【作者】高丽娟;曹夏【作者单位】山西医科大学生理学系,太原 030001;山西医科大学细胞生理学教育部重点实验室;山西医科大学基础医学院【正文语种】中文【中图分类】R735.2胃癌(gastric cancer,GC)是全球高发恶性肿瘤之一[1]。
基因芯片在胃癌基因表达谱中的应用
过程, 涉及 大量肿瘤相关基 因结构 改变与表 达异常 。基 因芯片 芯片 ,筛选 出 16 8 个与癌变相关 的基 因,其 中包括原癌基 因和抑 技术 以其快速 、 确 、 准 高通量地 分析数 以万计 的基 因表达谱 , 发 癌基 因, N X 、N 3 M P1 以及其它类基因 , 如 N 3 3、 R -, 如免疫相关的 现差异 表达基因 的优 势 , 显示 了其在肿 瘤等生物 医学领域 的应 f r et 、细胞凋亡相关 的 C -0 。在分析 胃癌 和正常组织的 i o cn bn i L2 等
胃癌在我 国发病 率较高 , 消化道恶性 肿瘤 的首位 。明确 居 其病 因与发病机 制 、 找早期诊断 及有效药 物靶点 的手 段显得 寻
2 基 因芯 片技术 在 胃癌基 因表 达谱 中的应 用
2 1 胃癌发生相关基因 胃癌的发生是一个复杂的过程 , . 尤 为重要 。目前研 究认为 , 胃癌是 一个复杂 的多 因素 、 阶段 的 众多 的基 因参与其中。有学者利用含 844个基 因 c N 多 6 D A片段的
.
7和钙粘蛋 白等多种基 因的表达发生显著变化 , 这为更精确地研
焦荧光检测系统等进行扫描 , 通过计 算机 分析 系统对每一探针上 究肿瘤发展和转移提供了信息 】研究显示癌旁黏膜在基 因表达 。
的荧光信号作出比较和检测 , 从而迅速获得所要 的信息 。基 因芯 水平上 13 4 个基因与 胃癌表达的基 因相同 , 提示这些基因可能与 片的杂交条件有赖于探针的长度 、G C碱基含 量及 芯片类型 的优 早期 胃癌变 的启动和演化 有关 】 ,便于 胃癌 的早期发现 与诊
速、 准确 、 高通量检测基因表达谱 的优点 , 现将该 技术应用 于胃癌发生 、 发展以及 治疗过程 中基 因表达谱 的研究进展作一综述。 【 关键字】基因芯片;胃癌 ;基 因;基因表达谱 ;
生物信息学分析PDGFRB在胃癌中的表达及其临床意义
1.1数据下载与整理TCGA是美国国家癌症研究 所(National Cancer 1nstitute)和美国人类基因组研究 所( National Human Genome Research 1nstitute ) 共同 监督的一个项目,目前已经收录了 60多种的肿瘤类 型。本研究从TCGA数据库中下载RNA-seq数据 和临床数据(https:///),包括正常胃 粘膜上皮样本32例及胃癌患者样本375例。利用 Perl软件进行基因1D的转换和临床数据信息的提 取,构建基因表达矩阵,随后采用R语言根据log (FC)>1,FDR<0.05['0]的筛选标准初步筛选胃癌组 织中的差异表达基因,并对差异基因进行热图和火 山图的绘制。 1.2目的基因的「选 为研究差异表达的基因对 胃癌患者的影响,对表达上调的差异基因进一步筛 选分析,设置筛选标准:log(FC) >1.3,6<logCPM<7, P<0.05[''],获得的候选基因采用R语言中的DESeq 程序包分析与生存和临床病理特征相关性,选取相 关性最显著的PDGFRB基因作为目的基因进行进 一步分析。 1.3 PDGFRB :因的差异表达及临床病理特征的 相关性分析 为分析PDGFRB基因表达水平和临 床病理特征的相关性,使用Perl软件将目的基因表 达数据和临床病理数据相结合, 构建成包含目的基 因信息和临床信息的表达矩阵。随后,利用R软件
更是胃癌的高发地区,全球胃癌患者约有42%来自 于中国⑵。近年来,虽通过手术治疗、放化疗、靶向 药物等多种治疗方法,患者生存期延长,生活质量有
基金项目:国家自然科学基金(21707002);安徽省自然科学基金( 1908085MH257);蚌埠医学院转化医学重点专项(BYTM2019008) 作者简介:苏旭( 1996-),男,硕士研究生,研究方向:消化道肿瘤发生发展的表观遗传学机制。 通讯作者:吴华彰,E-mail:whzhang1025@ o
基于杂交的基因差异表达技术在人胃癌研究中的应用
陈 怡 姒 健 敏
摘 要 寻找 胃癌 与正 常 胃黏膜 及癌 旁组 织 的差 异基 因对全 面 阐明 胃癌发 生发 展 及 转移 的分 子机 制 具 有重要 意 义。 目前 , 于杂 交的基 因差 异表 达分析技 术 已广泛 用 于 寻找 疾病 以及 细 胞 生 长发 育 不 同阶段 的 基 相 关基 因。此文 就基 于杂 交的基 因差异 表达技 术 的原理 、 点 以及在人 胃癌研 究 中的应 用作一 综述 。 特 关 键词 基 因差异 表达 ; 制 消减 杂 交;D 抑 c NA 微 阵列 ; 胃癌
表性差 异分析 ( A) ; 2 基 于测 序 的差 异表 达 RD 等 ( ) 技术, 主要包 括基 因表达 系列 分 析 ( AGE)表 达序 s 、
列 标签 ( S E T)等 ;3 基 于杂交 的差 异表 达技术 , H)和 c NA 微 阵列 D ( DNA Mirasy co sa )或 D NA 芯 片 等 。 目前 在 胃癌 研究 中基 于 杂 交 的差 异 表 达 技 术 应 用 最 为 广 泛 。 本 文就 S H 和 c NA 微 阵列 的 原 理 、 点 以 及 在 S D 特 胃癌研究 中的应 用作 一综 述 。 1 抑制 消减杂 交技 术
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miRNA-145与胃癌相关性研究进展
