数据库种类及其特点.doc
数据库第五版 王珊
第1章绪论1 ．试述数据、数据库、数据库系统、数据库管理系统的概念。
答:（l ）数据( Data ) :描述事物的符号记录称为数据.数据的种类有数字、文字、图形、图像、声音、正文等.数据与其语义是不可分的。
解析在现代计算机系统中数据的概念是广义的.早期的计算机系统主要用于科学计算，处理的数据是整数、实数、浮点数等传统数学中的数据.现代计算机能存储和处理的对象十分广泛,表示这些对象的数据也越来越复杂.数据与其语义是不可分的。
500 这个数字可以表示一件物品的价格是500 元，也可以表示一个学术会议参加的人数有500 人，还可以表示一袋奶粉重500 克。
( 2 ）数据库（DataBase ,简称DB ）：数据库是长期储存在计算机内的、有组织的、可共享的数据集合。
数据库中的数据按一定的数据模型组织、描述和储存，具有较小的冗余度、较高的数据独立性和易扩展性，并可为各种用户共享。
（ 3 ）数据库系统（DataBas . Sytem ，简称DBS ) :数据库系统是指在计算机系统中引入数据库后的系统构成，一般由数据库、数据库管理系统（及其开发工具)、应用系统、数据库管理员构成。
解析数据库系统和数据库是两个概念。
数据库系统是一个人一机系统，数据库是数据库系统的一个组成部分。
但是在日常工作中人们常常把数据库系统简称为数据库.希望读者能够从人们讲话或文章的上下文中区分“数据库系统”和“数据库”，不要引起混淆。
( 4 ）数据库管理系统（DataBase Management sytem ,简称DBMs ）:数据库管理系统是位于用户与操作系统之间的一层数据管理软件，用于科学地组织和存储数据、高效地获取和维护数据. DBMS 的主要功能包括数据定义功能、数据操纵功能、数据库的运行管理功能、数据库的建立和维护功能。
解析DBMS 是一个大型的复杂的软件系统，是计算机中的基础软件。
目前，专门研制DBMS 的厂商及其研制的DBMS 产品很多.著名的有美国IBM 公司的DBZ 关系数据库管理系统和IMS 层次数据库管理系统、美国Oracle 公司的orade 关系数据库管理系统、s 油ase 公司的s 油ase 关系数据库管理系统、美国微软公司的SQL Serve ,关系数据库管理系统等.2 ．使用数据库系统有什么好处？答：使用数据库系统的好处是由数据库管理系统的特点或优点决定的。
浅析国内引文数据库的种类及特点
浅析国内引文数据库的种类及特点（全文）作者：吕润宏(漯河医学高等专科学校图书馆河南462002)摘要本文主要对我国目前引文数据库的种类进行简单的介绍和分析。
关键词引文数据库分析引文索引不同于一般概念上的索引，而是通过文献之间的引证关系去揭示科学文献之间(包括学科之间) 的内在联系。
从这种引证关系上，不但可以看出某一学科或领域的研究动态和发展趋势，而且可以看出这一学科或领域的核心作者群、高影响力作者和论文，还可以根据某一学术概念、某一方法、某一理论的出现时间、出现频次、衰减情况等，分析出学科或领域研究的走向和规律。
那么国内引文数据库到底有哪些？他们各自有何特点呢？对此，我们作一简要介绍，以歹食读者。
1《中国科学引文数据库》( CSCD )该库创建于1989 年，由中国科学院文献情报中心与中国学术期刊( 光盘版) 电子杂志社联合建设，并由清华同方光盘电子出版社正式出版。
该数据库收入我国数学、物理、化学、天文学、地学、生物学、农林科学、医药卫生、工程技术、环境科学和管理科学等领域出版的中英文科技核心期刊和优秀期刊近千种，其中核心库来源期刊670种，扩展库期刊为378 种，已积累从1989 年到现在的论文记录近100 万条，引文记录近400万条，内容丰富、结构科学、数据准确。
系统除具备一般的检索功能外，还提供新型的索引关系——引文索引。
使用该功能，用户可迅速从数百万条引文中查询到某篇科技文献被引用的详细情况，还可以从一篇早期的重要文献或著者姓名入手，检索到一批近期发表的相关文献，对交叉学科和新学科的发展研究具有十分重要的参考价值。
中国科学引文数据库除提供文献检索功能外，其派生出来的中国科学计量指标数据库等产品，也成为我国科学文献计量和引文分析研究的强大工具。
另外《中国科学引文数据库》网络版从2002年开始研制，与中国科学学科文献库、中国科学文献目次库集成为“中国科学文献数据库服务系统”提供统一服务。
中国科学引文数据库网络版提供两种途径的检索：来源文献检索和引文检索。
数据库的介绍和类型
数据库的介绍和类型⼀、什么是数据库？简单的说，数据库（英⽂Dtabase）就是⼀个存放数据的仓库，这个仓库是按照⼀定的数据结构（数据结构是指数据的组织形式或数据之间的联系）来组织、存储的、我们可以通过数据库提供的多种⽅法来管理数据库⾥的数据更简单的形象理解，数据库和我们⽣活中存放杂物的仓库性质⼀样，区别只是存放的东西不同。
⼆、数据库的种类有哪些？早期⽐较流⾏的数据库模型有三种，分别为：层次式数据库、⽹络式数据库和关系型数据库。
⽽在当今的互联⽹中，最常⽤的数据库模型主要是两种，即关系型数据库和⾮关系型数据库。
1.关系型数据库介绍（1）关系型数据库由来⽹络数据库和层次数据库很好地解决了数据的集中和共享问题，但是在数据独⽴性和抽象级别上仍有很⼤⽋缺。
