医学一体化语言系统UMLS

过程
1986-1988的第一阶段，其研究和开发的重点是调查用户需求、 开发研究工具、 确定UMLS的性能及其实施方案、界定系统组 成等。在此阶段主要界定了UMLS的三个组成部分即超级叙词 表、语义网络、情报源图谱，并且进行了包括Mesh、 SNOMED、CMIT和PDQ词表在内的联接试验。
1989-1991年为UMLS的发展阶段，其开发的重点是迅速研制 和发行三个UMLS产品的试验版，同时继续开展用户调查和 UMLS功能开发。
到相同的Term identifier (LUIs)；同理“Auricular Fibrillation”和
“Auricular Fibrillations”也会同样被指引到另一个term identifier
(LUIs)。而当系统检视term identifier时会发现“Artial Fibrillation” 和
来源：这些概念和词来自60 多个生物医学受控词表、 术语表、分类表、专家系统中的词汇、词典及工具性词 表等，如Mesh表及其葡萄牙语、西班牙语、法语、德 语、俄语等各种译本、 《医学系统化术语表》、 《国 际疾病分类》修订第 10 版及其他各版、 《护理诊断分 类》、麻省总医院研制开发的DX plain专家系统、 《多 兰氏图解医学辞典》、 《校1 对词表》3.1 版等。
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概念组织：
叙词表是依据概念（concept）或涵义（meaning） 组织起来的，其根本目的是将相同概念的交替名称 和不同形式联系在一起，并识别不同概念之间的联 系。因此，可以说概念是超级叙词表组织系统的中 心。保留原有词表中概念与关系，同时增加了一个 新的关联。整合成一个庞大的可控的知识库。
涵会被错误指引的问题。然而在以后的版本中，有关处理 同形异义的问题，可能会采用限定词的方式，如“cold (temperature)”, “cold (disease)”等 。
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Concepts (CUIs)
C0009264 cold temperature
FIGURE 2.
Terms (LUIs)
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(1)工作量大。因为其工作繁难，国外的信息检 索系统中有75%的运行费用要用于人工标引。 (2)效率低。标引员要正确标引一篇文献，往往 要耗时一个半小时以上。
(3)一致性差。美国的Cleverton曾做过一些试 验，他指出：两组人为同一主题编出的叙词表， 其中词的同一率仅60%。两位有经验的标引员 用同一叙词表对同一篇文献进行标引，其标引 词的同一率仅有30%左右。两个在同一库中用 同一检索系统检索同一问题的人，检索出的结 果的同一率仅有40%。两位科研人员根据同一 提问判断一组指定文献的相关性，其同一率不 会超过60%。
医学一体化语言系统UMLS
前言
20世纪中叶是情报语言学研究中人工语 言发展的鼎盛时期，20世纪末叶是人工 语言与自然语言相结合的新兴阶段。
自然语言由于存在词汇的同义、多义现 象，词汇的模糊性和不确定性，词汇量 的巨大，词间关系不明晰等问题，不可 能单纯使用它进行检索，所以需要用一 种受控检索语言对检索和标引所用的词 汇进行控制，把用户的语言和标引人员 的语言统一起来。 由于信息量的扩充， 给人工语言的处理带来了很大的困难。
S0026353 Cold
S0026747 Common Cold
S0007171 Cold <2>
S0026353 Cold
不同概念间关联的建立
在Meta中展示了不同概念间的各种关系，而这些关系 的建立，有些是取自原有的索引表架构，有些则是在 建构Meta时所赋与的。例如“Atrial Fibrillation” （心 房纤维颤动）和“Arrhythmia”（心律失常）在MeSH 中是以层级架构来展示二词间的隶属关系。但“Atrial Fibrillation”在本质上也是一种“Arrhythmia” 在MeSH 中却没有被展现，此即Meta在建构时所新添的关系。 另外，有时也会有来自其它索引典所建立起来的概念 关系应用到Meta上。例如概念词“Paroxysmal Atrial Fibrillation” （阵发性心房纤维颤动）在Meta中被指 引为“Atrial Fibrillation” 的下位词(Narrowed term)， 即是取自MeSH, ICD-9, SNOMED等索引表中所建立 的架构。
92年至今为应用阶段 ，1996年UMLS新增了一个组成部分即 “专家词典”。在此阶段，许多研究机构利用UMLS 进行基于 Internet的应用开发，如决策支持系统DX plain、文献检索系统 Web medicine、临床Web搜索系统Clin web、医学世界检索 Medical world search以及集成化的Med weaver等。同时进行 了NLM/AHCPR大规模词汇测试。
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一、UMLS的建立与发展过程
建立目的：
