TAKARA糖基化分析试剂盒

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TaKaRa一步法RT-PCR提取法

TaKaRa一步法RT-PCR提取法

*2 用以校正孔与孔之间产生的荧光信号误差。ABI PRISM® 7000/7700 和 Applied
Biosystems® 7300 Real-Time PCR System 使用 ROX Reference Dye,7500
Real-Time PCR System 使用 ROX Reference Dye II,Thermal Cycler Dice Real
的荧光探针,游离荧光物质发出荧光。通过检测
反应体系中的荧光强度,可以达到检测 PCR 产物
扩增量的目的。具体原理见右图。
-2-
● 制品内容(50 μl 反应×100 次)
1. 2×One Step RT-PCR Buffer Ⅲ*1(2×)
840 μl ×3 支
2. TaKaRa Ex Taq HS(5 U/μl)
RNase Free dH2O
7.5 μl
Total
25 μl
*1 通常引物终浓度为 0.2 μM 可以得到较好结果。反应性能较差时,可以在 0.1~1.0 μM 范围 内调整引物浓度。
*2 探针浓度与所使用的 Real Time PCR 扩增仪、探针种类、荧光标记物质种类有关,使用时 请参考仪器说明书,或各荧光探针的具体使用要求进行。使用 Smart Cycler® System 时, 通常探针终浓度在 0.1~0.5 μM 范围内进行调整。
Stage 2:PCR 反应 Repeat:40 times 95℃ 5 sec 60℃ 20 sec
◆特别提示: 本制品中使用的 TaKaRa Ex Taq HS 是利用抗 Taq 抗体的 Hot Start 用 DNA 聚合酶,与其他公司的化 学修饰型 Hot Start 用 DNA 聚合酶相比,不需要 PCR 反应前的 95℃、5~15 分钟的酶的活性化反应。 如果高温处理时间过长,会使酶的活性下降,其 PCR 的扩增效率、定量精度等都会受到影响。PCR 反应前的反转录酶的热变性失活通常设定为 95℃、10 sec。

牦牛低氧诱导因子-1α基因克隆及蛋白质结构分析

牦牛低氧诱导因子-1α基因克隆及蛋白质结构分析

牦牛低氧诱导因子-1α基因克隆及蛋白质结构分析段荟芹;王利;李键;熊显荣【摘要】试验采用RT-PCR方法,以麦洼牦牛脾脏cDNA为模板扩增牦牛低氧诱导因子-1α (hypoxia inducible factor-1α,HIF-1α)基因,并运用生物信息学软件对其序列进行分析.结果发现,扩增得到的麦洼牦牛HIF-1α基因编码区长为2 472 bp,编码823个氨基酸;蛋白质预测结果显示,该蛋白质分子质量为92.13 ku,等电点5.09,为亲水性蛋白,二级结构以随机卷曲和α-螺旋为主,有69个磷酸化位点和4个N-糖基化位点;系统进化树显示,麦洼牦牛与牦牛、野牦牛、普通牛亲缘关系最近.本试验成功克隆麦洼牦牛HIF-1α基因并对其序列进行了分析,为进一步研究HIF-1α基因的功能提供参考.【期刊名称】《中国畜牧兽医》【年(卷),期】2016(043)006【总页数】7页(P1430-1436)【关键词】麦洼牦牛;低氧诱导因子-1α;克隆;蛋白质分析【作者】段荟芹;王利;李键;熊显荣【作者单位】西南民族大学青藏高原研究院,成都 610041;西南民族大学生命科学与技术学院,成都 610041;西南民族大学青藏高原研究院,成都 610041;西南民族大学生命科学与技术学院,成都 610041【正文语种】中文【中图分类】Q785低氧诱导因子(hypoxia inducible factor,HIF)最早是由Maroni等[1]在研究促红细胞生成素基因时发现,它是真核细胞调节氧稳态重要的转录调节因子,可靶向调控诸多低氧基因的表达。

HIF包括HIF-1、HIF-2和HIF-3,是由1个不稳定的α亚基和1个稳定的β亚基构成。

活性亚基HIF-1α是对氧气敏感的亚基,在细胞低氧信号转导过程中起枢纽作用,属于bHLH-PAS(basic helix-loop-helix-containing Per-ARNT/AhR-Sim domain protein family)蛋白家族[2-3]。

TAKARA植物DNA提取试剂盒说明书

TAKARA植物DNA提取试剂盒说明书

M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 1 2 M
1.0 kbp 0.5 kbp
2.0 kbp
PCR 反应液 4 μl,1% Agarose 电泳,M:Wide-Range DNA Ladder(50~10,000 bp) 图 3 以提取的基因组 DNA 为模板进行 PCR 扩增的电泳图
图 1 从植物组织中提取的基因组 DNA 电泳图 -2-
表 1 从植物组织中提取的基因组 DNA 纯度*
样品名称
样品量
Sample No.
A260/A280
A260/A230
20 mg
1
拟南芥幼芽
2
3
50 mg
4
2.2
1.4
2.2
1.4
2.1
1.7
2.1
1.7
20 mg
5
6
西红柿幼芽
7
50 mg
8
图 5 以提取的基因组 DNA 为模板进行 PCR 扩增的电泳图
注:长时间存放可能会有夹杂物沉淀,尽量迅速进入 下一步操作。
12. 12,000 rpm 4℃离心 10 分钟。 13. 弃上清,注意不要吸取沉淀。
注:沉淀有时肉眼看不见。
14. 加入 1 ml 70%乙醇,清洗沉淀。 15. 12,000 rpm 4℃离心 3 分钟。 16. 弃上清,注意不要吸取沉淀。 17. 沉淀干燥,加入适量 TE Buffer(约 20 μl)溶解沉
2. 取出冻结的植物组织于室温放置 5 分钟左右,使其融解。 3. 轻微离心,将植物组织收集在 Microtube 底部。 4. 使用 Pipet Tip 尖端将植物组织按压 Microtube 底部 10 次左右,进行物理破碎。 5. 加入 400 μl 的 Extraction Solution 1,剧烈振荡 5 秒钟。如果植物组织仍滞留于 Microtube 底部,

takara反转录试剂盒说明书

takara反转录试剂盒说明书

Code No. RR047A 研究用PrimeScript™RT reagent Kitwith gDNA Eraser(Perfect Real Time)说明书目录内容页码●制品说明1●制品内容 1 ●试剂盒外必备材料 1 ●保存 1 ●特长 2 ●使用注意 2 ●操作方法 2 ● Real Time PCR 4 ●实验例 6 ●附录7 ●关联产品8●制品说明为了准确地进行基因表达量分析,必须满足只有cDNA作为模板检出的先决条件,但Total RNA中常常混有基因组DNA,并可以直接作为PCR反应的模板进行扩增,因此会造成解析结果不准确。

为了避免这种情况发生,通常将检测用引物设计在内含子前后的外显子上,使基因组DNA得不到扩增。

但是,此方法不适合具有单个外显子的基因或两个外显子之间所跨的内含子过小的基因,同时当基因组上有伪基因存在时、或设计引物对基因组有非特异性扩增时、以及基因信息没被完全解析的生物种等也同样不适合于本方法。

在这种情况下,我们常常需要对Total RNA样品进行DNase I处理,以除去残存的基因组DNA。

而DNase I处理通常要进行复杂的纯化操作,同时会造成RNA的降解和损失。

PrimeScript RT reagent Kit with gDNA Eraser是可以除去基因组DNA进行Real Time RT-PCR反应的专用反转录试剂。

Kit中使用了具有较强DNA分解活性的gDNA Eraser,通过42℃,2 min即可除去基因组DNA。

同时由于反转录试剂中含有抑制DNA分解酶活性的组分,经过gDNA Eraser处理后的样品可以直接进行15 min的反转录反应合成cDNA,因此,20 min内即可迅速完成从基因组DNA去除到cDNA合成的全过程。

使用本制品合成的cDNA适用于SYBR® Green分析法和TaqMan®探针分析法,可以根据实验目的,选择与SYBR Premix Ex Taq™ II(Tli RNaseH Plus)(Code No. RR820Q/A/B)、Probe qPCR Mix(Code No. RR391S/A/B)组合使用。

2014-2015 Takara商品目录 (2)

2014-2015 Takara商品目录 (2)

