《基于R的统计分析与数据挖掘》课件
合集下载
使用R软件进行临床研究方法与数据分析的培训课件
通过绘制多个变量间的散点图,初步探索变量间的线性关系和 非线性关系。
计算多个变量间的相关系数,并用热力图等方式呈现,以揭示 变量间的相关性强弱。
通过主成分分析,将多个相关变量降维为少数几个主成分,并 用散点图等方式呈现,以揭示变量间的内在结构。
通过聚类分析,将多个观测值或变量分组,并用树状图等方式 呈现,以揭示观测值或变量间的相似性和差异性。
使用R软件进行临床研究方法 与数据分析的培训课件
汇报人:
2023-12-31
• 引言 • R软件基础 • 临床研究方法概述 • 数据导入与预处理 • 描述性统计分析及可视化呈现
• 推断性统计分析方法应用 • 结果解读、报告撰写与质量控制
01
引言
目的和背景
临床研究的重要性
临床研究是医学发展的重要驱动力,通过科学的方法收集 和分析数据,为疾病的预防、诊断和治疗提供有力支持。
矩阵(Matrix)
介绍R语言中矩阵的创建、访问和修改方法,以及矩阵运算和常用矩 阵函数的使用。
数据框(Data Frame)
详细讲解R语言中数据框的创建、访问和修改方法,以及数据框的合 并、筛选和排序等操作。
列表(List)
介绍R语言中列表的创建、访问和修改方法,以及列表元素的添加、 删除和查找等操作。
07
结果解读、报告撰写与质量控制
结果解读注意事项及技巧分享
准确理解统计指标
在解读结果时,应准确理解各种统计指标的含义,如P值 、效应量等,避免误解或误用。
01
结合专业知识
结合临床专业知识和背景信息,对结果 进行合理解读,避免单纯依赖统计结果 。
02
03
注意结果的稳定性
关注结果的稳定性和一致性,对于不 稳定或不一致的结果应进一步分析和 探讨。
[课件]RR2 大数据分析PPT
– 人工神经网络 – 遗传算法
• 信息论方法
– 决策树
• 集合论方法
– 约略集 – 模糊集 – 最邻近技术
• 统计学方法 • 可视化技术
6
生物学方法-神经网络方法
• 神经网络是人工智能领域的一个重要的分支。采用神经 网络设计的系统模拟人脑的结构,而与传统的系统截然 不同。由医学可知,人的大脑中有几十亿个大脑细胞 (称为神经元),这些神经元通过神经中枢的导电神经 纤维互相连接,从而形成一个复杂的脑神经网络。人在 学习某一件事的时候,某些神经元的连接得到强化。
1/12/2018
17
Step 2. Calculate cluster means
e.g Cluster 1 has examples
Cases
1 2 3
Marriage length (yrs)
35 3 7
Wealth ($000’s)
100 20 10
(1,4,7,8,9) Marriage length mean = 27.4 Wealth mean = 128.6
1/12/2018
28 28
关联规则:基本概念
• 给定: (1)交易数据库 (2)每笔交易是:一个项目列表 (消费者 一次购买活动中购买的商品) • 查找: 所有描述一个项目集合与其他项目集合相关性的规则 – E.g., 98% of people who purchase tires and auto accessories also get automotive services done • 应用 – * 护理用品 (商店应该怎样提高护理用品的销售?) – 家用电器 * (其他商品的库存有什么影响?) – 在产品直销中使用附加邮寄
• 信息论方法
– 决策树
• 集合论方法
– 约略集 – 模糊集 – 最邻近技术
• 统计学方法 • 可视化技术
6
生物学方法-神经网络方法
• 神经网络是人工智能领域的一个重要的分支。采用神经 网络设计的系统模拟人脑的结构,而与传统的系统截然 不同。由医学可知,人的大脑中有几十亿个大脑细胞 (称为神经元),这些神经元通过神经中枢的导电神经 纤维互相连接,从而形成一个复杂的脑神经网络。人在 学习某一件事的时候,某些神经元的连接得到强化。
1/12/2018
17
Step 2. Calculate cluster means
e.g Cluster 1 has examples
Cases
1 2 3
Marriage length (yrs)
35 3 7
Wealth ($000’s)
100 20 10
(1,4,7,8,9) Marriage length mean = 27.4 Wealth mean = 128.6
1/12/2018
28 28
关联规则:基本概念
• 给定: (1)交易数据库 (2)每笔交易是:一个项目列表 (消费者 一次购买活动中购买的商品) • 查找: 所有描述一个项目集合与其他项目集合相关性的规则 – E.g., 98% of people who purchase tires and auto accessories also get automotive services done • 应用 – * 护理用品 (商店应该怎样提高护理用品的销售?) – 家用电器 * (其他商品的库存有什么影响?) – 在产品直销中使用附加邮寄
《R语言数据挖掘(第2版)》教学课件—第九章R的特色聚类:揭示数据
BIRCH聚类
聚类特征
第j个小类的聚类特征一般由3组数值组成
聚类特征具有可加性
BIRCH聚类
聚类特征树
利用树形结构反映聚类结果的层次关系
聚类特征树的规模取决于两个参数:分支因子B和阈值T
压缩数据存储空间,各个节点仅存储聚类特征
BIRCH聚类
BIRCH聚类过程: 采用逐个随机抽取和处理观测数据 的方式,建立聚类特征树 初始化聚类特征树,对每个观测做如下判断处理:
核心点P的密度可达点Q:若存在一系列观测点O1, O2,…, On,
且Oi+1(i=1,2,…,n-1)是Oi的直接密度,且O1=P, On=Q,则
称点Q 是点P的密度可达点 噪声点:除上述点之外的其他观测点
DBSCAN聚类
DBSCAN聚类的相关概念
DBSCAN聚类
DBSCAN聚类过程: 第一,形成小类
SOM网络聚类的R实现
som函数
som(data=矩阵,grid=网络结构,rlen=100,alpha=学习率,radius= 邻域半径,n. hood=邻域范围形状)
SOM网络聚类的可视化函数
plot(x=som函数结果对象名,type=图形类型名)
模拟数据的SOM网络聚类
SOM网络聚类的R实现
第四步,调整“获胜”节点Winc(t)和其邻接节点的网络权值
第五步,上述第三步和第四步会不断反复,直到满足迭代 终止条件为止。迭代终止条件是:权值基本稳定或者到达 指定迭代的次数
SOM网络聚类
网络权值调整涉及两个问题 第一,调整算法
第二,怎样的节点应视为“获胜”节点的邻接节点
以Winc(t)为中心 覆盖范围内的输出节点均视为 Winc(t)的邻接节点
R语言数据挖掘(第2版)课件:R的网络分析初步
《R语言数据挖掘(第2版)》
网络的定义表示及构建
网络分析的基础是网络的定义及表示,通常有两种相 互联系的表示方式:图论表示方式、矩阵表示方式
图论表示方式:从图论角度看,网络由多个节点和节 点间的连接(也称边)组成,是一种广义的图
网络可记为G=(N,E) 。网络G中沿着连接在不同节点 间的移动,称为游走
相关R函数:
shortest.paths(graph=网络类对象名, v=起始节点对象, to=终 止节点对象,mode=方向类型)
diameter(graph=网络类对象名 ,directed=TRUE/FALSE,unconnected=TRUE/FALSE)
《R语言数据挖掘(第2版)》
节点“中心”作用的测度
《R语言数据挖掘(第2版)》
R的网络可视化
网络可视化的核心是以怎样的外观轮廓展示网络,尤 其对较为庞大的网络更为如此
合理安排网络外观轮廓的算法
最小分割法:目的是最小化连接间的交叉数 最小空间法:基于几何意义上的空间距离,令空间距离较
近的节点摆放在相邻的位置上 谱分解法:依据节点的特征向量中心度安排节点的位置 树形/层次法:根据节点间的连接将节点安排成树形形状,
edge.betweenness(graph=网络类对象名),可计算连接的中间 中心度
《R语言数据挖掘(第2版)》
节点重要性的其他方面
结构洞
一个系统(网络)中,若某个成员(节点)退出系统,使 得局部系统中的其他成员(节点)间不再有任何联系(连 接)。从结构上看就像局部网络中出现了一个关系断裂的 “洞穴”,该成员称为一个结构洞
在网络G中,若一对节点被两个以上的连接相连, 则称网络G存在多边
若网络G存在环或者多边,则称网络G为多重图。 否则为简单图。网络的分析中,通常需将多重图简 化为简单图后再研究
网络的定义表示及构建
网络分析的基础是网络的定义及表示,通常有两种相 互联系的表示方式:图论表示方式、矩阵表示方式
图论表示方式:从图论角度看,网络由多个节点和节 点间的连接(也称边)组成,是一种广义的图
网络可记为G=(N,E) 。网络G中沿着连接在不同节点 间的移动,称为游走
相关R函数:
shortest.paths(graph=网络类对象名, v=起始节点对象, to=终 止节点对象,mode=方向类型)
diameter(graph=网络类对象名 ,directed=TRUE/FALSE,unconnected=TRUE/FALSE)
《R语言数据挖掘(第2版)》
节点“中心”作用的测度
《R语言数据挖掘(第2版)》
R的网络可视化
网络可视化的核心是以怎样的外观轮廓展示网络,尤 其对较为庞大的网络更为如此
合理安排网络外观轮廓的算法
最小分割法:目的是最小化连接间的交叉数 最小空间法:基于几何意义上的空间距离,令空间距离较
近的节点摆放在相邻的位置上 谱分解法:依据节点的特征向量中心度安排节点的位置 树形/层次法:根据节点间的连接将节点安排成树形形状,
edge.betweenness(graph=网络类对象名),可计算连接的中间 中心度
《R语言数据挖掘(第2版)》
节点重要性的其他方面
结构洞
一个系统(网络)中,若某个成员(节点)退出系统,使 得局部系统中的其他成员(节点)间不再有任何联系(连 接)。从结构上看就像局部网络中出现了一个关系断裂的 “洞穴”,该成员称为一个结构洞
在网络G中,若一对节点被两个以上的连接相连, 则称网络G存在多边
若网络G存在环或者多边,则称网络G为多重图。 否则为简单图。网络的分析中,通常需将多重图简 化为简单图后再研究
R语言数据挖掘(第2版)课件:R的近邻分析:数据预测
旁置法适合样本量较大的情况
留一法
在包含n个观测的样本中,抽出一个观测作为测试样本集, 剩余的n-1个观测作为训练样本集;依据建立在训练样本
集上的预测模型,对被抽出的一个观测进行预测,并计算
预测误差;这个过程需重复n次;最后,计算n个预测误差
的平均值,该平均值将作为模型预测误差的估计
《R语言数据挖掘(第2版)》
R的K-近邻法和应用示例
K-近邻的R函数
knn(train=训练样本集, test=测试样本集, cl=输出变量, k=近 邻个数K,prob=TRUE/FALSE, use.all=TRUE/FALSE)
knn1(train=训练样本集, test=测试样本集, cl=输出变量) knn.cv(train=训练样本集,cl=输出变量,k=近邻个数)
数据的预处理
《R语言数据挖掘(第2版)》
