生物信息学考试试卷终审稿)
生物信息考试题及答案
生物信息考试题及答案生物信息学是一门结合生物学、计算机科学、信息技术和数学的交叉学科，它利用计算机技术来分析和解释生物数据。
以下是一份生物信息学考试题及答案的示例。
生物信息学考试题一、选择题（每题2分，共20分）1. 生物信息学中，用于存储DNA序列的文件格式是：A. FASTAB. JPEGC. MP3D. DOCX2. 以下哪项不是生物信息学分析的基本步骤？A. 数据收集B. 数据预处理C. 数据解释D. 数据存储3. 在蛋白质序列分析中，BLAST工具用于：A. 序列比对B. 序列组装C. 序列克隆D. 序列合成4. 以下哪个数据库不是用于存储基因表达数据的？A. NCBIB. GEOC. PDBD. ArrayExpress5. 以下哪个算法不是用于基因预测的？A. GeneMarkB. BLASTC. GlimmerD. Fgenesh二、简答题（每题10分，共30分）6. 简述生物信息学在现代生物学研究中的重要性。
7. 解释什么是基因组学，并说明其在医学研究中的应用。
8. 描述序列比对的基本原理及其在生物信息学中的作用。
三、计算题（每题15分，共30分）9. 假设你有一个DNA序列，其组成为：ATCGTA。
请计算其互补序列。
10. 给定两个蛋白质序列，序列A：A-B-C-D-E，序列B：A-C-E-B-D。
请使用Needleman-Wunsch算法计算它们的全局比对得分。
四、论述题（每题20分，共20分）11. 论述生物信息学在新药开发中的作用及其面临的挑战。
答案一、选择题1. A2. C3. A4. C5. B二、简答题6. 生物信息学在现代生物学研究中的重要性体现在它能够处理和分析大量的生物数据，如基因组序列、蛋白质结构等，帮助科学家快速发现生物现象的规律，推动生物学的发展。
7. 基因组学是研究生物基因组的结构、功能和演化的科学。
在医学研究中，基因组学可以帮助我们了解疾病的遗传基础，为个性化医疗提供理论基础。
《生物信息学》试卷(A)
武汉大学2007—2008学年度高校教师研修班《生物信息学》试卷（A）及答案一、翻译下列名词并解释。
(每题5分，共25分)1. EST2. ORF3. BLAST4. ANN5. HGP二、填空(每空2分，共20分)1、蛋白质空间结构测定常用的方法有和二维核磁共振技术。
2、BLAST对序列格式的要求是常见的格式。
3、系统发育树由一系列和组成，其中每个代表一个分类单元，而代表物种之间的进化关系。
、、等。
6. 目前已经是最广泛使用的系统发育程序。
三、解释说明: 请按要求对下列GenBank文件作解释说明。
(每小题4分，共20分)1、LOCUS行中的第3项mRNA linear表示，这里是。
2、DEFINITION行在GenBank记录中用以3 ACCESSION 是，是从数据库中检索一个记录的主要。
4. FEATURES后面部分是，直接表达了记录的生物背景知识，5 CDS 30…533 表示。
四、问答。
（共35分）1简述国际上有哪几个著名的核酸序列数据库？（10分）2何谓序列比对的相似性和同源性，它们之间有何联系和区别（10分）3试述发现基因的一般过程（15分）《生物信息学》试卷（A）答案一、翻译下列名词并解释。
(每题5分，共25分)1. EST expressed sequence tag 表达序列标签2. ORF Open Reading Frame, 开放阅读框3. BLAST Basic Local Alignment Search T ool 局部相似性基本查询工具4. ANN Artificial Neural Network, 人工神经网络5. HGP Human genome project 人类基因组计划二、填空(每空2分，共20分)1、蛋白质空间结构测定常用的方法有X射线晶体衍射法和二维核磁共振技术。
2、BLAST对序列格式的要求是常见的FASTA格式。
3、系统发育树由一系列节点和分支组成，其中每个节点代表一个分类单元，而节点之间的连线代表物种之间的进化关系。
生物信息技术考试试题
生物信息技术考试试题一、选择题（每题 3 分，共 30 分）1、以下哪个不是生物信息学的主要研究内容？（）A 基因组学B 蛋白质组学C 细胞学D 代谢组学2、生物信息学中用于序列比对的常用算法是（）A 动态规划算法B 贪心算法C 分治算法D 回溯算法3、在基因表达数据分析中，常用的标准化方法是（）A RPKMB TPMC FPKMD 以上都是4、以下哪种数据库主要用于存储蛋白质结构信息？（）A GenBankB PDBC UniProtD Ensembl5、进行系统发育分析时，常用的构建进化树的方法是（）A 邻接法B 最大简约法C 最大似然法D 以上都是6、以下哪个软件不是用于基因序列分析的？（）A Primer PremierB SPSSC DNAStarD Vector NTI7、生物信息学中，预测蛋白质二级结构的方法不包括（）A 基于同源建模B 基于机器学习C 基于物理化学原理D 基于经验规则8、在生物信息学中，BLAST 程序主要用于（）A 序列比对B 进化分析C 基因预测D 蛋白质结构预测9、以下哪种编程语言在生物信息学中应用较为广泛？（）A JavaB PythonC C+＋D Fortran10、用于分析基因芯片数据的软件包是（）A R 语言中的 BioconductorB MATLABC StataD SAS二、填空题（每题 3 分，共 30 分）1、生物信息学中的三大核心数据库是_____、＿____、＿____。
2、基因序列的相似性搜索常用的工具是_____。
3、蛋白质的一级结构是指_____。
4、常见的基因注释数据库有_____、＿____等。
5、系统发育树的构建基于_____的原理。
6、生物信息学中常用的数据格式有_____、＿____等。
7、预测蛋白质三级结构的方法主要有_____、＿____。
8、基因表达数据的差异分析常用的方法有_____、＿____。
9、用于分析高通量测序数据的软件有_____、＿____。
生物信息学试题及答案
广东海洋大学 2013—— 2014 学年第 一 学期《生物信息学 》课程试题答案课程号： 13432210 √ 考试 √ A 卷 √ 闭卷 □ 考查□ B 卷□ 开卷一、 简答题(一) 生物信息学及主要内容？(3)生物信息学是生物和信息技术的结合，这一学科包括了用来管理、分析和操作大量生物数据集的任何计算工具和方法。
(二) 生物信息学主要由哪三个组成部分？(6)1、 建立可以存放和管理大量生物信息学数据集的数据库；2、 开发确定大数据集中各成员关系的算法和统计方法；3、 使用这些工具来分析和解释不同类型的生物数据，包括DNA ，RNA 和蛋白质序列、蛋白质结构、基因表达以及生化途径。
(三) 存储在GenBank 中DNA 序列的类型？(6) 1、基因组DNA 2、cDNA 3、重组DNA(四) 解释下图说明基因组测序的策略？(6)1、霰弹测序法(shot gun sequencing)：随机打碎大DNA 分子，通过很多测序反应来覆盖整个分子，完整的序列通过使用计算机搜索重叠区来重新拼接。
2、克隆重叠群(clone contig)的方法中，DNA 片段用推理的方法亚克隆，并且进行系统的测序直到整个序列完成。
(五) 按制备方式分DNA 芯片的主要类型？(6)1、 原位合成芯片：采用显微光蚀刻等技术在特定部位原位合成寡核苷酸而制备的芯片。
探针较短；2、 DNA 微集阵列：将预先制备的DNA 片段以显微打印的方式有序地固化于支持物表面而制成的芯班级：姓名：学号：试题共页加白纸 2张密封线GDOU-B-11-302片。
探针的来源较灵活。
(六) 解释下图说明用芯片如何测定不同组织中基因表达的差异？(8)1、将要检测的基因用芯片点样仪芯片上2、提取待测样品和对照样品的RNA，分别用用Cy3标定一种RNA，而用Cy5标定另一种RNA。
Cy3发红色荧光，Cy5发绿色荧光。
3、用不同的激发光照射，测定两种样品中DNA的表达量。
内蒙古科技大学2009-2010学年第一学期《生物信息学》考试试题A卷
第 1 页 共 1 页内蒙古科技大学2009/2010学年第一学期《生物信息学》考试试题课程号：66149304 考试方式：开卷 使用专业、年级：生技06，生工07 任课教师：蔡禄 考试时间：2009年1月8日备 注：A 卷一、名词解释（共5题，每题3分，共15分）1. 序列比对2. 基序（motif ）3. 表达序列标签（EST ）4. 电子克隆5.开放阅读框（ORF ） 二、填空题（共6题，每空1分，共20分）1. 目前国际上最常用的核酸序列数据库有 、 和 。
2. 目前国际上最常用的蛋白序列数据库有 、 和 。
3. 列举至少五种NCBI 的服务项目 、 、 、 和 等。
4. 蛋白质得分矩阵类型有等价矩阵 、 、 、 和 等。
5. 预测蛋白质-蛋白质相互作用的理论方法主要有 、 、 和 等。
6. 对位排列主要有局部比对和 。
