《API细菌鉴定系统》PPT课件
细菌分类鉴定PPT.
❖ 在工作开始时，必须先准备好一批待研究菌株和有关典型菌 种的菌株，它们被称作OTU（操作分类单位，operational taxonomic units）。要用50个以上甚至几百个特征进行比 较，且所用特征越多，其结果也就越精确。在比较不同菌株 时，都要采用相同的可比特征，包括形态的、生理的、生化 的、遗传的、生态的和免疫的特征等。
如果是节假日，必须要说节假日好。
为用放线菌的形态特征和化学组分相结合的方法划分属提供了科学的依据。
2．全细胞水解液的糖型
现以放线菌为例，其糖型可分四类：
3．磷酸类脂成分的分析
位于细菌、放线菌的细胞膜上的磷酸类脂成分， 在不同属中有所不同，故可用于鉴别放线菌属的 重要指标之一。
4．枝菌酸的分析
❖ 枝菌酸存在于诺卡氏菌属、分枝杆菌属和棒杆菌 属3属称作“诺卡氏菌形放线菌”中，它们在形态、 结构和细胞壁上难以区分，但它们所含的枝菌酸 却差别明显，分别含有80、50、30个碳原子，可 对它们分属。
（二）细胞化学成分用作鉴定指标
化学分类法
微生物分类中，根据微生物细胞的特征性化学组 分对微生物进行分类的方法称化学分类法 (chemotaxonomy) 。
在近二十多年中，采用化学和物理技术来研究细 菌细胞的化学组成，已获得很有价值的分类和鉴 定资料。
细菌的化学组分分析及其在分类水平上的应用
细胞成份
原理
测定序列的相似性： <20% 不同属 20~60% 同一个属 60~85% 同一个种 >85% 同一个株
菌落原位杂交
特异性的探针主要用于 病原微生物的快速鉴定
3．rRNA寡核苷酸序列分析
微生物分类与鉴定PPT课件
一、 原核微生物分类系统
（一）《伯杰氏鉴定细菌学手册》 (Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology)
美国宾夕法尼亚大学的细菌学教授伯杰(D.Bergey)(18601937) 伯杰氏手册: 是目前进行细菌分类、鉴定的最重要参考书， 其特点是描述非常详细，包括对细菌各个属种的特征及进行 鉴定所需做的实验的具体方法。
第34页/共58页
界Ⅱ：真细菌(Bacteria)
部17：γ-变形细菌(γ-Proteobacteria，150属854 种)
部18：δ-变形细菌(δ-Proteobacteria，39属128 种)
部19：ε-变形细菌(ε-Proteobacteria，6属56种) 部20：梭菌(Clostridia)和相关细菌(73属403种) 部21：柔膜菌(Mollicutes，10属191种)
（二）伯杰氏系统细菌学手册 (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology)
第一版 1984年问世，至1989年出齐，共4卷。 第二版 由George Garrity主编分为5卷，将从2000年 起陆续出版。这一版纳入了研究核糖体RNA测序所产 生的许发育)分类系统。
• 部2：产甲烷菌(Methanogens，21属97种) • 部3：盐杆菌(Halobacteria，14属50种) • 部4：热原体(Thermoplasma，2属4种) • 部5：热球菌(Thermococci，5属19种)
第32页/共58页
界Ⅱ：真细菌(Bacteria)
部6：产液菌(Aquifex)和相关细菌(3属5种) 部7：栖热袍菌(Thermotoga)和Geotogas，9
API细菌鉴定系统
氧化酶 +
非发酵菌鉴定 API 20NE
革兰氏阴性杆菌
氧化酶 -
乳糖发酵 +
乳糖发酵 -
肠道杆菌鉴定 API 20E
API 20E 及 API 20NE
革兰氏阴性杆菌例子 (大肠杆菌 x 1000)
革兰氏阴性弧菌例子 (x 1000)
革兰氏阳性杆菌分类
触酶 +
革兰氏阳性杆菌
细小不透光菌落
短球杆菌
微生物鉴定
完整的鉴定谱
杆菌
球菌
接触酶
革兰氏
革兰氏
氧化酶
杆菌
球菌
API 鉴定范围
庞大资料库 15种试条 >600种细菌可被鉴定 研究用试条： 乳酸杆菌，芽胞菌，弯曲菌
API 试剂类别
• API 20E /RapiD 20E革兰氏阴性杆菌鉴定 • API 20NE非发酵菌鉴定 • API STAPH葡萄球菌及微球菌 • API STREP链球菌鉴定 • API 20C AUX酵母菌 • API 20A厌氧菌 • API LISTERIA李斯特菌 • API CAMPY弯曲菌属 • API CORYNE棒状杆菌 • API CH芽胞杆菌/乳酸杆菌
api20E 试剂
API 试剂条 24小时出结果
阅读结果
根据说明书上， 或彩图的指示， 记录结果於报告 单上。
利用编码手册 或APILAB PLUS软件进出分析
全Windows操作界面，多种语言。
API 结果
跟据T值及%Id的组合，作出评语：
(i) 极好的鉴定结果
%Id >99.9及T>0.75
，鉴定系统的发源生化测试＞750 - ＞1500多篇使用文献
微生物分类鉴定方法 ppt课件
t课件
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核酸分子杂交
定义
按碱基互补配对的原理，用人工方法对两条不同来源 的单链核酸进行复性，以构建新的杂合双链核酸的技 术，成为核酸杂交。包括DNA-RNA、DNA-rRNA、 rRNA-rRNA分子间的杂交。
ppt课件
14
核酸分子杂交
DNA是除少数RNA病毒以外的一切微生物的遗传信息载体。每一种微 生物均有其自己特有的、稳定的DNA即基因组的成分和结构，不同种 微生物间基因组序列的差异程度代表着它们之间亲缘关系的远近、疏密。 因此可以用基因组的一些指标作为鉴定微生物类别的依据。
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微生物分类鉴定中的现代方法
DNA碱基比例测定 核酸分子杂交法 rRNA寡聚核苷酸编目
微生物分类鉴定方法
ppt课件
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微生物分类鉴定方法
从不同层次（细胞的、分子的），用不同学科（化学、物理学、遗传学、 免疫学、分子生物等）的技术方法来研究和比较不同微生物的细胞、细 胞组分或代谢产物，从中发现的反映微生物类群特征的资料。
在微生物分类中，任何能稳定地反映微生物种类特征的资料，都有分类 学意义，都可以作为分类鉴定的依据。
以往各种界级分类不同的新系统，称为三域学说，
"域"是一个比界更高的界级分类单元，过去曾称原界。 三个域指的是细菌域(以前称"真细菌域")、古生菌域 (以前称古细菌域)和真核生物域。
ppt课件
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rRNA寡核苷酸数目
定义
一种通过分析原核或真核细胞种最稳定的rRNA寡 核苷酸序列同源性程度，以确定不同生物之间的 亲缘关系和进化谱系的方法。
第十一章微生物的分类和鉴定ppt课件
例1：苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种 Bacillus thuringiensis （subsp）galleria 例2：椭圆酿酒酵母（或酿酒酵母椭圆变种） Saccharomyces cerevisiae （var）ellipsoideus
