COX回归分析副本
cox回归分析
生存分析之COX回归分析1、生存分析,就是将终点事件出现与否与对应时间结合起来分析得一种统计方法;2、生存时间,就是从规定得观察起点到某一特定终点事件出现得时间,如膀胱癌术后5年存活率研究,及膀胱癌手术为观测起点,死亡为事件终点,两点为生存时间;3、完全数据,观测起点到终点事件所经历得时间,上述例子即膀胱癌手术到因膀胱癌死亡得时间;4、删失数据,因失访、研究结束终点事件未发生或患者死于规定得终点事件以外得原因而终止观察,不能确定具体生存时间得一类数据;5、生存概率,表示某时段开始存活得个体到该时段结束仍存活得概率,p=活满某时段得人数/该时段期初有效人口数;6、生存率,为观察起点起到研究时间点内各个时段得生存概率得累积概率,S(tk)=p1、p2、pk=S(tk-1)、pk;7、生存曲线,以生存时间为横轴,将各个时间点得生存率连在一起得曲线图;8、中位生存期,又称半数生存期,表示50%得个体存活得时间;9、PH假定(等比例风险假定),某研究因素对生存得影响不随时间得改变而改变,就是COX回归模型建立得前提条件。
Cox回归分析及其SPSS操作方法概述前面我们已经讲过生存分析及KM法得内容,详细可以回复数字26-28查瞧。
但有对统计不太熟悉得“微粉”还不太明白生存分析与一般统计得区别,不知道如何区别Cox回归与Logistic回归。
在我们做研究时,有时我们不仅关心某种结局就是否出现,还会关心结局出现得时间,例如肺部手术后观察五年生存率,一个有在1年之后死亡,另外一个人在在4、5后死亡,如果只瞧第5年时得结局,两者就是一样得(均死亡),但就是实际我们认为后者得治疗效果可能优于前者,即生存分析同时考虑结局与结局出现得时间,而一般分析只考虑结局。
另外在队列随访时,可能有人在没有到5年时就失访了,如迁徙或者电话更改,我们不了解其结局如何,在一般得分析中这种病例无法使用,而中间失访得病例结局可能更差,如果直接扔掉,可能会产生偏倚;而用生存分析,这种病例可以给我们提供部分资料,即我们记录最后一次随访时病例得状态,失访前得资料可以用于分析。
COX回归分析副本
Likelihood Chi-square df
45.145 14.783
6
Change From Previous Step
Change From Previous Block
Sig. Chi-square df
Sig. Chi-square df
Sig.
.022 16.199
6
.013 16.199
10.临床随访研究的缺点:
• 随访研究容易造成失访。当失访率 高于50%时,研究失败;
• 随访时间可能很长; • 各组间不易达到均衡一致,缺乏可
比性; • 常伴有主观因素的影响,盲法观察
不易实施。
小结
Cox回归与多重线性回归、logistic回归
多重线性回归
的比较
logistic回归
Cox回归
B 1.084 1.381
SE .421 .530
Wald 6.630 6.799
df 1 1
-1.589
.695
5.221
1
Sig. .010 .009
.022
Exp(B) 2.957 3.978
.204
• 设第i个因素的回归系数为bi,对应的风险比(risk ratio,记 为RRi): RRi=exp(bi),表示该因素每增加一个单位时,风险 度改变多少倍。
B 1.084 1.381
SE .421 .530
Wald 6.630 6.799
df 1 1
-1.589
.695
5.221
1
Sig. .010 .009
.022
Exp(B) 2.957 3.978
.204
Step 1 X4 Step 2 X4
Cox回归分析—非常详细的SPSS操作介绍
患者生存状态的影响因素分析——生存资料的COX回归分析1、问题与数据某研究者拟观察某新药的抗肿瘤效果,将70名肺癌患者随机分为两组,分别采用该新药和常规药物进行治疗,观察两组肺癌患者的生存情况,共随访2年。
研究以死亡为结局,两种治疗方式为主要研究因素,同时考虑调整年龄和性别的影响,比较两种疗法对肺癌患者生存的影响是否有差异。
变量的赋值和部分原始数据见表1和表2。
表1. 某恶性肿瘤的影响因素与赋值表2. 两组患者的生存情况group gender age time survival0 1 0 22 10 1 1 10 10 1 1 64 10 1 1 12 10 1 0 17 11 0 0 19 11 1 1 4 11 0 1 12 01 0 0 5 01 1 1 27 02、对数据结构的分析该研究以死亡为结局,治疗方式为主要研究因素,每个研究对象都有生存时间(随访开始到死亡、失访或随访结束的时间),同时考虑调整年龄和性别的影响。
欲了解两种疗法对肺癌患者生存的影响是否有差异,可以用Cox比例风险模型(Cox proportional-hazards model,也称为Cox回归)进行分析。
实际上,Cox回归的结局不一定是死亡,也可以是发病、妊娠、再入院等。
其共同特点是,不仅考察结局是否发生,还考察结局发生的时间。
在进行Cox回归分析前,如果样本不多而变量较多,建议先通过单变量分析(KM法绘制生存曲线、Logrank检验等)考察所有自变量与因变量之间的关系,筛掉一些可能无意义的变量,再进行多因素分析,这样可以保证结果更加可靠。
即使样本足够大,也不建议把所有的变量放入方程直接分析,一定要先弄清楚各个变量之间的相互关系,确定自变量进入方程的形式,这样才能有效的进行分析。
单因素分析后,应当考虑应该将哪些自变量纳入Cox回归模型。
一般情况下,建议纳入的变量有:1)单因素分析差异有统计学意义的变量(此时,最好将P值放宽一些,比如0.1或0.15等,避免漏掉一些重要因素);2)单因素分析时,没有发现差异有统计学意义,但是临床上认为与因变量关系密切的自变量。
部分COX回归分析
an1 an2
X3 …. XP
a13 … a1p a23 … a2p a33 … a3p
… ……
an3 … anp
3、COX回归模型 (Cox regression model)
(1)风险率(hazard rate):
患者在t时刻仍存活,在时间t后的瞬间 死亡率,以h(t)表示。
h(t)
死于区间(t,t t)的病人数 在t时刻尚存的病人数 t
The PHREG Procedure
Testing Global Null Hypothesis: BETA=0
Without
With
Criterion Covariates Covariates Model Chi-Square
-2 LOG L
Score
Wald
61.344 . .
