第九章:药物蛋白质组学
第九章 药物对免疫系统的毒性作用 大纲 2015.12.4
第九章药物对免疫系统的毒性作用主讲教师:莫雪梅2015年12月4日第一节免疫反应生物学➢免疫系统:机体为适应外界环境变化,抵御病原体和外来物质侵袭而进化形成的复杂防御体系;●免疫系统基本功能:1)免疫防御功能:阻止和清除入侵病原体及其毒素,即抗感染免疫作用;2)免疫监视功能:具有识别、杀伤并及时清除体内突变细胞,防止肿瘤发生的功能;3)免疫耐受:免疫活性细胞接触抗原性物质时所表现的一种特异性无应答状态;4)免疫调节功能:使免疫应答以最恰当的形式维持在最适当的水平;免疫系统组成⏹免疫系统:由免疫器官、免疫细胞以及免疫分子组成,散布于全身各处;免疫系统组成(一)免疫器官➢中枢免疫器官:骨髓、胸腺;骨髓:B细胞发育成熟;胸腺:T细胞发育成熟;➢外周免疫器官:淋巴结、脾(二)免疫细胞➢分类:●淋巴细胞:T细胞、B细胞、NK细胞(自然杀伤细胞)等;●免疫辅佐细胞:单核细胞、巨噬细胞、树突状细胞(DC)(提呈抗原)等;(三)免疫分子⏹免疫球蛋白;⏹补体;⏹细胞因子;(一) 免疫器官(一) 免疫器官⏹中枢免疫器官是免疫细胞产生、分化成熟的场所;而外周免疫器官是淋巴细胞分布定居和产生免疫应答的场所;➢中枢免疫器官:骨髓、胸腺;➢外周免疫器官:淋巴结、脾中枢免疫器官-骨髓⏹(1)骨髓:存在于长骨(如肱骨)的骨髓腔,扁平骨(如胸骨、肋骨)和不规则骨(如脊椎骨)的松质骨间网眼中的一种海绵状组织;⏹成年人骨髓分两种:红骨髓和黄骨髓;红骨髓含多能造血干细胞,能制造红细胞、血小板和白细胞;骨髓不但是造血器官,还是重要免疫器官;骨髓移植(造血干细胞移植)中枢免疫器官-胸腺⏹胸腺(thymus):机体重要淋巴器官,与免疫紧密相关,分泌胸腺激素及激素类物质,位于胸腔前纵隔;⏹主要功能是产生T淋巴细胞;造血干细胞经血流迁入胸腺,可增殖分化发育为成熟的T细胞。
T细胞循血流再迁移到周围淋巴结的弥散淋巴组织中,此处称胸腺依赖区;外周免疫器官-淋巴结⏹淋巴结:哺乳类特有周围淋巴器官,由淋巴细胞集合而成;呈豆形,位于淋巴管行进途中,遍布全身,是产生免疫应答重要器官之一;外周免疫器官-脾⏹脾:最大周围淋巴样器官,有造血、滤血、清除衰老血细胞及参与免疫反应等功能;因其含血量丰富,能够紧急向其他器官补充血液,有¡°人体血库¡±之称;⏹正常情况,脾只产生淋巴细胞及单核细胞,但在病态及大失血后可制造各种血细胞。
【北师大】细胞生物学-----第9章蛋白质分选与膜泡运输
信号假说
① ER转运蛋白质合成的起始。通过ER转运的蛋白合成仍然起 始于胞质溶胶中的游离核糖体。核糖体是蛋白质合成的基本 装置,它并不决定合成蛋白质的去向,合成的蛋白质何去何 从,是由mRNA决定的,也就是说是由密码决定的。
②信号序列与SRP结合。SRP的信号识别位点识别新生肽的信号 序列并与之结合; 同时,SRP上的翻译暂停结构域同核糖体的 A位点作用, 暂时停止核糖体的蛋白质合成。
蛋白质氨基末端的信号序列除了作为信号被SRP识别外, 还具有起始穿膜转移的作用。
可切除(信号肽酶作用位点)
2.内部信号序列(internal signal sequence)
不位于N-末端,但具信号序列的作用,故称为内含信号序列 。
可作为蛋白质共翻译转移的信号被SRP识别,同时它也是起 始转移信号。
③SRP受体(SPR receptor),是膜的整合蛋白,为异二聚体蛋白, 存在于内质网上,可与SRP特异结合。
④停止转移序列(stop transfer sequence),肽链上的一段特 殊序列,与内质网膜的亲合力很高,能阻止肽链继续进入内质 网腔,使其成为跨膜蛋白质。
⑤转位因子(translocator),由3-4个Sec61蛋白复合体构成的 一个类似炸面圈的结构,每个Sec61蛋白由三条肽链组成。
因停止转移信号的作用而形成单次跨膜的蛋白,那么该蛋白
在结构上只有一个停止转移信号序列,没有内含转移信号, 但在N-端有一个信号序列作为转移起始信号。
该蛋白在N-末端信号序列的作用下进行共翻译转运,当停止转移信号进入通道后,与 通道内的结合位点相互作用,使通道转运蛋白失活,从而停止蛋白质的转运。由于N末端的信号序列是可切除的,信号序列被切除后形成单次跨膜蛋白。
分子生物学第九章--分子生物学研究方法电子教案精选全文
可编辑修改精选全文完整版•第九章分子生物学研究方法1.课程教学内容(1)核酸技术1—基本操作(2)核酸技术2—克隆技术(3)核酸技术3—测序(4)基因表达和表达分析基因定点诱变(5)蛋白质与核酸的相互作用(6)其他(热点)技术2.课程重点、难点基因克隆技术、杂交技术、测序技术、蛋白质与核酸的相互作用检测技术3.课程教学要求掌握基因克隆技术、杂交技术、测序技术、蛋白质与核酸的相互作用检测等各种技术的原理。
本章内容•核酸的凝胶电泳•DNA分子的酶切割•核酸的分子杂交•基因扩增•基因的克隆和表达•细菌的转化•DNA核苷酸序列分析•蛋白质的分离与纯化•研究DNA与蛋白质相互作用的方法一、核酸的凝胶电泳基本原理:当一种分子被放置在电场当中时,它们会以一定的速度移向适当的电极。
电泳的迁移率:电泳分子在电场作用下的迁移速度,它同电场的强度和电泳分子本身所携带的净电荷成正比。