三、单项选择题（共5题，每题2分，共10分） 1. 如果我们试图做蛋白质亚细胞定位分析，应使用A. NDB 数据库B. SWISS-PROT 数据库C. GenBank 数据库D. PDB 数据库 2. Profiles 数据库是A. 蛋白质序列数据库B. 核酸序列数据库C. 蛋白质二级数据库D. 蛋白质结构数据库 3. 在蛋白质序列数据库中比较查询蛋白质序列，应使用学生班级________________学生学号：□□□□□□□□□□□□学生姓名：________________………………装订线………装订线………装订线…………试卷须与答题纸一并交监考教师…………装订线………装订线………装订线………………A. BLASTnB. BLASTpC. tBLASTnD. BLASTx 4. 构建系统发生树，应使用：A. BLASTB. FASTAC. UPGMAD. Entrez 5. 美国国家生物技术中心简称：A. SIBB. EBIC. NCBID. MIPS四、问答题（共3题，每题5分，共15分）1. 解释正则表达式C-Y-X2-[DG]-G-X-[ST]的含义2. 构建蛋白质二级数据库的主要方法有哪些?3. 总结基因融合法预测蛋白质相互作用的基本原理。
生物信息学考试试题
生物信息学考试试题一、选择题（每题 3 分，共 30 分）1、以下哪种不是常见的生物信息学数据库？（）A GenBankB SWISSPROTC PubMedD Baidu2、在 DNA 序列分析中，以下哪个不是用于序列比对的算法？（）A NeedlemanWunsch 算法B SmithWaterman 算法C BLAST 算法D Fourier 变换算法3、蛋白质结构预测的方法不包括（）A 同源建模B 从头预测C 折叠识别D 随机模拟4、以下哪种不是基因表达数据分析的常用方法？（）A 聚类分析B 主成分分析C 判别分析D 回归分析5、生物信息学中，用于预测蛋白质功能的方法有（）A 基于序列相似性B 基于结构相似性C 基于基因共表达D 以上都是6、在基因组学中，以下哪个不是测序技术？（）A Sanger 测序B 二代测序C 三代测序D 四代测序7、系统发生树构建的方法不包括（）A 距离法B 最大简约法C 最大似然法D 最小二乘法8、以下哪种不是生物信息学中常用的编程语言？（）A PythonB JavaC C+＋D Visual Basic9、以下哪个不是生物信息学在医学领域的应用？（）A 疾病诊断B 药物研发C 医疗美容D 个性化医疗10、生物信息学中，处理大规模数据常用的工具是（）A ExcelB R 语言C SPSSD Word二、填空题（每题 2 分，共 20 分）1、生物信息学是一门融合了生物学、计算机科学和（）的交叉学科。
2、常见的核酸序列格式有 FASTA 和（）。
3、蛋白质的二级结构包括α螺旋、β折叠和（）等。
4、基因芯片技术是一种（）分析技术。
5、序列比对的目的是寻找两个或多个序列之间的（）。
6、人类基因组计划的主要目标是测定人类基因组的（）序列。
7、生物信息学中的隐马尔可夫模型主要用于（）。
8、系统发生分析中，外群的作用是（）。
9、蛋白质相互作用网络分析有助于理解（）。
10、生物信息学数据库可以分为一级数据库和（）数据库。
《生物信息学》试卷(B)
武汉大学2007—2008学年度高校教师研修班《生物信息学》试卷（B）及答案一、翻译下列名词并解释。
(每题5分，共25分)1. HGP2. SRS3. Markov Chain4. ANN5. CDS二、填空(每空2分，共20分)1、生物信息学主要研究的两种信息载体是和。
2、目前国际上主要的核酸数据库是由建立和维护的、由维护的，和日本遗传研究所建立和维护的。
每个机构负责收集来自不同地理分布的数据， 3 个数据库所有信息并向世界开放，3、在进行序列两两比对时，有两方面问题直接影响相似性分值：和。
三、解释说明：请按要求对下列GenBank文件作解释说明。
(每小题4分，共20分)1、LOCUS行中的第3项mRNA linear表示，这里是。
2、DEFINITION行在GenBank记录中用以3 ACCESSION 是，是从数据库中检索一个记录的主要。
4. FEATURES后面部分是，直接表达了记录的生物背景知识，5 CDS 30…533 表示。
四、问答。
（共35分）1、DNA测序有哪些方法？其基本原理是什么？（10分）2、简述蛋白质结构预测的基本思想和方法。
（10分）3、试述人类基因组计划与生物信息学的关系。
（15分）《生物信息学》试卷（B）答案一、翻译下列名词并解释。
(每题5分，共25分)1. HGP Human genome project人类基因组计划2. SRS Sequence Retrieval System 序列检索系统3. 马尔科夫链（Markov Chain），对于生物分子序列分析，马尔科夫链是一个很好的数学统计模型，因为马尔科夫链本身就是相继发生事件的序列，其特征是对于事件序列中的任何一个事件都有一个发生概率，而这个概率依赖于该事件之前的若干个事件。
4. ANN Artificial Neural Network, 人工神经网络5. CDS指的是编码序列,从起始密码子到终止密码子二、填空(每空2分，共20分)1、生物信息学主要研究的两种信息载体是DNA分子和蛋白质分子2、目前国际上主要的核酸数据库是由美国国立生物技术信息中心建立和维护的Genbank库、由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护的EMBL-Bank，和日本遗传研究所建立和维护的日本DNA 数据仓库(DDBJ)。
生物信息考试题及答案
生物信息考试题及答案一、选择题（每题2分，共20分）1. 基因组学研究的核心是（）。
A. 基因克隆B. 基因表达C. 基因组序列D. 基因功能答案：C2. 下列哪项不是生物信息学的主要研究内容？（）A. 基因组序列分析B. 蛋白质结构预测C. 植物分类学D. 基因表达分析答案：C3. 转录组学研究的是（）。
A. 基因组中的所有基因B. 特定细胞或组织中的所有RNA分子C. 特定细胞或组织中的所有蛋白质分子D. 特定细胞或组织中的所有DNA分子答案：B4. 下列哪个数据库主要用于存储蛋白质序列信息？（）A. GenBankB. PDBC. Swiss-ProtD. EMBL答案：C5. 以下哪个不是生物信息学中常用的序列比对工具？（）A. BLASTB. FASTAC. ClustalWD. PCR答案：D6. 以下哪个是用于蛋白质三维结构预测的软件？（）A. Swiss-ProtB. PDBC. MODELLERD. GenBank答案：C7. 以下哪个是用于基因表达分析的高通量技术？（）A. Sanger测序B. 微阵列C. PCRD. 质谱分析答案：B8. 下列哪个是用于基因组关联研究的统计方法？（）A. 聚类分析B. 系统发育分析C. 连锁不平衡分析D. 多态性分析答案：C9. 以下哪个是用于蛋白质-蛋白质相互作用网络分析的工具？（）A. STRINGB. BLASTC. ClustalWD. GenBank答案：A10. 下列哪个是用于生物信息学数据可视化的工具？（）A. R语言B. PythonC. CytoscapeD. Perl答案：C二、填空题（每题2分，共20分）1. 生物信息学是一门结合了__________、__________和__________的交叉学科。
答案：生物学、计算机科学、信息技术2. 基因组学中的“组”指的是__________的集合。
答案：基因3. 转录组学研究的RNA分子包括__________、__________和__________。
生物信息学与计算生物学出版考核试卷
考生姓名：__________答题日期：__________得分：__________判卷人：__________
一、单项选择题（本题共20小题，每小题1分，共20分，在每小题给出的四个选项中，只有一项是符合题目要求的）
1.生物信息学的主要研究内容是：（）
A.生物数据的收集
4.基因表达分析的常用技术之一是______。（）
5.在生物信息学中，______是指通过计算机分析生物学数据，以发现新的生物学知识的过程。（）
6.生物信息学中，用于存储和检索生物学文献的数据库是______。（）
7.蛋白质组学研究中，______技术可以用来鉴定蛋白质及其修饰。（）
8.基因敲除技术的核心是利用______系统来特异性地去除目标基因的功能。（）
C. MODELLER
D. Swiss-Model
16.关于系统生物学，以下哪个描述是正确的？（）
A.仅关注单个基因或蛋白质的功能
B.不涉及数学模型与计算方法
C.研究生物系统中各组成部分的相互作用
D.与生物信息学无关
17.以下哪个数据库主要用于存储疾病相关基因信息？（）
A. OMIM
B. Orphanet
A. Clustal Omega
B. MUSCLE
C. TM-align
D. PSIBLAST
19.在生物信息学中，以下哪些方法可以用于识别非编码RNA？（）
A. RNAz
B. CPC
C. RNAmmer
D. BLAST
20.以下哪些是生物信息学中用于机器学习的常见算法？（）
A.支持向量机
B.随机森林
10.同源搜索
四、判断题
生物信息试题及答案