Testing Global Null Hypothesis: BETA=0
Without
With
Criterion Covariates Covariates Model Chi-Square
-2 LOG L 61.344 47.906 13.437 with 2 DF(p=0.0012)
Score
4、筛选变量(逐步COX回归分析)
(1)向前法(forward selection)
(2)后退法(backward selection)
(3)逐步回归法 逐步引入-剔除法(stepwise selection)
SLE和SLS的确定同前
调试法:P从大到小取值0.5, 0.1,0.05,一般实际用时,SLE, SLS应多次选取调整。
cox回归分析
cox回归分析生存分析之COX回归分析1.生存分析,是将终点事件出现与否与对应时间结合起来分析的一种统计方法;2.生存时间,是从规定的观察起点到某一特定终点事件出现的时间,如膀胱癌术后5年存活率研究,及膀胱癌手术为观测起点,死亡为事件终点,两点为生存时间;3.完全数据,观测起点到终点事件所经历的时间,上述例子即膀胱癌手术到因膀胱癌死亡的时间;4.删失数据,因失访、研究结束终点事件未发生或患者死于规定的终点事件以外的原因而终止观察,不能确定具体生存时间的一类数据;5.生存概率,表示某时段开始存活的个体到该时段结束仍存活的概率,p=活满某时段的人数/该时段期初有效人口数;6.生存率,为观察起点起到研究时间点内各个时段的生存概率的累积概率,S(tk)=p1.p2.pk=S(tk-1).pk;7.生存曲线,以生存时间为横轴,将各个时间点的生存率连在一起的曲线图;8.中位生存期,又称半数生存期,表示50%的个体存活的时间;9.PH假定(等比例风险假定),某研究因素对生存的影响不随时间的改变而改变,是COX回归模型建立的前提条件。
1.Cox回归分析及其SPSS操作方法概述前面我们已经讲过生存分析及KM法的内容,详细可以回复数字26-28查看。
但有对统计不太熟悉的“微粉”还不太明白生存分析与一般统计的区别,不知道如何区别Cox回归与Logistic回归。
在我们做研究时,有时我们不仅关心某种结局是否出现,还会关心结局出现的时间,例如肺部手术后观察五年生存率,一个有在1年之后死亡,另外一个人在在4.5后死亡,如果只看第5年时的结局,两者是一样的(均死亡),但是实际我们认为后者的治疗效果可能优于前者,即生存分析同时考虑结局和结局出现的时间,而一般分析只考虑结局。
另外在队列随访时,可能有人在没有到5年时就失访了,如迁徙或者电话更改,我们不了解其结局如何,在一般的分析中这种病例无法使用,而中间失访的病例结局可能更差,如果直接扔掉,可能会产生偏倚;而用生存分析,这种病例可以给我们提供部分资料,即我们记录最后一次随访时病例的状态,失访前的资料可以用于分析。
Cox回归分析
◦ 当其它协变量相同,变量Xi改变一个单位时,引起的死亡 风险改变倍数的自然对数值
从本质上讲,Cox模型无法准确估计出具体风险状 况和计算生存率
研究癌细胞是否有转移(x1:x1=0 无转移,x1=1 有转移)和是否 手术(x2:x2=0 无手术,x2=1 有手术)这两个协变量对癌症患者 生存时间的影响,建立了如下Cox回归模型:
(proportional hazard model) S (t) = S0 (t)exp( Xβ ')
Xβ'=β1x1+β2x2+…+βmxm
h0(t)称为基础风险函数(Baseline Hazard Function)
◦ 表示个体在时点t的基线死亡风险,也就是说 所有协变量为0,即风险因素为基线值时的死 亡风险率
4
3-
30
30
0.30
0.65
5
4-
10
10
0.10
0.75
6
5-
5
5
0.05
0.80
7
6-
4
4
0.04
0.84
8
7-
3
3
0.03
0.87
9
8-
2
2
0.02
0.89
10
9-
2
2
0.02
0.91
11
10-
1
1
0.01
0.91
12 11-21
8
0.8
0.008
1.00
半参数法
◦ 规定了影响因素和生存结局间的关系,对时间 (和风险函数)的分布没有加以限定
RR=exp(β)
cox回归分析
生存分析之COX回归分析1.生存分析,是将终点事件出现与否与对应时间结合起来分析的一种统计方法;2.生存时间,是从规定的观察起点到某一特定终点事件出现的时间,如膀胱癌术后5年存活率研究,及膀胱癌手术为观测起点,死亡为事件终点,两点为生存时间;3.完全数据,观测起点到终点事件所经历的时间,上述例子即膀胱癌手术到因膀胱癌死亡的时间;4.删失数据,因失访、研究结束终点事件未发生或患者死于规定的终点事件以外的原因而终止观察,不能确定具体生存时间的一类数据;5.生存概率,表示某时段开始存活的个体到该时段结束仍存活的概率,p=活满某时段的人数/该时段期初有效人口数;6.生存率,为观察起点起到研究时间点内各个时段的生存概率的累积概率,S(tk)=p1.p2.pk=S(tk-1).pk;7.生存曲线,以生存时间为横轴,将各个时间点的生存率连在一起的曲线图;8.中位生存期,又称半数生存期,表示50%的个体存活的时间;9.PH假定(等比例风险假定),某研究因素对生存的影响不随时间的改变而改变,是COX回归模型建立的前提条件。
1.Cox回归分析及其SPSS操作方法概述前面我们已经讲过生存分析及KM法的内容,详细可以回复数字26-28查看。
但有对统计不太熟悉的“微粉”还不太明白生存分析与一般统计的区别,不知道如何区别Cox回归与Logistic回归。
在我们做研究时,有时我们不仅关心某种结局是否出现,还会关心结局出现的时间,例如肺部手术后观察五年生存率,一个有在1年之后死亡,另外一个人在在4.5后死亡,如果只看第5年时的结局,两者是一样的(均死亡),但是实际我们认为后者的治疗效果可能优于前者,即生存分析同时考虑结局和结局出现的时间,而一般分析只考虑结局。
另外在队列随访时,可能有人在没有到5年时就失访了,如迁徙或者电话更改,我们不了解其结局如何,在一般的分析中这种病例无法使用,而中间失访的病例结局可能更差,如果直接扔掉,可能会产生偏倚;而用生存分析,这种病例可以给我们提供部分资料,即我们记录最后一次随访时病例的状态,失访前的资料可以用于分析。