miRNA-145与胃癌相关性研究进展
范军杰;席雨(综述);董永红(审校)
【期刊名称】《疑难病杂志》
【年(卷),期】2024(23)5
【摘要】胃癌是严重威胁人类生命健康的消化道恶性肿瘤之一,探索其发生发展机制具有重要意义。
大量研究表明,microRNA(miRNAs)在多种癌症的生长、侵袭、转移、化疗耐药、诊断及预后中扮演重要角色。
其中,miR-145及其所编码的
miR-145-5p通过调节靶基因或信号传导参与胃癌的生物学过程,包括增殖、凋亡、迁移、侵袭、血管生成和治疗抗性等。
文章对miR-145在胃癌中的作用及与其相关的治疗和化疗耐药进行综述,以期为胃癌的治疗提供新的思路。
【总页数】4页(P631-634)
【作者】范军杰;席雨(综述);董永红(审校)
【作者单位】山西医科大学第五临床医学院胃肠胰及疝与腹壁外科;山西中医药大
学第一临床学院
【正文语种】中文
【中图分类】R735.2
【相关文献】
1.miRNA-145与肿瘤的相关性研究进展
2.微卫星不稳定相关性胃癌、胃癌前病变及其有关基因的研究进展
3.EB病毒相关性胃癌的特征及免疫治疗的研究进展
4.口
腔菌群与胃癌相关性的研究进展5.炎症应答和胰岛素抵抗与胃癌患者营养状况的相关性研究进展
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胃癌分子分型研究进展
·综述·胃癌分子分型研究进展刘静文 刘红利 张涛【摘要】 胃癌是发病率及致死率较高的一种恶性肿瘤。
胃癌的病理分型是以组织形态结构和细胞生物学特性为基础,不同类型的胃癌,其形态结构和生物学行为各异,流行病学和分子机制亦不同,以致现有的胃癌病理分型系统众多。
以往常用的病理分型包括Borrmann 分型、Lauren 分型和WHO 分型,已有的这些胃癌分型对临床指导意义有限。
最新的研究对295例胃癌进行综合性分子分析,这是癌症基因组图谱(TCGA )计划工作的一部分,基于对所得数据的分析整合,提出了一种新的胃癌分子分型,将其分为四个亚型:EBV 感染型;微卫星不稳定(MSI )型;基因组稳定(GS )型;染色体不稳定(CIN )型。
该研究于2014年7月23日在《nature 》在线发表,新发现的胃癌分子分型有助于胃癌个体化治疗靶向药物的筛选。
本文将对胃癌的分子分型研究展开综述。
【关键词】 胃肿瘤; 分子分型Research progress of molecular type of gastric cancer Liu Jingwen, Liu Hongli, Zhang Tao. Cancer Center, Union Hospital, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430022, ChinaCorresponding author: Liu Hongli, Email: whliuhongli@【Abstract 】 Gastric cancer is a kind of malignant tumor which has higher incidence and mortality rate. Its pathological type is based on the morphological structure of tissue and cell biological characteristics. Not only morphological structure and biological characteristics but epidemiology and molecular mechanism are also different for each type, which makes so many typing systems come out. Usual pathological types include Borrmann type, Lauren type and WHO type. All these types have limited significance for clinic. The latest research analyzed 295 primary gastric carcinomas at comprehensive molecular stage, which is also a part of TCGA (The Cancer Genome Atlas) project. Ultimately, they put forward a new typing system which divided gastric cancer into four types including tumor positive for Epstein-Barr virus (EBV), microsatellite instable (MSI) tumors, genomically stable (GS) tumors and tumor with chromosomal instability (CIN). The study was published in the ‘nature’ online in July 23, 2014, which contributed to targeted drug screening of individualized treatment of gastric cancer. This paper reviewed the development of gastric cancer molecular type.【Key words 】 Stomach neoplasms; Molecular type1923年德国病理学家Borrmann 提出一种胃癌大体形态分型方法,称为Borrmann 分型。