Mung Bean Nuclease
225512S00BBa((AAm××55p)) le pBSieAPL6c3R1hNNAauPrcotlelyawmseeitrahse8 different colors.
2540B (A×5)
T7 RNA Polymerase
2650B (A×5)
Exonuclease I
价格(元)
520 540 2,160 1,170 2,340 1,170 1,170 170 770 770 2,390 720 950 4,640 1,170 1,670 1,890 2,250 1,850 1,170 590 3,150 8,780 520 2120 2750
C 基因操作试剂盒
增加23个高浓度限制酶大包装
包装量
10,000 U 50,000 U 50,000 U 10,000 U
5,000 U 20,000 U 50,000 U 15,000 U 20,000 U 10,000 U
5,000 U 50,000 U 25,000 U
5,000 U 50,000 U 10,000 U 15,000 U 10,000 U 15,000 U 25,000 U 15,000 U 30,000 U 20,000 U
制品名称
Apa I Apa I BamH I Bgl II Cla I Dra I (Aha III) EcoR I EcoR V Hae III Hap II (Hpa II, Msp I) Hinc II (Hind II) Hind III Kpn I Mlu I Pst I Sac I Sal I Sma I Xba I Xho I Msp I (Hpa II, Hap II) Hinf I Pvu II

大肠埃希菌CLM37菌株Lpp基因敲除及胞外表达N-糖基化重组蛋白研究

大肠埃希菌CLM37菌株Lpp基因敲除及胞外表达N-糖基化重组蛋白研究

大肠埃希菌CLM37菌株Lpp基因敲除及胞外表达N-糖基化重组蛋白研究阮瑶;王力凡;郭龙华;付鑫;丁宁;胡学军【摘要】目的· 构建外膜脂蛋白Lpp(Braun's lipoprotein)基因缺失的大肠埃希菌菌株,在该菌株中进行大肠埃希菌胞外生产N-糖基化重组蛋白研究.方法· 利用Red 同源重组系统,敲除大肠埃希菌CLM37基因组上的外膜脂蛋白Lpp基因;通过绘制生长曲线,研究Lpp基因缺失后对大肠埃希菌生长状态的影响.将受体蛋白表达载体pIG6-rFn3-Gly和空肠弯曲杆菌来源的N-糖基化基因簇载体pACYCpgl共转化大肠埃希菌CLM37?Lpp,研究大肠埃希菌胞外生产N-糖基化重组蛋白情况.结果· 获得了Lpp基因缺失的大肠埃希菌菌株CLM37?Lpp,并在该菌株中成功实现了胞外生产N-糖基化重组蛋白rFn3-Gly;相比于菌株CLM37,大肠埃希菌CLM37?Lpp 胞外生产重组蛋白rFn3-Gly的总量约提升了4倍,糖基化效率约提高了6倍.结论· 成功构建大肠埃希菌菌株CLM37?Lpp并实现了胞外生产N-糖基化重组蛋白rFn3-Gly,提高了糖蛋白产量及糖基化效率.【期刊名称】《上海交通大学学报(医学版)》【年(卷),期】2018(038)011【总页数】6页(P1306-1311)【关键词】Lpp基因;大肠埃希菌CLM37;N-糖基化蛋白【作者】阮瑶;王力凡;郭龙华;付鑫;丁宁;胡学军【作者单位】大连大学医学研究中心,大连116622;大连大学医学研究中心,大连116622;大连大学医学研究中心,大连116622;大连大学医学研究中心,大连116622;大连大学医学研究中心,大连116622;大连大学医学研究中心,大连116622【正文语种】中文【中图分类】Q51N-糖基化修饰可明显改善药物蛋白的理化性质,延长其血浆半衰期。

目前,已批准的蛋白治疗药物中有40%是糖基化修饰的药物[1],糖基化修饰可以显著增加药物活性,改善治疗效果[2]。

晚期糖基化终产物对人晶状体上皮细胞 TTase 表达的影响

晚期糖基化终产物对人晶状体上皮细胞 TTase 表达的影响

晚期糖基化终产物对人晶状体上皮细胞 TTase 表达的影响王旭;严宏【摘要】目的:观察晚期糖基化终产物对人晶状体上皮细胞硫醇转移酶表达及活性的影响。

<br> 方法:将体外人晶状体上皮细胞用 AGEs-BSA 浓度为1.5mg/mL,胎牛血清体积分数为10%的DMEM培养液培养,同时设定相同浓度的BSA对照组及空白对照组,分别于0,1,2,3,4 d收集细胞,测定晶状体上皮细胞内ROS含量、TTase 活性, qRT-PCR 检测 TTase mRNA 表达情况, Western blot 检测TTase蛋白质表达。

<br> 结果:与对照组相比, AGEs-BSA干预后,细胞内ROS含量呈时间依赖性增高,差异有显著统计学意义(P<0.01), BSA干预后ROS 的表达与对照组无显著差异。

AGEs可诱导TTase的 mRNA表达逐渐增高,2 d时达到峰值,约为正常对照组的5.06倍( P<0.01);而BSA处理组和对照组TTase的mRNA表达差异无统计学意义( P>0.05)。

与TTase的mRNA表达类似, TTase 活性升高,在3 d达到峰值,为正常对照组的2.01倍( P<0.01)。

Western blot检测发现,TTase蛋白质表达逐渐增加,从3d开始TTase表达与对照组相比差异有统计学意义(P<0.05)。

<br> 结论:AGEs可能是通过诱导人晶状体上皮细胞发生氧化应激,致使TTase表达上调,活性增强。

%AIM:To observe the effects of advanced glycation end-products (AGEs) on thioltransferase (TTase) expression and activity in human lens epithelial cells. <br> METHODS: Human lens epithelial cells B3 ( HLE B3 ) were treated with 1. 5mg/mL AGEs - BSA as the experimental groups cultured by fetal bovine serum of volume fraction 10% dulbecco modified eagle medium ( DMEM) and bovine serum albumin ( BSA) was added at the same concentrations as the negative control. The level of reactive oxygen species ( ROS ) wasevaluated. Cells were collected at 0, 1, 2, 3, 4d and total RNA or protein was extracted. TTase mRNA levels were detected by qRT-RCR. TTase expression was detected by Western blot and its activity was measured.<br> RESULTS: Compared with the control group, AGEs-BSA up-regulated the expression of ROS (P<0. 01), ROS content increased in a time-dependent manner. BSA had no effects on ROS expression. The expression of TTase increased after treatment with AGEs-BSA for 1d, peaked at 2d (nearly 5. 06-fold increase, P<0. 01), then decreased gradually. No change was observed between BSA and control group (P>0. 05). Similarly, TTase activity peaked at 3d (nearly 2. 01-fold increase, P<0. 01). Western blot test found that TTase protein expression was increased <br> gradually, starting from the 3d TTase expression was reflected that there was statistically significant difference compared with control group (P<0. 05). <br> CONCLUSION:AGEs-BSA significantly increases the production of ROS in human lens epithelial cells, and it then induces the oxidative stress which may promote the expression of TTase and enhances the activity of TTase.【期刊名称】《国际眼科杂志》【年(卷),期】2015(000)004【总页数】4页(P588-591)【关键词】晚期糖基化终产物;硫醇转移酶;晶状体上皮细胞;糖尿病性白内障【作者】王旭;严宏【作者单位】710038 中国陕西省西安市,第四军医大学唐都医院眼科;710038 中国陕西省西安市,第四军医大学唐都医院眼科【正文语种】中文方法:将体外人晶状体上皮细胞用AGEs-BSA浓度为1.5mg/mL,胎牛血清体积分数为10%的DMEM培养液培养,同时设定相同浓度的BSA对照组及空白对照组,分别于0,1,2,3,4d收集细胞,测定晶状体上皮细胞内ROS含量、TTase活性,qRT-PCR 检测TTase mRNA表达情况, Western blot检测TTase蛋白质表达。

takaraSYBR说明书

takaraSYBR说明书
®
使用量 12.5 μl 0.5 μl 0.5 μl 2 μl 9.5 μl 25 μl*3
终浓度 1× 0.2 μM*1 0.2 μM*1
*1 通常引物终浓度为 0.2 μM 可以得到较好结果。 反应性能较差时, 可以在 0.1~1.0 μM
Dissociation
试剂 SYBR Premix Ex Taq(2×) (Tli RNaseH Plus) ,Bulk PCR Forward Primer(10 μM) PCR Reverse Primer(10 μM) ROX Reference Dye(50×) DNA 模板(<100 ng) dH2O(灭菌蒸馏水) Total
*2 ®
使用量 10 μl 0.4 μl 0.4 μl 0.08 μl 2 μl 7.12 μl 20 μl
*3
使用量 25 μl 1 μl 1 μl 0.2 μl 4 μl 18.8 μl 50 μl*3
● 使用注意
以下为使用本试剂盒时的注意事项,使用前一定认真阅读。 1. 使用前,请上下轻轻颠倒混匀,避免产生气泡,防止因混合不均匀造成的反应效果不佳。 (1) 请勿涡旋振荡混匀。 (2) SYBR® Premix Ex Taq(2×) (Tli RNaseH Plus) ,Bulk 在-80℃存放可能会产生白色或淡 黄色的沉淀,可用手握缓慢溶解,于室温短时间避光放置,轻柔上下颠倒混匀直至沉淀全部消 失。 (3) 沉淀会导致溶液成分不均匀,使用前务必充分混匀试剂。 2. 配制反应液时,试剂请于冰上放置。 3. 本制品中含有荧光染料 SYBR® Green I,配制 PCR 反应液时应避免强光照射。 4. 反应液的配制、分装请一定使用新的(无污染的)枪头、Microtube 等,尽量避免污染。 5. 本制品中使用的 TaKaRa Ex Taq HS 是利用抗 Taq 抗体的 Hot Start 用 DNA 聚合酶,与其他公司的 化学修饰型 Hot Start 用 DNA 聚合酶相比,不需要 PCR 反应前的 95℃、5~15 分钟的酶的活性化反 应。如果高温处理时间过长,会使酶的活性下降,其 PCR 的扩增效率、定量精度等都会受到影响。如 果在 PCR 反应前进行模板的预变性,通常设定为 95℃、30 秒。

