建库流程-------
华大建库流程
华大建库流程详解华大基因（BGI）是全球领先的基因组学研究机构之一，拥有先进的高通量测序平台和丰富的经验，能够为科研机构、医疗机构、农业企业等客户提供高质量的基因组学数据。
华大建库流程是指将样本中的DNA或RNA提取、文库构建、测序和数据分析等步骤串联起来的一系列工作流程。
本文将详细介绍华大建库流程的步骤和流程。
1. 样本提取和质量检测华大建库流程的第一步是从样本中提取DNA或RNA，并进行质量检测。
样本可以是血液、组织、细胞、土壤、水体等。
提取DNA或RNA的方法根据样本的不同而有所区别，常用的方法有酚氯仿法、磁珠法、柱子法等。
提取的DNA或RNA样本需要进行质量检测，包括浓度检测和完整性检测。
常用的测量方法有紫外分光光度法和凝胶电泳法。
2. 文库构建文库构建是华大建库流程的核心步骤，它将提取的DNA或RNA样本转化为可以进行高通量测序的文库。
文库构建的具体步骤如下：2.1 DNA或RNA片段剪切首先，将提取的DNA或RNA样本通过酶切等方法剪切成适当的片段。
DNA片段的长度通常为200-800碱基对，而RNA片段的长度则根据实验的需要而定。
2.2 末端修复和连接将片段的末端进行修复，以使其适合连接测序引物。
修复的方法包括使用聚合酶填充末端和连接适配体。
适配体是一种含有特定序列的DNA片段，它可以与测序引物结合，并提供测序反应所需的序列。
2.3 PCR扩增通过PCR扩增来增加文库的数量。
PCR扩增的条件需要根据实验的要求进行优化，以保证文库的质量和数量。
2.4 文库纯化通过凝胶电泳或磁珠法等方法，将PCR产物中的目标文库分离出来，并去除杂质。
2.5 文库质检对纯化后的文库进行浓度检测和完整性检测，确保文库的质量符合要求。
3. 测序文库构建完成后，下一步是进行测序。
华大基因拥有世界领先的高通量测序平台，可以进行全基因组测序、转录组测序、外显子测序、甲基化测序等多种测序服务。
3.1 测序准备在进行测序之前，需要对文库进行一系列的处理，包括文库放大、文库纯化和文库浓度调整等。
国源软件建库流程
国源软件建库流程Establishing a software library in a company is an essential process. It involves several steps to ensure that the library is well-organized, easy to access, and helpful for the software development team. In China, the process of building a software library, known as "建库流程," is significant for the success of a software company.在公司建立软件库是一个必要的过程。
它涉及几个步骤，以确保库是组织良好的，易于访问的，并且对软件开发团队有所帮助。
在中国，建立软件库的过程被称为“建库流程”，对于软件公司的成功至关重要。
The first step in the software library building process is identifyingthe types of software documents, resources, and tools that need tobe included in the library. This involves understanding the needs of the software development team and determining the types of documents and resources that will be most beneficial for their work.建立软件库的第一步是确定需要包括在库中的软件文档、资源和工具的类型。
这涉及了解软件开发团队的需求，并确定对他们的工作最有益的文档和资源类型。
地理信息数据库建库流程
地理信息数据库建库流程Building a geographical information database is a complex process that requires careful planning and implementation. The first step in creating a geographic information database is to define the purpose and scope of the database. This involves determining the types of data that will be included, such as maps, satellite images, and other geographical information. It is important to clearly define the goals of the database and how it will be used, as this will guide the rest of the process.在建立地理信息数据库时，首先需要定义数据库的目的和范围。
这包括确定要包括在内的数据类型，如地图、卫星影像和其他地理信息。
明确定义数据库的目标和使用方式很重要，因为这将指导接下来的流程。
下一步是收集和organize the data that will be included in the database. This may involve gathering data from various sources, such as government agencies, research institutions, and commercial providers. The data must be organized in a way that is logical and easy to access, so that users can quickly find the information they need.收集和组织将包含在数据库中的数据是下一步。