tcga某个基因差异表达
tcga某个基因差异表达TCGA基因差异表达研究及其在肿瘤疾病中的应用引言:基因差异表达是指在不同组织、细胞或生理状态下,基因表达水平的差异。
TCGA(The Cancer Genome Atlas)项目是一个全球性的癌症基因组研究计划,旨在通过分析多种癌症类型的基因组数据,揭示癌症的发生机制和靶向治疗的潜在靶点。
本文将以TCGA某个基因差异表达为标题,探讨基因差异表达在肿瘤疾病中的应用。
第一节:基因差异表达的意义和方法基因差异表达研究可以帮助我们理解基因与表型之间的关系,揭示不同基因在不同条件下的表达模式,从而为疾病的发生机制和治疗提供重要线索。
常用的基因差异表达分析方法包括RNA测序和芯片技术,通过对样本中的RNA进行定量测量,得到基因的表达水平数据。
第二节:TCGA项目简介TCGA项目是一个多中心的合作研究项目,旨在通过对多种癌症类型的基因组数据进行系统分析,揭示癌症的分子特征和治疗靶点。
该项目利用高通量测序技术和其他生物信息学方法,对数千个癌症样本进行基因组测序,构建了一个庞大的癌症基因组数据库。
第三节:基因差异表达在肿瘤疾病中的应用基因差异表达在肿瘤疾病中有着广泛的应用。
首先,基因差异表达可以帮助我们发现新的肿瘤标志物。
通过比较肿瘤组织和正常组织中的基因表达差异,可以筛选出在肿瘤中高度表达的基因,并进一步验证其作为肿瘤标志物的潜力。
基因差异表达可以帮助我们理解肿瘤发生发展的分子机制。
通过比较不同肿瘤类型或不同分期的肿瘤组织中的基因表达差异,可以揭示不同类型和分期的肿瘤之间的分子差异,从而有助于我们理解肿瘤的发生和发展过程。
基因差异表达可以帮助我们预测肿瘤的预后和治疗反应。
通过分析肿瘤组织中的基因表达差异,可以建立预后模型和治疗响应模型,从而预测患者的生存期和对治疗的反应。
第四节:基因差异表达的挑战和解决方案基因差异表达研究面临着一些挑战,例如样本数量少、数据处理复杂等。
为了克服这些问题,研究者可以通过增加样本数量、使用更加精确的测序技术和开发更加有效的数据处理算法来提高研究的可靠性和准确性。
采用cDNA芯片对人胃腺癌凋亡相关基因表达谱的研究
a s g a s t i r c c a n c e r )d e v e l o p m e n t a n d p og r r e s s i o n . I t i s n e c e s s a r y t o s c r e e n a p o p t o s i s g e n e s r e l a t e d t o g a s t i r c c a n c e r 、 Ai ms :
C o r r e s p o n d i n g a u t h o r : G A O H e n g j u n , N a t i o n a l E n g i n e e i r n g C e n t e r f o r B i o c h i p a t S h a n g h a i , E m a i l :
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采用 c D N A芯片对 人 胃腺癌凋 亡 相关基 因表达谱 的研 究
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MicroRNA 在胃癌中的作用及研究进展
MicroRNA 在胃癌中的作用及研究进展09临八王亚文200900232137 摘要:MicroRNA(miRNA)是一类含有18-25 个核苷酸的小分子非编码RNA,通过与与其靶基因mRNA 3'-非编码区的碱基互补配对,降解靶基因mRNA导致转录后沉默或者抑制靶基因mRNA的翻译过程,影响细胞的增殖、分化、衰老和凋亡。
研究显示部分microRNA 在胃癌组织中确实存在表达异常,且异常表达的microRNA通过对其靶基因表达的调控影响胃癌的发生、发展及转移等过程。
外周血中microRNA检测技术的发展使得microRNA应用于胃癌的临床诊疗具有了一定的可行性。
众多研究提示microRNA在胃癌的演进中的作用可能作为胃癌早期诊断和疗效预测的生物标记物,本文就microRNA在胃癌中的作用及研究进展作一综述。
关键词:胃癌;microRNA;机制;早期诊断;预后预测前言:MicroRNA(miRNA,miR)是最初于1993 年由LEE 等在秀丽线虫中发现的一类含有18-25 个核苷酸的非编码小分子单链RNA,随后研究发现其广泛存在于真核细胞生物中[1]。
miR-NA 虽然不能编码蛋白,但是能够通过与其靶基因mRNA 3’-非编码区(3'-untranslationalregion, 3'-UTR)的碱基互补配对,降解靶基因mRNA 导致转录后沉默或者抑制靶基因mRNA 的翻译过程,影响细胞的增殖、分化、衰老和凋亡等过程。
miRNA 在肿瘤中异常表达及其功能的研究是近年来的热点。
越来越多的证据显示miRNA 在胃癌的发生、发展中发挥重要作用[2-4]。
胃癌是消化道中最常见的恶性肿瘤,深入地探讨其发病机制对于其预防、治疗及提高生存率有着非常重要的意义。
本文就miRNA 在胃癌中的作用及研究进展作一综述。