cox比例风险回归模型结果解读
COX比例风险回归模型是一种常用的生存分析方法,它能够对生存时间或事件发生时间进行建模,并且能够考虑到不同个体的观测时长不同这一特点。
在研究中,COX比例风险回归模型通常被用来探究某种因素对于生存时间或事件发生时间的影响程度。
本文将以COX比例风险回归模型为主题,深入探讨其原理、应用、结果解读和个人理解。
一、COX比例风险回归模型原理COX比例风险回归模型是由David R. Cox于1972年提出的,它是一种半参数模型,既考虑了危险比的比例关系,又不需要对基本风险函数作出严格的假设。
模型的基本形式为:$$ h(t|x) =h_0(t)exp(\beta_1x_1+\beta_2x_2+...+\beta_px_p) $$ 其中,h(t|x)为在给定协变量x情况下,观测到时间t的瞬时事件发生率;h0(t)为基础风险函数,与协变量无关;β1, β2,…, βp为协变量的回归系数;x1, x2,…, xp为对应的协变量。
二、COX比例风险回归模型应用COX比例风险回归模型主要适用于生存分析领域,例如医学、流行病学和生态学等研究中。
研究者可以利用COX比例风险回归模型来探究不同因素对于生存时间或事件发生时间的影响情况。
这种模型在临床试验中也得到了广泛的应用,可以用来评估治疗效果、预测疾病风险等。
三、COX比例风险回归模型结果解读在进行COX比例风险回归模型分析后,我们通常会得到各个协变量的回归系数、危险比和相应的置信区间。
这些结果对于理解不同因素对生存时间或事件发生时间的影响至关重要。
如果某个协变量的危险比为2.0,且置信区间不包含1.0,就说明该因素对事件发生的影响是显著的。
还需要考虑模型的比例风险假设是否成立,以及是否存在共线性等问题。
个人理解与观点:COX比例风险回归模型是一种非常有用的统计方法,它能够帮助研究者从更深层次理解不同因素对生存能力的影响程度。
然而,在进行模型分析时,我们还需要注意模型的适用性和准确性,避免结果的误导性。
COX回归分析分析
1、数据结构
设含有p个变量x1, x2,…,xp及时间T和结局C的 n个观察对象. 其数据结构见表3。
表3 COX模型数据结构
实验对象 t C
1
t1 1
2
t2 0
3
t3 0
… ……
n
tn 1
X1 X2
a11 a12 a21 a22 a31 a32
下的最 LLP (H1)
大部分似然函 和 LLP (H1 )
数
的
对
数
▪ 可以证明在H0成立的条件下,统计量
▪ 自χ由2=度-为2[p的LχLP2分(H布1 )。- LLP (H 0 ) ] 服从
(3)Cox比例风险回归模型
ln(h(t)/ h0(t))=β1x1+β2x2+…+βpxp 参数β 1,β2…,βp称为偏回归系数 , 由于h0(t)是未知的,所以COX模型称为半参 数模型。
COX比例风险函数的另一种形式: h(t)= h0(t)exp(β1x1+β2x2+…+βpxp)
(4) 流行病学意义
“ 生存”的概念
生物生存 仪器始使正常 疾病产生 疾病治愈
阴性
与死亡 与出现故障 与治愈 与复发
与阳性
起始事件 随访时间 终点事件
▪ 疾病确诊 治疗开始 治疗开始 接触危险物
死亡 死亡 痊愈 出现反映
截尾数据的处理
▪ 因为不太好处理截尾数据,很多临床 研究工作者常常将失访或中止等原因造 成的截尾数据在分析时抛弃。截尾数据 提供的信息虽然是不完全的,但也很有 价值,不应随便删掉它。
Logit( p) 0 1 X1 p X p
生存资料的Cox回归分析(3)-结果解读及结论撰写
生存资料的Cox回归分析(3)-结果解读及结论撰写读前提示:本篇文章是“Cox回归分析”的第三部分,如需前情回顾,请返回医咖会主界面,查看 9 月 5 日推送的前两条内容。
结果解读( 1 )CaseProcessingSummary 表格给出了分析数据的基本情况,其中包括事件发生数(Event )、删失数(Censored )和总数(Total )等信息。
(2 )Categorical Variable Codings 表格给出了 Categorical Covariates 选项中设置的变量(本例中为group )所对应的赋值情况和频率(Frequency )。
最后一列给出了变量编码的情况。
脚注b. Indicator Parameter Coding 说明了本研究中group 变量以First 为参照组(Categorical Covariates 选项中的设置)。
(3 )OmnibusTests of Model Coefficients 表格给出了模型中所有变量的回归系数全为0 的检验结果。
对于本例,①Score统计量为5.065, P=0.024 ;②对数似然比检验χ2 =5.399, P=0.020。
说明模型中至少有一个自变量的 HR 值不为1 ,模型整体检验有统计学意义。
( 4 )Variables in the Equation 表格给出了参数估计的结果。
结果显示最后筛选后的模型仅包含group 变量,①P =Sig.=0.029 说明治疗方式为影响肺癌患者预后的独立因素。
②相对危险度 HR=Exp(B)=0.410 ,说明使用新药的患者死亡风险为使用常规药物患者的 0.410 倍,③H R 的 95% 可信区间( 95% CI )为 0.184-0.914。
( 5 )生存曲线。
前述Plots 选项的设置要求输出按照不同药物分组的生存曲线。
新药组(赋值为 1 ,绿色线条)比常规药物组(赋值为0 ,蓝色线条)的生存率高。
cox回归分析
cox回归分析Cox回归分析是一种常用的统计学方法,用于分析生存时间数据和生存分析。
它在医学研究、生物学领域以及工程和社会科学等诸多领域得到广泛应用。
本文将介绍Cox回归分析的概念、原理、使用方法以及在实际问题中的应用。
Cox回归分析是由英国统计学家David Cox提出的一种统计方法。
它是基于风险比(Hazard Ratio)的概念,用于估计某个变量对事件发生概率的影响。
所谓“风险比”即某个因素发生后,事件发生概率相对于该因素不发生时的比值。
Cox回归分析的核心思想是通过构建一个风险函数来描述某个因素对事件发生的影响。
