近年来中国H9亚型禽流感分离株谱系分析

中国动物检疫 ２ １ ０ ２年第 ２ ９卷第 ４期
５ ｌ
近年 来 中国 Ｈ９亚型禽流感 分离株谱系分析
尚飞 雪 ， 刘 朔 蒋 文明 陈 杰 侯 广 宇 李 金平 黄保 续 陈继 明 ， ， ， ， ， ， １０ ３ ） ５０ ０
（． １中国动物卫生与流行病学 中心， 山东青岛 ２６ ３ ；． 农业 大学 ， ６ ０２２东北 黑龙 江哈 尔滨
（ ． ｈｎ Ａｎｍａ Ｈ ａ ｈ＆ Ｅ ｉｅ ｏｏｙＣ ｎｅ， ｉｇ ａ ， ｈｎ ｄｎ ，６ ０ ２ Ｃ ｉａ １ Ｃ ｉａ ｉ ｌ ｅｌ ｔ ｐｄｍｉｌｇ ｅｔｒＱｎ ｄｏ Ｓ ａ ｇ ｏ ｇ ２ ６ ３ ， ｈｎ ；
２ Ｎ ｒ ｅｓＡｇｉ ｌ ｒｌ ｉｅｓｙ Ｈａ ｉ， ｉ ｎｊ ｎ ， ５０ ０ Ｃ ｉａ ． ｏｔ ａｔ ｒ ｕｔ ａＵｎｖｒｉ ， ｒ ｎ Ｈｅ ｏ ｇｉ ｇ １０ ３ ， ｈｎ ） ｈ ｃ ｕ ｔ ｂ ｌ ａ
Ａｂ ｔ ａ ｔ ｓｒ ｃ ：Ａｌ ｔｅ８ ５ｎ ｃｅ ｔ ｅｓｑ ｅ ｃｓ（ ９ ０ｂ ｌｈ ８ ｕ ｌｏｉ ｅ ｕ ｎ ｅ ￣ ０ ｐ）ｏ ｔｅｈ ｍ ａ ｇｕｉｉ ｅ ｅｏ ｄ ＞ ｆ ｈ ｅ ｇ ｌｔ ｎｇ ｎ ｆＨ９ｓ ｂ ｐ ｖａ ｎ ｕ ｎ ａｖｒ ｅ ＡＩ ） ｎ ｕ ｔ ｅａ ｉｎｉｆ ｅ ｚ ｉ ｓ（ Ｖｓ ｙ ｌ ｕｓ
Ｓ ａ ｇＦ ｉ ｕ ， ｕ Ｓ ｕ Ｊａ ｇＷ ｅ ｍｉ ｇ ， ｅ ｉ Ｈｏ ｈ ｎ ｅｘ ｅ ～ Ｌｉ ｈ ｏ ， ｉｎ ｎ ｎ Ｃｈ ｎ Ｊｅ ， ｕＧｕ ｎ ｙ Ｌ ｉ ｐｎ Ｈｕ ｎ ａ ｇ ｕ ， ｉ ｎ ｉ ｇ ， ａ ｇＢａ ｘ ‘Ｃｈ ｎＪｍ ｉｇ Ｊ ｏ ｕ ， ｅ ｉ ｎ
ｔ ｅ ｄ ｍｉ ａ ｔｌ ｅ ｇ ｆＨ９ ｓ ｂ ｙ ｅ ＡＩ ｉ ａ ｉ ｅ ｅ ｔｙ ａ ｓｉ ９ ２ ５ ｒ ｐ ｅ ｅ ｔ ｙ Ａ／ ｈ ｃ ｅ ／ ａ ｇ ｉ ５ ２ ０ ｈ ｏ ｎ ｎ ｎ ａ ｅ ｏ ｕ ｔ ｐ Ｖｓｉ Ｃｈ ｎ ｒ ｃ ｎ ｅ ｒ ｓｈ Ａ．． ｅ ｒ ｓ ｎ ｅ ｂ ｃ ｉ ｋ ｎ Ｇｕ ｎ ｘ ／ ／ ０ ５，ｒ ｔ ｅ ｈ ｎ ｉ ｎ ｎ ｄ ５ ａｈ ｒｔ ａ