⽤户对这两种数据库进⾏存取时，依然需要明确数据的存储结构，⽀出存储路径。
⽽关系数据库就可以较好地解决这些问题（2）关系型数据库介绍 关系型数据库模型是把复杂的数据结构归结为简单的⼆元关系（即⼆维表格形式）。
Oracle 在数据库领域⾥上升到了霸主地位，形成每年⾼达数百亿美元的庞⼤市场，⽽MySQL也是不容忽视的数据库，以⾄于被Oracle重⾦收购MySQL 互联⽹市场 ———— Oracle 传统企业2.⾮关系型数据库的介绍 (1) ⾮关系型数据库诞⽣背景 ⾮关系型数据库也被成为NoSQL数据库，NOSQL的本意是“Not Olnly SQL” 。
指的是⾮关系型数据库，⽽不是“No SQL”的意思，因此，NoSQL的产⽣并不是要彻底地否定⾮关系型数据库，⽽是作为传统关系型数据库的⼀个有效补充。
NOSQL数据库在特定的场景下可以发挥出难以想象的⾼效率和⾼性能。
(2) 随着互联⽹Web2.0⽹站的星期，传统的关系型数据库在应付web2,0⽹站，特别是对于规模⽇益扩⼤的海量数据，超⼤规模和⾼并发的微博、微信、SNS类型的web2.0纯动态⽹站已经显得⼒不从⼼，暴露了很多难以克服的问题。
NoSQL数据库的特点与应用场景
NoSQL数据库的特点与应用场景MongoDB、HBase、Redis目录1.NoSQL的四大种类 (3)2.MongoDB (4)3.HBase (6)4.Redis (8)1.NoSQL的四大种类NoSQL数据库在整个数据库领域的江湖地位已经不言而喻。
在大数据时代，虽然RDBMS很优秀，但是面对快速增长的数据规模和日渐复杂的数据模型，RDBMS渐渐力不从心，无法应对很多数据库处理任务，这时NoSQL凭借易扩展、大数据量和高性能以及灵活的数据模型成功的在数据库领域站稳了脚跟。
目前大家基本认同将NoSQL数据库分为四大类：键值存储数据库，文档型数据库，列存储数据库和图形数据库，其中每一种类型的数据库都能够解决关系型数据不能解决的问题。
在实际应用中，NoSQL数据库的分类界限其实没有那么明显，往往会是多种类型的组合体。
主流nosql的详解：MongoDB、Hbase、Redis2.MongoDBMongoDB 是一个高性能，开源，无模式的文档型数据库，开发语言是C++。
它在许多场景下可用于替代统的关系型数据库或键/值存储方式。
1.MongoDB特点∙所用语言：C++∙特点：保留了SQL一些友好的特性（查询，索引）。
∙使用许可：AGPL（发起者：Apache）∙协议：Custom, binary（BSON）∙Master/slave复制（支持自动错误恢复，使用sets 复制）∙内建分片机制∙支持javascript表达式查询∙可在服务器端执行任意的javascript函数∙update-in-place支持比CouchDB更好∙在数据存储时采用内存到文件映射∙对性能的关注超过对功能的要求∙建议最好打开日志功能（参数--journal）∙在32位操作系统上，数据库大小限制在约2.5Gb∙空数据库大约占192Mb∙采用GridFS存储大数据或元数据（不是真正的文件系统）2.MongoDB优点：1）更高的写负载，MongoDB拥有更高的插入速度。
数据库模型：分析数据库模型的种类、特点和设计
数据库模型是数据库设计中的核心要素之一，它定义了数据库中数据的组织和结构。
不同的数据库模型适用于不同的应用场景，并具有各自的特点和设计原则。
在本文中，我将介绍数据库模型的种类、特点和设计方法，帮助读者更好地理解和应用数据库模型。
介绍什么是数据库模型数据库模型是对数据库中数据组织和结构的一种抽象表示。
它描述了数据库中的实体、关系、属性之间的对应关系，以及对数据进行存储、检索、修改和删除等操作的规则和约束。
数据库模型是数据库实际设计的基础，决定了数据的可靠性、稳定性和高效性。
数据库模型的重要性数据库模型对数据库的性能、扩展性和易用性有着重要影响。
一个好的数据库模型能够更好地满足应用的需求，提高数据的存储效率和操作效率，同时降低数据冗余和数据不一致性的风险。
因此，选择合适的数据库模型对于数据库设计来说非常重要。
数据库模型的分类数据库模型可以分为以下几种主要类型：层次模型、网状模型、关系模型、面向对象模型、文档模型和键值模型。
接下来，我们分别对这些模型进行详细介绍。
层次模型层次模型是数据库模型的一种最早的形式，它将数据组织成一个树状结构。
层次模型中的数据以父子关系进行组织，每个节点可以有多个子节点，但只能有一个父节点。
这种模型适用于嵌套关系比较简单的数据，例如组织机构、家族关系等。
层次模型的特点是简单直观，易于理解和操作，但对数据的表示能力有一定的限制。
网状模型网状模型是数据库模型的另一种较早期的形式，它将数据组织成一个图状结构。
网状模型中的数据以节点和边的形式表示，节点表示实体，边表示实体之间的关系。
不同于层次模型中只能有一个父节点的限制，网状模型中的节点可以有多个父节点和多个子节点。
这种模型适用于表示复杂的数据关系，例如供应链管理、电力系统等。
网状模型的特点是较好地解决了层次模型的限制，但对于数据操作的复杂性增加了一定的挑战。