具体而言,风险函数是生存时间的密度函数和基准风险函数的乘积。
基准风险函数是指在没有任何因素作用时,事件发生的概率密度函数。
Cox回归分析的目标是估计出各个因素的风险函数,进而计算出它们的风险比。
在进行Cox回归分析时,首先需要收集相关的数据。
数据包括生存时间和事件发生情况,以及可能的影响因素,如年龄、性别、治疗方式等。
然后,通过Cox回归模型,可以估计出每个因素的风险比及其置信区间。
Cox回归分析可以通过不同的方法进行模型拟合和参数估计。
常用的方法包括偏似然估计、梯度下降算法和牛顿-拉夫逊算法等。
根据模型拟合的结果,可以得到每个因素的风险比及其显著性检验结果。
Cox回归分析在实际问题中有广泛的应用。
以医学研究为例,研究者常常希望了解某种治疗方式对患者生存时间的影响。
通过Cox回归分析,可以估计出不同治疗方式的风险比,并判断其是否显著。
这样就可以为临床医生提供有关治疗选择的科学依据。
另外,Cox回归分析也可以用于预测生存时间。
在预测模型中,可以考虑多个因素的影响,并计算出每个因素的权重。
通过对新样本的观测数据进行Cox回归分析,可以基于已知因素的权重预测出其生存时间。
除了医学研究外,Cox回归分析还可以应用于其他领域。
例如,在金融领域,可以使用Cox回归分析来研究某个因素对违约概率的影响;在社会科学中,可以使用Cox回归分析来分析某个因素对离婚率的影响。
cox回归结果解析
之阳早格格创做筛选变量的要领:第一步,分离临床,临床认为有闭的变量均筛选出去.第二步.应用单变量的相闭分解,把隐著相闭的变量筛选出去,死存临床意思更大的那个.第三步,应用Kaplan-Meier法对付每个伤害果素的二个表露火仄搞存正在直线,若直线存留接叉,则不克不迭应用Cox存正在分解(Cox存正在分解也称比率危害返回,它包罗一个假定,即正在随访功夫表露于预后果素与非表露的危害比率保护恒定),那类变量需应用更搀纯的非比率危害返回模型,那里将不详述了.第四步,单果素分解.可应用COX存正在分解的第0步截止动做单果素分解的截止.可正在SPSS的Cox 返回里采用所有一种前进法,正在Option中采用at each step,与果子筛选第0步的Score考验截止动做单果子Cox 返回分解的截止.也有文章的单果素分解对付于失集型变量应用卡圆考验战连绝型变量应用t考验,等第资料应用单变量相闭分解.末尾,将举止Cox返回分解.应用SPSS中analysis-survival-cox regression.正在time一栏中采用存正在时间;正在state一栏中采用数据状态(正在数据编码中已经介绍),正在激活的define event一栏中设定single value 为1.那里要强调几个小问题:1,SPSS不妨收援钻研者搞二个大概以上的变量的共共效力,需正在主对付话框中共时选中需钻研的变量二个大概二个以上,那样协变量框中的>a*b>才会被激活.2,分类变量,正在那里被称为哑变量,需单打categorical,而后将分类变量选进对付话框.末尾得到的截止,B为协变量的系数,Exp(B)为相对付伤害度.可得到比率危害模型:h(t,x)=h0(t)exp(Σβ ixi)公式1-1预后指数也称预后得分,PI(prognostic index)= (Σβ ixi)PI=0代表伤害率处于仄衡火仄,PI<0,代表伤害率矮于仄衡火仄;PI>0,代表伤害率下于仄衡火仄.由公式1-1不妨供得局部病人的预后指数.将所有的预后指数搞等第变更,比圆分组的界面PI=-1,0,1,以PI为分类变量搞COX返回,并预计存正在率,便赢得预后指数分类存正在率,若样原量很大,大概代表性比较佳,可用内插法分别预计分歧预后指数火仄的人群的k年存正在率,以及中数存正在期,体例成参照表,即可用于临床,根据每个病人的PI值,预测其存活k年的概率,以及憧憬的存正在年数.末尾一段戴自圆积坤主编的第二版《医教统计教与电脑考查》.如果咱们不妨象海中一般搞大规模多核心前瞻的钻研,尔一定要搞到末尾一步.本去那个问题闭键仍旧正在您自己,便是您为何要定义分类变量?如果变量是连绝变量大概者是具备等第闭系的,那么普遍是大概义为分类变量的,比圆年龄,身下,体沉等等.如果变量的数值之间不等第闭系,比圆组别,咱们用1表示A组,2表示B性,3表示C组,那个正在分解的时间是需要定义为分类变量的,果为那个数值的大小是不意思的.所以闭键怎么采用,仍旧需要瞅楼主那几个变量所代表的简直意思.COX返回时如果需要分解的自变量中为有序多分类,为包管截止的准确性,应将其指定为亚变量举止分解(庄重的道,二分类变量也应举止指定,但是不指定时的分解截止是等价的),所以您定义为categorical后的预计截止是可疑的the final multivariate Cox regression model, xx was identified as an independent prognostic factor with an adjusted hazard ratio of 1.60 (95% confidence interval 1.07–2.41)”,而有的文章则是那样形貌“Cox regression indicated that ING4 expression is an independent prognostic factor for overall 5-year survival (Relative risk = 2.50, 95% confidence interval = 1.09–5.74, P = 0.031)”请问那二种形貌有什么辨别?hazard ratio与relative risk又有什么分歧?开开大家!相闭徐病:••1、Enter:所有自变量强造加进返回圆程;2、Forward: Conditional:以假定参数为前提做似然比概率考验,背前逐步采用自变量;3、Forward: LR:以最时势部似然为前提做似然比概率考验,背前逐步采用自变量;4、Forward: Wald:做Wald概率统计法,背前逐步采用自变量;5、Backward: Conditional:以假定参数为前提做似然比概率考验,背后逐步采用自变量;6、Backward: LR:以最时势部似然为前提做似然比概率考验,背后逐步采用自变量;7、Backward: Wald:做Wald概率统计法,背后逐步采用自变量.