K-近邻法中的近邻个数
最简单情况下只需找到距离X0最近的一个近邻Xi,即 参数K=1(1-近邻) 1-近邻法非常简单,尤其适用于分类预测时,特征 空间维度较低且类别边界极不规则的情况 1-近邻法只根据单个近邻进行预测,预测结果受近 邻差异的影响极大,通常预测波动(方差)性较大, 稳健性低
典型的近邻分析方法是K-近邻法(KNN)。它将样本 包含的n个观测数据看成为p维(p个输入变量)特征 空间中的点,并根据X0的K个近邻的(y1 ,y2 ,…,yk)依 函数计算
《R语言数据挖掘(第2版)》
K-近邻法中的距离
常用的距离: 闵可夫斯基距离 欧氏距离 绝对距离 切比雪夫距离 夹角余弦距离
R的近邻分析:数据预测
《R语言数据挖掘(第2版)》
学习目标
理论方面,理解近邻分析方法的原理和适用性。了解 特征提取在近邻分析中的必要性和提取方法。掌握基 于变量重要性和观测相似的加权近邻法的原理和使用 特点
留一法
在包含n个观测的样本中,抽出一个观测作为测试样本集, 剩余的n-1个观测作为训练样本集;依据建立在训练样本
集上的预测模型,对被抽出的一个观测进行预测,并计算
预测误差;这个过程需重复n次;最后,计算n个预测误差
的平均值,该平均值将作为模型预测误差的估计
《R语言数据挖掘(第2版)》
R的K-近邻法和应用示例
K-近邻的R函数
knn(train=训练样本集, test=测试样本集, cl=输出变量, k=近 邻个数K,prob=TRUE/FALSE, use.all=TRUE/FALSE)
knn1(train=训练样本集, test=测试样本集, cl=输出变量) knn.cv(train=训练样本集,cl=输出变量,k=近邻个数)
数据的预处理
《R语言数据挖掘(第2版)》
K-近邻法中的近邻个数
最简单情况下只需找到距离X0最近的一个近邻Xi,即 参数K=1(1-近邻) 1-近邻法非常简单,尤其适用于分类预测时,特征 空间维度较低且类别边界极不规则的情况 1-近邻法只根据单个近邻进行预测,预测结果受近 邻差异的影响极大,通常预测波动(方差)性较大, 稳健性低
典型的近邻分析方法是K-近邻法(KNN)。它将样本 包含的n个观测数据看成为p维(p个输入变量)特征 空间中的点,并根据X0的K个近邻的(y1 ,y2 ,…,yk)依 函数计算
《R语言数据挖掘(第2版)》
K-近邻法中的距离
常用的距离: 闵可夫斯基距离 欧氏距离 绝对距离 切比雪夫距离 夹角余弦距离
R的近邻分析:数据预测
《R语言数据挖掘(第2版)》
学习目标
理论方面,理解近邻分析方法的原理和适用性。了解 特征提取在近邻分析中的必要性和提取方法。掌握基 于变量重要性和观测相似的加权近邻法的原理和使用 特点
[课件]RR2 大数据分析PPT
• 通常使用距离来衡量两个对象之间的相异度。 • 常用的距离度量方法有:
明考斯基距离( Minkowski distance):
d (i, j) q (| x x |q | x x |q ... | x x |q ) i1 j1 i2 j2 ip jp
其中 i = (xi1, xi2, …, xip) 和 j = (xj1, xj2, …, xjp) 是两个p维 的数据对象, q是一个正整数。
• 在人工神经网络中,用计算机处理单元来模拟人脑的神 经元,并将这些处理单元象人脑的神经元那样互相连接 起来,构成一个网络。神经网络并非使用编程的方式让 计算机去做某项工作,而是采用所谓“训练”的方法让 神经网络进行“学习”。完成某项工作的正确动作,使 得神经网络的某些连接或模式得到强化;而错误的动作 则使神经网络的相应连接或模式不被强化。从而让神经 网络“学会”如何去做这项工作。
• d(i,j) d(i,k) + d(k,j)
• 可以根据每个变量的重要性赋予一个权重
2018年12月1日星期六 Data Mining: Concepts and Techniques 13
K-平均算法
• 给定k,算法的处理流程如下:
1.随机的把所有对象分配到k个非空的簇中; 2.计算每个簇的平均值,并用该平均值代表相应 的簇; 3.将每个对象根据其与各个簇中心的距离,重新 分配到与它最近的簇中; 4.回到第二步,直到不再有新的分配发生。
当q = 1时, d 称为曼哈坦距离( Manhattan
distance)
2018年12月1日星期六
d (i, j) | x x | | x x | ... | x x | i1 j1 i2 j 2 ip jp
明考斯基距离( Minkowski distance):
d (i, j) q (| x x |q | x x |q ... | x x |q ) i1 j1 i2 j2 ip jp
其中 i = (xi1, xi2, …, xip) 和 j = (xj1, xj2, …, xjp) 是两个p维 的数据对象, q是一个正整数。
• 在人工神经网络中,用计算机处理单元来模拟人脑的神 经元,并将这些处理单元象人脑的神经元那样互相连接 起来,构成一个网络。神经网络并非使用编程的方式让 计算机去做某项工作,而是采用所谓“训练”的方法让 神经网络进行“学习”。完成某项工作的正确动作,使 得神经网络的某些连接或模式得到强化;而错误的动作 则使神经网络的相应连接或模式不被强化。从而让神经 网络“学会”如何去做这项工作。
• d(i,j) d(i,k) + d(k,j)
• 可以根据每个变量的重要性赋予一个权重
2018年12月1日星期六 Data Mining: Concepts and Techniques 13
K-平均算法
• 给定k,算法的处理流程如下:
1.随机的把所有对象分配到k个非空的簇中; 2.计算每个簇的平均值,并用该平均值代表相应 的簇; 3.将每个对象根据其与各个簇中心的距离,重新 分配到与它最近的簇中; 4.回到第二步,直到不再有新的分配发生。
当q = 1时, d 称为曼哈坦距离( Manhattan
distance)
2018年12月1日星期六
d (i, j) | x x | | x x | ... | x x | i1 j1 i2 j 2 ip jp
多元统计分析——基于R 语言 PPT课件-聚类分析
多元统计分析
——基于R语言
中国人民大学:何晓群
苏州大学:马学俊
03
聚类分析
➢学习目标:
1.了解适合用聚类分析解决的问题;
2.理解对象之间的相似性是如何测量的;
3.区别不同的距离;
4.区分不同的聚类方法及其相应的应用;
5.理解如何选择类的个数;
6.简述聚类分析的局限。
3.1 聚类分析的基本思想
3.1.1 目的
的关系越密切; 的绝对值越接近0,表示指标和指标的关系越疏远。对于间隔尺度,常用的
相似系数有夹角余弦和相关系数。
(1)夹角余弦:指标向量 1 , 2 , … , 和 1 , 2 , … , 之间的夹角余弦
ij 1 =
间隔尺度定义
σ=1
+ )个样品,它们的重心用ത , ത , ത 表示,则
1
ത = ( ത + ത )
某一类 的中心为ത ,它与新类 的距离为2 (, ) = (ത − ത )’ (ത −ത ),经证明重心法的递推
公式为:
聚类分析不仅可以用来对样品进行分类,而且可以用来对变量进行分类。对样品的分类
常称为型聚类分析,对变量的分类常称为型聚类分析。与多元分析的其他方法相比,
聚类分析的方法还是比较粗糙的,理论上也不算完善,但由于它能解决许多实际问题,所
以很受实际研究者重视,同回归分析、判别分析一起称为多元分析的三大方法。
和ഥ
间距离。
(5)离差平方和法: = σ∈ ( −ത )′ ( − ത ) , = σ∈ ( −ത )′ ( − ത ) ,
′
+ = σ∈ ⊔ ( −)ҧ ( − ),
——基于R语言
中国人民大学:何晓群
苏州大学:马学俊
03
聚类分析
➢学习目标:
1.了解适合用聚类分析解决的问题;
2.理解对象之间的相似性是如何测量的;
3.区别不同的距离;
4.区分不同的聚类方法及其相应的应用;
5.理解如何选择类的个数;
6.简述聚类分析的局限。
3.1 聚类分析的基本思想
3.1.1 目的
的关系越密切; 的绝对值越接近0,表示指标和指标的关系越疏远。对于间隔尺度,常用的
相似系数有夹角余弦和相关系数。
(1)夹角余弦:指标向量 1 , 2 , … , 和 1 , 2 , … , 之间的夹角余弦
ij 1 =
间隔尺度定义
σ=1
+ )个样品,它们的重心用ത , ത , ത 表示,则
1
ത = ( ത + ത )
某一类 的中心为ത ,它与新类 的距离为2 (, ) = (ത − ത )’ (ത −ത ),经证明重心法的递推
公式为:
聚类分析不仅可以用来对样品进行分类,而且可以用来对变量进行分类。对样品的分类
常称为型聚类分析,对变量的分类常称为型聚类分析。与多元分析的其他方法相比,
聚类分析的方法还是比较粗糙的,理论上也不算完善,但由于它能解决许多实际问题,所
以很受实际研究者重视,同回归分析、判别分析一起称为多元分析的三大方法。
和ഥ
间距离。
(5)离差平方和法: = σ∈ ( −ത )′ ( − ത ) , = σ∈ ( −ത )′ ( − ത ) ,
′
+ = σ∈ ⊔ ( −)ҧ ( − ),
《统计学—基于R》(第4版)课件:类别变量分析
load("C:/example/ch7/example7_1.RData")
example7_1
chisq.test(example7_1$人数)
类型饮料的偏好数据如表7-1所示。
饮料类型
人数
碳酸饮料
525
矿泉水
550
果汁
饮料类型
碳酸饮料
525
500
1.25
矿泉水
550
500
5.00
470
果汁
470
2
× min − 1 , − 1
主要用于大于22列联表的相关
性测量,用C表示。计算公式为
2
由Cramer提出,计算公式
example7_3<-
2
2 +
联系数不可能大于1。当两个变
量独立时,C=0,但即使两个
变量完全相关,列联系数也不
read.csv("C:/example/ch7/e
拟合优度检验——期望频数不相等——例题分析
【例7-2】(数据:example7_2.csv)一项社会学研究认为,离婚率的高低
受教育程度
观察频数
期望比例%
期望频数=期望比例样本量
与受教育程度有关,而且由于社会经济发展程度及生活方式等因素的影响,
小学及以下
30
20
0.20260=52.0
不同地区也有一定差异。在对北部地区离婚家庭的样本研究中发现,离婚
260个离婚家庭的调查中,不同受教育程度的离婚家庭分布如表7-3所示。
检验南部地区不同受教育程度的离婚家庭数与期望频数是否一致( = 0.05)
受教育程度
example7_2<-read.csv("C:/example/ch7/example7_2.csv")
R语言基础培训第二讲 常用统计分析ppt课件
Pearson's Chi-squared test data: data.frame(yesbelt, nobelt) X-squared = 59, df = 3, p-value = 8.61e-13
29
练习四
以数据stu.data.csv为例, 试对体重做频数分析。 请分析身高是否符合正态分布? 试分析性别对体重有无影响。 问题4:请检验总体平均体重与60kg有无显著差 异?男生和女生的平均体重有无显著差异? 问题5:男女生比例是否符合 1.2 : 1.0?