由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准， 为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱， 细菌系统分类也像其他生物分类一样采用“模式概念”
学名（scientific name）
指一个菌种的科学名称，它是按照《国际 细菌命名法规》命名的、国际学术界公认并通 用的正式名字。
一、双名法（binominal nomenclature）
双名法指一个物种的学名由前面一个属名（generic name）和后面一个种名加词（specific epithet）两部分
Ainsworth从1966年起，就把真菌界分为两大门 （粘菌门和真菌门），并把真菌门再分成五个亚门。 目前，该系统已为各国广大真菌分类学者所普遍采 用，影响较大。
三、酵母菌的分类
酵母菌的分类普遍采用荷兰的Loddov在1970 年提出的分类系统。
在这个分类系统中，以是否形成各类有性孢子 作为分类的起点，
细致的观察和测试，参照一定的，用对比的方法来 确定该微生物的分类地位。
第一节 通用分类单元
三、种以下的分类单元
亚种（subspecies，subsp.，ssp.） 变种（variety，var.） 型（form） 类群（group） 菌株（strain） 小种（race） 相（phase） 态（state）
一般指自然存在的微生物交互变异中的一定阶段。
（八）态（state）
通常指微生物的菌落变异状态，如粗糙、光 滑或粘液状等。
微生物第5章分类与鉴定PPT课件
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2、常用分类方法 二分法 数值分类法（Numerical taxonomy）见书
3、 分子分类法： G + C 百分比的测定 核酸杂交 16 SrRNA 碱基测序
4、细菌鉴定的自动分析技术 API系统 Biolog系统
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API细菌鉴定系统
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适用于肠道厌氧细菌的 Enterotube鉴定系统
20世纪70年代，沃斯（Carl Woese）根据生物核糖体中 18SrRNA 和 16SrRNA 的 碱 基 序 列 将 生 物 划 分 为 3 个 “域（domain)“ 或称 “原界”：
古细菌原界（Archaea）： 甲烷菌，嗜盐菌，嗜热菌等 真细菌原界（Bacteria）： 除古细菌外的其它原核生物 真核生物原界(Eukarya)：原生生物、真菌、动物、植物
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生物的三原界系统发育树
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二、微生物的分类单元和命名：
1、种以上的微生物分类单元： 界（Kingdom）、门（Phylum）、 纲（Class）、目（Order）、 科（Family）、属（Genus）、 种（Species）
2、对于微生物来说，种的概念： 表型特征和包括16SrRNA在内的基因序列特征高度相
似的菌株群，而且这个菌株群和其它类群有明显差异。
3、种以下的分类概念： 菌株（strain）、模式菌株（typestrain） 亚种（subspecies） 型（form）：生物型、血清型、噬菌体型……
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4．菌种学名
（1）按《国际细菌命名法规》命名的，国际公认， 通用的正式菌种名字。采用林奈的双名法： 学名：属名+种名加词 （字母均为斜体）
对分类意义不大
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《细菌鉴定》PPT课件
形态学观察
* 营养需求（血琼脂、巧克力、营养琼脂生长 情况）
* 胆盐耐受（麦康凯生长情况） * 万古霉素耐受（含万古霉素巧克力生长情况） * 液体培养基生长现象（菌膜、上半部生长、
均匀浑浊、下半部生长、沉淀） * 半固体动力现象（清晰、毛刷样、倒伞状）
生化反应
* OF试验 * 各种糖发酵试验、糖氧化试验 * 糖衍生物发酵（α/β-甲基葡萄糖、β-葡萄糖胺、
不同种群的细菌根据培养的难易以及实际操作 时的难度而采用不同的鉴定手段
* 目前技术能培养的细菌采用传统手段
* 难培养细菌采用分子生物学手段（如麻风分支杆菌、 肺炎支原体、肺炎衣原体等）
* 而传统手段难以进一步鉴定的细菌则采用抗原抗体 血清学分类（如军团菌、沙门菌、志贺菌等）、细 胞壁脂肪酸结构和组成分类（如棒状杆菌相关属）、 挥发性代谢产物（如厌氧菌挥发性脂肪酸）指纹分 析
血清学试验（不常用）
* 铜绿假单胞菌生物分型血清 * 脑膜炎奈瑟菌分型血清 * 隐球菌可溶血抗原血清 * 脑膜炎5种可溶性抗原复合乳胶
* b型流感嗜血杆菌乳胶 * 肺炎链球菌乳胶（含83个血清型的多价血清） * A群脑膜炎奈瑟菌乳胶 * B群脑膜炎奈瑟菌/大肠埃希菌K1乳胶 * C群脑膜炎奈瑟菌乳胶
然耐药反证法鉴定
形态学试验
G+菌 BA生长、Choc不生长、MecK不生长，——Gram染色： 分G+co（革兰阳性球菌） ,G+ b（革兰阳性杆菌）
G+co—依靠溶血特征，菌落形态、菌落颜色、菌体形 态区分:
▲葡萄球菌：淡黄色/白色，中等大小，较凸，规则 圆形，β/γ溶血，较湿润，除金黄色葡萄球菌外， 一般不具有临床意义；
血清学试验（不常用）
API细菌鉴定系统ppt课件
API 系统
- 构成: 试条由特別选择的生化反应小管 API试条有多种类 各有相应的数据库 所有生化结果以同时间一并阅读
API 套件
API 试剂盒及其配套试剂
石腊油(容量: 125ml) 覆盖在指定小孔上
悬浮液 (容量: 5ml) 用於调菌液
安培架
附加试条 加进指定的生化孔内
革兰氏阴性杆菌 氧化酶 + 乳糖发酵 + 氧化酶 乳糖发酵 -
非发酵菌鉴定
API 20NE
肠道杆菌鉴定 API 20E
API 20E 及 API 20NE
革兰氏阴性杆菌例子 (大肠杆菌 x 1000)
革兰氏阴性弧菌例子 (x 1000)
革兰氏阳性杆菌分类
革兰氏阳性杆菌
触酶 +
触酶 -
细小不透光菌落
容许於平板(包括血平板)上作直接检测
- 玻片法
- 直接在平板上测试
ID COLOR CATALASE 接触酶试剂
步骤 :
– 玻片法 : 或 – 直接平板测试 : 落
将待检菌落乳化於一滴试剂中
将一滴试剂直接滴於平板上的菌
即时产生气泡 (5 秒内) 代表阳性结果。
鉴定用接触酶显色剂
接触酶试验是细菌鉴定中的一个重要反应。由於传统方法的弱 阳性结果，这个试验没有得到充分应用。
步骤 3 :
利用接种针挑单个菌落,穿刺到OF培养基(深度约1 cm.)
把其中一个已接种好的安培(OF.F),用石爉油覆盖1 cm. 把两个安培盖上朔料帽,培养35-37° C , 24 – 48 小时.