--------------------------------------------------------------------------------------------------------------正在自变量很多时,其中有的果素大概对付应变量的效率不是很大,而且x之间大概不真足相互独力的,大概有各类互做闭系.正在那种情况下可用逐步返回分解,举止x果子的筛选,不妨很佳天剔除一些对付模型孝敬不大的变量,那样修坐的多元返回模型预测效验会比较佳.如下,变量非常多的情况:y:历年病情指数x1:前年冬季油菜越冬时的蚜量(头/株)x2:前年冬季极度气温x3:5月份最下气温x4:5月份最矮气温x5:3~5月份落火量x6:4~6月份落火量x7:3~5月份均温x8:4~6月份均温x9:4月份落火量x10:4月份均温x11:5月份均温x12:5月份落火量x13:6月份均温x14:6月份落火量x15:第一次蚜迁下峰期百株烟草有翅蚜量x16:5月份油菜百株蚜量x17:7月份落火量x18:8月份落火量x19:7月份均温x20:8月份均温x21:元月均温正在变量较少大概者是有很多变量不意思的情况下,用ENTER比较佳forward用得最多,但是传闻backward效验更佳,但是二者截止基原普遍的,好别的情况很少尔睹过有的文章正在搞返回分解的时间,enter、forward、backward所有用“多果素logistic返回分解截止:enter、forward、backward 3 种分解均提示缓性炎症状态是最热烈的伤害果素,而血黑蛋黑删加、活动度删加、食欲革新具备呵护性效率. ”———1239例CKD并收营养不良战心血管徐病的多核心考察及中药搞预的真验。
COX回归分析解析
COX回归分析解析Cox回归分析是一种常用的生存分析方法,用于评估对生存时间有影响的因素。
它可以解决各种因素在时间上对生存时间的影响,并可以考虑协变量的影响。
本文将对Cox回归分析的原理、应用和解读进行详细解析。
1. Cox回归分析原理Cox回归分析基于Cox比例风险模型,该模型假设各个协变量对生存时间的影响是线性的,并且不随时间变化。
其模型的数学表达式如下:h(t,x) = h0(t) * exp(β1x1 + β2x2 + ... + βpxp)其中,h(t,x)表示在给定协变量(x1, x2, ..., xp)条件下,时间t时刻个体的瞬时风险;h0(t)是基准风险函数,表示在所有协变量都为0的情况下,个体的风险函数;β1, β2, ..., βp为协变量x1, x2, ..., xp的回归系数。
2. Cox回归分析应用Cox回归分析广泛应用于生存分析领域,特别是在临床研究中。
它可以研究各种协变量对生存时间的影响,并进行因素筛选和预测。
在临床研究中,Cox回归分析可以用于评估各种因素对疾病生存时间的影响,如性别、年龄、治疗方式等。
同时,它还可以用于预测患者的生存概率,为临床决策提供依据。
除了临床研究外,Cox回归分析还可以用于其他领域的生存分析,如经济学、社会学等。
它可以评估不同因素对个体生存时间的影响,并提供深入的解释和预测。
在进行Cox回归分析后,可以得到每个协变量的回归系数和相应的风险比(HR)。
风险比是比较不同协变量之间风险大小的衡量指标。
当HR大于1时,表示该因素增加了个体生存时间的风险;当HR小于1时,表示该因素减少了个体生存时间的风险。
此外,Cox回归分析还可以得到每个协变量的置信区间(CI),用于对回归系数的显著性进行评估。
当CI不包含1时,表示该因素对生存时间具有显著影响;当CI包含1时,表示该因素对生存时间的影响不显著。
为了更好地解释结果,还可以绘制Kaplan-Meier曲线,用于显示不同组之间的生存差异。
COX回归分析
COX回归分析
接下来,将事件发生时间、事件状态和预测变量作为输入,进行COX
回归分析。
在COX回归分析中,事件发生时间和事件状态被编码为一个对
数似然函数,即
log(λ(t)) = β0 + β1x1 + β2x2 + ... + βpxp
其中,λ(t)表示在时间t事件发生的概率密度函数,β0是一个基
准风险,β1到βp是对应预测变量的系数,x1到xp是对应预测变量的
取值。
模型评估的主要方法是似然比检验和比例风险检验。
似然比检验用于
检测整个模型的有效性,比例风险检验用于检测每个预测变量的有效性。
如果似然比检验的P值小于显著水平,可以认为预测变量对事件风险有显
著影响。
结果解读时,主要关注风险比(HR)和置信区间(CI)。
风险比可以
用来比较两个组之间的事件风险,HR>1表示高风险,HR<1表示低风险,HR=1表示相同风险。
置信区间表示了对风险比的估计的不确定性范围,
通常使用95%置信区间。
总之,COX回归分析可以帮助研究者识别和评估多个预测变量对事件
风险的影响。
通过选择预测变量、建立模型、评估模型和解读结果,可以
得到有关预测变量对事件风险影响的有效信息,为生存分析提供科学依据。
(仅供参考)Cox回归分析—非常详细的SPSS操作介绍
患者生存状态的影响因素分析——生存资料的COX回归分析1、问题与数据某研究者拟观察某新药的抗肿瘤效果,将70名肺癌患者随机分为两组,分别采用该新药和常规药物进行治疗,观察两组肺癌患者的生存情况,共随访2年。
研究以死亡为结局,两种治疗方式为主要研究因素,同时考虑调整年龄和性别的影响,比较两种疗法对肺癌患者生存的影响是否有差异。
变量的赋值和部分原始数据见表1和表2。
表1. 某恶性肿瘤的影响因素与赋值表2. 两组患者的生存情况group gender age time survival0 1 0 22 10 1 1 10 10 1 1 64 10 1 1 12 10 1 0 17 11 0 0 19 11 1 1 4 11 0 1 12 01 0 0 5 01 1 1 27 02、对数据结构的分析该研究以死亡为结局,治疗方式为主要研究因素,每个研究对象都有生存时间(随访开始到死亡、失访或随访结束的时间),同时考虑调整年龄和性别的影响。
欲了解两种疗法对肺癌患者生存的影响是否有差异,可以用Cox比例风险模型(Cox proportional-hazards model,也称为Cox回归)进行分析。