由于在电泳中使用了一种无反应活性的稳定的支持介质,如琼脂糖和丙烯酰胺,从而降低了对流运动,故电泳的迁移率又同分子的摩擦系数成反比。
在生理条件下,核酸分子的糖-磷酸骨架中的磷酸基团,是呈离子化状态的。
从这个意义上讲,DNA和RNA的多核苷酸链可叫做多聚阴离子,因此,当核酸分子放置在电场中时,它就会向正极移动。
在一定的电场强度下,DNA分子的这种迁移率,取决于核酸分子本身大小和构型。
分子量较小的DNA 分子,比分子量较大的分子,具有较紧密的构型,所以其电泳迁移率也就比同等分子量的松散型的开环DNA分子或线性DNA分子要快些。
Gel matrix (胶支持物) is an inserted, jello-like porous material that supports and allows macromolecules to move through.Agarose (琼脂糖):(1) a much less resolving power than polyacrylamide,(2)but can separate DNA molecules of up to tens of kbDNA can be visualized by staining the gel with fluorescent dyes, such as ethidium bromide (EB 溴化乙锭)Polyacrylamide (聚丙稀酰胺):(1)has high resolving capability, and can resolve DNA that differfrom each other as little as a single base pair/nucleotide.(2)but can only separate DNA over a narrow size range (1 to a fewhundred bp).Pulsed-field gel electrophoresis (脉冲电泳)(1)The electric field is applied in pulses that are orientedorthogonally (直角地) to each other.(2)Separate DNA molecules according to their molecule weight, as wellas to their shape and topological properties.(3)Can effectively separate DNA molecules over 30-50 kb and up toseveral Mb in length.二、DNA分子的酶切割Restriction endonucleases (限制性内切酶) cleave DNA molecules at particular sitesRestriction endonucleases (RE) are the nucleases that cleave DNA at particular sites by the recognition of specific sequences.RE used in molecular biology typically recognize (识别) short (4-8bp) target sequences that are usually palindromic (回文结构), and cut (切割) at a defined sequence within those sequences. e.g. EcoRIThe random occurrence of the hexameric (六核苷酸的) sequence: 1/4096 (4-6=1/46)(1) Restriction enzymes differ in the recognition specificity: target sites are different.(2) Restriction enzymes differ in the length they recognized, and thus the frequencies differ.(3) Restriction enzymes differ in the nature of the DNA ends they generate: blunt/flush ends (平末端), sticky/staggered ends (粘性末端).(4) Restriction enzymes differ in the cleavage activity.三、核酸的分子杂交原理:带有互补的特定核苷酸序列的单链DNA或RNA,当它们混合在一起时,其相应的同源区段将会退火形成双链的结构。
第9章 药物蛋白质组学
20世纪中期以来, 随着DNA 双螺旋结构的提出和 蛋白质空间结构的X射线解析, 开始了分子生物学 时代。 20 世纪90年代初期, 美国生物学家提出并实施了 人类基因组计划( human genome project, HGP), 预计在15年内投入30亿美元, 希望在分子水平上 破译人类所有的遗传信息. 2003年4月14日,美国人类基因组研究项目首席科 学家Collins F 博士在华盛顿隆重宣布: 人类基 因组序列图绘制成功。