关系模型关系模型是当前应用最广泛的数据库模型，它将数据以二维表的形式进行组织。
数据库复习基本知识
数据库复习基本知识1、数据库的4个基本概念：数据（描述事物的符号记录）、数据库（长期存储在计算机内、有组织的、可共享的大量数据的集合。
数据库中的数据按一定的数据模型组织、描述和存储，具有较小的冗余度、较高的数据独立性和易扩展性，并可为各种用户共享概括的讲，数据库数据具有永久存储、有组织和可共享三个基本特点）、数据管理系统（DBMS）和数据库系统（DBS）2、数据库系统的特点：数据结构化（数据库系统实现整体数据的结构化，这是数据库的主要特征这一，也是数据库系统与文件系统的本质区别）、数据的共享性高、冗余度低且易扩充（数据共享可以大大减少数据冗余，节约存储空间，数据共享还能够避免数据之间的不相容性与不一致性）、数据的独立性高（物理独立性和逻辑独立性）、数据由数据库管理系统统一管理和控制（必须具备的4各控制功能1、数据的安全性保护2、数据的完整性检查3、并发控制4、数据库恢复）3、数据库的定义：数据库是长期存储在计算机内有组织、大量、共享的数据集合。
它可以提供各种用户共享，具有最小冗余度和较高的数据独立性。
数据库管理系统在数据库建立、运用和维护时对数据库进行统一控制，以保证数据的完整性和安全性，并在多用户同时使用数据库时进行并发控制，在发生故障后对数据库进行恢复。
4、两大数据模型：1、概念模型（也称信息模型，主要用于数据库设计）2、数据模型（包括逻辑模型和物理模型逻辑模型主要用于数据库管理系统的实现）数据模型应满足三方面的要求：1、能比较真实的模拟现实世界2、容易为人所理解3、便于在计算机上实现<5、概念模型：它是按用户的观点来对数据和信息建模，主要用于数据库设计，从现实世界到概念模型的转换是由数据库设计人员完成的。
6、数据模型：它是对现实世界数据特征的抽象。
是用来描述数据、组织数据和对数据进行操作的。
数据模型是数据库系统的核心和基础。
包括逻辑模型（主要包括层次模型、网状模型、关系模型等。
它是按计算机系统的观点对数据建模，主要用于数据库管理系统的实现）和物理模型（对数据最底层的抽象，它描述数据在系统内部的表示方式和存取方方法是面向计算机系统的）从概念模型到逻辑模型的转换可以有数据可设计人员完成，也可以用数据可设计工具协助设计人员完成；从逻辑模型到物理模型的转换主要由数据库管理系统完成。
SCI、EI等各类数据库简介
EI：美国工程索引(The Engineering Index)收录文献几乎涉及工程技术各个领域。
例如：动力、电工、电子、自动控制、矿冶、金属工艺、机械制造、土建、水利等。
它具有综合性强、资料来源广、地理覆盖面广、报道量大、报道质量高、权威性强等特点。
旗下有两个数据库，核心数据库EI Compendex 和非核心数据库EI Page One。
目前，高校和科研机构多认可核心数据库。
SCI：《科学引文索引》(Science Citation Index)是由美国科学信息研究所(ISI)1961年创办出版的引文数据库，其覆盖生命科学、临床医学、物理化学、农业、生物、兽医学、工程技术等方面的综合性检索刊物，尤其能反映自然科学研究的学术水平，是目前国际上三大检索系统中最著名的一种，也是我国高校和科研机构认可度最高的检索类别。
SSCI：Social Sciences Citation Index为社会科学引文索引（Social Sciences Citation Index），为SCI 的姊妹篇，亦由美国科学信息研究所创建，是目前世界上可以用来对不同国家和地区的社会科学论文的数量进行统计分析的大型检索工具。
1999年SSCI全文收录1809种世界最重要的社会科学期刊，内容覆盖包括人类学、法律、经济、历史、地理、心理学等55个领域。
收录文献类型包括：研究论文，书评，专题讨论，社论，人物自传，书信等。
选择收录(Selectively Covered)期刊为1300多种。
CA：美国《化学文摘》（Chemical Abstracts）1907年创刊,由美国化学会所属化学文摘服务社(CAS)编辑出版, 现为世界上收录化学化工及其相关学科文献最全面,应用最广泛的一种文献检索工具。
属于专业性很强的特色型检索种类。
CSCD：《中国科学引文数据库。
（Chinese Science Citation Database）创建于1989年，1999年起作为中国科学文献计量评价系列数据库之A辑，由中国科学院文献情报中心与中国学术期刊（光盘版）电子杂志社联合主办，并由清华同方光盘电子出版社正式出版。
医学数据库及其使用技巧与应用
医学数据库及其使用技巧与应用医学数据库是医学领域内重要的信息资源，它们提供了大量有关医学研究、临床实践和医疗决策所需的信息。
本文将介绍医学数据库的种类以及使用技巧和应用。
医学数据库种类：1. PubMed：PubMed是生物医学领域最具影响力的数据库之一，由美国国家医学图书馆提供。
它包含了生物医学和生命科学方面的数百万篇研究论文摘要和全文。
PubMed的搜索功能强大，可以帮助研究人员快速找到所需的文献，并通过其链接到全文。
2. Medline：Medline 是PubMed 的子集，它与 PubMed 基本相同，但更专注于医学和临床方面的研究文献。