1. miRNA的生物合成机制与作用机制miRNA 根据编码基因蛋白的基因区域进行转录,合成原始转录本(pri-miRNA);RNA polymerase II 和RNA polymeraseIII 催化转录pri-miRNA;pri-miRNA 在细胞核中Drosha 的作用下,产生大约70nt 大小的发夹状pre-miRNA;生成的pre-miRNA 在核转运受体Exportin-5 的作用下,通过Ran-GTP依赖方式转运到细胞浆中;在Dicer 的作用下, 胞浆中的pre-miRNA 被剪切成不完整的双链RNA (dsRNA);dsRNA 中的一条链选择性的转运到miRNA 核蛋白复合体上,并与mRNA 3'-UTR 结合,另一条链发生降解。
癌症基因表达
癌症基因表达癌症是一类严重威胁人类健康的疾病,其发生和发展过程受到基因表达的调控。
基因表达是指基因转录生成mRNA,通过翻译形成蛋白质的过程。
在正常情况下,细胞的基因表达受到严格调控,以维持细胞的正常功能。
然而,当某些基因的表达异常时,会导致细胞失去正常调控,进而发展成癌症。
本文将深入探讨癌症基因表达的相关机制及其研究进展。
一、癌症基因的异常表达1. 癌基因的异常表达癌基因在正常细胞中也存在,但它们受到严格调控以保持细胞正常运行。
当这些癌基因发生异常表达时,会导致细胞的增殖和生存功能紊乱,从而为癌症的形成提供了条件。
常见的癌基因包括p53、RAS 和BRCA等。
2. 抑癌基因的异常表达抑癌基因是一类能够抑制细胞增殖和促进细胞凋亡的基因。
当抑癌基因的表达发生异常时,细胞的增殖受到限制,同时凋亡过程受到抑制,从而导致癌细胞的无限增殖。
常见的抑癌基因包括TP53、BRCA1和BRCA2等。
二、癌症基因表达的调控机制1. 转录调控转录调控是指通过转录因子在转录过程中对基因表达进行调控。
转录因子可以结合到基因的启动子或增强子上,促进或抑制基因的转录。
一些转录因子在癌症中被发现发生突变或异常表达,从而导致相关基因的表达紊乱。
2. 表观遗传调控表观遗传调控是指通过DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA等方式对基因表达进行调控。
DNA甲基化是最常见的表观遗传调控方式,当DNA发生异常甲基化时,会导致相关基因的表达紊乱。
在癌症中,DNA甲基化异常常见,从而导致癌基因或抑癌基因的表达紊乱。
三、癌症基因表达的研究进展1. 基因表达组学基因表达组学是研究基因表达谱的学科,可以通过高通量测序技术获得数以万计的基因表达数据。
通过比较正常细胞和癌细胞的基因表达谱,可以筛选出与癌症相关的基因。
基因表达组学为癌症的早期诊断和治疗提供了重要的依据。
2. 靶向基因治疗靶向基因治疗是利用基因工程技术干预癌细胞的基因表达,从而实现治疗效果。
2021胃癌相关基因及靶向治疗的研究进展(全文)
2021胃癌相关基因及靶向治疗的研究进展(全文)据统计,胃癌居全球恶性肿瘤发病率的第五位,死亡率居第三位,在亚洲胃癌死亡率仅次于肺癌。
我国为胃癌高发国家,世界卫生组织统计显示,2018年全球胃癌的发病例数已超103万,我国占44%;总死亡人数逾78万,约一半为中国人。
近年来胃癌的发病率逐年升高,社会负担和卫生经济支出负担也随之加重。
手术结合放化疗是目前治疗胃癌的主要方法,但因胃癌早期症状隐匿,确诊时多处于中晚期,5年生存率仍不足20%。
对化疗药物的普遍耐药也是导致疗效欠佳的主要原因之一。
精准医疗是肿瘤诊断和治疗的一种新模式,已被广泛应用于医学的各个领域。
目前基于基因的靶向治疗应用逐渐增多,致癌、抑癌基因在胃癌的靶向治疗中发挥着重要作用。
现就当前胃癌致癌和抑癌基因的国内外研究现状进行总结,便于进一步探索胃癌的有效靶向治疗方法。
01胃癌中关键致癌基因及其靶向治疗1.1人表皮生长因子受体(HER)-2HER-2定位于17q21,突变率为6.1%~23.0%。
HER-2的表达升高可激活下游信号通路磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(PKB/Akt)/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)和促分裂原活化的蛋白激酶(MAPK)途径,抑制肿瘤细胞凋亡、促进肿瘤血管再生、增强肿瘤细胞的侵袭力。
临床研究显示,HER-2在发生远处转移、Lauren 分型为肠型以及中高分化的胃腺癌患者中阳性率更高,与患者的年龄、肿瘤大小及位置无关。
HER-2是受体酪氨酸激酶家族的重要成员之一,而酪氨酸激酶抑制剂在胃癌个体化治疗中有重要作用,可能是胃癌靶向治疗中潜力较大的靶向基因之一。
曲妥珠单抗是目前针对HER-2阳性胃癌患者的靶向药物,旨在干扰HER-2调控的信号通路,介导免疫反应,抑制血管生成和肿瘤细胞增殖力。
应用曲妥珠单抗后HER-2表达明显降低,但HER-2阳性细胞不能完全消失,因此不能彻底根除肿瘤。
为提高治疗效果,有学者采用曲妥珠单抗与化疗方案联合的治疗方式,结果显示,曲妥珠单抗与伊立替康+顺铂方案联合可降低糖类抗原125、癌胚抗原和特异性组织多肽抗原的水平;曲妥珠单抗联合多西他赛+替吉奥胶囊方案可降低血清糖类抗原724、糖类抗原199、癌胚抗原的水平;曲妥珠单抗联合奥沙利铂+亚叶酸钙+5-氟尿嘧啶方案可明显提高行为状态评分,并增强近期化疗的疗效。
胃癌转移的免疫分子和基因研究进展
胃癌转移的免疫分子和基因研究进展
袭燕;段瑞生;宋伟;王建文;张瑞兰
【期刊名称】《肿瘤防治杂志》
【年(卷),期】2002(9)6
【摘要】近年来肿瘤免疫学的研究发展较快。
综述了有关胃癌浸润转移的免疫分子和基因的研究现状 ,提出了新的免疫学诊断指标在预测肿瘤转移方面的应用。
【总页数】4页(P649-652)
【关键词】胃癌转移;免疫分子;基因;研究进展;胃肿瘤;肿瘤浸润;肿瘤转移
【作者】袭燕;段瑞生;宋伟;王建文;张瑞兰
【作者单位】山东省千佛山医院;山东省千佛山医院老年病科;山东省立医院肿瘤中心
【正文语种】中文