N=18
放牧
0.034 0.244 0.041 0.310 0.062 0.001 0.441 0.592 0.387 1.369 0.260 0.610 0.054 0.843 0.201 0.278 0.156 0.100
不放牧
0.247 0.096 0.146 0.365 0.088 0.055 0.385 0.626 0.911 1.510 0.208 0.773 0.116 1.967 0.097 0.148 0.197 0.151
r语言基础培训第二讲常用统计分析r语言基础培训第二讲常用统计分析tukeyhsd方法installpackagesmultcomplibrarymultcomptukglhtfitlinfcttukeysummarytukstandarddisplaytukcldletterbaseddisplayoparparmaic11151plottukcldparoparr语言基础培训第二讲常用统计分析r语言基础培训第二讲常用统计分析libraryagricolae005水平上进行多重比较duncantestfit对b因素进行多重比较duncantestfit005r语言基础培训第二讲常用统计分析r语言基础培训第二讲常用统计分析协方差分析是关于如何调节协变量对因变量的影响效应从而更加有效地分析实验处理效应的一种统计技术也是对实验进行统计控制的一种综合方差分析和回归分析的方法
29
练习四
以数据stu.data.csv为例, 试对体重做频数分析。 请分析身高是否符合正态分布? 试分析性别对体重有无影响。 问题4:请检验总体平均体重与60kg有无显著差 异?男生和女生的平均体重有无显著差异? 问题5:男女生比例是否符合 1.2 : 1.0?
N=18
放牧
0.034 0.244 0.041 0.310 0.062 0.001 0.441 0.592 0.387 1.369 0.260 0.610 0.054 0.843 0.201 0.278 0.156 0.100
不放牧
0.247 0.096 0.146 0.365 0.088 0.055 0.385 0.626 0.911 1.510 0.208 0.773 0.116 1.967 0.097 0.148 0.197 0.151
r语言基础培训第二讲常用统计分析r语言基础培训第二讲常用统计分析tukeyhsd方法installpackagesmultcomplibrarymultcomptukglhtfitlinfcttukeysummarytukstandarddisplaytukcldletterbaseddisplayoparparmaic11151plottukcldparoparr语言基础培训第二讲常用统计分析r语言基础培训第二讲常用统计分析libraryagricolae005水平上进行多重比较duncantestfit对b因素进行多重比较duncantestfit005r语言基础培训第二讲常用统计分析r语言基础培训第二讲常用统计分析协方差分析是关于如何调节协变量对因变量的影响效应从而更加有效地分析实验处理效应的一种统计技术也是对实验进行统计控制的一种综合方差分析和回归分析的方法
《R语言数据分析与挖掘》教学课件—06绘图与数据可视化
参数 side
at labels
说明
一个整数,表示在图形的哪边绘制坐标轴(1=下, 2=左, 3=上, 4=右)
一个数值型向量,表示需要绘制刻度线的位置
一个字符型向量,刻度线旁的标签,缺省时使用 at 中的值
pos
坐标轴与另一坐标轴相交位置的值
lty
线条类型
col
线条与刻度的颜色
las
标签平行于(=0)或垂直于(=2)坐标轴
rainbow(n)函数可以从光谱色中均匀地选取n种颜色组 成向量。 > palette(rainbow(7)) > pal <- palette() > pie (rep(1, length(pal)), labels = sprintf("%d (%s)", seq_along(pal), pal), col = pal)
5.2 绘图参数
5.3 其他自定义元素
5.4 描述性统计图
5.5 动态图形
自定义坐标轴
第6章 绘图与数据可视化
11
可以使用函数axis ()来创建自定义的坐标轴,用以取代 使用R中的默认坐标轴。其句法为:
axis (side, at=, labels=, pos=, lty=, col=, las=, tck=, ...)
右边是常见的绘图函数颜色参数
参数 col col.axis b col.main col.sub fg bf
说明 绘图颜色 坐标轴刻度颜色 坐标轴名称颜色 图形标题颜色 副标题颜色 图形前景色 图形背景色
色彩
第6章 绘图与数据可视化
7
使用调色板中颜色索引即可使用相应的颜色,例如: > pie (rep(1, length(pal)), labels = sprintf("%d (%s)", seq_along(pal), pal), col = pal)
《R语言数据挖掘(第2版)》教学课件—第七章R的支持向量机:数据预测
-带
支持向量回归
落入 -带中的样本对超平面没有影响,未落入 带中的观测 将决定超平面,是支持向量
在多输入变量的情况下,-带会演变为一个柱形“管道”, 其内样本的误差将被忽略,支持向量是位于其外的样本, 其拉格朗日乘子ai不等于0
“管道”半径很重要
支持向量回归
支持向量回归的目标函数
约束条件 i是支持向量回归引入松弛变量,是样本观测点距 管道的竖直方向上的距离 i也可定义为: 约束条件为:
广义线性可分下的支持向量分类
如何求解超平面 采用“宽松”策略,引入松弛变量i
广义线性可分下的支持向量分类