转换及建库流程
城镇建库流程（CASS数据变换）第一部分：DWG转变SHPDWG变换前注意供给的文件坐标能否为实地坐标，如为图纸坐标应在CASS内先将DWG文件进行坐标变换后再进行下边的操作。
一、将DWG格式的文件变换为MDB格式经过ArcToolsbox------conversiontools------importfromCAD，如以下图1-1图1-1双击‘import fromCAD’，在弹出的对话框中选择需要变换的DWG文件，程序在翻开文件的同一目录下生成同文件名的MDB文件，如图1-2；二、将MDB文件变换为SHP文件1、读出MDB的图形及属性表：经过Arcmap的加载，选择生成的MDB文件，以以下图1-3图1-3双击‘珠宝屯村’文件，出现以下图的几个图层，CADStaging表示图形，其余的几个表为属性表，以以下图1-4图1-4属性表只要共同选择‘Entity’、‘XtrProp’两个表后点击ADD翻开，如图1-5，再次点击加载后，再次双击图形‘CADStaging’选择‘area’、‘line’、‘point’三层，如图1-6；图1-5图1-6图形和属性加载后，在左侧的目录树上能够看到相应的五层数据，如图1-7图1-72、将属性内容挂到相应的点、线、面的图形上；选择‘Point’层上点击右键，选择选择后，弹出以下对话框，选择‘Joins&Relates’，点击‘ADD’，以以下图1-8图1-8在弹出的1-9对话框中，将的钩去掉，再将1：EntID、2：XtrProp、3：EntID选择相应字段，以以下图1-9，点击‘OK’图1-9再次点击图1-8，将的钩去掉，再将1：、2：Entity、3：EntID选择相应字段，以以下图1-10，点击‘OK’图1-10此时‘Point’点图层内加载了此两层‘Entity’、‘XtrProp’的属性信息，如图1-11；图1-11其‘Line’、‘Area’的属性挂也好像‘Point’挂属性操作方式一致。
城镇初始建库流程说明文档
MAPGIS城镇土地调查数据库初始建库流程说明武汉中地数码科技有限公司国土事业部周丹2008年12月目录1、准备工作 (3)2、CASS数据转换 (3)3、内业处理 (8)4、建立城镇土地调查工程 (12)5、数据检查 (17)6、数据入库 (20)1、准备工作（1）数据准备：请准备好*.cas和*.qs数据（2）加密狗准备：请确认加密狗是否包含数据转换功能；（3）软件准备：MAPSUV二调采集系统（简称测图软件）MAPGIS二次土地调查建库系统（简称建库系统）城镇土地调查数据库管理系统（简称管理系统）2、CASS数据转换当数据源是南方CASS数据时，可以利用测图（即mapsuv）软件中转换工具进行转换。
操作步骤如下：（4）登录（5）新建测量工程，如图：（6）选择模板，如图：（7）确定后，进入系统主界面，如图：（8）选择“文件转换”中“转换南方CASS数据”，如图：（9）选择需要转换的*.qs和*.cas文件，选择的模版文件和保存路径，然后点击转换，如图：（10）转换完毕后，系统生成SUV文件，如图：注意：如果发现有个别地物没有转换过来，请检查C:\mapsuv2009\program\ CASSCode.txt文件中的地物编码对照是否正确。
（11）根据模板分层输出数据，如图：系统将自动根据模版中地物编码所在专题进行分层输出，生成mpj工程，如图：注意：如果发现有个别地物没有输出到对应的专题中，请检查测图模板中地物编码设置是否正确；3、内业处理（12）属性结构利用测图模版输出的图形成果数据默认的属性结构基本上是按照城镇二调数据库建库标准建立的，如果有特殊需要添加的字段，可以利用平台的属性库管理模块进行属性结构的添加或修改；对于新建的图形文件，也可以利用“MapGIS二次土地调查建库系统”中的“建立属性结构”功能自动生成属性结构，如图：（13）地类图斑地类图斑文件是一个全覆盖的区文件，可利用已有的线文件（如权属线、水系线、道路线、绿化线等）进行拓扑造区，对于没有封闭的线文件应该事先封闭完整。
发酵菌种：菌种建库流程及管理安全性问题
发酵菌种：菌种建库流程及管理安全性问题1. 菌种建库流程1.1菌种筛选菌种筛选是微生物菌种建库的第一步，其目的是从自然环境、生物体或实验室保存的菌种中，筛选出具有特定生理生化特征或能够合成特定代谢产物的菌株。
这一过程包括样品采集、菌种分离、初筛和复筛等环节。
1. 样品采集：从目标环境（如土壤、水、空气）或目标生物体（如植物、动物）中采集样品。
2. 菌种分离：将采集的样品经过适当的处理（如稀释、培养、纯化），分离得到单一菌株。
3. 初筛：通过生理生化实验，对分离得到的菌株进行初步筛选，以选择具有特定特征的菌株。
4. 复筛：对初筛中具有特定特征的菌株进行进一步的筛选，以确定最佳菌株。
1.2菌种鉴定在筛选出具有特定特征的菌株后，需要对菌种进行鉴定，以确定其分类学地位和生物学特性。
菌种鉴定主要包括形态学鉴定、生理生化鉴定和分子生物学鉴定等方法。
1. 形态学鉴定：观察菌株的形态、大小、结构、染色等特征，以确定其分类学地位。
2. 生理生化鉴定：对菌株进行一系列生理生化实验，如对碳源、氮源的利用，pH、温度等生长条件的适应性，以及代谢产物等的分析，以了解其生物学特性。
3. 分子生物学鉴定：通过基因序列测定、多态性分析等方法，对菌株进行分子水平的鉴定，以更准确地区分不同微生物物种。
1.3基因组测序基因组测序是微生物菌种建库的重要环节，其目的是获得菌株的全部基因组序列，从而为后续的基因组分析提供基础数据。