【中图分类】R735.2
【相关文献】
1.胃癌浸润、转移的免疫分子学诊断指标的研究进展 [J], 姜俊;刘长顺
2.胃癌侵袭转移相关免疫分子和基因的研究进展 [J], 孙薇;周晓军
3.腹腔镜微创远端胃癌D2根治术治疗老年胃癌的效果及其对免疫功能、低氧诱导因子-1α和结肠癌转移相关基因1表达的影响 [J], 汪昱;游红勇;刘东涛;陈智敏;赵昕波;李海;孙坤
4.驱动基因阴性晚期非小细胞肺癌脑转移免疫微环境及免疫治疗的研究进展 [J],
吴寅飞;周娟;叶伶云;苏春霞
5.免疫分子与胃癌侵袭转移的关系 [J], 刘霞;王承党
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基因表达差异与肿瘤发生的关系分析
基因表达差异与肿瘤发生的关系分析在生物学研究领域中,基因表达差异是一个备受各界关注的问题。
基因表达变异可以用来判断身体的全面功能或特定疾病的预后。
由于这种差异与许多疾病的病因相关,其中之一便是肿瘤的发生。
本文将探讨基因表达差异与肿瘤发生的关系,并讨论如何使用这种差异来提高肿瘤预防和治疗的效果。
一、基因表达差异的来源基因表达是指基因转录为RNA,这些RNA在翻译中转化为蛋白质,成为生命过程中的关键分子。
在成年人体内,有超过2万个基因用于编制RNA,为人类提供了旨在满足不同生物学需求的巨大的潜力。
虽然所有个体的细胞应遵循相同的基因组DNA ,但对这些基因的表达却存在差异。
这些差异来源于遗传变异、环境暴露和生活方式等,而不同基因的表达变异可能是生理功能的主要驱动力。
二、基因表达差异如何导致肿瘤发生肿瘤细胞是一种生长无节制的细胞,它们可以通过与常规细胞的行为和生命历程的不同之处来识别。
肿瘤细胞的起源通常可以与对基因表达的改变联系起来,因此使得细胞在原本认为最常见的分子缺陷、信号传导变异和细胞周期失调中产生了各种不同程度的生命活动反应。
当细胞表达某些特定基因时,就会产生或消除基因编码蛋白对不同细胞功能的影响。
肿瘤细胞的连接点、细胞周期调节和凋亡调节等过程会与正常细胞不同,而这些过程与基因表达差异有直接关联。
在某些情况下,基因表达的恶化可能是肿瘤细胞的直接根源,而在其他情况下,是肿瘤形成的结果。
三、使用基因表达差异潜力提高肿瘤预防和治疗的效果在临床实践中,基因表达差异可以作为肿瘤发展预测和治疗响应判断的强有力工具。
通过对某些基因表达的度量,医师可以设计出更为精准的治疗方案,同时监测肿瘤在治疗过程中的进展情况。
最近在肿瘤诊断和治疗中出现过一种新方法,即基于RNA的肿瘤治疗。
这种技术可以将肿瘤细胞的RNA序列与健康人的RNA序列进行比较,检测基因表达的差异并检测基因的异常变异,以此确定是否有肿瘤细胞存在。
除此之外,通常基于机器学习和大数据技术的药物研制和疾病治疗也在逐渐流行。
microRNA与胃癌关系的研究进展
microRNA与胃癌关系的研究进展作者:覃新干来源:《中国保健营养·中旬刊》2013年第07期胃癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一,发病率位居第4位,而在中国胃癌发病率更高,仅次于肺癌,位居第二,然而,目前对进展期胃癌治疗的疗效仍没有显著改善,而且临床上早期胃癌症状不典型,就诊时往往已是进展期。
因此,如何提高早期诊断水平,复发早期的及时发现及提高治疗效果成为提高胃癌患者治疗水平的关键。
近年来,以 microRNA 为基础的癌症诊断与治疗备受关注,取得了很大的进展。
本文就microRNA 与胃癌关系的研究进展做一综述,供临床参考。
1 MicroRNA概述MicroRNA(miRNA)是一类长度约为22个左右核苷酸的内源性非编码子单链RNA,具有高度遗传稳定性。
初始的miRNA转录产物由核糖核酸酶 Drosha和 Dicer1剪接后形成成熟的miRNA,后者主要通过与目的基因mRNA的3'非翻译区结合,使 mRNA 降解或抑制其翻译,从而发挥基因调节作用,调节RNA稳定和基因表达。
miRNA对约30%人类蛋白的表达具有调节作用。
miRNA通过转录后水平调节基因的表达而参与调控一列生命活动,包括参与调控细胞增殖,分化,生长,凋亡,代谢等功能;参与肿瘤发生,发展,转移的各个阶段。
microRNA 在不同组织中,癌症发展的不同时期,其表达水平也不同[1]。
2 MicroRNA的研究方法[2]:( 1)鉴定 miRNA:包括小分子 RNA直接克隆鉴定,miRNA 芯片分析和生物信息学预测的方法。
( 2)检测 miRNA 的表达水平:主要包括芯片技术( microarray)、RT-PCR( real time RT-PCR、Stem loop RT-PCR)、RNA 印记杂交( Northern blot)、核糖核酸酶保护实验( RPA)、磁珠流式检测( Bead-based flow cytometric assay)、寡核苷酸为基础的原位杂交( LNA-based ISH)。
胃癌诊断生物学标志物的研究进展
·综述·胃癌诊断生物学标志物的研究进展孟文婷王蔚虹*北京大学第一医院消化内科(100034)摘要早期诊断和治疗对提高胃癌患者的生存率至关重要,但目前胃癌诊断仍依赖胃镜检查,该检查方式有创、费用较高,很难在大规模无症状人群中筛查和普及。
因此,探索无创筛查方式对早期发现胃癌至关重要。
本文概述了胃癌相关生物学标志物的前沿研究,以期早期发现胃癌,提高胃癌患者的生存率。