实际上,Cox回归的结局不一定是死亡,也可以是发病、妊娠、再入院等。
其共同特点是,不仅考察结局是否发生,还考察结局发生的时间。
在进行Cox回归分析前,如果样本不多而变量较多,建议先通过单变量分析(KM法绘制生存曲线、Logrank检验等)考察所有自变量与因变量之间的关系,筛掉一些可能无意义的变量,再进行多因素分析,这样可以保证结果更加可靠。
即使样本足够大,也不建议把所有的变量放入方程直接分析,一定要先弄清楚各个变量之间的相互关系,确定自变量进入方程的形式,这样才能有效的进行分析。
单因素分析后,应当考虑应该将哪些自变量纳入Cox回归模型。
一般情况下,建议纳入的变量有:1)单因素分析差异有统计学意义的变量(此时,最好将P值放宽一些,比如0.1或0.15等,避免漏掉一些重要因素);2)单因素分析时,没有发现差异有统计学意义,但是临床上认为与因变量关系密切的自变量。
cox回归结果解析
筛选变量的办法:第一步,联合临床,临床以为有关的变量均筛选出来.第二步.运用双变量的相干剖析,把明显相干的变量筛选出来,保存临床意义更大的谁人.第三步,运用Kaplan-Meier法对每个安全身分的两个吐露珠平做生计曲线,若曲线消失交叉,则不克不及运用Cox生计剖析(Cox生计剖析也称比例风险回归,它包含一个假定,即在随访时代吐露于预后身分与非吐露的风险比例保持恒定),这类变量需运用更庞杂的非比例风险回归模子,这里将不胪陈了.第四步,单身分剖析.可运用COX生计剖析的第0步成果作为单身分剖析的成果.可在SPSS的Cox回归里选择任何一种进步法,在Option中选择at each step,取因子筛选第0步的Score磨练成果作为单因子Cox 回归剖析的成果.也有文章的单身分剖析对于离散型变量运用卡方磨练和持续型变量运用t磨练,等级材料运用双变量相干剖析.最后,将进行Cox回归剖析.运用SPSS中analysis-survival-cox regression.在time一栏中选择生计时光;在state一栏中选择数据状况(在数据编码中已经介绍),在激活的define event一栏中设定single value为 1.这里要强调几个小问题:1,SPSS可以支撑研讨者做两个或以上的变量的配合效应,需在主对话框中同时选中需研讨的变量两个或两个以上,如许协变量框中的>a*b>才会被激活.2,分类变量,在这里被称为哑变量,需单击categorical,然后将分类变量选入对话框.最后得到的成果,B为协变量的系数,Exp(B)为相对安全度.可得到比例风险模子:h(t,x)=h0(t)exp (Σβ ixi)公式1-1预后指数也称预后得分,PI(prognostic index)= (Σβ ixi)PI=0代表安全率处于平均程度,PI<0,代表安全率低于平均程度;PI>0,代表安全率高于平均程度.由公式1-1可以求得全体病人的预后指数.将所有的预后指数做等级变换,例如分组的界点PI=-1,0,1,以PI 为分类变量做COX回归,并估量生计率,便获得预后指数分类生计率,若样本量很大,或代表性比较好,可用内插法分离估量不合预后指数程度的人群的k年生计率,以及中数生计期,编制成参照表,即可用于临床,依据每个病人的PI值,猜测其存活k年的概率,以及期望的生计年数.最后一段摘自方积乾主编的第二版《医学统计学与电脑实验》.假如我们可以或许象国外一样做大范围多中间前瞻的研讨,我必定要做到最后一步.其实这个问题症结照样在你本身,就是你为何要界说分类变量?假如变量是持续变量或者是具有等级关系的,那么一般是不界说为分类变量的,比方年纪,身高,体重等等.假如变量的数值之间没有等级关系,比方组别,我们用1暗示A组,2暗示B性,3表示C组,这个在剖析的时刻是须要界说为分类变量的,因为这个数值的大小是没有意义的.所以症结怎么选择,照样须要看楼主这几个变量所代表的具体意义.COX回归时假如须要剖析的自变量中为有序多分类,为包管成果的精确性,应将其指定为亚变量进行剖析(严厉的讲,两分类变量也应进行指定,但不指准时的剖析成果是等价的),所以您界说为categorical后的盘算成果是可托的the final multivariate Cox regression model, xx was identified as an independent prognostic factor with an adjusted hazard ratio of 1.60 (95% confidence interval 1.07–2.41)”,而有的文章则是如许描写“Cox regr essionindicated that ING4 expression is an independent prognostic factor for overall 5-year survival (Relative risk = 2.50, 95% confidence interval = 1.09–5.74, P = 0.031)”请问这两种描写有什么差别?hazard ratio与relative risk又有什么不合?感谢大家!相干疾病:••1.Enter:所有自变量强迫进入回归方程;2.Forward: Conditional:以假定参数为基本作似然比概率磨练,向前慢慢选择自变量;3.Forward: LR:以最大局部似然为基本作似然比概率磨练,向前慢慢选择自变量;4.Forward: Wald:作Wald概率统计法,向前慢慢选择自变量;5.Backward: Conditional:以假定参数为基本作似然比概率磨练,向后慢慢选择自变量;6.Backward: LR:以最大局部似然为基本作似然比概率磨练,向后慢慢选择自变量;7.Backward: Wald:作Wald概率统计法,向后慢慢选择自变量.--------------------------------------------------------------------------------------------------------------在自变量许多时,个中有的身分可能对应变量的影响不是很大,并且x之间可能不完整互相自力的,可能有各种互作关系.