生物信息试题及答案考题一：1. 什么是生物信息学？生物信息学是一门综合学科，它融合了生物学、计算机科学和统计学等领域的知识和技术，旨在通过对生物序列、结构、功能和进化等信息的收集、管理、分析和应用，揭示生命现象和生物体的特性。
2. 生物信息学在生物研究中的应用有哪些？生物信息学在生物研究中有多种应用，包括：- 基因组学研究：通过对基因组序列的分析，探索基因组结构和功能，识别基因、编码蛋白质和非编码RNA等基因组元件。
- 转录组学研究：通过对转录组数据的分析，研究基因表达谱、异构剪切和转录调控等过程。
- 蛋白质组学研究：通过对蛋白质组数据的分析，研究蛋白质互作网络、翻译后修饰和蛋白质结构与功能等问题。
- 代谢组学研究：通过对代谢产物谱数据的分析，研究代谢途径、代谢物互作和生物样本间的代谢差异。
- 生物信息学工具开发：开发生物信息学软件和数据库，提供数据分析、可视化和挖掘的工具，并推动生物信息学的技术创新。
考题二：1. 生物序列中常见的两类序列是什么？生物序列中常见的两类序列是DNA序列和蛋白质序列。
2. 请简要解释DNA序列和蛋白质序列的意义。
DNA序列是生物遗传信息的载体，它决定了生物体的遗传特征和功能。
通过分析DNA序列，我们可以识别基因、预测基因功能，研究基因组结构和进化过程。
蛋白质序列是DNA翻译后产生的，蛋白质是生物体内多种生物学功能的主要执行者。
分析蛋白质序列可以预测蛋白质的结构和功能，从而理解生物体内蛋白质相互作用、代谢途径和信号传导等重要生物过程。
考题三：1. 什么是基因组学？基因组学是研究生物体基因组的学科，它包括了对基因组序列、结构、功能和进化等多个方面的研究。
基因组是一个生物体所有基因的集合，通过对基因组的研究，可以揭示生物体的遗传信息和特征。
2. 基因组学研究的主要内容有哪些？基因组学研究的主要内容包括以下几个方面：- 基因组测序：通过高通量测序技术，获取生物体基因组的序列信息。
研究生生物信息学考试题目.doc
1Bioinformatics examination1. Final examination schedule: 09/12/2014-7/01/2015, four weeks.2. Choose any ONE of the five proposed questions, and write a report on design and implementation3. Report sectionsa) Title page: title and personal information (including your name, student ID#, major, the class number, and contact information).b) Abstract: 250 words; Keywords: 3-5 wordsc) Introduction: 2-3 paragraphsd) Design and Implementation: at least include a flowcharte) References: please refer to the format of Bioinformatics.4. Requirementsa) Total words: 2000-2500 words (not include reference)b) If you choose the template of Bioinformatics (either 'word' or 'LaTex'), please disregard the 'format requirements5 below.c) Format requirements: Font size: Arial, 12 (宋体，5 号)；Line spacing, double;andParagraph after, 6pt5. Scoresa) Fail: if the duplication rate > 30 % in any two of reports, two would be consideredas plagiarization (score: 0). Never plagiarize your report.b) Bonus: +10 if written in English, please make sure that it is readable; and +10 if LaTex usedc) -Bonus: -10 if absent one time; and -20 if absent two times6. Please send your report in both the paper and electronic versions NO LATER THAN7/01/2015. The signed paper should be deposited to the Molecular Genetics Lab atthe 3rd floors, East building, and the compressedelectronic file should be sent to Mr.XXX at XXXX@ 1Question #1RNA editing is one of the post- or co-transcriptional processes with modification of RNA nucleotides from their genome-encoded sequence. In humans, the most prevalent type of RNAediting is mediated by double-strand RNA (dsRNA)-specific adenosine deaminase acting onRNA (ADAR) enzymes, which converts adenosines to inosines (A to I editing). Since I is interpreted as guanosine (G) during splicing and translation, A to I changes in protein-codingsequences may lead to codon changes, and thus alter functional properties of the proteins. RNAediting has been linked to a wide range of human diseases, including cancer, neurological disorders, metabolic diseases, viral infection, and autoimmune disorder.Suppose we aim to study the RNA editome for prostate cancer using next-generation sequencing technology. Suppose we have collected prostate cancer tissues and the adjacent non-cancer tissues from 20 prostate patients, please design a pipeline to detect (or identify)RNA editing sites by comparing RNA-seq variants with its counterparts on the genome.2Question #2Suppose a family of four members was collected in clinical practice (fig. 1), including an affected mother, an unaffected father, an affected offspring (daughter, founder), and an unaffected offspring. The affected family contains a series of clinical features and had not been diagnosed with a known disease (i.e., an unidentified syndrome).Suppose we aim to study the genetic basis of this family using the technology of whole-exome sequencing. Please design a study and pipeline to identify the causal mutations that may underline this unidentified syndrome. Fig.1.Pedigree.3Question #3The APOBEC3B gene is a member of the cytidine deaminase gene family, which encodes