关键词胃肿瘤;筛查;诊断;生物学标志物Advances in Research on Biomarkers of Gastric Cancer MENG Wenting,WANG Weihong.Department ofGastroenterology,Peking University First Hospital,Beijing (100034)Correspondence to:WANG Weihong,Email:***********************AbstractEarly diagnosis and treatment of gastric cancer may improve the prognosis of the disease.At present,thediagnosis of gastric cancer depends on gastric endoscopy and histopathology,which is invasive and expensive and not suitable for screening in the large population.Non⁃invasive screening method is essential for the early detection of cancer.This article reviewed the advances in research on related biomarkers of gastric cancer so as to increase the early detection of gastric cancer and survival rate of patients.Key wordsStomach Neoplasms;Screening;Diagnosis;BiomarkersDOI :10.3969/j.issn.1008⁃7125.2023.02.007*本文通信作者,Email:***********************胃癌是目前世界上发病率较高的肿瘤之一,2020年全球胃癌新确诊病例数>100万例[1],其中中国胃癌发病例数约占世界病例数的50%[2],而胃癌预后与治疗时机息息相关,早期诊断和治疗对提高胃癌患者的生存率至关重要。
FABP1在胃癌中的研究进展
・234・盒uWiOR F M's"#f2021‘a pr40(2):234一237•综述・FABP1在胃癌中的研究进展范海华,刘燕文(东南大学医学院,江苏南京210009"&摘要]胃癌位居国内消化道恶性肿瘤死亡率首位,60%晚期胃癌患者主要因转移至肝脏和腹膜死亡,目前需要早期诊断以降低死亡率,而临床常用的诊断标志物癌胚抗原(CEA f敏感度、特异性不高,且存在假阴性。
因此,我们需要寻找其他标志物以提高胃癌诊断准确性。
胃癌是一类代谢异常的疾病,其发生和转移与脂质异常代谢密切相关。
研究人员已经在多种恶性肿瘤中发现血清肝型脂肪酸结合蛋白(FABP1f水平升高,预示体内脂质异常代谢。
FABP1可能是胃癌诊断和转移潜在的靶点。
作者对FABP1在胃癌发生及相关转移中的表达和作用机制作一综述。
&关键词]肝型脂肪酸结合蛋白;胃癌;肝转移;腹膜转移;脂质代谢;综述&中图分类号]R735.2&文献标志码]A&文章编号]1671-6264(2021)02-0234-04doR10.3969/j.Rsn.1671-6264.2021.02.017胃癌是癌症相关死亡的第3大常见原因,仅次于肺癌和结直肠癌,占全球癌症死亡的8%以上[1]o临床资料显示,60%晚期胃癌患者主要因转移至肝脏和腹膜死亡[2]。
早期诊断是降低胃癌患者死亡率的关键,但目前内镜、影像学、血清标志物的应用仍不尽如人意。
由于内镜医师和病理学医师技能和经验的不同,诊断不一致,可能导致早期漏诊,而影像学检查显示阳性结果时病情可能已进入晚期。
目前临床用于检测胃癌的血清标志物主要为癌胚抗原(CEA f*糖类抗原19-9(CA19-9)、CA72-4[3],这些指标阳性的患者总生存率低,CEA阳性与肝转移有关,CA19-9、CA724阳性与肝转移、腹膜转移有关⑷。
但是,检测CEA、CA19-9和CA72-4对胃癌诊断的敏感度和特异性均不高&5',且CEA、CA19-9和CA72-4在有些胃癌中不表达或者表达较少,会产生假阴性,不能帮助早期发现胃癌。
结合激光微切割与cDNA芯片技术筛选胃癌进展过程中差异表达的基因
达最高 , 肿瘤 原发灶次之 , 巴结转移灶 表达最低 ; 另一个基 因( K 1 的表 达规律则 与癌基 因相似 。 结论 : 淋 而 AC) 采 用L MD和基 因芯 片技 术 , 成功筛选 出 胃癌进展过 程中的差异表达基因 , 为进 一步研究 胃癌发 生和转移 的机制奠 定
了 良好 的基 础 。 关键词 : 激光微切割 ; 基 因芯片 ; 胃癌 中 图分 类 号 : R 3 . 752 文献标识码 : A
t e c r i o y c mp rn h e e e p e so s i o ma in n a ti p t la,p ma y c n e n l i a cn ma b o ai g t e g n x r s in n n n- l a t g rc e i i g s he i r r a c r a d
Z A G Xa・i, I i g , U i a , igyn , N Q a Z A G L- a , I udn H N i q L a 2 S N X - i WU Ln-u WE u , H N i u 4 Q U Y -og , o Qn t n h
(. 1南京 大 学 医学 院附属鼓 楼 医 院消 化 科 , 苏南 京 20 0 ; . 京 大 学 医 学 院 附属 鼓 楼 医院 肝 江 10 8 2 南 胆研究 所 , 江苏 南 京 200 ;3 南 京 大 学 生 命 科 学 院 生 物 医 药 技 术 国 家 重 点 实 验 室 , 苏南 京 10 8 . 江 20 9 ; . 10 3 4 南京 大学 医学 院 附属鼓 楼 医院病 理科 , 江苏南 京 20 0 ) 108
