1.DICOM格式数据的自编程序显示和处理实验报告

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DICOM格式数据的自编程序显示和处理实验

DICOM格式数据的自编程序显示和处理实验
❖ 第四部分:服务类规范。说明了许多服务类,服务类详细论述了作用与信息对象上 的命令及其产生的结果。
❖ 第五部分:数据结构及编码。描述了怎样对信息对象类和服务类进行构造和编码。
❖ 第六部分:数据字典。描述了所有信息对象是由数据元素组成的,数据元素的属性 及涵义。
❖ 第七部分:消息交换。定义了进行消息交换通讯的医学图像应用实体所用到的服务 和协议。
、(窗宽)
Window Center(0x0028,1050): Value
。(窗位)
➢ 采用VC++、VB、或Delphi Pascal开发平台编程读DICOM图像文件 ankle.dcm,显示图像:
➢ 采用VC++、VB、或Delphi Pascal开发平台编程读其他DICOM图像文 件(MR或Brain目录中的文件),并显示图像。
❖ 第八部分:消息交换的网络通讯支持。说明了在网络环境下的通讯服务和支 持DICOM应用进行消息交换的必要的上层协议。
❖ 第九部分:消息交换的点对点通讯支持。说明了与ACR-NEMA2.0兼容的点对 点通讯的服务和协议。
❖ 第十部分:用于介质交换的介质存储和文件格式。该部分说明了在可移动存 储介质上医学图像信息存储的通用模型。提供了在各种物理存储介质上交换 不同类型的医学图像的框架,支持封装任何信息对象定义的文件格式。
%存储信息
metadata <CR>
%显示图像元素信息
• 请找出DICOM图像中的一下元素的值:
Rows:_______、
Columns:_______、
Bits Depth:________、
PixDataGroupLength:_______。
Window Center:

Dicom医学图像与nii标签数据处理

Dicom医学图像与nii标签数据处理

Dicom医学图像与nii标签数据处理Dicom 医学图像与 nii 标签数据处理Ⅰ. Dicom医学dicom 图像就长这样dicom图像的源数据范围相当⼤,⽽转化为图像形式保存的数据则为uint8类型,直接转化会有损失,本⽂将其转为.npy形式。

Ⅱ. nii标记数据处理使⽤ITK-SNAP对dicom 图像进⾏标记同样转化为.npy格式Ⅲ. 综合数据处理1. code1使⽤本代码是在dicom数据转化为.npy格式,⽽.nii的标记数据还未进⾏转化的情况下import numpy as np import os #遍历⽂件夹import nibabel as nib #nii 格式⼀般都会⽤到这个包import imageio #转换成图像from matplotlib import pyplot as plt import cv2 def nii_to_image (niifile ): filenames = os .listdir (filepath ) #读取nii ⽂件夹 slice_trans = [] for f in filenames : #开始读取nii ⽂件 img_path = os .path .join (filepath , f ) img = nib .load (img_path ) #读取nii img_fdata = img .get_fdata () fname = f .replace ('.nii','') #去掉nii 的后缀名 #开始转换为图像 (x ,y ,z ) = img .shape for i in range (0,z ): silce = img_fdata [:, :, i ] slice_trans .append (silce ) return slice_trans def get_image_file (file_dir ): image_data = [] files = os .listdir (file_dir ) files .sort (key = lambda x :int (x [:-4])) for file in files : if os .path .splitext (file )[1] == '.npy': img_item = np .load (file_dir + file ) image_data .append (img_item ) return image_data if __name__ == '__main__': filepath = './imgData/seg12190000' label = nii_to_image (filepath ) file_dir = './Documents/dicom2npy_75989854/' image_data = get_image_file (file_dir ) imgfile = './imgData/label/' for i in range (len (image_data )): filename_item = imgfile + str (i + 1) img_item = image_data [i ] # 简单对 img 进⾏处理 img_item [img_item < 0] = 0 img_item [img_item > 512] = 512 # img_item.dtype = np.uint8 img_item = img_item .astype (np .uint8) # 不知道为什么只有这样才能整出来 label_item = label [149-i ] label_item = np .rot90(label_item , -1) label_item = np .flip (label_item , 1) # 图⽚做成三通道查看⼀下效果 img_item = cv2.merge ([img_item , img_item , img_item ]) img_item [label_item > 0] = img_item [label_item > 0] * 0.6 + (80, 0, 0) # imageio.imwrite(os.path.join(imgfile, '{}.png'.format(i)), img_item) # imageio.imwrite(os.path.join(imgfile, '{}.png'.format(i)), label_item) # 保存调试好的label, 反序 + 左右翻转 + 旋转-1*90 np .save (os .path .join (imgfile , '{}.npy'.format (i )), label_item ) print (i )12345678910111213141516171819202122232425262728293031323334353637383940414243444546474849505152535455565758596061626364652. 需要说明不知道为什么,采⽤上述博客的做法即对提取出的标记数据以silce = img_fdata[:, :, i]直接进⾏切⽚效果对不上。