proteins that are structurally and functionally related to the C to U RNA-editing cytidinedeaminase APOBEC1. It is thought that the proteins may be RNA editing enzymes and haveroles in growth or cell cycle control.Suppose we aim to perform a bioinformatics analysis on both the mRNA and protein sequence of APOBEC3B. Please design a pipeline to download both sequences from online database, analyze its promoter regions and transcription factor binding sites, and proteindomain. Furthermore, construct an atomic-resolution model of APOBEC1 from its amino acidsequence (i.e., the protein 3D structure) by homology modeling.Note: please include your results in the report (the Results Section) if it was choose.4Question #4Electronic medical records (EMR) are a systematic collection of electronic health information about an individual patient or population, which is stored in a digit format. Everythingrelated to a patienfs care were stored in the EMR, including demographic information, clinicalnotes, laboratory reports, and other accessory tests (e.g., CT, and X-ray).Suppose we aim to construct an EMR database system, please state the procedures how to design and implement such a system. In addition, given the constructed database containing 2,000 patients, who have consulted in the Division of Cardiovascular Diseases,please design a study to classify these patients with and without coronary heart disease (CHD)using natural language processing (NLP) and evaluate your classification procedures.5Question #5Gene expression profiling refers to the measurement of the expression of thousands of genes at once, which is used to create a global picture of cellular function at the levels of transcriptome. The technologies of DNA microarray ('analog') and transcriptome sequencing(RNA-seq, 'digital') have been used to measures the relative activity of mRNA.Suppose we aim to perform a comparative microarray and RNA-seq analysis of gene expression changes in 10 patients of lung adenocarcinoma and its matched adjacent noncancertissues. Please design a study on this comparative analysis.。
生物信息试题及答案
生物信息试题及答案一、选择题（每题2分，共20分）1. 生物信息学的主要研究对象是（）。
A. 蛋白质结构B. 基因组序列C. 细胞信号传导D. 生物分子相互作用答案：B2. 以下哪项不是生物信息学的主要任务？（）A. 基因预测B. 蛋白质功能预测C. 疾病诊断D. 植物分类学研究答案：D3. 人类基因组计划的主要目标是（）。
A. 确定人类基因组中的所有基因B. 确定人类基因组中的所有蛋白质C. 确定人类基因组中的所有核苷酸序列D. 确定人类基因组中的所有代谢途径答案：C4. 以下哪种生物信息数据库不是公共数据库？（）A. GenBankB. Swiss-ProtC. PDBD. Myriad Genetics答案：D5. 在生物信息学中，BLAST是一种（）。
A. 基因克隆技术B. 基因表达分析软件C. 序列比对工具D. 蛋白质结构预测方法答案：C6. 以下哪种序列分析方法不适用于大规模基因组数据？（）A. 多重序列比对B. 单序列比对C. 基因预测D. 基因家族分析答案：B7. 以下哪种技术不是用于蛋白质结构预测的？（）A. 同源建模B. 从头预测C. 基因克隆D. 蛋白质折叠模拟答案：C8. 以下哪种生物信息学工具主要用于蛋白质功能预测？（）A. PfamB. BLASTC. ClustalWD. Swiss-Prot答案：A9. 以下哪种生物信息学数据库专门存储蛋白质结构数据？（）A. GenBankB. Swiss-ProtC. PDBD. KEGG答案：C10. 在生物信息学中，以下哪种数据类型不是高通量数据？（）A. 基因表达数据B. 蛋白质组数据C. 代谢组数据D. 单个基因序列答案：D二、填空题（每题2分，共20分）1. 生物信息学是应用__________和__________技术，研究生物大分子结构、功能和相互作用的科学。
答案：计算机；信息技术2. 人类基因组计划完成于__________年。
生物信息学考试试卷
一、名词解释(每小题4分,共20分)1、生物信息学广义：生命科学中的信息科学。
生物体系和过程中信息的存贮、传递和表达；细胞、组织、器官的生理、病理、药理过程的中各种生物信息。
狭义：生物分子信息的获取、存贮、分析和利用。
2、人类基因组计划人类基因组计划准备用15年时间，投入30亿美元，完成人类全部24条染色体的3×109脱氧核苷酸对(bp)的序列测定，主要任务包括作图(遗传图谱、物理图谱的建立及转录图谱的绘制)、测序和基因识别。
其中还包括模式生物(如大肠杆菌、酵母、线虫、小鼠等)基因组的作图和测序，以及信息系统的建立。
作图和测序是基本的任务，在此基础上解读和破译生物体生老病死以及和疾病相关的遗传信息。
3、蛋白质的一级结构蛋白质的一级结构是指多肽链中氨基酸的序列4、基因基因--有遗传效应的DNA片断,是控制生物性状的基本遗传单位。
5、中心法则是指遗传信息从DNA传递给RNA，再从RNA传递给蛋白质，即完成遗传信息的转录和翻译的过程。
也可以从DNA传递给DNA，即完成DNA的复制过程。
这是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。
6 、DNA序列比较序列比较的根本任务是：（1）发现序列之间的相似性；（2）辨别序列之间的差异目的：相似序列 相似的结构，相似的功能判别序列之间的同源性推测序列之间的进化关系7、一级数据库数据库中的数据直接来源于实验获得的原始数据，只经过简单的归类整理和注释8、基因识别基因识别，是生物信息学的一个重要分支，使用生物学实验或计算机等手段识别DNA序列上的具有生物学特征的片段。
基因识别的对象主要是蛋白质编码基因，也包括其他具有一定生物学功能的因子，如RNA 基因和调控因子。
9、系统发生学系统发生学(phylogenetics)——研究物种之间的进化关系。
10、基因芯片基因芯片（gene chip），又称DNA微阵列（microarray），是由大量cDNA或寡核苷酸探针密集排列所形成的探针阵列，其工作的基本原理是通过杂交检测信息。
生物信息学考试试题