拟穴青蟹Cactus基因的cDNA克隆、 序列及生物学功能

拟穴青蟹Cactus基因的cDNA克隆、 序列及生物学功能

拟穴青蟹Cactus基因的cDNA克隆、序列及生物学功能胡蕾1,2,邓恒为2,李晶晶2,刘姗姗2,何建国2,李海云1,翁少萍2*(1. 华南农业大学动物科学学院,广东广州 510642;2. 中山大学生命科学学院,有害生物控制与资源利用国家重点实验室,广东广州 510275)摘要:为获取拟穴青蟹Cactus基因cDNA全长、分析基本生物学信息,并初步探索其在病原物刺激下的免疫反应,实验采用RACE技术获得了拟穴青蟹Cactus(SpCactus)基因的cDNA全长序列,其cDNA全长为2 035 bp,开放阅读框(ORF)1 311 bp,编码436个氨基酸,分子量为46.01 ku。

对蛋白理化性质进行预测发现,SpCactus为亲水性蛋白,等电点pI为4.91。

经预测,SpCactus与其他物种的IκB蛋白具有相似的功能结构域。

同源性比对结果显示,SpCactus与凡纳滨对虾和中国明对虾的Cactus蛋白同源性均高达62%,相似度为73%。

系统进化树分析显示,SpCactus与甲壳动物聚为一支,与无脊椎动物聚为一大支。

实时荧光定量PCR(RT-PCR)检测发现,SpCactus基因在拟穴青蟹不同组织中均有表达,肌肉中的表达量最高,其次为心脏、眼柄、血液和鳃,肝胰腺中的表达量最低。

LPS 和金黄色葡萄球菌刺激均能显著诱导SpCactus基因的表达。

本实验成功扩增了SpCactus 基因全长,并进行了生物信息学分析、理化性质预测,初步探讨了其生物学功能,为进一步研究其在免疫反应中的生物学功能提供参考依据。

关键词: 拟穴青蟹;Cactus;基因克隆;组织分布;表达分析中图分类号: Q 785; S 917.4文献标志码: A拟穴青蟹(Scylla paramamosain)俗称青蟹,隶属于甲壳纲(Crustacea)、十足目(Decapoda)、短尾亚目(Brachyura)、梭子蟹科(Portunidae)、青蟹属(Scylla),生活在温暖海区,主要分布于印度洋至西太平洋地区,在我国主要分布在东南沿海地区[1]。

Takara 感受态制备试剂盒说明书

Takara 感受态制备试剂盒说明书

TaKaRa Code:D406Competent Cell Preparation Kit次(200量)宝生物工程(大连)有限公司目录内 容 页 码●制品说明 1●制品内容 1●制品保存 1●使用注意 1●感受态细胞的制备方法 1●感受态细胞的DNA转化 2●实验例 2●相关试剂及培养基的制备方法 3■Ampicillin 3■IPTG 3■X-Gal 3■LB培养基 3■LB/Amp培养基 3■SOB培养基 3■SOC培养基 4■φb×broth 4■LB/Amp/X-Gal/IPTG平板培养基 4●制品说明大肠杆菌经过处理后可以摄取外源DNA(Plasmid DNA、Phage DNA等),处于这种状态的细胞称为感受态细胞(Competent Cell)。

在基因工程实验中,经常要使用各种感受态细胞进行DNA的转化操作。

实验使用的感受态细胞的来源大体可以分为两种:一种是购买商品化的感受态细胞,但商品化感受态细胞成本高、运输及保存有一定困难(超低温);另一种是自己制备感受态细胞,实验人员自己制作感受态细胞时,往往受到各种试剂及实验条件等限制,制备的感受态细胞效率低,达不到实验要求。

TaKaRa Competent Cell Preparation Kit是一种方便、高效、快速制备感受态细胞的试剂盒。

使用本试剂盒制备的感受态细胞可以满足大多数实验的需要,并且适用于几乎所有常用的大肠杆菌,例如:E.coli DH5α、JM109、CJ236、HB101、MV1184、BMH71-18mut S等,转化效率均可以达到1×106 cfu/μg pUC19以上(转化效率根据大肠杆菌细胞系及转化用DNA不同稍有差异)。

使用本试剂盒制备的感受态细胞可以在-80℃保存一年。

●制品内容(200次量)Solution A 20 mlSolution B 20 ml●制品保存:4℃保存。

●使用注意1.制作感受态细胞时应使用专用的玻璃器皿或塑料容器。

Takara基因组抽提试剂盒说明书

Takara基因组抽提试剂盒说明书
15. 将 700 μl 的 Rinse B 加入至 Spin Column 中,12,000 rpm 离心 1 分钟,弃滤液。 注)请确认 Rinse B 中已经加入了指定体积的 100%乙醇。 请沿 Spin Column 管壁四周加入 Rinse B,这样有助于完全冲洗沾附于管壁上的盐份。
16. 重复操作步骤 15。 17. 将 Spin Column 安置于 Collection Tube 上,12,000 rpm 离心 1 分钟。 18. 将 Spin Column 安置于新的 1.5 ml 的离心管上,在 Spin Column 膜的中央处加入 60 μl 的灭菌
2. RNase A1 为混浊溶液,首次使用本试剂盒时,请把 RNase A1 溶液全量加入至 SP Buffer 中,均 匀混合后供实验使用。加入 RNase A1 溶液后的 SP Buffer 请于 4℃保存。
3. 准备 65℃水浴。 4. Solution A、Solution B 若出现沉淀,请于 65℃加热溶解,待恢复至室温后使用。 5. Rinse B 在首次使用前,请添加 56 ml 的 100%乙醇。 6. 洗脱结合于 DNA 制备膜上的基因组 DNA 时,把 Elution Buffer 或灭菌蒸馏水加热至 65℃使用将
② 菌体本身富含 DNA 酶活性。可以增加一次 Rinse A 的洗净操作。
Q3. 提取的基因组 DNA 中有 RNA 污染,为什么? A3. ① 请确认在首次实验前是否把 RNase A1 加入至 SP Buffer 中。
② RNase A1 可能失活。RNase A1 须在-20℃下保存,加入了 RNase A1 的 SP Buffer,请于 4℃下保存。RNase A1 比较稳定,一般不易失活。

甜叶菊RA苷合成关键基因SrUGT76G1对水分胁迫响应分析

甜叶菊RA苷合成关键基因SrUGT76G1对水分胁迫响应分析

第43卷第1期2021年1月Vol.43,No.1Jan.,2021中国糖料Sugar Crops of Chinadoi:10.13570/ki.scc.2021.01.001甜叶菊RA苷合成关键基因SrUGT76G1对水分胁迫响应分析张婷,杨永恒,孙玉明,王银杰,原海燕,张永侠,徐晓洋(江苏省中国科学院植物研究所/南京中山植物园,南京210014)摘要:RA苷是甜叶菊叶片中最主要的组分之一,其合成受到水分胁迫的影响。

为了探究其调控的分子机制,本研究首先分析了RA苷合成关键基因SrUGT76G1在水分胁迫下的表达模式,并对SrUGT76G1瞬时转化烟草和转基因拟南芥进行干旱处理及GUS染色,多方面阐释其对水分胁迫的响应。