ZOU a - ig ,XU h o mi Xio pn Z a - n ,CHEN o g da YU e g g n ,ZHANG n y e L n - in , Ch n -o g Mi - u ,DI NG -a Yito
胃癌患者原癌基因和抑癌基因的表达谱研究
胃癌患者原癌基因和抑癌基因的表达谱研究马万山;李晓冰;汪运山【期刊名称】《肿瘤防治杂志》【年(卷),期】2002(9)4【摘要】目的 :用基因表达谱芯片对人正常胃和胃癌组织原癌和抑癌基因表达的差异进行研究比较。
方法 :利用胃和胃癌组织的mRNA通过逆转录方法 ,将Cy3和Cy5 2种荧光分别标记到 2组cDNA上制成探针 ,然后和表达谱芯片进行杂交后扫描 ,通过计算机分析判定 2种基因是否在上述组织中存在差异表达。
结果 :在 195条原癌及抑癌基因中 ,存在差异表达的共 13条 ,表达上调的 6条 (0 0 71% ) ,表达下调的 7条 (0 0 83% )。
结论 :认为应用这种方法识别出的【总页数】3页(P379-381)【关键词】胃癌;原癌基因;抑癌基因;表达谱;研究【作者】马万山;李晓冰;汪运山【作者单位】山东省千佛山医院检验科;山东省医学科学院基础所;济南市中心医院中心实验室【正文语种】中文【中图分类】R735.202【相关文献】1.衰老过程中原癌基因及抑癌基因的表达谱 [J], 韩晓琳;张宗玉;童坦君2.顺铂为基础的同步放化疗对晚期宫颈癌患者恶性程度及原癌基因、抑癌基因表达的影响 [J], 贾瑞娟;张洋;董巨浪;魏君3.自发性高血压大鼠颈动脉血管平滑肌中抑癌基因P53和原癌基因c-jun、c-fos、c-myc mRNA表达的研究 [J], 刘洪;向前;祝平菊;孙明;尹卫东;刘英山4.关于宫颈癌前病变组织中高危型HPV感染与原癌基因、抑癌基因表达的相关性研究 [J], 闫欢5.用cDNA表达阵谱分析原癌基因和抑癌基因在胃癌中的表达 [J], 孙玉萍;马万山;汪运山因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
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胃癌转移相关基因谱及其差异性表达的研究进展胃癌是一种严重威胁人类健康的消化道恶性肿瘤。
肿瘤的侵袭转移是恶性肿瘤患者死亡的主要原因。
胃癌侵袭转移过程中涉及许多特殊基因,包括促进转移的转移促进基因和控制转移的转移抑制基因。
转移促进基因有:细胞粘附分子基因、基质金属蛋白酶基因、肝素酶基因等;转移抑制基因有:nm23、组织基质金属蛋白酶抑制因子基因、乳腺癌转移抑制基因等。
本文对胃癌侵袭转移相关基因谱及其在胃癌中的差异性表达以及其产物在侵袭转移过程中作用的研究进展作一综述。
标签:胃癌;胃癌转移相关基因;转移促进基因;转移抑制基因;表达胃癌是源自胃肠道黏膜上皮的恶性肿瘤,是威胁人类健康的常见疾病,目前其发病率及病死率分别居消化道恶性肿瘤第2位及第3位[1]。
肿瘤的发生与癌基因的激活和抑癌基因的失活密切相关,肿瘤的侵袭转移和肿瘤转移促进基因、肿瘤转移抑制基因、肿瘤蛋白亦有密切联系[2]。
寻找及研究胃癌侵袭转移相关基因,及其产物在胃癌侵袭转移过程中的表达变化与功能,可以加深我们对于胃癌侵袭转移调控机制的理解和认识,同时也为胃癌侵袭转移的早期诊断和治疗靶向的发现提供理论基础。
目前胃癌的转移相关基因研究仍是人类攻克胃癌难题的关键,国内外学者对胃癌的基因研究已取得一定成果。
现将近年胃癌转移相关基因谱及其差异性表达的研究进展综述如下。
1胃癌转移促进基因在胃癌中的差异性表达及其产物的作用1.1细胞粘附分子(cell adhesion molecule,CAM)细胞粘附分子(cell adhesion molecule,CAM)是参与细胞与细胞之间及细胞与细胞外基质之间相互作用的分子。
粘附在肿瘤细胞的浸润过程中起着双重作用:一方面肿瘤细胞必须先从其原来粘附的原发灶脱离才能浸润;另一方面,肿瘤细胞又需借粘附才能移动。
已有证据表明,多种细胞粘附分子与肿瘤细胞的侵袭转移行为密切相关。
现将与胃癌侵袭转移相关的粘附分子基因及其产物的结构、功能及其在肿瘤侵袭转移中的作用介绍如下:1.1.1 CD44 人类CD44基因定位于11号染色体短臂p13-14上,将其分为标准型(CD44s)和变异型(CD44v)。
肿瘤侵袭转移主要与CD44v 有关,而与CD44s 相关不明显已经得到广泛认可。
CD44v6阳性表达的部分位于癌细胞的细胞膜,在低分化腺癌伴有印戒细胞癌或单纯性低分化型腺癌组织中阳性表达率高:而在高、中分化型腺癌伴有粘液癌或单纯高、中分化型腺癌的癌组织中CD44v6的表达率低以及表达得强弱不等[3]。
有关研究表明,多种肿瘤的转移行为均与CD44 基因的异常转录有关,CD44s 促进胃癌的浸润和转移[4]。
以上研究结果说明不同结构的CD44v 分子在胃癌侵袭转移的作用及其机制有待于进一步深入研究和论证。
1.1.2选择素家族选择素(Selectin)是一类钙依赖碳水化合物结合蛋白。
选择素家族包括P、E、L-selectin,其配体包括磷酸化或硫酸化的单糖和多糖以及唾液酸化的Sle(x)、Sle(a)及相关的寡聚糖。
近几年的研究提示P-选择素表达与胃癌浸润深度、淋巴转移、TNM分期密切相关。
P-选择素在胃癌组织中的阳性率一般为53.3%,有淋巴结转移者P-选择素阳性表达率一般为70.3%,显著高于无淋巴转移的26.1%;晚期胃癌P-选择素阳性表达率为80%,显著高于早期胃癌的表达率26.7%;P-选择素阳性表达者平均生存期和5年生存率显著低于阴性者[5]。