DICOM文件格式与编程1

DICOM文件格式与编程1
现在举个例子:CR 图像 (DICOM Part 3, A.2.3, Table A.2-1
1. Patient IE:
a. Patient Module (参考 C.7.1.1)
2. Study IE:
a. Study Module (参考 C.7.2.1)
b. Patient Study Module (参考 C.7.2.2)
int length,
fwrite(&lComboTag, 1, sizeof(long), fp);
// Write VR
fwrite(CRDataSet[i].VR, 1, 2, fp);
if (lComboTag != 0x7fe00010)
{
fwrite(CRDataSet[i].length, 1, sizeof(short), fp);
0x7fe0, 0x0010, "OB", ' '' ', 0xffffffff // tag, VR, 长度
0xFFFE, 0x0000, 0xffffffff // Offset item begins
0x00000000 // Offset of first image = 0
0x00001000 // Offset of second image = 4096 (for example)
{
lComboTag = (CRDataSet[i].group_tag << 16) | CRDataSet[i].element_tag;
tch(lComboTag)
{
case 0x00280010:

医学成像原理实验报告

医学成像原理实验报告

实验一DICOM图像的读取和显示DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)即医学数字成像和通信,是医学图像和相关信息的国际标准。

它定义了质量能满足临床需要的可用于数据交换的医学图像格式,利用不同的灰度值实现成像。

DICOM被广泛应用于放射医疗,心血管成像以及放射诊疗诊断设备(X射线,CT,核磁共振,超声等),并且在眼科和牙科等其它医学领域得到越来越深入广泛的应用。

当前大约有百亿级符合DICOM标准的医学图像用于临床使用。

I = dicomread('CT-MONO2-16-ankle.dcm');info = dicominfo('CT-MONO2-16-ankle.dcm');I = dicomread(info);imshow(I,'DisplayRange',[]);dicomwrite(I,'ankle.dcm');info = dicominfo('CT-MONO2-16-ankle.dcm');I = dicomread(info);dicomwrite(I,'ankle.dcm',info);(2)图像读取程序如下:I = dicomread('CT-MONO2-16-ankle.dcm');imtool(I,'DisplayRange',[])info = dicominfo('CT-MONO2-16-ankle.dcm');info.SeriesInstanceUIDmax(I(:))min(I(:))Imodified = I;Imodified(Imodified == 4080) = 32;imshow(Imodified,[])2040608010012020406080100120204060801001202040608010012020406080100120204060801001202040608010012020406080100120实验二 MRI 图像显示和读取MRI 可获得人体横面、冠状面、矢状面及任何方向断面的图像,实现三维定位图像。

《医学影像DICOM的显示和处理》范文

《医学影像DICOM的显示和处理》范文

《医学影像DICOM的显示和处理》篇一一、引言医学影像在医疗诊断和治疗过程中起着至关重要的作用。

而DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)作为医学影像的标准,广泛应用于各种医疗设备和系统之间。

DICOM 的显示和处理是医疗影像工作中不可或缺的环节,它不仅要求有高质量的显示效果,还要求能进行高效的处理和解析。

本文旨在探讨医学影像DICOM的显示和处理的相关内容。

二、DICOM格式及特点DICOM是医学影像信息的国际标准,具有高度的标准化和兼容性。

它包含图像数据、患者信息、设备信息等多种内容,并以二进制格式存储。

DICOM格式的特点主要表现在以下几个方面:1. 标准化:DICOM标准为医学影像的传输、存储和交换提供了统一的规范,使得不同厂商的设备能够互相兼容。

2. 丰富性:DICOM文件包含丰富的信息,如患者信息、图像参数等,为医生提供了全面的诊断依据。

3. 兼容性:DICOM格式能够与各种医疗设备和系统进行无缝连接,方便了医疗信息的共享和交流。

三、医学影像DICOM的显示医学影像DICOM的显示是诊断过程中的重要环节。

高质量的显示效果能够提高医生的诊断准确性和效率。

在DICOM的显示过程中,需要注意以下几个方面:1. 显示设备:选择合适的显示设备是保证显示质量的关键。

常用的显示设备包括显示器、数字放射成像设备等。

这些设备应具有高分辨率、大屏幕和真实的色彩表现等特点。

2. 图像处理:图像处理包括对比度调整、亮度调整、窗口设置等操作。

这些操作能够优化图像质量,使医生能够更清晰地观察和分析图像。

3. 界面设计:界面设计应简洁明了,易于操作。

同时,应提供丰富的显示模式和选项,以满足不同医生的需求。

四、医学影像DICOM的处理医学影像DICOM的处理主要包括图像处理和数据分析两个方面。

通过对DICOM文件的处理和分析,可以提取出有用的诊断信息,为医生提供准确的诊断依据。

DICOM医学图象文件格式分析与显示实现

DICOM医学图象文件格式分析与显示实现

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2-2 !"#$% 数据集和数据元素
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影像学数据处理实训报告

影像学数据处理实训报告

一、实训背景随着医学影像技术的飞速发展,影像学数据在临床诊断、科研教学等方面发挥着越来越重要的作用。

为了提高影像学数据处理的技能,本人在某三甲医院影像科进行了为期一个月的实训,现将实训过程及收获总结如下。

二、实训目的1. 掌握影像学数据采集、传输、存储的基本流程;2. 熟悉常用影像学数据处理软件,如PACS、DICOM等;3. 学会影像学图像的预处理、增强、分割、配准等处理方法;4. 提高影像学数据分析能力,为临床诊断和科研提供有力支持。