研究结果表明,一定程度的水分胁迫可以促进SrUGT76G1的表达。

此外,对SrUGT76G1的启动子序列进行分析,发现存在多个茉莉酸响应元件及MYB转录因子结合位点。

本研究不但为后续深入开展甜叶菊栽培的高效水分利用与管理措施提供理论支持,也为进一步寻找RA苷上游水分胁迫响应调控因子并通过转基因手段提高RA苷含量奠定基础。

关键词:甜叶菊;RA苷;基因;SrUGT76G1启动子;水分胁迫中图分类号:S566.9文献标识码:A文章编号:1007-2624(2021)01-0001-06张婷,杨永恒,孙玉明,等.甜叶菊RA苷合成关键基因SrUGT76G1对水分胁迫响应分析[J].中国糖料,2021,43(1):1-6.ZHANG Ting,YANG Yongheng,SUN Yuming,et al.Water stress response of the SrUGT76G1gene for rebaudioside A gly‐coside synthesis in Stevia rebaudiana Bertoni[J].Sugar Crops of China,2021,43(1):1-6.0引言甜菊糖苷(Steviol glycosides,SGs)是富含于菊科多年生草本植物甜叶菊(Stevia rebaudiana Bertoni)叶片中的多种四环二萜类化合物的总称。

木薯MeLHCB4基因的克隆及表达分析

木薯MeLHCB4基因的克隆及表达分析

热带作物学报2021, 42(10): 2813 2818 Chinese Journal of Tropical Crops收稿日期 2021-01-13;修回日期 2021-03-01基金项目 海南省重点研发计划项目(No. ZDYF2019063);海南省研究生创新科研课题(No. Hys2019-133)。

作者简介 丁凯旋(1996—),男,硕士研究生,研究方向:作物分子育种。

*通信作者(Corresponding author ):耿梦婷(GENGMengting ),E-mail :************************。

木薯MeLHCB4基因的克隆及表达分析丁凯旋1,2,郑婉茹1,2,李琳琳1,2,潘月云1,2,张银东1,2,耿梦婷1,2*,陈银华1,21. 海南大学热带作物学院,海南海口 570228;2. 海南省热带生物资源可持续利用国家重点实验室培育基地,海南海口 570228摘 要:本研究采用RT-PCR 技术克隆了木薯叶绿素a/b 结合蛋白基因MeLHCB4编码区序列。

通过生物信息学对其基因结构、基因编码蛋白的理化性质等进行分析,并对不同物种的LHCB4氨基酸序列进行比对和构建进化树。

结果表明,木薯MeLHCB4基因的CDs 序列全长858 bp ,编码285个氨基酸,蛋白理论相对分子质量约为30.9 kDa ,理论等电点为5.47,该蛋白属于稳定的亲水性蛋白,预测该蛋白可能定位于细胞核或细胞质中。

实时荧光定量PCR 检测该基因的表达模式发现,MeLHCB4基因主要在木薯叶片和茎中表达,受到茉莉酸甲酯(JA )、水杨酸(SA )和乙烯前体(ACC )等激素的诱导表达,推测其可能参与了JA 、SA 、ACC 信号途径。

细菌性枯萎病病原菌侵染木薯叶片12 h 后,MeLHCB4的表达量显著提高,表明MeLHCB4参与了木薯对病原菌的响应过程。

关键词:木薯;叶绿素结合蛋白;MeLHCB4;基因克隆;基因表达 中图分类号:S533 文献标识码:ACloning and Expression Analysis of MeLHCB4 from CassavaDING Kaixuan 1,2, ZHENG Wanru 1,2, LI Linlin 1,2, PAN Yueyun 1,2, ZHANG Yindong 1,2, GENG Mengting 1,2*, CHEN Yinhua 1,21. College of Tropical Crops, Hainan University, Haikou, Hainan 570228, China;2. Hainan Key Laboratory for Sustainable Utiliza-tion of Tropical Bioresources, Haikou, Hainan 570228, ChinaAbstract: In this study, the MeLHCB4 coding region of cassava chlorophyll a-binding b binding protein gene was cloned by the RT-PCR technique. The structure of the gene and the physical and chemical properties of the protein encoded by the gene were analyzed by bioinformatics, and the LHCB4 amino acid sequences of different species were compared and the evolutionary tree was constructed. The results showed that the CDs sequence of cassava MeLHCB4 was 858 BP, encoding 285 amino acids, the theoretical molecular weight of the protein was about 30.9 kDa, and the theoretical isoelectric point was 5.47. The protein was a stable hydrophilic protein, and it was predicted that the protein might be located in the nucleus and cytoplasm. The expression pattern of MeLHCB4 was detected by real-time fluorescence quantitative PCR. It was found that MeLHCB4 was mainly expressed in the leaves and stems of cassava, and was in-duced by hormones such as JA, SA and ACC, which was speculated to be involved in JA, SA, ACC signal pathway. Af-ter 12 hours of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis infecting cassava leaves, the expression of MeLHCB4 increased significantly, indicating that MeLHCB4 was involved in the response process of cassava to pathogens. Keywords: Manihot esculenta ; chlorophyll binding protein; MeLHCB4; gene cloning; gene expression DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2021.10.009捕光色素蛋白复合体主要由色素分子和其结合的叶绿素a/b 结合蛋白组成[1-2]。