基因组测序一般采用第二代测序技术（如Illumina HiSeq、MiSeq等）或第三代测序技术（如PacBio RS II等）。
1. 基因组提取：从菌株中提取高质量的基因组DNA。
2. 测序建库：将基因组DNA构建成适合测序的文库。
3. 测序：将文库上机进行高通量测序。
4. 质控：对测序得到的原始数据进行质量控制，去除低质量序列和噪声。
5. 拼接：将高质量的序列拼接成完整的基因组序列。
1.4数据库构建数据库是微生物菌种建库的核心部分，其目的是将菌株的基因组数据存储起来，以便后续的数据分析和挖掘。
扩增子建库流程 -回复
扩增子建库流程-回复扩增子建库流程是一种用于研究DNA序列的技术方法。
通过建立扩增子（Amplified Fragment Length Polymorphism，简称AFLP）的DNA 库，可以对基因组进行快速、高通量的分析。
本文将一步一步地介绍扩增子建库流程。
第一步：样品准备在进行扩增子建库之前，首先需要准备研究对象的样品。
这些样品可以是来自不同生物体的DNA，比如植物、动物或微生物等。
样品的质量和纯度对扩增子建库的成功与否起着至关重要的作用。
因此，在样品准备过程中，需要严格控制DNA的质量，并避免任何污染。
第二步：DNA提取在扩增子建库之前，需要从样品中提取出DNA。
DNA提取是一个关键的步骤，直接影响到后续扩增子建库的质量。
有许多DNA提取方法可供选择，包括CTAB法、酚/氯仿法、商业化DNA提取试剂盒等。
选择合适的DNA提取方法可以根据研究对象的特点以及实验室资源的可用性来决定。
第三步：限制性内切酶剪切DNA扩增子建库的关键步骤是对DNA进行限制性内切酶的剪切。
限制性内切酶可以识别并剪切DNA特定的序列，产生具有不同长度的DNA片段。
在扩增子建库中，通常会使用两种不同的限制性内切酶，如EcoRI和MseI。
这两种酶分别在DNA的指定位置剪切，产生的片段具有特定的序列。
第四步：连接DNA适配器在DNA剪切之后，需要将适配器序列连接到DNA片段的末端。
适配器是一种含有限制性内切酶切位点的DNA片段，用于连接扩增子引物。
适配器连接的目的是引入扩增子引物的结合位点，使得DNA片段可以被特异性扩增。
第五步：选择性扩增DNA片段为了选择性地扩增连接了适配器的DNA片段，需要设计和合成扩增子引物。
扩增子引物是一对特异性引物，其中一个引物与适配器的序列相互匹配，另一个引物与限制性内切酶剪切后的DNA序列相互匹配。
通过PCR反应，特异性扩增连接了适配器的DNA片段，以便进行下一步的分析。
第六步：分离和纯化扩增子扩增子建库之后，需要将反应产物进行分离和纯化。
土地建库流程
土地建库流程第一节关于土地建库的工作内容（一）准备工作1．组织领导2．工具、资料准备3．专业队伍培训4．经费准备（二）外业调查土地利用现状变更调查资料是建立土地利用现状数据库的基础，其成果直接影响到建库质量。
土地行政界线、权属界线的错误会产生土地发证失误，导致土地纠纷，发生民告官的行政诉讼案件；权属代码和权属名称的错误会产生行政区划和权属面积统计不实；地类界线或地类代码的错误会使地类面积统计失真等等。
1、土地行政界线及土地权属界线的核实，包括市界、县区界线、乡镇界线、行政村界线（末级控制区），村集体土地权属界线，国有土地确权界线，村集体使用国有土地界线等。
2、土地利用现状的调查包括查清各类土地利用类型的数量、分布及利用现状、查清每块土地的权属状况。
--农用地利用现状的调查，包括耕地、园地、林地、牧草地及直接用于农业生产的水面。
--建设用地的清查，包括国有建设用地，农村集体建设用地，个体经济建设用地。
--未利用地调查，包括荒草地、盐碱地，天然苇地等。
土地利用现状调查的分类，依据全国土地利用现状调查规程的过渡分类标准，结合本地实际，制定标准。
基本农田的划区定界，根据基本农田规划调整后指标分解的要求，把每一块基本农田的四至落实到实地，并确定保护责任人。
查清每个土地利用图斑的土壤类型、种植作物、灌溉条件、年产量及本村划分的耕地等级，为农用地评等定级准备基础资料。
（三）内业建库1．分幅图矢量化，打印分幅检查图2．检查图的检查修改现状调查草图扫描影像的配准，点、线文件与影像的套合检查，地类图斑的检查、地类码、线状地物注记的检查、图幅接边的检查，线状地物属性转入。
打印着墨图，提供外业检查，内业修改。
行政区划、权属界线的检查修改，拓扑成区，录入区划、权属宗地的属性。
打印分幅权属图，提供外业查错，内业修改。
3．行政、权属界线的检查修改检查行政、权属界线，对以线状地物为界的行权属界线修改为跳线线型，进行图幅接边间接边后，打印透明检查图，提交外业检查，内业修改。
国源农村土地承包经营权建库软件建库流程
经营权建库流程一、创建工程的是PGDB或FGDB。
在工程信息中点击按钮，选择工程存放的位置，输入工程名称。
在参数信息中选择或导入坐标系统，点击按钮，弹出两个选项，选择或者导入。
选择是用户选择系统现有的投影，坐标与CAD保持一致。
或者自己创建一个投影，设定X、Y的容限，分辨率；导入是将现有的数据库的投影和X、Y 容限导入到新建的工程数据库中。
行政区划以列表的形式存在，在列表中包含中国各个地区的县区代码及名称。
比例尺以列表的形式存在，在列表中包含500、1000、2000、5000、10000、50000选项供用户选择。
创建拓扑先不勾选，然后点击“确定”即可。
二、档案入库1.进入建库子系统打开建库子系统，弹出系统登录窗口，点击“登录”即可。
2.参数设置点击“工程管理-参数-参数设置”，弹出“参数设置”窗口。
基础信息在基础信息中，用户可以设置县区简称，合同起止日期，（如果以后有新的承包合同添加时，合同起止日期为以后添加合同的默认起止日期），承包期限，根据合同起止日期的计算结果填写,成果面积单位、面积保留小数位、地块编号显示位数，公示天数。
其中面积单位有三种，公顷、平方米、亩；面积保留位数最多可以保留四位；地块编号可以截取后五位或者全部输出。