生物信息学考试试题1. 选择题1. DNA序列中哪种碱基与腺嘌呤形成碱基对？A. 腺嘌呤B. 胸腺嘧啶C. 钝甲嘧啶D. 尿嘧啶2. 下列哪种不属于生物信息学中常用的序列比对软件？A. BLASTB. ClustalWC. PhotoshopD. MEGA3. 在生物信息学中，什么是基因组装？A. 把基因组序列和蛋白质序列对应起来B. 把已知的DNA序列分析并组装成完整的基因组C. 把DNA序列和RNA序列对比分析D. 把基因组序列转录为RNA序列4. 下列哪个软件主要用于预测DNA序列中的基因结构？A. BLASTB. ClustalWC. FGENESD. MEGA5. 在生物信息学中，什么是密码子？A. DNA序列中的重复单元B. 氨基酸序列C. tRNA分子上的核苷酸组合D. mRNA上的三联体核苷酸序列2. 简答题1. 请简要解释生物信息学在基因组学中的应用。
2. 什么是序列比对？序列比对的意义是什么？3. 解释基因组装和基因注释在生物信息学中的作用。
4. 生物信息学中常用的两种序列分析方法分别是什么？简要描述它们的原理。
5. 请简要介绍生物信息学在进化比较基因组学中的应用。
3. 计算题1. 给定以下两条序列，求它们的相似度：序列1: ATCGTCCGATT序列2: ATCGACCGTTA2. 已知一个DNA序列长度为1000bp，其中AT含量为60%，求该序列中GC含量百分比。
4. 应用题1. 请利用BLAST软件对一组已知DNA序列进行序列比对，并解释结果。
2. 请使用ClustalW对两个已知蛋白质序列进行多序列比对，并分析比对结果。
3. 选取一个基因组装软件，对一个已知基因组序列进行装配，并解释装配结果。
以上是生物信息学考试试题，希望您认真作答，祝您考试顺利！。
河南农业大学《生物信息学》2020-2021学年第一学期期末试卷
河南农业大学《生物信息学学 2020-2021学年第一学期期末试卷《《《《《《《《《《《生物信息学》院/系——年纪——专业——姓名——学号——《《《一．选择题（每2分，共20分）1.《物信息学学主要关注的是（《）。
A.《物信大分子的合成B.《物信数据的收集、存储、分析和解释C.《物信系统的物态学关系D.《物信分子的信理性质2.《下列哪个不是物信息学学的主要应用领域？A.《基因组学B.《转录组学C.《蛋白质组学D.《分子物信学实验技术3.《在物信息学学中，用于描述物信序列中特定区域的特性的语言称为（《）。
A.《序列分析B.《序列比对C.《序列模式D.《序列注释4.《在进行基因组分析时，通常使用的数据库是（《）。
A.《PubMedB.《GenBankC.《PDBD.《UniProt5.《物信息学学中，BLAST是一种常用的（《）。
A.《序列比对工具B.《结构模拟软件C.《蛋白质功能预测方法D.《基因调控网络分析工具6.物信息学学是（《）。
《A.《研究物信大分子合成和降解的学科《B.《专门研究基因编辑技术的学科《C.《物信学与计算机科学的交叉学科，主要关注物信数据的收集、管理和分析《D.《研究物信进化历史的学科7.在物信息学学中，用于描述DNA序列中基因位置的数据库通常是（《）。
《A.《UniProt《B.《PDB《C.《Ensembl《D.《KEGG8.BLAST是一个常用的（《）。
《A.《蛋白质三维结构模拟软件《B.《基因表达谱分析工具《C.《局部序列比对搜索工具《D.《基因组组装软件9.下列哪个不是物信息学学在基因组学中的主要应用？（《）《A.《基因定位《B.《基因表达分析《C.《蛋白质结构预测《D.《基因编辑实验设计10.物信息学学中，用于预测蛋白质功能的常见方法不包括（《）。
《A.《序列比对《B.《结构域分析《C.《蛋白质-蛋白质相互作用网络《D.《分子物信学实验二、填空题（每题2分，共10分）1.《在物信息学学中，用于存储和检索核酸序列的数据库是___________。
生物科技在生物信息学的分析考核试卷
A.数据更新
B.数据备份
C.数据恢复
D.数据安全
20.生物信息学中的生物信息学应用领域的挑战包括（）
A.数据复杂性
B.技术创新
C.数据共享
D.伦理问题
三、填空题（本题共25小题，每小题1分，共25分，请将正确答案填到题目空白处）
1.生物信息学是______和______交叉的学科。
2.生物信息学的主要研究领域包括______、______和______。
A.序列比对
B.结构预测
C.机器学习
D.系统生物学
18.生物信息学中的生物信息学工具主要用于（）
A.数据处理
B.数据分析
C.数据可视化
D.以上都是
19.以下哪项不是生物信息学中的生物信息学数据库？（）
A. NCBI
B. UniProt
C. KEGG
D. PubMed
20.生物信息学中的序列比对算法包括（）
2. BLAST算法只能用于蛋白质序列的比对。（）
3.生物信息学中的基因注释是指确定基因序列的功能和位置。（）
4.生物信息学中的数据挖掘技术只能用于文本数据。（）
5.生物信息学中的系统生物学主要研究单个基因的功能。（）
6.生物信息学中的数据库都是公开免费的。（）
7.生物信息学中的序列比对结果总是唯一的。（）
D.系统生物学
4. DNA序列比对的主要目的是（）
A.查找基因突变
B.确定基因功能
C.分析进化关系
D.以上都是
5.生物信息学中的BLAST工具主要用于（）
A.序列比对
B.结构预测
生物信息学试题及个人答案(非参考答案)
生物信息学答题卷考题一：到蛋白质序列数据库中查询一条杆状病毒(Baculovirus)DNA聚合酶（DNA polymerase)的完整序列，写出序列名称、登录号及来源物种的分类情况，然后用Blast（注意：写出所用程序及所搜索的数据库名称）搜索到数据库中和它相似程度较高的10条序列（写出这些序列的名称和登陆号及来源物种的分类情况。
要求至少包括3-4个属，每个属中选择1-2个种），对这10条序列进行多序列比对后（写出比对所用程序及比对结果），使用phylip软件，用距离法对它们进行分子进化分析(包括对进化树进行统计评估)，说明这种蛋白质的进化历程（60分）。
答：（1）到蛋白质序列数据库中查询一条杆状病毒(Baculovirus)DNA聚合酶（DNA polymerase)的完整序列如下：完整序列（ORIGIN）：1 mastdsldtr tfdyasdssf eviiitnaph dydgyielga aarllapfqk nisalwtnaa61 pshkltrnnk nylhvfglfk ylqnynlntk khppeyytik svicdlmmga qgktfdplce121 iktqlcaiqe slneaivtln ghaaadpapr tearelvesl hseyskkltf atdtildhvk181 sikdlvclnk序列名称: capsid protein [Choristoneura fumiferana MNPV]即：云杉卷叶蛾(虎尾松卷叶蛾)颗粒体病毒具体信息：LOCUS NP_848433 190 aa linear VRL06-MAY-2009登录号(ACCESSION): NP_848433来源物种的分类情况SOURCE Choristoneura fumiferana MNPVORGANISM Choristoneura fumiferana MNPVViruses; dsDNA viruses, no RNA stage; Baculoviridae;Alphabaculovirus.FEATURES Location/Qualifierssource 1..190/organism="Choristoneura fumiferana MNPV"/db_xref="taxon:208973"/country="Ireland"（2）然后用Blast搜索和它相似程度较高的10条序列如下：说明：所用程序:blosum62所搜索的数据库名称:swissprot数据库中和它相似程度较高的10条序列1、RecName: Full=Capsid protein p24名称：RecName: Full=Capsid protein p24LOCUS VP24_NPVOP 192 aa linear VRL 11-JAN-2011登录号：P24078来源物种的分类情况：SOURCE Orgyia pseudotsugata MNPVORGANISM Orgyia pseudotsugata MNPVViruses; dsDNA viruses, no RNA stage; Baculoviridae;Alphabaculovirus.FEATURES Location/Qualifierssource 1..192/organism="Orgyia pseudotsugata MNPV"/host="Orgyia pseudotsugata (Douglas fir tussock moth)"/db_xref="taxon:262177"2、RecName: Full=Capsid protein p24名称：RecName: Full=Capsid protein p24LOCUS VP24_NPVAC 198 aa linear VRL 11-JAN-2011登录号：P41678来源物种的分类情况：SOURCE Autographa californica nucleopolyhedrovirusORGANISM Autographa californica