步骤 4 :
OF培养基
结果阅读:
oil
O+
API20E肠道菌鉴定系统
API 20 E 肠道菌鉴定系统（Ref. 20 100 )布丘菌属：乡间布丘菌Buttiauxella agrestis布戴约维采菌属：水生布戴维约采菌Budvicia aquatica布鲁菌属：布鲁菌属某些种Brucella spp西地西菌属：戴氏西地西菌Cedecea davisae拉氏西地西菌Cedecea lapagei奈氏西地西菌Cedecea neteri柠檬酸杆菌属：无丙二酸柠檬酸杆菌Citrobacter amalonaticus（+/-无丙二酸柠檬酸杆菌）(+/-Citrobacter amalonaticus) 布氏柠檬酸杆菌Citrobacter braakii（+/-弗氏柠檬酸杆菌）(+/-Citrobacter freundii)法氏柠檬酸杆菌Citrobacter farmeri（+/-无丙二酸柠檬酸杆菌）(+/-Citrobacter amalonaticus) 弗氏柠檬酸杆菌Citrobacter freundii（+/-弗氏柠檬酸杆菌）(+/-Citrobacter freundii)柯氏柠檬酸杆菌Citrobacter koseri（=差异柠檬酸杆菌）(=Citrobacter diversus)杨氏柠檬酸杆菌Citrobacter youngae（+/-弗氏柠檬酸杆菌）(+/-Citrobacter freundii)克氏/无丙二酸柠檬酸杆菌Citrobacter koseri/amalonaticus 爱德华菌属：迟钝爱德华菌Edwardsiella tarda保科爱德华菌Edwardsiella hoshinae艾肯菌属：啮蚀艾肯菌Eikenella corrodens肠杆菌属：阴沟肠杆菌Enterobacter cloacae产气肠杆菌Enterobacter aerogenes河生肠杆菌Enterobacter amnigenus中间肠杆菌Enterobacter intermedius日沟维肠杆菌Enterobacter gergoviae阪崎肠杆菌Enterobacter sakazakii生癌肠杆菌Enterobacter cancerogenus（=泰勒肠杆菌）(=Enterobacter taylorae)阿氏肠杆菌Enterobacter asburiae伯克霍尔德菌属：洋葱伯克霍尔德菌Burkholderia cepacie（=洋葱假单胞菌）(=Pseudomonas cepacie)欧文菌属某些种Erwinia spp埃希菌属：大肠埃希菌Escherichia coli弗格森埃希菌Escherichia fergusonii赫氏埃希菌Escherichia hermannii伤口埃希菌Escherichia vulneris假单胞菌属：铜绿假单胞菌Pseudomonsa aeruginosa荧光假单胞菌Pseudomonsa fluorescens恶臭假单胞菌Pseudomonsa putida类鼻疽假单胞菌Pseudomonsa pseudomallei假单胞菌属某些种Pseudomonsa spp寡养单胞菌属：嗜麦寡养食单胞菌Stenotrophomonas maltophilia（=嗜麦芽黄单胞菌）(= Xanthomonas maltophilia)气单胞菌属：嗜水气单胞菌Aeromonas hydrophila豚鼠气单胞菌Aeromonas caviae杀鲑杀鲑气单胞菌Aeromona ssalmonicidas salmonicidas （=杀鲑气单胞菌）(=Aeromonas salmonicidas)温和气单胞菌Aeromonas sobria产碱菌属：产碱菌属某些种Alcaligenes spp克雷伯菌属：植生肺炎克雷伯菌Klebsiella planticola土生拉乌尔菌Raoultella terrigena解鸟氨酸拉乌尔菌Raoultella ornithinolytica产酸克雷伯菌Klebsiella oxytoca肺炎肺炎克雷伯菌Klebsiella pneumoniae pneumoniae臭鼻肺炎克雷伯菌Klebsiella pneumoniae ozaenae鼻硬结肺炎克雷伯菌Klebsiella pneumonia rhinoscleromatis 克吕沃尔菌属：克吕沃尔菌属某些种Kluyvera spp抗坏血酸克吕沃尔菌Kluyvera ascorbata栖冷克吕沃尔菌Kluyvera cryocrescens科泽菌属：特氏科泽菌Koserella trabulsii勒克菌属：非脱羧勒克菌Leclercia adecarboxylata米勒菌属：威斯康星米勒菌Moellerella wisconsensis摩根菌属：摩氏摩根菌Morganella morganii奇异变形杆菌Proteus mirabilis彭氏变形杆菌Proteus penneri普通变形杆菌群Proteus vulgaris group普罗威登斯菌属：产碱普罗威登斯菌Providencia alcalifaciens 雷氏普罗威登斯菌Providencia rettgeri斯氏普罗威登斯菌Providencia stuartii拉氏普罗威登斯菌Providencia rustigianii腐败希瓦菌群Shewanella putrefaciens group 爱文菌属：美洲爱文菌Ewingella americana哈夫尼菌属：蜂房哈夫尼菌Hafnia alvei沙雷菌属：无花果沙雷菌Serratia ficaria居泉沙雷菌Serratia fonticola液化沙雷菌Serratia liquefaciens粘质沙雷菌Serratia marcescens气味沙雷菌1型Serratia odorifera 1气味沙雷菌2型Serratia odorifera 2普城沙雷菌Serratia plymuthica深红沙雷菌Serratia rubidaea志贺菌属：鲍氏志贺菌Shigella bogdii痢疾志贺菌Shigella dysenteriae弗氏志贺菌Shigella flexneri索氏志贺菌Shigella sonnei塔特姆菌属：痰塔特姆菌Tatumella ptyseos志贺菌属某些种Shigella spp耶尔森菌属：小肠结肠炎耶尔森菌Yersinia enterocolitica弗氏耶尔森菌Yersinia fredericksenii中间耶尔森菌Yersinia intermedia克氏耶尔森菌Yersinia kristensenii鼠疫耶尔森菌Yersinia pestis假结核耶尔森菌Yersinia pseudotuberculosis 鲁氏耶尔森菌Yersinia ruckeri莫拉菌属：莫拉菌属某些种Moraxella spp巴斯德菌属：产气巴斯德菌Pasteurella aerogenes溶血曼海姆菌Mannheimia haemolytica多杀巴斯德菌Pasteurella multocida侵肺巴斯德菌Pasteurella pneumotropica巴斯德菌属某些种Pasteurella spp沙门菌属：猪霍乱沙门菌亚利桑那亚种Salmonella choleraesuis ssp arizonae 猪霍乱沙门菌猪霍乱亚种Salmonella choleraesuis ssp choleraesuis 沙门菌甲型副伤寒血清型Salmonella ser.Paratyphi A乙型副伤寒沙门菌Salmonella paratyphi B沙门菌属某些种Salmonella spp伤寒沙门菌Salmonella typhi肠炎沙门菌Salmonella enteritidis沙门菌鸡血清型Salmonella ser.Gallinarum沙门菌鸡白痢血清型Salmonella ser.Pullorum鼠伤寒沙门菌Salmonella typhimurium不动杆菌属：鲍曼不动杆菌Acinetobacter baumannii醋酸钙不动杆菌Acinetobacter calcoaceticus不动杆菌属某些种Acinetobacter spp鞘氨醇单胞菌属：少动鞘氨醇单胞菌Sphlingomonas paucimobilis发光杆菌属：美人鱼发光杆菌Photobacterium damselae（=美人鱼利斯顿菌）(= Listonella damsela)邻单胞菌属：类志贺邻单胞菌Plesiomonas shigelloides拉恩菌属：水生拉恩菌Rahnella aquatilis弧菌属：解藻朊酸弧菌Vibrio alginolyticus霍乱弧菌Vibrio cholerae河流弧菌Vibrio fluvialis霍利斯格里蒙菌Grimontia hollisae最小弧菌Vibrio mimicus副溶血弧菌Vibrio parahaemolyticus创伤弧菌Vibrio vulnificus无色杆菌属：无色杆菌属某些种Achromobacter spp博德特菌属：博德特菌属某些种Bordetella spp色杆菌属：紫色色杆菌Chromobacterium violaceum金色单胞菌属：浅黄假单胞菌Pseudomonas luteola金黄杆菌属：产吲哚金黄杆菌Chryseobacterium indologenes（=产吲哚黄杆菌）(= Flavobacterium indologenes)脑膜脓毒性金黄杆菌Chryseobacterium meningosepticum（=脑膜脓毒性黄杆菌）(=Flavobacterium