PubMed检索完全攻略----好东西,值得分享!

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pubmed文献检索方法

pubmed文献检索方法

pubmed文献检索方法摘要:一、PubMed简介二、文献检索方法1.基本检索2.高级检索3.检索策略三、检索实例四、检索技巧1.关键词选择2.运用布尔操作符3.限制检索范围五、文献管理与分析工具六、总结与建议正文:一、PubMed简介PubMed是由美国国立卫生研究院(NIH)开发和维护的一个免费生物医学文献数据库,包含了大量的生物医学、生命科学、化学等领域的研究文献。

它为广大科研工作者、医生和药师等提供了便捷的文献查询途径。

二、文献检索方法1.基本检索在PubMed首页,可以通过输入关键词或输入文献的题名、作者、出版年份等进行基本检索。

基本检索的结果会按照相关性排序。

2.高级检索点击检索框下方的“高级检索”按钮,可以进入高级检索界面。

高级检索允许用户对检索词、检索范围、文献类型等进行更详细的设定,从而提高检索的准确性。

3.检索策略在检索过程中,可以采用一些策略提高检索效果。

例如,使用截词符(*)进行词干检索,或将关键词用引号括起来进行精确检索。

三、检索实例以下是的一个检索实例:假设我们想查找关于“新冠病毒”(SARS-CoV-2)的研究文献,可以在检索框中输入“SARS-CoV-2”或“新冠病毒”,然后点击检索按钮。

检索结果会包括与新冠病毒相关的文章,如病毒基因序列、疫苗研究、治疗方法等。

四、检索技巧1.关键词选择选择合适的关键词是提高检索效果的关键。

可以通过查阅相关领域的专业词典、综述文章等,了解研究领域的主要术语和概念。

2.运用布尔操作符布尔操作符(AND、OR、NOT)在检索过程中起到筛选和组合检索词的作用。

例如,输入“新冠病毒AND 疫苗”,可以检索到同时涉及新冠病毒和疫苗的文章。

3.限制检索范围在检索过程中,可以通过设置文献类型、发表年份、语言等限制条件,缩小检索范围,提高检索的针对性。

五、文献管理与分析工具PubMed提供了多种文献管理与分析工具,如引文导出、文献收藏、文献标签等。

Pubmed检索攻略大全(一)

Pubmed检索攻略大全(一)

Pubmed检索攻略大全(一)引言:pubmed是大家最爱用的文献检索网站了,喝水不忘挖井人,pubmed就由美国国立医学图书馆下属的美国生物技术信息中心研制的基于Web的文献数据库,收录全世界包括美国在内80多个国家的5000多种生物医学期刊的文摘及题录数据。

在后面的日子里,我们会一点点仔细来讲pubmed的一些用法。

科研高手请绕道哈,我们这是写给刚入门的小白们看的。

今天讲4个知识点,检索人名、检索期刊名、单篇引文匹配器以及检索临床研究。

如何检索人名?检索格式:姓(last name, 全称),名(initials,单字母缩写)。

如检索“Watson JD”,以此格式进行名字的检索,PubMed会自动地将其识别为作者名(author field)检索。

问大家一个问题,如果作者叫Bonnie W. Ramsey,检索框里面应该写什么呢?对的,检索Ramsey BW.如果检索作者的全名,Bonnie W. Ramsey,大家可以试试看,会少很多文献,可能的原因是2002年之前的很多文献里没有提供作者的名字全称。

如果你只知道作者的名字的一半,比如只知道Watson,那么可以直接检索Watson [au],或者用advanced search,就是大家最爱用的高级检索。

如果作者的名字包含了“禁用词”,挺多的,有下面这张大表。

挺多的,看得眼花,也没有必要了解那么多,所以出个主意,如果只知道作者名字的一半,本来就会检索出来好多好多结果,也不用管作者名字是不是包含停用词了,直接再加一个检索条件。

比如Smith是研究抽经的,那么再加上检索词。

比如:这样检索有7万多个结果,没法用。

加上其他检索词seizure,一下子缩减了很多。

如何检索期刊名?这个很简单,输入期刊的全称或者缩写,比如输入“molecular biology of the cell”或“Mol BiolCell”但是我们不太会为了找某本杂志的所有文献,如果要找到某本杂志的某个领域的,比如关于drosophila,可以用advanced search检索,或者直接在检索框里检索,两组检索结果差不多。

PUBMED检索_非常全面!!

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期刊检索
如果刊名是Mesh词(如:Gene Therapy、Science、Cell),或刊名 是单个单词(Scanning),如只想将 其作为刊名检索,需加刊名字段标识 [ta]。 推荐使用刊名全称或缩写查找, 因为有些过早的文献没有ISSN。
词组检索
对于输入PubMed的多词词组,PubMed会 查询词组索引,如果查到相应词组则将其作为一 个检索词来检索。如果未查到相应词组,则将其 拆分成单个词,分别进行检索并以逻辑和 (AND)进行组配,如:single cell相当于检索 single AND cell。可通过如下方式强制将其作 为一个词组进行检索:
自动匹配检索
对于输入检索框中未加标识的检索词, PubMed依次在下列词表中查找匹配的内容: 1.MeSH translation table 2.Journals translation table 3.Full Author translation table 4.Author index 5.Full Investigator (Collaborator) translation table
PubMed检索
2012年9月
概 况
PubMed(/pubmed)
是由美国国立医学图书馆(National Library of Medicine,NLM) 的国家生物 技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)开发 的一个以网络为基础的医学文献检索 系统,是NCBI庞大的检索体系Entrez的 一部分。
检索字段及标识符
MH(Mesh Terms): 主题词 MAJR(Mesh Major Topic): 主要主题词 PG(Pagination): 页码(起页) PT(Publication Type): 出版类型 SB(Subset): 文献子集 SH(Mesh Subheadings): 副主题词 TA(Journal Title Abbreviation): 刊名缩写 TI(Title): 文章题名 TIAB(Title/Abstract): 题名摘要 TW(Text Words): 文本词 VI(Volume): 卷号

