指数含义学习资料
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现在景观格局研究普遍采用Fragstats 3.3软件计算格局指数,我在写文章的过程中也使用了这一软件,期间也遇到不少问题,幸得高人指点和自己不断摸索(当时网上鲜有使用方法),终于把数据算出来了,现在把使用过程中遇到的一些问题与方法写出来,希望对后来者有些帮助,在写这个的过程中,参考了一些朋友的意见。
Fragstats 33软件的安装
如果你装了arcgis软件,那么Fragstats 3.3可以直接使用。下载下来的文件解压缩后,双击便可以使用,注意,要保证你的ArcGIS 是运行的状态。
环境变量的设置
打开软件后,看你的是“ARCGRID disabled”还是“ARCGRID enabled”,如果是后则,可以直接使用,如果是前者,学要设置环境变量。步骤:我的电脑->属性->高级->环境变量,在系统变量那里,新建,变量名为path,变量值为X:\ESRI\AV_GIS30\ARCVIEW\BIN32,X为Arcview 安装所在的盘符。
或者是C:\Program Files\ArcGIS\Bin,C为Arcview安装所在的盘符,一般默认安装在C盘上。这样你的软件就能用了。
数据准备
因为这个软件支持的是grid格式的数据,所以需要将手上的coverage、shape文件转换为grid格式的文件,用来运算。转换可以在Arcview里面进行,或者Arcmap都可以。以Arcmap为例: A、调出 B、转换为grid:feature to raster
如果想要grid按照你所设定的形状进行计算,可以进行裁剪。且可以保证背景的完整性。以Arcview为例: ert to Grid来生成。加载空间分析模块的方法:File->Extensions,选择Spatial Analyst,ok。
属性文件的制定(一般的计算景观格局的就不需要这一步,但是要计算moving widow的话就需要用到了)
新建txt文件,格式如下:
ClassID , ClassName , Status , isBackground
1 , shrubs , true , false
2 , conifers , true , false
3 , deciduous , true , false
4 , other , false , true
注意:每个之间用空格键和逗号隔开。1-3是你所分的地类所代表的属性,有多少个地类就列多少行。4是文件最后所必需的一列。最后保存为*.fdc格式。
参数设定
找到图标或者是fragstats\set run parameters打开Run parameters对话框。
Grid name:选择grid文件。
Output File: 随便命个名字,存在你能找到的地方。
Is properties file 找到步骤五所保存好的*.fdc文件。
Output Statistics:选择你要计算的指数,有斑块级别的、地类级别的、景观级别的,自己可以任意选择。
同意可以选择斑块的邻距。那要看自己怎么订了。4个cell或者8个cell。
注意:如果参数设置完成后,你的地类学要修改,或者有运行有什么问题,可以打开:tools/class properties进行修改。
指数的选择
Fragstats/select patch(class、land)metrics
指数一共有三个级别,path、class、land三个级别。不同级别对应不同的指数,对应着不同的生态学意义。所以选择指数的时候,一定要清楚所选择的指数对应的级别。
运行计算
选择好指数后,点击Fragstats/execute执行,或者是图标。
结果保存在步骤6种的Output File是所存的地方。找到后,用记事本打开。便是你要的结果了。
部分景观指数及其生态学含义
拼块类型面积(CA),单位:ha,范围:CA>0
公式描述:CA等于某一拼块类型中所有拼块的面积之和(m2),除以10000后转化为公顷(ha);即某拼块类型的总面积。
生态意义:CA度量的是景观的组分,也是计算其它指标的基础。它有很重要的生态意义,其值的大小制约着以此类型拼块作为聚居地(Habitation)的物种的丰度、数量、食物链及其次生种的繁殖等,如许多生物对其聚居地最小面积的需求是其生存的条件之一;不同类型面积的大小能够反映出其间物种、能量和养分等信息流的差异,一般来说,一个拼块中能量和矿物养分的总量与其面积成正比;为了理解和管理景观,我们往往需要了解拼块的面积大小,如所需要的拼块最小面积和最佳面积是极其重要的两个数据。
景观面积(TA),单位:ha,范围:TA>0
公式描述:TA等于一个景观的总面积,除以10000后转化为公顷(ha)。生态意义:TA决定了景观的范围以及研究和分析的最大尺度,也是计算其它指标的基础。在自然保护区设计和景观生态建设中,对于维护高数量的物种,维持稀有种、濒危种以及生态系统的稳定,保护区或景观的面积是最重要的因素。
拼块所占景观面积的比例(%LAND),单位:百分比,范围:0< %LAND<=100
公式描述:%LAND等于某一拼块类型的总面积占整个景观面积的百分
比。其值趋于0时,说明景观中此拼块类型变得十分稀少;其值等于100时,说明整个景观只由一类拼块组成。
生态意义:%LAND度量的是景观的组分,其在拼块级别上与拼块相似度指标(LSIM)的意义相同。由于它计算的是某一拼块类型占整个景观的面积的相对比例,因而是帮助我们确定景观中模地(Matrix)或优势景观元素的依据之一;也是决定景观中的生物多样性、优势种和数量等生态系统指标的重要因素。
拼块个数(NP),单位:无,范围:NP>=1
公式描述:NP在类型级别上等于景观中某一拼块类型的拼块总个数;在景观级别上等于景观中所有的拼块总数。
生态意义:NP反映景观的空间格局,经常被用来描述整个景观的异质性,其值的大小与景观的破碎度也有很好的正相关性,一般规律是NP大,破碎度高;NP小,破碎度低。NP对许多生态过程都有影响,如可以决定景观中各种物种及其次生种的空间分布特征;改变物种间相互作用和协同共生的稳定性。而且,NP对景观中各种干扰的蔓延程度有重要的影响,如某类拼块数目多且比较分散时,则对某些干扰的蔓延(虫灾、火灾等)有抑制作用。
最大拼块所占景观面积的比例(LPI),单位:百分比,范围:0