晶体解析与精修—其他文件

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晶体解析与精修—其他文件

name.res—结果文件(results file):xs、xl、refine产生的文件

name.lst—列表文件(listing file):记录xs、xl、refine过程和结果的文件

《Crystal Structure Refinement: A Crystallographer’s Guide to SHELXL》1一书中关于该文件描述摘录如下:

A brief summary of the progress of the structure refinement appears on the console, and a full listing is

written to a file name.lst, which can be printed or examined with any text editor. After each refinement cycle a file name.res is (re)written. The .res file is similar to the .ins file, but has updated values for all refined parameters. It may be copied or edited to name.ins for the next refinement run (Figure 1).

Figure 1. File organization in SHELXL.

《晶体结构精修——晶体学者的SHELXL软件指南》2一书中相关翻译如下:

结构精修过程的简要总结会出现在命令行窗口,而完整的叙述则写入name.lst文件,该文件可用任意文本编辑器打印和检查。每一轮精修后会产生name.res文件。它与.ins文件相似,不过所有用于精修的参数都被刷新了。name.res文件可以被拷贝或者编辑,保存成name.ins文件进入下一轮精修(Figure 1)。

name.fcf—结构因子文件

name.pcf—记录仪器型号、晶体外观等的文件

name.p4p—记录晶胞参数等的文件,与hkl联用可以省去手动输入晶胞参数的麻烦

name.tex—xcif生成的晶体结构报表文件

name.rtf—xcif生成的晶体结构报表文件,可用word打开

name_tables.html—Olex2生成的晶体结构报表文件,可用浏览器打开

name.abs—记录吸收校正信息的文件(Bruker仪器)

name._ls—其中可以找到所用衍射点和Tmax及Tmin等数据(Bruker仪器)

name.cif_old—记录仪器型号、晶胞参数及晶体外观等的文件(Rigaku仪器)

CrystalClear.cif—记录仪器型号、晶胞参数及晶体外观等的文件(Rigaku仪器)

参考文献:

[1] Müller, P.; Herbst-Irmer, R.; Spek, A. L.; Schneider, T. R.; Swaya, M. R. Crystal Structure Refinement: A Crystallographer’s Guide to SHELXL. Oxford University Press Inc. New York, 2006.

[2] Müller, P.; Herbst-Irmer, R.; Spek, A. L.; Schneider, T. R.; Swaya, M. R. 著; Müller, P. 编; 陈昊鸿译; 赵景泰校. 晶体结构精修——晶体学者的SHELXL软件指南. 北京: 高等教育出版社, 2010.

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