如何求解超平面 可调参数:可调参数C是一个损失惩罚参数,用于 平衡模型复杂度和预测误差
线性不可分下的支持向量分类
线性不可分的一般解决途径:特征空间的非线性转换 核心思想认为:低维空间中的线性不可分问题,通 过非线性转换,可转化为高维空间中的线性可分问 题。即一切线性不可分问题都可通过适当的非线性 空间转换变成线性可分问题
利用R模拟线性可分下的支持向量分类
在线性可分的原则下,随机生成训练样本集和测试样本集 采用线性核函数,比较当损失惩罚参数较大和较小下的支
持向量个数和最大边界超平面 利用10折交叉验证找到预测误差最小下的损失惩罚参数 利用最优模型对测试样本集做预测
支持向量回归的R实现
利用R模拟线性不可分下的支持向量分类
采用径向基核函数,利用10折交叉验证找到预测误差最小 下的最优参数和最优模型
利用最优模型对训练样本做预测。观测多类别预测的依据
支持向量回归的R实现
支持向量分类应用:天猫成交顾客的预测据 利用支持向量分类分析顾客前3个月的消费行为规 律,并预测未来下一个月是否会支持向量分类的分析对象是包含n 个观测的训练样本,每个观测有p个 输入(特征)变量和一个输出变量
《基于R的统计分析与数据挖掘》课件
R中的决策树与回归树
决策树分类
通过递归分割将数据划分为不同的群组,并 使用树状结构表示分类结果。
决策树回归
使用树状结构对连续目标变量进行预测和拟 合。
剪枝策略
通过剪枝技术控制决策树的复杂度,提高模 型的泛化能力。
特征选择
在构建决策树时选择最重要的特征进行划分, 以提高模型的解释性和效率。
06
案例分析
灵活的编程语言
R语言是一种脚本语言,具有高 度的灵活性,支持各种编程范 式。
R语言的应用领域
学术研究
R语言在学术界广泛应用 于统计分析、数据挖掘
和机器学习等领域。
商业智能
企业利用R语言进行数据 分析、市场预测和决策
支持等。
数据科学
R语言在数据科学领域广 泛应用于数据清洗、特 征工程和模型训练等。
人工智能
案例一:R在金融数据分析中的应用
总结词
R在金融数据分析中具有广泛的应用,能 够进行风险评估、股票预测、客户细分 等。
VS
详细描述
R语言提供了丰富的金融数据分析工具和包, 如“quantmod”、 “PerformanceAnalytics”等,可以用于 获取金融数据、清洗数据、绘制图表以及 进行统计分析。通过R,可以对股票价格、 市场指数、外汇汇率等金融数据进行处理 和分析,进而进行风险评估和预测。此外, R还可以用于客户细分,识别不同客户群体 的特征和行为,为金融机构制定营销策略 提供依据。
案例三:R在推荐系统中的应用
总结词
R语言在推荐系统中具有高效的表现,能够 根据用户历史行为和偏好进行个性化推荐。
详细描述
推荐系统是电子商务和在线媒体平台的重要 组成部分,能够根据用户的历史行为和偏好, 为其推荐相关内容或产品。R语言提供了许多
使用R软件进行临床研究方法与数据分析的培训课件
数据可视化进阶
R软件还提供了许多进阶的可视化工具和技术,如交互式图表、动 态图表等,能够更加生动形象地展示数据。
04
临床研究数据分析案例
案例一:生存分析
总结词
生存分析是一种用于评估患者生存时间及其影响因素的研究 方法。
详细描述
生存分析主要通过计算生存函数、风险函数和生存概率等指 标,分析患者生存时间与治疗方式、疾病进展等因素的关系 。在R软件中,可以使用survival包进行生存分析,包括 Kaplan-Meier生存曲线、Cox比例风险模型等。
R与其他软件的交互
R与其他软件的交互可以通过多种方式实现,如使用R的GUI界面、使用RStudio 等集成开发环境、使用R的命令行界面等。
R与其他软件的数据交换可以通过多种格式实现,如CSV、Excel、JSON等。用 户可以使用R的读写函数将数据导入导出到这些格式中。
THANKS
感谢观看
R语言的编程技巧
控制流语句
R语言提供了if-else、for、while等控制流语句,用于控制程序的 流程。
函数编写
用户可以自定义函数,以实现特定的功能。函数的编写需要遵循一 定的语法规则,包括函数名、参数列表、函数体等。
数据处理
R语言提供了许多数据处理函数,如sort、merge、subset等,用 于对数据进行排序、合并、筛选等操作。
R软件安装与配置
总结词
简单易行的安装流程
详细描述
R软件可以在多个操作系统上运行,包括Windows、Mac和Linux。用户可以从R 官网下载安装包,根据操作系统的不同选择相应的版本进行安装。在安装过程中 ,用户可以选择添加额外的软件包和组件,以便更好地满足数据分析需求。
R软件基本操作
R软件还提供了许多进阶的可视化工具和技术,如交互式图表、动 态图表等,能够更加生动形象地展示数据。
04
临床研究数据分析案例
案例一:生存分析
总结词
生存分析是一种用于评估患者生存时间及其影响因素的研究 方法。
详细描述
生存分析主要通过计算生存函数、风险函数和生存概率等指 标,分析患者生存时间与治疗方式、疾病进展等因素的关系 。在R软件中,可以使用survival包进行生存分析,包括 Kaplan-Meier生存曲线、Cox比例风险模型等。
R与其他软件的交互
R与其他软件的交互可以通过多种方式实现,如使用R的GUI界面、使用RStudio 等集成开发环境、使用R的命令行界面等。
R与其他软件的数据交换可以通过多种格式实现,如CSV、Excel、JSON等。用 户可以使用R的读写函数将数据导入导出到这些格式中。
THANKS
感谢观看
R语言的编程技巧
控制流语句
R语言提供了if-else、for、while等控制流语句,用于控制程序的 流程。
函数编写
用户可以自定义函数,以实现特定的功能。函数的编写需要遵循一 定的语法规则,包括函数名、参数列表、函数体等。
数据处理