pubmed检索方法与技巧

pubmed检索方法与技巧

6.1 结果的显示
(3)MEDLINE:以MEDLINE数据库的记录格 式来显示检索结果。字段内容主要包括PMID、 题目、摘要、作者、作者地址、语种、出版 类型、出处、MeSH、文献ID、出版状态等。
6.1 结果的显示
6.1 结果的显示
6.2 检索结果的保存
保存记录 在“send to”下拉菜单中选择“File”,可完 成将记录保存为文件。 选择“E-mail”,则可将结果发送至邮箱。 在检索结果显示页面可将某一次检索的全部 记录或标记记录保存;而“Clipboard”页面 可用于保存一次或多次检索的结果记录。
In Process Citations:每天收录,尚 未经规范处理的数据。[pubmed-in process]
Publisher-Supplied Citations:由出 版商提供的电子文献,每条记录标有 [PubMed-as supplied by Publisher]。
3. PubMed检索机制
("humans"[MeSH Terms] OR "humans"[All Fields] OR "human"[All Fields]) AND recombinant[All Fields] AND ("trefoil factor"[Supplementary Concept] OR "trefoil factor"[All Fields])
第2步:检索白血病/药物疗法
主题检索举例: 长春新碱(Vincristine )治疗白血病(leukemia)的文献
5.4 临床咨询和系统评价
可以使用户方便快捷地检索到有关临床方面的文献,如临 床疾病的诊断、治疗、病因和预后等;

PubMed检索攻略PPT精选课件

PubMed检索攻略PPT精选课件
PubMed每条记录均有惟一的识别号PMID(PubMed Unique Identifier) 。
MEDLINE: PubMed主体部分,记录均标有[PubMedindexed for MEDLINE]
In Process Citation: 又称PreMEDLINE,记录均标有 [PubMed-in process]
4
47
输入检索信息
点击“Search”
例:检索《病毒杂志》(archives of virology)2009年发表的《基因稳定性与连 续性分析》(genetic stability and linkage analysis)这篇文献
PubMed
1
主要内容
一、PubMed概述 二、PubMed检索途径与使用方法 三、 循证医学文献检索
2
一、PubMed概述
简介
PubMed是由美国国立医学图书馆(National Library of Medicine , NLM)下属美国生物技术 信息中心(National Center for Biotechnology Information ,NCBI)研制的基于Web的文献数据库
40
确定主题词
41
选择副主题词
添加到检 索框检索
主题词加权 检索选项
42
检索结果
43
例:通过主题词途径,检索有关心肌梗塞 (myocardial infarction)预防 (prevention and control)方面的文献。 要求主题词加权、不扩展检索
添加到检 索框检索
勾选加权检索、 不扩展检索选项
1971年正式建立了该系统的联机系统,称为“MEDLARS 联机检索系统”(MEDLARS online),即MEDLINE系统