1.1.3钙粘附素(cadherin)钙黏附素即钙黏蛋白,是一组钙依赖跨膜蛋白,主要介导同种细胞间的粘附反应。
表皮钙黏蛋白(E-cadherin,E-cad)是迄今为止研究的最为广泛的钙粘附素,E-cad分子表达水平降低与肿瘤细胞恶性程度显著相关。
E-cad的低表达与胃癌浸润深度、淋巴结转移、腹膜转移及生存期缩短相关。
一般E-cad表达阳性率约为47%,有淋巴结转移和远处转移者的E-cad 的表达率低于无淋巴结转移和无远处转移者[6]。
Karayiannakis等采用免疫组化的方法证实E-cad蛋白在胃癌细胞中的表达水平可以作为胃癌细胞分化水平的标志物[7]。
但大多数研究均表明,E-cad表达的改变可以作为评估胃癌侵袭转移潜能的一种指标。
1.2基质金属蛋白酶(matrixmetalloproteinase,MMPs)在肿瘤侵袭转移过程中,ECM 的降解是一个极重要的步骤,肿瘤细胞只有通过降解ECM 并使自身穿过ECM 侵入血管及从血管移出,才能到达宿主器官。
E C M 的降解依靠蛋白水解酶,其中最为重要的是基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinase,MMPs)。
与胃癌关系密切的有MMP-2、MMP-9 和MMP-7。
随着多学科综合治疗模最近国内有学者陆续报道,证实MMP-2 和MMP-9 的表达与胃癌新生血管形成有密切联系,能够分泌产生MMP-2 和MMP-9 的胃癌细胞具有较强的侵袭转移能力,从而进一步证实了MMP-2 与MMP-9 在胃癌侵袭转移中起到了重要的促进作用[8]。
1.3肝素酶(heparanase)近年来,随着肝素酶基因得以克隆,相继获得了一些令人振奋的实验结果,肝素酶在肿瘤细胞穿越血管壁、扩散、转移过程中的关键作用逐渐受到人们的广泛关注。
Tang等[9]研究结果表明肝素酶表达水平与胃癌进展呈正相关,肝素酶表达阳性的胃癌患者更易发生侵袭与转移,预后较差。
Takaoka 等[10]报道肝素酶基因的高水平表达可作为胃癌患者预后诊断的指标之一。
任小龙等[11]报道肝素酶与胃癌组织新生血管形成有密切联系,从而证实了肝素酶在胃癌细胞侵袭转移过程中有不可小视的作用。
1.4 snail基因snail基因是研究较多的与肿瘤密切相关的基因之一,snail 在胃癌中发挥癌基因的作用,其mRNA过表达可促进胃癌的发生、浸润和转移。
有实验结果显示:snail mRNA 在不同胃癌细胞系中差异表达,snail 在分化程度越低的胃癌细胞中表达越高,提示snail 在胃癌中发挥癌基因的作用,其mRNA 过表达可促进胃癌的发生、浸润和转移[12]。
2胃癌转移抑制基因在胃癌中的差异性表达及其产物的作用2.1 nm23 现普遍认为nm23 是一种肿瘤转移抑制基因,是第一个被发现的转移抑制基因,在肿瘤细胞的增殖、分化和侵袭转移中起重要作用[13]。
有研究表明,nm23基因的阳性表达率与胃癌的组织学分级、分化程度、淋巴结转移和临床分期等密切相关,提示nm23基因在胃癌的转移瘤形成阶段具有抑制肿瘤转移的作用,并与CD44s的促胃癌转移作用相拮抗[4]。
2.2组织基质金属蛋白酶抑制因子(tissue inhibitorof metalloproteinases,TIMPs)TIMPs 是MMPs的天然抑制剂,已经证实TIMPs能抑制MMPs的所有活性。
TIMP - 1基因作为MMP-9的天然抑制剂,TIMP-1在ECM中与MMP-9之间存在着微妙的平衡关系,在胃癌细胞的移行、侵袭转移及ECM的重建过程中均有着重要的作用[14]。
Yoshikawa等[15]研究发现在伴有癌旁组织浸润及淋巴结转移的患者的标本中,TIMP-1的表达水平显著增加,从而认为TIMP-1的表达可以作为胃癌患者临床预后的一项重要的独立的预测指标。
2.3乳腺癌转移抑制基因(BRMS1)BRMS1 mRNA在胃癌组织中的表达水平与淋巴结转移呈负相关,这提示BRMS1 mRNA的表达下降能够促进胃癌淋巴结的转移,可以作为临床预测胃癌转移的指标之一。
同时发现,BRMS1 mRNA 的表达与胃癌的病理类型和分化程度无关,提示可以将BRMS1 mRNA的表达水平下降作为判断胃癌患者发生转移的新指标,通过治疗前检测BRMS1 mRNA 的表达水平来预测胃癌发生远处转移的可能性,为制定胃癌手术和化疗方案提供指导[16]。
BRMS1基因对胃癌的转移也具有抑制作用,可望成为胃癌转移的分子生物学标志之一。
2.4其他相关抑制基因KISS-1 基因由是发现的一种新的肿瘤转移抑制基因。
大量研究表明,KISS-1基因具有肿瘤转移抑制作用。
但KISS-1 基因与胃癌的侵袭转移相关性研究报道较少,Zheng 等[17]研究表明,KISS-1 基因的低表达与胃癌淋巴结转移有着密切的联系。
NDRG-1 基因又称分化相关基因NDRG-1 ,Jiang 等[18]研究显示NDRG-1 在肿瘤的形成及阻止胃癌细胞的转移和侵袭中具有重要作用。
NDRG1基因可以发展作为胃癌诊断和评估预后的指标,同时可作为胃癌潜在的药物治疗靶标。
3总结与展望总之,胃癌侵袭转移的分子与细胞机制极其复杂。
阐明胃癌细胞侵袭转移的机制,对于胃癌侵袭转移的早期诊断以及找到治疗胃癌的有效途径有着非常重大的意义,对胃癌转移相关基因的研究还不完善。
目前关于胃癌的转移相关基因的研究在今后的一段时间内仍是国内外专家的研究重点,尤其snail基因、KISS-1 基因、NDRG-1 基因等方面更待我们去学习和研究,相信在不远的将来我们将全面了解胃癌转移相关基因,为我们攻克胃癌这一世界难题提供武器。
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