档案成果地块输出包含6种地块类型，成果输出时，除归户表外,只输出勾选的地块成果，归户表输出时，勾选的地块为承包地块，未勾选的地块为非承包地块✧承包合同在承包合同里可以选择输出面积是合同面积还是实测面积或者确权面积。
✧申请书在申请书中，用户可以设置制证机关和申请内容。
申请书内容中的县区名称、承包人姓名、面积等内容可以通过系统自动获取，方便用户申请书内容的录入，土地总面积可以选择合同面积、实测面积或者确权面积，申请书序号可以选择是顺序号或是指定位数的顺序号。
✧登记簿、经营权证在登记簿、经营权证中，用户可以设置登记簿中的制证机关、经营权证打印参数和经营权证发证机关。
权证序号选择是顺序号还是指定位数的顺序号，发证、填报日期有两种打印方式。
转座子建库流程及原理-概述说明以及解释
转座子建库流程及原理-概述说明以及解释1.引言1.1 概述转座子建库是一种重要的分子生物学技术，广泛应用于基因组学研究、进化生物学和遗传工程等领域。
通过转座子建库可以快速准确地获取目标DNA序列，并在进一步的研究中发挥重要作用。
转座子是一类能够在基因组中移动和复制的DNA序列，在生物进化过程中起到了重要的作用。
由于转座子的广泛存在和多样性，利用转座子进行建库研究能够有效地捕获和分析基因组中的各种变异和多样性。
转座子建库主要分为两个步骤：设计引物和提取目标DNA。
设计引物是为了选择特定的转座子元件，以便将目标DNA序列与转座子连接起来。
提取目标DNA是为了获取感兴趣的DNA序列，通常采用PCR等技术进行扩增。
转座子建库的原理是基于转座子的特性和作用机制。
转座子能够通过酶的作用在基因组中移动和复制，从而改变基因组结构和功能。
转座子的结构和特点对其移动和复制的方式产生了重要影响，这也是利用转座子进行建库研究的基础。
总结而言，转座子建库是一种重要的技术手段，能够帮助我们深入了解基因组的组成和功能。
通过设计合适的引物和提取目标DNA，我们可以获取到感兴趣的DNA序列，并通过分析转座子的移动和复制机制，揭示转座子在基因组中的作用和影响。
未来的研究方向包括进一步完善转座子建库技术和深入探究转座子的作用机制，以更好地应用于基因组学研究和生物技术开发中。
1.2文章结构文章结构部分的内容可以是以下内容：文章结构部分：本文将围绕转座子建库流程及原理展开讨论，主要分为以下几个部分：引言、正文和结论。
引言部分将对文章的主题进行一个概述，简要介绍转座子建库的相关背景和意义。
接着，将介绍文章的整体结构，明确各个章节的内容和目标。
最后，阐明本文的目的，即期望通过对转座子建库流程和原理的研究，推动相关领域的发展。
正文部分是本文的核心，将重点详细介绍转座子建库流程和原理。
首先，将详解转座子建库流程的各个步骤，包括设计引物和提取目标DNA。
数据建库入库操作流程 -回复
数据建库入库操作流程-回复数据建库是指将原始数据按照一定的规则和格式进行整理，然后将其存储到数据库中的操作过程。
数据建库入库操作流程包括以下几个步骤：数据需求分析、数据库设计、数据库构建、数据整理与转换、数据入库和数据库测试与维护。
以下将详细介绍每一个步骤。
第一步：数据需求分析在进行数据建库操作之前，需要先进行数据需求分析，明确所需数据的类型、来源、格式等，以及数据存储的目的和要求。
通过与数据需求方充分沟通，了解他们对数据的具体要求和使用目的，确定建库的目标。
第二步：数据库设计数据库设计是指根据数据需求分析的结果，设计数据库的结构和关系模型。
在数据库设计中，需要确定数据库中的表结构、字段、索引、关系等，以及表之间的关联关系和约束条件。
设计良好的数据库结构可以提高数据的查询和存储效率。
第三步：数据库构建在数据库设计完成后，需要根据设计结果来创建数据库。
首先，需要选择合适的数据库管理系统（DBMS），如MySQL、Oracle等。
然后，根据数据库设计的结果，在DBMS中创建数据库，并创建相应的表、字段、索引等，确保数据库的基本框架完整。
第四步：数据整理与转换数据整理与转换是将原始数据进行清洗、处理和转换的过程，以符合数据库设计的要求。
这一步包括数据清洗、数据格式转换、数据标准化等工作。
通过数据整理和转换，可以减少数据冗余、统一数据格式，提高数据质量和一致性。
第五步：数据入库数据入库是将经过整理和转换的数据存储到数据库中的过程。
通过使用数据库管理工具，如SQL语言、ETL工具等，将数据按照数据库设计的结构和模型，逐个表的方式导入数据库中。
在数据入库过程中，需要注意数据的完整性、一致性和正确性，进行校验和验证。
第六步：数据库测试与维护数据库测试是为了验证数据库的正确性和性能，包括功能测试、压力测试、容错测试等。
通过数据库测试，可以发现数据库中的问题和潜在风险，并及时进行修复和优化。
数据库维护是指在数据库使用过程中，定期进行备份、恢复、性能优化等工作，以确保数据库的稳定和可靠。
PCR建库流程
Amplicon Seq技术文库制备流程1、amplicon seq引物设计2、第一次PCR2.1 配制PCR反应体系2.2 PCR反应程序设置2.3 PCR产物纯化a、将AMPure XP beads回温至室温，同时PCR反应产物，1000g 离心1分钟b、充分震荡AMPure XP beads 30秒，加入20微升至PCR反应管中，轻轻吹吸10次左右，室温静置5分钟c、将反应管置于磁力板架上2分钟，小心弃去上清液d、加入200微升80%乙醇至每PCR管（操作过程是在磁力板架上），静置30秒后，小心去除上清，重复一次e、室温静置10-15分钟，使酒精充分挥发，加入52.5 微升pH 8.5浓度为10 mM Tris缓冲液（可考虑用DDW代替）f、吹吸数次，静置2分钟，将PCR板放置于磁力板架上，静置2分钟，上清中即PCR产物，转移50微升上清至新的PCR板中3、第二次PCR3.1 配制PCR反应体系3.2 PCR反应程序设置3.3 PCR 