3. Embase：Embase是全球最全面、更新速度最快的生物医学文献数据库之一，涵盖了生物医学、药学、生命科学和临床医学等领域。
它也是一个重要的资源，特别是在药品和药物研究方面。
4. Cochrane Library：Cochrane Library 是医学和健康领域内最受重视的系统评价和临床实证研究数据库之一。
它提供了大量可靠的循证医学证据，包括系统评价、临床实验和各种研究方法的摘要和全文。
5. ：这是一个由美国国家卫生研究院(NIH)维护的临床试验数据库。
它提供了来自世界各地的临床试验的信息，包括研究目的、参与者招募情况和研究结果等。
医学数据库的使用技巧：1. 关键词搜索：使用正确的关键词是快速找到所需文献的关键。
在进行搜索时，应使用相关的医学术语和词汇。
还可以利用数据库的高级搜索功能，如布尔搜索、截断搜索和限定查询结果的时间范围。
2. 过滤和排序：医学数据库通常提供过滤和排序功能，可以根据研究方法、研究类型、出版日期等进行筛选和排序，以得到更准确和相关的结果。
3. 综述和元分析：综述和元分析是对大量文献进行整合和分析的方法，可以提供更高水平的证据。
在搜索过程中，可以重点关注综述和元分析，以便快速获取最新的综合性研究结果。
4. 保存和导出：医学数据库通常允许用户保存和导出所找到的文献。
各个数据库管理系统的特点
数据库管理系统学院：信息工程学院专业：计算机科学与技术（教师教育）姓名：曹永荣Oracle数据库ORACLE数据库系统是美国ORACLE公司（甲骨文）提供的以分布式数据库为核心的一组软件产品，是目前最流行的客户/服务器(CLIENT/SERVER)或B/S体系结构的数据库之一。
比如Silver Stream就是基于数据库的一种中间件。
ORACLE数据库是目前世界上使用最为广泛的数据库管理系统，作为一个通用的数据库系统，它具有完整的数据管理功能；作为一个关系数据库，它是一个完备关系的2017-3-27产品；作为分布式数据库它实现了分布式处理功能。
但它的所有知识，只要在一种机型上学习了ORACLE知识，便能在各种类型的机器上使用它。
Oracle数据库最新版本为Oracle Database 12c。
Oracle数据库12c引入了一个新的多承租方架构，使用该架构可轻松部署和管理数据库云。
此外，一些创新特性可最大限度地提高资源使用率和灵活性，如Oracle Multitenant可快速整合多个数据库，而Automatic Data Optimization和Heat Map能以更高的密度压缩数据和对数据分层。
这些独一无二的技术进步再加上在可用性、安全性和大数据支持方面的主要增强，使得Oracle数据库12c成为私有云和公有云部署的理想平台。
My SQL数据库My SQL：是一种开放源代码的关系型数据库管理系统（RDBMS），My SQL数据库系统使用最常用的数据库管理语言--结构化查询语言（SQL）进行数据库管理。
由于My SQL是开放源代码的，因此任何人都可以在General Public License的许可下下载并根据个性化的需要对其进行修改。
My SQL因为其速度、可靠性和适应性而备受关注。
大多数人都认为在不需要事务化处理的情况下，My SQL 是管理内容最好的选择SQL Server数据库SQL Server是由Microsoft开发和推广的关系数据库管理系统（DBMS），它最初是由Microsoft、Sybase 和Ashton-Tate三家公司共同开发的，并于1988年推出了第一个OS/2版本。
数据库 第1章_习题参考答案
习题参考答案1.解释数据、数据库、数据库管理系统、数据库系统等概念。
答：数据是描述事物的符号记录，数据的种类是很多的，包括数字、文字、图形、图像、音频、视频等。
数据库：数据库是长期储存在计算机内，有组织的、可共享的大量数据的集合。
数据库管理系统：数据库管理系统是一种操纵和管理数据库的大型软件，用于建立、使用和维护数据库，简称DBMS。
它具有强大的数据定义、数据组织、数据存储、数据操纵和运行维护等功能，对数据库进行统一的管理和控制，以保证数据库的安全性和完整性。
数据库系统：数据库系统是为适应实际数据处理的需要而发展起来的一种较为理想的数据处理系统，通常由软件、数据库和数据库管理员组成。
2.数据管理经历了哪几个阶段，各有什么特点？答：数据管理经历了人工管理、文件系统和数据库系统三个发展阶段。
人工管理阶段的特点是：数据不保存；数据由程序管理；数据不共享；数据没有独立性。
文件系统阶段的特点是：数据长期保存；数据由文件系统管理；数据共享性差，冗余度大，一致性差；数据的独立性差。
数据库系统阶段的特点是：数据整体结构化；数据共享性高，冗余度低；数据独立性高；数据由DBMS统一管理和控制。
3.什么是数据模型？数据模型包含哪些要素？答：数据模型（Data Model）是对现实世界数据的模拟和抽象，是用来描述数据、组织数据、操作数据以及约束数据的。
数据模型是数据库系统的核心和基础。
数据模型由数据结构、数据操作和完整性约束三部分组成。
4.什么是概念模型，逻辑模型和物理模型？它们之间具有怎样的关系？答：概念模型也称信息模型，它是按照用户的观点和认识对现实世界的数据进行建模。