三、实训内容1. 影像学数据采集与传输实训期间,我学习了影像学数据采集的基本流程,包括患者信息采集、设备操作、数据传输等。

在操作过程中,我掌握了PACS系统的基本操作,学会了如何将影像数据从设备传输到服务器,以及如何查询和下载所需数据。

2. 影像学数据处理软件学习实训期间,我重点学习了DICOM格式影像数据的处理。

首先,了解了DICOM标准的基本概念和特点;其次,熟悉了常用影像学数据处理软件,如PACS、ImageJ、ITK 等;最后,掌握了图像的预处理、增强、分割、配准等处理方法。

3. 影像学图像处理在实训过程中,我学习了图像预处理的基本方法,如去噪、锐化、对比度增强等。

通过实际操作,我掌握了这些方法在临床诊断中的应用,如提高图像质量、突出病变特征等。

此外,我还学习了图像分割、配准等高级处理方法,为后续的影像学数据分析奠定了基础。

4. 影像学数据分析在实训的最后阶段,我参与了影像学数据分析的实际项目。

通过查阅文献、与导师讨论,我了解了影像学数据分析的基本方法,如定量分析、定性分析等。

在实际操作中,我学会了如何使用统计软件(如SPSS、R等)对影像学数据进行分析,为临床诊断和科研提供依据。

四、实训收获1. 提高了影像学数据处理技能,为临床诊断和科研提供了有力支持;2. 深入了解了影像学数据采集、传输、存储的基本流程;3. 掌握了常用影像学数据处理软件的操作方法;4. 学会了图像预处理、增强、分割、配准等处理方法;5. 提高了影像学数据分析能力,为临床诊断和科研提供了新的思路。

DICOM医学图像文件格式解析与应用研究综述

DICOM医学图像文件格式解析与应用研究综述

DICOM医学图像文件格式解析与应用研究综述摘要:由于生产医学影像设备的国内外厂商众多,其产品遵守DICOM3.0标准的程度也各不相同,而DICOM3.0是一个不断扩充和扩展的标准,因此,在进行医学影像处理应一用开发时,一般只能针对特定厂商的设备进行数据采集和处理,不大可能开发出一个能读取和显示所有医学影像设备中的DICOM格式图像的工具软件,除非国内外所有生产医学影像设备的制造商都严格遵守DICOM3.0标准的规定。

论文主要探讨了DICOM3.0标准的产生经过及DICOM医学图像文件格式的大致组成。

通过对DICOM图像文件的剖析,基本解决了医学影像应用开发的数据接31问题,为进一步针对医学影像处理应用的研究和开发提供了数据准备。

关键词:DICOM3.0标准PACS系统医学图像文件格式The Overview of research on the File format Analysis and Application of DICOMDanni Huang (school of Tianjin Medical University,07class 2,NO.2007093107)Abstract:Becouse threre are many the production of domestic and foreign manufacturers of medical imaging equipment companies,their products for adherence to standards of the degree DICOM3.0 are different. but DICOM3.0 is expanding and the expansion of a standard. the article is mainly to discusses the generation after DICOM3.0 standard DICOM medical image file format and the general composition. Through analysis of DICOM image files, basically solved the medical imaging application development, data access 31 problem, for further processing applications for medical imaging research and development provides the data preparation.Keywords: DICOM3.0 standardization;PACS system;format of Medical image file一.引言从20世纪90年代初开始,随着计算机技术、通信技术以及网络技术的发展,图像分析和处理以及PACS(PictureArchivingandCommunicationSystem)在临床诊断、远程医疗以及医学教学中发挥着越来越重要的作用。

DICOM报告

DICOM报告

DICOM一.DICOM由来随着一个行业的兴起,必然会有各种问题的频繁出现,比如行业内部各公司各部门之间的关系,行业生产要素的冲突等等。

有了冲突就要想办法解决冲突,因此各个行业的一些组织部门制定了统一的标准,就如同IEEE的OSI标准,TCP/IP 标准,是为了统一不同互联网设备生产商的设备而制定一样,DICOM也是为了统一医学影像及其相关信息而存在。

20世纪80年代,X光机,CT,MRI等设备技术逐渐稳定,信息技术也随之发展。

此时,医学图像学与信息技术日趋结合,逐渐诞生了医学图像信息学,而PACS(Picture Archiving and Communication System)则为医学影像学与信息技术的结晶。

在此过程中,由于每个医疗设备生产厂商生产的不同,造成与各种设备有关的医学图像存储格式,传输方式千差万别,使得医学图像及其相关信息在不同系统,不同应用之间的交换收到严重阻碍。

为此ACR和NEMA联合组成委员会,推出了医学数字图像存储与通信标准即DICOM。

DICOM标准中涵盖了医学数字图像的几乎所有信息交换的协议,如采集,归档,通信,显示等。

大大简化了医学影像交换信息的实现,推动了Teleradiology System和PACS 的研究与发展,并且由于DICOM的开放性与互联性,使得与其他医学系统的集成成为可能。

DICOM与其说是个标准,更是个编码和数据传输协议。

现在医院里的CT机出来的X光胶片就是遵从这个协议编码的,其他一切也是如此,平时看到的胶片是打印出来的DICOM文件的部分数据,CT机的所有操作包括打印生成文件,传输等都是遵循DICOM协议。