生命现象的主要体现者是蛋白质, 而蛋白质有其自身的特定活动规律,仅仅从 基因的角度来研究是远远不够的, 必须研究由基因转录和翻译出蛋白质的过 程,才能真正揭示生命现象的本质和规律。
后基因组时代
在后基因组时代, 研究的重心已从揭示生命 的所有遗传信息转移到在整体水平上对生物 功能的研究。
转向的第一个标志——产生了功能基因组学 的新学科。 另一个标志——产生了一门在整体水平上研 究细胞内全部蛋白质组成及其活动规律的新 兴学科—蛋白质组学。
二、蛋白质学的分类
1、表达蛋白质组学
是研究差异样品间蛋白质表达量的变化
。
2、结构蛋白质组学
又称细胞图谱蛋白质组学,
针对某一特定细胞器中全部蛋白质或蛋白 质复合体的结构进行分析,确定它们在细 胞质中的定位,了解蛋白质之间的相互关 系。
3、功能蛋白质组学
对蛋白质间、蛋白质与DNA/RNA 间 的相互作用及蛋白质翻译后修饰的研 究。
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第二节 药物蛋白质组学及应用
一、概述
二、药物蛋白质学应用
三、蛋白质组学在药物不良反应研究中的应用 四、蛋白质组学在中药研究中的应用 五、蛋白质组学研究的展望
生物制药复习题
第一章绪论1、生物药物广泛应用于医学各领域,按功能用途可分为三类,分别是()、()、()2、生物技术制药发展历程经历了飞速发展的四个十年,分别是()、()、()、()。
3、生物技术所含的主要技术范畴有()、()、()、()、()、()、()、()和()。
4、下列哪个产品不是用生物技术生产的()A 青霉素B 淀粉酶C 乙醇D 氯化钠5、我国科学家承担了人类基因组计划()的测序工作A 10%B 5%C 1%D 7%6、生物技术7、生物技术药物8、生物技术制药第二章基因工程制药1、基因工程药物制造的主要步骤是:()、()、()、()、()、()。
2、目的基因获得的主要方法是()、()、()、()。
3、基因表达的微生物宿主细胞分为2大类。
第一类为(),目前常用的主要有();第二类为(),常用的主要有()。
4、基因工程药物的分离纯化一般不应超过5个步骤,包括()、()、()、()和()。
5、在基因工程药物分离纯化过程中,基因重组蛋白的分离比较困难,可用()、()、()、()的方法,达到初步分离的目的。
6、人工化学合成DNA新形成的核苷酸链的合成方向是(),合成的DNA 5’末端是(),3’末端是()。
7、凝胶过滤法是依赖()来分离蛋白组分A、分子大小B、带电状态C、分子质量D、解离状态8、可用于医药目的的蛋白质和多肽药物都是由相应的()合成的A RNAB 基因C 氨基酸D 激素9、用反转录法获得目的基因,首先必须获得() P13cDNA文库法A tRNAB cDNAC rRNAD mRNA10、那一类细菌不属于原核细胞()A 大肠杆菌B 枯草芽孢杆菌C 酵母D 链霉菌11、基因工程菌的生长代谢与()无关A 碳源B RNA聚合酶C 核糖体 D产物的分子量12、基因工程菌的高密度发酵过程中,目前普遍采用()作为发酵培养基的碳源A 葡萄糖B 蔗糖C 甘油 D甘露醇13、下列那种色谱方法是依据分子筛作用来纯化基因工程药物()A 离子交换色谱B 亲和色谱C 凝胶色谱 D气相色谱简答:1、基因工程制药的概念?2、什么是载体?载体主要有哪几种?3、质粒载体的三种构型是什么?质粒载体的性质?用于克隆表达质粒载体的三个要素是什么?4、目的基因常用的制备方法有哪四种?这四种方法的基本步骤是什么?5、影响目的基因与载体之间的连接效率的主要因素是什么?6、重组DNA导入宿主细胞常用的四种方法是什么?7、什么是重组子?重组子删选与鉴定的5种方法是什么?8、重组蛋白的四种主要的分离技术?重组蛋白四种主要的纯化技术?9、分离纯化工艺应遵循的原则?10、基因工程药物的改造目的及改造思路是什么?11、定点突变的三种类型?12、基因工程的质量控制要点?13、蛋白质含量测定的5种方法?14、什么是蛋白质的等电点?等电聚焦法的原理?15、大肠杆菌表达系统的优缺点。
生物化学第九章蛋白质分解代谢
CH3 CHNH2 COOH
丙氨酸
COOH CH2 CHNH2 COOH
天冬氨酸
COOH + (CH2)2
C=O COOH α-酮戊二酸
COOH
+
(CH2)2
C=O
COOH
α-酮戊二酸
ALT AST
CH3 C=O COOH
丙酮酸
COOH
+ (CH2)2 CHNH2 COOH 谷氨酸
COOH CH2 C=O COOH
O H 酪胺
O H β-羟酪胺
(二) 氨的生成
未被吸收的氨基酸 渗入肠道的尿素
肠道细菌 脱氨基作用
尿素酶
氨 (ammonia)
• 降低肠道pH,NH3转变为NH4+以铵盐形式排出,可减少氨的吸收,这是酸性灌肠的依据。
(三)其它有害物质的生成
酪氨酸 半胱氨酸 色氨酸
苯酚 硫化氢 吲哚
第三节 氨基酸的一般代谢
生糖氨基酸
生酮氨基酸
生糖兼生酮 氨基酸
分类 生糖氨基酸 生糖兼生酮氨基酸 生酮氨基酸
生糖和生酮氨基酸种类