概念模型是对现实世界数据的第一步抽象，同具体的DBMS无关。
逻辑模型是按照计算机系统的观点来对数据建模，是数据抽象的中间层，用于描述数据库的整体逻辑结构。
逻辑模型同具体的DBMS密切相关。
物理模型是对数据的最底层抽象，主要描述数据在计算机系统内部的表示方式和存取方法，在磁盘等存储介质上的存储结构和存取方法。
数据库知识点总结归纳
一、基本概念1、数据(1)数据的定义:对客观事物的符号表示，如图形符号、数字、字母等，数据是数据库中存储的基本对象。
(2)数据的种类:文字、图形、图象、声音(3)数据的特点:数据与其语义是不可分的2、数据库数据库(DataBase 简称 DB)是按照数据结构来组织、存储和管理数据的仓库。
3、数据库管理系统(比如:MySql)(1)数据库管理系统(DatabaseManagementSystem 简称 DBMS)是一种控制和管理数据库的大型软件，是用于建立、使用和维护数据库。
(2)关系型数据库管理系统称为 RDBMS,R 指 Relation。
(3) DBMS 的作用:它对数据库进行统一的管理和控制，以保证数据库的安全性和完整性。
4、数据库系统数据库系统(DatabaseSystem,简称 DBS)，是由数据库及其管理软件组成的系统。
5、数据库管理员数据库管理员 (DatabaseAdministrator,简称 DBA),负责全面管理和控制数据库系统。
6、DBA、DBMS、DB 和 DBS 之间的关系7、数据库的优点(1)数据按一定的数据模型组织、描述和储存(2)可为各种用户共享(3)冗余度较小，节省存储空间(4)易扩展，编写有关数据库应用程序二、数据库管理系统(DBMS)1、DBMS 的主要功能(1)数据定义功能:提供数据定义语言(DDL)用于定义数据库的所有特性和属性，特别是行布局、列定义、键列 (有时是选键方法)、文件位置和存储策略，包括命令:DROP(删除数据库)删除数据库:dropdatabaseifexists 数据库名CREATE(创建数据库)创建表:createtableifnotexists 表名(列名列名约束)ALTER(修改数据库)添加列名:altertable 表名 add 列名约束条件修改列名:altertable 表名 change 老列名新列名数据类型修改列字段数据类型:altertable 表名modity 列名数据类型删除列名:altertable 表名 drop 列名修改表名:altertable 表名 rename 新表名GRANT(赋予权限)REVOKE(从当前用户或者组中取销权限)、TRUNCATE(只删除表中的所有数据,不删除表的结构)命令将快速删除数据表中的所有记录,但保留数据表结构。
生物信息学数据库的种类
生物信息学数据库的种类1.引言1.1 概述生物信息学数据库是由生物学和计算机科学相结合的一个重要领域。
随着高通量测序技术的快速发展, 生物学研究已经进入了“大数据”时代。
生物信息学数据库的出现, 解决了这些海量生物信息的存储和管理问题, 为生命科学研究提供了重要的工具和资源。
生物信息学数据库可以存储和管理各种类型的生物信息数据, 对于科学家和研究人员来说, 这些数据库包含了大量的基因组序列、蛋白质序列、基因表达数据等重要信息。
通过对这些数据的分析和挖掘, 科学家们可以更深入地研究生物体的组成、功能和进化等方面。
在当前的生物信息学数据库中, 可以根据数据类型进行分类。
常见的生物信息学数据库包括序列数据库、结构数据库、基因表达数据库、蛋白质互作数据库、药物数据库、多样性数据库、基因组数据库、疾病数据库和转录因子数据库等。
每种类型的数据库都有其独特的特点和应用领域。
随着生物学研究的不断深入和技术的不断进步, 生物信息学数据库也在不断发展。
未来的数据库将更加注重数据的互联互通, 提供更完整、准确和可靠的生物信息。
同时, 数据分析和挖掘的算法和工具也将不断更新和完善, 为科学家们的研究提供更加强大的支持。
总之, 生物信息学数据库是生物学研究中不可或缺的重要工具和资源。
通过这些数据库, 科学家们可以更加高效地存储、管理和分析生物信息,推动生命科学领域的发展。
未来, 随着生物学研究的不断进步, 生物信息学数据库将不断发展和完善, 为科学家们带来更多的可能性和突破。
1.2 文章结构本文将分为三个部分来详细介绍生物信息学数据库的种类。
首先，在引言部分，我们将提供对本文的概述，介绍生物信息学数据库的基本概念和作用，并说明文章的目的。
接下来，在正文部分，我们将详细介绍九种不同类型的生物信息学数据库，包括序列数据库、结构数据库、基因表达数据库、蛋白质互作数据库、药物数据库、多样性数据库、基因组数据库、疾病数据库和转录因子数据库。
1数据库系统有哪几种数据模型及特点
常见数据库种类及介绍
常用的关系数据库及其简介软件工程2班王欣欣摘要：从常见的关系数据库入手，阐述了常用关系数据库的发展现状，并具体介绍了当前主流关系数据库的共性、基本特点、关键技术、构件、分类，并提出了发展趋势和进一步研究的技术突破点。
关键字：关系数据库；；平台；技术；现状；趋势；特点关系数据库，是建立在关系数据库模型基础上的数据库，借助于集合代数等概念和方法来处理数据库中的数据。