二.DICOM的数据结构和编码规定DICOM格式文件包含了数字成像和通信两个方面内容。

该文件格式基于面向对象的思想,制定了一系列信息对象定义和服务对象定义,文件的数据结构和编码规则包含了数字成像和通信的真实信息。

DCM是比较常用的DICOM文件名的后缀,其他PACS软件也是用到了DCM,或是完全不适用后缀,直接就是一连串的数字或字符串命名的。

DICOM论文:DICOM格式颅脑图像解析与预处理

DICOM论文:DICOM格式颅脑图像解析与预处理

DICOM论文:DICOM格式颅脑图像解析与预处理【中文摘要】随着计算机技术和医学成像技术的快速发展,很多新的医学成像方法不断涌现,并逐步得到广泛的应用。

目前使用的大多数医疗信息设备,包括影像设备、医院信息系统等都逐步遵循医学数字成像与通信标准(DICOM)。

对DICOM标准进行分析,提取DICOM文件中的重要设备信息和技术参数,通过读取DICOM的医学数字图像并进行图像预处理,可以进一步帮助医生进行病理和病情的诊断。

所以,对DICOM标准进行分析并很好的利用,正确读取DICOM格式的医学图像并进行预处理,是开发医疗软件的基础步骤,具有较大的应用前景本文主要对医学DICOM标准进行剖析,利用集成开发工具实现了CT图像的解析和预处理。

在对DICOM格式的CT图像解析和预处理中主要完成了以下工作:第一,通过对DICOM 3.0医学数字成像与通信标准的分析,理解了DICOM文件的组织结构和编码方式。

依据DICOM文件的组织结构和编码方式,设计了CT图像的具体解析流程和方法。

第二,利用解析得到的CT图像数据和设备参数信息,对图像进行预处理。

主要包括对图像的缩放、旋转、反色和锐化等基本操作,并将操作的结果保存为BMP通用图像处理格式。

为实现三维重建,需要对CT图像进行插值。

本文分析了层间插值方法,考虑到实际应用和处理效率,采用线性插值方法,并对插值的图像数据进行横断面、矢状面和冠状面分析和显示。

利用DICOM数据,通过对图像的距离、角度和面积的测量计算完成对病人真实数据的计算,给医生提供必要的辅助诊断信息。

第三,对CT图像数据的显示技术进行研究。

由于设备所提取的医学图像像素的维数很高(0~4095),显示时需要将原始图像数据通过一定的方式映射到灰度图像(0~255)进行显示,同时,还可以通过窗宽和窗位技术实现对不同的医学组织的进一步观察。

由于人眼观察对色彩比灰度要敏感的多,通过对医学图像进行伪彩色增强显示,可以提高人眼对医学图像的识别能力。

DICOM格式医学图像及其图像信息的显示

DICOM格式医学图像及其图像信息的显示

收稿日期:2010-03-16基金项目:江苏省科技厅创新人才项目(BK2005414)作者简介:高升(1983-),男,江苏盐城人,硕士研究生,主要研究方向为DICOM 标准的应用,E-mail :gaosheng832323@ 。

DICOM 格式医学图像及其图像信息的显示高升1,葛云2(南京大学电子科学与工程学院,江苏南京210093)摘要:目的:DICOM (digital image and communication on medicine )的普及不仅提供了高效率的图像存取和使用服务,也为医院中包括图像信息在内的综合医学信息管理奠定了基础。

因此对D I C O M 格式图像显示的研究具有重要意义。

方法:首先对DICOM 医学图像文件的格式及数据编码规则进行了阐述,然后分四步具体介绍了图像及其信息的显示流程。

结果:基于Windows 平台,成功将DICOM 图像及其信息显示出来。

结论:实验证明,该方法能够较好地显示DICOM 医学图像,同时也为后续工作奠定了基础。

关键词:DICOM ;医学图像;数据编码规则DOI 编码:doi:10.3969/j.issn.1005-202X.2010.03.016中图分类号:TP317.4文献标识码:A文章编号:1005-202X (2010)03-1885-04The Display of DICOM Medical Image and Its InformationGAO Sheng 1,GE Yun 2(School of Electronics Science and Engineering,Nanjing Jiangsu 210093,China)Abstract:Objective :The popularization of DICOM not only offered high efficient service of storing and using image,but also established the foundation for the synthesis medical information management of hospitals including image information.So it is important to study on the display of DICOM medical image.Methods :Firstly this article describes the format and data encoding rules of DICOM medical image,followed by mainly introduces the display flow of image and its information by four steps.Re -sults:It is successfully realized the display of image and its information based on Windows.Conclusion :As the results show,the methods studied in the paper can preferably realize the display of DICOM image and its information,and laying a foundation for the following study.Key words:DICOM;medical image;data coding rules前言DICOM 标准是医学图像存储和传输的标准,为医学影像设备的生产厂家和用户提供了接口标准和交互协议。

医学影像系统实验PART II部分报告 U201012579 生医1002班刘志

医学影像系统实验PART II部分报告 U201012579  生医1002班刘志

医学影像系统实验PART II部分报告专业:生物医学工程*名:**学号:U*********班级:1002班邮箱:****************指导老师:张日欣(老师)完成时间:2013年6月23号实验一CT投影数据采集、反投影重建实验一、实验目的:1. 用Matlab实现模拟CT投影数据采集、反投影重建;2. 掌握反投影重建的方法步骤;3. 掌握Matlab进行模拟CT图像重建方法。