氨基酸 甘氨酸、丙氨酸、丝氨酸、精氨酸、脯氨酸、谷氨 酸、谷氨酰胺、苏氨酸、缬氨酸、组氨酸、甲硫氨 酸、半胱氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺
苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、异酸脱氢酶
NAD+ NADH+H+ (NADP+ NADPH+H+)
+H2O -H2O
3.谷氨酸脱氢酶的特点: ⑴活性高、分布广,(肌肉中活性很低) ⑵催化的反应可逆,逆过程可合成谷氨酸
4.氧化脱氨基作用的局限性: 仅谷氨酸经此脱氨
(三)联合脱氨基作用
2024-药物分析第九章
血浆的制备: 采集的静脉血液置含有抗凝剂的试管中,混
合后,以2500~3000r/min离心5~10min使 与血球别离,所得淡黄色上清液即为血浆。
抗凝剂—最常用的是肝素,其它抗凝剂EDTA、 枸橼酸盐、草酸盐等
血清的制备 采集的静脉血液置试管中,于37℃或室温放 置30min~1h。血液凝固后,用细竹棒或玻璃 棒 轻轻剥去试管壁上的血饼,再在2500~3000 r/min离心5~10min,上层淡黄色液体即为血 清
之间的关系; ③样品易于获取,便于处理、分析。 样品的贮存和稳定性
一、样品的采集
生 物
脏器组织
样 品
体液
血液、尿液、唾液、毛发、乳汁、 精液、脑脊液、泪液、胆汁、
胃液、胰液、淋巴液、粪便等
血液(血浆、血清)—表达药物浓度和治疗作用之间的关系 ——最常用的生物样本
〔一〕血样 因血液中药物浓度可以较好地表达药物浓度
被测定的药物和代谢物的浓度或活性极低; 样品复杂,干扰物多,大多需要别离和净化; 样品量少,不易重新获得; 在毒物学检测中要求能很快地提供结果; 分析方法具有类型多样化和综合性。
分析方法的新要求
药物服用的剂量越来越小、体液中药物浓度越来越低,对体内药物分析方法提出 了新的要求: 1. 检测方法的高灵敏度——最低检测量10-9-10-7g或10-15-10-12g 2. 别离方法的高选择性、高专属性。为满足各项要求,最常用的分析方法有 ①光谱法——比色法、紫外分光光度法、荧光分光法、原子吸收分光光度法 ②色谱法——TLC、GC、HPLC〔柱切换、手性药物〕、HPCE〔high-performance capillary electrophoresis高效毛细管电泳法 〕 ③免疫分析法——RIA放射免疫法、EIA酶免疫法、化学发光酶免疫、荧光免疫分析 ④联用技术——GC-MS、LC-MS
《动物生物化学》第九章蛋白质的生物合成试卷
8、核糖体循环:在翻译起始复合体形成的基础上,活化氨基酸在核蛋白体上反复翻 译 mRNA 上的密码并缩合生成多肽的循环反应过程。
院系 动物科技学 院
年级
专业 动物医学
姓名
学号
考试课程 动物生物化 学
《动物生物化学》第九章蛋白质的生物合成
题号
一
得分
二
三 四 五 六 七 八 总分
一、 名词解释
1、翻译(translation)是指以 mRNA 为“模板”、以各种氨基酸为原料合成蛋白质的过程。 2、S-D 序列:在翻译起始密码子 AUG 的上游,相距约 8—13 个核苷酸处,有一段由 4-9 个核 苷酸组成的富含嘌呤的序列。这一序列以 AGGA 为核心,因其发现者是 Shine-Dalgarno 而得 名 。 mRNA 上的 S-D 序列又称为核蛋白体结合位点 3、开放阅读框:从起始密码子开始,是 DNA 序列中具有编码蛋白质潜能,一段无终止密码 子打断的碱基序列。
合成的多肽链一级结构改变。
18、氯霉素能与核糖体 50S 亚基结合,抑制 转肽 酶活性,从而抑制蛋白质合成。
19、促进蛋白折叠功能的两种酶是 蛋白二硫键异构酶 和 肽-脯氨酰顺反异构酶。
20、结合蛋白是在 细胞内质网 及 高尔基体 中完成结合辅基等加工修饰的。
三、单项选择题
1.哺乳动物核糖体大亚基的沉降常数是:( D )
A.40S B.70S C.80S D.60S
2.多肽链的氨基酸序列取决于:( A )
A.mRNA
药物蛋白质组学
第一个反义药物:福米韦生 (fomivirsen)
1998年,美国FDA批准,由21个硫代脱氧核苷酸组成。通过抑制人类巨细胞病毒(CMV)mRNA发挥抗病毒作用。
3
2
1
4
01
02
03
04
siRNA药物
概述(概念、分类、主要技术)
药物蛋白质组学及应用 第九章 药物蛋白质组学 (Phamacoproteomics)
单核苷酸多态性(SNP)、单体型、检测技术
遗传变异与药物应答
基因分型指导合理用药
药物基因组学与新药研发、个性化用药
第八章 药物转录组学
反义药物
siRNA药物与基因失活性治疗
第九章 药物蛋白质组学
主要研究技术
药物蛋白质组学的应用
药靶候选基因的鉴定
反义药物和siRNA药物 包括:反义DNA、 反义RNA、 核酶 反义药物:通过与靶DNA 或 mRNA 互补杂交,阻止或抑制靶基因表达,发挥治疗作用的药物。
第二节 转录组学在药学中的应用
反义药物特点:
新的化学物质(核酸); 新的药物受体(DNA或mRNA); 新的结合方式(碱基配对 );新的结合后反应(降解靶RNA)。
名词解释:3分/题,10题
填空题:1分/空,20空
论述题:10分/题,3题
案例分析题:20分/题,1题
考试题型