pubmed检索步骤 -回复

pubmed检索步骤 -回复

pubmed检索步骤-回复Pubmed是世界上最大的医学文献数据库之一,提供了大量的生物医学文献资料,包括期刊文章、会议摘要、学位论文等。

Pubmed的使用可以帮助研究人员快速检索到相关的医学文献,有效地支持他们的科研工作。

本文将介绍使用Pubmed进行文献检索的步骤,并以"乳腺癌治疗的最新进展"为例进行说明。

第一步:进入Pubmed网站首先,我们需要打开网页浏览器,输入"第二步:选择搜索关键词在Pubmed的首页上,我们可以看到一个搜索框。

输入"乳腺癌治疗的最新进展"作为关键词进行搜索。

在这里,我们需要注意的是,关键词的选择应该准确反映我们所关注的研究主题,以便能够检索到相关的文献。

第三步:筛选搜索结果点击搜索按钮后,Pubmed会根据关键词进行检索,并列出包含这些关键词的文献列表。

在这里,我们可以看到大量的搜索结果。

为了筛选出最相关的文献,我们可以使用Pubmed的搜索筛选工具。

在搜索结果页面的左侧,有一栏搜索筛选工具。

我们可以根据不同的筛选条件,比如出版日期、文章类型、研究主题等进行进一步的筛选。

以乳腺癌治疗的最新进展为例,我们可以选择筛选条件为"出版日期",选择"最近五年",以获取最近的研究进展。

第四步:查看摘要和全文在筛选出相关的文献后,我们可以点击文献标题或摘要,进一步查看文献的详细信息。

在这里,我们可以通过查看摘要了解到文献的研究内容、方法和主要结论。

如果我们对某篇文献特别感兴趣,想要获取全文信息,可以通过点击链接或按钮,获取全文或者转至相关网页。

然而,需要注意的是,Pubmed并不提供所有文献的全文,有些文章可能需要通过其他渠道获得。

第五步:导出文献信息在Pubmed上查到的文献信息可以方便地导出到其他文献管理软件,如EndNote等。

在详细信息页面,Pubmed提供了一个"导出"按钮,点击后可以选择导出格式,然后将文献信息导出到所选的文献管理软件中。

PubMed检索指南

PubMed检索指南

PubMed检索指南1.PubMed基本检索方式(Basic PubMed Search)进入PubMed基本检索方式主页,在检索框中可以输入任意词,包括文献作者,出版杂志等:∙键入一个或多个检索词(可以为任意词),如protein disulfide isomerase ,也可以输入缩略名如pdi等;输入多个词时,可自动识别成词组;但词数太多时,则以逻辑与的方式识别,如可以将protein disulfide isomerase识别成一个词,也有可能将其识别成“protein AND disulfide AND isomerase”尤其是出现数字等符号时不易识别成词组;∙对PubMed不能识别检索的词组,需加引号强调,如键入:“Insight II”∙以文献作者方式检索,作者名的输入格式为:姓+名如输入:Freesman DJ ,其中“姓”为全称,“名”则为首字母简写形式(“名”可以省略);∙键入的杂志名称可以是全名,也可以是杂志名的MedLine缩写格式∙或ISSN杂志号(见期刊浏览)。

∙检索时可在词尾加“*”号检索所有具有同样词头的词。

如键入:biolog*可查得biology或biological 等词。

PubMed可将多个词以词组形式查询,对PubMed不能识别检索的词组,需加引号强调,如键入:“Insight II”将识别成词组“Insight II”以方式查询,若键入:Insight II则有可能分开识别成“Insight” 和“II”两个词,以逻辑与“Insight AND II”的方式进行检索。

词与词间可用AND、OR或NOT逻辑进行连词检索。

键入检索词后,别忘了选择检索年限(30天,10年不等)及选择文献的页面显示数目。

按Enter回车键或鼠标击话界面中的“Search”按钮可得到查询文献提要(document summary page)。

2.PubMed高级检索方式 (Advanced Search)与基本检索方式不同的是增加了检索范围(search fields).和检索模式(search mode)的选择框。

pubmed检索步骤 -回复

pubmed检索步骤 -回复

pubmed检索步骤-回复如何在PubMed中进行文献检索PubMed是一个由美国国立卫生研究院(NIH)管理的免费在线文献检索工具,旨在提供医学和生命科学领域的研究论文。