二、实验器材与设备:计算机或图形工作站、Matlab 6.5软件。

三、实验方法与步骤:(1)Matlab的Image processing工具箱中有radon、iradon和fanbeam、ifanbeam两组函数,可以分别进行对图像和体模的投影数据采集和反投影重建。

•其中radon、iradon是对对象进行平行直线束投影重建。

•Fanbeam、ifanbeam是进行扇型束投影重建,函数提供多种参数选择,如:图像和体模的灰阶,投影角度间隔,重建图像的矩阵等。

(2)本实验采用matlab 7.0版进行实验操作,选取shepp-logan图像,进行两种投影实验,获得投影数据图像和重建图像。

函数的具体功能可参看相关M文件。

四、实验要求:1.注释实验中各步骤命令。

2.记录获得的各步影像,分析函数所用的重建方法。

3.观察投影数据和重建图线,比较重建效果和伪影对图像的影响。

4.在实验各步骤中尝试选用其他参数,比较实验结果(如何提高投影和重建图像的精度)。

5.选用shepp_logan体模或自己采集一幅CT图像,进行实验。

五、实验结果显示及其分析:在m文件中输入如下程序代码:(对对象进行平行直线束投影重建)clear %清楚工作空间的所有原有变量P=phantom('Modified Shepp-Logan',256);%使用函数得到修改后的体模图像imshow(P);%显示体模图像title('Shepp-Logan体模图像');%对图像进行主题标明imwrite(P,'C:\MATLAB7\work\shepp-logan.png');%将体模图像写入到自定义的路径文件夹里进行保存%对对象进行平行直线束投影重建%CT=imread('shepp-logan.png');%读入一个图像扩展名为shepp-logan.png的图像,并将其图像矩阵赋给变量CTfigure;imshow(CT);%显示该CT图像title('CT-Shepp-Logan体模图像');%对图像进行主题标明thetal1=0:10:170;%定义一个thetal角度变量,其范围为0-170度,步长为10度thetal2=0:5:170;%定义一个theta2角度变量,其范围为0-170度,步长为5度[R1,Xp1]=radon(CT,thetal1);%对该CT图像进行rason变换,得到投影数据1[R2,Xp2]=radon(CT,thetal2);%对该CT图像进行rason变换,得到投影数据2Num_angles_R1=size(R1,2);%取矩阵R1的列数Num_angles_R2=size(R2,2);%取矩阵R2的列数N_R1=size(R1,1);%取矩阵R1的行数N_R2=size(R2,1);%取矩阵R2的行数Output_size=max(size(CT));%取CT图像矩阵中行数与列数两者的最大值figure;imagesc(thetal1,Xp1,R1);%显示该投影数据图像1title('用平行直线束投影所得到的投影数据图像1(thetal1=0:10:170)');%对图像进行主题标明figure;imagesc(thetal2,Xp2,R2);%显示该投影数据图像2title('用平行直线束投影所得到的投影数据图像2(thetal2=0:5:170)');%对图像进行主题标明Dthetal1=thetal1(2)-thetal1(1);%定义反变换1的步长Dthetal2=thetal2(2)-thetal2(1);%定义反变换2的步长I1=iradon(R1,Dthetal1,Output_size);%对图像数据1进行radon反变换I2=iradon(R2,Dthetal2,Output_size);%对图像数据2进行radon反变换figure;imshow(uint8(I1));%显示重建后的图像1title('用平行直线束投影所重建的图像1(thetal1=0:10:170)');%对图像进行主题标明figure;imshow(uint8(I2));%显示重建后的图像2title('用平行直线束投影所重建的图像2(thetal1=0:5:170)');%对图像进行主题标明%对对象进行扇型束投影重建%D=285;%将D赋值为285,表示从扇束顶点到旋转中心的像素dsensor1=0.5;%正实数指定扇束传感器的间距为0.5dsensor2=1;%正实数指定扇束传感器的间距为1dsensor3=2;%正实数指定扇束传感器的间距为2F1=fanbeam(CT,D,'FanSensorSpacing',dsensor1);%对CT图像进行fanbeam变换,得到投影数据1F2=fanbeam(CT,D,'FanSensorSpacing',dsensor2);%对CT图像进行fanbeam变换,得到投影数据2F3=fanbeam(CT,D,'FanSensorSpacing',dsensor3);%对CT图像进行fanbeam变换,得到投影数据3[F1,sensor_pos1,fan_rot_angles1]=fanbeam(CT,D,'FanSensorSpacing',dsensor1);%对CT图像进行fanbeam变换,并得到扇束传感器的位置sensor_pos1和旋转角度fan_rot_angles1[F2,sensor_pos2,fan_rot_angles2]=fanbeam(CT,D,'FanSensorSpacing',dsensor2);%对CT图像进行fanbeam变换,并得到扇束传感器的位置sensor_pos2和旋转角度fan_rot_angles2[F3,sensor_pos3,fan_rot_angles3]=fanbeam(CT,D,'FanSensorSpacing',dsensor3);%对CT图像进行fanbeam变换,并得到扇束传感器的位置sensor_pos3和旋转角度fan_rot_angles3 figure;imagesc(fan_rot_angles1,sensor_pos1,F1);%根据计算出的位置和角度展示F1的图像colormap(hot);%设置色图为hotcolorbar;%显示色栏xlabel('Fan Rotation angle(degress)');%标注x轴ylabel('Fan Sensor Position(deress)');%标注y轴title('用扇型束投影所得到的投影数据图像1(dsensor1=0.5)');%对图像进行主题标明figure;imagesc(fan_rot_angles2,sensor_pos2,F2);%根据计算出的位置和角度展示F2的图像colormap(hot);%设置色图为hotcolorbar;%显示色栏xlabel('Fan Rotation angle(degress)');%标注x轴ylabel('Fan Sensor Position(deress)');%标注y轴title('用扇型束投影所得到的投影数据图像2(dsensor1=1)');%对图像进行主题标明figure;imagesc(fan_rot_angles3,sensor_pos3,F3);%根据计算出的位置和角度展示F3的图像colormap(hot);%设置色图为hotcolorbar;%显示色栏xlabel('Fan Rotation angle(degress)');%标注x轴ylabel('Fan Sensor Position(deress)');%标注xy轴title('用扇型束投影所得到的投影数据图像3(dsensor1=2)');%对图像进行主题标明output_size=max(size(CT));%得到图像CT维数的最大值,并赋值给变量output_size Ifan1=ifanbeam(F1,D,'FanSensorSpacing',dsensor1,'Outputsize',output_size);%根据扇束投影数据F1及D,desensor1重建图像1Ifan2=ifanbeam(F2,D,'FanSensorSpacing',dsensor2,'Outputsize',output_size);%根据扇束投影数据F2及D,desensor2重建图像2Ifan3=ifanbeam(F3,D,'FanSensorSpacing',dsensor3,'Outputsize',output_size);%根据扇束投影数据F3及D,desensor3重建图像3figure;imshow(uint8(Ifan1));%显示重建图像1title('用扇型束投影所重建的图像1(dsensor1=0.5)');%对图像进行主题标明figure;imshow(uint8(Ifan2));%显示重建图像2title('用扇型束投影所重建的图像2(dsensor1=1)');%对图像进行主题标明figure;imshow(uint8(Ifan3));%显示重建图像3title('用扇型束投影所重建的图像3(dsensor1=2)');%对图像进行主题标明(1)见上述代码,均已做了注释。