nucleopolyhedrovirusViruses; dsDNA viruses, no RNA stage; Baculoviridae;Alphabaculovirus.FEATURES Location/Qualifierssource 1..198/organism="Autographa californica nucleopolyhedrovirus"/host="Lepidoptera (butterflies and moths)"/db_xref="taxon:46015"3、RecName: Full=Flagellar motor switch phosphatase FliY; AltName: Full=CheY-P phosphatase FliY; AltName: Full=Flagellar motor switch protein FliY名称：RecName: Full=Flagellar motor switch phosphatase FliY; AltName: Full=CheY-P phosphatase FliY; AltName: Full=Flagellar motor switch protein FliYLOCUS FLIY_BACSU 378 aa linear BCT 08-FEB-2011登录号：P24073来源物种的分类情况：SOURCE Bacillus subtilisORGANISM Bacillus subtilisBacteria; Firmicutes; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus.FEATURES Location/Qualifierssource 1..378/organism="Bacillus subtilis"/db_xref="taxon:1423"4、RecName: Full=Uncharacterized protein YjeA名称：RecName: Full=Uncharacterized protein YjeALOCUS YJEA_HAEGA 322 aa linear BCT 30-NOV-2010登录号：Q9ZIY0来源物种的分类情况：SOURCE Avibacterium paragallinarumORGANISM Avibacterium paragallinarumBacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pasteurellales;Pasteurellaceae; Avibacterium.FEATURES Location/Qualifierssource 1..322/organism="Avibacterium paragallinarum"/db_xref="taxon:728"5、RecName: Full=Protein YOP1名称：RecName: Full=Protein YOP1LOCUS YOP1_USTMA 172 aa linear PLN 08-MAR-2011 登录号：Q4P0H0来源物种的分类情况：SOURCE Ustilago maydisORGANISM Ustilago maydisEukaryota; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Ustilaginomycotina;Ustilaginomycetes; Ustilaginales; Ustilaginaceae; Ustilago. FEATURES Location/Qualifierssource 1..172/organism="Ustilago maydis"/db_xref="taxon:5270"6、RecName: Full=Protein anon-37Cs名称：RecName: Full=Protein anon-37CsLOCUS A37C_DROLE 544 aa linear INV 10-AUG-2010 登录号：O96570来源物种的分类情况：SOURCE Scaptodrosophila lebanonensisORGANISM Scaptodrosophila lebanonensisEukaryota; Metazoa; Arthropoda; Hexapoda; Insecta; Pterygota;Neoptera; Endopterygota; Diptera; Brachycera; Muscomorpha;Ephydroidea; Drosophilidae; Scaptodrosophila.FEATURES Location/Qualifierssource 1..544/organism="Scaptodrosophila lebanonensis"/db_xref="taxon:7225"7、RecName: Full=Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1; Short=PsaA名称：RecName: Full=Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1; Short=PsaA LOCUS PSAA_SYNPW 767 aa linear BCT 08-FEB-2011登录号：Q9R6U0来源物种的分类情况：SOURCE Synechococcus sp. WH 7803ORGANISM Synechococcus sp. WH 7803Bacteria; Cyanobacteria; Chroococcales; Synechococcus.FEATURES Location/Qualifierssource 1..767/organism="Synechococcus sp. WH 7803"/db_xref="taxon:32051"8、RecName: Full=UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase; AltName:Full=UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase名称：RecName: Full=UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase; AltName:Full=UDP-N-acetylmuramate dehydrogenaseLOCUS MURB_CAMJE 258 aa linear BCT 08-FEB-2011登录号：Q9PM01来源物种的分类情况：SOURCE Campylobacter jejuniORGANISM Campylobacter jejuniBacteria; Proteobacteria; Epsilonproteobacteria; Campylobacterales;Campylobacteraceae; Campylobacter.FEATURES Location/Qualifierssource 1..258/organism="Campylobacter jejuni"/db_xref="taxon:197"9、RecName: Full=UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase; AltName:Full=UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase名称：RecName: Full=UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase; AltName:Full=UDP-N-acetylmuramate dehydrogenaseLOCUS MURB_CAMJR 258 aa linear BCT 08-FEB-2011登录号：Q5HSB7来源物种的分类情况：SOURCE Campylobacter jejuni RM1221ORGANISM Campylobacter jejuni RM1221Bacteria; Proteobacteria; Epsilonproteobacteria; Campylobacterales;Campylobacteraceae; Campylobacter.FEATURES Location/Qualifierssource 1..258/organism="Campylobacter jejuni RM1221"10、RecName: Full=Probable molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A 名称：RecName: Full=Probable molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A LOCUS MOBA_METAC 225 aa