第2章 原核生物2

第二章

第二章

微生物分类学第二节

根据国际命名法规为一个纯培养物确定其学名的过程。

Erwinia carotovora subsp. carotovora(Jones 1901) Bergey et al1923

细菌的完整命名：

属名种名“亚种”亚种名前命名人及

时间现命名人及

时间

胡萝卜软腐欧文氏菌胡萝卜软腐亚种

Whittaker

（细菌为主）

KINGDOM MONERA

(prokaryotes)KINGDOM PROTISTA KINGDOM PLANTAE

KINGDOM ANIMALIA KINGDOM FUNGI

Whittaker五界分类系统Woese三域（原界）分类系统

系统发育树(phylogenetic tree): 在研究生物进化和系统分类中，常用类似树状分支的图形来概括各种（类）生物之间的亲缘关系。通过比较生物大分子序列差异的数值构建的系统树称为分子系统树。

16S rDNA（18S rDNA）序列的同源性分

Eukarya 真核

Bacteria 细菌

Archaea 古生菌

Bacteria (细菌)

古生菌

美国黄石公园的间歇泉中漂流的彩色的古生菌

无细胞壁的古生菌

火叶菌属（Pyrolobus ）

已知原核生物中最喜欢热的微生物，能在高于水沸（Halobacterium ）

二、细菌的分类和鉴定原核生物分类单元

细菌学中重要分类单元：细菌分类鉴定的标准

表型特征鉴定：

菌体形态∶大小、形状；

鞭毛的有无及着生位置；

芽孢、荚膜的有无；

根据革兰氏染色反应分为阴性和阳性菌；

对寄主植物的致病性。

加入生化反应板→培养→自动扫描

打印结果

种系发生关系鉴定

基因组DNA 的G+C mol%含量测定

同种细菌DNA 中的碱基对的顺序、数量和比例稳定； 不同细菌G+C 百分比值的变化幅度较大（27-75%）； (G+C)mol%值只能做否定判断；

(G+C)mol%值差别>5，为不同的种；差别>10，为不同的属。

A-腺嘌呤T-胸腺嘧啶G-鸟嘌呤C-胞嘧啶

G+C G+C+A+T

×100%

G+C 百分比值=

核酸杂交技术：DNA ∶DNA 、DNA ∶rRNA

双链DNA 加热解链成为单链；

恢复温度后DNA 单链互补形成稳定的双链

细菌分类学参考文献：

伯杰氏细菌鉴定手册

伯杰氏

伯杰氏细菌

1974

1994

细菌划分为

groups

第二版正在出版中，与第一版差异较大。分类以系统进化框架为基础。

三、植物病原原核生物的主要类群

Genera Pathovar(pv.)（致病变种）

三、植物病原原核生物的主要类群

目前已知的植物病原细菌（属）

Gracilicutes薄壁菌门Firmicutes厚壁菌门Agrobacterium土壤杆菌属 A.tumefacians蔷薇科根癌病Acidovorax食酸菌属 A.avenae燕麦条纹病

Bacillus 芽孢杆菌属 B.megaterium小麦白叶条斑

第二节