《医学影像DICOM的显示和处理》范文

《医学影像DICOM的显示和处理》范文

《医学影像DICOM的显示和处理》篇一一、引言医学影像DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)标准是医疗行业广泛使用的医学影像数据交换和存储标准。

随着医疗技术的不断发展,医学影像数据在诊断和治疗中扮演着越来越重要的角色。

因此,医学影像DICOM的显示和处理技术也成为了医疗领域中不可或缺的一部分。

本文将介绍医学影像DICOM的显示和处理技术,包括其基本原理、应用场景、技术挑战以及未来发展趋势等方面。

二、医学影像DICOM的基本原理医学影像DICOM标准是一种用于医学影像数据交换和存储的国际标准。

它定义了医学影像数据的格式、编码方式和传输协议等方面,使得不同的医疗设备和系统之间能够进行数据的交换和共享。

医学影像DICOM的数据通常以二进制格式存储,包含了大量的图像信息以及与之相关的元数据信息。

这些数据可以在医疗设备、医疗信息系统和医疗影像处理软件之间进行传输和共享。

在医学影像DICOM的显示方面,其主要依赖于DICOM服务器和DICOM工作站。

DICOM服务器负责存储和管理医学影像数据,而DICOM工作站则负责接收、处理和显示这些数据。

在显示过程中,需要用到图像处理技术,如图像的读取、解码、渲染等。

此外,还需要根据不同的需求进行图像的后处理,如增强、滤波、测量等。

三、医学影像DICOM的应用场景医学影像DICOM的应用场景非常广泛,主要应用于医疗诊断、治疗计划、手术导航和医学研究等方面。

在医疗诊断中,医生可以通过DICOM工作站查看患者的医学影像数据,进行疾病的诊断和治疗方案的制定。

在治疗计划中,医生可以根据患者的影像数据制定出更加精确的治疗方案,提高治疗效果。

在手术导航中,医生可以利用医学影像数据进行手术定位和导航,提高手术的精确性和安全性。

在医学研究中,医学影像数据可以用于研究疾病的发病机制、病程进展和治疗效果等方面。

四、医学影像DICOM的技术挑战虽然医学影像DICOM的应用非常广泛,但是其技术挑战也不容忽视。

实现DICOM医学图像文件读取进度显示的方法

实现DICOM医学图像文件读取进度显示的方法

实现DICOM医学图像文件读取进度显示的方法
郭圣文
【期刊名称】《中国医疗设备》
【年(卷),期】2007(022)004
【摘要】VTK是当前可视化软件开发的最重要软件包之一,而ITK具有强大的图像处理功能.本文讨论了在Visual C++环境中,将二者有机地集成来读取DICOM文件,显示文件读取进度的方法.最后给出了程序运行结果.
【总页数】3页(P5-7)
【作者】郭圣文
【作者单位】华南理工大学生物学院,生物医学工程系,广州,510640
【正文语种】中文
【中图分类】TP391.41
【相关文献】
1.DICOM医学图像文件的信息提取及图像显示的实现 [J], 王恒;朱玉全;吴微
2.基于DICOM标准的医学图像显示与处理系统的研究与实现 [J], 邱明辉;张纪国
3.基于Visual C#语言的DICOM标准医学图像的显示和实现 [J], 杨汝;奚弘光;高建新;丁祖泉
4.用Matlab和VC++实现DICOM医学图像的显示 [J], 马婷婷
5.DICOM医学图像显示算法改进与实现 [J], 林红利;陈真诚;王伟胜
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DICOM格式颅脑图像解析与预处理的开题报告