它涵盖了全球范围内的期刊文章、学位论文、专利等多种类型的文献资源。

在这篇文章中,我们将介绍如何在PubMed中进行文献检索,并提供一步一步的指导。

步骤一:访问PubMed网站首先,打开您的浏览器,输入“PubMed”关键字并搜索。

您可以直接点击PubMed网站的链接,它通常会显示在搜索结果的前几个位置。

另外,您也可以访问步骤二:了解PubMed的主要功能在进入PubMed网站后,建议您先了解一下主要的功能和搜索选项。

在主页的中央,您将看到一个搜索框。

在该搜索框中,您可以输入与您感兴趣的主题相关的关键词、研究领域、作者等进行搜索。

此外,您还可以使用筛选器和高级搜索工具来缩小搜索范围,以提高检索结果的准确性。

步骤三:选择合适的搜索词在进行文献检索之前,我们需要明确研究的具体主题,以便选择合适的搜索词。

确保您使用的关键词准确描述您感兴趣的主题,并且尽可能使用具体的词语。

例如,如果您的主题是关于抑郁症的药物治疗,您可以使用诸如“抑郁症”、“抑郁症药物治疗”、“抗抑郁剂”等关键词。

步骤四:使用简单搜索功能在PubMed的主页搜索框中输入您选择的关键词,然后点击“搜索”按钮。

这将触发简单搜索功能,搜索结果页面将列出与您的关键词相关的所有文献。

步骤五:筛选搜索结果当您得到搜索结果后,您可能会面临大量的文献信息。

为了限制搜索结果的数量并提高相关性,您可以使用筛选器进行进一步的筛选。

左侧边栏上的筛选器可以帮助您根据不同的标准(如出版日期、文章类型、研究范围等)来缩小搜索结果。

点击相关的筛选器,然后选择适当的选项以应用筛选器。

这样,您将只获得与这些特定标准匹配的文献。

步骤六:使用高级搜索功能如果您想进一步精确地控制文献检索过程,您可以使用高级搜索功能。

Pubmed检索方法【可编辑】

Pubmed检索方法【可编辑】

二、PubMed的数据范围
MEDLINE OLDMEDLINE(1950-1965)
PreMedline
出版商提供的书目信息
MEDLINE数据库简介
收录范围:来源于美国和世界上70多个国 家和地区、50种语言的7395种(截止到现 在)权威生物医学及相关学科期刊,内容 涉及生物医学各个领域;85%以上原文为 英语,80% 记录有文摘,5%免费全文。 目前记录已达约2200万条,约40万篇/年 。
(4)“ ”,将短语做为不可分割的整体进行检索。
如:“OXYGEN FREE RADICALS ” 注意:AND 必须大写、[ ]和“ ”必须为英文或中文半
角。
Pubmed简单检索实例
例一 查找有关“肝癌和肝炎的关系”的文献,英文 “liver cancer ” 和 “hepatitis”
检索结果显示 显示检索策略
限定检索 索引检索
PubMed高级检索实例
例: 查找关于“锌对于2岁婴儿(即出生 至23个月)成长的作用”(要求时间2000— 2008)的英文文献
步骤一,确定关键词Zinc Infant Growth ,把它们输入检索框。
步骤二,限定时间。点击 。在其中的Publication Date的输入框内输入 FROM"2000 " TO"2008 ".
题录格式内容(几个字段?)
作者限定字段检索
例在二西文例文:献著里者,“著H者en的ry署H名em一il般a”名应在转前换姓成在后, 查“找H作em者ila hH”,e后m加il著a者h字著段作限的定来文检献索,
注意:姓在前,名在后 姓全称,名缩写
四、PubMed的检索途径和方法
基本检索 高级检索 主题检索 期刊检索 专用检索

pubmed高级检索方法

pubmed高级检索方法

pubmed高级检索方法一、pubmed高级检索基础1.1 首先呢,pubmed是个超棒的医学文献宝库。

它的高级检索功能就像一把神奇的钥匙,能让你更精准地找到你想要的东西。

咱别小看这个功能,它就像一个隐藏的宝藏地图,要是会用,那可真是如鱼得水。

1.2 你得知道,pubmed高级检索界面有很多选项。

就好比一个大超市,每个货架都有不同的东西。

这里的选项就是那些货架,你得清楚每个货架放的是啥,才能快速找到你需要的“商品”,也就是文献啦。

二、检索字段的运用2.1 比如说作者字段。

这就像找人一样,你知道作者是谁,那就直接在作者字段里输入作者的名字。

这就好比你在人群里找一个熟人,直接喊他名字就好啦。

不过有时候作者名字可能有多种写法,你得像个侦探一样,把可能的写法都试试,可不能一根筋。

2.2 还有标题字段。

如果一个文献的标题里有你想要的关键词,那在标题字段检索就像瓮中捉鳖一样容易。

标题可是文献的招牌,往往包含了核心内容。

你要是想找关于某种疾病特定治疗方法的文献,在标题里搜这个治疗方法的名字,很可能就一击即中。

2.3 期刊字段也不能忽视。

你要是对某个期刊特别感兴趣,或者知道你要找的文献大概率发表在某个期刊上,那就在期刊字段里输入期刊名。

这就像你知道一个人住在某个小区,直接去那个小区找他就对了,省得满世界乱找。

三、布尔逻辑运算符的使用3.1 AND这个运算符啊,就像是交朋友里的“志同道合”。

你输入两个关键词,中间用AND连接,那搜索出来的文献就是同时包含这两个关键词的。

比如说你搜“糖尿病 AND 胰岛素”,那找出来的文献就是既和糖尿病有关,又提到胰岛素的,这样就把范围缩小得很精准了。

3.2 OR这个运算符呢,有点像广撒网。

当你输入两个关键词,中间用OR连接,搜索出来的文献只要包含其中一个关键词就会被显示。

比如“感冒 OR 流感”,那只要是关于感冒或者流感的文献都会出来。

这在你不确定具体用词或者想扩大搜索范围的时候很有用,就像你想找水果,苹果或者香蕉都可以满足你吃水果的愿望,这里的苹果和香蕉就相当于不同的关键词啦。

如何使用pubmed进行文献检索

如何使用pubmed进行文献检索

如何使用pubmed进行文献检索使用PubMed进行文献检索是非常重要的,因为它是一个专门为生命科学和医学领域提供的免费文献数据库。

下面是一个详细的步骤指南,以帮助你使用PubMed进行文献检索。

2. 进行关键词:在PubMed首页的框中输入你感兴趣的关键词,可以是疾病名称、特定的治疗方法、生物标志物等。

点击“”按钮。

4.阅读摘要和全文:当你找到感兴趣的文章时,你可以点击标题以查看摘要。

摘要通常提供了关于研究目的、方法、结果和结论的概述。

如果你对文章感兴趣并且有免费全文可用,你可以直接点击“全文”链接以阅读完整的文章。

5. 扩大或缩小范围:如果你的结果不够理想,你可以尝试扩大或缩小范围。

你可以使用更广泛或更具体的关键词来,或者使用PubMed高级功能来更精确地定位你的。

6. 使用MeSH词汇进行检索:MeSH(Medical Subject Headings)是PubMed的一种标准词汇,用于对文章进行分类和索引。

如果你想进行更准确的检索,你可以使用MeSH词汇来。

在框中输入你的关键词,然后点击右侧的“在[MeSH]中”按钮以进一步精确。

7. 使用历史和提示:PubMed提供了历史和提示功能,以帮助你更好地管理和改进你的。

你可以在框下方找到你最近的历史记录,并且当你输入关键词时,PubMed会自动提供相关的建议。

8. 使用PubMed Central进行全文检索:除了PubMed,你还可以使用PubMed Central来全文可用的文章。

PubMed Central是一个免费的全文文献数据库,其中包含了许多生命科学和医学领域的文章。

你可以在PubMed结果页面的右上方切换到PubMed Central进行检索。

总结起来,使用PubMed进行文献检索需要一些技巧和经验。

通过使用关键词、筛选结果、阅读摘要和全文、扩大或缩小范围、使用MeSH词汇、使用历史和提示、使用PubMed Central进行全文检索、导出和管理文献等功能,你可以更有效地利用PubMed来找到相关的研究文献。

pubmed文献检索方法

pubmed文献检索方法

pubmed文献检索方法【原创版4篇】目录(篇1)I.检索PubMed的意义II.PubMed的检索方法III.PubMed检索结果的展示和筛选IV.检索PubMed的注意事项正文(篇1)I.检索PubMed的意义PubMed是全球最大的生物医学数据库之一,提供了大量的生物医学文献资源。