产物纯化a 、将AMPure XP beads 回温至室温，同时PCR 反应产物，1000g 离心1分钟b 、充分震荡AMPure XP beads 30秒，加入56微升至PCR 反应管中，轻轻吹吸10次左右，室温静置5分钟c 、将反应管置于磁力板架上2分钟，小心弃去上清液d 、加入200微升80%乙醇至每PCR 管（操作过程是在磁力板架上），静置30秒后，小心去除上清，重复一次e 、室温静置10-15分钟，使酒精充分挥发，加入27.5 微升pH 8.5浓度为10 mM Tris 缓冲液（可考虑用DDW 代替）f 、吹吸数次，静置2分钟，将PCR 板放置于磁力板架上，静置2分钟，上清中即PCR 产物，转移25微升上清至新的PCR 板中 4、文库量化）浓度（）文库片段大小（μ浓度nM 10bp 660g/mol L)(ng/6=⨯⨯如公式所示，pH 8.5浓度为10 mM Tris 缓冲液稀释样品至4nM ，每5微升样品混合在一起。
(完整word版)CRISPR建库流程
(完整word 版)CRISPR 建库流程
两步骤DNA 建库测序方法
第一轮PCR 反应,计算每个样品的基因组DNA 的量,从而达到整个文库300倍的覆盖率，这样，一个样品需要用到200ug 的的DNA （106
个细胞产生6。
6ug 的DNA)。
对于每一个样品，用6—8ug 的基因组DNA 进行25-30个独立的100ul 体系的PCR 反应，之后，把PCR 产胡合并在一个15ml 的离心管里面(～2.5-3ml ）。
第一轮PCR 反应的引物名称为：
lentiCRIPR_F1
lentiCRISPR_RV2
反应体系如下：
第二轮PCR 反应中需要
将Illumina 的接头连接到样品上面，并且加上标签.第二轮PCR 从第一轮PCR 反应中取出2 ul 作为模板，在100ul 的体系中进行反应。
a 。
第二轮PCR 反应的引物包括了用于增加文库复杂性的可变序列和一个6个碱基的DNA 序列。
b 。
PCR 反应条件和第一轮PCR 反应相同，但需要把循环数减少到8-12个。
用2%的琼脂糖凝胶电泳和凝胶纯化试剂盒纯化PCR 产物.为了达到测序需要的DNA 的量，需要用到第二轮PCR 反应中的50ul 的PCR 产物.。
建库流程
Library construction试剂50*TAE 存储液，PH约8.5：242g Tris 碱57.1ml 冰醋酸37.2gNa2EDTA.2H2O加H2O至1000ml1*TAE:200ml 50*TAE加H2O至10000ml乙酸钠，3mol/l存储于4C将40.8gNaAc.3H2O溶于水，用乙酸调至PH5.2补加水至100ml溴化乙锭（EB），10mg/ml在20mlH2O中溶解0.2g溴化乙锭，均匀后于室温避光保存1%盐酸300ml浓盐酸，加H2O至10000ml第一日配胶配置一板1%琼脂糖凝胶超声1、取4-5ug DNA 入1.5mlEpperdorf管中，共4支2、4管DNA分别超声4秒、8秒、14秒、20秒（其中8、14、20秒分多个相同时间段进行，间歇时间为10秒，超声时应将变幅杆居中并伸入液面3mm）3、各取10ul 加入2ul 6*loading buffer，上样电泳（1%琼脂糖凝胶），至溴芬蓝泳动7cm，拍照，观察超声效果，8、14秒超声管的DNA片断量应以1.6-3.0kb处最多，而超声时间4、20秒的DNA片段量应以分别在4-10kb和1-1.6kb处最多4、根据电泳结果，对个别超声效果欠佳的样品要再次超声，具体时间应根据实际效果而定注：请详细填写建库组工作日程表纯化5、每管加1/10体积的3MnaAc和2倍体积预冷无水乙醇，-200C 30min6、离心：13000rpm,10min。
（室温，利于DNA沉淀），去上清7、各管加1ml 70% 乙醇，颠倒数次8、离心：13000rpm,5min9、弃上清，离心机甩一下，吸去上清，置室温15min以使酒精挥发干净10、每管加20ul无菌纯水溶解DNA，收集四管中的样品于一管末端补平11、如下表所示，在DNA样品种一次添加下列各试剂DNA 80ulH2O 3ul10*Buffer 10uldNTP(10mM) 2ulT4Polymerase(5u/ul) 5ulTotal 100ul充分混匀，离心机甩一下12、置370C水浴1小时。
华大建库流程
华大建库流程华大建库流程介绍华大建库（BGI Genomics）是全球最大的基因测序和解读中心之一，提供各种基因组学和生物信息学解决方案。
该公司提供的华大建库流程是一个先进的基因测序流程，以高质量、高效率和高通量的特点而闻名。
流程概述华大建库流程主要包括样品准备、文库构建、测序、数据分析和结果解读等关键步骤。
1.样品准备•收集和标记样品。
•提取样品中的核酸。
•评估样品DNA/RNA的质量和纯度。
•根据实验设计决定建库方法和测序策略。
2.文库构建•根据样品的特性和研究目标选择适当的建库方法。
•根据建库方法制备DNA文库或RNA文库。
•文库构建过程包括DNA/RNA片段加工、连接适配体、富集PCR等步骤。
•合成所构建文库的DNA片段。
3.测序•选择合适的测序平台和测序模式。
•根据文库的特征进行测序运行。
•解读生成的测序数据。
4.数据分析•对原始测序数据进行过滤、清洗和校正，删除低质量的序列。
•将测序数据与参考基因组进行比对。
•识别和注释变异位点。
•进行生物信息学分析，如基因表达分析、功能富集分析等。
5.结果解读•根据数据分析结果解读样品的遗传变异。
•结合相关文献和数据库进行注释和解释。
•给出研究结果和建议。
总结华大建库流程是一个高度系统化和标准化的基因测序流程，能够有效地为基因组学研究提供支持。
通过严格的样品准备、精确的文库构建、可靠的测序和深入的数据分析，华大建库流程确保了高质量的测序数据和可靠的结果解读，为基因研究和生物信息分析提供有力的支持。
流程细节下面将详细介绍华大建库流程的各个步骤。