DICOM格式颅脑图像解析与预处理的开题报告

DICOM格式颅脑图像解析与预处理的开题报告一、选题背景计算机辅助诊断(CAD)系统在医学图像诊断中已被广泛应用,其中DICOM格式图像是医学图像处理领域常见的格式之一,常用于医学领域中的诊断和治疗。

因此,对DICOM格式颅脑图像的解析与预处理对CAD系统的设计和实现具有至关重要的作用。

二、选题目的本文将探究DICOM格式颅脑图像解析与预处理的方法。

具体目的如下:1. 分析DICOM格式颅脑图像的特点和规律,提出有效的解析方法。

2. 研究颅脑图像预处理的必要性和实现方法,提高图像的准确性和分辨率。

3. 开发基于解析与预处理的CAD系统,提供更好的医学诊断服务。

三、研究内容和方法1. DICOM格式颅脑图像的特点和规律分析根据DICOM格式文件结构和颅脑图像的特点,对颅脑图像进行解析,找出其特征和规律。

主要方法为借助开源的DICOM解析库,结合颅脑图像的特点和规律,对图像进行分析。

2. 颅脑图像预处理的必要性和实现方法在对颅脑图像进行解析后,针对信噪比低、分辨率差等问题,进行预处理。

通过比较不同的预处理方法,并选取合适的方法对颅脑图像进行处理,提升图像分辨率和准确性。

3. CAD系统的设计与实现综合DICOM格式颅脑图像解析与预处理得到的结果和CAD系统的需求,进行CAD系统的设计和实现。

设计CAD系统的界面和功能,并测试其效果。

四、预期结果完成本文后,预期能够达到以下目标:1. 分析DICOM格式颅脑图像的特点和规律,并提出可行的解析方法。

2. 研究颅脑图像预处理方法,提高图像的准确性和分辨率。

3. 设计基于解析与预处理的CAD系统,提供更好的医学诊断服务。

五、研究意义本文对DICOM格式颅脑图像解析与预处理进行了深入研究,创新性的提出了基于解析与预处理的CAD系统设计方案。

完善了医学影像处理的理论与方法,提高了医学影像诊断的准确性和效率,具有一定的理论和实际应用价值。

DICOM图像文件解析及程序设计

DICOM图像文件解析及程序设计

DICOM图像文件解析及程序设计魏军;刘荣鑫;宋国兴;李金屏【期刊名称】《济南大学学报(自然科学版)》【年(卷),期】2007(021)003【摘要】分析DICOM标准,建立解析DICOM文件的模型,研究DICOM文件解析及其图像显示的方法.以DICOM3.0标准为对象,提出将DICOM文件划分为概念模型、数据模型、物理模型3个层面;以概念模型、数据模型为指导进行解析程序的设计,将物理模型与程序设计相结合进行解析程序的编程实现;利用线性/非线性两种算法对文件中的医学图像进行显示以及窗宽/窗位的调整.测试结果表明,该DICOM 文件解析程序能够完整解析DICOM3.0标准文件,显示医学图像并支持窗宽/窗位的调整.通过对标准的分析编程实现了DICOM3.0医学图像文件的解析、显示和调整.【总页数】4页(P215-218)【作者】魏军;刘荣鑫;宋国兴;李金屏【作者单位】济南大学控制科学与工程学院山东济南 250022;北京航空航天大学机器人所北京 100083;济南大学信息科学与工程学院山东济南 250022;济南大学信息科学与工程学院山东济南 250022;济南大学信息科学与工程学院山东济南 250022【正文语种】中文【中图分类】TP242.3【相关文献】1.DICOM格式医学图像及其图像信息的显示 [J], 高升;葛云2.DICOM标准医学图像文件解析及工具软件的研制 [J], 邱明辉;刘海一3.DICOM全方向M型心动图系统DICOM图像解析方法研究 [J], 许剑锋;黄立勤;林强4.DICOM文件解析及其消息传输 [J], 张元鲁;王超5.DICOM数据集研究和DICOM图像处理软件的实现 [J], 伍亚军;周正东;戴耀东因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

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读取DICOM文件;
分析关键数据元素; 显示图像。
四、实验步骤
1. 采用Matlab读取DICOM图像文件:
I=dicomread(‘ankle.dcm'); <CR>