在这种情形下可用慢慢回归剖析,进行x因子的筛选,可以很好地剔除一些对模子进献不大的变量,如许树立的多元回归模子猜测后果会比较好.如下,变量异常多的情形:y:积年病情指数x1:前年冬季油菜越冬时的蚜量(头/株)x2:前年冬季极端气温x3:5月份最高气温x4:5月份最低气温x5:3~5月份降水量x6:4~6月份降水量x7:3~5月份均温x8:4~6月份均温x9:4月份降水量x10:4月份均温x11:5月份均温x12:5月份降水量x13:6月份均温x14:6月份降水量x15:第一次蚜迁岑岭期百株烟草有翅蚜量x16:5月份油菜百株蚜量x17:7月份降水量x18:8月份降水量x19:7月份均温x20:8月份均温x21:元月均温在变量较少或者是有许多变量没有意义的情形下,用ENTER比较好forward用得最多,但据说backward后果更好,但两者成果根本一致的,差别的情形很少我见过有的文章在做回归剖析的时刻,enter.forward.backward一升引“多身分logistic回归剖析成果:enter.forward.backward 3 种剖析均提醒慢性炎症状况是最强烈的安全身分,而血红蛋白增多.运动度增多.食欲改良具有呵护性感化. ”———1239例CKD并发养分不良和血汗管疾病的多中间查询拜访及中药干涉的实验。
Cox回归分析.ppt
病人
处理 性别 生存 结局 组号 (男=1) 天数 (死=1)
风险函数 (因人而异)
Name x1 x2 t
d h(t)=h0(t) e b1x1b2x2
王一 1 1 18 1
e h0(t) b1b2
黄二 0 0 48 1
h0(t)
张三 0 1 70 0
h0(t) eb2
李四 1 0 90 1
h0(t) eb1
风险率 (随时变化)
18 天
48 天
h0(18) eb1b2
90天
h0(18) e 0 h0(18) eb2
h0(18) eb1
h0(48) e 0 h0(48) eb2
Cox模型的 基本形式
利用生存率函数S(t,X)与 风险函数h(t,X)的关系可 导出
St, X exp
t 0
ht,
X
dt
exp
t 0
h0
t exp
X
dt
S0
t exp(
X
)
j
较好地解 决截尾值 的问题
反映了协变量X与生存函数的关系
Cox回归分析
随访资料的特点
① 分布类型不易确定。一般不服从正态分布,少数 情况下近似服从指数分布、Weibull分布、 Gompertz分布等,多数情况下往往是不服从任 何规则的分布类型。
② 影响因素多而复杂且不易控制。 ③ 根据研究对象的结局,生存时间数据可分为两种
类型:
完全数据(complete data) 截尾数据(截尾值、删失数据,censored data)
1 0
2 2
1 0
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4. 生存曲线不能随意延长,也不能轻易用 于预测预报,经过大量研究所得的生存 曲线才有可能推广应用。 5.模型拟合优度考察: 据预后指数 PI(prognostic index)分组, 比较各组基于Cox模型的生存曲线与基于 kaplan-Meier 法估计的生存曲线,如两 组曲线吻合较好,表明Cox模型拟合较好。
1、数据结构
设含有p个变量x1, x2,…,xp及时间T和结局C的 n个观察对象. 其数据结构见表1。
表1
实验对象 t
COX模型数据结构
C X1 X2 X3
1 2 3 … n
t1 t2 t3 … tn
1 0 0 … 1
a11 a21 a31 … an1
a12 a22 a32 … an2
a13 … a23 … a33 … … … an3 …
a. Beginning Block Number 0, initial Log Likelihood function: -2 Log likelihood: -61.344 b. Beginning Block Number 1. Method: Enter
Variables in the Equation X1 X2 X3 X4 X5 X6 B .262 .053 -1.274 1.106 -2.587 -.541 SE .896 .053 1.261 .618 1.114 .848 Wald .085 .995 1.020 3.201 5.397 .407 df 1 1 1 1 1 1 Sig. .770 .318 .312 .074 .020 .524 Exp(B) 1.299 1.054 .280 3.023 .075 .582
• 5. 生存曲线(选入2个变量的模型)
9.COX回归应该注意事项
1.COX模型的基本假定是比例风险假定(PH)。只有满足该假 定的前提下,基于此模型的分析预测才是可靠和有效的。 即资料除满足基本要求外,还要求因素对生存时间的作用 不随时间变化(比例风险假定)。如观察年限超过10年时, 癌症手术后放疗的治疗作用可能逐渐消失,从而不满足这 一要求。 2.检查某自变量是否满足PH假定,最简单的方法是观察按该 变量分组的Kaplan-Meier生存曲线,若生存曲线明显交叉, 提示不满足PH假定。图形法有一定的主观性,但由于图法 简便、直观。在实际中很常用。 3.COX比例风险回归模型所需样本含量的经验估算方法是至 少需要相当于协变量个数10-15倍的阳性结局事件数。
Cox比例风险回归模型
ln(h(t)/ h0(t))=β1x1+β2x2+…+βpxp
参数β 1,β2…,βp称为偏回归系数 , 由于h0(t)是未知的,所以COX模型称为半参 数模型。 COX比例风险函数的另一种形式: h(t)= h0(t)exp(β1x1+β2x2+…+βpxp)
4. 流行病学意义
•
多元线性回归模型:
ˆi y
b0 b1 x1i b2 x2i
1 X1
bp x pi
pXp
Logistic回归模型:
ln[ p /(1 p)]
0
设不存在因素X1、X2 、Xp的影响下, 病人t 时刻死亡的风险率为h0(t), 存在因素X1、 X2 、Xp t的影响下, t时刻死亡的风险率为h(t). 用死亡率的比 h(t)/h0(t) 代替P/(1-P)即得。
编 项目登记 观察记录 号 性别 年龄 分期 鼻血 放疗 化疗 开始日 终止日 结局
…
51