对于研究人员、医学专业人士和学生来说,了解和掌握PubMed的检索方法,可以帮助他们快速找到所需的文献。

II.PubMed的检索方法1.打开PubMed网站,输入网址:https:///2.在页面左侧导航栏中选择“Search”按钮,进入检索页面。

3.在检索页面中,可以选择不同的检索方式,如关键词、作者、出版日期等。

4.输入检索词后,点击“Search”按钮,即可得到相关的检索结果。

III.PubMed检索结果的展示和筛选1.检索结果会按照相关度排序,用户可以选择不同的排序方式。

2.每个检索结果都包含标题、摘要、作者、出版日期等信息。

3.对于需要进一步阅读的文献,可以点击“Open”按钮,查看全文。

4.可以通过筛选条件,如主题、关键词、学科领域等,缩小检索范围。

IV.检索PubMed的注意事项1.避免使用过于具体的检索词,以免得到过多的无关结果。

2.对于复杂的检索需求,可以使用逻辑运算符和短语检索等方式进行组合检索。

目录(篇2)I.引言A.为什么需要pubmed文献检索方法B.pubmed简介II.pubmed文献检索方法A.如何使用pubmed1.输入关键词2.选择检索结果3.查看文献详情B.pubmed的优点1.方便快捷2.检索结果全面3.文献质量较高C.pubmed的不足1.检索结果可能不全面2.文献质量可能较低3.检索结果可能存在误导III.结论A.pubmed文献检索方法的重要性和实用性B.如何利用pubmed进行有效的文献检索正文(篇2)pubmed文献检索方法是一种非常实用的工具,可以帮助科研人员快速、准确地检索到所需的文献。

PubMed检索完全讲解

PubMed检索完全讲解

PubMed检索完全攻略----好东西,吐血狂顶!2011-11-21 08:57阅读(4)转载第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。

尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。

"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。

从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。

我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。

尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。

还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。

无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。

俗话说,喝水不忘掘井人。

PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。

有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢?PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。

其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。

当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。

而最新的文献几乎就在此时此刻。

与PubMed 挂钩的出版商会自动向PubMed 提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。

Pubmed检索攻略

Pubmed检索攻略

PUBMED简介一、何为PUBMED?PUBMED是美国国立卫生研究所(NIH)下属美国国立医学图书馆(NLM)开发的因特网检索系统,建立在国立生物医学信息中心(NCBI)平台上。

PUBMED主要提供基于WEB的MEDLINE数据库检索服务,其中包括医学文献的定购、全文在线阅读的链接、专家信息的查询、期刊检索以及相关书籍的链接等。

二、PUBMED与图书馆光盘版本的MEDLINE有何不同?PUBMED与光盘版本MEDLINE的不同之处在于:由于互联网的及时性,PUBMED的更新速度快于光盘版,光盘版本的更新周期是3个月,而PUBMED的更新周期是1天,PUBMED包含了一些尚未收录入光盘版MEDLINE的最新文献信息,因此PUBMED享有PRE-MEDLINE的美誉。

三、如何进入PUBMED检索系统?在浏览器地址栏中输入网址:/pubmed/四、PUBMED主页的基本组成?PUBMED的检索系统大致由三个板块组成:页面上方的检索框和功能按钮(Limit、Preview/Index、History、Clipboard、Details)。

在检索框"for"后面的空格中输入需要查询的关键词,点击"go"会出现相关的文献。

每个功能按钮的具体功能下面会逐项介绍。

左面的导航条指向PUBMED的一些其它功能板块,如MeSH Browser、Journal Browser等。

剩下的右下方大片空间便是显示检索结果的空间。

五、PUBMED的主要功能按钮组成?PUBMED的主要功能按钮有五种:Limit按钮、Preview/Index按钮、History按钮、Clipboard按钮和Details按钮。

六、LIMIT 按钮的主要功能?当点击Limit按钮,将出现以下界面:各下拉框的基本作用如下:All Field:下拉可选择搜索的范围,如作者名、关键词等Publication Types:下拉可选择所查文献的类型,如临床试验、荟萃分析等Ages:下拉可选择所查文献研究对象的不同年龄组Entrez Date:下拉可选择所查文献距离现在不同时间范围Publication Date:下拉可选择限定所查文献发表日期Language:下拉可选择所查文献的语种Human or Animal:下拉可选择所查文献的研究对象:人或动物Subset:下拉选择不同的医学网络系统,可查询特殊领域的文献AIDS, TOXICITY七、Preview/Index按钮的功能?点击Preview按钮,可以预览检索的结果,此预览功能使我们浏览结果前,先知道查询的结果数量,从而可估计是否有必要进一步修改检索式以缩小或扩大检索范围,避免每次因传输大量的无用数据而浪费时间。