1.样品准备在这一步骤中，需要收集并标记样品以确保其完整性和可追溯性。
然后对样品进行核酸提取，常见的方法包括酚-氯仿提取、磁珠提取等。
提取的核酸样品需要经过质量和纯度评估，通常使用比色法、毛细管电泳等技术进行检测。
最后，根据实验设计的需要选择合适的建库方法和测序策略。
2.文库构建在文库构建过程中，根据样品特性和研究目标选择适当的建库方法。
mentor 建库流程
Mentor 建库流程一：主要步骤1:创建Symbol2:创建Cell3:创建Part4:在数据库中添加Part 信息1.1：创建Symbol在中心库的Symbols目录下面以元件的MPN 为名字新建一个Symbol注意：Symbol一般按照供应商分类。
1.2：按照下图设置File\Preferences , 主要是格点的设置。
1.3：用下图按钮分别添加Smybol 的边框和Pin给Pin 添加属性“#”其值为：该Pin的序号。
并修改Pin label 为Pin 的网络名1.4：给Symbol 添加COMP and REFDES 属性。
其值分别为元件的MPN 和元件的类别标识二：创建Cell1.1：在Library Manager 的Cell目录下右键点击Smd_geoms 选择新建CellCell Name 以CMxxx-R–依次往下排。
2.1：按照SPEC 上推荐的大小建好所有pad。
2.3：按照元件的外形添加Assembly Outline ，line width：0mm添加SilkSereen Outline ，line width：0.1mm添加Inserstion Outline ，line width：0.15mm添加Placement Outlines （一般以Assembly Outline 单边扩大0.2-0.3 左右。
）在SilkSereen 和Inserstion 层添加1 Pin标识和极性标识。
在自定义的Unplaced Graphics silkscreen 上添加“x”型标记3.4：把元件的SPEC 放到X:\spec_data\元件MPN\ 目录下三：创建Part在Library Manager 的Parts目录下右键点击相应目录（按元件类别）选择新建Part ，其中Part Name 以申请到的为准。
添加Cell 高度和ReferenceReference 命名规则请参考文档X:\Doc\library manager user guide\library name rule .doc4.3：导入Cell and Smybol建议先导入Cell，如果有特殊Pin（如NC，Gnd）需要设置可在Supply and NC 标签里设置五：在数据库中添加Part 信息5.1：可以点击下面按钮通过SQL 或者Schema Browser1.选择要添加信息的表。
illumina dna建库流程
illumina dna建库流程下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成，希望大家下载以后，能够帮助大家解决实际的问题。
文档下载后可定制随意修改，请根据实际需要进行相应的调整和使用，谢谢!并且，本店铺为大家提供各种各样类型的实用资料，如教育随笔、日记赏析、句子摘抄、古诗大全、经典美文、话题作文、工作总结、词语解析、文案摘录、其他资料等等，如想了解不同资料格式和写法，敬请关注!Download tips: This document is carefully compiled by theeditor. I hope that after you download them,they can help yousolve practical problems. The document can be customized andmodified after downloading,please adjust and use it according toactual needs, thank you!In addition, our shop provides you with various types ofpractical materials,such as educational essays, diaryappreciation,sentence excerpts,ancient poems,classic articles,topic composition,work summary,word parsing,copy excerpts,other materials and so on,want to know different data formats andwriting methods,please pay attention!Illumina DNA 建库流程是一种用于构建 DNA 文库的方法，该方法可以用于高通量测序。
atac建库流程
atac建库流程ATAC（Assay for Transposase-Accessible Chromatin）是一种高通量测序技术，用于研究染色质的可及性和开放性。
该技术能够揭示基因组中开放和关闭状态的区域，为深入理解基因调控和表观遗传学提供了重要的信息。
下面将详细介绍ATAC建库的流程。
ATAC建库流程主要包括以下几个步骤：细胞处理、核提取、转座子反应、PCR扩增和测序。
1. 细胞处理：需要选择合适的细胞类型和条件进行实验。
细胞应当处于正常生长状态，并且足够数量以保证后续步骤的成功进行。
此外，细胞的培养条件也需要根据实验要求进行优化，例如时间和药物浓度等。
2. 核提取：将处理好的细胞进行离心，去除培养基，然后用低渗溶液溶解细胞膜，释放出细胞核。
接下来，可以通过离心等方法将细胞核沉淀下来，并用冰冷的细胞裂解缓冲液进行洗涤和裂解。
3. 转座子反应：将转座子反应试剂加入裂解的细胞核中，转座子反应试剂中含有转座酶和转座子。