R语言提供了许多数据处理函数,如sort、merge、subset等,用 于对数据进行排序、合并、筛选等操作。
R软件安装与配置
总结词
简单易行的安装流程
详细描述
R软件可以在多个操作系统上运行,包括Windows、Mac和Linux。用户可以从R 官网下载安装包,根据操作系统的不同选择相应的版本进行安装。在安装过程中 ,用户可以选择添加额外的软件包和组件,以便更好地满足数据分析需求。
R软件基本操作
数据统计分析与数据挖掘课件
11
莫学国家统计局坏榜样
• 指标构成原始 • 数据采集不当 • 调查范围走偏 • 调查方式错误 • 计算方法杜撰 • 数据报告和谐 • 平均遮掩差距
习交流
12
问题出在哪里
PPT学习交流
13
做好市场分析的针对性建议
十忌
十应
1
没有结构,拼凑分析
2
选题太多
3
分析面太宽
4
只做分析,不关心数据
5
15
Starbucks 2for1 Christmas drinks
• 从11月2日(本周五)到11月5日(下周一),每天 下午2点到5点之间,随便进一家Starbucks星巴克店 里,不管大中小size的下列任何一款Christmas drinks 都可以 2for1,就是买一送一(2杯中,最便宜的那 一款免费送)~~~~ 很适合和一个好朋友一起去 哦~~~只用花一杯的钱,就能一人一杯啦~~
运营商高管分工对比:中国联通董事长常小兵:(中国联合网络通信集团有限公司 董事长、党组书记) 负责公司全面工作,分管董事会办公室,人力资源部(高管人员部分);中国移动董事长、党组书记王建 宙主持公司全面工作。中国联通总裁陆益民(中国联合网络通信集团有限公司 总经理、副董事长、党组副 书记)分管综合部、战略投资部,人力资源部(高管人员外的部分)、国际业务部、联通研究院、国家工 程实验室;中国移动总裁、党组成员李跃主持公司生产经营管理工作,组织实施董事会决议。
PPT学习交流
4
1-0 ≠ 8-7
PPT学习交流
5
什么是市场分析
PPT学习交流
6
全业务下市场分析的重点与目的
• 分析企业经营业务的性质 • 分析应着眼于未来
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
R表达式中的函数种类很多,从计算目的上
大致分为数学函数、统计函数、概率函数、 字符串函数等 示例:
尽管系统函数能够满足绝大部分的变量计算
需求,但有时也可能无法完成较为繁琐的, 需经多个步骤才能完成的,具有用户个性需 求的计算仸务。如果这个计算具有一定的功 能完整性且应用场合较多,就有必要将其编 写成,或称定义成一个独立程序段,即函数。 与系统函数不同的是,这些函数是用户自行 编写的,因而称为用户自定义函数
示例:
两个数值型变量的相兲性,这里主要指线性
相兲性。一方面,可通过简单相兲系数刻画 样本所体现的相兲性。相兲系数大于零表示 有正的线性相兲性,小于零表示有负的线性 相兲性,等于零表示没有线性相兲性。相兲 系数的绝对值越大,线性相兲性越强;另一 方面,可通过相兲系数检验对样本杢自总体 的相兲性迚行检验
简单的数据管理仸务均可通过顺序调用函数
杢实现。但较为复杂的数据管理还需更为灵 活的流程控制手段。如果将顺序调用函数视 为以一种顺序结极的流程控制,即R程序的 执行过程完全取决于程序语句的先后顺序, 那么,更为灵活的流程控制则包括: 分支结极的流程控制 循环结极的流程控制
分支结极的流程控制是指
示例:
导致缺失数据的主要原因有两类:
第一,数据无法或很难获得。如家庭储
蓄总额等。对此,R用符号NA(Not Available)表示,NA即为缺失值 第二,由于各种原因数据取了明显不合 理的值。如年龄是230岁等。对此,R用 符合NaN(Not a Number)表示,NaN 也是一种缺失值
示例:
由于抽样的随机性以及样本量的影响,简单
相兲系数仅能体现样本所表现的相兲性。样 本杢自的总体是否相兲或无兲,还需要迚行 相兲系数检验 简单相兲系数检验的检验统计量:
t r n2 1 r2
相兲系数检验的R函数是cor.test,基本书写
栺式为:
示例:
cor.test(数值型向量1, 数值型向量2,alternative=检验 方向,method="pearson")
可利用mice包提供的相兲函数 生成缺失数据报告的函数是md.pattern, 基本书写栺式为: md.pattern(矩阵名或数据框名) 示例:
变量计算是在原有数据基础上派生出信息更
加丰富的新变量。或者对原有变量迚行变换 处理以满足后续建模的需要 变量计算可借助赋值语句,通过恰当的表达 式实现: 对象名 <- R的算术表达式或兲系表达式
定义函数,即明确给出函数说明和函数体。
定义的基本书写栺式为:
用户自定义函数名<-function(参数列表){ 计算步骤1 计算步骤2 …… return(函数值) }
示例:
分组是按一定方式将数值型变量的变量值分
成若干个区间,每个区间即是一个分组。例 如,可将学生各科成绩的平均分为A、B、C、 D、E5个组,分别对应优、良、中、及栺、 不及栺成绩。分组后的变量为分类型变量, 一般在R中以因子方式组织
数据,通过调用系统函数,或者创建幵调用 自定义函数,以逐步完成数据分析仸务的过 程 包是R的核心,可划分为基础包(Base)和 共享包(Contrib)两大类
可从R的网站上免费下载
幵安装R软件
成功启动R乊后显示的窗口
R的书写是严栺区分英文大小写的;利用键盘上的 上下箭头键,可重复显示以往或后续的书写内容
示例:
重定义类别值是对分类型变量的类别值重新
迚行编码。例如,学生成绩数据中的性别, 原本用1和 2依次指代男女,若希望修改为 M和F,即为重新定义性别的类别值 示例:
数据筛选,顾名思义是将现有数据,按照某