新版Pubmed最全实用教程(超全收藏版)

新版Pubmed最全实用教程(超全收藏版)

新版Pubmed最全实用教程(超全收藏版)PubMed 是一个免费的搜寻引擎,提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要。

它的数据库来源为MEDLINE。

其核心主题为医学,但亦包括其他与医学相关的领域,像是护理学或者其他健康学科。

它同时也提供对于相关生物医学资讯上相当全面的支援,像是生化学与细胞生物学。

该搜寻引擎是由美国国立医学图书馆提供,作为 Entrez 资讯检索系统的一部分。

PubMed 的资讯并不包括期刊论文的全文,但可能提供指向全文提供者(付费或免费)的链接。

PubMed是因特网上使用最广泛的免费MEDLINE,是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的,基于WEB的生物医学信息检索系统,它是NCBI Entrez整个数据库查询系统中的一个。

PubMed界面提供与综合分子生物学数据库的链接,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据,3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线,也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接等。

PubMed系统的特征工具栏提供辅助检索功能、侧栏提供其它检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索和特征文献检索。

提供原文获取服务免费提供题录和文摘,可与提供原文的网址链接,提供检索词自动转换匹配,操作简便、快捷。

Pubmed最近也是改头换面了,为了能够帮助大家快速熟悉上手新版Pubmed,我们这里进行了常用功能的总结,供大家参考。

首页是这样的:目录•基本检索•高级检索•Mesh主题词检索•常用检索技巧•如何让Pubmed自动发送最新文献•如何使用Pubmed直接复制黏贴参考文献基本检索基本检索是PubMed最常用的检索方式。

在PubMed基本检索框中输入检索词,点击Search即可检索文献。

比如在检索框中直接输入septic shock,点击检索。

结果显示界面如下,中间主体内容为检索获得的文献,左侧主体内容为Pubmed自带或者你自己自主设置的过滤器。

pubmed检索方法

pubmed检索方法
限定字段检索的项目有:
4.1 字段选择
可选择:所有字段(All Fields)、作者地址、作者姓名、期刊名、ISSN号码、语种、MeSH词、副主题词、页码、出版日期、自由词、标题词、期刊卷号、数据库更新代码、物资名称等22个选项,默认选项为All Fields。
4.2必须有摘要的文献(Only Items with Abstracts )
4.9 文献进入MEDLINE的时间
有30天、60天、90天、180天、1年、2年、5年和10年选择。
4.10 出版或进入MEDLINE的时间段
应输入时间范围。按照年/月/日的格式。
5. 利用预览/索引(Preview/Index)检索
使用预览/索引可以:预览检索出的文献数量,加快显示速度、一次性地增加检索词来精确检索、增加检索词来检索某些特殊领域、从索引中查看和选择检索词。例如:要检索以"chickenpox"为头的MeSH词,先选择在下拉式菜单的MeSH Terms,在检索框内输入chickenpox,再点击Index按钮。滚动索引Index窗,高亮显示"chickenpox vaccine",点击AND按钮,"Chickenpox vaccine" 就会出现在检索提问框内。 注意: Preview/Index 只能显示最近三次检索的预览结果。而历史(History)窗口能显示多达过去100次的检索请求。
为复选框,选中后检索出的文献均有摘要。注意1975年前的文献是没有摘要的。
4.3 出版形式(Publication Types)
包括: Clinical Trial 临床试验;Editorial 编辑按语;Letter 读者来信;Meta-Analysis 荟萃分析 ;Practice Guideline 实践指南 ;Randomized Controlled Trial 随即对照试验 ;Review 综述

pubmed检索教程

pubmed检索教程

获取基因和染色体图谱;蛋白质三维结构数据 及大分子模式(MMDB)等其他生物信息数 据库检索。
PubMed等文献数据。
10
复旦大学图书馆文献检索教研室
2021/2/4
(二) PubMed的特点
广域网免费提供题录和文摘 提供与原文的网址链接(部分免费获取) 提供检索词智能转换匹配 界面简洁,操作简便(须IE7.0以上版本)
2021/2/4
PubMed数据库
7
复旦大学图书馆文献检索教研室
2021/2/4
一、 PubMed简介
开发机构: NCBI(美国国立生物技术信息中心)
任务:
利用计算机信息处理技术,建立分子生物学、生物化 学、遗传学知识的自动存储和分析系统,并开展相关 先进方法的研究。
促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件 的使用。
NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。
近年数据涉及37种语种,回溯至1949年的数据涉 及60种语种。47%为美国本土出版文献,90%为 英文文献,79%的文献有文摘。
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复旦大学图书馆文献检索教研室
(以上由2009年7月数据库提供)
2021/2/4
二、 MEDLINE的检索平台
广域网免费平台:NCBI-PubMed(含非 MEDLINE数据)
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复旦大学图书馆文献检索教研室
2021/2/4
三、PubMed 基本检索规则
检索栏可输入布尔逻辑运算式:(运算符须大写)如: asthma AND (therapy OR treatment)
字段限定符:[ ],空格按词组匹配
试比较:
stroke AND thrombolysis[ti]
stroke thrombolysis[ti]