转座酶能够识别转座子的转座位点，并将其插入到开放的染色质区域中。
反应体系需在适当的温度下进行，以保证反应的高效和准确性。
4. PCR扩增：经过转座子反应后，需要进行PCR扩增，以扩增转座子插入的DNA 片段。
PCR反应体系中需要加入引物，引物的设计应能够扩增出转座子插入的DNA片段。
PCR条件需进行优化，以保证扩增的特异性和产物的丰富性。
5. 测序：PCR扩增后的产物可以进行测序。
可以选择不同的测序平台，如Illumina、PacBio等。
测序数据的处理和分析需要运用生物信息学的方法，包括数据清洗、比对、峰识别和差异分析等。
通过上述步骤，可以得到ATAC建库后的测序数据，进而进行染色质可及性和开放性的分析。
ATAC建库流程简单、高效，并且不需要大量的起始材料，适用于各种类型的细胞和样本。
该技术的应用广泛，可以用于研究基因调控、发育生物学、疾病机制等方面。
总结：ATAC建库流程包括细胞处理、核提取、转座子反应、PCR扩增和测序等步骤。
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MapGIS 四川农村集体土地确权登记发证系统操作手册成都中地六合科工贸有限公司二○一二年八月系统总述MapGIS 四川农村集体土地确权登记发证系统是在MapGisK9平台上，运用设计模式、元数据和软件构件等先进的软件开发技术并结合当前农村集体土地确权登记发证的实际需求开发完成。
系统具有“多级用户，适用面广”、“功能齐全，方便实用”、“界面友好，易于操作”、“数据丰富，拓展性强”的特点。
本系统分为两部分：MapGIS 四川农村集体土地确权建库系统与MapGIS 四川农村集体土地确权登记发证系统。
建库系统主要是数据入库、数据转换、数据检查、成果管理、汇总出表、等功能。
管理系统主要数据汇总、报表输出、宗地统一编码、土地登记、变更管理、成果管理、打证发证等功能。
本文档主要介绍集体土地所有权建库，文档中提到的集体土地确权系统涵盖所有权。
(确权包括所有权、使用权，也包括个别地方提到的所有权、宅基地使用权、建设用地使用权)一、农村集体土地确权数据库标准为规范农村集体土地确权数据库的内容、数据库结构、数据交换格式，促进城乡一体的管理和共享，根据《中华人民共和国土地管理法》等法律、法规，参照《第二次全国土地调查技术规程》、《土地登记规则》、《农村集体土地确权调查规程》等相关标准和规程，制定本标准。
农村集体土地确权数据库包括应用于农村集体土地确权数据处理、管理、交换和分析应用的基础地理要素、土地权属要素、土地利用要素、栅格要素，以及房屋等附加信息。
1.1依据标准主要依据《土地利用数据库标准》、《第二次全国土地调查技术规程》、《第二次全国土地调查数据库汇交办法》、《四川省第二次土地调查技术规范》和其他相关标准规范开展系统建设工作。
1.2土地利用行业规范和标准《中华人民共和国土地管理法》（1998年8月29日国家主席令第8号）《中华人民共和国土地管理法实施条例》（1998年12月27日国务院令第256号）《第二次全国土地调查技术规程》（TD/T 1014-2007）；《第二次全国土地调查总体方案》《第二次全国土地调查实施方案》《土地登记办法》国土资源部令第40号；《土地利用现状分类》（GB/T 21010-2007）；《土地利用数据库标准》《第二次全国土地调查数据库建设的技术规范》；《四川省第二次土地调查实施方案》（川办函［2007］239号）；《四川省第二次土地调查技术规范》；《地形数据库与地名数据库接口技术规程》(GB/T 17797-1999)《基础地理信息数字产品数据文件命名规则》(CH/T 1005-2000)《基础地理信息数字产品元数据》(CH/T 1007-2001)《国家基本比例尺地形图分幅和编号》(GB/T 13989-1992)《地球空间数据交换格式》（GB/T 17798-1999）《中华人民共和国行政区划代码》（GB/T 2260-1999）二、系统安装环境2.1 硬件环境（1）建议使用Microsoft Windows Server2003系统；（2）IIS;(3) 建议存储空间在100GB以上，内存2GB以上；2.2 软件环境（1）Microsoft OFFICE 2003；（2）32 位Microsoft SQL Server2005；（3）准备2台机器，一台安装MapGIS K9 20111230 SP2 数据中心集成开发平台和MapGIS 四川农村集体土地确权登记发证系统0803；另一台安装MapGIS K9 SP2 数据中心开发平台20110426和MapGISK9国土资源数据中心系统8月8号；(注：IE浏览器最好是6.0、7.0，不能装搜狗、百度工具栏、)三、软件安装3.1其他软件安装（1）安装IIS；（2）安装Microsoft SQL Server2005；3.2 许可证服务安装许可证服务器可以单独安装在服务器上，也可以和MapGISK9应用产品一起安装在服务器上。
可以按下述方法安装许可证服务管理器：(1) 插入MapGISK9USB加密狗；(2) 执行许可证服务器安装程序,开始安装：(3) 根据安装向导的提示信息继续安装，在安装过程中请根据所示的界面中输入安装密码继续进行安装：(4) 请在注册信息界面中输入您的注册信息，申请一个永久证书码，输入永久证书码，完成永久证书安装；然后单击“下一步”,直至安装完成。
一旦安装完毕，安装程序会在服务器上自动运行MapGIS许可证服务，如图：3.3 K9数据中心集成开发平台SP2 （20111230）安装安装MapGISK9SP2平台之前需要卸载以前安装的MapGIS7.x以上平台产品。
如果您的电脑上安装有MapGIS7.x产品，或者MapGISK9SP2版本以前的MapGISK9产品，您需要将已安装的平台软件卸载之后才能再次安装MapGISK9产品。