近 几 十年 来 ， 亚 型 禽流 感病 毒 （ ｖａ ｆ ｅ ｚ １ 材 料与 方法 Ｈ９ ａ ｉｎｉ ｌ ｎ ａ ｎｕ ｖｒ ｓ ＡＩ 在 我 国家 禽 中广泛 流 行 ， 仅 给 养禽 业 造 ｉ ， Ｖ） ｕ 不 如 果通过 变异 ， 可能 引发人 流感 大流 行 。 有 借助 Ｉｆ ｅ ｚ ｉ ｓＲ ｓｕｃ 网 站 ， ｎ ｕ ｎ ａＶ ｒ ｅｏ ｒｅ ｌ ｕ 从Ｇｅ Ｂ ｎ 中 ｎ ａｋ Ｈ９ 亚型ＡＩ Ｖ的血 凝 素（ ｅ ｇ ｌｔ ｉ， ｈ ｍａ ｇｕｉ ｎ ＨＡ） 因核 苷 酸 ｎ 基 成 严 重 危 害 ， 引起 了一 些 人 的感 染病 例 『 ］该 病 毒 下载 所有 长度 大 于９ ０ｂ 的来 自中国（ 港 、 、 ） 还 ｌ。 ０ ｐ 含 澳 台 的 目前 ， 关于Ｈ９ 型Ａ Ｖ在中 国的谱系 分布 ， 亚 Ｉ 存在 两 序 列 ， 用ＭＵＳ Ｌ 软 件进 行 对 比， 用ＭＥ Ｃ Ｅ 再 ＧＡ５０ 件 ．软 Ａ１ ３。 ４ ＨＡ１ 亚 种 截然 不 同的观 点 ： 一种观 点是 该病 毒 白２ ０ 年来 ， ００ 其 对 其 Ｈ 亚 单位 部 分 的序 列进 行 谱系 分 析 『 】
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ｉ ｌｔ ｈ ａ ｒ ｄｗｎｏｄ ｄｆ ｍ ｅＢａｋａ ｄｐ ｙ ｇｎ ｔ ａ ｙａａｙｅ ｓ ｇｔｅｓｆ ｒ ＭＥ Ａ ５０Ｔ ｅｒｓｌ ｇ ｅｔ ａ ｓ ａ ｄｉ Ｃ ｉ ｅ ｏ ｌａ ｅ ｏ Ｇ ｎ ｎ ｎ ｈ ｌ ｅｅ ｃｌ ｎ ｌ ｄｕ ｉ ｔ ｅ Ｇ ．． ｈ ｕｔ ｓ ｇ ｓｔ ｔ ｏ ｅ ｎ ｎ ｗｅ ｒ ｏ ｉ １ ｚ ｎ ｈ ｏ ｗａ ｅ ｓｕ ｈ
行谱 系 的分析 工作 ， 报告 如下 。 截 止 Ｎ２ １年 ９ １ 日， ｎ ａ ｋ￣ 的长度 大于 ０ 月 ７ Ｇｅ Ｂ ｎ ｑ 录 １ 我 们提 交 的序 列 ５ 条 ， ５ 登录 号 为 ： Ｊ ３ ５ １Ｆ ４ ４ ８ 、 Ｆ ４ ４ ６ ．Ｊ ３ ５ ７ ．
在 中 国的谱 系 分布 情 况 ， 们 开展 了Ｈ９ 我 亚型 禽 流感 流 ９ ０ｂ 的来 自中 国的Ｈ９ ０ ｐ 亚型ＨＡ序 列 共有 ８ ５ 含有 ８ 条（
谱 系分 布 未有 显著 变化 ， 如世 界 卫生 组织 （ ＷＨＯ） 感 单位 编码 保护 性抗 原表 位 ， 流 是病毒 高度 变异 的区域 ， 其
专 家组 ２ １ 年 ２ 报 告指 出 ： 虽 然关 于世 界 各地 的Ｈ９ 序 列是 Ｈ９ 型ＡＩ 系 划 分 的主 要 依 据 。 系 分 析 ０１ 月 “ 亚 Ｖ谱 】谱 采用Ｎｅ曲ｂ ｒｊｉｉｇ ｉ ｏ ｎｎ 计算 方法 ， 苷 ｏ 核 病 毒特 征 了解 很 少 ， 但是 已测 定 核酸 序 列 的Ｈ９ 病毒 大 的参 数设 置如 下 ： ｍｕ ａ２ｐ ｒｍｅｅ ｒ 各位 点变 异速 率 多数 属于 Ａ Ｑ ａｌ ｎ ｎ ／ ９ 、 ｃｉｋｎＨｏ ｇ 酸变 异设 为Ｋｉ ｒ －ａａ ｔ 模 式 ， ／ ｕ ｉＨｏ ｇＫｏ ｇＧ１ ７ Ａ／ｈｃ ｅ／ ｎ ／ ／