PubMed检索

PubMed检索

PubMed检索当很多人开始了解PubMed,并且逐渐得心应手的时候,都会面临一个棘手的问题,即如何获取全文?的确,PubMed真正向公众(public)免费开放的只是摘要部分,而绝大部分文章都没有全文提供。

当然,最省事最直截了当的做法是在PubMed上花钱购买,但一篇文章动辄十几甚至几十美金,使很多医学工作者只好望而却步。

其实,只要我们掌握一些技巧,还是有可能获得一些文章的全文的。

笔者查阅文献数年,为获取全文也做了不懈努力,积累了一些经验供大家参考。

一、PubMedPubMed上约有5%的文献是可以免费看到全文的,通常这些文献的左上角会有一个Free Full Text的小标记。

你只要点击这个图标,系统就自动链接入该文献的全文。

但有两点值得注意的是,第一,很多时候,这个图标在PubMed处于显示简要(summary)状态下并不出现,而只有在选择显示摘要(abstract)时才出现。

因此,如果你不只是泛泛浏览,而希望看到全文的话,我强烈建议你在display下拉菜单中选择摘要(abstract)状态。

第二,有些时候,小图标上仅标着Full Text,而并没有Free字样,但仍然可以链接入全文,你不妨试一试。

二、免费提供全文的期刊天下没有免费的午餐,这句老话也不一定正确。

有些期刊就提供全文免费检索。

比如著名的美国Science(科学)杂志,以前国内很多高校、研究所的资料室都流传着Science杂志的影印本,印刷质量低劣,而且有盗版之嫌。

后来Science的老板充分理解到中国的国情,干脆顺手做个人情,就与中国有关方面达成协议,使在中国大陆的读者都可以在网上免费看到Science的全文。

方法如下:(1)先登录Science网址:。

注意,不是,否则你得不到全文。

(2)点击中间那个SEARCH按钮,就进入查询页了。

你可以选择简单检索还是复杂检索。

(3)输入您要找的关键词(不一定是MESH标准主题词),再点击search就可以了。

Pubmed全攻略使用教程

Pubmed全攻略使用教程

PubMed检索系统简介PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE 数据库的网上检索系统。

MEDLINE是美国国立医学图书馆(U.S.National Library of Medicine)最重要的书目文摘数据库,内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。

收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊,现有书目文摘条目1000万余条,时间起自1966年。

PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。

它每天都在不断地接受新数据,可为用户提供基本的文献条目和文摘,其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。

PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据,这种条目带有[MEDLINE record in process]的说明,并标有[Record as supplied by publisher]的标识。

这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送,但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围,将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代,例如在综合性的科学杂志(Science 或Nature)上发表的地理学文章等。

PubMed 系统的主要特点1.词汇自动转换功能(Automatic Term Mapping)在PubMed主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表或索引,对检索词进行转换后再检索。

(1)MeSH转换表(MeSH Translation Table),包括MeSH词、参见词、副主题词等。

如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord 词(题名词和文摘词)进行检索。

例如:键入“Vitamin h",系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。

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PubMed检索完全攻略----好东西,值得分享!第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。

尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。

"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。

从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。

我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。

尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。

还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。

无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。

俗话说,喝水不忘掘井人。

PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH )的平台上。

有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed 前都感谢NCBI 呢?PubMed 覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。

其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。

当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。

而最新的文献几乎就在此时此刻。

与PubMed 挂钩的出版商会自动向PubMed 提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。

所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间,但借助于PubMed ,我们仍旧可以随时掌握最新的动向,从而大大有利于自己的临床和研究工作。

还有些出版商通过PubMed 提供文献的全文,有时甚至是免费的,这样,我们就可以在PubMed 上真正享受"坐拥书城"的感觉了(关于如何获取全文将在以后的章节中详述)。

进入PubMed 的主界面后, 首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如下图)。

这是PubMed 的核心部分。

大部分工作,我们只要利用这"一框五键"(检索框,Limit 键, Preview/Index 键, History 键,Clipboard 键和Details 键)即可完成。

在主界面的左侧框(如左图),有:· Journal Browser 期刊浏览· MeSh Browser 可以用它来分层流览MeSH 表· Single Citation Matcher 输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。

· Batch Citution Matcher 用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。

· Clinical Queries 这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。

· Old PubMed (使用旧式的PubMed 查询方式)3) Related Resources· Order Documents 可以使用户在当地得到文献的全文, 但这是要收费的,至于如何免费获得文献全文,我将在后面的有关章节中详述。

· Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。

Grateful Med也提供MEDLINE的接入,并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。

· Consumer Health提供与MEDLINEplus的链接,MEDLINEplus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。

· Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果的发布。

利用左侧框的这些服务,我们不仅能够进行功能更加强大的检索,而且还能得到不少非常有用的服务。

这些都将在后续章节中介绍。

总体而言,PubMed的界面相当简洁清晰,几乎是傻瓜式的。

然而傻瓜式的界面并不意味着傻瓜式的操作。

我看到很多人用了几年的PubMed,还是只知道在检索框里输入一个关键字,然后按一下"Go"按钮这样一种单一原始的检索方式。

虽然有一半左右的情况,这样的操作就足以得到令人满意的信息,但对于另一半情况,就没有那么幸运了,要么你真正所需的信息湮没在大量纷繁芜杂的"无用"信息中,要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。