基因、基因组、基因组学 病毒、原核生物、真核生物基因组特点 重叠基因、操纵子、断裂基因、基因家族;顺式作用元件、反式作用因子、启动子
人类基因组计划
第一章 基因与基因组
核酸分子杂交:核酸探针
1
2
第二篇 药学分子生物学应用
一、蛋白质组学(proteomics) 蛋白质组 (Proteome): 一种细胞、某一特定组织或个体所表达的全部蛋白质。 蛋白质组学 (Proteomics):从整体水平研究蛋白质组成、表达水平、翻译后修饰、相互作用的学科。
智慧树知到《药物设计学》章节测试答案
第一章1、药物作用的靶点可以是A:酶、受体、核酸和离子通道B:细胞膜和线粒体C:溶酶体和核酸D:染色体和染色质正确答案:酶、受体、核酸和离子通道2、属于生物大分子结构特征的是A:多种单体的共聚物B:分子间的共价键结合C:分子间的离子键结合D:多种单体的离子键结合正确答案:多种单体的共聚物3、药物与靶点发生的相互作用力主要是A:分子间的共价键结合B:分子间的非共价键结合C:分子间的离子键结合D:分子间的水化作用正确答案:分子间的非共价键结合4、生物膜的基本结构理论是A:分子镶嵌学硕B:微管镶嵌学硕C:流动镶嵌学说D:离子通道学说正确答案:流动镶嵌学说5、影响药物生物活性的立体因素包括A:立体异构B:光学异构C:顺分异构D:构象异构正确答案:立体异构,光学异构,顺分异构,构象异构第二章1、哪些信号的分子的受体属于细胞膜离子通道受体A:甾体激素B:乙酰胆碱C:5-羟色胺D:胰岛素正确答案:乙酰胆碱2、 cAMP介导的内源性调节物质有A:5-羟色胺B:乙酰胆碱C:胰岛素D:促肾上腺皮质激素正确答案:促肾上腺皮质激素3、胞内信使cAMP和cGMP是由哪种酶分解灭活的A:蛋白酶B:胆碱酯酶C:单胺氧化酶D:磷酸二酯酶正确答案:磷酸二酯酶4、维生素D是哪类受体的拮抗剂A:VDRB:PRC:ARD:PPARγ正确答案: VDR5、信号分子主要由哪些系统产生和释放A:心脑血管系统B:神经系统C:免疫系统D:内分泌系统正确答案:神经系统,免疫系统,内分泌系统第三章1、下列哪种氨基酸衍生物是苯丙氨酸类似物A:四氢异喹啉-3-羧酸B:2-哌啶酸C:二苯基丙酸D:焦谷氨酸E:1-氮杂环丁烷-2-羧酸正确答案:2、下列属于肽键(酰胺键)的电子等排体的是A:硫代丙烷B:氟代乙烯C:卤代苯D:乙内酰脲E:二硫化碳正确答案:3、维系肽的二级结构稳定的主要键合方式是A:离子键B:氢键C:酰胺键D:二硫键E:共价键正确答案:4、属于下丘脑的释放激素和释放抑制激素的主要活性肽是A:降钙素B:胰高血糖素D:血管紧张素E:促肾上腺皮质激素正确答案:5、当多肽的一个或几个酰胺键被电子等排体取代得到的肽类似物又被称为A:类肽B:二肽C:神经肽D:内啡肽E:α-螺旋模拟物正确答案:第四章1、快速可逆性抑制剂中既与酶结合,又与酶-底物复合物结合的抑制剂称为A:反竞争性抑制剂B:竞争性抑制剂C:非竞争性抑制剂D:多靶点抑制剂E:多底物类似物抑制剂正确答案:2、非共价键结合的酶抑制剂以不同的动力学过程与靶酶结合,遵循米氏方程的是A:快速可逆结合C:不可逆结合D:紧密结合E:缓慢-紧密结合正确答案:3、为了增加药物与酶之间的疏水结合,可引入的基团是A:甲氧基B:羟基C:羧基D:烷基E:磺酸基正确答案:4、底物或抑制剂与酶活性位点的作用力包括A:静电作用B:范德华力C:疏水作用D:氢键E:阳离子-π键正确答案:5、作为药物的酶抑制剂应具有以下特征A:对靶酶的抑制作用活性高B:对靶酶的特异性强C:对拟干扰或阻断的代谢途径具有选择性D:有良好的药物代谢和动力学性质E:代谢产物的毒性低正确答案:第五章1、下列物质中,哪种物质直接参与了核酸从头合成中嘧啶碱基的合成A:二氧化氮B:谷氨酸C:天冬氨酸D:甘氨酸E:丙氨酸正确答案:2、核酸的生物合成中,胞嘧啶核苷酸是经以下哪种物质转化生成的A:尿嘧啶B:尿嘧啶核苷C:尿嘧啶核苷酸D:尿嘧啶核苷二磷酸E:尿嘧啶核苷三磷酸正确答案:3、下列抗病毒药物中,属于碳环核苷类似物的是A:阿巴卡韦C:西多福韦D:去羟肌苷E:阿昔洛韦正确答案:4、下列抗病毒药物中,属于无环核苷磷酸酯类化合物的是A:泛昔洛韦B:喷昔洛韦C:更昔洛韦D:阿昔洛韦E:西多福韦正确答案:5、 siRNA的单恋长度一般为多少个核苷酸A:13-15B:15-17C:17-19D:19-21E:21-23正确答案:第六章1、药物在没得作用下转变成极性分子,再通过人体系统排出体外的生物转化过程称为B:药物分布C:药物代谢D:药物排泄正确答案:2、通常前药设计不用于A:提高稳定性,延长作用时间B:促进药物吸收C:改变药物的作用靶点D:提高药物在作用部位的特异性正确答案:3、本身没有生物活性,经生物转化后才显示药理作用的化合物称为A:前药B:软药C:硬药D:靶向药物正确答案:4、匹氨西林是半合成的广谱抗生素氨苄西林的前药,其设计的主要目的是A:降低氨苄西林的胃肠道刺激性B:增加氨苄西林的胃肠道刺激性C:增加氨苄西林的水溶性,改善药物吸收D:增加氨苄西林的脂溶性,促进氨苄西林的吸收5、按照前药原理常用的结构修饰方法有A:酰胺化B:成盐C:环合D:醚化E:电子等排正确答案:第七章1、普鲁卡因的酯基被替换成了下列哪个基团而开发成了抗心律失常药普鲁卡因胺?A:酰胺B:亚胺C:醚D:硫酯正确答案:2、非经典的生物电子