linear BCT 03-MAY-2011登陆号：Q8TPD6来源物种的分类情况：SOURCE Methanosarcina acetivorans C2AORGANISM Methanosarcina acetivorans C2AArchaea; Euryarchaeota; Methanomicrobia; Methanosarcinales;Methanosarcinaceae; Methanosarcina.FEATURES Location/Qualifierssource 1..225/organism="Methanosarcina acetivorans C2A"/db_xref="taxon:188937"搜索过程附图：（3）对这10条序列进行多序列比对:写出比对所用程序:clustalx比对结果分析：比对所得的以phy为后缀的文件用写字板格式打开后得如下结果： 10 771P24078.1 ---------- ---------- ------MANA DSLDAR-AFS YAPDASFEVIP41678.1 ---------- ---------- ---------- ----TR-NFM YSPDSSLEVVQ9R6U0 ---------- TAKTQVEKVD NPATFELFGK PGHFDR-ALA KGPKTTTWVWQ3AMS5.1 MTISPPERGS DAKSQVEKVD NPATFELFGK PGHFDR-ALA KGPKTTTWVWQ9PM01.1 ------MIID FKKYSSVRIG NEFEVLVLDQ ICDFDG-FLI GGANN----LQ4P0H0 ---------- ---------- -KVEYFVAQI DKELSRYPAL KKFEQTVPVPQ9ZIY0.1 ------SIQT LLSRAKIIAE IRQFFSERGL LEVETPILSE FGVTDVHLSTP24073.2 --IDALLNGT GSTLDEPEIP EVDDLSEMER DAIGEIGNIS FGSSATALSTO96570 ---------E SLSFSGYKLT RRNLYNAPAL KVMGRSVNNS SSNNNDQQQYQ8TPD6.1 ---------- ---------- MSGKTELKPG RTKSRSAIVL AGGRGRRMGMIITNAPNDHD GY---LELNA AARL-LAPFQ KN-ISALWTS ----------IITNSDGDHD GY---LELTA AAKV-MSPFL SNGSSAVWTN ----------NLHANAHDFD SHTSDLEEVS RKIF-SAHFG HLAVIFIWLS GAFFHGARFSNLHANAHDFD AHTSDLQEVS RRIF-SAHFG HLAVIFIWLS GAFFHGARFSLVSPKPKNIG ILGDGFNFIQ ILDR-NKDFI HLRIGCKTKS S---------KAYAALGAFG IFTLFVFFNI AAGF-LTNLL GFFVPAYFS- ----------FSTKLISPFQ KKEKTLWLST SPEYPMKRLL SAGSGAIFQL CKVFRN---ELLNQKVDITT PSVTVIPRSK ISDAFPEPYV AIEVNYTEGF SG--------NLESAKQNTQ IVVIGAGLAG LSAAQHLLRH GFRSTIVLEA TDRYGG---RVEKALLEFEG KTILERLLEN LFRVVDEVIL SVRDIPQKEK ----------……（此处省略约9KB的数据分析结果）以上是多序列比对的纯数据结果，部分数据省略，因为可以从下面的进化树得到具体的分析。
生物信息处理技术考试试题
生物信息处理技术考试试题一、选择题（每题 3 分，共 30 分）1、以下哪种数据结构常用于存储生物序列信息？（）A 栈B 队列C 链表D 数组2、在生物信息学中，用于分析蛋白质结构的常见方法是（）A 分子动力学模拟B 同源建模C 量子化学计算D 蒙特卡罗方法3、以下哪个是常见的生物信息学数据库？（）A GenBankB IMDbC arXivD JSTOR4、基因表达数据分析中，常用的标准化方法是（）A Zscore 标准化B MinMax 标准化C 对数标准化D 以上都是5、进行序列比对时，以下哪种算法的准确性较高但计算复杂度也较高？（）A 动态规划算法B 贪心算法C 分治法D 回溯算法6、在生物信息处理中，用于预测蛋白质二级结构的方法不包括（）A 基于机器学习的方法B 基于物理化学原理的方法C 基于统计学的方法D 基于人工神经网络的方法7、以下哪种编程语言在生物信息学中应用广泛？（）A PythonB JavaC C+＋D 以上都是8、生物信息学中，用于分析基因调控网络的方法是（）A 布尔网络模型B 贝叶斯网络模型C 以上都是D 以上都不是9、以下哪个不是生物信息学中常用的图形展示方式？（）A 柱状图B 折线图C 饼图D 思维导图10、处理大规模生物数据时，常用的分布式计算框架是（）A HadoopB SparkC 以上都是D 以上都不是二、填空题（每题 3 分，共 30 分）1、生物信息学的主要研究对象包括核酸、＿____和代谢物等生物分子。
2、序列比对的基本类型有全局比对和_____比对。
3、常见的基因测序技术有第一代测序技术 Sanger 测序、第二代测序技术和_____测序技术。
4、蛋白质的一级结构是指其_____序列。
5、在生物信息学中，常用的相似性搜索工具是_____。
6、系统发生树构建的方法主要有距离法、＿____法和最大简约法。
7、基因芯片技术可以同时检测大量基因的_____水平。
生物信息学试题及答案
生物信息学试题及答案一、单项选择题（每题2分，共20分）1. 生物信息学的主要研究对象是（）。
A. 生物数据B. 生物实验C. 生物模型D. 生物技术答案：A2. 下列哪项不是生物信息学中的常用数据库（）。
A. GenBankB. Swiss-ProtC. PubMedD. Google Scholar答案：D3. 蛋白质序列比对的主要目的是（）。
A. 确定蛋白质的三维结构B. 预测蛋白质的功能C. 比较蛋白质的氨基酸序列D. 计算蛋白质的分子量答案：B4. 在生物信息学中，以下哪种算法不是用于序列比对的（）。
A. BLASTB. FASTAC. Smith-WatermanD. Hidden Markov Model答案：D5. 下列哪种生物信息学工具主要用于基因表达分析（）。
A. ClustalWB. Primer3C. R语言D. PDB答案：C6. 以下哪种技术不是用于蛋白质结构预测的（）。
A. 同源建模B. 从头预测C. 序列比对D. 折叠识别答案：C7. 以下哪种生物信息学工具主要用于基因组注释（）。
A. BLASTC. GATKD. Primer3答案：B8. 在生物信息学中，以下哪种方法不用于基因表达数据的聚类分析（）。
A. K-meansB. Hierarchical clusteringC. Principal component analysisD. Multiple sequence alignment答案：D9. 下列哪种生物信息学工具主要用于蛋白质-蛋白质相互作用网络分析（）。
A. STRINGB. BLASTD. Primer3答案：A10. 在生物信息学中，以下哪种数据库不包含蛋白质结构信息（）。
A. PDBB. UniProtC. RCSBD. GenBank答案：D二、多项选择题（每题3分，共15分）11. 生物信息学中常用的序列比对工具包括（）。
A. BLASTB. FASTAC. ClustalWD. Pfam答案：ABC12. 以下哪些是生物信息学中常用的基因表达分析软件（）。
生物信息考试题及答案
生物信息考试题及答案一、单项选择题（每题2分，共20分）1. DNA双螺旋结构是由哪位科学家提出的？A. 孟德尔B. 达尔文C. 沃森和克里克D. 爱因斯坦答案：C2. 下列哪种生物信息学数据库主要用于存储蛋白质序列信息？A. GenBankB. PDBC. Swiss-ProtD. KEGG答案：C3. 以下哪个选项不是生物信息学的主要研究领域？A. 基因组学B. 蛋白质组学C. 系统生物学D. 量子物理学答案：D4. 在生物信息学中，BLAST是一种用于什么目的的算法？A. 序列比对B. 蛋白质结构预测C. 基因表达分析D. 代谢途径重建5. 以下哪种生物信息学工具用于基因预测？A. ClustalWB. BLASTC. GeneScanD. FASTA答案：C6. 以下哪个选项是生物信息学中用于描述基因表达模式的术语？A. SNPB. GOC. microRNAD. EST答案：D7. 以下哪种生物信息学数据库主要用于存储基因表达数据？A. GenBankB. GEOC. PDBD. Swiss-Prot答案：B8. 以下哪个选项不是生物信息学中用于蛋白质功能预测的方法？A. 同源性搜索B. 蛋白质结构预测C. 蛋白质家族分类D. 基因组测序答案：D9. 在生物信息学中，以下哪个选项是用于描述基因组中非编码区域的A. IntronB. ExonC. Intergenic regionD. Promoter答案：C10. 下列哪种生物信息学工具用于蛋白质-蛋白质相互作用网络分析？A. STRINGB. ClustalWC. MEGAD. BLAST答案：A二、多项选择题（每题3分，共15分）1. 以下哪些是生物信息学中常用的序列比对工具？A. BLASTB. ClustalWC. FASTAD. MEGA答案：ABCD2. 以下哪些数据库是生物信息学中常用的？A. GenBankB. PDBC. Swiss-ProtD. PubMed答案：ABCD3. 以下哪些是生物信息学中用于基因表达分析的方法？A. qRT-PCRB. MicroarrayC. RNA-seqD. Mass spectrometry答案：ABC4. 以下哪些是生物信息学中用于蛋白质结构预测的方法？A. Homology modelingB. Ab initio modelingC. ThreadingD. Docking答案：ABC5. 以下哪些是生物信息学中用于系统生物学分析的工具？A. BioCycB. KEGGC. ReactomeD. STRING答案：ABCD三、简答题（每题5分，共20分）1. 描述基因组学和蛋白质组学的主要区别。