小鼠肝癌与肝正常细胞系ST3Gal和ST6Gal家族mRNA表达差异研究

小鼠肝癌与肝正常细胞系ST3Gal和ST6Gal家族mRNA表达差异研究

小鼠肝癌与肝正常细胞系ST3Gal和ST6Gal家族mRNA表达差异研究马汝海;王冬青;潘忠诚;王天骄;何群;赵雨杰【摘要】To investigate the different expression of sialytransferase between liver cancer cell line Hepal-6 and normal cell line BNL CL.2,the mRNAs of ST3Gal family 6 members and ST6Gal family 2 members were detected by RT-PCR.The sialic acid levels on cell membrane surface were analyzed by lectin pared with normal cell line,BNL CL.2,ST3Gal Ⅰ ,ST3Gal Ⅳ,ST3Gal Ⅳ were identified highly expressed,ST3Gal Ⅴ was lowly expressed,ST6Gal Ⅰ was no t detected and there was no statistical differencebetween two cell lines in ST6Gal Ⅱ.The results indicate thatST3Gal Ⅰ ,ST3Gal IV,ST3Gal V,ST3Gal Ⅳ may play roles in liver cancer formation and ST3Gal Ⅰ ,ST3Gal Ⅳ,ST3Gal Ⅳ are responsible for the increased level of α 2-3 sialic acid on liver cancer cell membrane surface,ST6Gal family members have no correlation with the increased level of α 2-6 sialic acid on liver cancer cell surface.%探讨肝癌细胞系Hepa1-6与肝正常细胞系BNL CL.2唾液酸糖基转移酶ST3Gal和ST6Gal家族mRNA表达的差异以及与细胞膜唾液酸含量的关系,采用RT-PCR方法检测ST3Gal唾液酸转移酶家族6个成员以及ST6Gal唾液酸转移酶家族2个成员mRNA表达差异,用凝集素芯片检测细胞膜表面唾液酸表达情况,结果显示:与正常细胞系BNL CL.2相比,hepa1-6细胞内唾液酸转移酶ST3Gal Ⅰ、ST3GalⅣ、ST3GalⅥ呈现高表达,ST3Gal V低表达,ST3GalⅡ、ST3GalⅢ表达无显著性差异,两细胞系内均为检测出ST6GalⅠ表达,ST6GalⅡ表达无显著差异;hepa1-6细胞膜α2-3和α2-6连接唾液酸含量均显著增加;提示ST3Gal Ⅰ、ST3GalⅣ、ST3Gal V、ST3GalⅥ可能与肝癌发生过程相关,ST3Gal Ⅰ、ST3GalⅣ、ST3GalⅥ可能与肝癌细胞膜α2-3唾液酸含量增加相关,ST6Gal家族对细胞膜α2-6连接唾液酸含量增加无贡献.【期刊名称】《生命科学研究》【年(卷),期】2011(015)004【总页数】5页(P323-327)【关键词】唾液酸糖基转移酶;肝癌;细胞膜;糖基化【作者】马汝海;王冬青;潘忠诚;王天骄;何群;赵雨杰【作者单位】中国医科大学基础医学院化学教研室;中国医科大学基础医学院教育部细胞生物学重点实验室生物芯片中心,中国辽宁沈阳110001;中国医科大学基础医学院教育部细胞生物学重点实验室生物芯片中心,中国辽宁沈阳110001;中国医科大学基础医学院教育部细胞生物学重点实验室生物芯片中心,中国辽宁沈阳110001;中国医科大学基础医学院教育部细胞生物学重点实验室生物芯片中心,中国辽宁沈阳110001;中国医科大学基础医学院教育部细胞生物学重点实验室生物芯片中心,中国辽宁沈阳110001【正文语种】中文【中图分类】R392.12糖链及其复合物不仅参与生命活动的基本生理生化过程,而且在疾病的发生发展中发挥着重要作用[1],糖链合成是在糖基受体、供体和糖基转移酶共同作用下完成的,由基因编码糖基转移酶,后者催化糖链合成.糖基转移酶均有严格的底物专一性,保证了糖链中糖基的特定顺序,糖基转移酶表达差异将直接导致糖链结构的变化,从糖基转移酶入手可以从本质上阐明糖链在肿瘤发生过程中的变化规律及调控作用.肿瘤细胞膜表面唾液酸化水平的改变与肿瘤发生、发展及侵袭、转移之间有密切关系[2],目前已经发现的唾液酸转移酶按其底物特异性和组织分布分为4个家族(ST3Gal、ST6Gal、ST6Gal NAc和ST8Sia)共20个成员.ST3Gal家族为α2,3-唾液酸转移酶,催化唾液酸与半乳糖残基连接的反应;ST6Gal和ST6Gal NAc 为α2,6-唾液酸转移酶,催化唾液酸与末端和亚末端半乳糖、乙酰半乳糖的连接反应; ST8Sia家族为α2,8-唾液酸转移酶,催化将一个或者多个唾液酸残基转移到末端唾液酸残基上的反应[3,4].肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是一种常见的恶性肿瘤,有关肝癌的发病机制目前尚不清楚.目前研究表明,在肝癌发生发展过程中细胞内糖基转移酶表达及活性发生改变[4~7],糖基转移酶是如何参与细胞癌变过程的机理目前尚不清楚.我们前期研究发现:肝发生恶性转变过程中细胞膜糖链发生变化,细胞膜唾液酸含量显著增加[8].本实验对小鼠肝癌细胞系hepa1-6与肝正常细胞系BNL CL.2细胞膜表面唾液酸表达情况进行检测,选取了与此相关的ST3Gal、ST6Gal两个唾液酸转移酶家族共8个成员的 mRNA表达进行检测,分析其表达差异,并与细胞膜唾液酸糖链表达差异进行比较分析,分析肝癌发生过程中唾液酸糖基转移酶表达差异以及与细胞膜唾液酸表达的关系,为探讨糖基转移酶在肝癌的发生过程中可能参与的机制提供理论依据.凝集素(Vector laboratories Inc Burlingama CA),3-氨丙基三甲氧基硅烷、戊二醛、酪蛋白(美国Sigma公司),小鼠肝癌细胞系 Hepa 1-6和小鼠胚胎肝细胞系BNL CL.2(上海中科院细胞库),吖啶橙(赛驰生物科技公司),PCR引物由Takara公司合成.CO2细胞培养箱(力新仪器(上海)有限公司),生物芯片点样仪(MGⅡ600,BioRobiotics Ltd, England),激光扫描仪(Gene TACTMLS IV,Ge nomic Solutions A),低温离心机(Sigma,USA),聚丙烯酰胺电泳仪(北京百晶生物技术有限公司).1.2.1 细胞培养Hepa 1-6小鼠肝癌细胞和BNL CL.2小鼠胚胎肝细胞培养于RPMI 1640培养液(含10%胎牛血清、100 mg/L链霉素,100 U/mL青霉素)中,培养环境为37℃培养箱,饱和湿度,5%CO2,0.25%胰-0.02%EDTA消化传代细胞.1.2.2 凝集素芯片检测细胞膜唾液酸类型糖链表达1.2.2.1凝集素芯片的制备制备方法如文献[8]所述.1.2.2.2细胞系细胞提取及其荧光标记取对数生长期的细胞,倾去培养液,加入0.25%胶原酶Ⅳ (D-hank’s),37℃消化1 h,每隔10 min吹打一次.1 000 g/min离心5 min,收集沉淀.PBS洗涤2次,重悬,加入5 μL吖啶橙(100 mg/L溶于PBS)染色5 min,1 000 g/min离心5 min,收集沉淀,PBS洗涤2次,制成细胞悬液(1~10)×105/mL)备用.1.2.2.3细胞膜唾液酸表达检测取出已经制备好的凝集素芯片,于37℃湿盒内水化15 min,0.5%酪蛋白溶液(PB,0.01 mol/L, pH=7.2)封闭5 min,PB缓冲液(0.01 mol/L,pH= 7.2)洗涤5 min,将荧光标记的细胞悬液滴加到芯片上,37℃孵育40 min,PBS缓冲液(pH 7.2)洗涤5 min,3%戊二醛(PBS,pH 7.2)固定 10 min, GeneTACTMLSIV激光扫描仪扫描,检测凝集素芯片上各位点荧光信号强度,观察细胞膜唾液酸变化情况.1.2.3 唾液酸糖基转移酶mRNA引物设计及其RT-PCR检测在Genbank数据库内检索小鼠唾液酸糖基转移酶ST3Gal家族6个成员和ST6Gal家族2个成员mRNA序列,采用primer-Blast软件设计RT PCR引物,见表1.提取细胞内总RNA,采用PrimeScriptTMOne Step RT-PCR Kit(Takara),试剂盒对小鼠BNL细胞、Hepa1-6细胞系进行检测,同时扩增管家基因β-actin 作为对照,8%聚丙烯凝胶电泳,硝酸银染色.用BandScan凝胶图像分析软件检测不同样品PCR产物特异性条带的灰度值,各目的基因的灰度与管家基因灰度值的比值用于比较肝癌组与正常组目的基因表达量的差异,采用统计软件SPSS 11.5进行分析,所有数据以±s表示,差异显著性检验采用t检验,P<0.05视为有统计学意义.凝集素芯片上固定了5种亲和唾液酸的凝集素AAL、SNA、MAH、WGA和阴性对照BSA,芯片荧光扫描结果见图1,凝集素亲和的特异性见表2.与肝正常细胞系BNL CL.2相比,肝癌细胞系Hepa1-6 4种凝集素都呈阳性,BNL CL.2只有AAL呈现微弱的阳性,对比凝集素亲和唾液酸的特异性,Hepa1-6细胞膜上Siaα 2-3Galβ1-3[Siaα2-6GalNAc]α-R、Siaα 2-6Gal/GalNAc和多分支类型唾液酸含量增高.根据肝癌细胞膜所增加的唾液酸类型,我们对催化其反应的唾液酸转移酶ST3Gal 家族6个成员ST3GalⅠ~Ⅵ,ST6GalⅠ~ⅡmRNA表达情况进行了检测,结果显示:ST3Gal转移酶家族:小鼠肝癌细胞系Hepa1-6和肝正常细胞系BNL CL.2相比,ST3GalⅠ、ST3GalⅣ、ST3GalⅥ高表达(P<0.05);ST3GalⅢ在Hepa1-6和BNL CL.2中表达无显著性差异;ST3GalⅤ在Hepa1-6中呈现低表达.ST6Gal转移酶家族:在Hepa1-6中均未检测到ST6GalⅠ和ST6GalⅡ mRNA表达;均检测到ST6GalⅡmRNA表达,二者无显著性差异(图2).糖复合物参与基本的生命过程,如受精、胚胎发生、发育、分化、组织器官形态和系统恒态的维持;在疾病的发生和发展中,如炎症、病原体感染、自身免疫疾病、老化、癌变及转移等过程中都有糖链的参与.机体中糖复合物是指含糖链的生物大分子,包括糖蛋白、糖脂、蛋白多糖和杂多糖.唾液酸(SA)广泛存在于各种生物的组织中,是细胞膜糖蛋白、糖脂的重要结构和功能成份.唾液酸化寡糖的生物合成是在一系列唾液酸转移酶催化完成的,唾液酸转移酶催化唾液酸单糖添加到糖蛋白或糖脂寡糖链末端半乳糖(Gal)、N-乙酰半乳糖胺(N-Gal NAc)或糖链上的其它唾液酸上、并以α-2,3、α-2,6-或α-2,8-方式连接.