等排体不包括A:环与非环结构及构象限制B:构型转换C:可交换的基团D:基团的反转正确答案:3、狭义的电子等排体是指()都相同的不同分子或基团A:原子数B:电子总数C:电子排列状态D:极性正确答案:4、非经典的电子等排体是指原子或基团不一定相同,但()及其他性质与母体化合物是相似的分子或基团A:摩尔质量B:空间效应C:电性D:溶解性正确答案:5、下列哪个选项属于Me-too药物的专利边缘的创新策略A:改变粒度B:局部化学结构进行改造C:随机筛选D:引入杂原子正确答案:第八章1、关于孪药下列说法不正确的是A:可分为同孪药和异孪药B:同孪药均为对称分子C:异孪药为不对称分子D:可减少各自的毒副作用E:是前药的一种形式正确答案:2、关于多靶点药,下列说法不正确的是A:HAART鸡尾酒疗法为多药单靶点药B:多组分药物为多药单靶点药C:单药多靶点药物的最大特点是其对多个靶点的低亲和力相互作用D:单药多靶点药是指单体药物可以与体内的多个药物靶点发生相互作用进而产生生物学活性E:单药多靶点药为严格意义上的多靶点药物正确答案:3、多靶点药物的设计方法不包括A:药效团连接法B:药效团叠合法C:电子等排替换法D:筛选法E:从天然产物中发现正确答案:4、孪药的连接方式包括A:直接结合B:连接链模式C:重叠模式D:电子等排替换模式E:聚合模式正确答案:5、孪药可作用于A:酶B:受体C:核酸D:酶和受体E:离子通道正确答案:第九章1、组合化学是利用一些基本的小分子单元通过化学或生物合成的方法,反复以哪种键合方式装配成不同的组合A:离子键B:共价键C:分子间作用力D:氢键正确答案:2、通过()可以从大量可能具有药物活性的分子结构中找到能够被预测到具有所需的理化性质和生物活性的结构。
第九章 蛋白质结构分析
全β-折叠蛋白质
人晶状体蛋白(上图c, d)和大肠杆菌NANC离子通道蛋白(下图f)
a-螺旋/β-折叠蛋白质
细胞表面标志蛋白CD98(图d)及糖酵解的绝大多数酶蛋白 (图a)
a-螺旋+β-折叠类蛋白质
人TBP与双螺旋DNA复合物(1CDW.pdb)
(四)四级结构的主要类型和特征
有独立三级结构的单元通过非共价键聚集成的非共价 复合物称为四级结构,其所含独立三级结构单位为亚 基(subunit)。形成四级结构全部依靠非共价键相互 作用,且来自不同亚基的二级结构间可发生强的相互 作用以稳定四级结构,如生成跨亚基的更大β折叠结 构或α螺旋聚集体;其中,氢键、疏水相互作用和静 电作用是主要维持力。为了形成稳定的四级结构,必 然要求相互作用的任两个蛋白质间在空间外形互补以 增加接触面且理化性质互补。这些特征也是预测蛋白 质间相互作用时有用的辅助判据。
(1)主链骨架围绕中心轴盘绕形成右手螺旋; (2)螺旋每上升一圈是3.6个氨基酸残基,螺距为 0.54nm; (3)相邻螺旋圈之间形成许多氢键; (4)侧链基团位于螺旋的外侧。
2. β折叠(βsheets) 的结构特征为:
(1)若干条肽链或肽段平行或反平行排列成片; (2)所有肽键的C=O和N—H形成链间氢键; (3)侧链基团分别交替位于片层的上、下方。
3. 蛋白质三级结构中二级结构的折叠和组装
按二级结构组装模式对蛋白质进行分类对解析蛋 白质高级结构形成规律和预测蛋白质功能有重要 帮助。蛋白质二级结构组装模式主要是全α螺旋 、全β折叠、α螺旋/β折叠,还有少量α螺旋+β 折叠类。
全a-螺旋蛋白质
人血清白蛋白(上图a,b)和细菌视紫红质(下图 a-c)
人细胞珠蛋白(2DC3.pdb)的第121到140位残基 对应的a-螺旋侧面和顶部(N端)视图
执业药师《药学专业知识二》记忆口诀:第九章
学习攻略—收藏助考锦囊系统复习资料汇编考试复习重点推荐资料百炼成金模拟考试汇编阶段复习重点难点梳理适应性全真模拟考试卷考前高效率过关手册集高效率刷题好资料分享学霸上岸重点笔记总结注:下载前请仔细阅读资料,以实际预览内容为准助:逢考必胜高分稳过执业药师《药学专业知识二》记忆口诀:第九章抗菌药物1.青霉素【适应证】①G+球菌——A组和B组溶血性链球菌、肺炎链球菌、对青霉素敏感金黄色葡萄球菌;草绿色链球菌和肠球菌属所导致的心內膜炎(与氨基糖苷类联合应用);②G+杆菌——梭状芽孢杆菌——破伤风、气性坏疽、白喉、放线菌病;③G-球菌——流行性脑脊髓膜炎;④螺旋体——鼠咬热、梅毒、钩端螺旋体病、奋森(Vincent)咽峡炎。
青霉素·记忆口诀废草溶了长葡萄,白喉破气放心瞧。
勾搭梅毒鼠咬奋,上面还能治流脑。
2.苄星青霉素——预防风湿热;控制链球菌感染。
【记忆口诀】——变脸易得风湿热。
3.半合成青霉素青V耐酸口服好爽,产酶奈苯甲氟氯双。
阿莫氨苄阴阳都强,羧苄哌拉铜绿能抗,阿洛美洛还有替卡。
①天然青霉素——青霉素、普鲁卡因青霉素、苄星青霉素——不耐酸、不耐青霉素酶,抗菌谱较窄;②青霉素V——耐酸的口服青霉素;③甲氧、苯唑、氯唑、双氯、氟氯、萘夫-西林——耐青霉素酶类,对产青霉素酶的金黄色葡萄球菌有较好作用;④氨苄、阿莫-西林——广谱,作用于G+菌以及部分G-杆菌,如大肠埃希菌、奇异变形杆菌、沙门菌属、志贺菌属和流感嗜血杆菌等;⑤羧苄、哌拉、阿洛、美洛、替卡-西林——抗某些G-杆菌包括铜绿假单胞菌。