Ａ／ ｎ ｎ ／ ３ ８ ／ ０ ９，ｐ ｏ ｏ ｅ ｙ ｔ ｅ ｉ ｆ ｅ ｚ ｅ ｏ ｔ ｆ ｏ ｌ ａｔ ｇ ｎ ｚ ｔ ｎ ｉｓ ｅ ｎ Ｆｅ ． ０１ ． ｈ ｓ ｃ ｎ ｌ ｓ ｎ ｉ ｏ Ｈｏ ｇ Ｋｏ ｇｒ ９ ２ ２ ０ ３ ． ｒ ｐ ｓ ｄ ｂ ｌ ｎ ａ ｒｐ ｒ Ｗ ｒｄ Ｈｅ ｌ Ｏｒ ａ ｉａ ｉ ｓ ｕ ｄ ｉ ｂ ，２ １ Ｔ ｉ ｏ ｃ ｕ ｉ ｓ ｆ ｈ ｎ ｕ ｏ ｈ ｏ ｏ
ｈ ｎａ ｅ ｐｅｅｔｄｂ ｒ ｒ ｅ， ／ ｕ ｉＨ ｎ ｎ ／ ／７ Ａ／ ｃ ｒ ｏ ｇＫ ｎ ／ ／７ Ａ ｄｃ ／ ｎ ｏ ｇ ２ ０９ ， ｔｅｆ ｅｇ ｓ ｅｒｓｎｅ ｙｔｅｆｕ ｉ ｓｓ Ａ Ｑ ａｌ ｏ ｇＫｏ ｇＧ１９ ， ｃｉ ｅ Ｈ ｎ ｏ ｇＧ９９ ， ／ｕｋＨｏ ｇＫ ｎ ｒ８ ／７ ｉ ｒ ｈ ｏ ｖｕ ／ ｈｋｄ
摘 要 ：＆Ｇｅ Ｂａ ｋ ． Ｚ ｎ ｎ 中下 载 所有 来 自中国 （ 含港 、 、 ） 澳 台 的Ｈ９ 亚型 禽 流感 病毒 血 凝 素 基 因 ８ ５ ８ 条核 苷 酸序 列 （ 长度 ／ ０ ｐ， ＞９ ０ｂ ） 用ＭＥ Ａ５Ｏ Ｇ ．软件进行谱 系分析 。 果表 明我 国近年 来Ｈ９２ 结 ． ３ 型禽 流感病毒 以第ｈ ．．．分支为主（ ＂ ９４２５ 代表株 为Ａ／ｈｃ ｅ ／ ｃ ｉ ｎ ｋ Ｇ ａ ｇ ｉ ５２ ０ ） 而不是ｗＨＯ ｕ ｎ ｘ／ ／０ ５ ， ５ 新近报告 所列出的４ 株病毒（ ／ ｕ ｉＨｏ ｇＫｏ ｇＧ１ ７Ａ／ｈｃｅ／ ｎ ｏ ｇＧ ／７Ａ／ｕ ｋＨ ｎ Ａ Ｑ ａ ／ ｎ ｎ ／ ／ 、 ｃｉｋｎＨｏ ｇＫ ｎ ／ ９９ 、 ｄ ｅ／ ｏ ｇ ｌ ９
Ｋ ｎ ２０ ７ＡＨ ｎ ｏｇ ３ ８／ ０ ） Ｌ ｇ ８／ 、 ／ｏｇ ｎ／ ９２ ０９ 所代表 的分 支。 ０ ９ Ｋ ＇ ３ ＇ ２ 此分析结果对于研 制针 对这一病毒感 染的疫 苗有重要指导意 义。
关键词 ： 禽流感； 系分析 ； 谱 疫苗
中图分类号： ８ ２ ５ 文献标识码 ： 文章编号 ：０ ５９ ４ ２ １ ）４０ ５－３ ￥５． ６ Ｂ １ ０ ．４ Ｘ（０ ２ ０ ．０ １ ． ０