目前主流的关系数据库有oracle、SQL、access、db2、sqlserver，sybase等。
关系数据库（relational database）是一个被组织成一组正式描述的表格的数据项的收集，这些表格中的数据能以许多不同的方式被存取或重新召集而不需要重新组织数据库表格。
关系数据库是在1970 年被IBM 公司的 E. F.Codd发明的。
下面对常用的关系数据库做具体阐述：1.OracleOracle公司产品支持最广泛的操作系统平台。
目前Oracle关系数据库市场占有率有率名列前茅。
ORACLE是最早提出基于标准SQL数据库语言的关系数据库产品之一，1979年问世，近二十年来融汇了数据库的各种先进技术，在小型机及微型机的关系数据库系统领域，占有举足轻重的地位。
自第五版起，支持客户/服务器和协同服务器，目前最新版本是1998年推出的ORACLE8.0。
具有兼容性，可移植性，可联结性，高生产率。
还具有以下特点：(1)名符其实的大型数据库：ORACLE建立的数据库，最大数据量可达几百GB；(2)共享SQL和多线索服务器体系结构：这两个特性的结合，减少ORACLE的资源占用，增强处理能力，能支持成百甚至上千个用户。
(3)跨平台能力：ORACLE数据库管理系统可以运行在100多个硬件和软件平台上，这一点为其它PC平台上的数据库产品所不及。
(4)分布式数据库：可以使物理分布不同的多个数据库上的数据，被看成是一个完整的逻辑数据库，尽管数据操纵的单个事务可能要运行于多处地点，但这对应用程序却是透明的，应用程序开发人员的感觉就好象所有的数据都是物理地存储在本地数据库中。
数据库基础知识讲解
目录一、数据库基础知识 (1)二、Access 2003数据库对象 (5)三、数据表 (5)四、查询 (7)五、窗体 (8)六、报表 (10)七、数据访问页 (10)八、宏 (11)九、模块和VBA（Visual Basic for Application）编程 (12)十、公共基础知识 (15)一、数据库基础知识1、数据是描述客观事物及其活动的并存储在某一种媒体上能够识别的物理符号。
信息是以数据的形式表示的，数据是信息的载体。
分为临时性数据和永久性数据。
2、数据处理的目的是为了从大量、原始的数据中抽取对人们有价值的信息。
3、数据库是以一定的组织方式将相关的数据组织在一起存放在计算机外存储器上（有序的仓库），并能为多个用户共享与应用程序彼此独立的一组相关数据的集合。
4、数据库管理系统（DBMS ,database management system，数据库系统的核心）是软件系统。
数据库管理系统提供以下的数据语言：数据定义语言（DDL），负责数据的模式定义与数据的物理存取构建；数据操纵语言（DML），负责数据的操纵，如查询、删除、增加、修改等；数据控制语言，负责数据完整性、安全性的定义与检查，以及并发控制、故障恢复等。
5、数据库系统（DBS）包括5部分：硬件系统、数据库集合（DB）、数据库管理系统(DBMS)及相关软件、数据库管理员（DBA ,database administrator）和用户（专业用户和最终用户）。
需要操作系统的支持。
6、数据库管理技术的发展：人工管理、文件管理（数据冗余大、数据的不一致性、数据关联差）、数据库管理、分布式数据库管理、面向对象数据库管理。
根本目标是解决数据共享的问题。
7、数据库系统的特点：数据结构化(是数据库系统与文件系统的根本区别)，共享性高、冗余度低、易于扩充，独立性强（物理独立性和逻辑独立性），数据由DBMS统一管理和控制。
三级模式（概念模式、内模式和外模式）和二级映射（外模式/概念模式的映射、概念模式/内模式的映射）构成了数据库系统的内部的抽象结构体系。
数据库种类及其特点
大型数据库一、Microsoft SQL Server适用于入门者。
1、开放性:只能在windows上运行，没有开放性，操作系统的系统的稳定对数据库是十分重要的,Windows9X系列产品是偏重于桌面应用。
2、伸缩性：并行实施和共存模型并不成熟，很难处理日益增多的用户数和数据卷，伸缩性有限.3、安全性：没有获得任何安全证书。
4、性能：多用户时性能不佳5、客户端支持及应用模式：C/S结构，只支持windows客户，可以用ADO、DAO、OLEDB、ODBC连接6、操作性：操作简单，但只有图形界面。
7、使用风险：完全重写的代码，经历了长期的测试，不断延迟,许多功能需要时间来证明。
并不十分兼容。
二、Oracle强大的功能和可配置、可管理能力.1、开放性:能在所有主流平台上运行（包括 windows）.完全支持所有的工业标准。
采用完全开放策略。
可以使客户选择最适合的解决方案。
对开发商全力支持。
2、伸缩性与并行性：并行服务器通过使一组结点共享同一簇中的工作来扩展windows NT的能力，提供高可用性和高伸缩性的簇的解决方案.如果windows NT不能满足需要，用户可以把数据库移到UNIX中.Oracle的并行服务器对各种UNIX平台的集群机制都有着相当高的集成度.3、安全性：获得最高认证级别的ISO标准认证。