4.头孢分代一头孢唑林、拉定、氨苄、羟氨苄、噻吩、硫脒二头孢呋辛、孟多、替安、克洛、丙烯三头孢他啶、哌酮、曲松、甲肟、噻肟、克肟、泊肟、唑肟、匹胺、他美、地尼四头孢吡肟、匹罗四代头孢——记忆口诀因为喝了留下米粉,氨苄坐林一定拉肚。
夫妻辛苦替俺克丙,梦多。
三代太多不记啦!四匹骡子比谁更污?5.【引起双硫仑反应的药物·口诀】头孢(7)——哌酮、孟多、替安、匹胺、尼西、甲肟+曲松;7个头孢——派孟多替俺劈了你家曲松!6.第二代大环内酯类抗菌药物——阿奇霉素、罗红霉素、克拉霉素;【口诀】啊!罗红结婚,克拉钻戒!7.抑制细菌蛋白质合成:30而立四环素,红绿林利50载!8.大环内酯类典型不良反应(1)胃肠道反应——呕吐、腹胀、腹痛、腹泻,抗生素相关性腹泻等,严重时难以耐受。
第九章_药物遗传学
药物基因组学与基因 单核苷酸多态性( 单核苷酸多态性(SNPs)分析 )
消化道腺癌5-FU化疗敏感性与亚甲基四氢叶酸还原酶 例:消化道腺癌 化疗敏感性与亚甲基四氢叶酸还原酶 (methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR) 基因 ) 基因C677T 多态性的关系 核酸切除修复(NER)系统ERCC2(即XPD)基因 核酸切除修复( )系统 ( ) Lys751Gln(A C)、 )、Asp312Asn(G A)、 )、C156A ( )、 ( )、 ),XRCC1基因 基因Arg399Gln(G A)与铂类 (silent, C A), ), 基因 ( )与铂类 药物的化疗敏感性 的化疗敏感性。 药物的化疗敏感性。 二氢嘧啶脱氢酶活性与5-FU毒性之间的关系。 毒性之间的关系 二氢嘧啶脱氢酶活性与 毒性之间的关系。
药物代谢相关蛋白的多态性与药物反应的关系
基因座 表型 药物
异烟肼 氨苯砜
反应改变
减慢, 减慢,毒性神经炎 减慢, 减慢,膀胱癌
N-乙酰转移酶 乙酰化加快 - 或减慢 二氢嘧啶 脱氢酶 灭活降低
5-氟尿嘧啶 增强毒性作用 - 药物反应发生改变 对哮喘的控制作用 减弱 治疗效果的多样性 耐药
儿茶酚-O-甲基 甲基化水平增 左旋多巴 甲基 儿茶酚 转移酶 高或减低 甲基多巴 2肾上腺素受体 下调作用增强 沙丁胺醇 肾上腺素受体 5-羟色胺受体 羟色胺受体 多药耐药相关 蛋白 可变的多态性 录氮平 阿霉素, 肿瘤细胞高表 阿霉素,长 春新碱等 达
G6PD缺乏者可诱发贫血的药物 G6PD缺乏者可诱发贫血的药物
药物类别
1. 抗疟药 2. 解热镇痛药 3. 呋喃类 4. 磺胺类 5. 砜类 6. 其它
第09章 蛋白质的降解与氨基酸代谢
5. 脱酰氨作用
二、脱羧基作用
体内部分L-AA可在脱羧酶作用下,脱羧生成相应的 一级胺。生物体内广泛存在脱羧酶,其辅酶为磷酸吡 哆醛,但是His脱羧酶无需要辅基(生成组胺)。脱 羧酶的专一性很高,一般一种AA对应一种脱羧酶。
直接脱羧基作用:
氧化脱羧基作用:
*多巴进一步氧化可生成聚合物黑素。人体皮肤的表皮基 底层及毛囊中存在黑素细胞,能将酪氨酸转变为黑素 ,使皮肤和毛发呈现黑色。 *帕金森病人因中枢神经递质多巴胺的减少表现出颤抖等 症状。
Choline
第九章 蛋白质的降解与 氨基酸代谢
第三节 氨和氨基酸的生物合成
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
一、氮素循环
二、生物固氮
指大气中的分子氮 分子氮在某些微生物体内固氮酶的作用下 分子氮 还原为NH3,然后再被植物吸收,用于合成氨基酸及 其它含氮化合物的过程。 生物固氮反应在常温常压下进行,是氮素循环的重要 环节,为氨的主要来源,每年自然界生物固氮总量达 到2亿吨,远远超过工业固氮(Fe作催化剂,450℃, 20~30MPa)。
谷氨酸脱氢酶(GDH):普遍存在于动植物和微生物 谷氨酸脱氢酶 体内,无需氧气,活性和专一性都很强,且只对L-谷氨 酸起催化作用。
* 此酶是一个结构很复杂的别构酶。ATP、GTP、NADH 可抑制其活性;ADP、GDP及某些AA可激活其活性。 因此当ATP、GTP不足时,Glu的氧化脱氨会加速进行 ,有利于AA分解供能。
固氮反应
①固氮:N2 + 6H+ + 6e- → 2NH3 ②放氢:2H3O+ + 2e - → H2 + 2H2O
固氮条件 充足的ATP;②强还原剂(还原态铁氧蛋白);③厌 );③ ①充足的 ; 强还原剂(还原态铁氧蛋白); 氧环境。 氧环境。
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第六章 常用分子生物学技术
核酸分子杂交:核酸探针
印迹杂交:Southern blot、Northern
blot、Western blot;原位杂交(荧光 原位杂交);生物芯片(基因芯片、
蛋白质芯片)
第六章 常用分子生物学技术
聚合酶链式反应 (PCR):
PCR原理、体系、步骤;RT-PCR、多重PCR
Present only in (a)
Sample (a) Sample (b) Stronger in (b) than (a) or (c) Sample (c)
Present in (a) and (c) not (b)
荧光差异显示双向电泳 (2D-DIGE)
关 键 问 题: 如何鉴定双向电泳分离出来的蛋白质?