meningosepticum)黄色单胞菌属：栖稻黄色单胞菌Flavimonas oryzihabitans希瓦菌属：腐败希瓦菌Shewanella putrefaciens鞘氨醇杆菌属：多食鞘氨醇杆菌Sphingobacterium multivorum威克斯菌属：有毒威克斯菌Weeksella virosa动物溃疡威克斯菌Weeksella zoohelcum栖稻假单胞菌Pseudomonas oryzihabitansAPI 20 NE 非肠道菌鉴定系统（Ref. 20 050）假单胞菌属：绿脓假单胞菌Pseudomonas aeruginosa产碱假单胞菌Pseudomonas alcaligenes荧光假单胞菌Pseudomonas fluorescens门多萨假单胞菌Pseudomonas mendocina假产碱假单胞菌Pseudomonas pseudoalcaligenes恶臭假单胞菌Pseudomonas sputita施氏假单胞菌Pseudomonas stutzeri不动杆菌属：鲍氏不动杆菌Acinetobacter baumanii乙酸钙不动杆菌Acinetobacter calcoaceticu溶血不动杆菌Acinetobacter haemolyticus琼氏不动杆菌Acinetobacter junii约氏不动杆菌Acinetobacter johnsonii鲁氏不动杆菌Acinetobacter lwoffii抗辐射不动杆菌Acinetobacter radioresistgns莫拉菌属：腔隙莫拉菌Moraxella lacunata非液化莫拉菌Moraxella nonliquefaciens奥斯陆莫拉菌Moraxella osloensis莫拉菌属某些种Moraxella spp巴斯德菌属：产气巴斯德菌Pasteurella aerogenes溶血曼海姆菌/海藻巴斯德菌Mannheimnia haemolytica/Pasteurella trehalosi 多杀巴斯德菌Pasteurella multocida侵肺巴斯德菌Pasteurella pneumotropica巴斯德菌群EF4 Pasteurella gr.EF4巴斯德菌属某些种Pasteurella spp气单胞菌属：嗜水气单胞菌Aeromonas hydrophila豚鼠气单胞菌Aeromonas caviae温和气单胞菌Aeromonas sobria杀日本鲑杀鲑气单胞菌Aeromonas salmonicida masoucida无色杀鲑气单胞菌Aeromonas salmonicida achromogenes杀鲑杀鲑气单胞菌Aeromonas salmonicida salmonicida（=杀鲑气单胞菌）(= Aeromonsa salmonicida)发光杆菌属：美人鱼发光杆菌Photobacterium damselae（=美人鱼利斯顿菌）( =Listonella damsela)邻单胞菌属：类志贺邻单胞菌Plesiomonas shigelloides威克斯菌属：有毒威克斯菌Weeksella virosa伯格菌属：动物溃疡伯格菌Bergeyella zoohelcum（=动物溃疡威克斯菌）(= Weeksella zoohelcum)窄食单胞菌属：嗜麦芽窄食单胞菌Stenotrophomonas maltophilia（=嗜麦芽黄单胞菌）(=Xanthomonas naltophilia)短波单胞菌属：缺陷短波单胞菌Brevendimonas diminuta（=缺陷假单胞菌）(=Pseudomanas diminuta)泡囊短波单胞菌Brevendimonas vesicularis（=泡囊假单胞菌）(=Pseudomanas vesicularis)腐败希瓦菌群Shewanella putrefaciens group产碱菌属：粪产碱菌Alcaligenes faecalis反硝化无色杆菌Achromobacter denitrificans（=木糖氧化产碱杆菌反硝化亚种）(=A. xylosoxidans subsp denitrificans) 木糖氧化无色杆菌Achromobacter xylosoxidans（=木糖氧化产碱杆菌木糖亚种）(=A. xylosoxidans subsp xylosoxidans) 土壤杆菌属：放射根瘤菌Rhizobium radiobacter博德特菌属：支气管炎博德特菌Bordetella bronchiseptica鸟博德特菌Bordetella aviumCDC：少见沃特菌Wautersia paucula丛毛单胞菌属：睾丸酮丛毛单胞菌Comonas testosteroni（=睾丸酮假单胞菌）(= Pseudomonas testosteroni)食酸代尔夫特菌Delftia acidovorans（=食酸假单胞菌）(= Pseudomonas acidovorans)色杆菌属：紫色色杆菌Chromobacterium violaceum金色单胞菌属：浅黄假单胞菌Pseudomonas luteola黄色单胞菌属：栖稻假单胞菌Pseudomonas oryzihabitans苍白杆菌属：人苍白杆菌Ochrobactrum anthropi寡源杆菌属：解脲寡源杆菌Oligella ureolytica尿道寡源杆菌Oligella urethralis希瓦菌属：腐败希瓦菌Shewanella putrefaciens鞘氨醇单胞菌属：少动鞘氨醇单胞菌Sphlingomonas paucimobilis鞘氨醇杆菌属：多食鞘氨醇杆菌Sphingobacterium multivorum食神鞘氨醇杆菌Sphingobacterium spiritovorum弧菌属：解藻朊酸弧菌Vibrio alginolyticus霍乱弧菌Vibrio cholerae河流弧菌Vibrio fluvialis霍利斯格里蒙菌Grimontia hollisae梅氏弧菌Vibrio metschnikovii最小弧菌Vibrio mimicus副溶血弧菌Vibrio parahaemolyticus创伤弧菌Vibrio vulnificus伯克霍尔德菌属：洋葱伯克霍尔德菌Burkholderia cepacia（=洋葱假单胞菌）(=Pseudomonas cepacia)唐菖蒲伯克霍尔德菌Burkholderia gladioli类鼻疽伯克霍尔德菌Burkholderia pseudomallei（=类鼻疽假单胞菌）(=Pseudomonas pseudomallei)API 20 STREP 链球菌及有关种类的鉴定系统（Ref. 20 600）链球菌属：毗邻颗粒链菌Granulicatella adiacens（=毗邻链球菌）(=Streptococcus adjacens)软弱克养菌Abiotrophia defectiva（=软弱链球菌）(=Streptococcus defectiva)少酸链球菌Streptococcus acidominimus无乳链球菌Streptococcus agalactiae咽峡炎链球菌Streptococcus anginosus牛链球菌ⅠStreptococcus bovis Ⅰ牛链球菌ⅡStreptococcus bovis Ⅱ狗链球菌Streptococcus canis软弱链球菌Streptococcus defectivus停乳停乳链球菌Streptococcus dysgalatiae dysgalatiae （=停乳链球菌）(=Streptococcus dysgalatiae)马肠链球菌Streptococcus equinus似马停乳链球菌Streptococcus dysgalactiae equisimilis (=似马链球菌）(= Streptococcus equisimilis)星座链球菌Streptococcus constellatus中间链球菌Streptococcus intermadius缓症链球菌Streptococcus mitis口腔链球菌Streptococcus oralis类血链球菌Streptococcus parasanguis肺炎链球菌Streptococcus penumoniae豕链球菌Streptococcus porcinus化脓链球菌Streptococcus pyogenes唾液唾液链球菌Streptococcus salivarius salivarius嗜热唾液链球菌Streptococcus salivarius thermophilus 血链球菌Streptococcus sanguinis猪链球菌ⅠStreptococcus suisⅠ猪链球菌ⅡStreptococcus suisⅡ兽瘟马链球菌Streptococcus equi zooepidemicus唾液链球菌Streptococcus salivarius马马链球菌Streptococcus equi equi格氏链球菌Streptococcus gordoniiL群链球菌Streptococcus gr L变异链球菌Streptococcus mutans乳房链球菌Streptococcus uberis肠球菌属：铅黄肠球菌Enterococcus casselifavus耐久肠球菌Enterococcus durans粪肠球菌Enterococcus faecalis屎肠球菌Enterococcus faecium鹑鸡肠球菌Enterococcus gallinarum鸟肠球菌Enterococcus