ｓｇ ｉ ｃ ｃ ｏ ｅｖ ｃ ｉ ｅｄ ｖ ｌ ｐ ｅ ｔ ｇ ｉ ｓ ｅ ｉ ｆ ｃ ｏ ｆ ｈ ｉ ｓ ｓ ｉ ｎ ｆ ａ ｅｆ ｒ ａ ｃｎ ｅ ｅ ｏ ｍ ｎ ａｎ ｔ ｈ ｅ ｔ ｎ ｏ ｅｖｒ ｅ ． ｉｎ ｈ ｔ ａ ｔ ｎ ｉ ｔ ｕ
Ｋｅ ｒ ｓ Ａｖ ａ ｆ ｅ ｚ ；ｐ ｙ ｏ ｅ ｅｉ ｎ ｌ ｓｓ ａ ｃｎ ｙｗｏ ｄ ： ｉ ｉｌ ｎ ａ ｈ ｌ ｇ ｎ ｔ ａ ａｙ ｉ ；ｖ ｃ ｉ ｅ ｎ ｎｕ ｃ
中禽源８ ７ 、 ２ 个 猪源 ３ 个 、 源 １个 、 ７ 人 １ 狗源 １ 、 自环 境 这 个 分 支 含有 上 述 世 界 卫生 组 织 （ 个 来 ＷＨＯ） 感报 告 所 流 ９ ； 自中国大陆 的有 ８ ２ ， 自中国香港６ 个 。 个 来 ２个 来 ３ 列举 的两 个 代表 株 ， 即Ａ／ ａ ／ ｏ ｇＫ０ ｇＧ１ ７ Ａ Ｑｕ ｉ Ｈ ｎ ｎ ／ ／ 和 ／ ｌ ９ ｏ ｇＫｏ ｇ３ ９ ２２ ０ 。 ９４２ １ 株病 毒 ， 这 ８ ５ 序 列中Ｈ 部分 （ 度９ ０ ｐ 的进 化树 如 Ｈ ｎ ｎ ／３ ８ ／０ ９ 第 ｈ ．．分支 含有 ８ ７ ８条 Ａ１ 长 ６ｂ ） 图１ 示 。 所 它们 分布 于第 ｈ ．、 ９３ ９１ 第ｈ －和第ｈ ．等 三 个一 其 时 间跨 度 为 １ ９ —０ １ （ 中２ ８ 为２ ０ 年或 其 ９４ ９４２ １年 其 ６株 ０７ 级 分 支 中 。 中 ， ９ １ 支含 有 两 株病 毒 ， 其 第ｈ ．分 都来 自黑 后 的毒株 ）地 理跨 度包 括 中 国数 十个 省份 。 ， 因此 ， 从毒 龙 江 ， 离时 间分别 为 １ ９ 年 ￣ ２ ０ 年 ； ｈ ．分 支含 株数 量 、 间和地 理分 布来 看 ， 分 ９ ８ Ｈ ０ ０ 第 ９３ 时 在二 级分 支上 ， ９ ． 第ｈ ． ２ ４ 有 １ 株 病毒 ， 自香港 （ ４ ） 汕 头 （ 株 ） 其 中 １ ７ 分支 是２ ０ 年 后 中 国Ｈ９ 型ＡＩ ８ 来 １株 和 ４ ， ９０ ０７ 亚 Ｖ主要流 行分 支 。 年 代 １株 ， ９ ０ 代 １ ， ９ ０ 代２ ， ０ ０ 代４ ； １ １８ 年 株 ｌ ９年 株 ２０年 株 第 ｈ ．．二级 分 支 可 以进 一步 分 为６ ９４２ 个三 级 分 支 。 第 ｈ ．分 支 含 有８ ５ 病 毒 ， 时 间跨 度 为 １ ９ — ０ １ 这 ６ 三 级 分 支 的特 征 （ １ 。 中 ， ９４２１ 支对 ９４ ６株 其 ９ ４２ １ 个 图 ）其 第ｈ ．．．分 年 ， 理跨 度包括 中国数十 个 省份 。 