4、性能：性能最高, 保持开放平台下的TPC—D和TPC—C的世界记录.5、客户端支持及应用模式：多层次网络计算,支持多种工业标准,可以用ODBC、JDBC、OCI等网络客户连接。
6、操作性：较复杂，同时提供GUI和命令行，在windows NT和unix下操作相同。
7、使用风险：长时间的开发经验，完全向下兼容。
得到广泛的应用。
完全没有风险。
三、IBM UDB/DB2不管是小型商业系统,还是大的银行系统，用DB2都是可以高枕无忧的。
最近推出的新版DB2 6.1, 管理和调节工具更加卓越和便于使用。
数据库复习
1.1 数据库系统概述1.1.1数据库的地位数据库技术产生于六十年代末，是数据管理的最新技术，是计算机科学的重要分支。
数据库技术是信息系统的核心和基础，它的出现极大地促进了计算机应用向各行各业的渗透。
数据库信息量的大小和使用频度已成为衡量一个国家信息化程度的重要标志。
1.1.2四个基本概念一、数据(Data)1．数据是数据库中存储的基本对象2．数据的定义：描述事物的符号记录。
3．数据的种类：文本、图形、图像、音频、视频、学生的档案记录、货物的运输情况等。
4．数据的特点：数据与其语义是不可分的。
二、数据库(Database,简称DB)1.数据库的定义：数据库是长期储存在计算机内、有组织的、可共享的大量数据集合。
2.数据库的基本特征：数据按一定的数据模型组织、描述和储存；可为各种用户共享；冗余度较小；数据独立性较高；易扩展。
三、数据库管理系统（Database Management System，简称DBMS）1．什么是DBMS数据库管理系统是位于用户与操作系统之间的一层数据管理软件。
2．DBMS的用途科学地组织和存储数据、高效地获取和维护数据。
3．DBMS的主要功能（1）数据定义功能：提供数据定义语言(DDL)；定义数据库中的数据对象。
（2）数据操纵功能:提供数据操纵语言(DML)；实现对数据库的基本操作(查询、插入、删除和修改)。
（3）数据库的运行管理：数据库在建立、运行和维护时由DBMS 统一管理和控制；保证数据的安全性、完整性、多用户对数据的并发使用；发生故障后的系统恢复。
（4）数据库的建立和维护功能(实用程序)：数据库初始数据装载转换；数据库转储；介质故障恢复；数据库的重组织；性能监视分析等。
四、数据库系统1．什么是数据库系统（Database System ，简称DBS ）数据库系统是指在计算机系统中引入数据库后的系统构成。
在不引起混淆的情况下常常把数据库系统简称为数据库。
2．数据库系统的构成由数据库、数据库管理系统（及其开发工具）、应用系统、数据库管理员（和用户）构成。
主流数据库种类特点
主流数据库种类特点一、关系型数据库（RDBMS）关系型数据库是以关系模型为基础，采用表（table）的形式存储数据，并通过关系运算对数据进行操作和管理。
常见的关系型数据库包括MySQL、Oracle、SQL Server等。
特点：1.数据的结构化：关系型数据库需要事先定义数据表的结构，即表中的字段和字段类型，确保数据的结构化、一致性和完整性。
2.强大的功能：关系型数据库提供了丰富的SQL语言和事务支持，能够实现复杂的数据操作和查询，保证数据的一致性和可靠性。
3.ACID特性：关系型数据库遵循ACID（原子性、一致性、隔离性和持久性）特性，保证数据的完整性和可靠性。
4.可扩展性有限：关系型数据库扩展性相对有限，需要对数据表进行拆分和分布式部署来实现大规模数据存储和处理。
二、非关系型数据库（NoSQL）非关系型数据库也被称为NoSQL（Not Only SQL），是针对传统关系型数据库的局限性而出现的一种新型数据库，适用于大规模分布式系统和海量数据的存储和处理。
常见的NoSQL数据库包括MongoDB、Redis、Cassandra等。
特点：1.非结构化数据存储：非关系型数据库可以存储非结构化或半结构化的数据，不需要严格的表结构定义，能够存储各种类型的数据，如文档、键值对、图等。
2.高可扩展性：非关系型数据库采用分布式架构，能够通过数据的分片和复制技术实现高可扩展性，适用于大规模分布式系统和高并发访问场景。
3.灵活性和高效性：非关系型数据库放宽了数据一致性和事务支持的要求，提高了数据的读写效率和吞吐量，并且能够根据应用需求进行灵活的数据模型设计。
4. CAP定理：非关系型数据库根据应用场景的需求可以在一致性（Consistency）、可用性（Availability）和分区容错性（Partition tolerance）之间做出选择，即CAP定理。
三、新一代数据库新一代数据库是指在关系型数据库和非关系型数据库的基础上，结合了二者的优势，加上新的技术和理念而产生的一类数据库。
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大型数据库
一、Microsoft SQL Server
适用于入门者。
1、开放性：只能在windows上运行，没有开放性，操作系统的系统的稳定对数
据库是十分重要的，Windows9X系列产品是偏重于桌面应用。
2、伸缩性：并行实施和共存模型并不成熟，很难处理日益增多的用户数和数据
卷，伸缩性有限。
3、安全性：没有获得任何安全证书。
4、性能：多用户时性能不佳