药物作用靶点(drug target):具有重要生理 或病理功能,能够与药物分子相结合并产生药理 作用的(生物大)分子及其特有的结构位点。
Current number of drug targets ~500
Nuclear receptors 2% Ion channels 5% Unknown 7% Hormones & factors Enzymes 11% 28%
质谱分析技术路线:
电离
质量分选
离子源
形成带电离子
质量分析器
根据m/z分选离子
离子检测器
检测离子
样品
固体 液体 蒸汽
质谱分析的基本步骤: 1. 样品离子化 2. 根据质荷比(m/z)不同分离离 子 3. 检测每种质量离子的数目 4. 收集、处理数据得到质谱图
数据处理
质谱
离子源——基质辅助激光解析电离 (MALDI)
质量分析器——飞行时间 (TOF)
MALDI-TOF MS (基质辅助激光解析电离飞行时间质谱)
图1. 一个典型的质谱图 (横坐标为质荷比,即相对分子质量,纵坐标 为各个肽段的相对含量,每个峰的数字代表了这 个峰对应的肽段的质量)
肽质量指纹谱(PMF)
凝胶 数据库
? 蛋白质
胰酶消化 质谱
3235.2256 1234.5396
、实时荧光定量PCR;PCR技术应用 RNA 干 扰 技 术 : siRNA 、 RNA 干 扰 、 机制、应用 基因敲除技术:基因敲除
第十章
外源基因表达与基因工程药物
基因工程(DNA重组、分子克隆)技术 分子克隆程序:分、切、连、转、筛、表 目的基因获取途径 载体(种类、特征)、质粒、多克隆位点 、工具酶、感受态细胞、转化、转导 阳性重组体筛选 基因工程生产重组药物一般流程
质 谱 分 析
质谱:是将被测物用一定的方法离子化,然后 按产生的带电离子的质荷比(质量/电荷,m/z )进行分离并检测,最后根据各离子谱峰的强 度解析被测物的相对分子质量和结构信息的一 种分析技术。用于测量分析生物样本(蛋白质 、核酸)称为生物质谱。
12 units 12 units
8
9
10 11 12 13 14 15 16
基因失活性治疗
第二篇 药学分子生物学应用
第九章 药物蛋白质组学
(Phamacoproteomics)
一、概述(概念、分类、主要技术) 二、药物蛋白质组学及应用
一、蛋白质组学(proteomics)
蛋白质组 (Proteome): 一种细胞、某一特 定组织或个体所表达的全部蛋白质。 蛋白质组学 (Proteomics): 从整体水平研究蛋白质组成 、表达水平、翻译后修饰、 相互作用的学科。
siRNA药物
根据 RNA 干扰原理设计出来的小干扰 RNA , 通过诱导同源mRNA降解,有效阻断基因表达, 起到治疗疾病效果。 VEGF 可 促 进 湿 性 老 年 性 黄 斑 变 性 ( wetAMD)眼中新血管的生长,使血液渗漏进人眼 内,从而导致视力丧失。 OPKO公司开发出 Bevasiranib(siRNA药物) ,抑制VEGF表达,治疗AMD。
New Targets Expected from Human Genome Project
药物作用靶点发现的方法
考试题型
1、名词解释:3分/题,10题
2、填空题:1分/空,20空
3、论述题:10分/题,3题 4、案例分析题:20分/题,1题
第一章 基因与基因组
基因、基因组、基因组学 病毒、原核生物、真核生物基因组特点 重叠基因、操纵子、断裂基因、基因家 族;顺式作用元件、反式作用因子、启 动子 人类基因组计划
反义药物特点:
新的化学物质(核酸); 新的药物受体( DNA或mRN)。
第一个反义药物:福米韦生 (fomivirsen) 1998年,美国FDA批准,由21个硫代脱氧核苷酸 组 成 。 通 过 抑 制 人 类 巨 细 胞 病 毒 ( CMV ) mRNA发挥抗病毒作用。
DNA 2%
Receptors 45%
Proteins/peptides ~ 95%
新的药物作用靶点
Number of Drug Targets 12,000 10,000 8,000 6,000 4,000 2,000 0 Approx. 500 5,000–10,000
Cumulative Number of Targets Known Today
转录组学(transcriptomics)
在整体水平研究细胞中基因转录情况及其调控 规律的学科。
研究方法:基因芯片技术、SAGE (基因表达系列分析)、 MPSS(大规模平行信号测序系统)、 RNA测序
第二节 转录组学在药学中的应用
一、药靶候选基因的鉴定 二、反义药物和siRNA药物 反义药物:通过与靶DNA 或 mRNA 互补 杂交,阻止或抑制靶基因表达,发挥治疗 作用的药物。 包括:反义DNA、 反义RNA、 核酶
1
2
3
多肽 已测得质 谱数据或理论 质谱 数据
783.9147 375.2561
比较: 是否相同 ??
蛋 白 质 芯 片
酵母双杂交
二、药物蛋白质组学及应用
构建分子药理筛选模型 :分子细胞、组织器官 、整体动物水平 药物靶点的发现、 验证和优化 药物作用机制研究 药物毒理机制研究 耐药机制研究
二、蛋白质组学分类
1. 表达蛋白质组学:比较正常样品与
病理样品、药物治疗前后样品的蛋白 质表达或修饰差异。
2. 结构蛋白质组学:分析蛋白质或复
合体结构、定位
3. 功能蛋白质组学:研究蛋白质功能
基因组-转录组-蛋白质组
DNA (Genome) RNA (Transcriptome) Proteins (Proteome)
药学分子生物学
张 徐
江苏大学 医学院 分子生物学及检验教研室
xuzhang@
第二篇 药学分子生物学应用
第八章 药物转录组学
(pharmacotranscriptomics)
一、转录组与转录组学
二、转录组学在药学中的应用
转录组(transcriptome)
广义:指在某一生理条件下、一种细胞、组织 、器官或生物体所能转录出来的所有RNA的总 和,包括mRNA和非编码RNA。 狭义:指所有mRNA的集合。
第七章 药物基因组学
定义、目标、研究方法
单核苷酸多态性(SNP)、单体型、检测技术
遗传变异与药物应答 基因分型指导合理用药
药物基因组学与新药研发、个性化用药
第八章 药物转录组学
反义药物
siRNA药物与基因失活性治疗
第九章 药物蛋白质组学
主要研究技术
药物蛋白质组学的应用
?
DNA sequencing Whole genome Microarray 2D-PAGE MS/MS
四、蛋白质组学主要研究技术
1、蛋白质分离 双向凝胶电泳技术 2、蛋白质鉴定 生物质谱 3、蛋白质-蛋白质相互作用 蛋白质芯片、酵母双杂交
双向凝胶电泳技术
双向凝胶电泳技术
双向凝胶电泳技术
双向凝胶电泳图像分析