avium气球菌属：浅绿气球菌Aerococcus viridans加德纳菌属：阴道加德纳菌Gardnerella vaginalis孪生球菌属：溶血孪生球菌Gemella haemolysans麻疹孪生球菌Gemella morbillorum乳球菌属：乳脂乳酸乳球菌Lactococcus lactis cremoris乳乳酸乳球菌Lactococcus lactis lactis明串珠菌属：明串珠菌属某些种Luconostoc spp利斯特菌属：无害利斯特菌Listeria innocua伊氏利斯特菌Listeria ivanovii单核细胞增生利斯特菌Listeria monocytogenes斯氏利斯特菌Listeria seeligeri利斯特菌属某些种Listeria spp威氏利斯特菌Listeria welshimeri嗜热链球菌Streptococcus thermophilusAPI CAMPY 弯曲杆菌鉴定系统（Ref. 20 800）弯曲杆菌属：大肠弯曲杆菌Campylobacter coli嗜低温弓形杆菌Arcobacter cryaerohoilus（=嗜低温弯曲杆菌）(= Campylobacter ryaerophilus)胚胎胚胎弯曲杆菌Campylobacter fetus fetus性病胚胎弯曲杆菌Campylobacter fetus venerealis豚肠弯曲杆菌Campylobacter hyointestinalis德莱空肠弯曲杆菌Campylobacter jejuni doylei空肠空肠弯曲杆菌Campylobacter jejuni jejuni红嘴鸥弯曲杆菌Campylobacter lari红嘴鸥弯曲杆菌UPTC Campylobacter lari UPTC粘膜弯曲杆菌Campylobacter mucosalis牛唾液弯曲杆菌Campylobacter sputorrum bubulus唾液弯曲杆菌粪生物变种Campylobacter sputorum bv fecalis 乌普萨拉弯曲杆菌Campylobacter upsaliensis同性恋螺杆菌Helicobacter cinaedi（=同性恋弯曲杆菌）(=Campylobacter cinaedi)芬纳尔螺杆菌Helicobacter fennelliae（=芬纳尔弯曲杆菌）(=Campylobacter fennelliae)幽门螺杆菌Helicobacter pyloriAPI STAPH 葡萄球和微球菌鉴定系统（Ref. 20 500）葡萄球菌属：金黄色葡萄球菌Staphylococcus aureus耳葡萄球菌Staphylococcus auricularis头状葡萄球菌Staphylococcus capitis山羊葡萄球菌Staphylococcus caprae肉葡萄球菌Staphylococcus carnosus产色葡萄球菌Staphylococcus chromogenes科氏科氏葡萄球菌Staphylococcus cohnii cohnii（+/-科氏葡萄球菌）(+/-Staphylococcus cohnii )解脲科氏葡萄球菌Staphylococcus cohnii urealyticum （+/-科氏葡萄球菌）(+/-Staphylococcus cohnii )表皮葡萄球菌Staphylococcus epidermidis溶血葡萄球菌Staphylococcus haemolyticus人葡萄球菌Staphylococcus hominis猪葡萄球菌Staphylococcus hyicus缓慢葡萄球菌Staphylococcus lentus路邓葡萄球菌Staphylococcus lugdunensis腐生葡萄球菌Staphylococcus sarophyticus施氏葡萄球菌Staphylococcus schleiferi松鼠葡萄球菌Staphylococcus sciuri模仿葡萄球菌Staphylococcus simulans沃氏葡萄球菌Staphylococcus warneri木糖葡萄球菌Staphylococcus xylosus库克菌属：克氏库克菌Kocuria kristinae（=克氏微球菌）(=Micrococcus kristinae)变异库克菌Kocuria varians（=变异微球菌）(=Micrococcus varians)玫瑰色库克菌Kocuria roseus（=玫瑰色微球菌）(=Micrococcus roseus)微球菌属：滕黄微球菌Micrococcus luteus莱拉微球菌Micrococcus lylae微球菌属某些种Micrococcus spp粘滑罗斯菌Rothia mucilaginosa不动盖球菌Kytococcus sedentaruis（=不动微球菌）(=Micrococcus sedentaruis)西宫皮肤球菌Dermacoccus nishinomiyaensis（=西宫微球菌）(=Micrococcus nishinomiyaensis)API NH 奈瑟氏菌及嗜血杆菌鉴定系统（Ref. 10 400）伴放线菌素嗜血菌Haemophilus actinomycemtecomitans 奈瑟球菌属：淋病奈瑟球菌Neisseria gonorrhoeae脑膜炎奈瑟球菌Neisseria meningitidis乳糖奈瑟球菌Neisseria lactamica多糖奈瑟球菌Neisseria polysaccharea灰色奈瑟球菌Neisseria cinerea干燥奈瑟球菌Neisseria sicca粘液奈瑟球菌Neisseria mucosa奈瑟菌属某些种Neisseria spp微黄奈瑟球菌Neisseria subflava嗜血杆菌属：流感嗜血杆菌Haemophilus influenzae流感嗜血杆菌ⅠHaemophilus influenzaeⅠ流感嗜血杆菌ⅡHaemophilus influenzaeⅡ流感嗜血杆菌ⅢHaemophilus influenzaeⅢ流感嗜血杆菌ⅣHaemophilus influenzaeⅣ流感嗜血杆菌ⅤHaemophilus influenzaeⅤ副鸡嗜血菌Haemophilus paragallinarum流感嗜血杆菌ⅥHaemophilus influenzaeⅥ流感嗜血杆菌ⅦHaemophilus influenzaeⅦ流感嗜血杆菌ⅧHaemophilus influenzaeⅧ副流感嗜血杆菌Haemophilus parainfluenzae副流感嗜血杆菌ⅠHaemophilus parainfluenzaeⅠ副流感嗜血杆菌ⅡHaemophilus parainfluenzaeⅡ副流感嗜血杆菌ⅢHaemophilus parainfluenzaeⅢ副流感嗜血杆菌ⅣHaemophilus parainfluenzaeⅣ副流感嗜血杆菌ⅤHaemophilus parainfluenzaeⅤ副流感嗜血杆菌ⅥHaemophilus parainfluenzaeⅥ副流感嗜血杆菌ⅦHaemophilus parainfluenzaeⅦ副流感嗜血杆菌ⅧHaemophilus parainfluenzaeⅧ嗜沫嗜血杆菌Haemophilus aphrophilus副嗜沫嗜血杆菌Haemophilus paraphrophilus睡眠嗜组织菌Histophilus somni布兰汉球菌属：卡他莫拉菌（布兰汉菌）Moraxella(Branhamella) catarrhalis 大叶性肺炎放线杆菌Actinobacillus pleuropneumoniaeAPI 20 C AUX 酵母菌鉴定系统（Ref. 20 210）假丝酵母属：白假丝酵母Candida albicans博伊丁假丝酵母Candida boidinii西弗射盾子囊霉Stephanoascus ciferrii软假丝酵母Candida colliculosa都柏林假丝酵母Candida dubliniensis无名假丝酵母Candida famata光滑假丝酵母Candida glabrata季也蒙假丝酵母Candida guilliermondii平常假丝酵母Candida inconspicua乳酒假丝酵母Candida kefyr克柔假丝酵母Candida krusei朗比可假丝酵母Candida lambica解脂假丝酵母Candida lipolytica葡萄牙假丝酵母Candida lusitaniae木篮假丝酵母Candida magnoliae挪威假丝酵母Candida norvegensis近平滑假丝酵母Candida parapsilosis菌膜假丝酵母Candida pelliculosa皱落假丝酵母Candida rugosa圆球形假丝酵母Candida sphaerica热带假丝酵母Candida tropicalis产朊假丝酵母Candida utilis诞沫假丝酵母Candida zeylanoides隐球菌属：浅白隐球酵母Cryptococcus albidus腐殖隐球菌Cryptococcus humicola（=土生假丝酵母）(= Candida humicolus)罗伦隐球酵母Cryptococcus laurentii新型隐球酵母Cryptococcus neoformans地生隐球酵母Cryptococcus terreus指甲隐球酵母Cryptococcus uniguttulatus地霉属：白地霉Geotrichum candidum头状地霉Geotrichum