α-2,3-唾液酸糖基转移酶(beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase,ST3)是唾液酸转移酶(sialyltransferases, STs)大家族下4个亚家族成员之一,在糖基修饰反应中催化CMP-Neu5Ac中的乙酰神经氨酸通过2、3糖苷键转移到糖蛋白和糖脂的末端半乳糖残基的反应.该酶有6个亚型:ST3GalⅠ、ST3GalⅡ、ST3GalⅢ、ST3GalⅣ、ST3GalⅤ和ST3GalⅥ[1,2],ST3GalⅢ、ST3GalⅣ和ST3GalⅥ,可能参与sLex and sLea抗原的生物合成反应.我们应用本实验室建立的凝集素芯片对细胞膜唾液酸表达含量进行检测,该芯片将凝集素固定在芯片上,将待检测细胞进行荧光标记,利用凝集素对糖链的特异亲和性捕获细胞,扫描捕获到细胞的凝集素位点的荧光信号,根据捕获到细胞的凝集素的糖链亲和性判断细胞膜上的糖链类型.结果显示:正常细胞系相比,小鼠肝癌细胞系Hepa1-6细胞膜上Siaα 2-3Galβ1-3[Siaα2-6Gal NAc]α-R和Siaα 2-6Gal/Gal NAc类型唾液酸含量增高.针对上述情况我们对催化其反应的唾液酸ST3Gal和ST6Gal家族mRNA进行检测,结果显示肝癌细胞系ST3GalⅠ、ST3GalⅣ、ST3GalⅥ高表达,ST3GalⅤ低表达,ST6Gal家族表达无显著性差异.ST3GalⅠ催化O-连接聚糖末端半乳糖链的α2,3连接的唾液酸反应,有研究表明ST3GalⅠ在多种肿瘤细胞中高表达,能够促进乳腺癌、膀胱癌的形成[9],本实验结果显示小鼠肝癌细胞中ST3GalⅠ高表达,与相关文献报道一致.目前关于ST3GalⅡ与肿瘤相关性的报道很少,Saito S报道ST3GalⅡ与肾癌相关[10];ST3GalⅢ能够调节胰腺癌细胞的运动和黏附,增强转移潜能 [11],本实验中ST3GalⅡ和ST3GalⅢ在小鼠正常肝细胞系与肝癌细胞系中表达无显著差异.有关ST3GalⅤ与肝癌以及肿瘤的相关性未见报道,我们实验结果中肝癌细胞系Hepa1-6 ST3GalⅤ呈现低表达的趋势.ST3GalⅤ是GM3的合成酶,GM3属于糖鞘脂,参与诱导细胞分化、调整细胞增殖、维持细胞形态、信号传导和细胞黏附的过程[12],小鼠肝癌细胞系中ST3GalⅤ呈现低表达趋势,可能与通过调控细胞膜GM3含量参与肝癌变机制.ST3GalⅥ在卵巢恶性肿瘤中起重要作用,ST3GalⅣ、ST3GalⅥ参与对Galβ1-4GlcNac-R类型糖链进行唾液酸修饰形成NeuA-cα2-3Galβ1-4GlcNac-R的反应,有文献报道其表达与肿瘤相关[13,14],本实验检测到肝癌细胞系ST3GalⅣ、ST3GalⅥ高表达,提示了ST3GalⅣ和ST3GalⅥ在多种肿瘤中可能协同作用.有研究证明ST6Gal系列唾液酸转移酶在肿瘤组织,特别是转移组织中呈高表达;α-2,6-唾液酸转移酶的表达受ras-基因的调控,由于在多种肿瘤中均检测出了ras癌基因的异常,α-2,6-唾液酸转移酶也逐渐被认为是一种肿瘤标志物[15], Gong M等发现,酒精肝患者ST6GalⅠ基因表达下降[16].本实验中ST6GalⅠ基因在癌和正常肝细胞中没有检测到mRNA表达;目前未见有关S T6GalⅡ与肿瘤相关性的报道,我们研究结果显示ST6GalⅡ在肝癌和肝正常细胞中表达无显著性差异.ST3Gal转移酶家族催化唾液酸与末端半乳糖残基α-2,3的连接反应,肝癌细胞系中ST3GalⅠ、ST3GalⅣ、ST3GalⅥ高表达,提示ST3GalⅠ、ST3GalⅣ、ST3GalⅥ与肝癌细胞膜Siaα 2-3Galβ1-3α-R类型糖链增加可能相关;凝集素MAH与SNA 都亲和Siaα2-6GalNAcα-R类型糖链,SNA还亲和Siaα 2-6Gal类型糖链,这两种凝集素对肝癌细胞膜检测结果都呈现阳性结果.唾液酸转移酶另一个家族ST6GalNAc催化Siaα2-6Gal NAcα-R类型糖链的合成,Marcos等报道肿瘤细胞ST6Gal NAcⅠ和Ⅱ与癌细胞相关的sialyl-Tn抗原表达相关[17].ST6Gal催化Siaα 2-6Gal的合成,我们发现肝癌细胞系与正常细胞系中ST6Gal表达无显著性差异,提示该家族与细胞膜2,6连接的唾液酸表达变化无关,细胞膜2,6连接的唾液酸可能以Siaα2-6Gal NAcα-R为主.唾液酸转移酶的结构与功能的关系、酶催化底物在细胞功能中的作用现在还没有研究清楚,研究肝癌与肝正常细胞唾液酸各家族表达差异以及分析其表达与细胞膜唾液酸表达之间的关系,以期为探讨肝癌发生机制提供了一些理论基础.【相关文献】[1] DENG W,LI R,LADISCH S.Influence of cellular ganglioside depletion on tumor formation[J].Journal of the National Cancer Institute,2000,92(11):912-917.[2] LIN S,KEMMNER W,GRIGULL S,et al.Cell surface alpha 2,6 sialylation affects adhesion of breast carcinoma cells[J]. 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[6] WEI Y,LIU D,ZHOU F,et al.Identification of beta-1,4-galactosyltransferase I as a target gene of HBx-induced cell cycle progression of hepatoma cell[J].Journal of Hepatology, 2008,49(6):1029-1037.[7] MATHIEU S,GEROLAMI R,LUIS J,et al.Introducing alpha (1,2)-linked fucose into hepatocarcinoma cells inhibits vasculogenesis and tumor growth[J].International Journal of Cancer, 2007,121(8):1680-1689.[8] 何群,李春辉,潘忠诚,等.应用凝集素芯片检测肝癌膜表面糖链变化[J].生物化学与生物物理进展(HE Qun,LI Chunhui,PAN Zhong-cheng,et al.Glycoprofiling investigation of hepatocellular carcinoma cell surface with lectin microarray[J]. Progress in Biochemistry and Biophysics),2010,37(3):269-277.[9] PICCO G,JULIEN S,BROCKHAUSEN I,et al.Over-expression of ST3Gal I promotes mammary tumorigenesis[J].Glycobiology,2010,20(10):1241-1250.[10]SAITO S,AOKI H,ITO A,et al.Human alpha2,3-sialyltransferase (ST3GalⅡ)is a stage-specific embryonic antigen-4 syn-thase[J].The Journal of Biological Chemstry,2003,278 (29):26474-26479.[11]PÉREZ-GARAY M,ARTETA B,PAGÈS L,et al.alpha2,3-sialyltransferase ST3GalⅢ modulates pancreatic cancer cell motility and adhesion in vitro and enhances its metastatic potential in vivo[J].PLoS One,2010,5(9):e12524.[12]CHUNG T W,KIM S J,CHOI H J,et al.Ganglioside GM3 inhibits VEGF/VEGFR-2-mediatedangiogenesis:Direct interaction of GM3 with VEGFR-2[J].Glycobiology,2009,19(3):229-239.[13]SAITO S,YAMASHITA S,ENDOH M,et al.Clinical significance of ST3Gal IV expression in human renal cell carcinoma [J].Oncology Reports,2002,9(6):1251-1255.[14]SOUADY J,HÜLSEWIG M,DISTLER U,et al.Differences in CD75s-and iso-CD75s-ganglioside content and altered mRNA expression of sialyltransferases ST6Gal1 andST3Gal6 in human hepatocellular carcinomas and nontumoral liver tissues[J]. Glycobiology,2011,21(5):584-594.[15]KOREKANE H,MATSUMOTO A,OTA F,et al.Involvement of ST6GalⅠ in the biosynthesis of a unique human colon cancer biomarker candidate,alpha2,6-sialylated blood group type 2H(ST2H)antigen[J].Journal of Biochemstry,2010,148 (3):359-370.[16]GONG M,GARIGE M,HIRSCH K,et al.Liver Galbeta1, 4GlcNAc alpha2,6-sialyltransferase is down-regulated in human alcoholics:possible cause for the appearance of asialoconjugates[J].Metabolism,2007,56(9):1241-1247.[17]MARCOS N T,PINHO S,GRANDELA C,et al.Role of the human ST6GalNAc-I andST6GalNAc-II in the synthesis of the cancer-associated sialyl-Tn antigen[J].Frontiers in Bioscience, 2011,1(3):1443-1455.。