如果您的电脑上只安装有MapGIS6.7产品，您可以不用卸载以安装的MapGIS6.7产品直接安装MapGISK9产品。
可以按下述步骤准备安装MapGISK9平台产品：1.关闭您的电脑上所有打开的应用程序；2.验证您的电脑满足系统需求中的要求；3.决定使用哪一个许可证服务器（也就是确定加密狗所在位置）；4.执行MapGISK9平台产品目录中Setup.EXE开始安装；5．首先您将看到的是欢迎界面，直接单击“下一步”按钮继续安装；6．选择安装目录，点击“安装”，选择许可证服务器。
如果许可证服务器装在本机上就选“使用本机许可证”如果没有安装在本机上就不要选择这项，在弹出的对话框中输入服务所在电脑的IP地址，完成安装。
（如果您使用的是临时证书，在注册组件的时候将会弹出如下界面，您可以单击“继续试用”使用临时证书完成安装。
）3.4 集体土地确权系统安装安装完2011年12月30日版本的SP2版的K9平台后，即可安装MapGIS集体土地确权系统。
直接双击名为应用程序，根据安装向导完成安装，集体土地确权系统必须安装在其默认所指的K9安装目录下的program文件夹中。
打开系统界面如图：四、MAPGIS K9集体土地所有权建库流程各地用户应在先掌握各地集体土地确权数据库标准、本省确权数据库建设相关要求的基础上，根据实际情况制定建库工作路线，灵活选用软件的各项工具。
4.1 建库总体流程4.2 数据转换农村集体土地确权登记发证工作，在数据准备中，根据数据来源的不同，主要分为两大类。
基础地理、土地利用等专题数据，采用开展调查的上一年度变更调查数据库的成果为基础；农村集体土地所有权数据，采用外业逐宗调查。
根据数据格式的不同，从各地的实际数据情况来看，主要分为AutoCAD 、ARCGIS和MAPGIS格式数据。
4.2.1 ARCGIS格式数据转换MAPGIS GDB企业管理器中，在存放数据的数据库上点击右键，导入其他数据，选择要导入的数据，确定数据转换后的名称，点击转换。
数据被转换成MAPGIS K9格式，并且存放在目的数据库中。
4.2.2 AutoCAD和南方CASS格式数据转换可以用MAPGIS 6.7平台进行转换，也可以用MAPGIS K9进行转换。
4.2.2.1 编辑符号对照表在导入mapgis67之前需进对照表和文件转换。
对系统库目录..\ slib下这4个对照表文件进行编辑，可直接用Windows写字板或记事本方式打开，需要注意的是，对照表中MAPGIS编码是在“数字测图”系统中查到的，并且要区分对照表的大小写。
符号对照表------“arc—map.pnt”；线型对照表------“arc—map.lin”；颜色对照表------“cad—map.clr”；层对照表------“cad—map.tab”；（1）符号对照表前面一列W-L, 718A , 5261代表AUTOCAD软件的块名（符号），后面一列9431 9511 9531代表 MAPGIS系统的代码（注：这个代码在数字测图系统里能看见。
方法是启动数字测图系统，新建一个测量工程文件，然后就会看见地类编码的管理框（2）线型对照表前面一列CONTINUOUS、DASH1、DASH4代表AUTOCAD里的线形名（注：如果某种线的线型是采用随层方式，那么这种线型是不能按照对照表转入到MAPGIS中的。
所以，如果有这种情况，请把线的线型改成为实际线型），后面一列2110 1402 4320代表MAPGIS系统的代码（并非线型号，这个代码在数字测图系统里能看见）。
（3）层对照表左侧是mapgis的图层，右侧是cad的图层注意事项：1、Autocad代码和mapgis代码之间可以用空格也可以用tab键，MAPGIS代码后为“Enter”键，不能出现空格；2、上面列举的对照表文件中第一行（代码说明行）是不需要；3、块名要区分大小写4.2.2.2文件转换将AUTOCAD的dwg格式，转换为AUTOCAD的数据交换格式DXF，最好是2000或者R12的DXF格式。
选择“文件转换”模块，选择“输入”按钮，单击“装入DXF”，将需要转换的AUTOCAD文件装入到系统中，此时，系统会提示“选择不转出的层”，选择不转出图层一个一个进行转出，选择后确定，则系统会按照已经设定好的对照关系开始转换。
也可用成批转换命令，把指定路径下的所有dxf转换为点线。
在窗口中单击右键选择“复位窗口”，以便于选择需要的文件。
然后再保存，存点存线。
把需要的图层全部存完后，在maipgis67 平台中，点击“图形处理”——“输入编辑”，添加图层打开装换完毕的图层。
如图:用MAPGIS K9转换的步骤与ARCGIS数据转换的步骤一致，在目的数据库中点击右键，导入其他数据，选择要转换的CAD数据，确定数据转换后的名称，点击转换，数据被转换成MAPGIS K9格式并且存放在目的数据库中。
4.2.2.3 MAPGIS数据格式上一年度变更调查数据库的成果，如果采用MAPGIS格式，以xyz工程管理的点线区(.wt、.wl、.wp)数据，那么可以通过工程升级的方式来导入数据。
只需在MapGIS K9集体土地所有权调查数据库建库系统中对数据进行工程升级即可。
4.3 建库详细流程4.3.1 新建数据库（1）新建主库MPDBASTER：打开K9平台，“工具箱”——“GDB安装器”；点击GDB安装器弹出地理数据库安装器：服务器类型：SQL SERVERSa口令：注意是登陆sqlserver登录名一样的点击下一步弹出：建立一个主库MPDBASTER管理员口令和确认口令最好是方便你记录的口令。
根据提示下一步，下一步，完成。
打开SQL SERVER,点击数据看到里面有个MPDBASTER，说明SQL和GDB连接成功：（2）新建数据库：主库建好后，现在还需添加数据库，运用创建主库同样的方法来创建数据库；设置数据库和数据库管理员用户，地理数据库名最号用字母代替GB/T XXXXX—XXXX 点击下一步，这里选择你存储的路径，点击，下一步，点击完成。