capitatum（=头状丝孢酵母）(=Trichosporon capitatum)克氏地霉Geotrichum klebahnii安格斯毕赤酵母Pichia angusta克勒克酵母属：埃皮斯克勒克酵母Kloeckera apis细尖克勒克酵母Kloeckera apiculata日本克勒克酵母Kloeckera japonica克勒克酵母某些种Kloeckera spp奥默柯达菌Kodamaea ohmeri魏氏原壁菌Prototheca wickerhamii红酵母属：粘红酵母Rhodotorula glutinis小红酵母Rhodotorula minuta粘质红酵母Rhodotorula mucilaginosa（=深红酵母+果蝇红酵母）（=Rhodotorula rubra + Rhodotorula pilimanae）酵母属：酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae掷孢酵母属：赭色掷孢酵母Sporobolomyces salmonicolor丝孢酵母属：阿萨丝孢酵母Trichosporon asahii（+/-皮状丝孢酵母）(+/-Trichosporon cutaneum) 墨汁丝孢酵母Trichosporon inkin（+/-皮状丝孢酵母）(+/- Trichosporon cutaneum) 粘性丝孢酵母Trichosporon mucoides（+/-皮状丝孢酵母）(+/- Trichosporon cutaneum) API Candida 假丝酵母鉴定系统（Ref. 10 500）白色假丝酵母Candida albicans无名丝酵母Candida famata光滑假丝酵母Candida glabrata平常假丝酵母Candida inconspicua乳洒假丝酵母Candida kefyr克假丝酵母Candida krusei葡萄牙假丝酵母Candida lusitaniae挪威假丝酵母Candida norvegensis近平滑假丝酵母Candida parapsilosis热带假丝酵母Candida tropicalis新型隐球酵母Cryytococcus neoformans白地霉Geotrichum candidum头状地霉Geotrichum capitatum(=头状丝孢酵母) (=Trichosporon capitatum)酿洒酵母Saccharomyces cerevisiae丝孢酵母某些种Trichosporon sppAPI 20 A 厌氧菌鉴定系统（Ref. 20 300）放线菌属：衣氏放线菌Actinomyces israelii麦氏放线菌Actinomyces mey eri内氏放线菌Actinomyces naeslundii溶齿放线菌Actinomyces odontolyticus粘放线菌Actinomyces viscosus拟杆菌属：粪拟杆菌Bacteroides caccae多毛拟杆菌Bacteroides capillosus吉氏拟杆菌Bacteroides distasonis埃氏拟杆菌Bacteroides eggerthii脆弱拟杆菌Bacteroides fragilis屎拟杆菌Bacteroides merdae卵形拟杆菌Bacteroides ovatus粪便拟杆菌Bacteroides stercoris多型拟杆菌Bacteroides thetaiotaomicron单形拟杆菌Bacteroides uniformis解脲拟杆菌Bacteroides ureolyticus普通拟杆菌Bacteroides vulgatus双歧杆菌属：青春双歧杆菌Bifidobacterium adolescentis双歧双歧杆菌Bifidobacterium bifidum短双歧杆菌Bifidobacterium breve齿双歧杆菌Bifidobacterium dentium双歧杆菌某些种Bifidobacterium spp梭菌属：巴氏梭菌Clostridium barati拜氏梭菌Clostridium beijerinckii双酶梭菌Clostridium bifermentans肉毒梭菌Clostridium botlinum拜氏/丁酸梭菌Clostridium beijerinckii/butyricus 丁酸梭菌Clostridium butyricus尸毒梭菌Clostridium cadaveris梭状梭菌Clostridium clostridioforme艰难梭菌Clostridium difficile矛形梭菌Clostridium hastiforms溶组织梭菌Clostridium histolyticum无害芽胞梭菌Clostridium innocuum泥渣梭菌Clostridium limosum类腐败梭菌Clostridium paraputrificum产气荚膜梭菌Clostridium perfringens多枝梭菌Clostridium ramosum败毒梭菌Clostridium septicum索氏梭菌Clostridium sordellii生孢梭菌Clostridium sporogenes梭菌属某些种Clostridium spp近端梭菌Clostridium subterminate第三梭菌Clostridium tertium破伤风梭菌Clostridium tetani产气柯林斯菌Collinsella aerofaciens真杆菌属：产气真杆菌Eubacterium aerofaciens迟缓埃格特菌Eggerthelle lenta粘液真杆菌Eubacterium limosum梭杆菌属：死亡梭杆菌Fusobacterium mortiferum坏死梭杆菌Fusobacterium necroporum具核梭杆菌Fusobacterium nucleatum可变梭杆菌Fusobacterium varium孪生球菌属：麻疹孪生球菌Gemella mobillorum乳杆菌属：嗜乳酸杆菌Lactobacillus acidophilus发酵乳杆菌Lactobacillus fermentium詹氏乳杆菌Lactobacillus jensenii消化球菌属：黑色消化球菌Peptococcus niger卟啉单胞菌属：不解糖卟啉单胞菌Porphyromonas asaccharolyticus牙龈卟啉单胞菌Porphyromonas gingivalis普雷沃菌属：二路普雷沃菌Prevotella bivia颊普雷沃菌Prevotella buccae解糖胨普雷沃菌Prevotella disiens中间普雷沃菌Prevotella intermedia产黑色普雷沃菌Prevotella melaninogenica口腔普雷沃菌Prevotella oralis口普雷沃菌(=口拟杆菌) Prevotella oris(=Bacteroides oris) 丙酸杆菌属：疮疱丙酸杆菌Propionibacterium acnes颗粒丙酸杆菌Propionibacterium granulosum贪婪丙酸杆菌Propionibacterium avidum丙酸丙酸杆菌Propionibacterium propionicum消化链球菌属：不解糖嗜胨菌Peptoniphilus asaccharolyticus厌氧消化链球菌Peptostreptococcus anaerobius吲哚消化链球菌Peptostreptococcus indolicus大消化链球菌Peptostreptococcus magnus微小消化链球菌Peptostreptococcus micros普氏消化链球菌Peptostreptococcus prevotii消化链球菌群Peptostreptococcus group葡萄球菌属：解糖葡萄球菌Staphylococcus saccharolylicus链球菌属：星座链球菌Streptococcus constellaus中间链球菌Streptococcus intermedius韦荣球菌属：小韦荣球菌Veillonella parvulaAPI CORYNE 棒状杆菌及有关种类的鉴定系统（Ref. 20 600）棒杆菌属：水生雷弗森菌Leifsonia aquatica拥挤棒杆菌Corynebacterium accolens（=G1群棒杆菌）(=Corynebacterium group G1)非发酵棒杆菌Corynebacterium afermentans（+/-ANF-1群棒杆菌）(+/-Corynebacterium group ANF-1) 无枝菌酸棒杆菌Corynebacterium amycolatum银色棒杆菌Corynebacterium argentoratense耳棒杆菌Corynebacterium auris科伊尔棒杆菌Corynebacterium coyleae膀胱炎棒杆菌Corynebacterium cystitidisbelfanti白喉棒杆菌Corynebacterium diphtheriae belfanti 中间白喉棒杆菌 C. diphtheriae intermedius解葡萄糖苷棒杆菌Corynebacterium glucuronolyticum麦氏棒杆菌Corynebacterium macginleyi（=G1/G2群棒杆菌）(= Corynebacterium group G1/G2) 兔肾棒杆菌群Corynebacterium renale group丙酸棒杆菌Corynebacterium