糖化血红蛋白(HbA1c)测定试剂盒(酶法)产品技术要求mairui

糖化血红蛋白(HbA1c)测定试剂盒(酶法)产品技术要求mairui

1 性能指标
2.1外观
试剂应为清澈透明的液体,无沉淀、悬浮物和絮状物。

样本处理液应为澄清透明的液体,无沉淀、悬浮物和絮状物。

校准品应为冻干粉。

2.2净含量
液体试剂的净含量应不少于标示值。

2.3线性范围
试剂盒在3%~16%范围内:
a)线性相关系数r 应不小于0.9900;
b)当样本结果不大于8%时,线性绝对偏差应不大于±0.8%;当样本结果大于8%时,线性相对偏差应不大于±10.0%。

2.4测量精密度
2.4.1重复性
变异系数:CV 应不大于 5.0%。

2.4.2批间差
相对偏差:R 应不大于10.0%。

2.5准确度
测定校准品,测定结果与靶值的相对偏差应不大于±10.0%。

2.6分析特异性
葡萄糖浓度在1000 mg/dL 内、抗坏血酸浓度在30 mg/dL 内、内源性酯浓度在2000 mg/dL 内、胆红素浓度在50 mg/dL 内,对试剂检测结果的偏差影响应在±10%以内。

2.7校准品均一性
试剂盒校准品的均一性:CV 应不大于 5.0%。

2.8生物安全性
校准品的HBsAg、HIV抗体、HCV抗体、梅毒螺旋体TP抗体检测应为阴性。

1。

RNA干扰OGT_OGA对hela细胞糖基化作用的影响

RNA干扰OGT_OGA对hela细胞糖基化作用的影响

RNA干扰OGT_OGA对hela细胞糖基化作用的影响RNA 干扰 OGT/OGA 对 hela 细胞糖基化作用的影响张越1,马纪2,孙奋勇2(1. 暨南大学生物工程研究所,上海 200072; 52. 上海市第十人民医院,上海 200072) 摘要 : 目的 : 通过 RNA 干扰技术,敲减 O 连接的 N- 乙酰葡萄糖胺 ( O-linked N-acetylglucosamine,O-GlcNAc)修饰中起重要作用的 O -连接 N-乙酰氨基葡萄糖转移酶(OGT)或 O-连接 N-乙酰氨基葡萄糖苷酶(OGA)的表达,研究 OGT 或 OGA 对hela 细胞总蛋白糖基化作用的影响。

方法:设计特异性的针对 OGT 和 OGA 基因的 siRNA,瞬时转染到 10hela 细胞;Western blot(WB)和荧光定量 PCR 方法检测 siRNA 的干扰效率;WB 检测敲减 OGT 和 OGA 后 hela 细胞总蛋白的糖基化水平;采用 OGA 抑制剂 PUGNAc 处理 hela 细胞检测其糖基化水平。

结果:荧光定量 PCR 结果显示si-OGT 干扰效率为 72%,si-OGA 干扰效率为 79%,WB 结果显示 OGT 及 OGA 均能被明显敲减。

并且敲减 OGT 之后,hela 细胞总蛋白糖基化水平下降,而敲减 OGA 后,hela 细胞总蛋白糖基化水平明显增加。

用 15PUGNAc 处理 hela 细胞后发现总蛋白糖基化水平减少。

结论:敲减 OGT 或OGA 的表达能够显著影响 hela 细胞总蛋白的糖基化修饰水平,为后续 OGT 或OGA 在糖基化修饰中作用的研究提供基础。

关键词:RNA 干扰;糖基化;hela 细胞中图分类号:,,,, 20The alteration of glycosylation level in hela cells wasinfluenced by siRNAZhangYue1, MaJi2, SunFenyong2(1. Bioengineering Institute of Jinan University, ShangHai 200072;252. Shanghai Tenth People's Hospital, ShangHai 200072) Abstract: Objective:To investigate the effect of OGT or OGA expression inhibitedby RNAi on the alteration of glycosylation level in hela cells. Method: The siRNAs targeting OGT or OGA gene were designed and chemically synthesized. The siOGT and siOGA were transfected into hela cells via lipofectamine 2000. The efficacy of RNA interference was detected by RT-PCR and WB. 30The level of proteins glycosylation were detected by Western blotafter the siRNA transfected and PUGNAc treatment hela cells for 48 h. Results: Si-OGT or siOGA could effectively regulate the expression of OGT or OGA gene compared with si-NC group.The level of glycosylation was significantly downregulated after inhibition of OGT gene expressionby si-OGT and theglycosylation was upregulated following the inhibition of OGA gene expression by si-OGA or 35PUGNAc treatment. Conclusion: The alteration of glycosylation level in hela cells was influenced by si-OGT or si-OGA,and provide further support for the rearch of glycosylation. Keywords: O-GlcNAc; RNA interference; hela cells0 引言 40蛋白质的 O 连接的 N-乙酰葡萄糖胺(O-linked N-acetylglucosamine,O-GlcNAc) 修饰作用是发生在细胞浆与细胞核内的、仅单个 N-乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc) 通过O-糖苷键连接到丝氨酸或苏氨酸(Ser/Thr) 羟基上的一种广泛存在的动态的蛋白质翻译后修饰现象[1][2]。

TAKARA糖基化分析试剂盒

TAKARA糖基化分析试剂盒
用 1.5 ml Microtube 收集(分为 2 管,每管 1 ml)。最后用空气将 Cellulose Cartrige Colum 内 的溶液全部吹出。 c) 洗脱液用真空离心等方法干燥后,用 100 μl 左右的灭菌蒸馏水溶解,经适当稀释后进行 HPLC 分析。
注:Cellulose Cartridge Column 不能重复使用。
使用本试剂盒不需要特殊的pa化设备操作简单回收率对糖链进行pa化标记反应时首先是糖链的还原末端与2氨基吡啶反应形成西夫碱schiffbase西夫碱在还原剂的作用下生成稳定的糖链氨基吡啶衍生物pa糖链pa糖链是一种稳定的荧光诱导体检测灵敏度高
TaKaRa Code:D4480
Pyridylamination Manual Kit (20 次量)
④ Cellulose Cartrige Column 的洗净。 注射器中吸入 10 ml*1 的试剂 1,安装到 Adaptor 上,以 1 滴/秒左右的速度推出液体,清洗 Cellulose Cartrige Column*2。整个操作过程要始终保持柱子中有液体。最后注射器内吸入 2 ml 左右的空气, 把 Cellulose Cartrige Column 内的液体吹出。
向标记反应后的 PA 化糖链样品 40 μl 中,加入 1 ml 的试剂 1,充分振荡混匀。此样品溶液一定不 要进行离心操作。 注 1:样品中有可能产生蛋白质等的沉淀,请一定不要进行离心操作,保持悬浊液的状态直接上样。 注 2:充分振荡后,样品溶液仍然明显分为两层时,可用试剂 1 稀释,有可能均一化。如果试剂 1 的
1. 使用本试剂盒,按照上述操作方法,对 Biantennary Sugar Chain 进行 PA 化后充分干燥标记物。 2. 用 100 μl 灭菌蒸馏水溶解标记物,取 5 μl 加入至 5 μl 的内部标准糖链 PA-Sugar Chain 003

takara genome walking kit 原理

takara genome walking kit 原理

takara genome walking kit 原理Takara Genome Walking Kit的原理
Takara Genome Walking Kit是一种用于基因组步移分析的工具。