%读取图像 %存储信息
读取和显示DICOM图像数据元素:
%显示图像元素信息
Columns:__512_____、 PixDataGroupLength:___524296____。
第七部分:消息交换。定义了进行消息交换通讯的医学图像应用实体所用到的服务 和协议。
第八部分:消息交换的网络通讯支持。说明了在网络环境下的通讯服务和支 持DICOM应用进行消息交换的必要的上层协议。 第九部分:消息交换的点对点通讯支持。说明了与ACR-NEMA2.0兼容的点对 点通讯的服务和协议。 第十部分:用于介质交换的介质存储和文件格式。该部分说明了在可移动存 储介质上医学图像信息存储的通用模型。提供了在各种物理存储介质上交换 不同类型的医学图像的框架,支持封装任何信息对象定义的文件格式。 第十一部分:介质存储应用框架。用于医学图像及相关设备信息交换的兼容 性声明。给出了心血管造影、超声、CT、核磁共振等图像的应用说明和CD-R 格式文件交换的说明。 第十二部分:用于介质交换的物理介质和介质格式。提供了在医学环境中数 字图像计算机系统之间信息交换的功能。这种交换功能将增强诊断图像和其 它潜在的临床应用。这部分说明了在描述介质存储模型之间关系的结构以及 特定的物理介质特性及其相应的介质格式。具体说明了各种规格的磁光盘, PC机上使用的文件系统和1.44M软盘,以及CD-R可刻写光盘。


支持点对点(PPP)和TCP/IP网络通讯协议。
三、实验内容
1. 采用Matlab打开DICOM图像文件、观察数据元素变量 中的信息; 2. 采用UltraEdit编辑器观察DICOM图像文件结构;
3. 分析DICOM图像文件结构,分解出DICOM各数据元素;
4. 采用VC++、VB或Delphi等开发工具之一编写程序:
metadata = dicominfo(‘ankle.dcm'); <CR> metadata <CR>
Rows:___512____、 Bits Depth:___16_____、
• 请找出DICOM图像中的一下元素的值:
Window Center:

1024

Window Width:
4095

显示DICOM图像:
%显示图像
imagesc(I); <CR>
2. 采用UltraEdit编辑器观察DICOM图像文件结构, 打开 ankle.dcm 文件;
3. 分析DICOM图像文件结构,分解出DICOM各数据元素:
DICOM文件是按照DICOM标准而 存储的医学图像文件,组成如左图 所示。 图中的SOP 指服务-对象对 (Service-Object Pair)。 一般由一个DICOM文件头和一 个DICOM数据集合组成。 DICOM数据集合是按照DICOM标 准的PS 3.5部分来编码组成的。
UltraEdit文本/十六进制编辑器
VC++2006及以上 VB6.0及以上 Delphi7.0及以上
二、实验原理
DICOM:全称是Digital Imaging Communications in
Medical 该标准包括数字医学成像和通讯两个方面。 由美国放射学院(ACR),美国国家电子制造协会( NEMA)共同制定。
这几部分文档是既相关又相互独立的。

其中规定了Patient、Study、Series、Image 四个层 次的医学图像信息结构,以及由它们组成的信息 对象(Information Object); 采用服务类客户/服务类提供者(Service Class User/Service Class Provider)概念组成的服务-对 象对(Service-Object Pair);
生物医学影像系统实验
DICOM格式数据的自编程序显示和处理
张日欣
2018年10月11日
生命科学与技术学院 实验教学中心 HTTP://115.156.250.205
V2015版
Hale Waihona Puke 一、实验目的:了解DICOM标准内容 研究DICOM图像数据结构 自编程序读取数据与显示图像
二、实验软件
Matlab 6.5版本及以上
DICOM3.0 的组成
DICOM 3.0标准随着技术的发展,不断地进行更新,目前由18部分组成:
第一部分:引言与概述。简要介绍了DICOM的概念及其组成。 第二部分:兼容性。定义了要求制造商精确地描述其产品的DICOM兼容性,即构 造一个该产品的DICOM兼容性声明,它包括选择什么样的信息对象、服务类、数 据编码方法等,每一个用户都可以从制造商处得到这样一份声明。 第三部分:信息对象的定义:定义了两类信息对象类:普通性、复合型。 第四部分:服务类规范。说明了许多服务类,服务类详细论述了作用与信息对象上 的命令及其产生的结果。 第五部分:数据结构及编码。描述了怎样对信息对象类和服务类进行构造和编码。 第六部分:数据字典。描述了所有信息对象是由数据元素组成的,数据元素的属性 及涵义。
第十三部分:点对点通信支持的打印管理。定义了在打印用户和打印提供方 之间点对点连接时,支持DICOM打印管理应用实体通信的必要的服务和协议 。点对点通信框架提供了与第8部分相同的上层服务,因此打印管理应用实体 能够应用在点对点连接和网络连接。点对点打印管理通信也使用了低层的协 议,与已有的并行图像通道和串行控制通道硬件硬拷贝通信相兼容。 第十四部分:说明了灰度图像的标准显示功能。这部分仅提供了用于测量特 定显示系统显示特性的方法。这些方法可用于改变显示系统以与标准的灰度 显示功能相匹配或用于测量显示系统与标准灰度显示功能的兼容程度。 第十五部分:安全措施 第十六部分 内容映射资源(content mapping resource)定义了标准使用的模板和 上下文组。 第十七部分 说明信息 第十八部分 由WEB接入DICOM持久对象 DICOM3标准下载
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