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生物信息学考试试卷文稿归稿存档编号：[KKUY-KKIO69-OTM243-OLUI129-G00I-FDQS58-
一、名词解释(每小题4分,共20分)
1、生物信息学
广义：生命科学中的信息科学。
生物体系和过程中信息的存贮、传递和表达；细胞、组织、器官的生理、病理、药理过程的中各种生物信息。
狭义：生物分子信息的获取、存贮、分析和利用。
2、人类基因组计划
人类基因组计划准备用15年时间，投入30亿美元，完成人类全部24条染色体的3×109脱氧核苷酸对(bp)的序列测定，主要任务包括作图(遗传图谱、物理图谱的建立及转录图谱的绘制)、测序和基因识别。
其中还包括模式生物(如大肠杆菌、酵母、线虫、小鼠等)基因组的作图和测序，以及信息系统的建立。
作图和测序是基本的任务，在此基础上解读和破译生物体生老病死以及和疾病相关的遗传信息。
3、蛋白质的一级结构
蛋白质的一级结构是指多肽链中氨基酸的序列
4、基因
基因--有遗传效应的DNA片断,是控制生物性状的基本遗传单位。
5、中心法则
是指遗传信息从传递给，再从RNA传递给，即完成遗传信息的转录和翻译的过程。
也可以从DNA传递给DNA，即完成DNA的复制过程。
这是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。
6 、DNA序列比较
序列比较的根本任务是：（1）发现序列之间的相似性；（2）辨别序列之间的差异
目的：
相似序列相似的结构，相似的功能
判别序列之间的同源性
推测序列之间的进化关系
7、一级数据库
数据库中的数据直接来源于实验获得的原始数据，只经过简单的归类整理和注释
8、基因识别
基因识别，是生物信息学的一个重要分支，使用生物学实验或计算机等手段识别DNA 序列上的具有生物学特征的片段。
基因识别的对象主要是蛋白质编码基因，也包括其他具有一定生物学功能的因子，如RNA基因和调控因子。
9、系统发生学
系统发生学(phylogenetics)——研究物种之间的进化关系。
10、基因芯片
基因芯片（gene chip），又称DNA微阵列（microarray），是由大量cDNA或寡核苷酸探针密集排列所形成的探针阵列，其工作的基本原理是通过杂交检测信息。
二、综合题(共60分)
1 生物信息学分析的数据对象主要有哪几种这些数据之间存在着什么关系
其研究重点主要落实在核酸和蛋白质两个方面，包括它们的序列、结构和功能。
生物信息学以基因组DNA序列信息分析作为出发点，破译遗传语言，认识遗传信息的组织规律，辨
别隐藏在DNA序列中的基因，掌握基因调控信息，对蛋白质空间结构进行模拟和预测，依据蛋白质结构和功能的关系进行药物分子设计。
2 生物信息学的主要研究任务是什么目前生物信息学的主要研究内容是什么
A．收集和管理生物分子数据；数据分析和挖掘；开发分析工具和实用软件：生物分子序列比较工具、基因识别工具、生物分子结构预测工具、基因表达数据分析工具。
B．（1）生物分子数据的收集与管理；（2）数据库搜索及序列比较；（3）基因组序列分析；
（4）基因表达数据的分析与处理；（5）蛋白质结构预测。
5 在基因组序列分析方面，科学家关注哪些信息？
就人类基因组而言，编码区域在人类基因组所占的比例不超过3%。
其余97%是非编码序列。
对于非编码序列，人们了解得比较少，尚不清楚其含义或功能。
然而，非编码区域对于生命活动具有重要的意义。
这部分序列主要包括内含子、简单重复序列、移动元件（mobile element）及其遗留物、伪基因（pseudo gene）等。
6掌握蛋白质结构有什么意义为什么要进行蛋白质结构预测
（1）研究蛋白质的结构意义重大，分析蛋白质结构、功能及其关系是蛋白质组计划中的一个重要组成部分。
研究蛋白质结构，有助于了解蛋白质的作用，了解蛋白质如何行使其生物功能，认识蛋白质与蛋白质（或其它分子）之间的相互作用，这无论是对于生物学还是对于医学和药学，都是非常重要的。
（2）对于未知功能或者新发现的蛋白质分子，通过结构分析，可以进行功能注释，指导设计进行功能确认的生物学实验。
通过分析蛋白质的结构，确认功能单位或者结构
域，可以为遗传操作提供目标，为设计新的蛋白质或改造已有蛋白质提供可靠的依据，同时为新的药物分子设计提供合理的靶分子结构。
简述分子生物学中的“中心法则”。
“中心法则”的核心是什么
（1）DNA是遗传物质，是携带遗传信息的载体。
信息从基因的核苷酸序列中被提取出，用来指导蛋白质合成的过程对地球上的所有生物都是相同的，分子生物学家称之为中心法则(central dogma)。
（2）“中心法则”的核心：DNA分子中的遗传信息转录（transcription）到RNA分子中（即RNA聚合酶以DNA为模板合成RNA），再由RNA翻译（translation）生成体内各种蛋白质，行使特定的生物功能。
若一条 mRNA 序列 5 '－ AUG GGA UGU CGC CGA AAC － 3 '被核糖体翻译，将形成怎样的氨基酸的序列若将第一个核苷酸删掉而将另一个 A 加到 mRNA 序列的 3 ' - 端，又将形成怎样的氨基酸序列
(1) 画出下面两条序列的简单点阵图。
将第一条序列放在 x 坐标轴上，将第二条序列放在 y 坐标轴上。
TGAACTCCCTCAGATATTA
CGAACCCTCACATATTAGCG
(11) 为什么要进行序列片段组装在进行序列片段组装时会遇到哪些问题
大规模基因组测序得到待测序列的一系列序列片段，这些序列片段覆盖待测序列，序列片段之间也存在着相互覆盖或者重叠。
遇到的问题：碱基标识错误；不知道片段的方向；存在重复区域；缺少覆盖。
(1) 国际上有哪几个着名的核酸序列数据库
（1）欧洲分子生物学实验室的EMBL 。
（2）美国生物技术信息中心的GenBank。
（3）日本遗传研究所的DDBJ
(3) 具有简并性的密码子一共有多少个什么是基因的密码子使用偏性造成密码子使用偏性可能的原因有哪些
(9) 假设给你一条蛋白质序列，要求预测该蛋白质的结构。
你计划采用什么策略来预测该蛋白质的结构
画出四个分类单元 A 、 B 、 C 和 D 所有可能的无根树和有根树。
三、论述题(两个小题,共20分)
1、简述人类基因组计划与生物信息学之间的相互促进关系。
人类基因组计划(Human Genome Project, HGP)是美国在1990年提出实施的一项伟大的科学计划，与阿波罗登月计划、曼哈顿原子弹计划同称为人类自然科学史上的三大计划。
自实施以来，该计划在世界各国引起了很大反响。
在人类基因组计划中，人们准备用15年时间，投入30亿美元，完成人类全部24条染色体中3×109个碱基对(bp，base pair)的序列测定，其主要任务包括作图(遗传图谱、物理图谱的建立及转录图谱的绘制)、测序和基因识别，还包括模式生物(如大肠杆菌、酵母、线虫、小鼠等)基因组的作图和测序，以及信息系统的建立。
随着人类基因组计划的提出和实施，实验数据和可利用信息急剧增加，人类基因组计划提供了以往不可想象的巨量的生物学信息资源。
基因组信息的收集、储存、分发、分析显得越来越紧迫和重要，信息的管理和分析成为人类基因组计划实施过程中的一项重要工作，人类基因组计划向信息学提出了巨大的挑战。
值得庆幸的是，人类基因组计划一开始就与计算机技术、信息高速公路同步发展，信息技术为生物信息学的发展提供了非常好的
条件，为生物信息学的研究和应用提供了非常好的支撑。
生物信息学与人类基因组计划紧密结合，互相渗透，生物信息学成为基因组计划不可分割的一部分。
事实证明，人类基因组计划在生物信息学的支持下，前进步伐大大加快，已经提前完成计划，功能基因组研究也已经全面展开。
而人类基因组计划反过来又大大促进了生物信息学的发展，HGP丰富了生物信息学的研究内容，促进生物信息学新思想、新方法的产生，生物信息学在最近10年迅速发展的历程证明了这一点。