5、客户端支持及应用模式：C/S结构，只支持windows客户，可以用ADO、DAO、
OLEDB、ODBC连接
6、操作性：操作简单，但只有图形界面。
7、使用风险：完全重写的代码，经历了长期的测试，不断延迟，许多功能需要
时间来证明。
并不十分兼容。
二、Oracle
强大的功能和可配置、可管理能力。
1、开放性：能在所有主流平台上运行（包括windows）。
完全支持所有的工业
标准。
采用完全开放策略。
可以使客户选择最适合的解决方案。
对开发商全力支持。
2、伸缩性与并行性：并行服务器通过使一组结点共享同一簇中的工作来扩展
windows NT的能力，提供高可用性和高伸缩性的簇的解决方案。
如果windows NT不能满足需要，用户可以把数据库移到UNIX中。
Oracle 的并行服务器对各种UNIX平台的集群机制都有着相当高的集成度。
3、安全性：获得最高认证级别的ISO标准认证。
4、性能：性能最高，保持开放平台下的TPC-D和TPC-C的世界记录。
5、客户端支持及应用模式：多层次网络计算，支持多种工业标准，可以用ODB、C
JDBC、OCI等网络客户连接。
6、操作性：较复杂，同时提供GUI和命令行，在windows NT和unix 下操作相
同。
7、使用风险：长时间的开发经验，完全向下兼容。
得到广泛的应用。
完全没有
风险。
三、IBM UDB/DB2
不管是小型商业系统，还是大的银行系统，用DB2都是可以高枕无忧的。
最近推出的新版DB2 6.1 ，管理和调节工具更加卓越和便于使用。
DB2 可以运行在Intel 架构上，也可以运行在IBM的S/390 大型计算机上。
如果你所在的行业对
IBM的机器特别地称道，建议你学习IBM DB2。
1、开放性：能在所有主流平台上运行（包括windows）。
最适于海量数据。
DB2
在企业级的应用最为广泛，在全球的500 家最大的企业中, 几乎85%以上用DB2数据库服务器，而国内到97 年约占5%。
2、伸缩性与并行性：具有很好的并行性。
DB2把数据库管理扩充到了并行的、多
节点的环境。
数据库分区是数据库的一部分，包含自己的数据、索引、配置
文件、和事务日志。
数据库分区有时被称为节点安全性。
3、安全性：获得最高认证级别的ISO标准认证。
4、性能：性能较高适用于数据仓库和在线事物处理。
5、客户端支持及应用模式：跨平台，多层结构，支持ODBC、JDBC等客户。
6、操作性：操作简单，同时提供GUI和命令行，在windowsNT和unix 下操作相
同。
7、使用风险：在巨型企业得到广泛的应用，向下兼容性好。
风险小。
四、以Java 为中心的数据库-Sybase Adaptive Server Enterprise(ASE) 12.0
持多个CPU和更多的并发。
1、开放性：能在所有主流平台上运行（包括windows ）。
但由于早期Sybase
与OS集成度不高，因此VERSION11.9.2以下版本需要较多OS和DB级补丁。
在多平台的混合环境中，会有一定问题。
2、伸缩性与并行性：虽然有DB SWITCH来支持其并行服务器，但DB SWITCH在
技术层面还未成熟，且只支持版本12.5 以上的ASE S ERVE。
RDBSWITCH技术
需要一台服务器充当SWITCH，从而在硬件上带来一些麻烦。
3、安全性：获得最高认证级别的ISO标准认证。
4、性能：性能接近于SQLServer ，但在UNIX平台下的并发性要优与SQL Server 。
5、客户端支持及应用模式：C/S 结构，可以用ODBC、Jconnect 、Ct-library 等
网络客户连接。
6、操作性：较复杂，同时提供GUI和命令行。
但GUI较差，常常无法及时状态，
建议使用命令行。
7、使用风险：向下兼容, 但是ct-library 程序不益移植。
小型数据库
Access
1、完善地管理各种数据库对象，具有强大的数据组织、用户管理、安全检查等
功能。
2、强大的数据处理功能，在一个工作组级别的网络环境中，使用Access 开发
的多用户数据库管理系统具有传统的XBASE(DBAS、EFoxBASE的统称) 数据库
系统所无法实现的客户服务器(Cient/Server) 结构和相应的数据库安全机制，Access 具备了许多先进的大型数据库管理系统所具备的特征，如事务处理/ 出错回滚能力等。
3、可以方便地生成各种数据对象，利用存储的数据建立窗体和报表，可视性好。
4、作为Office 套件的一部分，可以与Office 集成，实现无缝连接。
5、能够利用Web检索和发布数据，实现与Internet 的连接。
Access 主要适
用于中小型应用系统，或作为客户机/ 服务器系统中的客户端数据库。
MySQL
MySQL是一种关联数据库管理系统，关联数据库将数据保存在不同的表中，而不
是将所有数据放在一个大仓库内，这样就增加了速度并提高了灵活性。
MySQL所使用的SQL 语言是用于访问数据库的最常用标准化语言。
MySQL软件
采用了双授权政策，它分为社区版和商业版，由于其体积小、速度快、总体拥有
成本低，尤其是开放源码这一特点，一般中小型网站的开发都选择MySQL 作为网站数据库。