propinquum(=ANF-3群棒杆菌) (= Corynebacterium ANF-3)解葡萄糖苷棒杆菌Corynebacterium glucuronolyticum解脲棒杆菌Corynebacterium urealyticum(=D2群棒杆菌) (= Corynebacterium Group D2)牛棒杆菌Corynebacterium bovis缓和白喉棒杆菌Corynebacterium diphtheriae mitis重白喉棒杆菌Corynebacterium diphtheriae gravis杰氏棒杆菌Corynebacterium jeikeium库氏棒杆菌Corynebacterium kutscher（=JK群棒杆菌）(= Corynebacterium gr.JK)极小棒杆菌Corynebacterium minutissimum多毛棒杆菌Corynebacterium pilosum假结核棒杆菌Corynebacterium pseudotuberculosis假白喉棒杆菌Corynebacterium pseudodiphtheriticum兔肾炎棒杆菌Corynebacterium renale纹带棒杆菌Corynebacterium striatum溃疡棒杆菌Corynebacterium ulceransF-1群棒杆菌Corynebacterium group F- 1（=F群棒杆菌）(= Corynebacterium group F)G群棒杆菌Corynebacterium group G（=G1/G2群棒杆菌）(= Corynebacterium group G1/G2) 红球菌属：马红球菌Rhodococcus equi红球菌属某些种Rhodococcus spp利斯特菌属：单核细胞增生利斯特菌Listeria monocytogenes无害利斯特菌Listeria innocua格氏利斯特菌Listeria grayi斯氏利斯特菌Listeria seeligeri魏氏利斯特菌Listeria welshimeri利斯特菌属某些种Listeria spp厄菌属：厄菌属某些种Oerskovia spp放线菌属：无硝纽氏放线菌Actinomyces neuii anitratus纽氏纽氏放线菌Actinomyces neuii neuiiActinomyces neuii radingae图列茨放线菌Actinomyces neuii turicensis丹毒丝菌属：猪红斑丹毒丝菌Erysipelothrix rhusiopathiae隐秘杆菌属：溶血隐秘杆菌Arcanobacterium haemolyticum伯纳德隐秘杆菌Arcanobacterium bernardiae化脓隐秘杆菌Arcanobacterium pyogenes（=化脓放线菌）(= Actinomyces pyogenes)短杆菌属：短杆菌属某些种Brevibacterium spp乳酪短杆菌Brevibacterium casei（=B1和B3群棒杆菌）(= Corynebacterium gr B1 and B3) 表皮短杆菌Brevibacterium epidermidis（=B群棒杆菌）(= corynebacterium gr B)加德纳菌属：阴道加德纳菌Gardnerella vaginalis戈登菌属：戈登菌属某些种Gordona spp罗菌属：龋齿罗菌Rothia dentocariosa节杆菌属：节杆菌属某些种Arthrobacter spp（=A群棒杆菌）(= Corynebacterium gr.A)纤维单胞菌属：纤维单胞菌属某些种Cellulomonas spp（=A3/A4群棒杆菌）(= Corynebacterium gr A3/A4)特氏纤维单胞菌Cellulomonas turbata（=特氏厄菌）(=Oerskovia turbata)皮肤杆菌属：人皮肤杆菌Dermabacter hominis迪茨菌属：迪茨菌属某些种Dietzia spp微小杆菌属：微小杆菌属某些种Microbacterium spp（+/-A4/A5群棒杆菌）(+/- Corynebacterium gr.A4/A5)奴卡菌属：奴卡菌属某些种Nocardia spp厄菌属：纤维化纤维微细菌Cellulosimicrobium cellulans丙酸杆菌属：痤疮丙酸杆菌Propionibacterium acnes贪婪丙酸杆菌Propionibacterium avidum微杆菌属某些种Microbacterium sppAPI 10 S 肠杆菌科快速筛选鉴定系统（Ref. 10 100 ）鲍曼不动杆菌Acinetobacter baumannii嗜水气单胞菌Aeromonas hydrophilia产吲哚金黄杆菌Chryseobacterium indologenes（=产吲哚黄杆菌）(=Flavobacterium indologenes)脑膜脓毒性金黄杆菌Chryseobacterium meningosepticum （=脑膜脓毒性黄杆菌）(=Flvobacterium meningosepticum) 布氏柠檬酸杆菌Citrobacter braakii（+/-弗氏柠檬酸杆菌）(+/- Citrobacter freundii)法氏柠檬酸杆菌Citrobacter farmeri（+/-无丙二酸柠檬酸杆菌）(+/-Citrobacter amalonaticus)弗氏柠檬酸杆菌Citrobacter freundii（+/-弗氏柠檬酸杆菌）(+/-Citrobacter freundii)克氏/无丙二酸柠檬酸杆菌Citrobacter koseri/amanlonaticus 迟钝爱德华菌Edwardsiella tarda肠杆菌属某些种Enterobacter spp产气肠杆菌Enterobacter aerogenes河生肠杆菌Enterobacter amnigenus阴沟肠杆菌Enterobacter cloacae大肠埃希菌Escherichia coli伤口埃菌Escherichia vulneris蜂房哈夫尼亚菌Hafnia alvei产酸克雷伯菌Klebsiella oxytoca肺炎肺炎克雷伯菌Klebsiella pneumoniae pneumoniae摩根摩根菌Morganella morganii泛菌属某些种Pantoea spp（+/-成团肠杆菌）(+/- Enterobacter agglomerans)类志贺邻单胞菌Plesiomonas shigelloides奇异变形杆菌Proteus mirabilis彭氏变形杆菌Proteus penneri普通变形菌群Proteus vulgaris group普通变形杆菌Proteus vulgaris雷氏普罗威登斯菌Providencia rettgeri斯氏/产碱普罗威登斯菌Providencia stuartii/ alcalifaciens铜绿假单胞菌Pseudomonas aeruginosa荧光假单胞菌Pseudomonas fluorescens恶臭假单胞菌Pseudomonas putida假单胞菌属某些种Pseudomonas spp猪霍乱沙门菌亚利桑那亚种Salmonella choleraesuis ssp arizonae 猪霍乱沙门菌猪霍乱亚种Salmonella choleraesuis ssp choleraesuis 沙门菌鸡血清型Salmonella ser.Gallinarum沙门菌甲型副伤寒血清型Salmonella ser.Paratyphi A沙门菌鸡白痢血清型Salmonella ser.Pullorum沙门菌属某些种Salmonella spp伤寒沙门菌Salmonella typhi液化沙雷菌Serratia liquefaciens粘质沙雷菌Serratia marcescens气味沙雷菌Serratia odorifera腐败希瓦菌Shewanella putrefaciens志贺菌属某些种Shigella spp多食鞘氨醇杆菌Sphingobacterium multivorum嗜麦芽寡养单胞菌Stenotrophomonus maltophilia（=嗜麦芽黄单胞菌）(=Xanthomonas maltophilia)解藻朊酸弧菌Vibrio alginolyticus副溶血弧菌Vibrio parahaemolyticus创伤弧菌Vibrio vulnificus霍乱弧菌Vibrio cholerae小肠结肠类耶尔森菌V ersinia enterocolitica假结核耶尔森菌Versinia pseudotuberculosis腐败希瓦菌群Shewanella putrefaciens groupRAPID 20 E 肠道菌快速鉴定系统（Ref. 20 700）柠檬酸杆菌属：无丙二酸柠檬酸杆菌Citrobacter amalonaticua（+/-无丙二酸柠檬酸杆菌）(+/-Citrobacter amalonaticus)法氏柠檬酸杆菌Citrobacter farmeri（+/-无丙二酸柠檬酸杆菌）(+/- C. Amalonaticus)弗氏柠檬酸杆菌群Citrobacter freundii group（=弗氏柠檬酸杆菌）(=C. Freunclii)克氏柠檬酸杆菌Citrobacter Koseri（=差异柠檬酸杆菌）(= C.diversus)爱德华菌属：保科爱德华菌Edwardsiella hoshinae迟钝爱德华菌Edwardsiella