…
2
…
2
…
1
…
0
…
…
…
…
2363
88-12-1 95-5-22 1
注:性别‘ 1’ 为男性、放疗‘ 1’ 表示采用,‘ 0’ 表示未采用、结局 ‘1’表示死亡。
3.SPSS 软件实现方法
• File→Open→相应数据(已存在)→ Analyze→ Survival→Cox regression →Time(dat)→Status →Define event →single value(1) →Continue → Covariates(自变量) →method → Fkward→Continue →
Total a. Dependent Variable: DAY
Omnibus Tests of Model Coefficientsa,b Overall (score) -2 Log Likelihood Chi-square df 45.145 14.783 6 Change From Previous Step Change From Previous Block Sig. Chi-square df Sig. Chi-square df Sig. .022 16.199 6 .013 16.199 6 .013
Cox模型中回归系数的检验
• 假设为 H0: ,其它参数β固定; 0 k • H1: ,其它参数β固定。 0 k • H0 成 立 时 , 统 计 量 Z = bk / SE(bk) 服从标准正态分布。SE(bk)是回归系数bk的 标准误。
6、Cox回归模型的作用
(1) 可以分析各因素的作用 (2)可以计算各因素的相对危险度 (relative risk,RR) (3)可以用 β1x1+β2x2+…+βpxp(预后 指数)估计疾病的预后。
Covariate Means X1 X2 X3 X4 X5 X6 Mean .500 44.625 2.063 1.250 .563 .625
Zhubu:Block1: Method = Forward Stepwise (Wald)
Variables not in the Equationa,b Step 1 X1 X2 X3 X5 X6 X1 X2 X3 X6 Score 1.320 .220 .019 6.144 .488 .016 .712 .867 .692 df 1 1 1 1 1 1 1 1 1 Sig. .251 .639 .891 .013 .485 .900 .399 .352 .406
模型结构
变量筛选 前进法;后退法;逐步法 参数估计 最小二乘法 参数检验 F-test t-test 参数解释 回归系数b 样本含量 至少变量数的10倍 应用 因素分析 预测预报 Y 最大似然法 似然比检验 Wald检验 score检验 优势比OR 至少变量数的20倍 最大似然法 似然比检验 Wald检验 score检验 RR 非截尾例数至少变 量数的10倍
(1)向前法(forward
7、筛选变量(逐步COX回归分析)
selection)
(2)后退法(backward selection) (3)逐步回归法 逐步引入-剔除法(stepwise selection) SPSS实现方法与Logistic回归相同
Enter和Remove的确定同前
调试法:P从大到小取值0.5,0.1, 0.05,一般实际用时, Enter , Remove应多次选应的风险比(risk ratio,记 为RRi): RRi=exp(bi),表示该因素每增加一个单位时,风险 度改变多少倍。
• 在本例中放疗X5,取值0和1,b=-1.589, RR=0.204,表示因 子水平1与0比较,前者的风险度是后者的0.204倍 (20.4%),提示“放疗”是有利因素。“鼻血”X4取值是 0、1、2, b=1.38, RR=3.978,表示因子水平每增加1个等级, 风险度增加3.978倍,提示“鼻血”是不利因素。
…. XP
a1p a2p a3p … anp
2、COX回归模型 (Cox regression model)
(1)风险率(hazard rate):
患者在t时刻仍存活,在时间t后的瞬间 死亡率,以h(t)表示。
h(t )
死于区间(t , t t )的病人数 在t时刻尚存的病人数 t
3.COX回归模型的构造
Variables in the Equation Step 1 Step 2 X4 X4 X5 B 1.084 1.381 -1.589 SE .421 .530 .695 Wald 6.630 6.799 5.221 df 1 1 1 Sig. .010 .009 .022 Exp(B) 2.957 3.978 .204
• Options→Correlation of estimate→ Display model→at last step→Entry-removal (0.05,0.10)→Maximum iterations(20)→ Continue→OK
Case Processing Summary N Cases available in analysis Cases dropped Event a Censored Total Cases with missing values Cases with non-positive time Censored cases before the earliest ev ent in a stratum Total 15 1 16 0 0 0 0 16 Percent 93.8% 6.3% 100.0% .0% .0% .0% .0% 100.0%
变量xj暴露水平时的风险率与非暴 露水平时的风险率之比称为风险比HR (hazard ratio)
HR= eβi
HR风险比 相对危险度RR
偏回归系数及意义
1. 若危险因素为二值变量,其偏回归系数表示当 其他自变量固定时,相对危险度的对数值;
2. 若危险因素为等级变量,偏回归系数表示当其 他自变量不变的情况下,变量每改变一个等级, 两个相邻等级的RR值增加exp(bi)倍;
3. 若危险因素为连续性变量,偏回归系数表示当 其他自变量不变的情况下,变量每改变(增加) 一个单位,其RR值变化(增加) exp(bi)倍。