标准名称-检验检疫标准管理信息系统
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
ICS
点击此处添加中国标准文献分类号
SN 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准
SN/T XXXXX—XXXX
油菜茎基溃疡病菌检疫鉴定方法
Detection and Identification of Leptosphaeria maculans (Desm)
Ces. & de Not. of colza
点击此处添加与国际标准一致性程度的标识
(征求意见稿)
XXXX-XX-XX发布XXXX-XX-XX实施
前言
本标准按照GB1.1-2009给出的规则起草。
请注意本文件的某些内容可能涉及专利,本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。
本标准由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。
本标准主要起草单位:中华人民共和国湖北出入境检验检疫局,中国检验检疫科学研究院,上海出入境检验检疫局,江苏出入境检验检疫局,华中农业大学等
本标准主要起草人:赵晖,王振华,易建平,吴翠萍,周国梁,曾宪东,李彬,吴品珊,李国庆。
本标准系首次发布的出入境检验检疫行业标准。
油菜茎基溃疡病菌检疫鉴定方法
1 范围
本标准规定了油菜茎基溃疡病菌的检疫鉴定方法。
本标准适用于油菜繁殖用种子和油用种子、种苗、植株等油菜茎基溃疡病菌的检疫鉴定。
2 规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法
3 原理
3.1 分类地位
油菜茎基溃疡病菌(Leptosphaeria maculans (Desm) Ces. & de Not.),属真菌界(Fungi),子囊菌门(Ascomycota),座囊菌纲(Dothideomycetes),格孢腔菌目(Pleosporales),格孢腔菌科(Pleosporaceae),小球腔菌属(Leptosphaeria),无性态为Phoma lingam。
该病菌在世界上的分布参见附录A
该病菌的寄主广泛,主要有芸苔属植物,如油菜、甘蓝、花椰菜等十字花科作物。可造成油菜茎基及根系腐朽,易于折断而死亡。
3.2 鉴定原理
根据油菜茎基溃疡病菌在培养基上生长的菌落、菌丝、分生孢子和分生孢子器形态,以及其在寄主上的为害症状、形态学特征和PCR特异扩增片段作为鉴定依据。
4 仪器设备和用具
4.1 仪器设备
生物显微镜、体视显微镜、高速冷冻离心机、纯水仪、高压灭菌器、PCR仪、凝胶成像系统、电泳系统、实时荧光PCR仪、培养箱、低温冰箱。
4.2 用具
可调微量加样器(2 μL、10μL、20μL、100μL、200μL、1000μL)及其枪头、网筛(孔径2.5 mm 和1.5 mm)、研钵、吸水纸、培养皿、试管、、研钵、离心管(1.5 mL、1.0 mL)、PCR管(0.2 μL)、量筒、烧杯等。
5 试剂和培养基
除另有规定外,所有试剂均为分析纯或生化试剂,实验用水符合GB/T 6682。
5.1 1%次氯酸钠。
5.2DNA提取试剂:DNA提取试剂盒,异丙醇,无水乙醇。
5.3PCR试剂:PCR Buffer (含Tris-HCl,MgCl2),Taq酶,dNTP。
5.4凝胶电泳试剂:琼脂粉,TAE,Loading Buffer,EB。
5.5麦芽琼脂培养基:6 g麦芽提取物,3 g琼脂,200 mL蒸馏水,调整pH至5.2,121℃,15 min灭菌。
5.6 对照菌株:油菜茎基溃疡病菌(Leptosphaeria maculans (Desm) Ces. & de Not.)标准菌株、油菜黑胫病菌(Leptosphaeria biglobosa)。
6 检疫鉴定方法
6.1 取样
6.1.1种子:待检样品混匀,取1 kg用作试验样品,用孔径2.5 mm和1.5 mm的网筛过筛试验样品,筛上物多为豆荚等植株残体,筛下物多为油菜籽碎片或小形种子。取筛上物、筛下物和种子各1 g~2 g 用于PCR初筛。
6.1.2植株:主要检查茎根部和叶部。选取叶片上出现圆形或不规则形,稍凹陷,中部灰白色病斑,部分斑内散生许多小黑点症状的病变部位。植茎则选取不规则形淡褐色斑;或灰白色病斑,稍凹陷,上生黑色小点;或茎基及根系溃疡、枯萎症状的病变部位(参见附录B)。
6.2 PCR初筛
6.2.1 样品DNA提取
取筛上物、筛下物和种子,或植株可疑病变组织各1 g ~2 g,液氮研磨后各取样0.1 g ~0.2 g,采用商业化试剂盒提取DNA(参见附录C)。取1 μL样品DNA进行PCR检测,重复3次。用油菜茎基溃疡病菌(Leptosphaeria maculans(Desm) Ces. & de Not.)标准菌株作阳性对照,用油菜黑胫病菌
(Leptosphaeria biglobosa)弱毒株作阴性对照,用蒸馏水作空白对照。
6.2.2 PCR选择一
油菜茎基溃疡病菌L. maculans特异性引物一,LMR1-D:5'-GCGTAAGAAGCGTGCCTTAGAGTC-3' / 5'-TCCTGCTCCTACTCCTTCTCTAGC-3',预期扩增产物为580 bp。
PCR反应体系为10×PCR buffer(含pH 8.3,100 mM Tris- HCl,500 mM KCl,15 mM MgCl2)2.5 µL,10 mmol/L dNTP 0.5 µL, 10 µmol/L正反引物各1 µL,2.5 U Taq DNA聚合酶,模板DNA为1 µL,总体积为25 µL。
PCR反应程序为94℃ 5 min;94℃ 30 s,58℃ 30 s,72℃ 40 s,35个循环;72℃ 7 min。
6.2.3 PCR选择二
油菜茎基溃疡病菌L. maculans特异性引物二,Lmb:5’-CACCAATTGGATCCCCTA-3’
/5’-AGGCGAGTCCCAAGTGGAACA-3’,预期扩增产物为276 bp。
PCR反应体系为10×PCR buffer(含pH 8.3,100 mM Tris- HCl,500 mM KCl,15 mM MgCl2)2.5 µL,10 mmol/L dNTP 0.5 µL, 10 µmol/L正反引物各1 µL,2.5 U Taq DNA聚合酶,模板DNA为1 µL,总体积为25 µL。
PCR反应程序为94℃3 min;94℃30 s,56℃30 s,72℃30 s,35个循环;72℃5 min。
6.2.4 PCR扩增产物检测
扩增产物用1.5%琼脂糖凝胶在1×TAE缓冲液中电泳,EB染色后用凝胶成像系统分析。
需要时可用实时荧光PCR检测(参见附录D)。
6.3 分离培养
6.3.1 样品挑选
若PCR检测结果为阳性,挑选油菜籽、病残体或植株病变组织进行分离培养。在解剖镜下挑选籽