旨在建立一个计算机化的可持续发展的生物医学检索语言集成系 统和机读情报资源指南系统，其目的在于提高计算机程序“理解” 用户提问中生物医学词汇语义的能力，并利用这种理解帮助用户 检索和获取相关的机读情报。UMLS是计算机化的情报检索语言 集成系统，它不仅是语言翻译、自然语言处理及语言规范化的工 具，而且是实现跨数据库检索的词汇转换系统，它可以帮助用户 在联接情报源，包括计算机化的病案记录、书目数据库、事实数 据库以及专家系统的过程中对其中的电子式生物医学情报作一体 化检索。是使医疗卫生专业人员和研究工作者能够通过多种交互 检索程序，克服由于不同系统语言差异性和不同数据库相关情报 的分散性所造成的诸多情报检索问题，帮助用户从电子病案系统、 书目数据库、图像数据库、事实数据库、专家系统等各种联机情 报源中检索和获取综合性或特定性的情报信息。 主要解决：1） 同一概念由于不同的人或在不同的数据库中可能会有不同的表达 方式； 2） 数据库系统分散所1造成的检索不完整的问题 。
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Hale Waihona Puke （ 1 ）超级叙词表超级叙词表是生物医学概念、术语、词汇及其等级范畴 的广泛集成。“Meta”意即超越、含盖。
1997年第8版的超级叙词表收录了来源于30多种生物医 学词表和分类表的能表达33万多个概念的739439个词 汇，2001年12版收录了83万个概念，190万个词。到 2002 年 ， 第 13 版 超 级 叙 词 表 收 录 了 776940 个 概 念 共 210万个词。
或语文上拼字的不同，凡是有差异者均视为一个独
立的字符串，而分别赋予不同的字符串识别码
(unique string identifier, 简称SUI)。由于Meta实际
上是由英文款目所构成的，所以不同词型间表达相
同概念的语词要能连结在一起，就必须依赖一般形
式识别码术语码(common term identifier, 简称LUI)
类推。
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Meta利用LUIs来串接SUIs及CUIs。但是这种处理方式有可
能导致一个字符串若含有多种意义时，可能会被错误指引。 尤其是Meta中包含多个索引表系统，此类状况当然可能发 生。
举例：字符串Cold的含义可能指温度上的冷，也可能是指 一般感冒，因此在SUIs中将其分别定义为cold (1)、cold (2)，在String部份就会产生四个与cold近似的字。因cold、 cold (1)、cold (2)在拼字上仅有些许差异，故被指引到同 一个LUI，相对的Common Cold则被指定为另一个LUI。 而检视Term identifier时，根据语词含义，再分别指引到所 属含义的CUIs，其中Cold因语义模糊，所以被指引到二个 Concept identifier，系统以此方式解决同一字符串不同内
的指引。
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Concept (CUI)
Terms (LUIs)
C0004238 Atrial Fibrillation (preferred) Atrial Fibrillations Auricular Fibrillation Auricular Fibrillations
L0004238 Atrial Fibrillation (preferred) Atrial Fibrillations
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(4)词表的不完备性影响了标引的质量。词 表的更新赶不上时代发展的步伐。庞大的词 表，使标引速度大大地降低。
(5 )标引员与检索员都必需熟悉词表才能工 作，使用非常不便。因此，必须发展使用电 脑来进行自动标引。早在1956年，美国的 H.P.Luhn就开始了文献自动标引的试验； 60年代初，美国的G.Salton教授在自动标引 方面取得了令世界瞩目的成就。
中医药文献数据库在多年的建库过程中，深 刻体会到标引工作的复杂性与耗时、人、财 量。
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为实现自动标引与自由检索，以及数据 库的深层次加工与数据挖掘。现行方法 有二个方面。
数据库结构的拆分与细化。 语言处理。
美国国立医学图书馆研制了统一的医学 语言系统（Unified Medical Language System,UMLS），其目的在于克服计算 机生物医学信息检索中相同的概念具有 不同的表达方式，有用的信息分散在不 同的数据库系统中。
对于同一概念的不同术语以及不同的变异形式，超 级叙词表采用三级结构模式，即概念（I 级）-术语 （II 级）-词串（III 级），将一个概念的多种不同术 语连同多个变异词串有序地组织在一起。对于不同 的概念，超级叙词表采用多种“关系”概念如相关 概念、组配概念、共现概念等来描述不同概念之间 的关系。
L0215040 cold temperature
L0009264 Cold <1> Cold
C0009443 Common Cold
L0009443 Common Cold
L0009264 Cold <2> Cold
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Strings (SUIs)