tarda肠杆菌属：产气肠杆菌Enterobacter aerogenes阿氏肠杆菌Enterobacter asburiae生癌肠杆菌Enterobacter cancerogenus（=泰勒肠杆菌）(=Enterobacter taylorae)阴沟肠杆菌Enterobacter cloacae日沟维肠杆菌Enterobacter gergoviae阪崎肠杆菌Enterobacter sakazakii埃希菌属：大肠埃希菌Escherichia coli费格森埃希菌Escherichia fergusonii赫氏埃希菌Escherichia hermannii伤口埃希菌Escherichia vulneris爱文菌属：美洲爱文菌Ewingella americana哈夫尼亚菌属：蜂房哈夫尼菌Hafnia alvei克雷伯菌属：解鸟氨酸拉乌尔菌Raoultella ornithinolytica产酸克雷伯菌Klebsiella oxytoca植生克雷伯菌Klebsiella planticola臭鼻肺炎克雷伯菌Klebsiella pneumoniae ozaenae肺炎肺炎克雷伯菌Klebsiella pneumoniae pneumoniae鼻硬结肺炎克雷伯菌Klebsiella pneumoniae rhinoscieromatis 土生克雷伯菌Klebsiella terrigena克吕沃尔菌属：抗坏血酸克吕沃尔菌Kluyvera ascorbata栖冷克吕沃尔菌Kluyvera cryocrescens克吕沃尔菌属某些种Kluyvera spp米勒菌属：威斯康星米勒菌Moellerella wisconsensis摩根菌属：摩氏摩根菌Morganella morganii勒克菌属：非脱羧勒克菌Leclercia adcarboxglata变形杆菌属：奇异变形菌Proteus mirabilis彭氏变形菌Proteus penneri普通变形菌群Proteus vuigaris group泛菌属：泛菌属某些种Pantoea spp（+/-成团肠杆菌）(+/-Enterobacter agglonerans)发光杆菌属：美人鱼发光杆菌Photobacterium danselae（=美人鱼利斯顿菌）(=Listonella damsela)普罗威登斯菌属：产碱普罗威登斯菌Providencia alcalifaciens雷氏普罗威登斯菌Providencia rettgeri斯氏普罗威登斯菌Providencia stuartii沙门菌属：猪霍乱沙门菌亚利桑那亚种Salmonella choleraesuis ssp arizonae猪霍乱沙门菌猪霍乱亚种Salmonella choleraesuis ssp choleraesuis沙门菌甲型副伤寒血清型Salmonella ser.Paratyphi A沙门属某些种Salmonella spp伤寒沙门菌Salmonella typhi鸡沙门菌Salmonella gallinarum志贺菌属：志贺菌属某些捉Shigella spp索氏志贺菌Shigella sonnei沙雷菌属：无花果沙雷菌Serratia ficaria居泉沙雷菌Serratia fonticola液化沙雷菌Serratia liquefaciens粘质沙雷菌Serratia marcescens气味沙雷菌Serratia odorifera普城沙雷菌Serratia plymuthica深红沙雷菌Serratia rubidaea寡养单胞菌属：嗜麦芽寡养单胞菌Stenotrophomonas maltophilia（=嗜麦芽黄单胞菌）(=Xanthomonas maltophilia)耶尔森菌属：小肠结肠炎耶尔森菌Yersinia enterocolitica鼠疫耶尔森菌Yersinia pestis假结核耶尔森菌Yersinia pseudotuberculosis不动杆菌属/假单胞菌属：不动杆菌属某些种Acinetobacter spp不动杆菌属某些种/假单胞菌属某些种Acinetobacter spp/Pseudomonas spp 气单胞菌属：嗜水气单胞菌Aeromonas hydrophila邻单抱菌属：类志贺邻单胞菌Plesiomonas shigelloides弧菌属：解藻朊酸弧菌Vibrio alginolyticus霍乱弧菌Vibrio cholerae河流孤菌Vibrio fluvialis霍利斯格里蒙菌Grimontia hollisae梅氏弧菌Vibrio metschnikovi副溶血弧菌Vibrio parahaemolyticus创伤弧菌Vibrio vulnificus洋葱伯克霍尔德菌Burkholderia cepacia（=洋葱假单胞菌）(=Pseudomonas cepacia) 乡间布丘菌Buttiauxella agrestis戴氏西地西菌Cedecea davisae拉氏西地西菌Cedecea lapagei奈氏西地西菌Cedecea neteri西地西菌属某些种Cedecea sppAPI LISTERIA 李斯特菌鉴定系统（Ref. 10 300）李斯特菌属：单核细胞增生利斯特菌Listeria monocytogenes 无害利斯特菌Listeria innocua伊氏利斯特菌Listeria ivanovii威氏利斯特菌Listeria welshimeri斯氏利斯特菌Listeria seeligeri格氏利斯特菌Listeria grayi。
api鉴定介绍pdf
api鉴定介绍
API鉴定系统是由法国生物-梅里埃公司生产的细菌数值分类分析鉴定系统，它能够鉴定超过800种细菌。
这个系统的主要组成部分包括API试剂条、辅助试剂等。
API系统提供了15个鉴定系列，涵盖550多个细菌种，如肠杆菌科细菌鉴定的API20E，厌氧菌鉴定的API20A，葡萄球菌及微球菌鉴定的API STAPH，李斯特氏菌鉴定的API LIS，弯曲杆菌鉴定的API CAMPY等等。
API鉴定系统是一种基于生化反应原理的微生物鉴定方法，其基本原理是利用不同细菌对特定底物和指示剂的不同代谢能力，通过观察试剂条上的颜色变化来判断细菌的种类。
在操作过程中，将待鉴定的细菌样品加入含有特定底物和指示剂的反应管中，在一定的温度和时间条件下进行培养，然后观察试剂条上的颜色变化，根据颜色的变化情况来确定细菌的种类。
与传统的微生物鉴定方法相比，API鉴定系统具有以下优点：
1.快速：API鉴定系统的检测时间通常只需要几个小时到一天左右，而传统的微生物鉴定方法可能需要几天甚至几周的时间才能得出结果。
2.准确：API鉴定系统可以准确地鉴定出大多数常见的细菌种类，并且具有较高的特异性和灵敏度。
3.简便：API鉴定系统的操作简单，不需要复杂的设备和技术，只需要按照说明书的要求进行操作即可。
4.经济：API鉴定系统的试剂成本相对较低，且可以使用多次，因此比传统的微生物鉴定方法更加经济实惠。
总之，API鉴定系统是一种快速、准确、简便和经济的微生物鉴定方法，广泛应用于医疗卫生、食品加工、环境监测等领域。
微生物分类鉴定方法ppt课件
细菌自动鉴定系统
API细菌数值鉴定系统 “Enterotube”系统 “Biolog”全自动和手动 细菌鉴定系统
API细菌数值鉴定系统流程 7
微生物分类鉴定中的现代方法
核酸分析鉴定微生物的遗传型 细胞化学成分用作鉴定指标
（略） 数值分类法（略）
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核酸分析鉴定微生物的遗传型
DNA是除少数RNA病毒以外的一切微生物的遗传信息载体。每一种微 生物均有其自己特有的、稳定的DNA即基因组的成分和结构，不同种 微生物间基因组序列的差异程度代表着它们之间亲缘关系的远近、疏密。 因此可以用基因组的一些指标作为鉴定微生物类别的依据。
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核酸分子杂交
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rRNA寡核苷酸数目
20世纪70年代末由于美国伊利诺斯大学的C.R.Woese 等人对大量微生物和其他生物进行16s和18srRNA的寡 核苷酸测序，并比较其同源性水平后，提出了一个与 以往各种界级分类不同的新系统，称为三域学说， "域"是一个比界更高的界级分类单元，过去曾称原界。 三个域指的是细菌域(以前称"真细菌域")、古生菌域 (以前称古细菌域)和真核生物域。
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微生分类鉴定中的现代方法
DNA碱基比例测定 核酸分子杂交法 rRNA寡聚核苷酸编目
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DNA碱基比例
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DNA碱基比例
每个生物种都有特定的 GC%范围，因此 可以作为 分类鉴定的指标。细菌的 GC%范围为25--75%，变化 范围最大，因此更适合于 细菌的分类鉴定。
12
DNA碱基比例
GC%测定主要用于对表型特征难区分的细菌作 出鉴定，并可检验表型特征分类的合理性，从分子 水平上判断物种的亲缘关系。
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rRNA寡核苷酸数目