地 因此 ， 毒株数 量 、 应 ３株 Ｈ９ 离 株 ， 中 Ｉ９．０ ５ ５ ￣２ ０ 年 １ 从 ６ 分 其 ９ ８２ ０ 年３ 株 ０ ７ 株 时 间和地 理分 布来 看 ， 级分 支上 ， ｈ ．分支 是 １ ９ 分布 于华 北 、 一 第 ９４ ９４ 西北 、 中 、 东 、 华 华 华南 、 南共 １ 省份 ； 西 ５ 第
Ｋｏ ｇＧ９９ 或 Ａ ｄ ｃ ／ ｏ ｇＫｏ ｇＹ２ ０９ 类 的Ｈ９ ｎ ／ ／７ ／ｕ ｋＨ ｎ ｎ ／ ８ ／ ７ 病 设为 Ｇ ｍｍａ ａ 分布 （ ｍｍａ Ｇａ 参数 为４０ 。 系 的划分 ， ．） 谱 进
５ Ｂ ｏｓ ａ 值 ］ ｔ 毒 ， 三 株病 毒 都是 １９ 年 香港 分 离 的病 毒 ”此 报 告 行三 个级别 的划 分和 命名 ＿。 ｏ ｔ ｒｐ 的计算 设置 为 这 ９７ 。 还 提 出 一 个 新 的 疫 苗 株 候 选 对 象 （ 常 是 主 要 流 行 １００ 通 ０ 个重 复 。 遗传 距 离 的计 算方 法 与谱 系分 析参 数 设
谱 系 的代 表 株 ） ￣Ａ／ ｏ ｇＫｏ ｇ３ ９ ２２ ０ 。 一种 置相 同 。 ， Ｈ ｎ ｎ／３ ８ ／０ ９ 另 主要流 行 分支 的判 定兼顾 毒株 分 离数 、 毒株 的 观 点是 自２ ０ 年 以来 ， 国Ｈ９ 毒开 始 以Ａ／ｈｃ ｅ／ 时 间分布 和地 理分布 等 因素 。 ０７ 我 病 ｃｉｋ ｎ Ｇ ａ ｇ ｉ ５２ ０ 为 代 表 的 分 支 为 主 ， 这 一 分 支在 ２ 结 果 ｕ ｎ ｘ／ ／０ ５ ５ 而 ２ ０ 年 之 前很 少 出现 『。 了进 一步 明确Ｈ９ 型ＡＩ ０７ 】为 ） 亚 Ｖ
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中国动物检疫 ２ １ ０ ２年第 ２ ９卷第 ４期
Ｆ ８ ７ ０ 一 Ｊ０ ７ 、 Ｊ ０ ７ ８Ｆ ８ ７ ＧＱ４ ３ 一 Ｑ４ ３ ２ ）这 些 序 列 头 ， 中４ 株分 离 于 １９ ～２ ０ 年 ， 株分 离于 ２ ０ 年 。 １ ９ ６ ２ Ｇ ６ ２ ７ 。 １ ２ 其 ６ ９７ ０５ ２ ０９
Ｐｈｙ ｏ ｅ ｅ ｉ ｎａ ｙ ｉ ｆＨ ９ ｓ ｙ ｖｉ ｎ ｉ ｆｕｅ ａ ｖ ｒ ｓ ｓｉｏ ａ ｅ ｆ ｏ ｉ ｎ ｒ ｃ ｎ ｅ ｒ ｌ ｇ ｎ ｔｃａ ｌ ｓｓｏ ｕｂｔ ｐｅ ａ ａ ｎ ｌ ｎｚ ｉ ｕ ｅ ｓ ｌ ｔ ｄ ｒ ｍ Ｃｈ ｎａｉ ｅ ｅ ｔｙ ａ ｓ