该套件利用特
定引物和PCR技术,能够快速准确地扩增出目标基因组中的未知序列,并揭示目
标基因周围的DNA序列。

该套件的原理基于PCR扩增技术。

在步移分析过程中,首先需要使用已知的
基因组序列设计出特定引物,其中一个引物与目标基因组中的已知序列匹配,而另一个引物与翻译到逆向的未知序列局部匹配。

这两个引物将用于PCR反应的两个
不同阶段。

第一阶段,将已知引物与目标DNA混合,在进行PCR反应时,引物与目标DNA序列互相结合,扩增出特定长度的产物。

这个扩增产物是已知序列末端的延伸。

第二阶段,使用另一组引物与第一阶段扩增产物进行二次PCR反应。

这些引
物设计为能与第一阶段产物的延伸序列匹配,从而在扩增中获取未知序列信息。

通过重复这两个阶段的PCR反应,可以逐步扩增出未知序列周围的DNA片段。

这种步进的扩增策略使得当目标基因组中存在长片段未知序列时,也能有效地获取到这些序列,并进一步的分析和研究。

总结起来,Takara Genome Walking Kit利用特定引物的PCR扩增技术,能够通过逐渐扩增已知序列的延伸,并最终获得未知序列。

这一原理使得研究人员能够深入探索基因组中的未知区域,进一步了解基因的功能和调控机制。

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用 1.5 ml Microtube 收集(分为 2 管,每管 1 ml)。最后用空气将 Cellulose Cartrige Colum 内 的溶液全部吹出。 c) 洗脱液用真空离心等方法干燥后,用 100 μl 左右的灭菌蒸馏水溶解,经适当稀释后进行 HPLC 分析。
注:Cellulose Cartridge Column 不能重复使用。
TaKaRa Code:D4480
Pyridylamination Manual Kit (20 次量)
说明书
宝生物工程(大连)有限公司
目录
内容
●制品说明 ●制品内容 ●保 存 ●PA 化反应的操作方法 ●PA 化糖链的纯化方法 ●对照实验例 ●参考文献
页码
1 1 2 2 3 4 5
●制品说明
本试剂盒是利用 2-Aminopyridine(2-氨基吡啶, 2-AP)对糖链进行荧光标记(PA 化)的试剂盒。使用 本试剂盒不需要特殊的 PA 化设备,操作简单,回收率 高。 对糖链进行 PA 化标记反应时,首先是糖链的还原末端 与 2-氨基吡啶反应形成西夫碱(Schiff Base),西夫碱 在还原剂的作用下生成稳定的糖链氨基吡啶衍生物 (PA-糖链),PA-糖链是一种稳定的荧光诱导体,检测 灵敏度高。(原理见图 1)。 对糖链进行 PA 化标记后,使用试剂盒中的 Cellulose Cartridge Column 进行层析,能够高效除去反应后的 残存试剂,回收 PA-糖链。使用这种方法要比使用糖质 PA 化标记专用设备(如 PALSTATION 或 GlycoTAG 等通过蒸发除去反应后的残存试剂)的回收效果好。 本试剂盒标记的 PA-糖链具有荧光性,可以通过 HPLC 对糖链进行高灵敏度的分析。
④ Cellulose Cartrige Column 的洗净。 注射器中吸入 10 ml*1 的试剂 1,安装到 Adaptor 上,以 1 滴/秒左右的速度推出液体,清洗 Cellulose Cartrige Column*2。整个操作过程要始终保持柱子中有液体。最后注射器内吸入 2 ml 左右的空气, 把 Cellulose Cartrige Column 内的液体吹出。
注 2:配制均一的偶联试剂,在常温以下时有时能发生凝固,此时需要加热融化。由于粘度较大,适 当搅拌有助于融解。
③ 还原试剂的配制。 称量 Borane-dimethylamine Complex 20 mg 装入 1.5 ml 的 Microtube 中,加入 100 μl 的 Acetic Acid,充分振荡溶解。
向标记反应后的 PA 化糖链样品 40 μl 中,加入 1 ml 的试剂 1,充分振荡混匀。此样品要进行离心操作,保持悬浊液的状态直接上样。 注 2:充分振荡后,样品溶液仍然明显分为两层时,可用试剂 1 稀释,有可能均一化。如果试剂 1 的
照糖链差别较大时,建议首先进行预实验,以寻找最适合的反应条件。
* 本试剂盒中附带的对照糖链 Biantennary Sugar Chain 的结构
●制品内容(20 次量)
本试剂盒分为-20℃保存和常温保存两部分。 【-20℃保存部分】
2-Aminopyridine Borane-dimethylamine Complex Biantennary Sugar Chain(500 pmol/50 μl) PA-Biantennary Sugar Chain(100 pmol/100 μl)
注 2:本还原试剂应现用现配,配制后请于当天使用。
2. PA 化操作方法。 ① 将糖链样品(50 pmol~50 nmol)装入带有螺旋盖的 1.5 ml Microtube 中,用真空离心或冻结干
燥等方法将样品充分干燥。
注:糖链样品应尽量除去盐类、蛋白质、脂质等杂质,在 PA 化标记反应前可以使用 Cellulose Cartridge Glycan Preparation Kit(TaKaRa Code:D4403)或者凝胶过滤柱层析等方法纯 化。
Cellulose Cartridge Column。 c) 重复上述 b)操作 2 次。 d) 注射器内吸入空气,将 Cellulose Cartridge Column 中的水完全吹尽。 e) 注射器内吸入 10 ml 的试剂 2,安装到 Adaptor 上,以 2~5 滴/秒的速度推出液体,清洗 Cellulose
*1 上样的样品量过多时,可按样品量+洗净液(试剂 1)量 = 12 ml 的比例调整洗净液量。 *2 洗出液先收集保留,待分析结果出来后再废弃。
⑤ 糖链的洗脱。 a) 取 2 ml 的试剂 2 加入至上述④的未安装有 Adaptor 的 Cellulose Cartrige Column 内。 b) 按顺序安装上 Adaptor、吸入空气的注射器,慢慢推进注射器(以出液速度 1 滴/秒为宜),洗脱液
加量达到 5 ml 仍分为两层时,通常是样品中的杂质原因,特别是盐类含量太高等,有可能导 致样品得不到充分 PA 化标记。此时,我们建议再次干燥,进行凝胶过滤柱层析除盐后,重新 进行 PA 化反应。
③ 上样操作。 a) 样品溶液振荡混匀后,加入至上述①处理的未安装有 Adaptor 的 Cellulose Cartrige Column 内。 b) 按顺序安装上 Adaptor、吸入空气的注射器,慢慢推进注射器(以出液速度 1 滴/秒为宜),最后注
【说 明】
图 1. 糖链的 PA 化反应过程
PA 化的反应效率和利用 Cellulose Cartridge Column 回收标记的 PA-糖链的回收率,受糖链样品本身结
构的影响。本试剂盒最适于对具有两个分支的复合型糖链 N-Glycan(试剂盒中附带的对照糖链 Biantennary
Sugar Chain*)进行标记。用于标记的糖链的结构,特别是糖链还原末端残基的种类和糖链的分子量与对
300 mg×2 瓶 100 mg×2 瓶
50 μl 100 μl
【常温保存部分】
Cellulose Cartridge Column(0.5 ml) Adaptor Syringe(10 ml)
20 个 1个 3个
-1-
【本试剂盒以外需要自备试剂】 ① n-Butanol ② Ethanol ③ Acetic Acid ④ Ammonium Bicarbonate ⑤ 灭菌蒸馏水
(分析纯以上) (分析纯以上) (分析纯以上) 75 mM 水溶液
约 500 ml 约 500 ml 约 5 ml 约 500 ml
●保 存
-20℃保存部分: -20℃保存。 常温保存部分: 常温保存。
●PA 化反应的操作方法
1. 仪器的准备和反应试剂的配制。 ① 将恒温箱或水浴设定至 80℃(也可以使用加热块,但其控温稳定性不太好,往往得不到良好的实验
●对照实验例
将试剂盒中的试剂 Biantennary Sugar Chain 10 μl(100 pmol),按照上述操作步骤,进行 PA 化标 记反应及纯化。将得到的 PA 化糖链,与试剂 PA-Biantennary Sugar Chain 同时进行 HPLC 分析比较, 确认 PA 化收率。简单方法如下:
意不要让 Cellulose Cartrige Column 干燥,让微量溶液保留于充填剂的上端。 注:溶出液先收集保留,待分析结果出来后再废弃。
c) 用 1 ml 的试剂 1 清洗样品管,将清洗液同样加入 Cellulose Cartrige Column 内,然后按照 b)的 方法进行操作。
-3-
50000 40000 30000
A B
Fliorescence
20000
10000
0
0
20
40
60
Time (min)
A:PA 化后的 Biantennary Sugar Chain(本实验样品)。 B:内部标准品 PA-Sugar Chain 003(TaKaRa Code: D4103)*。
* 本试剂盒中不备有,需要另行购买。
注 1:由于 Borane-dimethylamine Complex 极易吸潮,称量时应首先将制品瓶于室温下复温,然后 在湿度较低的地方称量。称量操作要迅速,可按实际使用量称量,再按比例加入 Acetic Acid。 称量后的 Borane-dimethylamine Complex 瓶要盖严,然后用封口膜等封严。
-4-
HPLC 条件: Column:TSKgel Amide-80(4.6×250) (TOSOH Code:01371) Solvent A:500 mM Acetic Acid-Triethylamine(pH7.3)/CH3CN/H2O(10/75/15) Solvent B:500 mM Acetic Acid-Triethylamine(pH7.3)/CH3CN/H2O(10/50/40) Gradient:0~0%B/0~15 min,0~100%B/15~65 min,100~100%B/65~75 min, 0~0%B/75~90 min Flow Rate:1 ml/min Fluorescence Detection:Ex:310 nm,Em:380 nm Column Temperature:40℃
结果)。 ② 偶联试剂的配制。
向装有 300 mg 偶联试剂(2-Aminopyridine)的制品瓶中加入 100 μl 的 Acetic Acid,可在 80℃ 左右加热,并用振荡器充分振荡溶解,配制后的试剂量约为 250 μl。
注 1:用 300 mg 的 2-Aminopyridine 配制的偶联试剂可以做 10 次反应。使用后的剩余试剂请转移至 1.5 ml 的 Microtube 中,于-20℃密封冻结保存,此偶联试剂请于 3 个月内使用。
Cartridge Column。最后注射器内吸入空气,将试剂 2 完全吹出。 f) 注射器内吸入 10 ml 的试剂 1,安装到 Adaptor 上,以 2~5 滴/秒的速度推出液体,清洗 Cellulose
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