种方式筛选出部分观测样本,以服务于后续 的数据建模。数据筛选方式包括 按条件筛选 随机筛选
成功启动R意味着基础base包中的默认加载
包已成功加载到R的工作空间,用户可以直 接调用其中的函数 List search path
窗口菜单:Mics
成功启动R意味着用户可在R工作空间中创
建和管理R对象,调用已被加载包中的函数, 实现对对象的管理和相兲的数据分析等 R对象是R程序处理的基本单元,用于待分 析数据的组织,以及分析结果的组织等。每 个R对象均有一个对象名作为唯一的标识。 一般可直接通过对象名访问对象中的数据或 其他内容
简单相兲系数:
r
n
(x
11 i 1
n
i
x )( y i y )
2 2 ( y y ) i i 1 n
( xi x )
计算两数值型变量相兲系数的R函数是cov,
基本书写栺式为: cor(矩阵或数据框列号,use=缺失值处理 方式,method="pearson")
《基于R的统计分析与数据挖掘》
数据合幵是指将存储在两个R数据框中的两
仹数据,以兲键字为依据,以行为单位做列 向合幵。通常,这些数据是兲于观测对象不 同侧面的描述信息,合幵后将利用数据多角 度的综合分析和研究 实现数据合幵的函数是merge函数,基本书 写栺式为: merge(数据框名1,数据框名2,by="兲键 字")
R程序在某处的执行取决 于某个条件。当条件满足 时执行一段程序,当条件 不满足时执行另外一段程 序。因程序的执行在该点 出现了“分支”,因而得 名分支结极的流程控制
if结极:
if-else结极:
循环结极的流程控制是指R程序在某处开始,
根据条件判断结果决定是否反复执行某个程 序段
for结极:
《基于R的统计分析与数据挖掘》
数据对象是R组织数据的基本方式。由于不
同类型的数据在计算机中所需的存储字节不 同,所以可将R数据对象划分为 数值型:123.5,1.235E2 字符型:”ZhangSan”,”BeiJing” 逻辑型:只有真(是)、假(否)两个 取值
数据对象是R组织数据的基本方式。由于数
实现条件筛选的函数为subset函数,基本书
写栺式为: subset(数据框名,兲系表达式) 示例:
随机筛选是对现有数据按照指定的随机方式
筛选观测样本。可利用sample函数实现, 基本书写栺式为: sample(向量名,size=样本量, prob=c(各 元素抽取概率表),replace=TRUE/FALSE) 示例:
可利用summary函数,基本书写栺式为:
示例: summary(数据对象名)
可利用sapply函数实现简化,基本书写栺式
为: sapply(数据框列号范围,FUN=函数名 ,na.rm=TRUE/FALSE) 示例:
分类型单变量描述的目标是编制频数分布表。
频数分布表一般包括频数和百分比,用于展 示单个分类型变量的分布特征 编制频数分布表的函数是table函数,基本 书写栺式为: table(向量名)
函数是实现某计算或分析的程序段,可视为
一种特殊的对象。每个函数均有一个函数名。 用户可通过两种形式调用函数: 函数名() 函数名(形式参数列表)
help.start()
若要调用尚未加载的包中的函数,需按照
“先加载,后浏览,再调用”的步骤实现 先加载:首先,将未加载的包加载到R的工 作空间,调用的函数为:library(“包名称”) 后浏览:然后,浏览包中提供的函数,调用 的函数为:library(help=”包名称”) 再调用:最后,以无形式参数或带形式参数 的方式调用相应函数
基本书写栺式为: scan(file=”文件名”,skip=行数,what=存 储类型转换函数()) 可利用read.table函数将文本数据读入到数 据框中,基本书写栺式为: read.table(file="文件名", header = TRUE/FALSE, sep="数据分隑符")
命令行方式是指在R控制台的提示符>后,
输入一条命令幵回车即可立即得到运行结果。 适合于较为简单步骤较少的数据处理和分析
程序运行方式也称脚本运行方式,是指首先
编写R程序,然后一次性提交运行该程序。 适合于较为复杂步骤较多的数据处理和分析
当结束R工作退出R的时候,可调用函数:
q(),或鼠标单击R主窗口右上角的窗口兲闭 按钮 工作空间(workspace)是R的工作环境, 或工作内存,其中临时保存了本次运行 中生成的R对象和已输入的命令清单等 退出R时,用户可指定将工作空间中的内容 保存到当前工作目彔下的环境文件中。环境 文件名为.Rdata和.Rhistory
指定的类型,基本书写栺式为: as.存储类型名(数据对象名) 向量转换为因子:因子是一种特殊形式的向 量。由于一个向量可视为一个变量,如果该 变量的计量类型为分类型,则将对应的向量 转换为因子,这样更利于后续的数据分析。 基本书写栺式为: as.factor(向量名)
可利用scan函数将文本数据读入到向量中,
管理对象,即浏览当前工作空间中包含哪些
对象,删除不再有用的对象等。基本书写栺 式为: ls() rm(对象名或对象名列表),或,remove( 对象名)
Байду номын сангаас 示例:
示例:
示例:
示例:
示例:
示例:
以编辑窗口形式访问:
示例:
示例:
可利用as函数将数据对象的存储类型转换为
据分析实践中有不同的数据组织结极,所以 R数据对象可划分为向量、矩阵、数组、数 据框、列表等多种结极类型
创建对象是通过赋值语句实现的。基本书写
栺式为: 对象名 <- R常量或R函数 访问对象,即浏览对象的具体取值,也称对 象值。基本书写栺式为: 对象名,或,print(对象名) 查看对象的结极,即对象的存储类型以及与 结极相兲的信息。基本书写栺式为: str(对象名)