ImageJ软件在检验医学图像分析处理中的应用

ImageJ软件在医学图像分析处理中的应用

ImageJ是一个用Java语言开发的图像处理和分析平台,具备多种图像处理和分析功能, 下载地址: http: / /rsb1info1nih1gov/ ij/download /win32 / ij1332setup1exe 。该软件是一个免费软件,支持插件技术,而且开放源代码。互联网上针对该软件的免费插件很多(下载地址: http: / / rsb1info1nih1gov/ ij/p lugins/index1html) 。

一、软件准备

下载并安装ImageJ: 得益于Java 的跨平台性优势,ImageJ可以运行在Linux、Mac OS和Windows等平台上,这也是该软件的一大优势,是其得以广泛应用的原因之一。

二、实验分析:

分析电泳图谱: (1)启动ImageJ ,打开采集的图像。用方形图像选择工具在图像上圈定一个电泳图谱(注意要将各个条带都全部框住), 然后按1 键(相应的菜

单操作为:Analyze→Gels→Select First Lane),标记和选定该电泳图谱。如果一幅图像上有多个电泳图谱,将鼠标放在该方框的中央,按住鼠标拖动方框(注意不要改变方框大小)将其放在下一个电泳图谱上,按2键(相应的菜单操作为: Analyze→Gels→Select Next Lane),分别标记和选定这些电泳图谱。(2)所有电泳图谱都标记完毕后,按3键(相应的菜单操作为:Analyze→Gels→Plot Lanes)生成所有选定电泳图谱的光密度分布曲线。用直线工具在每一条曲线上划一条基线,使得曲线上的每一个波峰都能与基线围成一个封闭区域。如果生成的曲线较多,可以用手形工具上下移动图像执行此操作。(3)选用魔术棒工具,在曲线上的每一个波峰的封闭区域内单击鼠标,程序自动计算该封闭区域的面积,一个曲线上的所有波峰的面积都计算完毕后执行Analyze →Gels→Label Peaks,程序自动计算每一波峰的面积百分比,并标记在曲线上。此值即为该电泳图谱上各个条带的含量百分比。(4)一个电泳图谱分析完毕后,执行

Analyze→Gels→ResetCounter将计数器回零,重复第3步操作,分析下一个电泳图谱的光密度曲线。

统计学处理:用Excel 2000进行t检验。

1.首先用image J来打开此western blot的图像

2.选定并标记目的条带的区域

3读取目的区域的光密度

4得到目的区域的光密度

5将每个区域隔开

6读取光密度数据

7. 将得到的数据输入excel 或spss里面进行统计处理.