令人费解的是,很多医务工作者宁可在每次检索时都花上成倍的时间,却不愿花上几个小时的时间去认真研究一下PubMed。

"君欲善其事,必先利其器",PubMed就好像一把功能强大的枪,你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹,更重要的是,你要知道如何利用准星瞄准,如何把这把枪的功能发挥到及至。

在以后的章节中,我们将逐步深入地了解PubMed,相信通过这些章节的学习,我们可以真正熟练掌握PubMed,从而使自己的工作事半功倍。

第二章 PUBMED简单检索技巧一.在这一章里,我们将对如何应用PUBMED这一得力助手检索文献,作以简单介绍。

1.当你打开浏览器,在地址栏内键入/PubMed/或是/后,就进入了PUBMED检索系统主页,可以见到如下的页面。

2.在靠近页面上部的地方,首先映入我们眼帘的,即是供我们输入所需查询内容的检索框。

在检索框中输入查询词,然后单击"go"按钮或按回车键,PubMed将会自动开始检索,并将检索到的相关条目显示在屏幕上。

在检索框前面,你还可以选定所要检索内容的数据库范围,除NCBI的数据库以外,可供选择的还有:PROTEIN, STRUCTURE, POPSET等等。

说到这里,很多人可能以为只需傻瓜式的输入几个字符然后回车一敲便可万事大吉,其实不然。

每个人搜索效率的高低往往存在很大差别。

在这里提供以下建议仅供读者参考:? 明确你索要检索的关键概念及词语,即关键字;? 考虑到关键字的类似说法,即有可能出现的同义词;? 通过限定DATES, STUDY GROUP等,精炼你的检索范围;? 多向有经验的人求教,因为不同的专业背景以及个人的差异,都有可能形成不同的方法和技巧。

3.通过布尔(BOOLEAN)运算来提高你的效率最常用的三种布尔运算即是AND,OR,和NOT。

? AND提供的运算方式即不管所输入的两个关键词语所出现的位置在哪,只要他们都出现在索引文章的某一处,就将其列出。

? 而OR则是将出现至少一个关键词的文章列出,这种运算在想将相似主题的文章罗列在一起时,十分有效。

? NOT运算可以在你的检索范围内将某些不需要的部分除去。

但是在使用的时候要特别注意,会有可能将一些你所需要的文章漏掉。

比如当你的检索词为LEAD POISONING NOT CHILDREN时,除了会删除掉那些仅讨论儿童的文章,同时也会删去那些同时讨论儿童及其他年龄组的文章。

4.PUBMED检索类型通常我们所要查询的单词类型大致可以分为:? 词语(主题)检索这时我们在PubMed主页的检索框中键入的是英文单词或短语(大写或小写均可)。

然后回车或点击"Go",PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索,并将检索结果直接显示在主页下方。

例如:键入"vitamin c common cold"后回车或点击"Go",PubMed开始检索并将检索结果显示出来。

? 著者检索当我们所要查询的是著作者时,在检索框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写,格式为:"著者姓空格名字首字母缩写",例如smith ja,然后回车或点击Go,系统会自动到著者字段去检索,并显示检索结果。

? 刊名检索在检索框中键入刊名全称或MEDLINE形式的简称、ISSN号,例如:molecular biology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524,然后回车或点击Go,系统将在刊名字段检索,并显示检索结果。

? 日期或日期范围检索可以在检索框中键入日期或日期范围,然后回车或点击Go,系统会按日期段检索,并将符合条件的记录予以显示。

日期的录入格式为YYYY/MM/DD;如:1999/09/08也可以不录月份和日子,如:2000或1999/12。

? 检索期刊子集(辑)检索的格式为:检索词AND jsubseta,如:neoplasm AND jsubseta。

可供检索的期刊子库有3种:Abridged Index Medicus(有120种重要核心期刊)、Dental和Nursing。

分别使用jsubseta, jsubsetd, jsubsetn进行限定。

? 检索带文摘的记录检索的格式为:检索词AND has abstract, 如:liver cancer AND has abstract。

要注意的是在1975年前出版的文章,其MEDLINE记录中没有文摘。

? 布尔逻辑检索PubMed系统允许使用布尔逻辑检索,只要在检索框中键入布尔逻辑运算符(AND,OR或NOT)。

具体使用时要注意的问题,详见上第3点所述。

5.如何处理检索结果当你点击GO或回车后,PubMed将会自动运行检索命令,在屏幕的下方显示出符合检索要求的项目,并且在查询框内保留原检索词。

此时要注意的是符合检索要求的项目是以SUMMARY(简要格式)显示出来的,就是列出作者,文章题目,以及文章来源的一些信息。

在DISPLAY键后还可以选择别的显示格式,点击DISPLAY键后,系统按所选格式全部检索结果。

如果只需要显示其中一部分记录,则需点击该记录左边的查询框,使标记后,再点击Display键;如果只需显示一条记录,则可直接点击该记录中的作者姓名超链接,系统会自动显示该记录的文摘格式。

还有一点,系统所设定的默认值为每页显示20条选项,这点可以在SHOW后的下拉菜单处选择。

如果选中所感兴趣的内容,即可进行保存,打印等等操作。

PubMed 系统允许最多可保存5000条记录。

要保存全部检索结果时,打开Summary 下拉菜单选择其中一种格式,然后点击Save键;要保存特定记录时,点击记录左边的选择框予以标记后,再点击Save键。

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